AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i AA/AA_sum_all009_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944238696 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 aq_609 300 hypothetical protein #1 thdF 145 thiophene and furan oxidation protein #2 aq_1137 29 putative protein #3 aq_1256 293 putative protein #4 himA 31 DNA binding protein HU #5 rpsA 66 ribosomal protein S01 #6 rpoD 38 RNA polymerase sigma factor RpoD #7 dnaG 66 DNA primase #8 rpsH 40 ribosomal protein S08 #9 rpsN 33 ribosomal protein S14 #10 rplN 145 ribosomal protein L14 #11 rpmA 77 ribosomal protein L27 #12 thrA 168 homoserine dehydrogenase #13 hflX 300 GTP-binding protein HflX #14 trxA1 300 thioredoxin #15 era1 62 GTP-binding protein Era #16 aq_1996 38 hypothetical protein #17 aq_2066 39 hypothetical protein #18 argB 73 acetylglutamate kinase #19 pepA 26 leucine aminopeptidase #20 gatC 297 glutamyl-tRNA (Gln) amidotransferase subunit C #21 aq_2170 300 hypothetical protein Motif 1 GGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTT 0 21 1 ATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTT 0 88 1 ATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGCTTT 0 155 1 ACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATAAAATTTC 0 220 1 TAATATATTTCTTTAGTTAGGGGGTGTGGCGGAATTGGC 1 85 0 TGGTAGAGGGCTTAAAAGAAGGAAAAGAATTTCTTATTC 3 85 1 GTCCATGGGACTGAAGGAGGGGAAAAGGGCAAAAATACT 3 167 1 GGAAGGTATTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 1 0 ATAACTTTTTCTTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 54 1 AATCTTTAACCTGACGGGGTGGGAAAGTGCCTTAAAAAA 14 66 0 CCTCTCGATACTCAAGGCACGGGGCATAGTAGGTTGGAA 14 188 1 CCTTTTAAGCCGTGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCCCGG 20 86 0 CTCTTAGCAGCTCAACTGGTGGAGCGGAGGGGACTCGAA 20 152 1 TATGGCATGTCGGAGGTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCCGC 20 175 0 AATTTCTATTCTGTCAGTAGGGGCGGTAGCTCAGCTGGG 20 224 0 ** * * * *** * * MAP Score: 26.8088 Motif 2 CCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTTC 0 29 1 CCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTTC 0 96 1 CCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGCTTTA 0 163 1 GGTGGGGGTGGAGGGAGTCGAACCCTCACGGG 1 18 1 TTATTTCACGAAAGGAGGTAGAAAATGGTAGA 3 60 1 AGAGGGCTTAAAAGAAGGAAAAGAATTTCTTA 3 89 1 CCATGGGACTGAAGGAGGGGAAAAGGGCAAAA 3 169 1 ATCTCCTTAAGAAGGAGGCTCACTGA 3 277 1 TTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 0 0 TCTCTTTGAAAAAGAAGTGAGAATGTTTTACA 5 17 1 TACTCTAATTAAAGGGGTGAAAAGCC 10 129 1 TTCTTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 62 1 TTTATTTTTAAAAGGGGGACAAGGACTTAAGA 12 133 0 CTATGGAACAAAGGGAAGTTAACATACAGGAC 13 62 1 CAGTATTTCTAACGAGGGGAAACAGGATAGTG 13 134 1 TACCATAGTAGAGGGTGGATGAACTTGATAAA 13 249 1 GAAGGATGATAAGAGAAGAGCT 14 0 1 TCTTTAACCTGACGGGGTGGGAAAGTGCCTTA 14 71 0 AATTAATTGTAAAGGAGGAAGAAC 14 286 1 TAAACAAAAAGAAGGAGGTGGAAA 16 2 0 CCTTCATTTAAAAGGATTATAATTTCTATTCT 20 251 0 AAATATCTCCAAAGAGGGTTAATTTTCCCGTA 21 108 0 ******** ** MAP Score: 24.1912 Motif 3 GAAATGTCGCAATCCCTTATTGTAAGGGCATAA 0 24 0 TTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCACAGAAAG 0 56 0 GAAATGTCGCAATCCCTTATTGTAAGGGCATAA 0 91 0 TTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCACAGAAAG 0 123 0 GCAAAGTCGCAATCCCTTATTGTAAGGGCATAA 0 158 0 TAACTAAAGAAATATATTATACTTATAGAAAGA 1 105 1 AAATTAATGATTTAATATATAAAACTCA 2 11 0 GAAGGAAAAGAATTTCTTATTCTCGGATACGAA 3 102 1 AAGGAGATCAAATAAATTTTTGTCTATAACTAT 3 252 0 CTCCAGACAGAATTTTTTATTGTAAAACATTCT 5 36 0 TAACTCTAAAAATTTATTAAAGTTAA 6 3 0 CACTCAAAAGAATTTATTTTATTTCTGATCTGT 7 43 0 AAGAAGTGTTAATTTATTATAGTTTGCGGTGGG 10 33 1 TTCTAACATAAATTTGTTATAATATCAATTTGC 10 94 1 AATTGTTTAAAATAATTAAACTT 11 0 1 GTTGTCCAGGAATAACTTTTTCTTTTGCAAAGG 11 43 1 GAATGCATAAAATGTCTTAATTTTCAAAAATGA 12 63 1 AACATATAAAAATTAGTTTAAGTCTTAAGTCCT 12 111 1 TCAAGAATTAATTTAATTTTTACAAGAG 13 282 0 TAGAAATTATAATCCTTTTAAATGAAGGTTTCA 20 255 1 **** ***** * MAP Score: 21.3915 Motif 4 CTCCCTCCACCCCCACCACCCAACC 1 4 0 CTCTACCATTTTCTACCTCCTTTCGTGAAAT 3 62 0 ATAAGAAATTCTTTTCCTTCTTTTAAGCCCT 3 91 0 TTTTTGCCCTTTTCCCCTCCTTCAGTCCCAT 3 171 0 TCTCTTACCTCCTAACTCTAAAA 6 25 0 ACCTAACTTTACCTCCTGAAGCTAAGT 9 16 0 AACGCGAAGGTTTTTACAGCTCACTTTAGCC 10 64 0 CTTTCACACCTCCTTTGCAAA 11 66 0 CACTATCCTGTTTCCCCTCGTTAGAAATACT 13 135 0 TTTTATCAAGTTCATCCACCCTCTACTATGG 13 251 0 GCTCTTCGAGCTTTTCCTCGCTCAAAAGCTC 14 27 0 CCTTAAAAAATTCCGCCAGCTCTTCGAGCTT 14 45 0 TTTTAAGGCACTTTCCCACCCCGTCAGGTTA 14 68 1 GGTTTAATAGTTCTCCCAGGTTTTTAACGCA 14 132 0 ACTATTAAACCTTTCCCAGCCCAGCGTTTCT 14 152 1 CGAGCCTTCTCTCTTCCAACCTACTATGCCC 14 209 0 GTTCTTCCTCCTTTACAATTAA 14 288 0 TTTCCACCTCCTTCTTTTTGTT 16 1 1 AAGGCCGTTGCTCTACCAACTGAGCTACCGG 20 121 1 CATATCGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTACCGC 20 210 1 AGTAGCAATTCTTTTACTGCTCTTTGTAATT 21 243 0 **** ****** MAP Score: 19.9262 Motif 5 CAGGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTT 0 19 1 CAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTT 0 86 1 CAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGCTT 0 153 1 ATACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATAAAATTT 0 218 1 AAGCTCAGGTCCATGGGACTGAAGGAGGGGAAAAGGGCAA 3 159 1 GGGCAAAAATACTTATGAAGAACGGAAGGGTTTACCTTCT 3 193 1 GGCTTTTCACCCCTTTAATTAGAGTAAGGCAAATTGATAT 10 115 0 AGTTATGTATCCTATGGAACAAAGGGAAGTTAACATACAG 13 51 1 ACACCATTCTCCTTGAAGTTGAAGGACAGCCTCACCTGAT 13 191 1 GAAACCGCGTGCTTGTAAATCAGGTGAGGCTGTCCTTCAA 13 209 0 TAAGAGAAGAGCTTTTGAGCGAGGAAAAGCTCGAAGAGCT 14 19 1 AGAGCAACGGCCTTTTAAGCCGTGGGTCGCGGGTTCGAGT 20 95 0 TAAAGTACAACCCTGCCAATTACGAAAAGCCAGAAATATC 21 133 0 TTTTACTGCTCTTTGTAATTGAGGGACAGGTTTCTCTCAC 21 223 0 ** * * * *** ** MAP Score: 19.5293 Motif 6 TTCGACTCCCTCCACCCCCACCACCCAACC 1 8 0 CCAATTCCGCCACACCCCCTAACTAAAGAAAT 1 86 1 TCTACCATTTTCTACCTCCTTTCGTGAAATAA 3 60 0 TTCCTTCTTTTAAGCCCTCTACCATTTTCTAC 3 77 0 TTTTGCCCTTTTCCCCTCCTTCAGTCCCATGG 3 169 0 AACGGAAGGGTTTACCTTCTGAAAGTTGACAA 3 213 1 TCAGTGAGCCTCCTTCTTAAGGAGAT 3 277 0 TCTCTTACCTCCTAACTCTAAAAAT 6 23 0 TACAAACCTCCTTCAAGCCGGCAG 8 26 0 ACCTAACTTTACCTCCTGAAGCTAAGTAT 9 14 0 GGCTTTTCACCCCTTTAATTAGAGTAA 10 128 0 CTTTCACACCTCCTTTGCAAAAGAAA 11 61 0 ATACATAACTCAAACCTCCTGAAGATTTAAGA 13 29 0 ACTATCCTGTTTCCCCTCGTTAGAAATACTGT 13 133 0 ATCAAGTTCATCCACCCTCTACTATGGTAGAA 13 246 0 AAGGCACTTTCCCACCCCGTCAGGTTAAAGAT 14 72 1 TCCAACCTACTATGCCCCGTGCCTTGAGTATC 14 194 0 TTTCCACCTCCTTCTTTTTGTTTA 16 2 1 GGAGGGGACTCGAACCCCCGACCTCCGACATG 20 177 1 AAGACGCAAGGGCACCTCCTGCGGTCTAAAAA 21 18 0 TACGGGAAAATTAACCCTCTTTGGAGATATTT 21 108 1 * ******** * MAP Score: 19.3558 Motif 7 GCAGGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCT 0 18 1 TCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCT 0 85 1 TCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGCT 0 152 1 CATACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATAAAATT 0 217 1 AGGAAGGTATTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 9 0 CAAGTATAAAAGATACAGGACAAAGGGTTAAAG 12 3 1 CCTTGTCCCCCTTTTAAAAATAAAGGATAATTCTCTT 12 141 1 GGAACAAAGGGAAGTTAACATACAGGACGAGCTGTTAAAC 13 66 1 CACCCCGTCAGGTTAAAGATTATAGGAATACTCATTGAGG 14 84 1 GAAAATCTACGAATTAATTGTAAAGGAGGAAGAAC 14 275 1 AACTTGAATATCTTAAAGGAGAGTTTATCATCT 17 16 0 TTTCTGGAATCTATGAAAAATACGGGAAAATTAACCCTCT 21 88 1 GAACTGCCACGTATGTATAGTAAAGTACAACCCTGCCAAT 21 153 0 * ** ** **** * MAP Score: 19.0594 Motif 8 TACCATTTTCTACCTCCTTTCGTGAAATAA 3 60 0 TTGCCCTTTTCCCCTCCTTCAGTCCCATGG 3 169 0 AGAAGGTAAACCCTTCCGTTCTTCATAAGT 3 203 0 TCAGTGAGCCTCCTTCTTAAGGAGAT 3 277 0 TCCCCTTCCCTTTCCCTTATAA 4 2 1 AAAACATTCTCACTTCTTTTTCAAAGAGAT 5 16 0 TAACTTCCTCCAGACAGAATT 5 55 0 TACAAACCTCCTTCAAGCCGGCAG 8 26 0 CTTTCACACCTCCTTTGCAAAAGAAA 11 61 0 AATAAATTATAACTTCCGTT 13 0 0 CCTGTATGTTAACTTCCCTTTGTTCCATAG 13 62 0 GTTCTTCCTCCTTTACAATTAATT 14 286 0 AAAAACCTCCGTTTACTAAACTT 15 49 0 TTTCCACCTCCTTCTTTTTGTTTA 16 4 1 AAGATGATAAACTCTCCTTTAAGATATTCA 17 15 1 GGGTTCGAGTCCCCTCCGCTCCACCAGTTG 20 164 0 GACGCAAGGGCACCTCCTGCGGTCTAAAAA 21 18 0 ********** MAP Score: 16.8724 Motif 9 TTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTTC 0 24 1 TTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTTC 0 91 1 TTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGCTTTA 0 158 1 TTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATAAAATTTCC 0 223 1 TTTGGACTTGACACAAAGATTTTGAGATTGTATCTTT 3 25 1 TCTTTATTTCACGAAAGGAGGTAGAAAATGGTAGAGG 3 57 1 AGGTATTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 0 0 GCCTTACTCTAATTAAAGGGGTGAAAAGCC 10 125 1 AAGTTAACATACAGGACGAGCTGTTAAACAGGTTCAA 13 77 1 GAAGGATGATAAGAGAAGAGCTTTTGAGCGAGGAAAA 14 10 1 ATAATCTTTAACCTGACGGGGTGGGAAAGTGCCTTAA 14 70 0 AGGTGCTGAGAAACGCTGGGCTGGGAAAGGTTTAATA 14 154 0 TATATTAAAGACGACAGGGTTAAGAAAATCTACGAAT 14 252 1 AGATAAACAAAAAGAAGGAGGTGGAAA 16 0 0 ** * *** * * ** MAP Score: 16.4383 Motif 10 CTCCCTCCACCCCCACCACCCAACC 1 0 0 GGAGTCGAACCCTCACGGGCTTTTCGCCCAGGGGA 1 31 1 ATAAGAAATTCTTTTCCTTCTTTTAAGCCCTCTAC 3 87 0 TATTTTTGCCCTTTTCCCCTCCTTCAGTCCCATGG 3 169 0 AGAAGGTAAACCCTTCCGTTCTTCATAAGTATTTT 3 198 0 TCTCTTACCTCCTAACTCTAAAAATT 6 22 0 CTGTAAAAACCTTCGCGTTTCTAACATAAATTTGT 10 76 1 AAAAGTTATTCCTGGACAACCTTTCGTGTCAAGTT 11 28 0 GTCTTAAGTCCTTGTCCCCCTTTTAAAAATAAAGG 12 132 1 TGGTCGAGAACCTTTCCCACTATCCTGTTTCCCCT 13 148 0 TGAAGGACAGCCTCACCTGATTTACAAGCACGCGG 13 210 1 ATTCCGCCAGCTCTTCGAGCTTTTCCTCGCTCAAA 14 32 0 TTTTAAGGCACTTTCCCACCCCGTCAGGTTAAAGA 14 68 1 ACTATTAAACCTTTCCCAGCCCAGCGTTTCTCAGC 14 152 1 CGAGCCTTCTCTCTTCCAACCTACTATGCCCCGTG 14 205 0 GTTCTTCCTCCTTTACAATTAATTCG 14 284 0 CTTCAGGAAGCCCTGCCTTACATACGGGAATTTCA 18 35 1 GGGTTCGAGTCCCGCCCGGCTCACCATATAACTAT 20 70 0 AAGGCCGTTGCTCTACCAACTGAGCTACCGGCTCT 20 121 1 GGGTTCGAGTCCCCTCCGCTCCACCAGTTGAGCTG 20 159 0 GCGGAGGGGACTCGAACCCCCGACCTCCGACATGC 20 175 1 CATATCGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTACCGCCCCT 20 210 1 **** ** ** * * MAP Score: 14.8741 Motif 11 TTTAGTAAACGGAGGTTTTT 15 52 1 CCGGCTTGAAGGAGGTTTGTA 8 29 1 GAATTTCACGGAAAGGTTTTC 18 62 1 TAAATCTTCAGGAGGTTTGAGTTATGTATC 13 32 1 TATGAAGAACGGAAGGGTTTACCTTCTGAA 3 206 1 AGGAAGGTATTATAAGGGAAA 4 20 0 TTAGAAACGCGAAGGTTTTTACAGCTCACT 10 70 0 GCTGGGCTGGGAAAGGTTTAATAGTTCTCC 14 147 0 AGGATAGTGGGAAAGGTTCTCGACCACGAC 13 157 1 AACTTGACACGAAAGGTTGTCCAGGAATAA 11 28 1 ATATCTTAAAGGAGAGTTTATCATCTTAAC 17 12 0 ACATTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCAC 0 62 0 ACATTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCAC 0 129 0 GTAAATTTGGGGAAATTTTATCACGATCCC 0 240 0 AACGGAAGTTATAATTTATTCTT 13 3 1 CCTTTTAAATGAAGGTTTCAAGTATCTATA 20 268 1 CTTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 64 1 AAGAGCTGGCGGAATTTTTTAAGGCACTTT 14 52 1 TTCGTAATTGGCAGGGTTGTACTTTACTAT 21 147 1 GATTTCTTGAGAAAAGTTCTTTCTATAAGT 1 125 0 TTTTGGAATTTTTAGACCGCAGGA 21 4 1 ********** MAP Score: 14.4876 Motif 12 AACATTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCA 0 63 0 AACATTGATTGGGAAATTTTTTTAAATGCA 0 130 0 AGTAAATTTGGGGAAATTTTATCACGATCC 0 241 0 ACTGAAGGAGGGGAAAAGGGCAAAAATACT 3 176 1 TTATGAAGAACGGAAGGGTTTACCTTCTGA 3 205 1 GGTATTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 6 0 TTTTAAAAGGGGGACAAGGACTTAAGACTT 12 130 0 ACAGGATAGTGGGAAAGGTTCTCGACCACG 13 155 1 CTGACGGGGTGGGAAAGTGCCTTAAAAAAT 14 65 0 ACGCTGGGCTGGGAAAGGTTTAATAGTTCT 14 149 0 GGGAATTTCACGGAAAGGTTTTC 18 60 1 GATTACTACGGGGACGGTGAAATTAAAAGC 21 57 1 TGAAAAATACGGGAAAATTAACCCTCTTTG 21 101 1 TTGTAATTGAGGGACAGGTTTCTCTCACTC 21 221 0 ********** MAP Score: 13.8336 Motif 13 GGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACA 0 21 1 TTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAA 0 57 1 ATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACA 0 88 1 TTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAA 0 124 1 ATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACT 0 155 1 ACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATA 0 220 1 TTTACAATAATGCTCTTTGGAC 3 0 1 TGGTAGAGGGCTTAAAAGAAGGAAAAGAATTT 3 85 1 GTATTGTCAACTTTCAGAAGGTAAACCCTTCC 3 216 0 TTAACTTTAATAAATTTTTAGAGTTA 6 4 1 TCAATACTGGCTTAAAGAAGTGTTAATTTATT 10 19 1 CCACCGCAAACTATAATAAATTAACACTTCTT 10 33 0 CTTCGCGTTTCTAACATAAATTTGTTATAATA 10 86 1 AATTGTTTAAAATAATTAAACTTGACA 11 5 1 AATGTCTTAATTTTCAAAAATGATAAAATGGT 12 73 1 GGACTTAAGACTTAAACTAATTTTTATATGTT 12 111 0 TAATTTAATTTTTACAAGAGTTTTATCAAGTT 13 270 0 TTATAATCCTTTTAAATGAAGGTTTCAAGTAT 20 261 1 ****** **** MAP Score: 13.4069 Motif 14 GCGACTTTGCTTTATAATACTTAATAAGCGATA 0 181 1 AATTGTTTAAAATAATTAAACTTGACAC 11 5 1 AAAACCTCCGTTTACTAAACTTAATTTTCTTTA 15 38 0 ACTCTAAAAATTTATTAAAGTTAA 6 1 0 ACTAAAGAAATATATTATACTTATAGAAAGAAC 1 107 1 AAATTGATATTATAACAAATTTATGTTAGAAAC 10 92 0 GAAGTGTTAATTTATTATAGTTTGCGGTGGGCT 10 35 1 TTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAAT 0 124 1 TTTCTGTGCATTTAAAAAAATTTCCCAATCAAT 0 57 1 TAAACTCTCCTTTAAGATATTCAAGTT 17 22 1 TTATAAAGAATATATCATATTTTCCTTTTGG 15 8 0 CATTTTATCATTTTTGAAAATTAAGACATTTTA 12 70 0 AATGATTTAATATATAAAACTCAC 2 1 0 GCTGTCAAATTATTTGATAGTTATATGGTGAGC 20 54 1 AGGGTTGTACTTTACTATACATACGTGGCAGTT 21 159 1 **** *** *** MAP Score: 11.3636 Motif 15 CAGGGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCG 0 19 1 CAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCG 0 86 1 CAATGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCG 0 153 1 ATACGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTG 0 218 1 CCGCCACACCCCCTAACTAAAGAAATATATT 1 92 1 CCTTCCCTTTCCCTTATAATACCTTCCT 4 13 1 TCTCTTACCTCCTAACTCTAAAAATTTATT 6 18 0 ACCTAACTTTACCTCCTGAAG 9 22 0 ATATCAATTTGCCTTACTCTAATTAAAGGGG 10 115 1 CAGGGAACAACCATTACAGTATTTCTAACGA 13 118 1 ******** ** MAP Score: 11.2692 Motif 16 GGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACAT 0 22 1 TGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACAT 0 89 1 TGTTATGCCCTTACAATAAGGGATTGCGACTT 0 156 1 TATTAAGTATTATAAAGCAAAGTCGCAATCCC 0 175 0 CGTTACGCCCTAACAGTAAGGGATCGTGATAA 0 221 1 AATATATTTCTTTAGTTAGGGGGTGTGGCGGA 1 91 0 TGTATCTTTATTTCACGAAAGGAGGTAGAAAA 3 53 1 TATTATAAGGGAAAGGGAAGGGGA 4 2 0 TTTGCCTTACTCTAATTAAAGGGGTGAAAAGC 10 122 1 TAATTAAACTTGACACGAAAGGTTGTCCAGGA 11 22 1 GTCCCCCTTTTAAAAATAAAGGATAATTCTCT 12 145 1 TTACAGTATTTCTAACGAGGGGAAACAGGATA 13 131 1 CCATTCTCCTTGAAGTTGAAGGACAGCCTCAC 13 194 1 AATTCCCGTATGTAAGGCAGGGCTTCCTGAAG 18 35 0 CATACGGGAATTTCACGGAAAGGTTTTC 18 55 1 ATTTCTATTCTGTCAGTAGGGGCGGTAGCTCA 20 230 0 TTATAATCCTTTTAAATGAAGGTTTCAAGTAT 20 261 1 ACGGGGACGGTGAAATTAAAAGCTTTTCTGGA 21 64 1 TACTGCTCTTTGTAATTGAGGGACAGGTTTCT 21 228 0 * *** ****** MAP Score: 10.4728 Motif 17 CTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTTCT 0 31 1 CTTACAATAAGGGATTGCGACATTTCTTTCT 0 98 1 CTTACAATAAGGGATTGCGACTTTGCTTTAT 0 165 1 GGTTGGGTGGTGGGGGTGGAGGGAGT 1 5 1 AAAAGCCCGTGAGGGTTCGACTCCCTCCACC 1 24 0 TCTTTAGTTAGGGGGTGTGGCGGAATTGGCA 1 84 0 CCATGGGACTGAAGGAGGGGAAAAGGGCAAA 3 169 1 CCTTCAAGCCGGCAGTTGGGCTTTAAACCCC 8 10 0 CTTTTGCAAAGGAGGTGTGAAAG 11 64 1 TAAATCTTCAGGAGGTTTGAGTTATGTATCC 13 32 1 GGGGAAACAGGATAGTGGGAAAGGTTCTCGA 13 149 1 CATAGTAGAGGGTGGATGAACTTGATAAAAC 13 252 1 ACAAAAAGAAGGAGGTGGAAA 16 0 0 CTTACATACGGGAATTTCACGGAAAGGTTTT 18 51 1 GCCGTGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGCCCGG 20 86 0 TAGCTCAGTTGGTAGAGCAACGGCCTTTTAA 20 117 0 CAGCTCAACTGGTGGAGCGGAGGGGACTCGA 20 159 1 GTCGGAGGTCGGGGGTTCGAGTCCCCTCCGC 20 175 0 TAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCGATATGGCAT 20 206 0 ATACATACGTGGCAGTTCGGGTGTACTTTCC 21 175 1 ** ******** MAP Score: 9.36727 Motif 18 GCGTGCAGGGTTATGCCCTTACAATAAGGG 0 14 1 CCAATCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGG 0 81 1 CCAATCAATGTTATGCCCTTACAATAAGGG 0 148 1 CCAGGGGATTTTAAGTCCCCCGCGTCTGCC 1 58 1 TTTCCTTCTTTTAAGCCCTCTACCATTTTC 3 80 0 TCATAAGTATTTTTGCCCTTTTCCCCTCCT 3 181 0 AAAATTTATTTGATCTCCTTAAGAAGGAGG 3 265 1 GGCTTTTCACCCCTTTAATTAGAGT 10 130 0 AGTTTAAGTCTTAAGTCCTTGTCCCCCTTT 12 125 1 ********** MAP Score: 5.49312