AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i CP/CP_sum_all008_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239873 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 CPn0008 300 hypothetical protein #1 CPn0009 126 hypothetical protein #2 CPn0010 300 hypothetical protein #3 CPn0010.1 50 frame-shift with CPn0010 #4 CPn0041 300 hypothetical protein #5 CPn0042 57 hypothetical protein #6 CPn0043 261 hypothetical protein #7 CPn0044 43 hypothetical protein #8 CPn0045 287 hypothetical protein #9 CPn0124 300 hypothetical protein #10 CPn1054 300 hypothetical protein #11 CPn1055 224 hypothetical protein Motif 1 AAAACATAAGTTAAAGCAACTAAGCTACTCATATCAAT 0 49 0 TTTTTGAGCATGATGACATCACAGATTCATAATGCAAG 0 83 1 ATGCAAGTATTCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCC 0 114 1 ATCGTTTGCTTTAAGTCCTCCCAACAACCATTGATATC 1 43 0 TCAAAGAATTTTAAAGAAACACAGCTCCTGGAGTTTTA 2 87 0 AACACATAAATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 2 133 0 TGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 2 167 1 ATGCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCC 2 198 1 AACACATAAGTTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 4 136 0 TGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAG 4 170 1 ATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCC 4 201 1 TGCGCTAAGCTAACAGCAGCGCAGCAGCGAGTTGCAGC 6 12 1 TGTTTGATTCCGATAGCACCACAGATTCATA 6 240 1 AATACATAAGTTTAACCAACTAAGCTACTAATACATAG 8 123 0 TATTTGGTCACGATGGCATCACAGATTCATAATGCAAG 8 157 1 GGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAAC 8 237 1 AACACATAAATTAAACCCACTAAGCTACTAATATATAG 10 245 0 TGTTTGATCGCGATGGCACCACAGATTCATA 10 279 1 AACACATAAGTTAAACCCACTAAGCTACTAACATATAG 11 57 0 TGTTTGAGCATGATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAG 11 91 1 ATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCC 11 122 1 * * * * ***** * MAP Score: 67.1268 Motif 2 GATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGA 0 52 1 GGGGGGGGGGGGGTAGTTGAGGAGATAAGAATACTTGCATTATGAAT 0 107 0 AAACTTCGTAGTTTATCGATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGTGCTTTT 0 181 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGG 2 136 1 GGGGGGGGGGGGGTAGCTGCGGAGATAGAAGTACTTGCATTATGAAT 2 191 0 AAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 271 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGG 4 139 1 TTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTTGCATTATGAAT 4 194 0 AAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 271 1 TATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAG 6 209 1 TCCTTGAGTTTCAAACTGTTGTACTTGTTCTCTAAGA 7 16 0 TGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGG 8 126 1 AAGCTTCGTATTTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 258 1 GCTTTTTTTATAATAGGTCGAACCAAAGAGGAACTTGTTTCATTAAA 10 40 1 GGTTGTGCGAGTATATTGGTGAGTATTTTTATCTTTGTATTTAGAAA 10 109 0 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGG 10 248 1 TATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGG 11 60 1 TGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTTGCATTATGAAT 11 115 0 AAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 11 195 1 * *** ** **** MAP Score: 51.6009 Motif 3 TCATCATGCTCAAAAACATAAGTTAAAGCA 0 69 0 GATGACATCACAGATTCATAATGCAAGTAT 0 94 1 CACTAAGCTACTAATATATAGTATTTTATT 2 124 0 CCATCGCGATCAAACACATAAATTAAACCC 2 153 0 GATGGCACCACAGATTCATAATGCAAGTAC 2 178 1 CACTAAGCTACTAATATATAGTATTTTATT 4 127 0 CCATCGCGATCAAACACATAAGTTAAACCC 4 156 0 GATGGCACCACAGATTCATAATGCAAGTAC 4 181 1 AACTCAGCCACTAATATATAGTATTTTATT 6 197 0 CTATCGGAATCAAACACATAAGTTAAACTA 6 226 0 GATAGCACCACAGATTCATA 6 251 1 AACTAAGCTACTAATACATAGCATTTTATT 8 114 0 CCATCGTGACCAAATACATAAGTTTAACCA 8 143 0 GATGGCATCACAGATTCATAATGCAAGTAC 8 168 1 CCGTGTTGGACAAATACCTAAGAAGATTTT 9 77 1 CACTAAGCTACTAATATATAGTATTTTATT 10 236 0 CCATCGCGATCAAACACATAAATTAAACCC 10 265 0 GATGGCACCACAGATTCATA 10 290 1 CACTAAGCTACTAACATATAGTATTTTATT 11 48 0 CCATCATGCTCAAACACATAAGTTAAACCC 11 77 0 GATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAGTAC 11 102 1 ********** MAP Score: 46.5143 Motif 4 AAAAAGACCTTGGAATAAAATAATTGATATGAGTAGCTTA 0 27 1 AGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATG 0 58 1 TTAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 2 111 1 AGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATG 2 142 1 ATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 4 114 1 AGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATG 4 145 1 TTTAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTGGCTGA 6 184 1 AGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATA 6 215 1 AAAAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGTAGCTTA 8 101 1 AGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATG 8 132 1 ATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 10 223 1 AGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATG 10 254 1 TAAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGTAGCTTA 11 35 1 AGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATG 11 66 1 * * * ** * * * * * MAP Score: 45.1357 Motif 5 TAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGACAT 0 65 1 TTCTTGTTCTAAACTTCGTAGTTTATCGATCACTCTT 0 171 1 CACTCTAGCCACAAGAGGTGTTTTCTCTTTCAGGATC 2 15 0 TCTTGTGGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGCGAG 2 36 1 TAAGCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATTT 2 114 0 TAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCAC 2 149 1 TTCTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTT 2 261 1 TAAGCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGATT 4 117 0 TAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGGCAC 4 152 1 TTCTCGATATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTT 4 261 1 CGCAGCAGCGAGTTGCAGCATTTGAATCCATAGAAGT 6 31 1 TCGGGTAAATAAAGAACGCGCTTTATCCAGCAAACTC 6 101 0 TCAGCCACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATTT 6 187 0 GAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGCAC 6 222 1 TCGAGTAAATAAAGAACGCGCTTTATCCATAAGACTT 8 15 0 TAAGCTACTAATACATAGCATTTTATTCAAAAAAATT 8 104 0 TAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGGCAT 8 139 1 TTGGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAACCATTACTTTT 8 248 1 TAAGCTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGATT 10 226 0 TAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCAC 10 261 1 TAAGCTACTAACATATAGTATTTTATTCAAAGAATTT 11 38 0 TAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGGCGC 11 73 1 TTGTCTGTCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTT 11 185 1 * ** ******* MAP Score: 41.6791 Motif 6 GATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGA 0 52 1 CTTGTTCTAAACTTCGTAGTTTATCGATCACTCTTTTAGTTCTT 0 173 1 AACTCCAGGAGCTGTGTTTCTTTAAAATTCTTTGAATAAAATAC 2 90 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGA 2 136 1 CCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAAACTTCGCG 2 237 1 CTCCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTT 2 263 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGA 4 139 1 CCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATATAAACTTCGCG 4 237 1 CTCGATATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTT 4 263 1 TATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGA 6 209 1 AAACCTATGAGTTGTGTTGCTTTAAAAATTTTTTTGAATAAAAT 8 78 1 TGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGA 8 126 1 GGCAACCTAAGCTTCGTATTTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTT 8 250 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGA 10 248 1 AACTCCAAGAGTTGTGTTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAAATA 11 13 1 TATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGA 11 60 1 GTCTGTCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTT 11 187 1 *** ** ** * * * MAP Score: 38.1648 Motif 7 ATAATTGATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAAC 0 46 1 TGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGACA 0 69 1 TGTTCTAAACTTCGTAGTTTATCGATCACTCT 0 175 1 AGTTTATCGATCACTCTTTTAGTTCTTGGTGT 0 190 1 GGTTTGGGATTTTCTGCTTTAGGAGGAGTGCT 0 277 1 GTGGCTAGAGTGCGTTCTTTATTTACTCGCGA 2 40 1 CTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATT 2 115 0 ATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAAT 2 130 1 GGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCA 2 153 1 CCATCTAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTT 2 265 1 GTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 280 1 GAATTTGTGAATTCTTCTTTAGAAGGAAAATG 4 85 1 CTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGAT 4 118 0 ATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAAC 4 133 1 GGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGGCA 4 156 1 CGATATAAACTTCGCGTTTTAGCGATTACTTT 4 265 1 GTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 280 1 CCACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAATT 6 188 0 ATACTATATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAAC 6 203 1 TAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGCA 6 226 1 AGAGTATCTTAGAGAACAAGTA 7 0 1 ATGCTATGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAAC 8 120 1 ATTTTAACCATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 8 267 1 TTATAAGAAAATTCTTCTTTAGAAGGAAGATG 10 194 1 CTACTAATATATAGTATTTTATTCAAAGAGAT 10 227 0 ATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAAT 10 242 1 GGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCA 10 265 1 CTACTAACATATAGTATTTTATTCAAAGAATT 11 39 0 ATACTATATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAAC 11 54 1 GGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGGCG 11 77 1 CTGTCTAAATTTCGTGTTTTAGCAATCACTTT 11 189 1 GTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 11 204 1 * *** ****** MAP Score: 36.4413 Motif 8 TGATGACATCACAGATTCATAATGCAAGTA 0 93 1 CGGCTCCAAAAGAGATCCCTGCAGTGAGTC 0 248 0 CGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAGTA 2 177 1 TTTTATTCAAAGAGATTCATTTTCCTTCTA 4 104 0 CGATGGCACCACAGATTCATAATGCAAGTA 4 180 1 TAGAAGTTCCTGAGATTCCTGAGGCCCCAG 6 61 1 AACAGGGCCTAGAGACTCCTAGAGTGGTTC 6 152 0 CGATAGCACCACAGATTCATA 6 250 1 CGATGGCATCACAGATTCATAATGCAAGTA 8 167 1 TATATAGAGAAGAAATTCCTAAGGCACTTT 9 124 1 TTTTATTCAAAGAGATTCATCTTCCTTCTA 10 213 0 CGATGGCACCACAGATTCATA 10 289 1 TGATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAGTA 11 101 1 ********** MAP Score: 35.6588 Motif 9 TAGTTGCTTTAACTTATGTTTTTGAGCATGATGACATCACA 0 65 1 TTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAA 2 120 1 TAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACA 2 149 1 TTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAA 4 123 1 TAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACA 4 152 1 TTTGAATAAAATACTATATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAA 6 193 1 GAGTTAGTTTAACTTATGTGTTTGATTCCGATAGCACCACA 6 222 1 TTTGAATAAAATGCTATGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAA 8 110 1 TAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCACGATGGCATCACA 8 139 1 TAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCGCGATGGCACCACA 10 261 1 TTTGAATAAAATACTATATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAA 11 44 1 TAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCATGATGGCGCCACA 11 73 1 * ***** ** * * MAP Score: 35.2845 Motif 10 AGAGCGTCGGGGGGGGGGGGGGTAGTTGAGGAGATAAGAAT 0 122 0 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCG 2 136 1 AGAGTGTTGGGGGGGGGGGGGGTAGCTGCGGAGATAGAAGT 2 206 0 CCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAAA 2 233 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGATCG 4 139 1 CAGAGTGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTAC 4 207 0 CTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATATAAA 4 233 1 TGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGTATTTGGTCA 8 126 1 CCTACCGAGTGATCGGGGGGTAGCTGTGGTGGGTGATACGT 8 198 0 CCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAG 8 220 1 TATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGTGTTTGATCG 10 248 1 TATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGAGCA 11 60 1 AGTGGTCTGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTAC 11 128 0 CCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGTCTAAA 11 157 1 * ** **** * ** MAP Score: 33.0496 Motif 11 AAAGACCTTGGAATAAAATAATTGATATGAGT 0 29 1 AAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 2 113 1 ACCAAAAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAACG 2 279 0 CTGATTTTCATAAGAAAATTCTTTTCGCAGAG 4 28 1 GAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 4 116 1 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATCGCTAAAACG 4 279 0 TAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 6 186 1 AAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGT 8 103 1 ACCAAGAACTAAAAAAGTAATGGTTAAAATA 8 266 0 ACTATATAGAGAAGAAATTCCTAAGGCACTTT 9 122 1 TAAATACAAAGATAAAAATACTCACCAATATA 10 113 1 TCGGTTTTTATAAGAAAATTCTTCTTTAGAAG 10 187 1 GAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 10 225 1 AAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGT 11 37 1 ACCAAGAACTAAAAAAGTGATTGCTAAAACA 11 203 0 *** ***** ** MAP Score: 31.4747 Motif 12 GAAAAAGACCTTGGAATAAAATAATTGATATGAGT 0 26 1 ATAAGAATACTTGCATTATGAATCTGTGATGTCAT 0 95 0 AGGAGCTGTGTTTCTTTAAAATTCTTTGAATAAAA 2 96 1 ATAGAAGTACTTGCATTATGAATCTGTGGTGCCAT 2 179 0 TTTTCTTGAAGACCTTTTCTGATTTT 4 1 1 CCTTTTCTGATTTTCATAAGAAAATTCTTTTCGCA 4 22 1 AATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 4 113 1 ATAGAGGTACTTGCATTATGAATCTGTGGTGCCAT 4 182 0 TTTTAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 6 183 1 TGTTGTACTTGTTCTCTAAGATACTCT 7 2 0 ATGAGTTGTGTTGCTTTAAAAATTTTTTTGAATAA 8 84 1 TAAAAATTTTTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGT 8 100 1 ATACGTGTACTTGCATTATGAATCTGTGATGCCAT 8 169 0 CCTATCCCAGTTTGTATAAAATCGTACTCAAGCTC 9 30 0 CCTAAGGCACTTTAATTAAAAGGTTTATTGCCATA 9 141 1 TGCCATATTCTTGCCTTGAAAATTTTTGATTATAG 9 169 1 ACAATGACTAGTGCAGTAAAAACCTCATCACTCAT 9 217 1 GAGGAACTTGTTTCATTAAAATTACTTAAAAAGTG 10 67 1 CAAAGGAAGTTTTCTTGAAGATCTTTTTCGGTTTT 10 160 1 TCTTTTTCGGTTTTTATAAGAAAATTCTTCTTTAG 10 181 1 GATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGT 10 222 1 AAGAGTTGTGTTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAA 11 19 1 TTAAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGT 11 34 1 ATAGAGGTACTTGCATTATGAATCTGTGGCGCCAT 11 103 0 **** ***** * MAP Score: 31.4143 Motif 13 GTATTCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCCCCCG 0 120 1 GTACTTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCCA 2 204 1 ACGTATCACCCACCACAGCTACCCCCCGATCACTCG 8 198 1 GTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCCCAGA 11 128 1 GTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCCAACA 4 207 1 AACTACCCCCCCCCCCCCCGACGCTCTCTAGGGGTT 0 136 1 AGCTACCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCG 2 220 1 AGCTACCCCCCCCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCT 11 144 1 * ** * * ** *** MAP Score: 30.3719 Motif 14 ACTCACTGCAGGGATCTCTTTTGGAGCCGGTTTG 0 249 1 TCCTGAAAGAGAAAACACCTCTTGTGGCTAGAGT 2 17 1 GATTCATAATGCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCT 2 190 1 TCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTTTTGGT 2 276 1 ATTTTCATAAGAAAATTCTTTTCGCAGAGATGGA 4 31 1 AATAGAATTTGTGAATTCTTCTTTAGAAGGAAAA 4 81 1 GATTCATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCT 4 193 1 TCGCGTTTTAGCGATTACTTTTTTAGTTCTTGGT 4 276 1 TCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAG 8 227 1 AACTGGGATAGGGATTGCCTCTATCCGTGTTGGA 9 53 1 AAGTGCCTTAGGAATTTCTTCTCTATATAGTCGG 9 119 0 TGAAAAAATGGGAATGGCTTTTTTTATAATAGGT 10 24 1 TTTTAATGAAACAAGTTCCTCTTTGGTTCGACCT 10 54 0 GATCTTCAAGAAAACTTCCTTTGTCAAGGTTGTG 10 149 0 GTTTTTATAAGAAAATTCTTCTTTAGAAGGAAGA 10 190 1 GATTCATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCT 11 114 1 AGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGTCT 11 161 1 TCGTGTTTTAGCAATCACTTTTTTAGTTCTTGGT 11 200 1 * ** * ***** * MAP Score: 27.0768 Motif 15 AAAATAATTGATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTAACTTATGT 0 43 1 CTAGCATAAAACTCCAGGAGCTGTGTTTCTTTAAAATTCTT 2 81 1 AAAATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGT 2 127 1 AAAATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGT 4 130 1 AGTGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTTG 4 204 0 ATTTGAATCCATAGAAGTTCCTGAGATTCCTGAGGCCCCAG 6 50 1 AAAATACTATATATTAGTGGCTGAGTTAGTTTAACTTATGT 6 200 1 GAAACCTATGAGTTGTGTTGCTTTAAAAATTTTTTTGAATA 8 77 1 AAAATGCTATGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTATGT 8 117 1 AAACCTTTTAATTAAAGTGCCTTAGGAATTTCTTCTCTATA 9 126 0 GTTTATTGCCATATTCTTGCCTTGAAAATTTTTGATTATAG 9 163 1 AAAATACTATATATTAGTAGCTTAGTGGGTTTAATTTATGT 10 239 1 TAACTCCAAGAGTTGTGTTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAA 11 12 1 AAAATACTATATGTTAGTAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGT 11 51 1 GGTCTGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTTG 11 125 0 * ** **** * ** MAP Score: 24.6913 Motif 16 GCAAGTATTCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCCCCCG 0 116 1 CCTCAACTACCCCCCCCCCCCCCGACGCTCTCTAGGGGTT 0 132 1 GCAAGTACTTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCCA 2 200 1 CCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCG 2 216 1 GCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCCAACA 4 203 1 CCACAGCTACCCCCCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATT 4 219 1 GTACACGTATCACCCACCACAGCTACCCCCCGATCACTCG 8 194 1 GCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCCCAGA 11 124 1 * * ** * * ** * * MAP Score: 23.932 Motif 17 GTTTCTTTAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 2 105 1 TGTTTTTTTAAATTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTGGCTGA 6 178 1 AGGAAAATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 4 108 1 AGGAAGATGAATCTCTTTGAATAAAATACTATATATTAGTAGCTTA 10 217 1 TTTCTTTAAAAATTCTTTGAATAAAATACTATATGTTAGTAGCTTA 11 29 1 CCCCCCCCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGTCTGTCTAAAT 11 153 1 TTTTGAATAAAATGCTATGTATTAGTAGCTTAGTTGGTTAAACTTA 8 109 1 CCCCCCCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCCATCTAAAC 2 229 1 CCCCCTCCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCTCGATATAAAC 4 229 1 AATGAGAAAAAGACCTTGGAATAAAATAATTGATATGAGTAGCTTA 0 21 1 AAAGTAAGTCTTATGGATAAAGCGCGTTCTTTATTTACTCGA 8 6 1 CTACCCCCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGGCAACCTAAGC 8 216 1 TTTTGATTATAGATTTTGGTATTGAACAATGACTAGTGCAGTAAAA 9 192 1 TGCGGAACAAAGGTTTAGGGATATCAATGGTTGTTGGGAGGACTTA 1 24 1 ACTGCAGGGATCTCTTTTGGAGCCGGTTTGGGATTTTCTGCTTTAG 0 253 1 TAGAAGTACTTGCATTATGAATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACA 2 167 0 TACGTGTACTTGCATTATGAATCTGTGATGCCATCGTGACCAAATA 8 157 0 TAGAGGTACTTGCATTATGAATCTGTGGTGCCATCGCGATCAAACA 4 170 0 AAGCAAACGATCTTTTGGGTAGGAGAACATGATTGTACGGACATAG 1 70 1 GTGAGTATTTTTATCTTTGTATTTAGAAAACGATATCACTTTTTAA 10 92 0 * ** ** ** * * * MAP Score: 23.0563 Motif 18 TTCTTATCTCCTCAACTACCCCCCCCCCCCCC 0 123 1 CTCAACTACCCCCCCCCCCCCCGACGCTCTCT 0 133 1 CTTCTATCTCCGCAGCTACCCCCCCCCCCCCC 2 207 1 CGCAGCTACCCCCCCCCCCCCCAACACTCTGT 2 217 1 ATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACC 4 198 1 CCTCTATCACCACAGCTACCCCCCTCCCCAAC 4 210 1 CACAGCTACCCCCCTCCCCAACACTCTGTAGG 4 220 1 CGAATCTTTGTGCCGTTCTCCCTAAACTCCGC 5 31 0 AAGTACACGTATCACCCACCACAGCTACCCCC 8 192 1 ACCACAGCTACCCCCCGATCACTCGGTAGGGG 8 209 1 GGATAGAGGCAATCCCTATCCCAGTTTGTATA 9 47 0 GGATAGGGATTGCCTCTATCCGTGTTGGACAA 9 58 1 ATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACC 11 119 1 CCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCCCAG 11 131 1 CACAGCTACCCCCCCCCCCCAGACCACTCTGT 11 141 1 * ** ******* MAP Score: 15.4247 Motif 19 TATGTTTTTGAGCATGATGACATCACAGATTCATAATGCAAG 0 79 1 ACCGGCTCCAAAAGAGATCCCTGCAGTGAGTCCCGGAATCCC 0 238 0 GTAGGAGAACATGATTGTACGGACATAGAGACCGTACGTAAA 1 88 1 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TATGTGTTTGAGCATGATGGCGCCACAGATTCATAATGCAAG 11 87 1 CATAATGCAAGTACCTCTATCACCACAGCTACCCCCCCCCCC 11 118 1 * * * ***** * * MAP Score: 7.39499 Motif 20 GCGTCGGGGGGGGGGGGGGTAGTTGAGGAG 0 130 0 CTTTTAGTTCTTGGTGTGCTTTTGTTGACC 0 205 1 AAAGAGATCCCTGCAGTGAGTCCCGGAATC 0 240 0 GAGAAAACACCTCTTGTGGCTAGAGTGCGT 2 25 1 CATTATGAATCTGTGGTGCCATCGCGATCA 2 171 0 TTGGGGGGGGGGGGGGTAGCTGCGGAGATA 2 211 0 CTACAGAGTGTTGGGGGGGGGGGGGGTAGC 2 221 0 CCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCT 2 235 1 CATTATGAATCTGTGGTGCCATCGCGATCA 4 174 0 AGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTT 4 205 0 CAGAGTGTTGGGGAGGGGGGTAGCTGTGGT 4 218 0 CCCCAACACTCTGTAGGGTCGATTTCTTCT 4 235 1 TATGAATCTGTGGTGCTATCGGAATCA 6 244 0 GAGTTTCAAACTGTTGTACTTGTTCTCTAA 7 18 0 CATTATGAATCTGTGATGCCATCGTGACCA 8 161 0 CGGGGGGTAGCTGTGGTGGGTGATACGTGT 8 196 0 ACCGAGTGATCGGGGGGTAGCTGTGGTGGG 8 206 0 CCCGATCACTCGGTAGGGGCTACTTCTTGG 8 222 1 CATTATGAATCTGTGGCGCCATCATGCTCA 11 95 0 GGGGGGGTAGCTGTGGTGATAGAGGTACTT 11 126 0 GTGGTCTGGGGGGGGGGGGTAGCTGTGGTG 11 138 0 CCAGACCACTCTGTAGGGGCTTTTTTTTGT 11 159 1 ********** MAP Score: 2.9951 Motif 21 ATAATTGATATGAGTAGCTTAGTTGCTTTA 0 46 1 ACGCTCTCTAGGGGTTTCTTGTTCTAAACT 0 156 1 ACTCACTGCAGGGATCTCTTTTGGAGCCGG 0 249 1 AGCCGGTTTGGGATTTTCTGCTTTAGGAGG 0 273 1 CACAAGAGGTGTTTTCTCTTTCAGGATCTT 2 13 0 CTCCAGGAGCTGTGTTTCTTTAAAATTCTT 2 92 1 TCTGCGAAAAGAATTTTCTTATGAAAATCA 4 29 0 AGAAGGAAAATGAATCTCTTTGAATAAAAT 4 105 1 TAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGA 4 147 1 CTCCGCTTCCTGTTTCTCTTCTTCTTC 5 7 0 CAGCAAACTCGGTTTCTCTTCTGGGGCCTC 6 81 0 ACCTATGAGTTGTGTTGCTTTAAAAATTTT 8 80 1 AAGTGCCTTAGGAATTTCTTCTCTATATAG 9 123 0 GATTTAAGGTTGAGTCACTTGGATGAGTGA 9 244 0 TTTTCAAATAGGAATGGCTT 10 0 0 TTCTAAAGAAGAATTTTCTTATAAAAACCG 10 188 0 AGAAGGAAGATGAATCTCTTTGAATAAAAT 10 214 1 TAGCTTAGTGGGTTTAACTTATGTGTTTGA 11 68 1 ********** MAP Score: 1.84922