AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HI/HI_operons001_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944236859 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 HI0349 84 adenylate kinase (adk) #1 HI0350 141 permease, putative #2 HI0351 172 UDP-glucose 4-epimerase (galE) #3 HI0352 300 conserved hypothetical protein #4 HI0514 241 DNA-directed RNA polymerase, beta' chain (rpoC) #5 HI0515 300 DNA-directed RNA polymerase, beta chain (rpoB) #6 HI0517 172 ribosomal protein L11 (rpL11) #7 HI0518 83 purine-nucleoside phosphorylase (deoD) #8 HI0519 98 transport protein, putative #9 HI0521 212 conserved hypothetical protein #10 HI0548 169 translation initiation factor 1 (infA) #11 HI0578 64 elongation factor Tu (tufA) #12 HI0579 83 elongation factor G (fusA) #13 HI0580 156 ribosomal protein S7 (rpS7) #14 HI0581 181 ribosomal protein S12 (rps12) #15 HI0582 300 glucose inhibited division protein (gidA) #16 HI0632 300 elongation factor Tu (tufB) #17 HI0638 128 conserved hypothetical protein #18 HI0639 22 adenylosuccinate lyase (purB) #19 HI0640 271 ribosomal protein L10 (rpL10) #20 HI0641 54 ribosomal protein L7/L12 (rpL7/L12) #21 HI0701 108 conserved hypothetical protein #22 HI0706 23 lipoprotein #23 HI0707 132 DNA mismatch repair protein (mutS) #24 HI0708 205 L-seryl-tRNA selenium transferase (selA) #25 HI0713 300 trigger factor (tig) #26 HI0714 122 ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit (clpP) #27 HI0716 237 preprotein translocase SecE subunit (secE) #28 HI0775 205 transcriptional regulator #29 HI0776 190 ribosomal protein S10 (rpS10) #30 HI0781 25 ribosomal protein S19 (rpS19) #31 HI0787 300 H. influenzae predicted coding region HI0787 #32 HI0788 280 ribosomal protein L14 (rpL14) #33 HI0792 36 ribosomal protein S8 (rpS8) #34 HI0798.1 28 ribosomal protein L36 (rpL36) #35 HI0799 139 ribosomal protein S13 (rpS13) #36 HI0801 27 ribosomal protein S4 (rpS4) #37 HI0802 31 DNA-directed RNA polymerase, alpha chain (rpoA) #38 HI0803 40 ribosomal protein L17 (rplQ) #39 HI0817 170 conserved hypothetical protein #40 HI0819 37 galactokinase (galK) #41 HI0820 207 galactose-1-phosphate uridylyltransferase (galT) #42 HI0864 230 GTP-binding protein #43 HI1282 300 conserved hypothetical protein #44 HI1644 233 pseudouridylate synthase I (truA) #45 HI1722_HI1723 135 HI1722: methionine aminopeptidase (map), HI1723: conserved hypothetical protein #46 HI1726 124 phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase (purC) #47 HI1727 155 argininosuccinate synthetase (argG) #48 HI1735 79 peptide chain release factor 3 (prfC) Motif 1 CTGATAAAGCATAGTGCGGTCAAATTTTTT 0 28 0 AAAGTGCGGTTAATTTTAGT 1 131 0 TGAAATCGCCGAAGTGCGGTCAAAATTCTC 4 171 1 TTAAAGGTTTAAAGTGCGGTTAAAAATTTC 4 202 0 CCTTACTTCTATAGTGGGGTGACAACTCAA 5 197 0 AGTAAGGTTCAGAGTGCGGTCATTTTAACG 5 220 1 GATTATATAAAAAGTGCGGTTGTTTTTCAA 6 36 0 AATCAATTAAAAAGTGCGGTAAAAAATGAC 7 18 1 AAAAATGAATAAAGTGCGGTCATTTTTTAC 7 36 0 ACGTTTACAAAAAGTGCGGTGAAAATTCGC 8 10 1 TTTAATAAGAAAAGTGCGGTTATTATAGGG 10 18 1 TGTTTCCTAAGAAGTGCGGTATAAAACAAT 11 38 0 TAAAAAAACAAAAGTGCGGTAAATTTTAAT 14 19 1 AACAAGAACAAAAGTGCGGTTATTTTAGTG 21 23 1 CTTCCTGTAAAAAGTGCGGTAAAAAATCTC 23 11 1 AAGCCAGATAAAAGTGCGGTAAAAATTTGT 23 42 0 TCCGTGGTTGAAATTGCGGTCACTTTAGCG 24 142 1 CTTACAAACAAAAGTGCGGTCAAAAATGAT 25 135 0 TGATTGAATAAAAGTGCGGTCGCTCTTTTT 26 25 1 TTTAATCGCAAAAGTGCGGTTGTTTTCACC 27 11 1 TATAATTCCAAAAGTGCGGTAAATTTTAAC 32 101 1 AGGTTATGATATAGTGCGGTGAATTACACC 43 233 1 TTGGCTTAATAAAGTGCGGTTATGGTAGCC 44 203 0 ACAAAGAGGAAAAGTGCGGTTATACTCTAT 47 74 1 ********** MAP Score: 115.49 Motif 2 GATTGATTGATTGATTGATT 3 0 0 GATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA 3 12 0 GATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA 3 24 0 GATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA 3 36 0 GATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA 3 48 0 GATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA 3 60 0 GATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA 3 72 0 GATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA 3 84 0 GATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTGA 3 96 0 ATGACAGACTTTGATTGATTGATTGATTGA 3 108 0 AGCAAAGATTTAGATTGATTTTTAATCAAT 5 55 1 ACCGCACTTTTTAATTGATTAAGATAAA 7 8 0 ********** MAP Score: 35.0622 Motif 3 TATTTGTTTTTCTTTTTTAGGAAGAAGAATGCTAAA 1 20 1 AAACGTTTGCTATTTTTTAAAAAGAAATAAAAATCC 46 80 0 AAATAATCGATTTTTGTGAATAAAAATTCTATAGAG 47 98 0 TGTAATGACATTTTTATTATAAATAATGGC 39 4 0 CAGAATGAGATCTTTATCACAAAAAATTCACATTTA 44 85 1 TAAGGGCTCTTTTTTATCGAAAATAATTGTGCGAAA 21 79 0 TTAACATTTTTCTTGCCAAGAACCAGTTGAGT 35 6 1 TGCCAAATTGAGTTTTTCATGAACAATATTATTTTT 10 81 1 AGTTTTTTATAAAAAAACAAAAGTGC 14 0 1 CTATCTCTATTTATTCTGATCAAAAAATTGGCGTTA 15 272 0 TGTATAATAATTATTATCATTAAAAATTAAGGAAAC 25 12 0 TCATTTTTATTCATTATTAAAAATAAGGAAAAATT 7 58 1 GAAGATCATTATTTTCTTGGCAAGAAAATAAAAAAA 3 229 1 ACTGCTAATTATTTTATCGTAAATAACCCACAAATA 26 75 0 GCATATTGTTTAATTATTGACAATAAAGCGTAAAAC 14 66 1 AATAATAAGATCTTTATATATAAAAAGAGATCTTAT 15 158 1 TAATTGAGCGTCTTTTTATTTAACAAACGTGTTCGG 25 235 1 AGTTTTGGGGTTTTTTTCTATAAGAAATTTAGTAAC 43 84 1 CTACTGGGAATATTTCTAATGAAGATTGGGATTGGT 31 254 1 TATCGTAAATTATTTATGATCAAAATATAAGATTTA 41 33 0 AATTTATACTAAATTATTGTAAATAAACCGTGATCT 41 143 0 ATGGCAACCGAAATTGTTGATAAAAAGAAAAATACG 27 152 1 TCATTGCGCCATTTTTTATGTAACAATGCAATAAAA 42 173 1 AGGTGTTTTAAATTTCTGTAGAATAACGCCAATTTT 15 249 1 ATAGAAGTAGATTTTTTGAACAACATTCTATTCTTG 14 128 1 TTATTTTCTTATTTTGTGACAAAGATCACGGTTTAT 41 121 1 GAAAATGCGATCATTTTCTTTAAAAATCTTGTGTGT 15 39 0 AAAAATCCCCTAATTTTTACAAAAATCCTTTAATTG 1 72 1 GTAAGAATGGTGATTTTCAATAAAATAAAAAACCTG 2 92 0 TTTTTCAACAATATTCTTTACAAGAACATAGCTTTT 19 22 1 GTTGCAATCAATTTTATTTTGAAGATCATTATTTTC 3 209 1 * *** * * ** ** MAP Score: 32.3629 Motif 4 ACTTTATTCATTTTTATTCATTATTAAAAATAAGGAA 7 51 1 TAACGCCAATTTTTTGATCAGAATAAATAGAGATAGA 15 272 1 ATTATACTTTTTTTTGATATTGATTAAATAAATTGAA 25 58 0 AATAAATATGTTTTTGATATAAATGAACTGACAAAAT 9 68 0 TTAAGGGCTCTTTTTTATCGAAAATAATTGTGCGAAA 21 79 0 GTTTCCTTAATTTTTAATGATAATAATTATTATACAT 25 12 1 GTGATATAATTTTTTAGTCTCAATAATTAACAAGGAA 2 139 1 TGTAATGACATTTTTATTATAAATAATGGC 39 3 0 AACTTTTTCCTTGTTATAATCTATAAATCT 41 3 1 ATTAAGATCTTTTTTGGTTGTGAGTAACCTTATTCGA 15 115 0 ACAATATTATTTTTTCTTTCGTAGAAAGCTAAAAACG 10 103 1 CTAATATTTGTTTTTCTTTTTTAGGAAGAAGAATGCT 1 16 1 TTTCAGAGGATTTTTATTTCTTTTTAAAAAATAGCAA 46 73 1 TAGCAACAGGTTTTTTATTTTATTGAAAATCACCATT 2 86 1 CTTCTTGCGTATTTTTCTTTTTATCAACAATTTCGGT 27 158 0 TTGACTCCTGTTTTTTATCAATGTAAACGATTACATT 41 179 0 CTCTATAGAATTTTTATTCACAAAAATCGATTATTTA 47 98 1 CCAAATTGAGTTTTTCATGAACAATATTATTTTTTCT 10 83 1 TAAATGTGAATTTTTTGTGATAAAGATCTCATTCTGA 44 84 0 TGCCTTTCTCTTTTTCTTTTGATAAAATCCGCCGCCT 32 177 1 ATATTTTCCTTACTAATAATTAGAATTGA 47 136 0 TTAACATTTTTCTTGCCAAGAACCAGTTGAGT 35 5 1 TAAATCTTATATTTTGATCATAAATAATTTACGATAA 41 33 1 ACATGTATAATTTTTCCTTTTCGACAAATGTAGAAAT 42 124 1 GCCATGCTATTTTTTCATGAAATTTATTTTTCTTATT 42 62 1 TACGAAATTCTTTTTGCTATTTTTAATATCAATCTAG 28 117 0 GAGCATTTCATTTTTTCTGCAGTTTATTTTTCATTCG 32 35 1 GAAGATCATTATTTTCTTGGCAAGAAAATAAAAAAAG 3 229 1 TAAAAATTGCATTTTGATAATTTTAAAATATGACTTA 25 161 0 TTATCCCTCTATTTTAGTAATAGTAAAAAGATAGTTT 43 171 0 GTTTTGGGGTTTTTTTCTATAAGAAATTTAGTAACTG 43 85 1 ACCTAACCCTTTTTTTATGCCTGAGATTTAATAAACT 43 139 1 ATTTCTCCGTATTTTAATCTTCAGGATATCCAAAACC 13 124 0 ATAGGTTAAGATTTTTCTGAGAAGGATAAGATC 38 17 1 GCACTCCTATATTTTAATTAATTTGATATTCTGATCT 35 109 0 TGTGGCTCATATTTTTGTGTGGTGCAATGAATCTTGC 6 86 1 ***** * ** ** MAP Score: 31.5978 Motif 5 TTCTTCCTAAAAAAGAAAAACAAATATTAG 1 16 0 ATTGTTGATAAAAAGAAAAATACGCAAGAA 27 164 1 GGATTTTATCAAAAGAAAAAGAGAAAGGCA 32 177 0 TCATAGCAGAAAAAGAAAAATACATGTATA 42 103 1 ACATTTGTCGAAAAGGAAAAATTATACATG 42 125 0 AATAACACCTAAAAGAAAAGGTGCGGGTT 31 9 0 AGAATTTCGTAAAAGAAATACATCTTTCTT 28 143 1 TATGACTAGAATAAGAAAAATAAATTTCAT 42 78 0 CTATTTTTTAAAAAGAAATAAAAATCCTCT 46 77 0 GATTTTCAATAAAATAAAAAACCTGTTGCT 2 87 0 TCTTGGCAAGAAAATAAAAAAAGTATTTTT 3 243 1 AGGCAAGGCGAAAAGAAAATGCTACAATCG 27 70 1 ATATGAGCATAAAAGAAAATCATTTTTGAC 25 117 1 GTTTTATCATAAAAGGAAAGATGCAAAAAC 9 31 1 ATTATTAAAAATAAGGAAAAATT 7 70 1 ATGAAAAACTAAAAGGAAATT 44 1 0 GTACTATTTAATAAGAAAAGTGCGGTTATT 10 12 1 TTAAAATAAAAGCTTGCAAATA 29 2 1 TTTGTGCATTAAAAGCAAAAATCTTTATTT 47 37 0 GCCATTATTTATAATAAAAATGTCATTACA 39 10 1 ATCAATTCCTAAAATAAATAAAGTTAGATG 20 30 0 ACGGTTACTCAAAATAAATATGTTTTTGAT 9 87 0 TTGTCACAAAATAAGAAAATAAGCAAAATT 41 113 0 AATGATCTTCAAAATAAAATTGATTGCAAC 3 209 0 TAACGGAACAATAAGGAATAACT 22 10 1 ATAATGAATAAAAATGAATAAAGTGCGGTC 7 45 0 AACTGCAGAAAAAATGAAATGCTCTCTTCT 32 29 0 GTTTTTTTCTATAAGAAATTTAGTAACTGG 43 93 1 CTTATTTTTAATAATGAATAAAAATGAATA 7 55 0 ********** MAP Score: 26.4531 Motif 6 GGGAATGATTAAAAATCCCCTAATTTTTACAAAAATC 1 62 1 AAATACAACTAAAATTAACCGCACTTT 1 124 1 AAGTGCGGTCAAAATTCTCCGAAATTTTTAACCGCAC 4 182 1 CACACAATGACAAATTCACCGTTATTTGTCGTTGTTT 5 135 1 GAAGTGCTTGAAAAACAACCGCACTTTTTATATAATC 6 29 1 AAGTGCGGTAAAAAATGACCGCACTTTATTCATTTTT 7 29 1 AAAGTGCGGTGAAAATTCGCCGACTTTTCATAAGAAA 8 20 1 GAAAACAAGTAGAATAAGCCGAATTTTATTAACTTAA 8 53 1 ATGAACTGACAAAATTATTTCTGTTTTTGCATCTTTC 9 46 0 AAAAACGGCTATAATCCGCCCGTTTTTCTTAACTTTT 10 133 1 TGCGAATTTCTCCGTATTTTAATCTTCAG 13 137 0 AAACTAGATTAAAATTTACCGCACTTTTGTTTTTTTA 14 19 0 GATTTTTAAAGAAAATGATCGCATTTTCACAAGATTT 15 47 1 AAATTTCTGTAGAATAACGCCAATTTTTTGATCAGAA 15 258 1 AATATTGTTGAAAAAAGAGCCAAATTC 19 0 0 ATTTATCCACTAAAATAACCGCACTTTTGTTCTTGTT 21 23 0 TTTATCGAAAATAATTGTGCGAAATTCTATGCGACTT 21 66 0 AAATTAATTGGCAATTCAACGTTATTTTAAACGGATT 24 173 1 TTCTTTCGTTATAATTGAGCGTCTTTTTATTTAACAA 25 224 1 CGGTTGCCATAGAATTGAATCCGTTTTAAATGGAAAT 27 125 0 TAATCCAGTTAAAATTTACCGCACTTTTGGAATTATA 32 101 0 TTTTAACGCTAGAAATGAACCTGATTTATAGATCTTG 39 38 0 TAAATCATAAAAAATTTTGCTTATTTTCTTATTTTGT 41 101 1 AGCTTTGTGCATAAAAAATCCTAATTT 47 0 0 TTAGAATTGAATAAATAATCGATTTTTGTGAATAAAA 47 109 0 TAAAATCAGGGAAAATAGTCCACATTTTTAATTGAAC 48 40 1 * **** ** *** MAP Score: 19.2165 Motif 7 TTGAGCGTCTTTTTATTTAACAAACGTGTTCGG 25 238 1 TTGCGCCATTTTTTATGTAACAATGCAATAAAA 42 176 1 AGTCCACATTTTTAATTGAACAAAGAAGAAACA 48 56 1 AGTTTTTTATAAAAAAACAAAAGTGCG 14 4 1 GCGATGGCTTTTTTATTTACAAAGGTTTACACT 39 119 1 TCTATAGAATTTTTATTCACAAAAATCGATTAT 47 99 1 AATTAGGATTTTTTATGCACAAAGCTAAATAAA 47 11 1 TAAGATCTCTTTTTATATATAAAGATCTTATTA 15 160 0 GATTTTTGCTTTTAATGCACAAAACACTAGACA 47 44 1 AAAAATCTACTTCTATATAGAAATAGACGGCGA 14 111 0 AATAATTCAATTTATTTAATCAATATCAAAAAA 25 53 1 ATCCTTTTACTTTAAATGAACAA 34 0 0 CAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATC 3 65 1 CAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATC 3 45 1 AATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATC 3 9 1 CAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATC 3 81 1 CAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATC 3 25 1 CAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAAAG 3 97 1 ACACTCCAAAATTTATTCAAAAATAAGCGATAG 44 140 0 TTGCGTATTTTTCTTTTTATCAACAATTTCGGT 27 158 0 AACCTGATCTTTCAAAGGATCAATAGATCCATT 15 205 1 TCTCGTAAAGTTTTTTCAAAAAAGTGAGATAAA 45 111 1 TAATTAGCAGTTTTAATGAAAAAGGTAAGAAA 26 100 1 GTTTGCTATTTTTTAAAAAGAAATAAAAATCCT 46 79 0 AGCAAAACAATTTAAACCATAAACTCCAGTCAA 13 45 1 CTTTCTCTTTTTCTTTTGATAAAATCCGCCGCC 32 180 1 CAGTTTATTTTTCATTCGATAAATTTTTGAGAG 32 54 1 CAATTCTAACTTCAAAATAGAAAAGGAGGTGCA 29 161 0 ATAGAAGTAGATTTTTTGAACAACATTCTATTC 14 128 1 ATAAACTGATATTAAATAAACAAGGTTATAATA 12 60 1 CTTTTTGCTATTTTTAATATCAATCTAGTTCCT 28 112 0 AAGTACTATTTAATAAGAAAAGTGCGGTTA 10 7 1 AAATCCCCTAATTTTTACAAAAATCCTTTAATT 1 74 1 TACACACAAGATTTTTAAAGAAAATGATCGCAT 15 38 1 TGTAATGACATTTTTATTATAAATAATGGC 39 7 0 TGTCAGTTCATTTATATCAAAAACATATTTATT 9 72 1 ****** * *** MAP Score: 18.7661 Motif 8 AATACAACTAAAATTAACCGCACTTT 1 125 1 AATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCA 3 3 1 ATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCA 3 19 1 ATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCA 3 35 1 ATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCA 3 51 1 ATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCA 3 67 1 ATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCA 3 83 1 ATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAAAGTCTGT 3 99 1 GATTGATTAAAAATCAATCTAAATCTTTGCTAATTT 5 50 0 AATGACCGTTAAAATGACCGCACTCTGAACCTTACT 5 220 0 AAGTGCTTGAAAAACAACCGCACTTTTTATATAATC 6 30 1 TTGTGTGGTGCAATGAATCTTGCACTAAAAATTATC 6 100 1 AGTGCGGTAAAAAATGACCGCACTTTATTCATTTTT 7 30 1 AACAACCCCTATAATAACCGCACTTTTCTTATTAAA 10 18 0 AGTGCGGTATAAAACAATCATATTTTACACCGCTGG 11 20 0 GAATGTTGTTCAAAAAATCTACTTCTATATAGAAAT 14 120 0 TTTATCCACTAAAATAACCGCACTTTTGTTCTTGTT 21 23 0 AAATAGCCGCCACAAAACCTATCTTTATTCAGTTTC 23 91 1 AATTTACGCTAAAGTGACCGCAATTTCAACCACGGA 24 142 0 AAATCTGGTGAAAACAACCGCACTTTTGCGATTAAA 27 11 0 AAATTATTGTAAATAAACCGTGATCTTTGTCACAAA 41 133 0 TAAGTTCAGTAAAAGAACCCCAGTTTTGGGGTTTTT 43 63 1 CAGTTTTTTCCTAGAAATCGTGCTATAATCTCGTAA 45 83 1 *** **** ** * MAP Score: 18.1406 Motif 9 TTATATCAAAAACATATTTATTTTGAGTAACCG 9 83 1 AACCGTTTGCATAATGTTTATTTTCTAAAACTG 9 111 1 AACATTTCAGAGGATTTTTATTTCTTTTTAAAA 46 69 1 ATTAAAAGCAAAAATCTTTATTTAGCTTTGTGC 47 27 0 TAAAAGCGATCGCATTTTTATTTGTGGGTTATT 26 57 1 TTCCGTTGCAATCAATTTTATTTTGAAGATCAT 3 205 1 CTATTTTTTCATGAAATTTATTTTTCTTATTCT 42 68 1 GAAAGTTATTAACAACTTTATTT 15 0 0 CACATTAACCAATAAATTTATTTGCTGATTGAT 16 229 0 TATACTCTATAGAATTTTTATTCACAAAAATCG 47 94 1 GTTATGGTAGCCCAAGTTTATTTGGAGCGCAAA 44 182 0 CGCCACAAAACCTATCTTTATTCAGTTTCAAAG 23 98 1 TATAATTGAGCGTCTTTTTATTTAACAAACGTG 25 233 1 TATTATAACCTTGTTTATTTAATATCAGTT 12 63 0 TTTTAGCAACAGGTTTTTTATTTTATTGAAAAT 2 83 1 ATTAAAAAATACTTTTTTTATTTTCTTGCCAAG 3 244 0 ACTTCATCTAACTTTATTTATTTTAGGAATTGA 20 26 1 TAAAAACACTCCAAAATTTATTCAAAAATAAGC 44 145 0 ATATTAAATAATTCAATTTATTTAATCAATATC 25 47 1 TTCATTTTTTCTGCAGTTTATTTTTCATTCGAT 32 41 1 TCACAAAAATCGATTATTTATTCAATTCTAATT 47 115 1 TTTGAAATATAAGATACTTATTTGTTGATATTC 28 41 0 TAAAAAATGACCGCACTTTATTCATTTTTATTC 7 37 1 AGAAGCAAGAAAAATTCTTATTCTGTTCACCAT 19 169 0 GTATAGGGGGAAAATGTTTATTATTGGAAATTT 46 29 0 TTTGGTTGTGAGTAACCTTATTCGATCCTTATG 15 107 0 ATCATAAAAAATTTTGCTTATTTTCTTATTTTG 41 104 1 * ** ******* MAP Score: 18.1349 Motif 10 AAGTGCGGTAAAAATTATAAAAAA 0 0 1 AAAGTGCGGTTAATTTTAGTTGTAT 1 126 0 AAAAGTATAGTATTGCTCAAAAATTGTAGAAC 3 278 0 GAAATCGCCGAAGTGCGGTCAAAATTCTCCGAAA 4 172 1 TAAAGGTTTAAAGTGCGGTTAAAAATTTCGGAGA 4 197 0 ATAAAAGGTCAAGATTGATTAAAAATCAATCTAA 5 64 0 TGTGACGTGAATGACCGTTAAAATGACCGCACTC 5 231 0 ATCAATTAAAAAGTGCGGTAAAAAATGACCGCAC 7 19 1 CGTTTACAAAAAGTGCGGTGAAAATTCGCCGACT 8 11 1 GTTTCCTAAGAAGTGCGGTATAAAACAATCATAT 11 33 0 AAAAAAACAAAAGTGCGGTAAATTTTAATCTAGT 14 20 1 TCAAGAATAGAATGTTGTTCAAAAAATCTACTTC 14 131 0 TATCTCTATTTATTCTGATCAAAAAATTGGCGTT 15 273 0 TCTTGTAAAGAATATTGTTGAAAAAAGAGCCAAA 19 13 0 AGATGAAGTAAGAAACGCTTAATAA 20 1 0 TCGCACAATTATTTTCGATAAAAAAGAGCCCTTA 21 81 1 TTCCTGTAAAAAGTGCGGTAAAAAATCTCAACAA 23 12 1 AGCCAGATAAAAGTGCGGTAAAAATTTGTTGAGA 23 37 0 ATCCGTTTAAAATAACGTTGAATTGCCAATTAAT 24 175 0 TATAATAATTATTATCATTAAAAATTAAGGAAAC 25 12 0 TTACAAACAAAAGTGCGGTCAAAAATGATTTTCT 25 130 0 CAGTCGATAAAAGAGTGATTAAAAATTGCATTTT 25 183 0 CACACCGAACACGTTTGTTAAATAAAAAGACGCT 25 241 0 TAATATTATTATGATTGAATAAAAGTGCGGTCGC 26 14 1 TTTGTGGGTTATTTACGATAAAATAATTAGCAGT 26 77 1 AATAATTAGCAGTTTTAATGAAAAAGGTAAGAAA 26 98 1 TTATTTTTACATTTCCATTTAAAACGGATTCAAT 27 115 1 AAGGATTGTTTAAAACACTATCAAA 28 190 0 ATAATTCCAAAAGTGCGGTAAATTTTAACTGGAT 32 102 1 TAGTTAAGCTTAAAACCAAAGAGAG 37 1 1 GCCATTATTTATAATAAAAATGTCATTACA 39 6 1 ATCGTAAATTATTTATGATCAAAATATAAGATTT 41 34 0 ATCATAAATAATTTACGATAAATTGAAAGCGGTT 41 49 1 TTTATTGCATTGTTACATAAAAAATGGCGCAATG 42 174 0 GTTTTTATGCATTTGCGCTCCAAATAAACTTGGG 44 171 1 GAGGATTTTTATTTCTTTTTAAAAAATAGCAAAC 46 78 1 * ** ** * **** MAP Score: 14.8615 Motif 11 TTTGTAAAAATTAGGGGATTTTTAATCATTCCCCTA 1 59 0 CGCCTTTCAATTAAAGGATTTTTGTAAAAATTAGGG 1 79 0 TACTTTTTAGCAACAGGTTTTTTATTTTATTGAAAA 2 79 1 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