AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i AG/AG_operons004_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944242022 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 AF0025 300 cyanate transport protein (cynX) #1 AF0074 261 biotin operon repressor/biotin--[acetyl CoA carboxylase] ligase (birA) #2 AF0075 26 conserved hypothetical protein #3 AF0154 139 conserved hypothetical protein #4 AF0155 62 A. fulgidus predicted coding region AF0155 #5 AF0157 99 molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit #6 AF0176 58 molybdopterin oxidoreductase, molybdopterin binding subunit #7 AF0177 300 tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E (fwdE) #8 AF0499 300 molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit #9 AF0813 72 phosphoglycerate dehydrogenase (serA) #10 AF0950 177 carbon monoxide dehydrogenase, iron sulfur subunit (cooF) #11 AF1186 139 conserved hypothetical protein #12 AF1189 283 A. fulgidus predicted coding region AF1189 #13 AF1191 32 dihydroxynaphthoic acid synthase (menB) #14 AF1192 50 conserved hypothetical protein #15 AF1195 27 activator 1, replication factor C, 53 KD subunit #16 AF1196 65 N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase (mer-2) #17 AF1197 300 3-ketoacyl-CoA thiolase (fadA-2) #18 AF1205 53 pantothenate permease (panF-2) #19 AF1208 165 conserved hypothetical protein #20 AF1210 108 conserved hypothetical protein #21 AF1778 105 stage V sporulation protein (spoVG) #22 AF1779 57 2-hydroxyacid dehydrogenase, putative #23 AF1822 49 serine/threonine phosphatase (ppa) #24 AF1823 73 F420H2:quinone oxidoreductase, 16.5 kDa subunit, putative #25 AF1928 142 tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D (fwdD-2) #26 AF2278 49 pyruvate formate-lyase activating enzyme (act-4) #27 AF2281 66 aldehyde ferredoxin oxidoreductase (aor-4) #28 AF2371 170 A. fulgidus predicted coding region AF2371 #29 AF2374 159 A. fulgidus predicted coding region AF2374 #30 AF2377 115 conserved hypothetical protein #31 AF2378 47 conserved hypothetical protein #32 AF2383 33 conserved hypothetical protein #33 AF2384 190 molybdopterin oxidoreductase, molybdopterin binding subunit Motif 1 TAGGCCAACCAAAAACTTTTTAAATTTAGG 3 102 1 GATATATAAAAAAAACTTTTAATAAACACT 25 34 1 AGACTTCCTCAAAAACTTTTGGTGATAGG 25 123 1 CTTTTACGATAAAAACTTTTACTCGTCCAC 9 22 0 GGGCAGAGCTAAAAACTTTTACGATAAAAA 9 37 0 CTTTTGCTTCAAAACCTTTTTATCTTTTCT 22 22 1 TCAGTAAGTCAATAACTTTTATCAATATTT 0 264 1 TAATCTTAATAAACCCTTTTTTCCTCAAGC 1 225 0 TTCTCTCTTAAATACCTTTTTTACCGGTTT 20 27 1 GCTGAGGTATATAAACTTTTGTAATGTTTG 11 105 0 GTAATAACCTATAAACTTTTTGCAATTTCC 33 107 1 ATTTTAGGGAAAAACCTTATGACCTTGCCA 6 24 1 TGTTAAATATAAACACTGTTAGGTAACAGT 3 28 0 TCACCACCCCAAACACTGTTACCTAACAGT 3 14 1 TAAAATGCTGAATATCTTTTTTCTCAGAAT 12 56 0 TTAAAGCTTTTAACACTTTTCAATAGATTG 12 109 0 AACAATTCGAAAAATCTGTTAAAGAAAAGG 19 31 0 ACATACTTAAATTAACTTTTTTGAAGCTAA 19 142 1 CCTTAAAGCATATAACTTTTCGGATTGCCT 31 15 0 TTAATTTCCAAAACCCTTATATTTTATCAA 5 31 1 TACATAAGCCAAAATCTTATAATAACCATT 8 120 1 TTAGCTTATATTAACCTTTTGCTTTTTTAT 8 222 0 CACTCAGCAGTATATCTTTTTTATTGTCGG 0 70 1 ATTTGTAGTATTTACCTTTTCTTTAACAGA 19 17 1 ********** MAP Score: 25.2324 Motif 2 TTTTAATTTTTATTTTTTCCAACAGATAG 16 6 1 CTTCAAAACCTTTTTATCTTTTCTGGGTTCAAT 22 28 1 TTTTTTATTTTTATTTTTTAAAT 30 0 1 TTATTTTTATTTTTTAAATTTTAAACAATCCTC 30 14 1 AATAATTTTCTTTTTGTCTTTTAAGTGATTAGC 33 42 1 ACAGTGTTTTTTTGATTTTATTTAATAAGA 33 170 0 ACCTATAAACTTTTTGCAATTTCCACGTTATTT 33 113 1 CTATTTGTAGTATTTACCTTTTCTTTAACAGAT 19 15 1 TTGGTGAAGATTTTTCAGATTTACCTACGCTTG 10 61 0 TTTTTCGTTTTTTTTACGGTGTT 5 0 1 TTTTTTTCATATTCGAAGATTTTA 4 1 1 AAAATTTTTAGTATATCCTTTTACCA 2 4 1 ATTAAAAGTTTTTTTTATATATCCAGCGCGCTT 25 24 0 GGCAATATTATTTTTATTATATCACACTTCTTT 11 15 1 TATATTAACCTTTTGCTTTTTTATTCGATTCTG 8 213 0 ATTTCCACGTTATTTATAATTTCATCAGCACCG 33 131 1 ACCTCAAGACTTTTAGGCTTTTCTAAAAAACGG 30 46 0 CAAGTAGCATTTATTAAATTTTCAGTCAACTAC 23 22 1 CCTCCTTCACTTTTTTCTTATTAAAATACCATC 17 271 0 ATAACAGCTCTTTTGAAATTATCATCCCGGAGG 17 176 1 ***** ***** MAP Score: 15.2878 Motif 3 TACTTTTTTGTAATACAAAATTAAAAATCGAAGAGAGG 1 38 0 AAAAGCCCAATTAACCCACCTTAAAAATGGGCCCGCGG 1 116 1 TGGTAAAAGGATATACTAAAAATTTT 2 3 0 AAAACCGATTTTAGGCCAACCAAAAACTTTTTAAATTT 3 91 1 CGTTATGTTTAGGATAGCCTAAATTTAAAAAGTTTT 3 113 0 GATTTTGGCTTATGTATAGAGGAAAACTTTAAATATAA 8 98 0 GTCTGCGGACTTAGGAGAGCCAAAATATATCGAAAAAT 8 171 0 AAGCAAAAGGTTAATATAAGCTAAATATACAGCAGACA 8 228 1 CAGGCAAGCGTAGGTAAATCTGAAAAATCTTCACCAAT 10 57 1 ACTTTTTTCATACGACTAATAAAAAAATATTCTGAGAA 12 28 1 TAACTATCTGTTGGAAAAAATAAAAATTAAAA 16 4 0 CCGGATGGTATTTTAATAAGAAAAAAGTGAAGGAGGTG 17 268 1 CGAGCTTCGCTTGAACAATTCGAAAAATCTGTTAAAGA 19 36 0 CGTTCTCTTTTTGGGCGAGGAGAAAAATAATAGTCTTT 25 67 0 CCTCCGTTTTTTAGAAAAGCCTAAAAGTCTTGAGGTCA 30 43 1 ATTTTAGGCAATCCGAAAAGTTATATGCTTT 31 3 1 TAATCACTTAAAAGACAAAAAGAAAATTATTAAATTTG 33 35 0 ** * * * **** * MAP Score: 13.8632 Motif 4 TTTAAAAAGTTTTTGGTTGGCCTAAAATCGGTTTTG 3 90 0 ACTTTTTAAATTTAGGCTATCCTAAACATAACG 3 116 1 TTTCGATATATTTTGGCTCTCCTAAGTCCGCAGACG 8 174 1 TTGGTATGTATTTGAGAATTGGTGAAGATTTTTCAG 10 76 0 CAATTCCTGATTGGGGATATTTTAAAGCTTTTAACA 12 124 0 CCGGTAGTTATTGGGGGGTGGATGAAAGAATGCAAT 12 205 1 CTATACTAAATTAAAGTAGTCTTAAATTTTTCGTTC 12 244 0 GCAGAGAAAGTTCTGGACTTCCGGAAGGCACTGGCC 17 35 1 AGATTGGTGTTTACGGTTTTGATGAGCAAACGAAGA 17 89 1 GTCCTCAACGTTACGTCCTTCATGAAGCGCTAAGAG 17 133 0 GGACGTAACGTTGAGGACGTGTTGAATAACAGCTCT 17 151 1 CCGTTCTCTTTTTGGGCGAGGAGAAAAATAATAGTC 25 70 0 CCAAAAGTTTTTGAGGAAGTCTTAACAAATACTATT 25 109 0 CCTCAAGACTTTTAGGCTTTTCTAAAAAACGGAGGA 30 42 0 GCATATAACTTTTCGGATTGCCTAAAAT 31 2 0 AATAAGAACTTTGCGGTGCTGATGAAATTATAAATA 33 141 0 ** ** ** **** MAP Score: 12.984 Motif 5 TTTTTCGTTTTTTTTACGGTGTTAA 5 0 1 TTTTAATTTTTATTTTTTCCAACAG 16 0 1 TTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTTT 30 1 1 ACAGTGTTTTTTTGATTTTATTTAATAAGAACT 33 167 0 GCATTATGCATTTTTGATTGCATTTTCAAAACCGA 3 64 1 CTCTCTTCGATTTTTAATTTTGTATTACAAAAAAG 1 39 1 TATTATAAGATTTTGGCTTATGTATAGAGGAAAAC 8 109 0 ATTTAATAATTTTCTTTTTGTCTTTTAAGTGATTA 33 38 1 TAGTCTTAAATTTTTCGTTCCATATTGCATTCTTT 12 229 0 AACTCATTAGCTTTAAATTATTTTTGAACGGTGTT 7 264 0 CAGCAAACTATTTTAATTTGCCTTAAACATTAGAG 26 12 0 CAATTTTTCCTAATATTTTAGGGAAAAA 6 3 1 TCATCTAAAATTTTCAATACTTTTTTCATACGACT 12 10 1 AACAGGGAGATTTCTCATTACTTATACTTTAACTA 16 36 0 TTATATTAACCTTTTGCTTTTTTATTCGATTCTGA 8 212 0 CTAACCCTCCTTTCAAATTTCGTTACTCTCAAACA 21 78 0 TATTTGTAGTATTTACCTTTTCTTTAACAGATTTT 19 16 1 ATATCAGTTTTGACTACTATTATTGTCCCCGA 29 7 1 GCATATAACTTTTCGGATTGCCTAAAAT 31 3 0 TTTAAGTATGTTTTCAATATCATTACATATCATTA 19 118 0 TCTGCTGTATATTTAGCTTATATTAACCTTTTGCT 8 229 0 **** ** * *** MAP Score: 12.1493 Motif 6 TTAAACTTTGCCAAAAGCGCGCTGGA 25 5 1 CAACATCTACCTTTTCCCTAAAATCTTCGAA 4 21 0 AACCCTACTTCGCCTTAAAGCATATAAC 31 29 0 GAACTCTTTTCCAAAATAAAGGTAAG 28 154 0 AACCTTATGACCTTGCCAAAAAGACACTATT 6 36 1 AAAGAAAGAGCTTCTCCGAAAATCCATTCAT 28 98 1 TTATTTTTCTCCTCGCCCAAAAAGAGAACGG 25 75 1 TAGTATTTACCTTTTCTTTAACAGATTTTTC 19 22 1 CCGATTACGGCTTTTCTGTAAACTTCAAATT 8 269 0 GACTTTTAGGCTTTTCTAAAAAACGGAGGAT 30 41 0 GGTCATAAGGTTTTTCCCTAAAATATTAGGA 6 17 0 TTTAAACGAGCTTCGCTTGAACAATTCGAAA 19 49 0 AATCCATTCATTTTTCCGGAATCGTTTACGT 28 118 1 AACTATTTTAATTTGCCTTAAACATTAGAGC 26 11 0 TATATTACTATTTTGCTGTAATTTTTAAT 14 8 0 TTCCACCTCCTCTTGCCAGAACCTTTCTGGC 5 77 0 GTTAATTGGGCTTTTCCAAGATTGGGATTGC 1 100 0 ******* *** MAP Score: 11.7048 Motif 7 CAAAACCGATTTTAGGCCAACCAAAAACTTTTTAAA 3 90 1 ACTTTTTAAATTTAGGCTATCCTAAACATAACG 3 116 1 AATAGTGTCTTTTTGGCAAGGTCATAAGGTTTTTCC 6 31 0 TATTATAAGATTTTGGCTTATGTATAGAGGAAAACT 8 108 0 TCCAGCGCGCTTTTGGCAAAGTTTAA 25 0 0 CCGTTCTCTTTTTGGGCGAGGAGAAAAATAATAGTC 25 70 0 GCTCTAATGTTTAAGGCAAATTAAAATAGTTTGCTG 26 11 1 CCTCAAGACTTTTAGGCTTTTCTAAAAAACGGAGGA 30 42 0 ATTTTAGGCAATCCGAAAAGTTATATGC 31 2 1 *** *** * *** MAP Score: 11.2847 Motif 8 GCTTATAATGTTAAATATAAACACTGTTAG 3 36 0 TACTACTTGATAAAATATAAGGGTTTTGGA 5 37 0 GGTTTTTCCCTAAAATATTAGGAAAAATTG 6 10 0 AAAAACACCGTTAAATTTAAATACAGCGTT 7 202 0 TTTTACATGATTAAAAATAATCGAATTAGG 7 228 1 TTAACACCGTTCAAAAATAATTTAAAGCTA 7 262 1 GAGGAAAACTTTAAATATAATGGGGGATAA 8 88 0 ATTAAAAATTACAGCAAAATA 14 1 1 TTGGAAAAAATAAAAATTAAAA 16 2 0 AGAAGATTAATCAAATATAATAAGTTAAAT 20 76 1 GTTTAAAATTTAAAAAATAAAAATAAAAAA 30 10 0 ATTAGTGCAGTCAAATTTAATAATTTTCTT 33 24 1 TGATTAGCAATTAAATATAACTCAGTATTC 33 67 1 AAAGTTCTTATTAAATAAAATCAAAAAAAC 33 165 1 ********** MAP Score: 9.13298 Motif 9 AACTTAAAGGGGCATTGGCCAAAAGTTCAG 0 174 1 CGAACCCCGGACCTCTCGCTTATCAGGCGA 1 159 1 GCCTGGTTAGAGCGCTCGCCTGATAAGCGA 1 174 0 GAGGGCCCGTGGCTCAGCCTGGTTAGAGCG 1 190 0 ATCAACATCTACCTTTTCCCTAAAATCTTC 4 24 0 TTTCCACCTCCTCTTGCCAGAACCTTTC 5 81 0 CAGCCTTATAAGCTCAGGCTTCCCCTTCTC 7 26 1 CCCCTTCTCAACCTCACGCCTCTCATCTGC 7 47 1 CCTGTAGCTGACCTTATCCTTCTTCACCTC 7 110 1 TCTCTTTCCCAGCTCTTCCCAATACACAAT 7 152 1 GCTTATATTAACCTTTTGCTTTTTTATTCG 8 219 0 AAAAGTTTTTAGCTCTGCCCCTGAGCGTGA 9 47 1 AAGTTTATATACCTCAGCCCACTTCACATT 11 117 1 ACTTCCGGAAGGCACTGGCCCCTACAGGGT 17 51 1 TTAAGAGTTTGGCTTTTGCTTCAAAACCTT 22 10 1 TGCCACCTCTGCCTCTTCCCCGATCGGGGA 29 35 0 CTCATCGTAAGGCTTTCGCCTCACTCCTAA 29 122 0 ********** MAP Score: 7.9403 Motif 10 CAAAAACTTTTTAAATTTAGGCTATCCTAAACA 3 111 1 TAAAGTAGTCTTAAATTTTTCGTTCCATATTGC 12 236 0 GTAGCATTTATTAAATTTTCAGTCAACTACACA 23 25 1 CTCTTCGATTTTTAATTTTGTATTACAAAAAAG 1 41 1 TTAAGACTACTTTAATTTAGTATAGCAAGGTGT 12 255 1 TTTTAATTTTTATTTTTTCCAACA 16 1 1 CTTACTGAAGTTAAATCTATCTTTATCAAAAAG 0 239 0 GAGAGGACAATTAAATCTTTAATCTCAATTACA 8 22 1 TTATCCCCCATTATATTTAAAGTTTTCCTCTAT 8 88 1 CTAACAGTGTTTATATTTAACATTATAAGCATT 3 36 1 AGCGTGGTAATTTAATCTAACGTTTCCTGCAAT 21 24 1 TTTTTTATTTTTATTTTTTAAATTT 30 2 1 CTCATTAGCTTTAAATTATTTTTGAACGGTGTT 7 264 0 GAAAACATACTTAAATTAACTTTTTTGAAGCTA 19 138 1 TTCAAAACCTTTTTATCTTTTCTGGGTTCAATT 22 29 1 TATATTTAGCTTATATTAACCTTTTGCTTTTTT 8 224 0 AGTCAATAACTTTTATCAATATTTAATCAAACG 0 270 1 ********* * MAP Score: 7.63654 Motif 11 GTATTACAGGATTTAAAAACAAATTAGATTGCA 0 122 1 CTTTTTTGTAATACAAAATTAAAAATCGAAGAG 1 41 0 ATATTCGAAGATTTTAGGGAAAAGGTAGATGTT 4 18 1 TTTTCCTAATATTTTAGGGAAAAACCTTATGAC 6 14 1 TTTCCATGATTTTTCAAACCAAACGCTGTATTT 7 181 1 ATAACCATTATTATGAGGTCAAAAATCATCATT 8 141 1 TCAGAATCGAATAAAAAAGCAAAAGGTTAATAT 8 212 1 ACACCTTGCTATACTAAATTAAAGTAGTCTTAA 12 255 0 GGATGGTATTTTAATAAGAAAAAAGTGAAGGAG 17 270 1 AAATTAACTTTTTTGAAGCTAAATC 19 150 1 AAAAAGGTATTTAAGAGAGAAAAATCTGCCGTT 20 15 0 TTAATCAAATATAATAAGTTAAATCCTATCTGT 20 82 1 GATAAAAAGGTTTTGAAGCAAAAGCCAAACTCT 22 13 0 ATTATATATTTTTTCAAATCAAATGGTATTGGT 27 37 1 GAACTCTTTTCCAAAATAAAGGTAAGCCGG 28 150 0 TGTTTAAAATTTAAAAAATAAAAATAAAAAA 30 8 0 CTATTTTTAGGATAAATTGCTGGCTA 32 3 1 TGCTAATCACTTAAAAGACAAAAAGAAAATTAT 33 43 0 CGCAAAGTTCTTATTAAATAAAATCAAAAAAAC 33 162 1 **** *** *** MAP Score: 7.24418 Motif 12 GTGGTCATTTCCGAAGAATGCCTGAACTTTTGGCCAA 0 188 0 TAAAAATGGGCCCGCGGGGGTTCGAACCCCGGACCTC 1 137 1 AGCCACGGGCCCTCAGTCAGCTTGAGGAAAAAAGGGT 1 206 1 TTTCCACCTCCTCTTGCCAGAACCTTTCTGGCT 5 76 0 GCGACGAGAACCTTCCACTGCGTGAAGGGAGCAATCC 7 75 1 TTTAGCTCTGCCCCTGAGCGTGAGAGGT 9 54 1 TTCAGATTTACCTACGCTTGCCTGCAGGTAATTTAAC 10 44 0 GACTGCTAACCCCTCGATAGCTGGAACTCATCATATT 12 166 1 CCTGTAGGGGCCAGTGCCTTCCGGAAGTCCAGAACTT 17 42 0 TCCGAACCTGCCGATGCATGTAAGAACGATGATCTGG 28 19 1 TTTAAACAATCCTCCGTTTTTTAGAAAAGCCTAAAAG 30 33 1 TCCTCCTCTGTAACTCGGAACGCACACCTTC 30 94 0 ** ** ** **** MAP Score: 5.74994 Motif 13 CATTGGCCAAAAGTTCAGGCATTCTTCGGAAATG 0 186 1 GGGCTTTTCCAAGATTGGGATTGCTTAGGTATGA 1 90 0 TGATAAGCGAGAGGTCCGGGGTTCGAACCCCCGC 1 150 0 TCAGCCTTATAAGCTCAGGCTTCCCCTTCTCAAC 7 25 1 GTAGCAGAGAAAGTTCTGGACTTCCGGAAGGCAC 17 32 1 GGAATCGTTTACGTTCCGGCTTACCTTTATTTTG 28 135 1 GCTTCTCTGCGAGCTCGGGGACACACCATGTCGA 29 79 1 TAAAAGTCTTGAGGTCACGCTTGCAAACATGAAG 30 64 1 ATGAAGGTGTGCGTTCCGAGTTACAGAGGAGGA 30 92 1 *** ** *** * * MAP Score: 4.4466 Motif 14 TAGATTGCACATAGTGCGAATGCAATTTAACTTAAAGGGG 0 146 1 TTTCAAACCAAACGCTGTATTTAAATTTAACGGTGTTTTT 7 192 1 GCAACTTAACACCGTTCAAAAATAATTTAAAGCTAATGAG 7 257 1 ATCGAATAAAAAAGCAAAAGGTTAATATAAGCTAAATATA 8 217 1 ATTAAAAATTACAGCAAAATAGTAATATATATGTTAATCA 14 10 1 GCTGATATGTAGAGTCGAACCACATTGTATAATGATATGT 19 89 1 TACCTTTTTTACCGGTTTATGTCAATTTATGTGATTTAGA 20 39 1 TATGTGATTTAGAAGATTAATCAAATATAATAAGTTAAAT 20 66 1 TTATTATGAGAGCGTGGTAATTTAATCTAACGTTTCCTGC 21 14 1 CTGAAATACTATCGATTTAGTAAAATTTATTAGTGTGTGG 24 28 1 TAATCACTTAAAAGACAAAAAGAAAATTATTAAATTTGAC 33 33 0 * ** * *** *** MAP Score: 4.40298 Motif 15 CACTCAGCAGTATATCTTTTTTATTGTCGGA 0 70 1 CTTCAGTAAGTCAATAACTTTTATCAATATT 0 262 1 CTCTCTTCGATTTTTAATTTTGTATTACAAA 1 39 1 GCTTTATGAGTATTTACTTTTTTGTAATACA 1 59 0 AGCCTAAATTTAAAAAGTTTTTGGTTGGCCT 3 103 0 TTTTTCGTTTTTTTTACGGTG 5 0 1 TCTTAAAAACTCATTAGCTTTAAATTATTTT 7 275 0 CCCCATTATATTTAAAGTTTTCCTCTATACA 8 93 1 ATTTAGCTTATATTAACCTTTTGCTTTTTTA 8 223 0 TGGTGGACGAGTAAAAGTTTTTATCGTAAAA 9 20 1 GTTTTTATCGTAAAAGTTTTTAGCTCTGCCC 9 36 1 TTCGATATATATTTTTTTGCATTCAA 10 5 1 GGCTGAGGTATATAAACTTTTGTAATGTTTG 11 105 0 TCATCTAAAATTTTCAATACTTTT 12 3 1 TTGAAAAGTGTTAAAAGCTTTAAAATATCCC 12 116 1 ATTAAAGTAGTCTTAAATTTTTCGTTCCATA 12 240 0 TTTTAATTTTTATTTTTTCCA 16 0 1 CTATTTGTAGTATTTACCTTTTCTTTAACAG 19 15 1 ACATACTTAAATTAACTTTTTTGAAGCTAAA 19 142 1 TTTTCTCTCTTAAATACCTTTTTTACCGGTT 20 25 1 GGCTTTTGCTTCAAAACCTTTTTATCTTTTC 22 20 1 AAGTAGCATTTATTAAATTTTCAGTCAACTA 23 23 1 AGCCACACACTAATAAATTTTACTAAATCGA 24 39 0 TAGTGTTTATTAAAAGTTTTTTTTATATATC 25 34 0 TAAGACTTCCTCAAAAACTTTTGGTGATAGG 25 121 1 TATCGGAAATTATATATTTTTTCAAATCAAA 27 29 1 TTTTTTATTTTTATTTTTTAAA 30 1 1 TATTTTTATTTTTTAAATTTTAAACAATCCT 30 15 1 GGTAATAACCTATAAACTTTTTGCAATTTCC 33 106 1 ACAGTGTTTTTTTGATTTTATTTAATAAG 33 171 0 ****** **** MAP Score: 4.10458 Motif 16 AAAAATGGGCCCGCGGGGGTTCGAACCCCGGACCTCTCGCT 1 138 1 CCAGGCTGAGCCACGGGCCCTCAGTCAGCTTGAGGAAAAAA 1 198 1 CCCATCACCACCCCAAACACTGTTACCTAACAGTGTTTATA 3 10 1 CCACTCTCAGCCTTATAAGCTCAGGCTTCCCCTTCTCAACC 7 19 1 CAGGCTTCCCCTTCTCAACCTCACGCCTCTCATCTGCGACG 7 40 1 ATAAGGTCAGCTACAGGATTGCTCCCTTCACGCAGTGGAAG 7 86 0 CACCTCGAAACTTCCCAGTCTCTTTCCCAGCTCTTCCCAAT 7 134 1 TACACAATTTCCATGATTTTTCAAACCAAACGCTGTATTTA 7 174 1 TTTCTGTAAACTTCAAATTCTCTGTCTGCTGTATATTTAGC 8 247 0 ACTGCTAACCCCTCGATAGCTGGAACTCATCATATTTGCCG 12 167 1 GCTTCATTCTCTTCGTTTGCTCATCAAAACCGTAAACACCA 17 93 0 TCAGTATATCCCATCTTGCCTCCAAAATACCACCTCCTGCA 18 11 0 TCTAACCCTCCTTTCAAATTTCGTTACTCTCAAACAAAGTG 21 73 0 TCAGTTTTGACTACTATTATTGTCCCCGATCGGGGAAGAGG 29 13 1 ATCGTCGGCACTGCCACCTCTGCCTCTTCCCCGATCGGGGA 29 35 0 TGAAGCTTCTCTGCGAGCTCGGGGACACACCATGTCGATAG 29 75 1 TCCTCCTCTGTAACTCGGAACGCACACCTTCATGT 30 90 0 ** * *** ** * * MAP Score: 3.71551 Motif 17 TTATCAAAAAGCGGTTTTTATGGTAGTGGTCATTTCCGAAGA 0 208 0 CGGACCTCTCGCTTATCAGGCGAGCGCTCTAACCAGGCTGAG 1 166 1 TGAGCCACGGGCCCTCAGTCAGCTTGAGGAAAAAAGGGTTTA 1 204 1 GGTTCTCGTCGCAGATGAGAGGCGTGAGGTTGAGAAGGGGAA 7 45 0 GGGAAAGACTGCTAACCCCTCGATAGCTGGAACTCATCATAT 12 160 1 CATATTTGCCGGTAGTTATTGGGGGGTGGATGAAAGAATGCA 12 197 1 TTGCAGGAGGTGGTATTTTGGAGGCAAGATGGGATAT 18 5 1 GGGCTTATTATGAGAGCGTGGTAATTTAATCTAA 21 2 1 CTATTTAACCGTTCTCTTTTTGGGCGAGGAGAAAAATAATAG 25 72 0 CAGTTAGAGAGGATTTCCGTTGAGTGAGCTAAAGAAAGAGCT 28 68 1 TGCCACCTCTGCCTCTTCCCCGATCGGGGACAATAATAGTAG 29 23 0 CATGTCGATAGGTCCCCTTAGGAGTGAGGCGAAAGCCTTACG 29 105 1 ** * * * * * ** * MAP Score: 1.92823 Motif 18 CCACCTTAAAAATGGGCCCGCGGGGGTTCGAACCC 1 131 1 CAGCTACAGGATTGCTCCCTTCACGCAGTGGAAGG 7 85 0 TTATCATCGAAAAAATCCCGCTTGGACAATCTATT 12 83 1 TTTCCAGTACATTTTTCCCTGCCCGGAG 13 14 1 AAGTAATGAGAAATCTCCCTGTTGGCT 16 48 1 TCCGGAAGGCACTGGCCCCTACAGGGTGATAACGC 17 54 1 CACTTAAAGAATTGGACCCGGATGGTATTTTAATA 17 251 1 GACTACTATTATTGTCCCCGATCGGGGAAGAGGCA 29 21 1 CACCATGTCGATAGGTCCCCTTAGGAGTGAGGCGA 29 102 1 **** **** ** MAP Score: 1.82632 Motif 19 TTCTTCGGAAATGACCACTACCATAAAAACCGC 0 207 1 CCCATCACCACCCCAAACACTGTTAC 3 3 1 AATGTTAAATATAAACACTGTTAGGTAACAGTG 3 27 0 GGTTTTGGAAATTAACACCGTAAAAAAAACGAA 5 13 0 TTAATCATGTAAAAACACCGTTAAATTTAAATA 7 209 0 CCAAAATCTTATAATAACCATTATTATGAGGTC 8 128 1 TCGTTTGCTCATCAAAACCGTAAACACCAATCT 17 89 0 AAAACTTTTAATAAACACTACGAAAGACTATTA 25 45 1 TTATAATTTCATCAGCACCGCAAAGTTCTTATT 33 144 1 ** * ****** * MAP Score: 1.54909 Motif 20 GAAGATTTTAGGGAAAAGGTAGATGTTGATTGCTG 4 24 1 GAAAGGTTCTGGCAAGAGGAGGTGGAAA 5 81 1 GCAGATGAGAGGCGTGAGGTTGAGAAGGGGAAGCC 7 42 0 ATTGTGTATTGGGAAGAGCTGGGAAAGAGACTGGG 7 147 0 GTATAATCTGGTGATGAGTATGGAGATAAGACCTG 8 53 0 ATTACCTGCAGGCAAGCGTAGGTAAATCTGAAAAA 10 49 1 ATCAGGAATTGGGGAAAGACTGCTAACCCCTCGAT 12 149 1 TGATGAGCAAACGAAGAGAATGAAGCTCTTAGCGC 17 108 1 TTAAACTTTGCCAAAAGCGCGCTGGATATATAAA 25 9 1 TCCCCGATCGGGGAAGAGGCAGAGGTGGCAGTGCC 29 35 1 CGAAAGCCTTACGATGAGTATGGGGCAACCCGGAC 29 134 1 ******** * * MAP Score: 1.51406 Motif 21 GCAGTCCGACAATAAAAAAGATATACTGCTGAGT 0 71 0 TTAAAAATCGAAGAGAGGAGAAATCGATTAAGGC 1 22 0 TTTTTGTAATACAAAATTAAAAATCGAAGAGAGG 1 38 0 ATTTTGTATTACAAAAAAGTAAATACTCATAAAG 1 55 1 TAACACCGTAAAAAAAACGAAAAA 5 0 0 AGAGAGGACAATTAAATCTTTAATCTCAATTACA 8 21 1 TTATGTATAGAGGAAAACTTTAAATATAATGGGG 8 93 0 CGAATAAAAAAGCAAAAGGTTAATATAAGCTAAA 8 219 1 TGAAGTTTACAGAAAAGCCGTAATCGGAGGAATA 8 273 1 GTGTGATATAATAAAAATAATATTGCCAAGAA 11 8 0 TATTAGTCGTATGAAAAAAGTATTGAAAATTTTA 12 15 0 TCATACGACTAATAAAAAAATATTCTGAGAAAAA 12 35 1 AAATATTCTGAGAAAAAAGATATTCAGCATTTTA 12 52 1 TAAAAATTACAGCAAAATAGTAATATATATGTTA 14 12 1 TGTTGGAAAAAATAAAAATTAAAA 16 0 0 TCGTTTGCTCATCAAAACCGTAAACACCAATCTG 17 88 0 AAATCTGTTAAAGAAAAGGTAAATACTACAAATA 19 16 0 AATTGAACCCAGAAAAGATAAAAAGGTTTTGAAG 22 28 0 TTTTTCATGTAATAAAGCTGAAATACTATCGATT 24 11 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