AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i CP/CP_fusions001_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944236724 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 CPn0008 300 hypothetical protein #1 CPn0009 126 hypothetical protein #2 CPn0010 300 hypothetical protein #3 CPn0010.1 50 frame-shift with CPn0010 #4 CPn0041 300 hypothetical protein #5 CPn0042 57 hypothetical protein #6 CPn0043 261 hypothetical protein #7 CPn0044 43 hypothetical protein #8 CPn0045 287 hypothetical protein #9 CPn0124 300 hypothetical protein #10 CPn1055 224 hypothetical protein Motif 1 AAAACATAAGTTAAAGCAACTAAGCTACTCATATCAAT 0 49 0 TTTTTGAGCATGATGACATCACAGATTCATAATGCAAG 0 83 1 ATGCAAGTATTCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCC 0 114 1 ATCGTTTGCTTTAAGTCCTCCCAACAACCATTGATATC 1 43 0 TCAAAGAATTTTAAAGAAACACAGCTCCTGGAGTTTTA 2 87 0 AACACATAAATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 2 133 0 TGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 2 167 1 ATGCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCC 2 198 1 AACACATAAGTTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 4 136 0 TGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 4 170 1 ATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCC 4 201 1 TGCGCTAAGCTAACAGCAGCGCAGCAGCGAGTTGCAGC 6 12 1 TGTTTGATTCCGATAGCACCACAGATTCATA 6 240 1 AAAAAAATTTTTAAAGCAACACAACTCATAGGTTTCTA 8 75 0 AATACATAAGTTTAACCAACTAAGCTACTAATACATAG 8 123 0 TATTTGGTCACGATGGCATCACAGATTCATAATGCAAG 8 157 1 GGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAAC 8 237 1 AACACATAAGTTAAACCCACTAAGCTACTAACATATAG 10 57 0 TGTTTGAGCATGATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAG 10 91 1 ATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCC 10 122 1 * * * * ***** * MAP Score: 58.3056 Motif 2 GATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGC 0 52 1 CCCCCCCGACGCTCTCTAGGGGTTTCTTGTTCTAAACTTC 0 148 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATC 2 136 1 CCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTA 2 232 1 TCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTG 2 268 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATC 4 139 1 CCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATATA 4 232 1 TATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTG 4 268 1 GCTTTATCCAGCAAACTCGGTTTCTCTTCTGGGGCCTCAG 6 79 0 TATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATT 6 209 1 TGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTC 8 126 1 CCCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACCTA 8 219 1 CCTAAGCTTCGTATTTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTTG 8 255 1 TTTAATTAAAGTGCCTTAGGAATTTCTTCTCTATATAGTC 9 121 0 TATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGC 10 60 1 CCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGTCTA 10 156 1 TCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTG 10 192 1 ** * ** **** * MAP Score: 43.239 Motif 3 TAAGTTAAAGCAACTAAGCTACTCATATCAAT 0 49 0 CTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCCCCCGA 0 125 1 TAAATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 2 133 0 TCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCCAA 2 209 1 ATGGAGAAGAAATCGACCCTACAGAGTGTTGG 2 237 0 ATTTCTTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGC 2 256 1 TAAGTTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 4 136 0 TCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCCAACAC 4 212 1 ATCGAGAAGAAATCGACCCTACAGAGTGTTGG 4 237 0 CGTTCTCCCTAAACTCCGCTTCCTGTTTCTCT 5 18 0 TAAGTTAAACTAACTCAGCCACTAATATATAG 6 206 0 TAAGTTTAACCAACTAAGCTACTAATACATAG 8 123 0 TCACCCACCACAGCTACCCCCCGATCACTCGG 8 203 1 ACTTCTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAAC 8 243 1 CGTACAGTTGCAATTACGCTCCTT 9 286 1 TAAGTTAAACCCACTAAGCTACTAACATATAG 10 57 0 TCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCCCAGAC 10 133 1 ** ******* * MAP Score: 36.6694 Motif 4 GATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATG 0 52 1 TCGTAGTTTATCGATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGCTTTTG 0 186 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCG 2 136 1 TCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 276 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCG 4 139 1 TCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 276 1 GCTTTATCCAGCAAACTCGGTTTCTCTTCTGGGGCCTCAGGAA 6 76 0 GAGTCTCTAGGCCCTGTTTTTTTAAATTCTTTGAATAAAATAC 6 164 1 TATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCG 6 209 1 TCGTATTTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 263 1 CAAGAATATGGCAATAAACCTTTTAATTAAAGTGCCTTAGGAA 9 139 0 TATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATG 10 60 1 TCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 10 200 1 ** *** * ** * * MAP Score: 35.8816 Motif 5 TGTTTTTGAGCATGATGACATCACAGATTCATAATGCAAG 0 81 1 AAGTTTAGAACAAGAAACCCCTAGAGAGCGTCGGGGGGGG 0 147 0 ACCGGCTCCAAAAGAGATCCCTGCAGTGAGTCCCGGAATC 0 240 0 TGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 2 165 1 CCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCT 2 225 1 TGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 4 168 1 CTACCCCCCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCT 4 225 1 AGTTGCAGCATTTGAATCCATAGAAGTTCCTGAGATTCCT 6 41 1 TCCTGAGATTCCTGAGGCCCCAGAAGAGAAACCGAGTTTG 6 68 1 TGTGTTTGATTCCGATAGCACCACAGATTCATA 6 238 1 TGTATTTGGTCACGATGGCATCACAGATTCATAATGCAAG 8 155 1 ACAGCTACCCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGG 8 212 1 TGTGTTTGAGCATGATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAG 10 89 1 CCCCCCCCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGT 10 149 1 * ** * * * ** * * MAP Score: 32.9704 Motif 6 GCAAGTATTCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCCCCCG 0 116 1 CCTCAACTACCCCCCCCCCCCCCGACGCTCTCTAGGGGTT 0 132 1 GCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCCA 2 200 1 CCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCG 2 216 1 GCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCCAACA 4 203 1 GTACACGTATCACCCACCACAGCTACCCCCCGATCACTCG 8 194 1 GCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCCCAGA 10 124 1 CCACAGCTACCCCCCCCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCT 10 140 1 * * ** * * ** * * MAP Score: 32.2359 Motif 7 TTTCTTGTTCTAAACTTCGTAGTTTATCGATCACTCTT 0 170 1 CTTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTT 2 260 1 CTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAACCATTACTTTT 8 247 1 TTTGTCTGTCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTT 10 184 1 CTTCTCGATATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTT 4 260 1 TTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGGCGC 10 72 1 TTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCAC 2 148 1 TTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGGCAC 4 151 1 TTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGACAT 0 64 1 TTTTTGATTATAGATTTTGGTATTGAACAATGACTAGT 9 191 1 TGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGCAC 6 221 1 GTCTTATGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGAGAA 8 17 1 CTCTTGTGGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGCGAG 2 35 1 GTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACCCGAGAA 6 103 1 TTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGGCAT 8 138 1 *** * ** ** * * MAP Score: 31.2439 Motif 8 TTTTGAGCATGATGACATCACAGATTCATAATGCAAGT 0 84 1 TCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCCCCCGACGCTC 0 124 1 GGGACTCACTGCAGGGATCTCTTTTGGAGCCGGTTTGG 0 246 1 TCCTGAAAGAGAAAACACCTCTTGTGGCTAGAGTGCGT 2 17 1 GTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAGT 2 168 1 GATTCATAATGCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCTACCC 2 190 1 TTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCCAACACTC 2 208 1 GTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAGT 4 171 1 GATTCATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCC 4 193 1 CTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCCAACACTCTGT 4 211 1 GTTTGATTCCGATAGCACCACAGATTCATA 6 241 1 ATTTGGTCACGATGGCATCACAGATTCATAATGCAAGT 8 158 1 ATCACCCACCACAGCTACCCCCCGATCACTCGGTAGGG 8 202 1 AACACGGATAGAGGCAATCCCTATCCCAGTTTGTATAA 9 46 0 GTTTGAGCATGATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAGT 10 92 1 GATTCATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCC 10 114 1 CTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCCCAGACCACTC 10 132 1 ** ** *** * ** MAP Score: 29.0755 Motif 9 GTTAAAGCAACTAAGCTACTCATATCAATT 0 48 0 TTCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCCC 0 123 1 GTTTCTTGTTCTAAACTTCGTAGTTTATCG 0 169 1 AATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 2 115 1 ATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAGT 2 132 0 TCTTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCG 2 259 1 ATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 4 118 1 GTTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAGT 4 135 0 TCTTCTCGATATAAACTTCGCGTTTTAGCG 4 259 1 GCCGTTCTCCCTAAACTCCGCTTCCTGTTT 5 22 0 AATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 6 188 1 TACTTGTTCTCTAAGATACTCT 7 2 0 GTTTAACCAACTAAGCTACTAATACATAGC 8 122 0 TCTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAACC 8 246 1 AATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGT 10 39 1 GTTAAACCCACTAAGCTACTAACATATAGT 10 56 0 TTTTGTCTGTCTAAATTTCGTGTTTTAGCA 10 183 1 ********** MAP Score: 28.7845 Motif 10 GCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGACATCACAG 0 70 1 GTTTCTTTAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATT 2 105 1 GGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAG 2 154 1 AGGAAAATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATT 4 108 1 GGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAG 4 157 1 TGTTTTTTTAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATT 6 178 1 AGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGCACCACAG 6 227 1 TGCTTTAAAAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATT 8 95 1 GGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGGCATCACAG 8 144 1 TTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTT 10 29 1 GGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGGCGCCACAG 10 78 1 * * ***** *** MAP Score: 28.3658 Motif 11 GCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGACATCACAGATTC 0 70 1 GTTTCTTTAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTA 2 105 1 GGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTC 2 154 1 AGGAAAATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTA 4 108 1 GGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTC 4 157 1 TGTTTTTTTAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTG 6 178 1 AGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGCACCACAGATTC 6 227 1 TGCTTTAAAAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGTA 8 95 1 GGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGGCATCACAGATTC 8 144 1 TTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGTA 10 29 1 GGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGGCGCCACAGATTC 10 78 1 * * ***** ** * MAP Score: 28.344 Motif 12 CACAGATTCATAATGCAAGTATTCTTATCTCCTCAACTACCC 0 102 1 AAGAGATCCCTGCAGTGAGTCCCGGAATCCCCAAGGTCAACA 0 227 0 GGATCTCTTTTGGAGCCGGTTTGGGATTTTCTGCTTTAGGAG 0 260 1 CTCTTGTGGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGCGAGGACC 2 35 1 CACAGATTCATAATGCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCTACCC 2 186 1 CACAGATTCATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCC 4 189 1 GTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACCCGAGAAGATC 6 103 1 GTCTTATGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGAGAAGATC 8 17 1 CACAGATTCATAATGCAAGTACACGTATCACCCACCACAGCT 8 176 1 CACAGATTCATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCC 10 110 1 * ** ** * ** ** MAP Score: 24.1224 Motif 13 CCCCCCCCCCCCCCGACGCTCTCTAGGGGTTTCTTGTT 0 141 1 CTTGGGGATTCCGGGACTCACTGCAGGGATCTCTTTTG 0 234 1 CCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTT 2 225 1 CTACCCCCCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTT 4 225 1 TCCTGAGATTCCTGAGGCCCCAGAAGAGAAACCGAGTT 6 68 1 ACAGCTACCCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTT 8 212 1 CCCCCCCCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTT 10 149 1 ** * * * * **** MAP Score: 23.6685 Motif 14 GCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCAT 0 62 1 CGATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGCTTTTG 0 197 1 GCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGC 2 146 1 CGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 287 1 GCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGC 4 149 1 CGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 287 1 GCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCC 6 219 1 GCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCAC 8 136 1 CCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 274 1 AATTTTTGATTATAGATTTTGGTATTGAACAA 9 189 1 GCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCAT 10 70 1 CAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 10 211 1 ***** ** *** MAP Score: 21.7002 Motif 15 CCCCCCCCGACGCTCTCTAGGGGTTTCTTGTTCTAAACT 0 147 1 GATTCCGGGACTCACTGCAGGGATCTCTTTTGGAGCCGG 0 240 1 AGGGATATCAATGGTTGTTGGGAGGACTTAAAGCAAACG 1 40 1 AACACCTCTTGTGGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCG 2 30 1 CCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATC 2 231 1 ATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTT 2 267 1 CCCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATA 4 231 1 ATATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCT 4 267 1 ACCGAGTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACCCG 6 98 1 AGTAAGTCTTATGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCG 8 12 1 ACCCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACC 8 218 1 CCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGTC 10 155 1 GTCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCT 10 191 1 * * * **** *** MAP Score: 19.6087 Motif 16 ACATCACAGATTCATAATGCAAGTATTCTTATCT 0 98 1 GCACCACAGATTCATAATGCAAGTACTTCTATCT 2 182 1 GCACCACAGATTCATAATGCAAGTACCTCTATCA 4 185 1 CCGAGTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTA 6 99 1 GTAAGTCTTATGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTA 8 13 1 GCATCACAGATTCATAATGCAAGTACACGTATCA 8 172 1 AGAGAAGAAATTCCTAAGGCACTTTAATTAAAAG 9 129 1 GCGCCACAGATTCATAATGCAAGTACCTCTATCA 10 106 1 * ***** ** ** MAP Score: 19.0446 Motif 17 CTCATATCAATTATTTTATTCCAAGGTCTTTTTC 0 26 0 CTCTCTAGGGGTTTCTTGTTCTAAACTTCGTAGT 0 159 1 TATCGATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGCTTTT 0 194 1 ACAGCTCCTGGAGTTTTATGCTAGGTATGGTCCT 2 71 0 CTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATTTTAAA 2 110 0 GTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCG 2 143 1 TCTGCGAAAAGAATTTTCTTATGAAAATCAGAAA 4 25 0 GAGATGGAATGATTTTCCTTCTAAAATAGAATTT 4 57 1 CAAAGAGATTCATTTTCCTTCTAAAGAAGAATTC 4 93 0 CTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGATTCATT 4 113 0 TAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 284 1 CAGCAAACTCGGTTTCTCTTCTGGGGCCTCAGGA 6 77 0 CTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATTTAAAA 6 183 0 TTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGCACCACA 6 229 1 CTAATACATAGCATTTTATTCAAAAAAATTTTTA 8 100 0 TAACCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 271 1 TACCTAAGAAGATTTTGATTCCGGCTTTCCGACT 9 91 1 CAACTGTACGTTGTTTACTTCTGATTTAAGGTTG 9 262 0 CTAACATATAGTATTTTATTCAAAGAATTTTTAA 10 34 0 TAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 10 208 1 * *** ***** * MAP Score: 17.7211 Motif 18 TAATTGATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTAT 0 47 1 TCGGGGGGGGGGGGGGTAGTTGAGGAGATAAGAAT 0 122 0 AAACCCCTAGAGAGCGTCGGGGGGGGGGGGGGTAG 0 138 0 TTAGTTCTTGGTGTGCTTTTGTTGACCTTGGGGAT 0 208 1 GGGATCTCTTTTGGAGCCGGTTTGGGATTTTCTGC 0 259 1 TACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTAT 2 131 1 GAGTGTTGGGGGGGGGGGGGGTAGCTGCGGAGATA 2 211 0 AATAATCTCCTTGGAGACTGGGGGACA 3 33 1 GTGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGT 4 209 0 GAAACAGGAAGCGGAGTTTAGGGAGAACGGCACAA 5 21 1 TACTATATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTAT 6 204 1 TGCTATGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTAT 8 121 1 CCGAGTGATCGGGGGGTAGCTGTGGTGGGTGATAC 8 200 0 TACTATATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTAT 10 55 1 GTCTGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGT 10 130 0 AGCCCCTACAGAGTGGTCTGGGGGGGGGGGGTAGC 10 145 0 * **** * ** ** MAP Score: 9.75061 Motif 19 TGAGCATGATGACATCACAGATTCATAATGCAAG 0 87 1 GATTCCGGGACTCACTGCAGGGATCTCTTTTGGA 0 240 1 TGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 2 171 1 AAGTACTTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCC 2 202 1 AGAAGAAATCGACCCTACAGAGTGTTGGGGGGGG 2 231 0 TGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 4 174 1 AAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCC 4 205 1 AGAAGAAATCGACCCTACAGAGTGTTGGGGAGGG 4 231 0 AGCTAACAGCAGCGCAGCAGCGAGTTGCAGCATT 6 19 1 TGCAGCATTTGAATCCATAGAAGTTCCTGAGATT 6 44 1 TTTCTCTTCTGGGGCCTCAGGAATCTCAGGAACT 6 65 0 TGATTCCGATAGCACCACAGATTCATA 6 244 1 TTAGAGAACAAGTACAACAGTTTGAAACTCAAGG 7 18 1 ATGAATCTGTGATGCCATCGTGACCAAATACATA 8 153 0 TGAGCATGATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAG 10 95 1 AAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCC 10 126 1 ACAAAAAAAAGCCCCTACAGAGTGGTCTGGGGGG 10 155 0 * * ****** * * MAP Score: 9.18921 Motif 20 ATTCCAAGGTCTTTTTCTCATTTCAAAACCCT 0 11 0 TTTATCGATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGC 0 192 1 GGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGCGAGG 2 42 1 ACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATTTT 2 113 0 TTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 282 1 TTCTTGAAGACCTTTTCTGATTTTCATAAGAA 4 12 1 TTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 282 1 GGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACCCGAGAAG 6 110 1 AGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATA 6 223 1 GGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGAGAAG 8 24 1 AGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATG 8 140 1 TTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 269 1 TGCAACTGTACGTTGTTTACTTCTGATTTAAG 9 266 0 TTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 10 206 1 **** **** ** MAP Score: 8.31816 Motif 21 ACCAAGAACTAAAAGAGTGATCGATAAACTAC 0 188 0 TTCTGCTTTAGGAGGAGTGCTC 0 288 1 GATACGAGTGCTCATGCGGAACA 1 1 1 AATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACATAA 2 162 0 AAATCGACCCTACAGAGTGTTGGGGGGGGGGG 2 228 0 AATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACATAA 4 165 0 AAATCGACCCTACAGAGTGTTGGGGAGGGGGG 4 228 0 GTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACC 6 103 1 TATTTACCCGAGAAGATCGTTCTTAGAACCAC 6 127 1 GTCTTATGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACT 8 17 1 TATTTACTCGAGAAGATCGTTCCTAGCACAAC 8 41 1 AAGTAGCCCCTACCGAGTGATCGGGGGGTAGC 8 215 0 AAAAAGCCCCTACAGAGTGGTCTGGGGGGGGG 10 152 0 * ******* ** MAP Score: 7.62741 Motif 22 AATGCAAGTATTCTTATCTCCTCAACTACC 0 113 1 ATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGCTTTTG 0 199 1 CACTGCAGGGATCTCTTTTGGAGCCGGTTT 0 252 1 GTTTGGGATTTTCTGCTTTAGGAGGAGTGC 0 278 1 TAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAAACTTC 2 248 1 TTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 281 1 GACATCAATAATCTCCTTGGAGACTGGGGG 3 27 1 CATAAGAAAATTCTTTTCGCAGAGATGGAA 4 36 1 AATTTGTGAATTCTTCTTTAGAAGGAAAAT 4 86 1 TAGGGTCGATTTCTTCTCGATATAAACTTC 4 248 1 ATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 289 1 CAAACTCGGTTTCTCTTCTGGGGCCTCAGG 6 78 0 TCTAAGAACGATCTTCTCGGGTAAATAAAG 6 124 0 AGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGC 6 227 1 ACTGTTGTACTTGTTCTCTAAGATACTCT 7 9 0 GCTAGGAACGATCTTCTCGAGTAAATAAAG 8 38 0 CGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAGC 8 232 1 TTTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 268 1 CGGAATCAAAATCTTCTTAGGTATTTGTCC 9 84 0 CCTTAGGAATTTCTTCTCTATATAGTCGGA 9 118 0 GGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGGC 10 78 1 ATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 10 213 1 ********** MAP Score: 1.04268 Motif 23 ACACCAAGAACTAAAAGAGTGATCGATAAACTA 0 189 0 CCCAAACCGGCTCCAAAAGAGATCCCTGCAGTG 0 252 0 GGATTTTCTGCTTTAGGAGGAGTGCTC 0 283 1 CGCACTCTAGCCACAAGAGGTGTTTTCTCTTTC 2 21 0 AGAAACACAGCTCCTGGAGTTTTATGCTAGGTA 2 78 0 ACCAAAAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAACG 2 279 0 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAACG 4 279 0 GCATTTGAATCCATAGAAGTTCCTGAGATTCCT 6 48 1 GGCCTAGAGACTCCTAGAGTGGTTCTAAGAACG 6 144 0 CGCGCTTTATCCATAAGACTTACTTT 8 3 0 AGTTGTGTTGCTTTAAAAATTTTTTTGAATAAA 8 87 1 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATGGTTAAAATA 8 266 0 AGAAACACAACTCTTGGAGTTATG 10 1 0 AGTTGTGTTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAAA 10 22 1 AAAAAAAGCCCCTACAGAGTGGTCTGGGGGGGG 10 153 0 ACCAAGAACTAAAAAAGTGATTGCTAAAACA 10 203 0 *** ****** * MAP Score: 0.631579 Motif 24 AGCGTCGGGGGGGGGGGGGGTAGTTGAGGA 0 131 0 AACCCCTAGAGAGCGTCGGGGGGGGGGGGG 0 142 0 AGAACTAAAAGAGTGATCGATAAACTACGA 0 186 0 GTTGACCTTGGGGATTCCGGGACTCACTGC 0 228 1 GGATATCAATGGTTGTTGGGAGGACTTAAA 1 42 1 AGGAGAACATGATTGTACGGACATAGAGAC 1 90 1 AGTGTTGGGGGGGGGGGGGGTAGCTGCGGA 2 215 0 CGACCCTACAGAGTGTTGGGGGGGGGGGGG 2 226 0 AATCTCCTTGGAGACTGGGGGACA 3 36 1 CAGAGTGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGT 4 218 0 ACAGGAAGCGGAGTTTAGGGAGAACGGCAC 5 24 1 AAGAGAAACCGAGTTTGCTGGATAAAGCGC 6 91 1 CATAGGTTTCTAGAGTTGTGCTAGGAACGA 8 57 0 CCTACCGAGTGATCGGGGGGTAGCTGTGGT 8 209 0 TCACTTGGATGAGTGATGAGGTTTTTACTG 9 230 0 AGTGGTCTGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGT 10 139 0 AGCCCCTACAGAGTGGTCTGGGGGGGGGGG 10 150 0 ********** MAP Score: 0.123505