Motif Search v1.1 April 7, 1998 by Jason D. Hughes Motif: tccatttcacgatgaaaaaaatg 1 1 1 -4.47961 gtttattcattgatcgaaataag 2 1 1 -5.17067 gatattttacctttcgaaatttc 3 1 1 -3.83298 ttattttagatatcgaaaaaatt 4 1 1 -6.42552 tttaatttgcgatacgaattaaa 5 1 1 -4.42077 cttattttatcattcaaaaaatc 6 1 1 -1.18377 *********************** Average: -4.25222 Std. Dev.: 1.74574 Sites scoring better than avg-2*sdev: TCGATTTCGATAATAGAAATATC 1 12763 0 -7.46529 CTATTTTCATTAGTCAAATAAAC 1 317898 0 -7.49161 TTTATTTGACTAATGAAAATAGA 1 317899 1 -7.05186 CACTATTCACGATCTGAAAAATG 1 373364 1 -7.60109 GTTTTTTTGCTAAGAATAAAATC 1 384348 1 -7.32219 TATAAATAAAGATTAAAAATATT 1 389107 0 -7.55538 TTTTTTGCGTTATGAAAAATAAT 1 465203 1 -7.45799 GTGATTTCACCTTTAAAATAAAA 1 467551 1 -7.46529 TTAATTTCACCAACAAAAAAAAG 1 528271 0 -5.26806 TTAATTTCACGTATCGAATAACG 1 536825 0 -7.32949 CTTATTTTATCATTCAAAAAATC 1 702927 0 -1.18377 TTTAATTTGCGATACGAATTAAA 1 703021 1 -4.42077 TATTTTTCGCGACGCGAATTATC 1 707426 0 -7.15513 TTTTATTCATCATACAACAAATT 1 752153 0 -5.77159 TTTTTTTCGCGATGGGAAAAATT 1 888769 0 -3.96878 ATTATTTTATTAATGCAAATATA 1 953991 1 -7.13701 TTTTTTTTGCCTTTAGTAAATTG 1 1018177 0 -7.23703 ACTATTTCACTATTCCAATAAAA 1 1050134 1 -7.7248 CTTTTTTTGTCTTGCGCAAAATC 1 1118734 1 -6.8702 GTTATTTTACCTGTATAAATAAC 1 1120735 0 -7.46529 TATACTTTGTTATTCAAAATCAG 1 1167338 0 -7.20578 TTAATTTCGTTATGAAAACAATC 1 1202145 0 -6.70315 TTTATTTCATTAAGTAAAAAAGA 1 1213911 1 -7.7248 GTTATTTCATTACCCAATATATC 1 1369863 0 -6.81956 TATTTTTTATGAGAAAAATTATG 1 1411949 0 -7.66596 TACATTTTACCATTTAAATTTTG 1 1432016 1 -6.99302 GTTAATTACCGGTTCGATAAATG 1 1473548 1 -7.63234 TTTTATTTATCATACAAATAAAT 1 1489541 0 -4.75724 CTCATTTAACTTAGGGAAAAATG 1 1496596 0 -7.13701 GTAATTTTACGAAGAGAAATAAG 1 1580583 1 -5.26806 TATTTTTTATATTGAAAAATATG 1 1584703 0 -6.67683 TATTTTTCAATATAAAAAATAAG 1 1584705 1 -5.40387 TTTTTTTCGCCGTCATAAAAATC 1 1620825 0 -6.50248 TACATTTTACCATTTAAATTTTG 1 1631306 0 -6.99302 GTCATTTTACGGGACAAAAAAAT 1 1639873 0 -6.8775 TCTCTTTCGCCGTTAAAAAAATC 1 1671361 0 -6.41732 GTAATTTCTCTGTGCAAAAATTA 1 1694412 0 -7.7248 TTTTTGCTGCGATTCAAAAAAAT 1 1810674 0 -7.40408 TTACATTAATTATGCAAAATTTA 1 1864669 1 -7.7248 TTTCGTTAACGATAAAAAATATT 1 1868449 0 -7.69848 GATATTTTACCTTTCGAAATTTC 1 1899866 1 -3.83298 TTATTTTAGATATCGAAAAAATT 1 1899931 0 -6.42552 TTTATTTTAGATATCGAAAAAAT 1 1899932 0 -7.05186 GTAAATTTAAAATAAGAAAAATT 1 1906000 1 -6.93634 CTTTATTTAGCATGAGAAAAATA 1 1907270 0 -6.42552 GTTATTTTATTATTTGCAAAAGG 1 1986666 0 -7.63234 GTTTTATCATGATAGAAAAAATC 1 2010059 0 -6.10806 TTTATCTATTTGTTCAAAAAATG 1 2031533 0 -7.04456 AATAATTTGTTATTTAAAAAATT 1 2040293 0 -7.26462 GTTTTTTCAATATTGAAATTATA 1 2051271 1 -5.01675 GATATTTTACGACTGAACATATC 1 2066493 0 -7.49654 CTCTTTTCGCTTTCAAAAAAAAG 1 2078752 1 -7.09026 GAATCTTTGTCTTTCAAAAAATC 1 2105696 1 -7.34158 AACATTTTTTTATGCGAAATATC 1 2112749 0 -7.52413 AACATTTTGTTATTCGTAATATC 1 2113094 0 -7.63234 TTTTTTTAGCGATGATAAAAAAT 1 2185301 0 -7.0133 GAATATTAACGATAGAAAATAAG 1 2231842 0 -7.09026 TTTTCTTTGCTGTAGAAAAAATA 1 2253235 0 -6.92815 TTTATATTATTATTCGACATTTC 1 2381579 0 -6.76565 TCTGTTTTAAGATGCGAAACATG 1 2384909 1 -6.93634 TTATATTTAATATCATAAATATT 1 2386461 0 -7.52413 TTTCTTCCATCATGCAAAAAAAA 1 2411365 1 -7.38103 TATATATTACTTTTAGAAATAAC 1 2467438 0 -6.44857 GTTTTTTTAATTTATAAAATAAT 1 2468423 1 -7.0133 TTTTTTTAATTTATAAAATAATT 1 2468424 1 -7.07817 TTTATCTTGTCATAATAAAAATG 1 2473034 0 -7.38103 GTTTTTTAGATGTGAGAAATATT 1 2474543 0 -6.76199 CTCATTTTCTCAATAAAAATAAG 1 2481687 0 -7.46529 TTAATTTCGCGCATCAAAATAAT 1 2531522 0 -6.61799 TTTTTTTTATTATTCGCAAACTC 1 2574017 1 -5.8871 TTTTTTTCGTTAATAGAAAATGC 1 2714017 0 -7.74292 TTTTTTTCAATATTAAAAATTGC 1 2757333 0 -6.36668 CAATTTTTAATATTGAAAAAAAA 1 2757334 1 -6.67683 TTAATTTCACAAAACAAAATATT 1 2758338 1 -5.70193 TTCATTTTGCGATCAAAATAACA 1 2823758 1 -7.63964 TTTTTTTTGCCTTACGGAAATTG 1 2898305 0 -6.98572 ATTAATTCAATATTAAAAAAATA 1 2901820 1 -5.3269 TTTTTTTTGTTATACATAAAGTC 1 2987488 0 -7.32219 TTTTAATTTTCATTGAAAAAATG 1 2989007 1 -7.37283 ATAATTTTACCGTTCGGAATAAC 1 3067316 1 -7.29587 CTTAATTCACAATAAAAAATAAC 1 3086264 1 -5.91469 GAAATTTCAACAAACAAAAAATT 1 3117301 1 -6.37487 TATATTTTGCTATTAGTAAAATC 1 3169888 0 -5.34996 TTTTTTTGGGGATTGAAAATATG 1 3170307 0 -6.16601 TCTATTTTAACGTGCGAGAAATA 1 3188225 1 -6.9676 TTCTGTTTATTATTGGAATTATT 1 3190941 1 -7.12882 TTTATTTAACGAAACAAATTCTG 1 3224050 0 -6.69106 GTTTCTTTACTATCGAAAAAACC 1 3281995 1 -7.26462 TCGATATTAATATACAAAATATG 1 3358518 1 -7.55538 TTTTCTTTATGAATGAAAATTTT 1 3407683 0 -7.32949 TTTTATTTATTTTTCTAATAAAC 1 3453604 0 -6.44364 TAAATTTTGCCATCGAAAATAAC 1 3467354 1 -5.31871 TTCAATTTAACATTTTAAATATG 1 3467641 0 -6.67683 GGTAATTCACTATTCGAATTATA 1 3537554 1 -5.26806 TTTAATTCATTGTTTTAAAAAAG 1 3555791 1 -7.09026 ATAATTTCACCATTCAAAAAGAA 1 3561650 0 -6.8775 GCTATTTTATCAATGGCAATATT 1 3579447 0 -7.24523 GTTTATTAACCTGTCAAAAAATA 1 3667101 0 -6.36668 TTTATATCACCATGATAAATATG 1 3759677 0 -6.79324 TGAATTTTACCAATCGAAGTATT 1 3800735 0 -7.50384 TTTATTTTTACTATCAAAAATAG 1 3834349 1 -7.32949 TTATTTTTACTATCAAAAATAGC 1 3834350 1 -5.82953 TAAATTTCGCCATTATAAATAAC 1 3858294 0 -6.75379 TTTTTTTAAACATTAAAATTCTT 1 3885899 1 -7.589 TTTTTTTAAAGATTATAAATTAC 1 3885924 0 -7.21397 TCCATTTCACGATGAAAAAAATG 1 3912886 0 -4.47961 GTTTATTCATTGATCGAAATAAG 1 3913039 0 -5.17067 TATTATTTATGATTCAAAAACAT 1 3929400 1 -6.10717 TGAATTTTATCATTCATAATAAG 1 3983888 1 -6.78505 TGCATTTGATTATCGAAAAAATG 1 4005543 1 -7.52413 GCTTTTTTATTATTTAATAAATA 1 4041664 1 -7.63234 TGTAATTTATCGTCAAAAAATTG 1 4071227 1 -7.46529 TTATATTCAAGAATGAAAAATTT 1 4077093 0 -7.66596 TTTATTTCACCGTACCTAAAATT 1 4100233 0 -7.30407 TTAAATTCGATAAAAAAAATATG 1 4218234 0 -6.70315 GTTGTTTTATATTTGAAAAAATA 1 4248431 0 -7.18766 GATTTGTCGATTTTCAAAATATC 1 4274367 0 -7.45799 TTGTTTTTACCTTCCATAATATG 1 4350156 0 -7.29587 TTTTTCTTCTCTTCCGAAAAATC 1 4374021 1 -7.63234 TCTTTTTTAACAAAGAAAATAAT 1 4495543 0 -6.8775 CATATTTCATGATGAGAATTATG 1 4537762 0 -5.86405 *********************** Average: -27.3898 Std. Dev.: 4.53981