AlignACE 3.0 10/20/99
AlignACE2 -i CY/CY_operons019_300.orf 
Parameter values:
 expect =      	10
 gcback =      	0.38
 minpass =     	200
 seed =        	944249705
 numcols =     	10
 undersample = 	1
 oversample = 	1

Input sequences:
#0	hypothetical	300	hypothetical protein
#1	Fat	82	Fat protein
#2	phoH	131	phosphate starvation-inducible protein
#3	hypothetical	181	hypothetical protein
#4	hypothetical	31	hypothetical protein
#5	serS	90	seryl-tRNA synthetase
#6	hemolysin	104	hemolysin
#7	hypothetical	129	hypothetical protein
#8	ggt	25	gamma-glutamyltranspeptidase
#9	hypothetical	96	hypothetical protein
#10	rffM	197	UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid transferase
#11	hypothetical	251	hypothetical protein
#12	hypothetical	29	hypothetical protein
#13	pilM	184	membrane protein
#14	hypothetical	81	hypothetical protein
#15	hypothetical	39	hypothetical protein
#16	gspD	80	general secretion pathway protein D
#17	pilT	300	twitching mobility protein
#18	hemolysin	289	hemolysin
#19	pilT	300	twitching motility protein
#20	gspF	103	general secretion pathway protein F
#21	hypothetical	181	hypothetical protein
#22	gspE	217	general secretion pathway protein E
#23	hypothetical	216	hypothetical protein
#24	gspE	222	general secretion pathway protein E
#25	hypothetical	119	hypothetical protein
#26	hypothetical	45	hypothetical protein

Motif 1
TAGCTGACTCCTGGGGGCAACCAAAATCAT	25	39	1
AAGGTTACGGCTGGGGGAAATTGGGTTACA	11	86	1
AAAAAAGTGGCAGGGGCCAAAATATAGTTC	23	83	1
ATTGCTTAAACTAGGGGAAAGTACTAAGTT	24	70	1
GCCCTCCAGTCTAGGGGAAAATAGCCATGG	6	51	1
AAAGCAAGCACAGGGGCTAACAAAAGTTTA	19	244	0
ATCCGGTAGGCCGGGGATAAATTTAGTGGG	18	250	0
GGTTGGCCGACTGGGGTCAATTTGTTCGGT	24	40	0
CGTTTGGTCACTGGGGACGATTTTCCCTCA	23	162	1
CAAAGGTTTACCGGGGGTTAGCTGTGCCAC	17	253	1
CGTAAATTTTCAGGGGCCCAGCTCAATCGC	18	86	1
CAGTTTGTGCCCGGGGGAGAGTTCGGAATC	18	158	0
         AAAGGGGACAACTCAGGAAGG	2	120	0
TGCCCAGGCTATGGGGATAATCTGGTGGCC	3	89	0
AAATCTATGGCAAGGGCAAAAACAATCGTT	21	159	0
GGAAATGTTCCAGGGGTTAATAATCGGGGG	11	44	1
CATTAAGGACATAGGGACAAACGTGGGGAA	17	84	1
GGCTTTCCCAATGGGGTCAAGGATTCCGAA	18	137	1
GTAATCGCAAAAAGGGGAAACGCTGTTCGC	9	50	0
TCCACTGCATAAAGGGCCAATTTTGTTTGA	11	17	0
GCTAAGCCGGAAGGGGGATAATCCAACATC	0	106	0
AGTTCGGTGGCTAGGGATCA          	15	0	0
TCACCATTGGCTAGGGAATAGTTTACATCA	22	174	1
TCCCCTAATCCCAGGGATTACGAAAA    	24	6	0
GGCTAATGTTAAAGGGGTCAGCGTTTGGTC	23	141	1
GACAACTGGCACAGGGACGATTGGAATCGG	19	91	0
TTTAAACTATATGGGGTTGACCATTAATGA	5	35	1
          **********
MAP Score: 23.7676

Motif 2
AAAATACCGAGCTAAGCCGGAAGGGGGATAATCCA	0	111	0
TGGATAAAACGCCGAGTCAGTGGGGAAGGATGGCA	2	50	1
TCTACAATGTGCCCAGGCTATGGGGATAATCTGGT	3	93	0
GGCTATTTTCCCCTAGACTGGAGGGCTAGGAACAA	6	42	0
ATTTCCCTCCGCATTGTCCAGAGGGATGGGACTCA	10	136	0
GCAGGCGATCGCCCACACCTCCGGTTACGCTGACG	11	152	1
CCGGGGGTTAGCTGTGCCACAAGTGCAAAATCCGG	17	263	1
GCCGCAGATAGCCATGGCACCAGGGCTTTCCCAAT	18	114	1
TGACTCAGGAGCACAGACAGTCGGGATGTTTTCTT	18	186	1
ATTGGAATCGGCCACCCCAAAGGTGGGTTTTGTAA	19	67	0
GCCCAAATTTGCCAACTTGCTGGGGGTTTTTACGG	19	138	0
CCCTGTGCTTGCTTTGGCTGTGGGTTCAGAACTTA	19	259	1
CTTATATCCTACCATGCCCGCCGGGCAAGCTTGCA	21	67	1
GTAAACTATTCCCTAGCCAATGGTGACCATCGGTG	22	165	0
GGCGGAGATAGCTGACTCCTGGGGGCAACCAAAAT	25	31	1
TCCAGCCGTTGCCCACCCATTGGTGCT        	26	28	1
          *** ** *   ****
MAP Score: 21.2778

Motif 3
AAAATAGACCATTGCCATTACCGTCCAACGAA	2	17	0
CCACCAGATTATCCCCATAGCCTGGGCACATT	3	91	1
CATTAATCCTCCCCCCATAACC          	4	19	1
TTATACGGGGCGACCCATTGACAGCGACACCA	7	38	0
GTTGGGAACTAGACCGATCGCCAATCCGTTTA	7	78	1
GCACCTTTAACCACCCATCATCCCATCGTCTC	10	19	0
CCAATTTCCCCCAGCCGTAACCTTTATCCACA	11	78	0
TGTTGATTGGCAGGCGATCGCCCACACCTCCG	11	143	1
GCGCCAGAACCCTACCATTGACTGATAGATAT	13	95	1
CTTATTATCGCCAGCGATTACCGCAACCCCC 	13	163	1
GCACAGCTAACCCCCGGTAAACCTTTGATGCA	17	248	0
AGCTCAATCGCCGCAGATAGCCATGGCACCAG	18	105	1
CTCTATTTGTCCGGCGATCGCCACAAATGGTC	19	201	0
AGCCTTATATCCTACCATGCCCGCCGGGCAAG	21	64	1
ACTTTTAGGGACTCCCATTGCCATAAAAAAGT	23	59	1
CCCCAGTCGGCCAACCATTGCTTAAACTAGGG	24	54	1
CTATCTCCGCCCTCCGATCGCCATGGTTAAAA	25	10	0
CCAACATTTTCCAGCCGTTGCCCACCCATTGG	26	19	1
          ** ***** ***
MAP Score: 18.57

Motif 4
GTGACGGACCTTGCCATCCTTCCCCACTGACTCGG	2	61	0
ATCAATTCCTTGGACTTCTTTGCCCAAATTTGCCA	19	159	0
GAAACTTTTTTTGTCATCATTGCCCAATTTTTTTA	0	154	0
 CGGCTTGGTTTGTTCACCTTGCCCACACCTATTG	14	9	1
GCCCAACATTTTCCAGCCGTTGCCCACCCATTGGT	26	17	1
TCCTACTAAACTTAGTACTTTCCCCTAGTTTAAGC	24	73	0
ACATAAGTTTTTCGGTGCAATCCCCCTAATCATCT	20	31	1
CGCTAAATAACTTACCGCATTGCCCTAAGAATTGT	9	18	0
TGGTGTTGATTGGCAGGCGATCGCCCACACCTCCG	11	140	1
GTTCAGCTTTTGGTTAACTTTTCCC          	3	166	1
GGGTCAAGGATTCCGAACTCTCCCCCGGGCACAAA	18	150	1
TTAATTTTGTTGGTGACCAATTCCCGGTACATGGC	0	17	1
CAGCTATCTCCGCCCTCCGATCGCCATGGTTAAAA	25	10	0
TGATGTTTGTCGTCAGCCACTCCCCACTAAATTTA	18	228	1
CCCGGCCTACCGGATTTCTATCCCTAAAAATTGA 	18	265	1
GCTGAGTTGTCTGGTCACATTCCCA          	9	81	1
TTCCTCTATTTGTCCGGCGATCGCCACAAATGGTC	19	201	0
AACAAAACGACGCATTTGTTTCCCCACGTTTGTCC	17	98	0
GAATACTAGACTGAGTCCCATCCCTCTGGACAATG	10	125	1
TAATCACCGATGGTCACCATTGGCTAGGGAATAGT	22	161	1
         GCTTTGTTGATTGCCCTCCGACTGGA	13	1	1
TGCTCTAAATTGCTCCTCTATTGCCATAAAAATGA	0	236	0
TAAACGATTGTTTTTGCCCTTGCCATAGATTTTT 	21	157	1
CGACGGACTACTCTTCAGCTTCCCTAACTCTAGTG	21	117	0
          ***    * ******
MAP Score: 18.5457

Motif 5
CATTTTCCAGCCGTTGCCCACCCATTGGTGC	26	23	1
TTGATGATTTTGGTTGCCCCCAGGAGTCAGC	25	41	0
GATTGGCAGGCGATCGCCCACACCTCCGGTT	11	147	1
   GCTTTGTTGATTGCCCTCCGACTGGATT	13	7	1
GACCTTGCCATCCTTCCCCACTGACTCGGCG	2	59	0
TCCTTGGACTTCTTTGCCCAAATTTGCCAAC	19	157	0
TTTTTTGTCATCATTGCCCAATTTTTTTATC	0	152	0
ACAAGTTTGTTCCTAGCCCTCCAGTCTAGGG	6	36	1
ACTGTTATCTCGGTCGCCCCTGCC       	24	208	1
      TGATCCCTAGCCACCGAACTTTGTT	15	4	1
ACGACGCATTTGTTTCCCCACGTTTGTCCCT	17	96	0
GAGTCAGCTATCTCCGCCCTCCGATCGCCAT	25	18	0
TTGTCGTCAGCCACTCCCCACTAAATTTATC	18	234	1
AAAAAATAGACCATTGCCATTACCGTCCAAC	2	20	0
ATTGTTTTTGCCCTTGCCATAGATTTTT   	21	163	1
TTAGGGACTCCCATTGCCATAAAAAAGTGGC	23	63	1
TGGTTTGTTCACCTTGCCCACACCTATTGCT	14	15	1
TAGCGAACAGCGTTTCCCCTTTTTGCGATTA	9	48	1
GAGTCATTAATCCTCCCCCCATAACC     	4	15	1
TATATTTTGGCCCCTGCCACTTTTTTATGGC	23	78	0
ATTTGTCCGGCGATCGCCACAAATGGTCACA	19	198	0
ATTAAACTTTTGTTAGCCCCTGTGCTTGCTT	19	242	1
GGAACTAGACCGATCGCCAATCCGTTTATCT	7	82	1
GTAAACTATTCCCTAGCCAATGGTGACCATC	22	169	0
          ** ********
MAP Score: 17.6597

Motif 6
ATTCATAGCGGGGCTTGCCATGGAGGGTCCAGGT	0	69	1
GACCTTGCCATCCTTCCCCACTGACTCGGCGTTT	2	56	0
TCTACAATGTGCCCAGGCTATGGGGATAATCTGG	3	94	0
TTATTATACGGGGCGACCCATTGACAGCGACACC	7	39	0
CTAGACTGAGTCCCATCCCTCTGGACAATGCGGA	10	130	1
GTGTGGGCGATCGCCTGCCAATCAACACCAATTT	11	136	0
GCAGGCGATCGCCCACACCTCCGGTTACGCTGAC	11	152	1
GCCCTAACGCTCGTTTCCCTTTGAATCT      	12	11	1
CTTTGTTGATTGCCCTCCGACTGGATTACAGTAA	13	11	1
       TGATCCCTAGCCACCGAACTTTGTTTT	15	3	1
ATGGCACCAGGGCTTTCCCAATGGGGTCAAGGAT	18	127	1
ACTAAATTTATCCCCGGCCTACCGGATTTCTATC	18	253	1
GATTGGAATCGGCCACCCCAAAGGTGGGTTTTGT	19	69	0
GATTGTTTTTGCCCTTGCCATAGATTTTT     	21	162	1
TGTAAACTATTCCCTAGCCAATGGTGACCATCGG	22	167	0
GAGTCAGCTATCTCCGCCCTCCGATCGCCATGGT	25	15	0
TTCCAGCCGTTGCCCACCCATTGGTGCT      	26	27	1
          ****  ****  **
MAP Score: 16.7625

Motif 7
AAAAATTGCTCTAAATTGCTCCTCTATTGCCAT	0	244	0
CAAACCCTTCCTGAGTTGTCCCCTTT       	2	115	1
TTCAAGGCCACCAGATTATCCCCATAGCCTGGG	3	84	1
   TTCGGCTAGAAGTTCACCCCAACGATTTAA	5	7	1
ATTTAGCGAACAGCGTTTCCCCTTTTTGCGATT	9	45	1
ATTCTTCAAACAAAATTGGCCCTTTATGCAGTG	11	12	1
AACCTTTATCCACAATTTCCCCCGATTATTAAC	11	59	0
ATAAATGTAACCCAATTTCCCCCAGCCGTAACC	11	88	0
ATTTGTTTCCCCACGTTTGTCCCTATGTCCTTA	17	87	0
TAAATAATGTCCCCAATGTCCCCATTGAATTCG	17	172	1
GCACTTGTGGCACAGCTAACCCCCGGTAAACCT	17	256	0
ATGATAAACGCGAAATTTTTCCCAGTCTATTTT	18	18	0
GTCAAGGATTCCGAACTCTCCCCCGGGCACAAA	18	152	1
CCACTCCCCACTAAATTTATCCCCGGCCTACCG	18	244	1
CCCAGTGACCAAACGCTGACCCCTTTAACATTA	23	144	0
ATTTAACCGAACAAATTGACCCCAGTCGGCCAA	24	35	1
          * *****  ****
MAP Score: 16.0515

Motif 8
TGGCAATAGAGGAGCAATTTAGAGCAATTTTT	0	245	1
CCCATAGCCTGGGCACATTGTAGACGGATATC	3	104	1
AAAAAGAATTGCGGAATTTGTGACAAGTTTGT	6	14	1
TCCAGTCTAGGGGAAAATAGCCATGGTCTATA	6	55	1
AAAGTTTCCTTGAGAAATTGGCGATTCTTCCC	10	56	1
ACTGCATAAAGGGCCAATTTTGTTTGAAGAAT	11	12	0
TATTAACCCCTGGAACATTTCCACTGCATAAA	11	34	0
TTAATAATCGGGGGAAATTGTGGATAAAGGTT	11	60	1
GTTACGGCTGGGGGAAATTGGGTTACATTTAT	11	89	1
         AGGGTAATTTTGCTGGTAGATTA	16	1	1
CGAATTCAATGGGGACATTGGGGACATTATTT	17	173	0
AAATAGACTGGGAAAAATTTCGCGTTTATCAT	18	19	1
ATTTTTAGGGTCGTAAATTTTCAGGGGCCCAG	18	75	1
GGTAGGCCGGGGATAAATTTAGTGGGGAGTGG	18	244	0
CCCAGCAAGTTGGCAAATTTGGGCAAAGAAGT	19	149	1
TCCAAGGAATTGATAAATTGTGACCATTTGTG	19	180	1
GGCGATCGCCGGACAAATAGAGGAAAGTGGCA	19	211	1
ATCGAGGGAGGCAAAAATTGGCTAATGTTAAA	23	122	1
CCTAGGATGAGGGAAAATCGTCCCCAGTGACC	23	167	0
AAGTTTAGTAGGAAAAATTGTCAGCCTTGGGT	24	95	1
          *** ****** *
MAP Score: 15.4341

Motif 9
GGATAAAACGCCGAGTCAGTGGGGAAGGATGGC	2	51	1
CTACAATGTGCCCAGGCTATGGGGATAATCTGG	3	94	0
GCTATTTTCCCCTAGACTGGAGGGCTAGGAACA	6	43	0
ATGTTGGTGTCGCTGTCAATGGGTCGCCCCGTA	7	34	1
AAGATAAACGGATTGGCGATCGGTCTAGTTCCC	7	81	0
   ACGCTGTCTGAGACGATGGGATGATGGGTG	10	7	1
TTTCCCTCCGCATTGTCCAGAGGGATGGGACTC	10	137	0
TGGATAAAGGTTACGGCTGGGGGAAATTGGGTT	11	80	1
AATTGGTGTTGATTGGCAGGCGATCGCCCACAC	11	137	1
AAACAAAGTTCGGTGGCTAGGGATCA       	15	3	0
AGCCCTGGTGCCATGGCTATCTGCGGCGATTGA	18	108	0
CTGAGTCAGTTTGTGCCCGGGGGAGAGTTCGGA	18	161	0
GACTCAGGAGCACAGACAGTCGGGATGTTTTCT	18	187	1
TTGTGACCATTTGTGGCGATCGCCGGACAAATA	19	197	1
CCTGTGCTTGCTTTGGCTGTGGGTTCAGAACTT	19	260	1
CAAAATGCAAGCTTGCCCGGCGGGCATGGTAGG	21	74	0
    AAAAATCTATGGCAAGGGCAAAAACAATC	21	162	0
CGATGGTCACCATTGGCTAGGGAATAGTTTACA	22	168	1
TGCCACTTTTTTATGGCAATGGGAGTCCCTAAA	23	62	0
TGCCATAAAAAAGTGGCAGGGGCCAAAATATAG	23	77	1
    TTTTAACCATGGCGATCGGAGGGCGGAGA	25	6	1
          *  **** *****
MAP Score: 14.6141

Motif 10
CGGTACATGGCCAGTTCTTGGGAGAGCAATTC	0	41	1
CTTGGGAGAGCAATTCATAGCGGGGCTTGCCA	0	57	1
AATAGAGGAGCAATTTAGAGCAATTTTTGTTT	0	249	1
GTTTATTTGTCGATTTGTTGAGCTTTTATTGC	0	277	1
      ACTACTATTCGTTGGACGGTAATGGC	2	4	1
TGGCAATGGTCTATTTTTTGGATAAAACGCCG	2	32	1
GATAAAACGCCGAGTCAGTGGGGAAGGATGGC	2	52	1
 CATTGGTTACAATTCTTAGGGCAATGCGGTA	9	9	1
TCCCTCTGGACAATGCGGAGGGAAATGATTAA	10	145	1
CAATCAACACCAATTTAGACGGCGATACCTAA	11	120	0
TTACTGTAATCCAGTCGGAGGGCAATCAACAA	13	13	0
TCATTCTAACCTATTTTTTGGGGCCAGAATTT	18	47	1
TTTGGGGCCAGAATTTTTAGGGTCGTAAATTT	18	63	1
GGCCGGGGATAAATTTAGTGGGGAGTGGCTGA	18	240	0
         TCAATTTTTAGGGATAGAAATCC	18	276	0
CACAATTTATCAATTCCTTGGACTTCTTTGCC	19	170	0
AATCTAGCTTCGACTTTTAGGGACTCCCATTG	23	47	1
CGACTGGGGTCAATTTGTTCGGTTAAATCCCC	24	31	0
          * **** *****
MAP Score: 13.8323

Motif 11
GTTACGGCTGGGGGAAATTGGGTTACATTTAT	11	89	1
CGAATTCAATGGGGACATTGGGGACATTATTT	17	173	0
TCTGAGACGATGGGATGATGGGTGGTTAAAGG	10	16	1
AGTTTCAAGCTGGGATGGTTGGTAAGTTTCGA	0	183	1
CAACTGGCACAGGGACGATTGGAATCGGCCAC	19	87	0
CCGAGTCAGTGGGGAAGGATGGCAAGGTCCGT	2	61	1
CTTGCCCGGCGGGCATGGTAGGATATAAGGCT	21	64	0
CATGCCCGCCGGGCAAGCTTGCATTTTGCAAA	21	79	1
TTTGTGCCCGGGGGAGAGTTCGGAATCCTTGA	18	153	0
CCCAGCAAGTTGGCAAATTTGGGCAAAGAAGT	19	149	1
CTCCAGTCTAGGGGAAAATAGCCATGGTCTAT	6	54	1
TTAATAATCGGGGGAAATTGTGGATAAAGGTT	11	60	1
GTGTTGAATGTAGGAAGTTTGGAATTTGTCCA	25	75	0
CGGACAAATAGAGGAAAGTGGCATTAAACTTT	19	220	1
TCCTGACCAAAGGGAATGTTGGTGTCGCTGTC	7	19	1
TAACTCTAGTGAGGAATTTTGCAAAATGCAAG	21	96	0
          ***** * ****
MAP Score: 13.7343

Motif 12
GCCGAGTCAGTGGGGAAGGATGGCAAGGTCCGTC	2	60	1
GGGCAACGGCTGGAAAATGTTGGGCTGTCCAG  	26	8	0
GTTTGTGCCCGGGGGAGAGTTCGGAATCCTTGAC	18	152	0
AATGTTCCAGGGGTTAATAATCGGGGGAAATTGT	11	47	1
AGGTTACGGCTGGGGGAAATTGGGTTACATTTAT	11	87	1
TGGTGTTGATTGGCAGGCGATCGCCCACACCTCC	11	140	1
AATGTTAAAGGGGTCAGCGTTTGGTCACTGGGGA	23	145	1
AAAATAGACTGGGAAAAATTTCGCGTTTATCATT	18	18	1
TACTATTCGTTGGACGGTAATGGCAATGGTCTAT	2	12	1
TAATCACCGATGGTCACCATTGGCTAGGGAATAG	22	161	1
GTAATTTTGCTGGTAGATTATCGCTAACGGTCTT	16	13	1
GGTTTACCGGGGGTTAGCTGTGCCACAAGTGCAA	17	257	1
CATACGAATCTGGGTAGGTCTTGCT         	22	202	1
CCCAGCAAGTTGGCAAATTTGGGCAAAGAAGTCC	19	149	1
TCCCGGTACATGGCCAGTTCTTGGGAGAGCAATT	0	38	1
GTTCAGCTTTTGGTTAACTTTTCCC         	3	166	1
TCAATTTTTAGGGATAGAAATCCGGTAGGCCGGG	18	265	0
ATAAAAAAATTGGGCAATGATGACAAAAAAAGTT	0	153	1
TTGGTCACTGGGGACGATTTTCCCTCATCCTAGG	23	165	1
GACAAACGTGGGGAAACAAATGCGTCGTTTTGTT	17	99	1
CTGAGACGATGGGATGATGGGTGGTTAAAGGTGC	10	17	1
ACCAACGGACTGGAAAATAAGCCGCAAAAGTTAA	11	202	0
GTCTATTTTTTGGATAAAACGCCGAGTCAGTGGG	2	40	1
GGGGAAATTGTGGATAAAGGTTACGGCTGGGGGA	11	70	1
TTAATTTTGTTGGTGACCAATTCCCGGTACATGG	0	17	1
CCCACCTTTGGGGTGGCCGATTCCAATCGTCCCT	19	75	1
TCGAATTCAATGGGGACATTGGGGACATTATTTA	17	172	0
CCCATCCCTCTGGACAATGCGGAGGGAAATGATT	10	141	1
ATTGTCCAGAGGGATGGGACTCAGTCTAGTATTC	10	125	0
          ***  ** * ****
MAP Score: 10.6521

Motif 13
TTGCCATGGAGGGTCCAGGTCTTGATGTTGGATTATCCCCCTTCC	0	83	1
          GGGAAAAGTTAACCAAAAGCTGAACAAAATTTTTA	3	156	0
   TGGGAATGTGACCAGACAACTCAGCCGTAATCGCAAAAAGGG	9	64	0
CAGAGGGATGGGACTCAGTCTAGTATTCTCCCAGAATTGCCGGAG	10	108	0
GGGAAATTGTGGATAAAGGTTACGGCTGGGGGAAATTGGGTTACA	11	71	1
AGGTTTACCGGGGGTTAGCTGTGCCACAAGTGCAAAATCCGGTGA	17	256	1
CCTATTTTTTGGGGCCAGAATTTTTAGGGTCGTAAATTTTCAGGG	18	56	1
AAATTTTCAGGGGCCCAGCTCAATCGCCGCAGATAGCCATGGCAC	18	89	1
TTTCCCAATGGGGTCAAGGATTCCGAACTCTCCCCCGGGCACAAA	18	140	1
CTTTGGCTGTGGGTTCAGAACTTATAGGAGCATTAAAGTC     	19	270	1
TTAATAGTTTGGGGTCAGATGATTAGGGGGATTGCACCGAAAAAC	20	37	0
GTCTGGGTTAGGGCCCAGTCGTGCAAAGTTAGTGAAATTCGTTGA	21	12	1
GTAAGTTAGTGCGGCCAGTTAACTAGACCGGAGGATTATCATTGT	22	113	1
CCATTGGCTAGGGAATAGTTTACATCATACGAATCTGGGTAGGTC	22	177	1
TAATGTTAAAGGGGTCAGCGTTTGGTCACTGGGGACGATTTTCCC	23	144	1
CGTAATCCCTGGGATTAGGGGATTTAACCGAACAAATTGACCCCA	24	14	1
GCTTAAACTAGGGGAAAGTACTAAGTTTAGTAGGAAAAATTGTCA	24	73	1
GTTGCCCCCAGGAGTCAGCTATCTCCGCCCTCCGATCGCCATGGT	25	15	0
          *** ****   *       *    *
MAP Score: 9.1891

Motif 14
       GCCTTGATTAATTTTGTTGGTGACCA	0	3	1
TTTGTCATCATTGCCCAATTTTTTTATCCAAGC	0	147	0
GCTGGGATGGTTGGTAAGTTTCGATGGTGTACA	0	191	1
AGAGCAATTTTTGTTTATTTGTCGATTTGTTGA	0	265	1
ATTTGTCGATTTGTTGAGCTTTTATTGCC    	0	281	1
TCCTGTTTATTTGAGAATTTTCT          	1	69	1
TGTAAAAATTTTGTTCAGCTTTTGGTTAACTTT	3	154	1
CAAAAAAGAATTGCGGAATTTGTGACAAGTTTG	6	12	1
GTCTATAATCTTGGTAAGTTGGTTTCGGAATTT	6	80	1
CAAAGTTTCCTTGAGAAATTGGCGATTCTTCCC	10	55	1
TTCCAGTCCGTTGGTCATTTTGGTTGAGGAGTG	11	221	1
GTCATTTTGGTTGAGGAGTGTTCTGTA      	11	234	1
TAACACTTTGTTGCTTATTGTTGACAGTGTGCG	13	65	1
 CGGCTTGGTTTGTTCACCTTGCCCACACCTAT	14	9	1
CCCCAGCAAGTTGGCAAATTTGGGCAAAGAAGT	19	148	1
GTCCAAGGAATTGATAAATTGTGACCATTTGTG	19	179	1
GGGTCAGCGTTTGGTCACTGGGGACGATTTTCC	23	155	1
CTGTTGTTGTTTGCTGAACTGTTATCTCGGTCG	24	191	1
TTGTCCATCATTGATGATTTTGGTTGCCCCCAG	25	49	0
          *** * * *****
MAP Score: 8.98264

Motif 15
GTCATCATTGCCCAATTTTTTTATCCAAGCCAAAATACCGA	0	136	0
CATATGATATCCGTCTACAATGTGCCCAGGCTATGGGGATA	3	100	0
GATTATAGACCATGGCTATTTTCCCCTAGACTGGAGGGCTA	6	49	0
TTTAACCACCCATCATCCCATCGTCTCAGACAGCGT     	10	5	0
GGATGGGACTCAGTCTAGTATTCTCCCAGAATTGCCGGAGT	10	107	0
CCTAATAAATGTAACCCAATTTCCCCCAGCCGTAACCTTTA	11	84	0
         GCTTTGTTGATTGCCCTCCGACTGGATTACAG	13	1	1
CGTTGCTGCAGGCTGTATCGTCTCCTCTGTCTGCATCAAAG	17	217	1
TGGGGTCAAGGATTCCGAACTCTCCCCCGGGCACAAACTGA	18	148	1
TCAGCCACTCCCCACTAAATTTATCCCCGGCCTACCGGATT	18	240	1
TTTGGGGTGGCCGATTCCAATCGTCCCTGTGCCAGTTGTCT	19	81	1
GTGCAATCCCCCTAATCATCTGACCCCAAACTATTAAGCTC	20	45	1
CGGATCTTAAACGATTGTTTTTGCCCTTGCCATAGATTTTT	21	150	1
TAAGATTAGGAACTATATTTTGGCCCCTGCCACTTTTTTAT	23	81	0
AATCTCAAATCACTGTCTACTCACCCTAGGATGAGGGAAAA	23	182	0
GGGGATTTAACCGAACAAATTGACCCCAGTCGGCCAACCAT	24	31	1
TTGCTGAACTGTTATCTCGGTCGCCCCTGCC          	24	201	1
          *    *    ** **** * *
MAP Score: 8.91696

Motif 16
GGTTGGCCGACTGGGGTCAATTTGTTCGGTTAAATC	24	34	0
ACGGTAATGGCAATGGTCTATTTTTTGGATAAAACG	2	25	1
TGCCAGTTGTCTTCAGTCCATTTTTTCTCCGTAAAA	19	110	1
TTTTCCAGTCCGTTGGTCATTTTGGTTGAGGAGTGT	11	219	1
TATATTTTGGCCCCTGCCACTTTTTTATGGCAATGG	23	73	0
TGTCTGTGCTCCTGAGTCAGTTTGTGCCCGGGGGAG	18	169	0
TTTAATGCCACTTTCCTCTATTTGTCCGGCGATCGC	19	212	0
TTTTTGTCATCATTGCCCAATTTTTTTATCCAAGCC	0	146	0
ACCCCTTTAACATTAGCCAATTTTTGCCTCCCTCGA	23	123	0
ACAGCGACACCAACATTCCCTTTGGTCAGGATAGTT	7	14	0
TAGCGAACAGCGTTTCCCCTTTTTGCGATTACGGCT	9	48	1
AGGTTAAAGACTTTTTTCTGTTTTTCGTCAGTTGTT	17	134	0
TCACAAATTCCGCAATTCTTTTTTGCC         	6	1	0
TGTTTCCCCACGTTTGTCCCTATGTCCTTAATGAGA	17	81	0
TGGGGAAACAAATGCGTCGTTTTGTTAAACAACTGA	17	107	1
TCGGCCACCCCAAAGGTGGGTTTTGTAAACTTATTT	19	59	0
CCCCTTCCGGCTTAGCTCGGTATTTTGGCTTGGATA	0	120	1
TCCACTGCATAAAGGGCCAATTTTGTTTGAAGAATT	11	11	0
AATTTTTGTTTATTTGTCGATTTGTTGAGCTTTTAT	0	270	1
          *    ***  ******
MAP Score: 8.01962

Motif 17
TGGCTTGGATAAAAAAATTGGGCAATGATGACA	0	145	1
CGACAAATAAACAAAAATTGCTCTAAATTGCTC	0	256	0
         CAGAAAATATTGTTTATGAGAACT	1	1	1
GGCGTTTTATCCAAAAAATAGACCATTGCCATT	2	30	0
CTCCAGTCTAGGGGAAAATAGCCATGGTCTATA	6	54	1
AAGGATACGAGGGAAGAATCGCCAATTTCTCAA	10	65	0
TAATTCTTCAAACAAAATTGGCCCTTTATGCAG	11	10	1
GTTACGGCTGGGGGAAATTGGGTTACATTTATT	11	89	1
ATAATCTACCAGCAAAATTACCCT         	16	1	0
      ACTAAATAAAAATAGACTGGGAAAAAT	18	4	1
AAATAGACTGGGAAAAATTTCGCGTTTATCATT	18	19	1
AATTCTGGCCCCAAAAAATAGGTTAGAATGATA	18	45	0
GTTTTTACGGAGAAAAAATGGACTGAAGACAAC	19	115	0
CCAGCAAGTTGGCAAATTTGGGCAAAGAAGTCC	19	150	1
GTGCAAAGTTAGTGAAATTCGTTGATAAATCCA	21	32	1
AATCGAGGGAGGCAAAAATTGGCTAATGTTAAA	23	121	1
CCCTAGGATGAGGGAAAATCGTCCCCAGTGACC	23	167	0
GGGATTTAACCGAACAAATTGACCCCAGTCGGC	24	32	1
TAAGTTTAGTAGGAAAAATTGTCAGCCTTGGGT	24	94	1
          ** ****** * *
MAP Score: 5.29737

Motif 18
AATTCCCGGTACATGGCCAGTTCTTGGGAGAGCAATTCA	0	35	1
TTTTTTGGATAAAACGCCGAGTCAGTGGGGAAGGATGGC	2	45	1
TGAGTCGAGTATATGGCCTAGGTGACGGACCTTGCCATC	2	78	0
TCCGTCTACAATGTGCCCAGGCTATGGGGATAATCTGGT	3	93	0
ACCATGGCTATTTTCCCCTAGACTGGAGGGCTAGGAACA	6	43	0
      GTTAAACTATCCTGACCAAAGGGAATGTTGGTG	7	4	1
         ACGCTGTCTGAGACGATGGGATGATGGGTG	10	1	1
AGTCCCATCCCTCTGGACAATGCGGAGGGAAATGATTAA	10	138	1
CCCCTGGAACATTTCCACTGCATAAAGGGCCAATTTTGT	11	21	0
GATTGGCAGGCGATCGCCCACACCTCCGGTTACGCTGAC	11	147	1
TTTTGCGGCTTATTTTCCAGTCCGTTGGTCATTTTGGTT	11	207	1
CCCCACTAAATTTATCCCCGGCCTACCGGATTTCTATCC	18	249	1
TCTTTGCCCAAATTTGCCAACTTGCTGGGGGTTTTTACG	19	139	0
TTAGCCCCTGTGCTTGCTTTGGCTGTGGGTTCAGAACTT	19	254	1
CAGCCTTATATCCTACCATGCCCGCCGGGCAAGCTTGCA	21	63	1
ATGATGTAAACTATTCCCTAGCCAATGGTGACCATCGGT	22	166	0
ACTGGGGACGATTTTCCCTCATCCTAGGGTGAGTAGACA	23	171	1
    TTTTCGTAATCCCTGGGATTAGGGGATTTAACCGA	24	6	1
AGTCGGCCAACCATTGCTTAAACTAGGGGAAAGTACTAA	24	58	1
CGGAGGGCGGAGATAGCTGACTCCTGGGGGCAACCAAAA	25	26	1
CATTTTCCAGCCGTTGCCCACCCATTGGTGCT       	26	23	1
          *  * *** *  *   ***
MAP Score: 5.2862

Motif 19
TAATTTTGTTGGTGACCAATTCCCGGTACATGG	0	18	1
GCCAGTTCTTGGGAGAGCAATTCATAGCGGGGC	0	50	1
TAAGCCGGAAGGGGGATAATCCAACATCAAGAC	0	101	0
TAAAAAAATTGGGCAATGATGACAAAAAAAGTT	0	154	1
CCGAGTCAGTGGGGAAGGATGGCAAGGTCCGTC	2	61	1
          GGGAAAAGTTAACCAAAAGCTGA	3	168	0
   GGTTATGGGGGGAGGATTAATGACTCGGAG	4	11	0
CTCCAGTCTAGGGGAAAATAGCCATGGTCTATA	6	54	1
CAAGGATACGAGGGAAGAATCGCCAATTTCTCA	10	66	0
ACAATGCGGAGGGAAATGATTAAGGCACTTCTT	10	154	1
GTTAATAATCGGGGGAAATTGTGGATAAAGGTT	11	59	1
AAGGATGGGAGGGAGAGAATATCTATCAGTCAA	13	112	0
GTGTGGGCAAGGTGAACAAACCAAGCCG     	14	5	0
GACAAACGTGGGGAAACAAATGCGTCGTTTTGT	17	99	1
TGCAAAATCCGGTGAAAAAATCCC         	17	286	1
AAAAATAGACTGGGAAAAATTTCGCGTTTATCA	18	17	1
TTCCCAATGGGGTCAAGGATTCCGAACTCTCCC	18	141	1
CCGGTAGGCCGGGGATAAATTTAGTGGGGAGTG	18	245	0
CCACCTTTGGGGTGGCCGATTCCAATCGTCCCT	19	76	1
TGGCAAATTTGGGCAAAGAAGTCCAAGGAATTG	19	159	1
TTTGGTCACTGGGGACGATTTTCCCTCATCCTA	23	164	1
GCTTAAACTAGGGGAAAGTACTAAGTTTAGTAG	24	73	1
AATGCCTCAAGGGAGCAAAATCCTATCAAAATT	24	136	0
GGCGATCGGAGGGCGGAGATAGCTGACTCCTGG	25	20	1
        GGTGGAGCGGTAATCTGGAACAGTG	25	104	0
          ****** ***  *
MAP Score: 4.87624

Motif 20
TGATTAATTTTGTTGGTGACCAATTCCCGGT	0	14	1
ATTATGTTCCTTTTGGTTTCCAAGTTCAAGG	3	60	1
TTTGTTCAGCTTTTGGTTAACTTTTCCC   	3	163	1
AATCTTGGTAAGTTGGTTTCGGAATTTT   	6	86	1
CCAAAGGGAATGTTGGTGTCGCTGTCAATGG	7	25	1
CCGTTGGTCATTTTGGTTGAGGAGTGTTCTG	11	228	1
      GCTTTGTTGATTGCCCTCCGACTGG	13	4	1
TTGCTTTGGCTGTGGGTTCAGAACTTATAGG	19	267	1
TCATTGATGATTTTGGTTGCCCCCAGGAGTC	25	44	0
          ******** **
MAP Score: 3.12175

Motif 21
TGACCAATTCCCGGTACATGGCCAGTTCTT	0	30	1
TACAATGTGCCCAGGCTATGGGGATAATCT	3	96	0
TCCTAGCCCTCCAGTCTAGGGGAAAATAGC	6	46	1
TTCCCTTTGGTCAGGATAGTTTAAC     	7	5	0
GGATTGGCGATCGGTCTAGTTCCCAACCCA	7	75	0
GGGATGGGACTCAGTCTAGTATTCTCCCAG	10	119	0
GGCTTATTTTCCAGTCCGTTGGTCATTTTG	11	213	1
AGAATATCTATCAGTCAATGGTAGGGTTCT	13	100	0
GAAATTTTTCCCAGTCTATTTTTATTTAGT	18	10	0
CCAGTTGTCTTCAGTCCATTTTTTCTCCGT	19	112	1
CTTATGTTAATCGGTATATTTCCGTATG  	20	8	0
TGATAATCCTCCGGTCTAGTTAACTGGCCG	22	124	0
          **********
MAP Score: 2.05509

Motif 22
TTCCGGCTTAGCTCGGTATTTTGGCTTGGATAAAA	0	124	1
AAAGTTTCAAGCTGGGATGGTTGGTAAGTTTCGAT	0	181	1
TGGATAAAACGCCGAGTCAGTGGGGAAGGATGGCA	2	50	1
GCTATTTTCCCCTAGACTGGAGGGCTAGGAACAAA	6	41	0
TGCGATTACGGCTGAGTTGTCTGGTCACATTCCCA	9	71	1
     ACGCTGTCTGAGACGATGGGATGATGGGTG	10	5	1
ATCAAAGTTTCCTTGAGAAATTGGCGATTCTTCCC	10	53	1
CCTCCGCATTGTCCAGAGGGATGGGACTCAGTCTA	10	131	0
AATTTACGACCCTAAAAATTCTGGCCCCAAAAAAT	18	59	0
ATTGGGAAAGCCCTGGTGCCATGGCTATCTGCGGC	18	114	0
ACCTAGAAAAGCCCAGTAATATTGCTTTACCTTAA	19	15	1
CCGTAAAAACCCCCAGCAAGTTGGCAAATTTGGGC	19	138	1
TACCATGCCCGCCGGGCAAGCTTGCATTTTGCAAA	21	76	1
AAAAGTCGAAGCTAGATTTTTTGGCTGCTTCAGGC	23	30	0
TTTTCGTAATCCCTGGGATTAGGGGATTTAACCGA	24	10	1
AAATTGTCAGCCTTGGGTATTTAGCGCAATTTTGA	24	109	1
GTGGGCAACGGCTGGAAAATGTTGGGCTGTCCAG 	26	9	0
          *** **   * ****
MAP Score: 0.0493547