AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i AA/AA_operons009_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944235186 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 aq_609 300 hypothetical protein #1 thdF 145 thiophene and furan oxidation protein #2 aq_1137 29 putative protein #3 aq_1256 293 putative protein #4 himA 31 DNA binding protein HU #5 rpsA 66 ribosomal protein S01 #6 rpoD 38 RNA polymerase sigma factor RpoD #7 dnaG 66 DNA primase #8 rpsH 40 ribosomal protein S08 #9 rpsN 33 ribosomal protein S14 #10 rplN 145 ribosomal protein L14 #11 rpmA 77 ribosomal protein L27 #12 thrA 168 homoserine dehydrogenase #13 hflX 300 GTP-binding protein HflX #14 trxA1 300 thioredoxin #15 era1 62 GTP-binding protein Era #16 aq_1996 38 hypothetical protein #17 aq_2066 39 hypothetical protein #18 argB 73 acetylglutamate kinase #19 pepA 26 leucine aminopeptidase #20 gatC 297 glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit C #21 aq_2170 300 hypothetical protein Motif 1 GAAAGAAATGTCGCAATCCCTTATTGTAAGGG 0 29 0 GAAAGAAATGTCGCAATCCCTTATTGTAAGGG 0 96 0 TAAAGCAAAGTCGCAATCCCTTATTGTAAGGG 0 163 0 GGAAATTTTATCACGATCCCTTACTGTTAGGG 0 228 0 CCCGTGAGGGTTCGACTCCCTCCACCCCCACC 1 18 0 TCTACCATTTTCTACCTCCTTTCGTGAAATAA 3 60 0 TAAGAAATTCTTTTCCTTCTTTTAAGCCCTCT 3 89 0 TTTTGCCCTTTTCCCCTCCTTCAGTCCCATGG 3 169 0 TCAGTGAGCCTCCTTCTTAAGGAGAT 3 277 0 TCCCCTTCCCTTTCCCTTATAA 4 0 1 TGTAAAACATTCTCACTTCTTTTTCAAAGAGA 5 17 0 GGCTTTTCACCCCTTTAATTAGAGT 10 130 0 CTTTCACACCTCCTTTGCAAAAGAA 11 62 0 TCTTAAGTCCTTGTCCCCCTTTTAAAAATAAA 12 133 1 GTCCTGTATGTTAACTTCCCTTTGTTCCATAG 13 62 0 TTTATCAAGTTCATCCACCCTCTACTATGGTA 13 249 0 AGCTCTTCTCTTATCATCCTTC 14 0 0 CTCTTCGAGCTTTTCCTCGCTCAAAAGCTCTT 14 25 0 GTTCTTCCTCCTTTACAATTAATT 14 286 0 TTTCCACCTCCTTCTTTTTGTTTA 16 2 1 GGTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCCGCTCCACCA 20 168 0 AGAATAGAAATTATAATCCTTTTAAATGAAGG 20 251 1 TACGGGAAAATTAACCCTCTTTGGAGATATTT 21 108 1 ** ******** MAP Score: 23.9413 Motif 2 TCTTTCTATAAGTATAATATATTTCTTTAGTTA 1 105 0 CCCACCGCAAACTATAATAAATTAACACTTCTT 10 33 0 GCAAATTGATATTATAACAAATTTATGTTAGAA 10 94 0 TTCGTATCCGAGAATAAGAAATTCTTTTCCTTC 3 102 0 AGAATGTTTTACAATAAAAAATTCTGTCTGGAG 5 36 1 ACAGATCAGAAATAAAATAAATTCTTTTGAGTG 7 43 1 TTAACTTTAATAAATTTTTAGAGTTA 6 3 1 TCATTTTTGAAAATTAAGACATTTTATGCATTC 12 63 0 TTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTC 0 24 1 TTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGC 0 158 1 TTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTC 0 91 1 CTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAA 0 56 1 CTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAA 0 123 1 TGAAACCTTCATTTAAAAGGATTATAATTTCTA 20 255 0 CCTTTGCAAAAGAAAAAGTTATTCCTGGACAAC 11 43 0 TGAGTTTTATATATTAAATCATTAATTT 2 11 1 ATAGTTATAGACAAAAATTTATTTGATCTCCTT 3 252 1 CTCTTGTAAAAATTAAATTAATTCTTGA 13 282 1 AGGACTTAAGACTTAAACTAATTTTTATATGTT 12 111 0 CAAGTATAAAAGATACAGGACAAAG 12 2 1 CCCCCTTTTAAAAATAAAGGATAATTCTCTT 12 147 1 TAAAATGGTAAATTAAACATATAAAAATTAGTT 12 96 1 TGAAGATTTAAGAATAAATTATAACTTCCGTT 13 9 0 * ***** * *** MAP Score: 22.7057 Motif 3 TCTTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 63 1 AACAAAAAGAAGGAGGTGGAAA 16 1 0 TTAAATCTTCAGGAGGTTTGAGTTATGTATC 13 31 1 ATGGGACTGAAGGAGGGGAAAAGGGCAAAAA 3 171 1 TTTTAGAGTTAGGAGGTAAGAGA 6 25 1 ATTTCACGAAAGGAGGTAGAAAATGGTAGAG 3 62 1 TTCTTTAGTTAGGGGGTGTGGCGGAATTGGC 1 85 0 CTTTAACCTGACGGGGTGGGAAAGTGCCTTA 14 71 0 AGTATTTCTAACGAGGGGAAACAGGATAGTG 13 135 1 ACTTAGCTTCAGGAGGTAAAGTTAGGT 9 16 1 ACTCTAATTAAAGGGGTGAAAAGCC 10 130 1 AATATCTCCAAAGAGGGTTAATTTTCCCGTA 21 108 0 GCCGGCTTGAAGGAGGTTTGTA 8 28 1 CACGGGGCATAGTAGGTTGGAAGAGAGAAGG 14 205 1 TGTCGGAGGTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCCG 20 176 0 TTAATTGTAAAGGAGGAAGAAC 14 288 1 CTATTCTGTCAGTAGGGGCGGTAGCTCAGCT 20 227 0 TTATTTTTAAAAGGGGGACAAGGACTTAAGA 12 133 0 GGTTGGGTGGTGGGGGTGGAGGGAGTCGAAC 1 10 1 ******** ** MAP Score: 20.7234 Motif 4 GCAGGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCT 0 18 1 TCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCT 0 85 1 TCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGCT 0 152 1 CATACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATAAAATT 0 217 1 GGACTTAAAATCCCCTGGGCGAAAAGCCCGTGAGGGTTCG 1 36 0 AAAGCTCAGGTCCATGGGACTGAAGGAGGGGAAAAGGGCA 3 158 1 TTATTTGATCTCCTTAAGAAGGAGGCTCACTGA 3 270 1 AGGAAGGTATTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 4 0 AAGCCCAACTGCCGGCTTGAAGGAGGTTTGTA 8 18 1 AATAACTTTTTCTTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 53 1 GAGTTATGTATCCTATGGAACAAAGGGAAGTTAACATACA 13 50 1 TACACCATTCTCCTTGAAGTTGAAGGACAGCCTCACCTGA 13 190 1 GCACGCGGTTTCTACCATAGTAGAGGGTGGATGAACTTGA 13 237 1 GGCATAGTAGGTTGGAAGAGAGAAGGCTCGATTATATGCT 14 210 1 AGAGCCGGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAACGGCCTTTTAAG 20 116 0 GCTCTTAGCAGCTCAACTGGTGGAGCGGAGGGGACTCGAA 20 151 1 AGAGCGCCGATATGGCATGTCGGAGGTCGGGGGTTCGAGT 20 184 0 AGGGGCGGTAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCGATATGGCATG 20 205 0 GAAATTATAATCCTTTTAAATGAAGGTTTCAAGTATCTAT 20 257 1 CTTTTACTGCTCTTTGTAATTGAGGGACAGGTTTCTCTCA 21 224 0 *** * ***** * MAP Score: 20.0833 Motif 5 CATATCGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTACCGCC 20 210 1 ACTATTAAACCTTTCCCAGCCCAGCGTTTCTC 14 152 1 TTTTAAGGCACTTTCCCACCCCGTCAGGTTAA 14 68 1 ATAAGAAATTCTTTTCCTTCTTTTAAGCCCTC 3 90 0 CTTTCACACCTCCTTTGCAAAA 11 65 0 TTCGGGTGTACTTTCCCGTCGTTATGTTTATG 21 190 1 CGAGCCTTCTCTCTTCCAACCTACTATGCCCC 14 208 0 ATTTTTGCCCTTTTCCCCTCCTTCAGTCCCAT 3 171 0 ACCTAACTTTACCTCCTGAAGCTAAGTA 9 15 0 AAGGCCGTTGCTCTACCAACTGAGCTACCGGC 20 121 1 GTTCTTCCTCCTTTACAATTAAT 14 287 0 CTCTACCATTTTCTACCTCCTTTCGTGAAATA 3 61 0 GGCTTTTCACCCCTTTAATTAGAGT 10 130 0 AGTAGCAATTCTTTTACTGCTCTTTGTAATTG 21 242 0 TTGTAAAACATTCTCACTTCTTTTTCAAAGAG 5 18 0 TCTCTTACCTCCTAACTCTAAAA 6 25 0 CCACTATCCTGTTTCCCCTCGTTAGAAATACT 13 135 0 GAACGGAAGGGTTTACCTTCTGAAAGTTGACA 3 212 1 GTCTTAAGTCCTTGTCCCCCTTTTAAAAATAA 12 132 1 AACGCGAAGGTTTTTACAGCTCACTTTAGCCC 10 63 0 GTTTGAACCTGTTTAACAGCTCGTCCTGTATG 13 84 0 GGTTTAATAGTTCTCCCAGGTTTTTAACGCAC 14 131 0 GCTCTTCGAGCTTTTCCTCGCTCAAAAGCTCT 14 26 0 ******* *** MAP Score: 19.9547 Motif 6 GCAGGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTT 0 18 1 TCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTT 0 85 1 TCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGCTTT 0 152 1 CATACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATAAAATTTC 0 217 1 AGGAAGGTATTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 7 0 CAAGTATAAAAGATACAGGACAAAGGGTTAAAGGA 12 3 1 CCTTGTCCCCCTTTTAAAAATAAAGGATAATTCTCTT 12 141 1 GGAACAAAGGGAAGTTAACATACAGGACGAGCTGTTAAACAG 13 66 1 TCTAACGAGGGGAAACAGGATAGTGGGAAAGGTTCTCGACCA 13 141 1 CAAGCACGCGGTTTCTACCATAGTAGAGGGTGGATGAACTTG 13 234 1 CACCCCGTCAGGTTAAAGATTATAGGAATACTCATTGAGGGA 14 84 1 GAAAATCTACGAATTAATTGTAAAGGAGGAAGAAC 14 275 1 TTTCTGGAATCTATGAAAAATACGGGAAAATTAACCCTCTTT 21 88 1 * * *** *** * * MAP Score: 18.961 Motif 7 TTTAGTAAACGGAGGTTTTT 15 52 1 CCGGCTTGAAGGAGGTTTGTA 8 29 1 GAATTTCACGGAAAGGTTTTC 18 62 1 TTAGAAACGCGAAGGTTTTTACAGCTCACT 10 70 0 ATGAAGAACGGAAGGGTTTACCTTCTGAAA 3 207 1 TAAATCTTCAGGAGGTTTGAGTTATGTATC 13 32 1 GCTGGGCTGGGAAAGGTTTAATAGTTCTCC 14 147 0 AACTTGACACGAAAGGTTGTCCAGGAATAA 11 28 1 AGGATAGTGGGAAAGGTTCTCGACCACGAC 13 157 1 ATATCTTAAAGGAGAGTTTATCATCTTAAC 17 12 0 ACATTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCAC 0 62 0 ACATTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCAC 0 129 0 CCTTTTAAATGAAGGTTTCAAGTATCTATA 20 268 1 GTAAATTTGGGGAAATTTTATCACGATCCC 0 240 0 TTCGTAATTGGCAGGGTTGTACTTTACTAT 21 147 1 AAGAGCTGGCGGAATTTTTTAAGGCACTTT 14 52 1 GATTTCTTGAGAAAAGTTCTTTCTATAAGT 1 125 0 TTTTGGAATTTTTAGACCGCAGGA 21 4 1 AGGAAGGTATTATAAGGGAAA 4 20 0 AACGGAAGTTATAATTTATTCTT 13 3 1 ********** MAP Score: 16.3323 Motif 8 CGACTCCCTCCACCCCCACCACCCAACC 1 4 0 GATTTTAAGTCCCCCGCGTCTGCCAATTCCGCCA 1 64 1 TTGCCCTTTTCCCCTCCTTCAGTCCCATGGACCT 3 165 0 AGAAGGTAAACCCTTCCGTTCTTCATAAGTATTT 3 199 0 TCCCCTTCCCTTTCCCTTATAATACC 4 2 1 TAACTTCCTCCAGACAGAATTTTTT 5 51 0 TACAAACCTCCTTCAAGCCGGCAGTTGG 8 22 0 CGAGCCTTCTCTCTTCCAACCTACTATGCCCCGT 14 206 0 AAAAACCTCCGTTTACTAAACTTAATT 15 45 0 TTTCCACCTCCTTCTTTTTGTTTATCTA 16 4 1 GGGTTCGAGTCCCGCCCGGCTCACCATATAACTA 20 71 0 GCGGGACTCGAACCCGCGACCCACGGCTTAAAAG 20 90 1 GGGTTCGAGTCCCCTCCGCTCCACCAGTTGAGCT 20 160 0 AGGGGACTCGAACCCCCGACCTCCGACATGCCAT 20 179 1 AGCTGAGCTACCGCCCCTACTGACAGAATAGAAA 20 227 1 GACGCAAGGGCACCTCCTGCGGTCTAAAAATTCC 21 14 0 ******** * * MAP Score: 15.2679 Motif 9 GGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGAC 0 22 1 TTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCA 0 58 1 TGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGAC 0 89 1 TTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCA 0 125 1 TGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGAC 0 156 1 AATATAGTCGTTAGAAAAAGCACAAATACA 0 271 0 TTTACAATAATGCTCTTTGGA 3 1 1 GGTAGAGGGCTTAAAAGAAGGAAAAGAATT 3 86 1 TGAGAATGTTTTACAATAAAAAATTCTGTC 5 34 1 AATTGTTTAAAATAATTAAACTTGAC 11 6 1 GACGACAGGGTTAAGAAAATCTACGAATTA 14 261 1 AGGTTAAGATGATAAACTCTCCT 17 3 1 AAACCTTCATTTAAAAGGATTATAATTTCT 20 256 0 ACCCTGCCAATTACGAAAAGCCAGAAATAT 21 134 0 TGTCCCTCAATTACAAAGAGCAGTAAAAGA 21 235 1 GTTAAAATAAGATACTAAACG 21 289 0 ********** MAP Score: 13.6028 Motif 10 ATTTCTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCC 0 52 1 ATTTCTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCC 0 119 1 CCATGGACCTGAGCTTTTGAATTACAGGATT 3 144 0 GCCGGCAGTTGGGCTTTAAACCCC 8 3 0 GGGCTAAAGTGAGCTGTAAAAACCTTCGCGT 10 63 1 TTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 65 1 CATACAGGACGAGCTGTTAAACAGGTTCAAA 13 84 1 TAGAAACCGCGTGCTTGTAAATCAGGTGAGG 13 220 0 GGGTGGGAAAGTGCCTTAAAAAATTCCGCCA 14 58 0 TTAACCTGACGGGGTGGGAAAGTGCCTTAAA 14 69 0 AGGGAAAGCAGTGCGTTAAAAACCTGGGAGA 14 121 1 GAGAAACGCTGGGCTGGGAAAGGTTTAATAG 14 153 0 GTATCGAGAGGTGCTGAGAAACGCTGGGCTG 14 168 0 TATTAGTATATAGCTTTTAAATCTTGCTGTC 20 29 1 CTTTTAAATCTTGCTGTCAAATTATTTGATA 20 42 1 CAATTACAAAGAGCAGTAAAAGAATTGCTAC 21 242 1 ******* *** MAP Score: 13.2162 Motif 11 ATTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCACAGA 0 59 0 ATTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCACAGA 0 126 0 AAGAAGGAAAAGAATTTCTTATTCTCGGATA 3 100 1 GTTATAGACAAAAATTTATTTGATCTCCTTA 3 255 1 AAAAGAAGTGAGAATGTTTTACAATAAAAAA 5 26 1 TCCTCCAGACAGAATTTTTTATTGTAAAACA 5 40 0 CCTAACTCTAAAAATTTATTAAAGTTAA 6 7 0 CACTCAAAAGAATTTATTTTATTTCTGAT 7 47 0 TGCATTCATAAGTATTTCTTAATAGTCCTTT 12 39 0 ATGAATGCATAAAATGTCTTAATTTTCAAAA 12 61 1 CAACCATTACAGTATTTCTAACGAGGGGAAA 13 125 1 AAGAGCTGGCGGAATTTTTTAAGGCACTTTC 14 52 1 ATTAATTCGTAGATTTTCTTAACCCTGTCGT 14 262 0 AGTATGTATTATAGATACTTG 20 286 0 ******* *** MAP Score: 12.4332 Motif 12 TTTTAAATGCACAGAAAGAAATGTCGCAATCCCTT 0 39 0 TTTTAAATGCACAGAAAGAAATGTCGCAATCCCTT 0 106 0 TATTGAGAAAAAGATCTACTATTAGT 20 1 1 AGAGCTTTTGAGCGAGGAAAAGCTCGAAGAGCTGG 14 26 1 TATGTTTATGAGTGAGAGAAACCTGTCCCTCAATT 21 212 1 GGCTTAAAAGAAGGAAAAGAATTTCTTATTCTCGG 3 93 1 CTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAATG 0 56 1 CTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAATG 0 123 1 AATATATTATACTTATAGAAAGAACTTTTCTCAAG 1 115 1 GCCCTGCCTTACATACGGGAATTTCACGGAAAGGT 18 44 1 CCAATTACGAAAAGCCAGAAATATCTCCAAAGAGG 21 123 0 AGGAATACTCATTGAGGGAAAGCAGTGCGTTAAAA 14 107 1 AAGAATAGTTATAGACAAAAATTTATTTGATCTCC 3 248 1 CACACCCCCTAACTAAAGAAATATATTATACTTAT 1 96 1 CTTTTCTGGAATCTATGAAAAATACGGGAAAATTA 21 86 1 TCATAAACATAACGACGGGAAAGTACACCCGAACT 21 188 0 CAGTATTTCTAACGAGGGGAAACAGGATAGTGGGA 13 134 1 GGTAAATTAAACATATAAAAATTAGTTTAAGTCTT 12 102 1 * ** ***** ** MAP Score: 11.1489 Motif 13 TGCAGGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGAC 0 17 1 TTAAAAAAATTTCCCAATCAATGTTATGCCCTTAC 0 68 1 ATCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGAC 0 84 1 TTAAAAAAATTTCCCAATCAATGTTATGCCCTTAC 0 135 1 ATCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGAC 0 151 1 GCGTAACGTATGCCTTATCGCTTATTAAGTATTAT 0 194 0 GCATACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGAT 0 216 1 TCCCCTTCCCTTTCCCTTATAATACCTTCC 4 5 1 TAATATCAATTTGCCTTACTCTAATTAAAGGGGTG 10 113 1 TTAAGGCACTTTCCCACCCCGTCAGGTTAAAGATT 14 70 1 CCGCAGGAGGTGCCCTTGCGTCTTTATATCTGATT 21 26 1 ****** * * ** MAP Score: 10.2621 Motif 14 TTCTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAATG 0 54 1 TTCTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAATG 0 121 1 CGGGGACGGTGAAATTAAAAGCTTTTCTGGAATCTAT 21 65 1 AACGGAAGTTATAATTTATTCTTAAATCTTC 13 4 1 GACATTTTATGCATTCATAAGTATTTCTTAATAGTCC 12 42 0 GACACAGATCAGAAATAAAATAAATTCTTTTGAGTG 7 40 1 CCTCCTTTGCAAAAGAAAAAGTTATTCCTGGACAACC 11 42 0 CCAAAAGGAAAATATGATATATTCTTTATAAAGA 15 7 1 AGGGCTTAAAAGAAGGAAAAGAATTTCTTATTCTCGG 3 91 1 AAGGTTTCAAGTATCTATAATACATACT 20 279 1 AAACCTGGGAGAACTATTAAACCTTTCCCAGCCCAGC 14 140 1 AAACTCTTGTAAAAATTAAATTAATTCTTGA 13 279 1 AGCTTTTCTGGAATCTATGAAAAATACGGGAAAATTA 21 84 1 TGACAGAATAGAAATTATAATCCTTTTAAATGAAGGT 20 247 1 * * **** **** MAP Score: 7.2777 Motif 15 GCACAGAAAGAAATGTCGCAATCCCTTATT 0 36 0 GCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAATGTTA 0 64 1 GCACAGAAAGAAATGTCGCAATCCCTTATT 0 103 0 GCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAATGTTA 0 131 1 GATCGTGATAAAATTTCCCCAAATTTACTT 0 242 1 GTGGTCGAGAACCTTTCCCACTATCCTGTT 13 154 0 GTGCCTTAAAAAATTCCGCCAGCTCTTCGA 14 49 0 TTTTTTAAGGCACTTTCCCACCCCGTCAGG 14 66 1 GAACTATTAAACCTTTCCCAGCCCAGCGTT 14 150 1 ********** MAP Score: 6.77916 Motif 16 GCAGGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTT 0 18 1 TCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTT 0 85 1 TCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTG 0 152 1 CATACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATAAAA 0 217 1 ACCCTCACGGGCTTTTCGCCCAGGGGATTTTAAGTCCC 1 39 1 ATTGTATCTTTATTTCACGAAAGGAGGTAGAAAATGGT 3 51 1 CTTTAATAAATTTTTAGAGTTAGGAGGTAAGAGA 6 14 1 AAAGCCCAACTGCCGGCTTGAAGGAGGTTTGTA 8 17 1 TAAAATACTTAGCTTCAGGAGGTAAAGTTAGGT 9 5 1 CAATTTGCCTTACTCTAATTAAAGGGGTGAAAAGCC 10 119 1 GAATAACTTTTTCTTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 52 1 * ** ******* MAP Score: 6.36112 Motif 17 AGGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACA 0 20 1 AATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACA 0 87 1 AATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACT 0 154 1 TACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATA 0 219 1 CCCTCACGGGCTTTTCGCCCAGGGGATTTTAAG 1 40 1 GCTCTTTGGACTTGACACAAAGATTTTGAGATT 3 21 1 AATAATTAAACTTGACACGAAAGGTTGTCCAGG 11 20 1 ACAAAGGGAAGTTAACATACAGGACGAGCTGTT 13 69 1 AAACCGCGTGCTTGTAAATCAGGTGAGGCTGTC 13 215 0 GGAAGCCCTGCCTTACATACGGGAATTTCACGG 18 40 1 *** *** **** MAP Score: 6.2122 Motif 18 GGGTTCGACTCCCTCCACCCCCACCACCCA 1 13 0 TTCTTTTAAGCCCTCTACCATTTTCTACCT 3 75 0 TGCCCTTTTCCCCTCCTTCAGTCCCATGGA 3 168 0 TCCCCTTCCCTTTCCCTTATAATACCTTC 4 9 1 TACAAACCTCCTTCAAGCCGGCAGT 8 25 0 TCAGGTGAGGCTGTCCTTCAACTTCAAGGA 13 200 0 AGTTCATCCACCCTCTACTATGGTAGAAAC 13 244 0 TAACGCACTGCTTTCCCTCAATGAGTATTC 14 109 0 GAACTATTAAACCTTTCCCAGCCCAGCGTT 14 150 1 ATCGAGCCTTCTCTCTTCCAACCTACTATG 14 212 0 AGATGATAAACTCTCCTTTAAGATATTCAA 17 16 1 GAGTCCCCTCCGCTCCACCAGTTGAGCTGC 20 158 0 GCCATATCGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAC 20 208 1 GGACAGGTTTCTCTCACTCATAAACATAAC 21 210 0 TGAGAGAAACCTGTCCCTCAATTACAAAGA 21 224 1 ********** MAP Score: 4.11612 Motif 19 CATGGGACTGAAGGAGGGGAAAAGGGCAAA 3 170 1 CTTATGAAGAACGGAAGGGTTTACCTTCTG 3 204 1 ATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 0 0 TGTTAGAAACGCGAAGGTTTTTACAGCTCA 10 72 0 TAAACTTGACACGAAAGGTTGTCCAGGAAT 11 26 1 TTCTTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 62 1 AACGGAAGTTATAATTTATTC 13 1 1 TATGGAACAAAGGGAAGTTAACATACAGGA 13 63 1 CAGTATTTCTAACGAGGGGAAACAGGATAG 13 134 1 ACAGGATAGTGGGAAAGGTTCTCGACCACG 13 155 1 GTTCTCGACCACGACAGGTACACCATTCTC 13 172 1 TATATTAAAGACGACAGGGTTAAGAAAATC 14 252 1 AGTTTAGTAAACGGAGGTTTTT 15 50 1 CGGGAATTTCACGGAAAGGTTTTC 18 59 1 AACTGGTGGAGCGGAGGGGACTCGAACCCC 20 165 1 ********** MAP Score: 2.87724 Motif 20 CTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAAT 0 56 1 CTTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAAT 0 123 1 AAAAGCACAAATACAAGTAAATTTGGGGAAATTT 0 252 0 CACCCCCTAACTAAAGAAATATATTATACTTATA 1 98 1 TCACGAAAGGAGGTAGAAAATGGTAGAGGGCTTA 3 65 1 CTTAAAAGAAGGAAAAGAATTTCTTATTCTCGGA 3 95 1 GAGGGGAAAAGGGCAAAAATACTTATGAAGAACG 3 183 1 AAAGTTGACAATACAAGAATAGTTATAGACAAAA 3 234 1 GAATAGTTATAGACAAAAATTTATTTGATCTCCT 3 250 1 TACCTCCTAACTCTAAAAATTTATTAAAGTTAA 6 9 0 CTGTGTCAAGCTGAAGAAATACCTGTAAAATCAA 7 13 0 CAGATCAGAAATAAAATAAATTCTTTTGAGTG 7 44 1 ACGAAAGGTTGTCCAGGAATAACTTTTTCTTTTG 11 36 1 TTAAAGGACTATTAAGAAATACTTATGAATGCAT 12 37 1 TAAATTAAACATATAAAAATTAGTTTAAGTCTTA 12 104 1 CCTCCTGAAGATTTAAGAATAAATTATAACTTCC 13 13 0 AGAGCTTTTGAGCGAGGAAAAGCTCGAAGAGCTG 14 26 1 AAGACGACAGGGTTAAGAAAATCTACGAATTAAT 14 259 1 TATTGAGAAAAAGATCTACTATTAG 20 1 1 AATTACGAAAAGCCAGAAATATCTCCAAAGAGGG 21 122 0 TATGTTTATGAGTGAGAGAAACCTGTCCCTCAAT 21 212 1 ACAAAGAGCAGTAAAAGAATTGCTACTAAAATTC 21 247 1 ** ******* * MAP Score: 2.67665 Motif 21 ACAAGCGTGCAGGGTTATGCCCTTA 0 3 1 GGTTGGGTGGTGGGGGTGGAGGGAGT 1 4 1 CTGGGCGAAAAGCCCGTGAGGGTTCGACTCCC 1 30 0 AGGAGGTAGAAAATGGTAGAGGGCTTAAAAGA 3 72 1 AGGGCTTAAAAGAAGGAAAAGAATTTCTTATT 3 91 1 CAGGTCCATGGGACTGAAGGAGGGGAAAAGGG 3 164 1 ATACTTATGAAGAACGGAAGGGTTTACCTTCT 3 201 1 ATTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 1 0 TTTTAGAGTTAGGAGGTAAGAGA 6 25 1 CCCAACTGCCGGCTTGAAGGAGGTTTGTA 8 21 1 AATTAAACTTGACACGAAAGGTTGTCCAGGAA 11 23 1 TATTTTTAAAAGGGGGACAAGGACTTAAGACT 12 131 0 AGAAACGCTGGGCTGGGAAAGGTTTAATAGTT 14 151 0 TACTATATTAAAGACGACAGGGTTAAGAAAAT 14 249 1 TTATATGGTGAGCCGGGCGGGACTCGAACCCG 20 74 1 CTCAACTGGTGGAGCGGAGGGGACTCGAACCC 20 162 1 GCGCCGATATGGCATGTCGGAGGTCGGGGGTT 20 189 0 TGGAATTTTTAGACCGCAGGAGGTGCCCTTGC 21 13 1 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