AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i CP/CP_fusions001_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944236754 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 CPn0008 300 hypothetical protein #1 CPn0009 126 hypothetical protein #2 CPn0010 300 hypothetical protein #3 CPn0010.1 50 frame-shift with CPn0010 #4 CPn0041 300 hypothetical protein #5 CPn0042 57 hypothetical protein #6 CPn0043 261 hypothetical protein #7 CPn0044 43 hypothetical protein #8 CPn0045 287 hypothetical protein #9 CPn0124 300 hypothetical protein #10 CPn1054 300 hypothetical protein #11 CPn1055 224 hypothetical protein Motif 1 AAAACATAAGTTAAAGCAACTAAGCTACTCATATCAAT 0 49 0 TTTTTGAGCATGATGACATCACAGATTCATAATGCAAG 0 83 1 ATGCAAGTATTCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCC 0 114 1 ATCGTTTGCTTTAAGTCCTCCCAACAACCATTGATATC 1 43 0 TCAAAGAATTTTAAAGAAACACAGCTCCTGGAGTTTTA 2 87 0 AACACATAAATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 2 133 0 TGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 2 167 1 ATGCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCC 2 198 1 AACACATAAGTTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 4 136 0 TGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 4 170 1 ATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCC 4 201 1 TGCGCTAAGCTAACAGCAGCGCAGCAGCGAGTTGCAGC 6 12 1 TGTTTGATTCCGATAGCACCACAGATTCATA 6 240 1 AATACATAAGTTTAACCAACTAAGCTACTAATACATAG 8 123 0 TATTTGGTCACGATGGCATCACAGATTCATAATGCAAG 8 157 1 AAGTACACGTATCACCCACCACAGCTACCCCCCGATCA 8 192 1 GGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAAC 8 237 1 AACACATAAATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 10 245 0 TGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATA 10 279 1 AACACATAAGTTAAACCCACTAAGCTACTAACATATAG 11 57 0 TGTTTGAGCATGATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAG 11 91 1 ATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCC 11 122 1 * * * * ***** * MAP Score: 66.611 Motif 2 GTTAAAGCAACTAAGCTACTCATATCAATTATTTTATTCCAAGGTC 0 32 0 GAGAAAACACCTCTTGTGGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGCG 2 25 1 ATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAAT 2 116 0 ATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACATAAATTAAACCCACTAAG 2 147 0 GGGTCGATTTCTTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTT 2 250 1 GTGAATTCTTCTTTAGAAGGAAAATGAATCTCTTTGAATAAAATAC 4 91 1 GTTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGA 4 119 0 ATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACATAAGTTAAACCCACTAAG 4 150 0 GGGTCGATTTCTTCTCGATATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTT 4 250 1 GAACGATCTTCTCGGGTAAATAAAGAACGCGCTTTATCCAGCAAAC 6 103 0 GTTAAACTAACTCAGCCACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAAT 6 189 0 ATCTGTGGTGCTATCGGAATCAAACACATAAGTTAAACTAACTCAG 6 220 0 GAACGATCTTCTCGAGTAAATAAAGAACGCGCTTTATCCATAAGAC 8 17 0 GTTTAACCAACTAAGCTACTAATACATAGCATTTTATTCAAAAAAA 8 106 0 ATCTGTGATGCCATCGTGACCAAATACATAAGTTTAACCAACTAAG 8 137 0 GGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAACCATTACTT 8 237 1 GTAATTGCAACTGTACGTTGTTTACTTCTGATTTAAGGTTGAGTCA 9 257 0 GAAAATTCTTCTTTAGAAGGAAGATGAATCTCTTTGAATAAAATAC 10 200 1 ATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGA 10 228 0 ATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACATAAATTAAACCCACTAAG 10 259 0 GTTAAACCCACTAAGCTACTAACATATAGTATTTTATTCAAAGAAT 11 40 0 ATCTGTGGCGCCATCATGCTCAAACACATAAGTTAAACCCACTAAG 11 71 0 GGGGCTTTTTTTTGTCTGTCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTT 11 174 1 ** * * * ** ** * MAP Score: 45.4795 Motif 3 TCATCATGCTCAAAAACATAAGTTAAAGCAACTAAG 0 63 0 GATGACATCACAGATTCATAATGCAAGTATTCTTAT 0 94 1 CCATCGCGATCAAACACATAAATTAAACCCACTAAG 2 147 0 GATGGCACCACAGATTCATAATGCAAGTACTTCTAT 2 178 1 CCATCGCGATCAAACACATAAGTTAAACCCACTAAG 4 150 0 GATGGCACCACAGATTCATAATGCAAGTACCTCTAT 4 181 1 CTATCGGAATCAAACACATAAGTTAAACTAACTCAG 6 220 0 CCATCGTGACCAAATACATAAGTTTAACCAACTAAG 8 137 0 GATGGCATCACAGATTCATAATGCAAGTACACGTAT 8 168 1 CCATCGCGATCAAACACATAAATTAAACCCACTAAG 10 259 0 CCATCATGCTCAAACACATAAGTTAAACCCACTAAG 11 71 0 GATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAGTACCTCTAT 11 102 1 ** * ***** ** MAP Score: 44.4866 Motif 4 ATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCA 0 53 1 CCCCCCGACGCTCTCTAGGGGTTTCTTGTTCTAAACTTCG 0 149 1 TTCCGGGACTCACTGCAGGGATCTCTTTTGGAGCCGGTTT 0 242 1 CTTTTGGAGCCGGTTTGGGATTTTCTGCTTTAGGAGGAGT 0 266 1 ATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCG 2 137 1 CCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAA 2 233 1 CTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGG 2 269 1 ATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCG 4 140 1 CTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATATAA 4 233 1 ATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGG 4 269 1 CTTTATCCAGCAAACTCGGTTTCTCTTCTGGGGCCTCAGG 6 78 0 ATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTC 6 210 1 GTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCA 8 127 1 CCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACCTAA 8 220 1 GAAACAAGTTCCTCTTTGGTTCGACCTATTATAAAAAAAG 10 41 0 ATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCG 10 249 1 ATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCA 11 61 1 CCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGTCTAA 11 157 1 * ** ** *** ** MAP Score: 43.9077 Motif 5 AAAGACCTTGGAATAAAATAATTGATATGAGTAGCTTA 0 29 1 TAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATG 0 60 1 CACCTCTTGTGGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGC 2 32 1 AAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 2 113 1 TAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATG 2 144 1 TTTCTTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACT 2 257 1 GAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 4 116 1 TAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATG 4 147 1 TTTCTTCTCGATATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACT 4 257 1 CGAGTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACCCGA 6 100 1 TAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTGGCTGA 6 186 1 TGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATA 6 217 1 TAAGTCTTATGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGA 8 14 1 AAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGTAGCTTA 8 103 1 TAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATG 8 134 1 GAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 10 225 1 TAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATG 10 256 1 AAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGTAGCTTA 11 37 1 TAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATG 11 68 1 TTTTTTGTCTGTCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACT 11 181 1 * * ** * ** * * * MAP Score: 43.8546 Motif 6 TATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGA 0 54 1 ACTTCGTAGTTTATCGATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGCTTTT 0 183 1 TATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGG 2 138 1 ACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 273 1 TATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGG 4 141 1 ACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 273 1 TATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAG 6 211 1 TATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGG 8 128 1 GCTTCGTATTTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 260 1 CGGAAAGCCGGAATCAAAATCTTCTTAGGTATTTGTCCAACACGG 9 77 0 TATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGG 10 250 1 TGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGG 11 62 1 ATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 11 197 1 * ** ** ** *** MAP Score: 41.3819 Motif 7 TTATGTTTTTGAGCATGATGACATCACAGATTCATAATGCA 0 78 1 CGTCGGGGGGGGGGGGGGTAGTTGAGGAGATAAGAATACTT 0 118 0 TTCTTGGTGTGCTTTTGTTGACCTTGGGGATTCCGGGACTC 0 212 1 TTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCA 2 162 1 TGTTGGGGGGGGGGGGGGTAGCTGCGGAGATAGAAGTACTT 2 202 0 TTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCA 4 165 1 GAGTGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTT 4 205 0 ATATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATT 6 208 1 TTATGTGTTTGATTCCGATAGCACCACAGATTCATA 6 235 1 TTATGTATTTGGTCACGATGGCATCACAGATTCATAATGCA 8 152 1 TTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATA 10 274 1 TTATGTGTTTGAGCATGATGGCGCCACAGATTCATAATGCA 11 86 1 TGGTCTGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTT 11 126 0 * * **** * *** MAP Score: 39.978 Motif 8 GATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGA 0 52 1 AAGAATACTTGCATTATGAATCTGTGATGTCATCATGCTCAAAAACA 0 81 0 TGGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGCGAGGACCATACCTAGCAT 2 41 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGG 2 136 1 AGAAGTACTTGCATTATGAATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACA 2 165 0 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGG 4 139 1 AGAGGTACTTGCATTATGAATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACA 4 168 0 CTCTTCTGGGGCCTCAGGAATCTCAGGAACTTCTATGGATTCAAATG 6 49 0 TGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACCCGAGAAGATCGTTCTTAGAAC 6 109 1 TATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAG 6 209 1 TGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGAGAAGATCGTTCCTAGCAC 8 23 1 TGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGG 8 126 1 ACGTGTACTTGCATTATGAATCTGTGATGCCATCGTGACCAAATACA 8 155 0 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGG 10 248 1 ATAACTCCAAGAGTTGTGTTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAAATAC 11 11 1 TATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGG 11 60 1 AGAGGTACTTGCATTATGAATCTGTGGCGCCATCATGCTCAAACACA 11 89 0 ** * ** *** ** MAP Score: 38.8728 Motif 9 ATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAGTA 2 131 0 GTTTAACCAACTAAGCTACTAATACATAGCA 8 121 0 ATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAGTA 10 243 0 GTTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAGTA 4 134 0 GTTAAACCCACTAAGCTACTAACATATAGTA 11 55 0 AAAGTGATTGCTAAAACACGAAATTTAGACA 11 190 0 AATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTA 2 115 1 ATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTA 10 227 1 AATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGTA 11 39 1 ATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTA 4 118 1 AATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTG 6 188 1 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATGGTTAAAA 8 268 0 ACCAAAAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAA 2 281 0 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAA 4 281 0 TACTTGTTCTCTAAGATACTCT 7 1 0 GTTAAAGCAACTAAGCTACTCATATCAATTA 0 47 0 AGAGTGATCGATAAACTACGAAGTTTAGAAC 0 176 0 AAAGTAATCGCTAAAACGCGAAGTTTAGATG 2 266 0 AAAGTAATCGCTAAAACGCGAAGTTTATATC 4 266 0 ATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGTA 8 105 1 GTTAAACTAACTCAGCCACTAATATATAGTA 6 204 0 ACACCAAGAACTAAAAGAGTGATCGATAAAC 0 191 0 ACCAAGAACTAAAAAAGTGATTGCTAAAA 11 205 0 ****** **** MAP Score: 38.6725 Motif 10 TATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGAT 0 54 1 CTCTAGGGGTTTCTTGTTCTAAACTTCGTAGTTTATCGATCAC 0 161 1 AAACTTCGTAGTTTATCGATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGC 0 181 1 GTTCTTGGTGTGCTTTTGTTGACCTTGGGGATTCCGGGACTCA 0 211 1 TATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGAT 2 138 1 GGTCGATTTCTTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTAC 2 251 1 AAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 271 1 ATGATTTTCCTTCTAAAATAGAATTTGTGAATTCTTCTTTAGA 4 65 1 TATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGAT 4 141 1 GGTCGATTTCTTCTCGATATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTAC 4 251 1 AAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 271 1 TATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGAT 6 211 1 TATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGAT 8 128 1 GGGCTACTTCTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAACCATTAC 8 238 1 AAGCTTCGTATTTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 258 1 CGGAAAGCCGGAATCAAAATCTTCTTAGGTATTTGTCCAACAC 9 79 0 AGTATATTGGTGAGTATTTTTATCTTTGTATTTAGAAAACGAT 10 104 0 AAGGAAGTTTTCTTGAAGATCTTTTTCGGTTTTTATAAGAAAA 10 162 1 TATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGAT 10 250 1 AAGAATTTTTAAAGAAACACAACTCTTGGAGTTATG 11 3 0 TGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGAT 11 62 1 GGGCTTTTTTTTGTCTGTCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCAC 11 175 1 AAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 11 195 1 * * * * *** * ** MAP Score: 31.6353 Motif 11 AAAGACCTTGGAATAAAATAATTGATATGAGT 0 29 1 AAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 2 113 1 ACCAAAAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAACG 2 279 0 CTGATTTTCATAAGAAAATTCTTTTCGCAGAG 4 28 1 GAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 4 116 1 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAACG 4 279 0 TAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 6 186 1 AAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGT 8 103 1 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATGGTTAAAATA 8 266 0 ACTATATAGAGAAGAAATTCCTAAGGCACTTT 9 122 1 TAAATACAAAGATAAAAATACTCACCAATATA 10 113 1 TCGGTTTTTATAAGAAAATTCTTCTTTAGAAG 10 187 1 GAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 10 225 1 AAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGT 11 37 1 ACCAAGAACTAAAAAAGTGATTGCTAAAACA 11 203 0 *** ***** ** MAP Score: 31.4747 Motif 12 AAGCACACCAAGAACTAAAAGAGTGATCGATAAACTA 0 189 0 AAATCCCAAACCGGCTCCAAAAGAGATCCCTGCAGTG 0 252 0 TCATGTTCTCCTACCCAAAAGATCGTTTGCTTTAAGT 1 65 0 AGAACGCACTCTAGCCACAAGAGGTGTTTTCTCTTTC 2 21 0 TACCTAGCATAAAACTCCAGGAGCTGTGTTTCTTTAA 2 78 1 GAGAAGAAATCGACCCTACAGAGTGTTGGGGGGGGGG 2 229 0 ACCAAAAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAACG 2 279 0 GAATGATTTTCCTTCTAAAATAGAATTTGTGAATTCT 4 63 1 GATTCATTTTCCTTCTAAAGAAGAATTCACAAATTCT 4 84 0 GAGAAGAAATCGACCCTACAGAGTGTTGGGGAGGGGG 4 229 0 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAACG 4 279 0 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATGGTTAAAATA 8 266 0 GTGTTGGACAAATACCTAAGAAGATTTTGATTCCGGC 9 79 1 TTTCATTAAAATTACTTAAAAAGTGATATCGTTTTCT 10 77 1 TTTTCTTATAAAAACCGAAAAAGATCTTCAAGAAAAC 10 168 0 GATTCATCTTCCTTCTAAAGAAGAATTTTCTTATAAA 10 193 0 CATAACTCCAAGAGTTGTGTTTCTTTAA 11 1 1 GACAAAAAAAAGCCCCTACAGAGTGGTCTGGGGGGGG 11 153 0 ACCAAGAACTAAAAAAGTGATTGCTAAAACA 11 203 0 * ** ****** * MAP Score: 31.1677 Motif 13 CGGGGGGGGGGGGGGTAGTTGAGGAGATAAGAATAC 0 120 0 TGGGGGGGGGGGGGGTAGCTGCGGAGATAGAAGTAC 2 204 0 CGAGTGATCGGGGGGTAGCTGTGGTGGGTGATACGT 8 198 0 TCTGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTAC 11 128 0 TGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTAC 4 207 0 AACCCCTAGAGAGCGTCGGGGGGGGGGGGGGTAGTT 0 136 0 CGACCCTACAGAGTGTTGGGGGGGGGGGGGGTAGCT 2 220 0 AGCCCCTACAGAGTGGTCTGGGGGGGGGGGGTAGCT 11 144 0 *** ** * * ** * MAP Score: 30.3719 Motif 14 ACTCACTGCAGGGATCTCTTTTGGAGCCGGTTTG 0 249 1 TCCTGAAAGAGAAAACACCTCTTGTGGCTAGAGT 2 17 1 GATTCATAATGCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCT 2 190 1 TCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 276 1 ATTTTCATAAGAAAATTCTTTTCGCAGAGATGGA 4 31 1 AATAGAATTTGTGAATTCTTCTTTAGAAGGAAAA 4 81 1 GATTCATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCT 4 193 1 TCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 276 1 TCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAG 8 227 1 AACTGGGATAGGGATTGCCTCTATCCGTGTTGGA 9 53 1 AAGTGCCTTAGGAATTTCTTCTCTATATAGTCGG 9 119 0 TGAAAAAATGGGAATGGCTTTTTTTATAATAGGT 10 24 1 TTTTAATGAAACAAGTTCCTCTTTGGTTCGACCT 10 54 0 GATCTTCAAGAAAACTTCCTTTGTCAAGGTTGTG 10 149 0 GTTTTTATAAGAAAATTCTTCTTTAGAAGGAAGA 10 190 1 GATTCATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCT 11 114 1 AGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGTCT 11 161 1 TCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 11 200 1 * ** * ***** * MAP Score: 27.0768 Motif 15 TAATTAAAGTGCCTTAGGAATTTCTTCTCTA 9 128 0 AAGAATACTTGCATTATGAATCTGTGATGTC 0 97 0 AGAAGTACTTGCATTATGAATCTGTGGTGCC 2 181 0 ACGTGTACTTGCATTATGAATCTGTGATGCC 8 171 0 AGAGGTACTTGCATTATGAATCTGTGGCGCC 11 105 0 AGAGGTACTTGCATTATGAATCTGTGGTGCC 4 184 0 GCGGAACAAAGGTTTAGGGATATCAATGGTT 1 25 1 CTCTTCTGGGGCCTCAGGAATCTCAGGAACT 6 65 0 AAAGTAAGTCTTATGGATAAAGCGCGTT 8 7 1 TAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTA 11 194 1 TAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTA 2 270 1 TAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTA 4 270 1 TATACAAACTGGGATAGGGATTGCCTCTATC 9 47 1 AATCTGTGGTGCTATCGGAATCAAACACATA 6 236 0 AATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACATA 10 275 0 AATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACATA 2 163 0 AATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACACATA 4 166 0 ** ******** MAP Score: 26.0317 Motif 16 AATGAGAAAAAGACCTTGGAATAAAATAATTGATATGAGTAGCTTA 0 21 1 GTTTCTTTAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 2 105 1 CCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAAAC 2 229 1 AGGAAAATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 4 108 1 CCCCCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATATAAAC 4 229 1 TGTTTTTTTAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTGGCTGA 6 178 1 TGCTTTAAAAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGTAGCTTA 8 95 1 GGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAACCATT 8 233 1 TTTAATTAAAGTGCCTTAGGAATTTCTTCTCTATATAGTCGGAAAG 9 115 0 AGGAAGATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 10 217 1 TTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGTAGCTTA 11 29 1 CCCCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGTCTAAAT 11 153 1 * *** * * * * * * MAP Score: 22.6204 Motif 17 CCTCAACTACCCCCCCCCCCCCCGACGCTCTCTAGGGGT 0 132 1 CCTTGGGGATTCCGGGACTCACTGCAGGGATCTCTTTTG 0 233 1 ACCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTT 2 224 1 TGTCCCCCAGTCTCCAAGGAGATTATTGATGTC 3 27 0 GCTACCCCCCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTT 4 224 1 TTTGCGCTAAGCTAACAGCAGCGCAGCAGCGAG 6 4 1 TTCCTGAGATTCCTGAGGCCCCAGAAGAGAAACCGAGTT 6 67 1 CACAGCTACCCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTT 8 211 1 ACCCCCCCCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTT 11 148 1 *** * * * * ** * MAP Score: 20.143 Motif 18 ATAATTGATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAAC 0 46 1 GGGGGGGGGGGTAGTTGAGGAGATAAGAATAC 0 120 0 GATCTCTTTTGGAGCCGGTTTGGGATTTTCTG 0 261 1 TAAAACTCCAGGAGCTGTGTTTCTTTAAAATT 2 87 1 ATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAAT 2 130 1 GGGGGGGGGGGTAGCTGCGGAGATAGAAGTAC 2 204 0 ATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAAC 4 133 1 GGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTAC 4 207 0 ATACTATATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAAC 6 203 1 TAGAAACCTATGAGTTGTGTTGCTTTAAAAAT 8 75 1 ATGCTATGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAAC 8 120 1 TGATCGGGGGGTAGCTGTGGTGGGTGATACGT 8 198 0 TGAAAAAATGGGAATGGCTTTTTTTATAATAG 10 24 1 ATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAAT 10 242 1 ATACTATATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAAC 11 54 1 GGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTAC 11 128 0 AGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGT 11 161 1 ***** * **** MAP Score: 18.4515 Motif 19 TCAACTACCCCCCCCCCCCCCGACGCTCTCT 0 134 1 GCAGCTACCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGT 2 218 1 CCACAGCTACCCCCCTCCCCAACACTCTGTA 4 219 1 GTACACGTATCACCCACCACAGCTACCCCCC 8 194 1 CCACAGCTACCCCCCCCCCCCAGACCACTCT 11 140 1 ***** ***** MAP Score: 12.885 Motif 20 TCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGCTTTTGTTG 0 200 1 AAAGAAACACAGCTCCTGGAGTTTTATGCTAG 2 81 0 GTTTCTTTAAAATTCTTTGAATAAAATACTAT 2 105 1 CCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTC 2 229 1 GACATCAATAATCTCCTTGGAGACTGGGGGAC 3 27 1 AGGAAAATGAATCTCTTTGAATAAAATACTAT 4 108 1 CCCCCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTC 4 229 1 TGTTTTTTTAAATTCTTTGAATAAAATACTAT 6 178 1 CTACCCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTC 8 216 1 TGCATTCAGCTCCATGAGGAGAGCTTGAG 9 7 1 AGGAAGATGAATCTCTTTGAATAAAATACTAT 10 217 1 AAAGAAACACAACTCTTGGAGTTATG 11 4 0 TTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAAATACTAT 11 29 1 CCCCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTT 11 153 1 * ******* ** MAP Score: 11.9028 Motif 21 GCTACTCATATCAATTATTTTATTCCAAGGTCTTTTTCTC 0 24 0 CTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGCGAGGACCATACCTA 2 44 1 GCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATTTTAAAGA 2 108 0 TGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGA 2 152 1 GCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGATTCATTTT 4 111 0 TGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGA 4 155 1 ACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATATAAACTTCGC 4 240 1 ATAAAGCGCGTTCTTTATTTACCCGAGAAGATCGTTCTTA 6 112 1 GCCACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATTTAAAAAA 6 181 0 TTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGCACCACAGA 6 225 1 AGTTTCAAACTGTTGTACTTGTTCTCTAAGATACTCT 7 7 0 ATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGAGAAGATCGTTCCTA 8 26 1 TTGTGTTGCTTTAAAAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGT 8 89 1 TTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGGCATCACAGA 8 142 1 CAAAATCTTCTTAGGTATTTGTCCAACACGGATAGAGGCA 9 68 0 TTAAAGTGCCTTAGGAATTTCTTCTCTATATAGTCGGAAA 9 116 0 GCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGATTCATCTT 10 220 0 TGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACAGA 10 264 1 AGTATTTTATTCAAAGAATTTTTAAAGAAACACAACTCTT 11 19 0 GTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATG 11 63 1 * **** ** * * * MAP Score: 11.8603 Motif 22 AGCGTCGGGGGGGGGGGGGGTAGTTGAGGAGATAAG 0 125 0 CCCCCGACGCTCTCTAGGGGTTTCTTGTTCTAAACT 0 150 1 GACCTTGGGGATTCCGGGACTCACTGCAGGGATCTC 0 231 1 TTTTGGAGCCGGTTTGGGATTTTCTGCTTTAGGAGG 0 267 1 CAAAGGTTTAGGGATATCAATGGTTGTTGGGAGGAC 1 31 1 AGTGTTGGGGGGGGGGGGGGTAGCTGCGGAGATAGA 2 209 0 CCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAA 2 237 1 TAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTT 2 270 1 GGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTTGCATTATGAAT 4 194 0 CAGAGTGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGA 4 212 0 CCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATATAA 4 237 1 TAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCT 4 270 1 ATCCATAGAAGTTCCTGAGATTCCTGAGGCCCCAGA 6 56 1 GAGTTTGCTGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACCCG 6 101 1 AAGTCTTATGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCG 8 15 1 CCTACCGAGTGATCGGGGGGTAGCTGTGGTGGGTGA 8 203 0 TATACAAACTGGGATAGGGATTGCCTCTATCCGTGT 9 47 1 TTCTTTAGAAGGAAGATGAATCTCTTTGAATAAAAT 10 208 1 GGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTTGCATTATGAAT 11 115 0 AGTGGTCTGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGA 11 133 0 TAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCT 11 194 1 * * **** * *** MAP Score: 11.4047 Motif 23 GTGATGTCATCATGCTCAAAAACATAAGTTAAA 0 72 0 CAGTGAGTCCCGGAATCCCCAAGGTCAACAAAA 0 224 0 AAATCCCAAACCGGCTCCAAAAGAGATCCCTGC 0 256 0 GTGGTGCCATCGCGATCAAACACATAAATTAAA 2 156 0 CAGCTACCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGG 2 219 1 GTGGTGCCATCGCGATCAAACACATAAGTTAAA 4 159 0 CCACAGCTACCCCCCTCCCCAACACTCTGTAGG 4 219 1 ATAAGTTAAACTAACTCAGCCACTAATATATAG 6 206 0 GTGGTGCTATCGGAATCAAACACATAAGTTAAA 6 229 0 GTGATGCCATCGTGACCAAATACATAAGTTTAA 8 146 0 ATGCAAGTACACGTATCACCCACCACAGCTACC 8 188 1 CTTCTTAGGTATTTGTCCAACACGGATAGAGGC 9 69 0 GTCGGAAAGCCGGAATCAAAATCTTCTTAGGTA 9 91 0 GTGGTGCCATCGCGATCAAACACATAAATTAAA 10 268 0 GTGGCGCCATCATGCTCAAACACATAAGTTAAA 11 80 0 CCACAGCTACCCCCCCCCCCCAGACCACTCTGT 11 140 1 * ********* MAP Score: 5.49166 Motif 24 GTTCTCCTACCCAAAAGATCGTTTGCTTTAAGT 1 65 0 GTGTTTTCTCTTTCAGGATCTTTTA 2 2 0 TAGCATAAAACTCCAGGAGCTGTGTTTCTTTAA 2 82 1 CCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCA 2 235 1 TTTTCTTGAAGACCTTTTCTGATTTTC 4 4 1 TTTATTTACCCGAGAAGATCGTTCTTAGAACCA 6 125 1 CTCTAGGAGTCTCTAGGCCCTGTTTTTTTAAAT 6 158 1 TTTATTTACTCGAGAAGATCGTTCCTAGCACAA 8 39 1 CCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAA 8 222 1 AGGAAGTTTTCTTGAAGATCTTTTTCGGTTTTT 10 163 1 CATAACTCCAAGAGTTGTGTTTCTTTAA 11 5 1 CCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTG 11 159 1 ** ******* * MAP Score: 0.903251 Motif 25 GATACGAGTGCTCATGCGGAAC 1 2 1 CTAGCCACAAGAGGTGTTTTCTCTTTCAGG 2 18 0 AAAACTCCAGGAGCTGTGTTTCTTTAAAAT 2 88 1 ATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTG 2 139 1 AAGAAGACGGGGGCTTTGACATCAA 3 5 1 ATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTG 4 142 1 GAGTGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGA 4 216 0 GAGACTCCTAGAGTGGTTCTAAGAACGATC 6 141 0 CAAACTGTTGTACTTGTTCTCTAAGATACT 7 12 0 TAGGTTTCTAGAGTTGTGCTAGGAACGATC 8 55 0 AGAAACCTATGAGTTGTGTTGCTTTAAAAA 8 76 1 ATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTG 10 251 1 ATAACTCCAAGAGTTGTGTTTCTTTAAAAA 11 11 1 TACTATATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAA 11 55 1 GACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTG 11 162 1 ********** MAP Score: 0.0327091