AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i AG/AG_operons016_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944242924 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 AF0071 156 ATP-dependent RNA helicase, putative #1 AF0072 300 conserved hypothetical protein #2 AF1149 105 large helicase-related protein (lhr-1) #3 AF1870 78 A. fulgidus predicted coding region AF1870 #4 AF2253 78 molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B (mobB) #5 AF2254 207 ATP-dependent RNA helicase, DEAD-family (deaD) #6 AF2338 300 A. fulgidus predicted coding region AF2338 #7 AF2344 110 A. fulgidus predicted coding region AF2344 #8 AF2345 47 A. fulgidus predicted coding region AF2345 #9 AF2346 106 A. fulgidus predicted coding region AF2346 #10 AF2350 300 ATP-dependent RNA helicase HepA, putative #11 AF2351 219 conserved hypothetical protein #12 AF2406 36 ATP-dependent RNA helicase, putative #13 AF2407 221 conserved hypothetical protein #14 AF2408 42 conserved hypothetical protein #15 AF2436 254 conserved hypothetical protein Motif 1 AACTGGTTTATTGATGCAGGGATTTTGGGGT 0 99 1 GTTTGTTAATTTGATGGAGGGAATTTACAGG 0 128 1 CCGGTCTGGGTTGAAACTGCGCAGGATGAGC 1 64 1 TTAAGGAGGTTTGACACAGGTTTGACAATCC 1 128 1 TTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCGCGAAACTG 2 40 1 CTGATTTGAGTTGATGTTGGGGTTGAATCAA 6 140 0 TGATTGCTGATTGATGTTGATTCATTGCTGA 6 178 0 AATCAAATTCTTGATGCAGCGTTGATTGCTG 6 200 0 AAGAGGGTTTTTGAGGCTGGTTGCTCGGAAA 11 75 1 AAGGTTTATGTTGATGCTGCAAGAAAAACGT 14 11 0 TTGGTTGTTTTTGAGATTGGGTTGAGTTGGT 15 65 0 **** ****** MAP Score: 13.097 Motif 2 ATACCTTAGTAGATAGGGGTCGCGACCTCTTTTC 1 193 1 AGGTTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCGCGAAACTG 2 37 1 CGTAAAGGCTATGTTGGCGGGGAGGTGATTAAAG 2 81 0 GTAAATCCGCAGGAAGTGGCTGAAAATTCATCAA 6 68 1 ATTTGAGTTGATGTTGGGGTTGAATCAACGTAGA 6 134 0 TGAAAACCTGAGATAGGTGGTGCA 8 33 1 CATGATGAAAAGGATGTCGCTGCATACATTTTTT 9 77 1 AAATGCATCTATGATGACGTTGAAATCGTGAGGT 10 239 0 CCTCTTTACGATGTAGAGGTAGTATTTTTCCCCG 11 47 0 GTAGAACATCATGACGTAGCCGCAATTCTCGCAG 13 36 1 ACTTGATAGCATGGAGAGGAGGCACCTGAAATGC 13 159 0 TCTCCATGCTATCAAGTGGCAGCAAGGCTTTTAA 13 176 1 GAAAAGGTTTATGTTGATGCTGCAAGAAAAACGT 14 11 0 ****** * *** MAP Score: 9.16002 Motif 3 CTGCGCAGTTTCAACCCAGACCGGGACTAGT 1 57 0 AGTTTCGCGCTCAGCTTCAACCTGCAAAAAC 2 39 0 TGAAAATTCATCAAATTCAACTGAAATCAAC 6 88 1 TGGGGTTGAATCAACGTAGAATCATTCTGAA 6 123 0 CTACGTTGATTCAACCCCAACATCAACTCAA 6 135 1 AACCCCAACATCAACTCAAATCAGCTTTGAA 6 147 1 CAGCAATGAATCAACATCAATCAGCAATCAA 6 179 1 ATTGCTAAACTCAAATCAAATTCTTGATGCA 6 213 0 ATTTATCTTCTCAAAGCCAAATAAAGACTGG 7 17 0 CCTCACGATTTCAACGTCATCATAGATGCAT 10 240 1 TCTTGCAGCATCAACATAAACCTTTTCAACT 14 18 1 AATAACCAACTCAACCCAATCTCAAAAACAA 15 61 1 CAACCCAATCTCAAAAACAACCAAATATAAA 15 72 1 ***** ***** MAP Score: 8.94498 Motif 4 TAGTTACGCTTGACGATTTCATCGGAAAAGAAAATGAATGTG 0 13 1 TAAGGTGTTGTCCGGTCCTCCTCGAACAACTAGTCCCGGTCT 1 29 1 GCAAAAGCTTTAATCACCTCCCCGCCAACATAGCCTTTACG 2 74 1 TCAAAAGATTTAAACCTCTCCGCATGACGGGATTGT 4 4 0 AGCAAATTATTTATCTTCTCAAAGCCAAATAAAGACTGGTGA 7 14 0 TTTTCAGCCATGATCTTCTCCAGAGAACCAGTAGTTAAGAAG 10 147 1 AACTCGAACCTCACGATTTCAACGTCATCATAGATGCATTTC 10 232 1 GTTATCACCTCACCGAAATCTCACCAAATTTCT 10 277 0 GCCATACGTAGTAAGGCCTCCACTCGATTTCAAAGGGGAGTT 11 133 0 CTCAACACCTCCAGCAAAATTAAATCTTCATAT 11 196 0 AAAACCAATTTTAACTTCTCCCCGAACTTTGAAA 12 12 1 ACTCAAATAATAACCAACTCAACCCAATCTCAAAAACAACCA 15 53 1 * * * **** * * * MAP Score: 8.03419 Motif 5 TATTGATGCAGGGATTTTGGGGTTTGTTAATT 0 107 1 TTTGATGGAGGGAATTTACAGGGGGATTT 0 137 1 TATCTACTAAGGTATTTCCAGCTCCTATACAC 1 176 0 GAATTTTTAAGGTTTTTGCAGGTTGAAGCTGA 2 28 1 AAACTTCCTGGGTTTTCAGAGGTT 4 64 1 TTGAATTTGATGAATTTTCAGCCACTTCCTGC 6 76 0 CATGGAGAGTGCATTTTTCAGCCATGATCTTC 10 133 1 ATCGTAAAGAGGGTTTTTGAGGCTGGTTGCTC 11 69 1 ACAGCAAGTGGGGATTTACGGCCCACAAGGTC 13 81 0 ** **** **** MAP Score: 7.84982 Motif 6 ATTCAAAGCTGATTTGAGTTGATGTTGGGGTTGA 6 145 0 TCGTAAAGAGGGTTTTTGAGGCTGGTTGCTCGGA 11 70 1 AATTTTTAAGGTTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCG 2 29 1 CAGTTGAAAAGGTTTATGTTGATGCTGCAAGAAA 14 16 0 CAAATATAAGGTTTTTGCTTGCTGTCAGAGTTGT 1 256 0 GCTCTTGTACTCTTTAAGGTGTTGTCCGGTCCTC 1 15 1 TTGATGCAGGGATTTTGGGGTTTGTTAATTTGAT 0 109 1 GTTGGAAAAAGCTATAAGGGGTTGTCACAGTAAT 15 135 0 GGATTGCACTCATTTCAGATGTTGAAAACCTGAG 8 11 1 AACTCTTTTTCATGGTGAAAGTTTTGT 5 3 1 AAAATTCGGTTCTTTGAGTGTTTGAATGTGTTGG 15 164 0 ACCAAACTCCTGTTTGGGAGAATGAATTCAGTCA 10 82 1 AAAAACCTTATATTTGACAAGGTGTAACTTTGCT 1 274 1 TATATTTGGTTGTTTTTGAGATTGGGTTGAGTTG 15 67 0 * *** ** ** ** MAP Score: 7.44493 Motif 7 CATACTAAATGGAAAAACTTAATTCTGAATAG 6 264 1 GAAACTGAAGGCAAAAGCTTTAATCACCTCCC 2 64 1 CTGACAGCAAGCAAAAACCTTATATTTGACAA 1 262 1 GCTTCAACCTGCAAAAACCTTAAAAATTCTTC 2 25 0 TATAGGAGCTGGAAATACCTTAGTAGATAGGG 1 179 1 AATATACATCGGAAAAGGCTAAATATTGCTTT 3 26 0 TTATTTGAGTGGTAAAGCTTGAGGAAAAGATT 15 31 0 GGCAGTTGAAAAGGTTTATGTTGATGCT 14 24 0 TCGATTTAGTGGTAAATCCGCAGGAAGTGGCT 6 57 1 TTCACTAAGCGGTAAATATTAAAAGCCTTGCT 13 196 0 TAAACTCAAATCAAATTCTTGATGCAGCGTTG 6 207 0 CTGAATCGAAGCAAATTATTTATCTTCTCAAA 7 33 0 TTGTTTAATCTCAAAAGATTTAAACCTCTCCG 4 24 0 TTTTGCAATTTGAAATACTGCAAC 10 2 0 CCATGAAAAAATGTATGCAGCGACA 9 91 0 TGAATGTGTTGGAAAAAGCTATAAGGGGTTGT 15 144 0 TAAAGCTTGAGGAAAAGATTTTAAAGCAAAAA 15 19 0 ****** *** * MAP Score: 6.79947 Motif 8 ACCGGTAACTGGTTTATTGATGCAGGGATTTTGGGGT 0 93 1 CCCGGTCTGGGTTGAAACTGCGCAGGATGAGCGTGAT 1 63 1 GACATGACGACGTGTATAGGAGCTGGAAATACCTTAG 1 165 1 GTTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCGCGAAACTGAAGGC 2 39 1 CGTAAAGGCTATGTTGGCGGGGAGGTGATTAA 2 83 0 TTAAAATTAAGGAGTGGATTCGCCCGATTTGAGCCGA 5 41 1 CATCGATTTAGTGGTAAATCCGCAGGAAGTGGCTGAA 6 55 1 AAAAGCCCATATTAAACAGGTGCTGGAT 7 92 1 ATCGTAAAGAGGGTTTTTGAGGCTGGTTGCTCGGAAA 11 69 1 ATTTCAAAGGGGAGTTTGTTTGCTGGATCTTGAATTA 11 112 0 AAAATATGAAGATTTAATTTTGCTGGAGGTGTTGAG 11 193 1 ACGTCATGATGTTCTACAAAGGCAGGACTATCTGGGA 13 16 0 TTCCAAATCCAGACTATTTCCGCAGGAATCGCAATTG 15 196 1 ** ** * ** *** MAP Score: 6.46141 Motif 9 TTTCAAAGTTCGGGGAGAAGTTAAAATTGG 12 16 0 CTTGATAGCATGGAGAGGAGGCACCTGAAA 13 162 0 TCCCGTCATGCGGAGAGGTTTAAATCTTTT 4 14 1 GCTATGTTGGCGGGGAGGTGATTAAAGCTT 2 78 0 ATTTGCATCTCGGAGAGAGTCGAAGATTGA 5 110 1 ATTGCAAAACTGGAGAGATAAACGCCATCG 10 25 1 GCCAGAAATTTGGTGAGATTTCGGTGAGGT 10 274 1 ACTGGTTCTCTGGAGAAGATCATGGCTGAA 10 149 0 GGTGAGATTTCGGTGAGGTGATAAC 10 285 1 AAACTCCTGTTTGGGAGAATGAATTCAGTC 10 85 1 CGCTCTGCAGTGGAGAAAAATTCAGGGCTG 13 128 0 CTAAATTCTACGGGGAAAAATACTACCTCT 11 37 1 GTTAATTTGATGGAGGGAATTTACAGGGGG 0 132 1 CAGCCAAGCGTTGGGAGATAGAGTGGAACG 5 169 1 CTCTTTTTCATGGTGAAAGTTTTGTAAAGT 5 12 1 TTATTTGGCTTTGAGAAGATAAATAATTTG 7 24 1 GAGTCGAAGATTGAGGGATTCAAACAAAGA 5 126 1 ********** MAP Score: 6.09959 Motif 10 GATTTTGGGGTTTGTTAATTTGATGGAGGGAATT 0 119 1 TTTTTAAGGTTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCGCG 2 31 1 ACACGTTGTTAATTTGAAAGCAATATTT 3 4 1 AACTCTTTTTCATGGTGAAAGTTTTGTAA 5 5 1 TGGTGAAAGTTTTGTAAAGTTAAAATTAAGGAGT 5 22 1 TTCAGACATGTTTAGAAGTTTAATTTGCATCTCG 5 88 1 ACAAGCCTAATTGAGCAAGTTGAATCCAAAGATT 6 17 1 TTTATTTGGCTTTGAGAAGATAAATAATTTGCTT 7 23 1 AGCCAAATAATTTTTTAAGTTAAAAGCCCATATT 7 71 1 ATTGCACTCATTTCAGATGTTGAAAACCTGAGAT 8 13 1 ATCTCTCCAGTTTTGCAATTTGAAATACTGCAAC 10 10 0 AATTCGGTTCTTTGAGTGTTTGAATGTGTTGGAA 15 162 0 *** * ****** MAP Score: 5.65486 Motif 11 AACTGGTTTATTGATGCAGGGATTTTGGGGTTTGTTA 0 99 1 GTTTGTTAATTTGATGGAGGGAATTTACAGGGGGATT 0 128 1 TAGTTGTTCGAGGAGGACCGGACAACACCTTAAAGAG 1 24 0 AGGTTTTTGCTTGCTGTCAGAGTTGTGAATGAAAACC 1 245 0 AAGGCTATGTTGGCGGGGAGGTGATTAAAGCTTTTGC 2 74 0 CAATCCCGTCATGCGGAGAGGTTTAAATCTTTTGAGA 4 11 1 GAAGTTTAATTTGCATCTCGGAGAGAGTCGAAGATTG 5 102 1 TCCCAACGCTTGGCTGAAGGGTATATAAGTCTTTGTT 5 148 0 CTGATTTGAGTTGATGTTGGGGTTGAATCAACGTAGA 6 134 0 GCAGCGTTGATTGCTGATTGATGTTGATTCATTGCTG 6 179 0 AGTCTTTATTTGGCTTTGAGAAGATAAATAATTTGCT 7 19 1 TTTGGTGAGATTTCGGTGAGGTGATAAC 10 282 1 TTTTTGAGGCTGGTTGCTCGGAAATAGAGATAATTCA 11 82 1 TTACTACGTATGGCGTTACGGAAACTATATTTAAAAT 11 161 1 AGATTTAATTTTGCTGGAGGTGTTGAG 11 202 1 TCTGCGAGAATTGCGGCTACGTCATGATGTTCTACAA 13 34 0 TGCTATCAAGTGGCAGCAAGGCTTTTAATATTTACCG 13 182 1 GTTTATGTTGATGCTGCAAGAAAAACGTC 14 2 0 ****** ** * * MAP Score: 5.57474 Motif 12 GGAAATACCTTAGTAGATAGGGGTCGCGAC 1 189 1 TGTATATTGGTAGCAGAAAGATTTATATTA 3 50 1 AATTTGCATCTCGGAGAGAGTCGAAGATTG 5 109 1 AGCCAAGCGTTGGGAGATAGAGTGGAACGT 5 170 1 TACCTCTACATCGTAAAGAGGGTTTTTGAG 11 60 1 GGCTGGTTGCTCGGAAATAGAGATAATTCA 11 89 1 TCGAAGTCCCAGATAGTCCTGCCTTT 13 6 1 GCCGCAATTCTCGCAGATAGCTATGCGGAC 13 54 1 TGCGATTCCTGCGGAAATAGTCTGGATTTG 15 199 0 ********** MAP Score: 4.02952 Motif 13 TTAAGGTTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCGCGAA 2 34 1 TGTTTAGAAGTTTAATTTGCATCTCGGAGAGAG 5 96 1 AGCCTAATTGAGCAAGTTGAATCCAAAGATTGA 6 20 1 TCAACGTAGAATCATTCTGAATCTCGTTGATTT 6 111 0 TCAGAATGATTCTACGTTGATTCAACCCCAACA 6 124 1 TCAACTCAAATCAGCTTTGAATCAGCAATGAAT 6 157 1 TGATTGCTGATTGATGTTGATTCATTGCTGATT 6 176 0 CAATCAGCAATCAACGCTGCATCAAGAATTTGA 6 196 1 TGAGAAGATAAATAATTTGCTTCGATTCAGATT 7 35 1 TTATTTGGCTTTAAATCTGAATCGAAGCAAATT 7 48 0 GTTGAAAAGGTTTATGTTGATGCTGCAAGAAAA 14 15 0 * * ******** MAP Score: 3.95503 Motif 14 TTAAGGTTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCGCGAA 2 34 1 AGTTAAAATTAAGGAGTGGATTCGCCCGATTTG 5 39 1 AGCCTAATTGAGCAAGTTGAATCCAAAGATTGA 6 20 1 GTAAATCCGCAGGAAGTGGCTGAAAATTCATCA 6 68 1 TGAGTTGATGTTGGGGTTGAATCAACGTAGAAT 6 132 0 TGATTGCTGATTGATGTTGATTCATTGCTGATT 6 176 0 TCAAATCAAATTCTTGATGCAGCGTTGATTGCT 6 201 0 CATGATGAAAAGGATGTCGCTGCATACATTTTT 9 77 1 CCCCTTTGAAATCGAGTGGAGGCCTTACTACGT 11 137 1 GTAGAACATCATGACGTAGCCGCAATTCTCGCA 13 36 1 ACTTGATAGCATGGAGAGGAGGCACCTGAAATG 13 160 0 TCTCCATGCTATCAAGTGGCAGCAAGGCTTTTA 13 176 1 GTTGAAAAGGTTTATGTTGATGCTGCAAGAAAA 14 15 0 **** ** ** ** MAP Score: 3.68623 Motif 15 AACAAACCCCAAAATCCCTGCATCAATAAACCA 0 102 0 ATCCCCCTGTAAATTCCCTCCATCAAATTAACA 0 131 0 ACAATCCCGTCATGCGGAGAGGT 4 0 1 CTACGTTGATTCAACCCCAACATCAACTCAAAT 6 135 1 TTTTTTAAGTTAAAAGCCCATATTAAACAGGTG 7 81 1 CCTCACGATTTCAACGTCATCATAGATGCATTT 10 240 1 GGGGAAAAATACTACCTCTACATCGTAAAGAGG 11 48 1 AACCAGCCTCAAAAACCCTCTTTACGATGTAGA 11 64 0 GATCCAGCAAACAAACTCCCCTTTGAAATCGAG 11 120 1 TTTACGGCCCACAAGGTCCGCATAGCTATCTGC 13 66 0 TTGTGGGCCGTAAATCCCCACTTGCTGTCCAGC 13 85 1 **** *** *** MAP Score: 3.31516 Motif 16 CGTTGATTTCAGTTGAATTTGATGAATTTTCA 6 88 0 ATTCAGAATGATTCTACGTTGATTCAACCCCA 6 122 1 CATCAACTCAAATCAGCTTTGAATCAGCAATG 6 155 1 CAAATTCTTGATGCAGCGTTGATTGCTGATTG 6 196 0 CTGCATCAAGAATTTGATTTGAGTTTAGCAAT 6 212 1 ACCAGTCTTTATTTGGCTTTGAGAAGATAAAT 7 16 1 GAAGATAAATAATTTGCTTCGATTCAGATTTA 7 38 1 TTAAAAAATTATTTGGCTTTAAATCTGAATCG 7 57 0 TGGATAAGTAACTCTGCTATGACTGAATTCAT 10 103 0 CAGCAAACAAACTCCCCTTTGAAATCGAGTGG 11 124 1 * ** ******* MAP Score: 2.64504 Motif 17 GGATTTTGGGGTTTGTTAATTTGATGGAGGGAATTTA 0 118 1 TCCCGGTCTGGGTTGAAACTGCGCAGGATGAGCGTGA 1 62 1 AACCACCGGCGGTGGTGTATCTGAAAAGAGGTCGCGA 1 212 0 ATATTTGACAAGGTGTAACTTTGCTCA 1 283 1 GGTTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCGCGAAACTGAAGG 2 38 1 ACACGTTGTTAATTTGAAAGCAATATTTAG 3 3 1 GTTAAAATTAAGGAGTGGATTCGCCCGATTTGAGCCG 5 40 1 TCATCGATTTAGTGGTAAATCCGCAGGAAGTGGCTGA 6 54 1 ACGATGTAGAGGTAGTATTTTTCCCCGTAGAATTTAG 11 37 0 GATTTCAAAGGGGAGTTTGTTTGCTGGATCTTGAATT 11 113 0 TTTTATATTTGGTTGTTTTTGAGATTGGGTTGAGTTG 15 67 0 *** ** ** ** * MAP Score: 2.05764 Motif 18 CTAGTCCCGGTCTGGGTTGAAACTGCGCAGGATGAG 1 58 1 ACGACGTGTATAGGAGCTGGAAATACCTTAGTAGAT 1 171 1 CCTTAGTAGATAGGGGTCGCGACCTCTTTTCAGATA 1 196 1 CGATGTATATTGGTAGCAGAAAGATTTATATTAAAT 3 47 1 ATTCGCCCGATTTGAGCCGAGACTCTAGCGTTCAGA 5 58 1 TGAATCATCGATTTAGTGGTAAATCCGCAGGAAGTG 6 50 1 AATCCGCAGGAAGTGGCTGAAAATTCATCAAATTCA 6 71 1 TGAGTTGATGTTGGGGTTGAATCAACGTAGAATCAT 6 129 0 ATGAGGTTTATCGTGTTTGTAAAATTGCTAAACTCA 6 231 0 GAACATCATGACGTAGCCGCAATTCTCGCAGATAGC 13 39 1 ATGCGGACCTTGTGGGCCGTAAATCCCCACTTGCTG 13 76 1 CCATGCTATCAAGTGGCAGCAAGGCTTTTAATATTT 13 179 1 TTGGTTATTATTTGAGTGGTAAAGCTTGAGGAAAAG 15 34 0 AAAAAGCTATAAGGGGTTGTCACAGTAATTTATCTT 15 128 0 GAGTGTTTGAATGTGTTGGAAAAAGCTATAAGGGGT 15 147 0 * ***** * ** * MAP Score: 1.83842 Motif 19 ACCAGTTACCGGTAAACCTAAGCTCATTAGAT 0 74 0 TTTTGGGGTTTGTTAATTTGATGGAGGGAATT 0 121 1 CCCGGTCTGGGTTGAAACTGCGCAGGATGAGC 1 63 1 GTTTTTGCAGGTTGAAGCTGAGCGCGAAACTG 2 39 1 ACACGTTGTTAATTTGAAAGCAATATTT 3 6 1 TTTAACTTTTGTTTAATCTCAAAAGATTTAAA 4 32 0 GTGAAAGTTTTGTAAAGTTAAAATTAAGGAGT 5 24 1 ATGTTTAGAAGTTTAATTTGCATCTCGGAGAG 5 95 1 AATTGAGCAAGTTGAATCCAAAGATTGAATCA 6 25 1 TCGATTTAGTGGTAAATCCGCAGGAAGTGGCT 6 57 1 GTTGATTTCAGTTGAATTTGATGAATTTTCAG 6 87 0 ATTATTTGGCTTTAAATCTGAATCGAAGCAAA 7 50 0 CCAAATAATTTTTTAAGTTAAAAGCCCATATT 7 73 1 GTTGCAGTATTTCAAATTGCAAAACTGGAGA 10 9 1 TTACGGTATTGGTGAACTCGAACCTCACGATT 10 218 1 CAAACTCCCCTTTGAAATCGAGTGGAGGCCTT 11 131 1 AAAGGTTTATGTTGATGCTGCAAGAAAAACGT 14 11 0 *** ** ***** MAP Score: 1.51557 Motif 20 GGGGTTTGTTAATTTGATGGAGGGAATTTA 0 125 1 TCTACTAAGGTATTTCCAGCTCCTATACAC 1 176 0 AAATATAAGGTTTTTGCTTGCTGTCAGAGT 1 259 0 TATTTGAAGAATTTTTAAGGTTTTTGCAGG 2 20 1 ATTTTTAAGGTTTTTGCAGGTTGAAGCTGA 2 30 1 TTTAATATAAATCTTTCTGCTACCAATATA 3 52 0 AAAGTTAAAAAACTTCCTGGGTTTTCAGAG 4 55 1 TTAGAAGTTTAATTTGCATCTCGGAGAGAG 5 99 1 GAATTTGATGAATTTTCAGCCACTTCCTGC 6 76 0 TCAAATCAAATTCTTGATGCAGCGTTGATT 6 204 0 GAAGATAAATAATTTGCTTCGATTCAGATT 7 38 1 TGCCGAGCTCTTCTTTCAGCTCTCTGAATA 9 33 0 TGGAGAGTGCATTTTTCAGCCATGATCTTC 10 135 1 TCCCCGTAGAATTTAGCAGCTTTGTACTCG 11 23 0 AAGGGGAGTTTGTTTGCTGGATCTTGAATT 11 113 0 TGAAGATTTAATTTTGCTGGAGGTGTTGAG 11 199 1 GACGTTTTTCTTGCAGCATCAACATAA 14 7 1 ********** MAP Score: 1.48276 Motif 21 TCAAATTAACAAACCCCAAAATCCCTGCAT 0 112 0 CAGCAAGCAAAAACCTTATATTTGACAAGG 1 266 1 TACGTTGATTCAACCCCAACATCAACTCAA 6 136 1 CAAACACGATAAACCTCATACTAAATGGAA 6 248 1 TTTTAAGTTAAAAGCCCATATTAAACAGGT 7 83 1 CTGGAGAGATAAACGCCATCGGAGTTATTA 10 34 1 CTCACGATTTCAACGTCATCATAGATGCAT 10 241 1 GCATCAACATAAACCTTTTCAACTGCC 14 25 1 ATAACCAACTCAACCCAATCTCAAAAACAA 15 62 1 ATTACTGTGACAACCCCTTATAGCTTTTTC 15 135 1 ********** MAP Score: 0.673736