AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HI/HI_operons003_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944237022 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 HI0016 167 GTP-binding membrane protein (lepA) #1 HI0017 257 conserved hypothetical protein #2 HI0229 298 polynucleotide phosphorylase (pnp) #3 HI0273 300 ribonuclease PH (rph) #4 HI0431 35 conserved hypothetical protein #5 HI0432 66 conserved hypothetical protein #6 HI0433 75 orfG protein #7 HI0439 98 competence protein A (comA) #8 HI0568 95 transcription accessory protein (tex) #9 HI0963 34 riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase (ribF) #10 HI0964 300 virulence factor (mviN) #11 HI0997 300 H. influenzae predicted coding region HI0997 #12 HI0998 180 ribosomal protein L34 (rpL34) #13 HI1002 130 thiophene and furan oxidation protein (thdF) #14 HI1219 279 cytidylate kinase 1 (cmkA) #15 HI1220 75 ribosomal protein S1 (rpS1) #16 HI1221 122 integration host factor, beta-subunit (himD) #17 HI1288 300 ribosome binding factor A (rbfA) #18 HI1310 24 H. influenzae predicted coding region HI1310 #19 HI1311 148 phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit (pheS) #20 HI1312 33 phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit (pheT) #21 HI1324 96 lon protease, putative #22 HI1325 168 3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier-protein) dehydratase (fabA) #23 HI1326 233 H. influenzae predicted coding region HI1326 #24 HI1328 135 ribosomal protein S15 (rpS15) #25 HI1331 163 transcription elongation factor (greA) #26 HI1368 103 zinc protease, putative #27 HI1369 43 conserved hypothetical protein #28 HI1370 107 molybdenum-pterin binding protein (mopI) #29 HI1371.1 56 conserved hypothetical protein #30 HI1472 67 iron chelatin ABC transporter, periplasmic-binding protein, putative #31 HI1475 227 H. influenzae predicted coding region HI1475 #32 HI1476 227 transcriptional regulatory protein #33 HI1646 300 cytidylate kinase 2 (cmkB) Motif 1 AAAGAGCAGGTTATTTTTTTAATTAATTTTTAT 1 141 0 AAAAACTTTCTTTTATTTTTATT 8 0 0 NTTCCATTTCTTACATTTTTATTACTATTTGTG 14 122 1 GAATACGTTATTCCATTTTTATTTTTGATAAGC 19 29 1 ATTTGTACAGTTTTATTATTATTTTCGTGCCAA 1 221 1 TAGCGTAGAGTTTTCTTTTTTCTAGGTAAAATA 26 80 1 TAAACGGGCGTTTTCTTTTTTGTTTAAATTCTT 31 26 1 TGTTTTTCCTTTTACTAAATAAAACA 25 147 0 ATTTTTCGCATTATTCTTTTACTTTTTAAGGAC 19 67 1 TTGTTGTTATCCTTTTAATTCAAATCCGA 20 14 0 CGGAATGTGCTTTCTTTATTATTTGATCTTAAT 13 35 1 GTGCTTTACCTTGCTTTATTAATTTGGTGGAGA 3 157 0 TTTTTCTTTATTAATTCATACAAAA 23 2 1 ACTTCGGGGTTTCTTTTTTCATTCAAACTGAAA 0 10 0 AATATTCTTGTTATTTTTTAATTTTATTAGTGG 23 110 1 GTATTCGCTATTCCATTTTTTCTTG 19 2 0 TTTTTTCGCTTTTCTTTTTTTCTATAATTTCTA 22 26 1 TCTAGCACGCTTTAGTTTTTATTTTTGTTAAAA 3 228 0 CGGGTAATAATTTAGTTTTTAATCCCGTAATAG 32 167 1 TAACATTAATTTAACTTTTTATTGAATGAATGT 1 52 0 AAGTAGCTCTTTTTTCTATTATTAAATTGGACA 33 135 0 ATATTCTATATTCTTCTATTAATGCTATAACTA 14 157 0 TATTTTATCCTATTAATAAGTTTTTAT 1 4 1 CACCTTGCTGTTTTATTATCAATAATCAATATC 3 187 1 ATTATAAATCTTCTTTTATAACTCA 5 2 0 TTCCTATTTCTTTTGTTTTCTTTGTTTTG 31 208 1 TTTCCCCTGCTTCTCTTTTCTCTATAAAATAAA 19 123 0 TTACTGTGGTTTTTGTTTTATTTAGTAAAAGGA 25 134 1 TTATTCGGGGTTTTGTTTTATCTAAAAAGTTTG 0 42 1 CCCATGGCCATTTTTTTTCTACTGATAAAGAAT 11 254 0 CCCATACAAATTATCCTTTCATTCTCCAAATTT 14 255 0 CGTGCTTAATTTCAGTTTTTTGTATAAACGAAG 33 83 1 TTTTCCTATTTTTCACGTATAAT 29 0 1 ATATTTCAAATTATTTTATATTTATTTGATAAA 1 171 0 TTAAAATTCATTAATTTTTAAATAAAATTTATA 1 94 0 TTTTAATCTATTGTTTTACTATTTCGAATAAAA 32 110 1 TAGCCATCATTACATTATATTTCATATAAAAG 2 9 1 TTCAGATTCCTTTATATATGATAAATCCA 22 149 0 TAATTTCTATTTAAATTATAAATAATATACTAA 23 198 1 CTTATCGCGCTTTTTTTTCCAGTGCTTTATA 6 8 0 TTTTAAAAATTTCCGTTTCTTATTTGACGAACG 12 93 1 AGAAAGTTTTTTGAATTATATTTGAGCCATCCC 8 22 1 ** * ****** * MAP Score: 37.4361 Motif 2 TTTCCTTAAAATTTATATTAAAAACAATGCCTTA 2 269 0 AGTTTTACTAAAAAAATGATCTGC 11 286 0 AGAAACGGAAATTTTTAAAAAAAACTTCAAACGA 12 79 0 CACTCTTAGAAATTATAGAAAAAAAGAAAAGCGA 22 31 0 TATCTTAGCGAATTTTAACAAAAATAAAAACTAA 3 216 1 TGTCCAATTTAATAATAGAAAAAAGAGCTACTTT 33 135 1 ACTAAACACAAATAGTAATAAAAATGTAAGAAAT 14 127 0 ATCTTACTGCAGTATTATCAAAAATAAACTTGAA 25 91 0 AAAACTAAGAATTTAAACAAAAAAGAAAACGCCC 31 31 0 AGATTTTCTGAAATTTAAGAAAAAGCTTGAAAGG 33 253 1 GGTGCGGTGAAAATCTAGGAAAAACTTTCACCGC 23 37 0 GTTTTTATTCATTATAAACAAAAACATTCATTCA 1 29 1 ATTTACCACTAATAAAATTAAAAAATAACAAGAA 23 114 0 TGTTTTATTTAGTAAAAGGAAAAACA 25 147 1 TTCCATTGACAAAAGTATAAAAAATCGGCATATT 10 52 0 TTAGGGAAAGAAAACTAAGAAAAAATCAGATCTT 31 92 0 GTGCCACAATAGTTATTAAAAAAACCTTGAAATG 33 192 1 AAATTTATAAAAATTAATTAAAAAAATAACCTGC 1 135 1 TCCTTTTACTAAATAAAACAAAAACCACAGTAAA 25 133 0 AAATTTAATGATTTTTGAGAAAAACAATCTTTT 0 144 1 TTGTTTTACTATTTCGAATAAAAACAATGACTTA 32 120 1 TTTTTAAATGANTTAGACGAAAAACTTTGGGCAT 17 44 0 GCTTATCCCTGTTTCTACTAAAAAAACTCTATCT 13 86 0 TCTACACTTCGTTTATACAAAAAACTGAAATTAA 33 88 0 TTCTATAATAACGTTTATTAAAAACTTTAAAATA 23 154 0 ATTGATATAAATTTTATTTAAAAATTAATGAATT 1 89 1 ATCAGGTGTCATTTTATCGAAAAACAGTATTAAG 17 202 1 AGAATATTATAGATATTTTAAAAATTTATTACAA 23 84 0 AAAGTAAAAGAATAATGCGAAAAATCATTGGCTT 19 58 0 AAAACTTCAAACGAATATTAAAAAATATATGCAC 12 59 0 TTTCAGTTTGAATGAAAAAAGAAACCCCG 0 5 1 AGTCTTTAGAACAAGTTTGAAAAAATGTGTATAT 33 28 1 GATGGCTCAAATATAATTCAAAAAACTTTCTTTT 8 19 0 ATAGAAAAAAAGAAAAGCGAAAAAATGCTCGCTT 22 17 0 TCGGGGTTTTGTTTTATCTAAAAAGTTTGAAAAT 0 46 1 * ** ** ***** MAP Score: 36.932 Motif 3 ATGAAAGGGAAAAGTGCGGTCAAATTTTCAAA 0 71 0 TTGTACCTGAAAAGCGCGGAAATCGCTAGGGA 0 102 0 TTAAACGCCCAAAGTGCGGTCATTTTTTCGAA 2 206 1 CCAAATTAATAAAGCAAGGTAAAGCACCTTGC 3 163 1 CGCACTTTCAAAAGTGCGGTCATTATAAATCT 5 24 0 CGCACTTTTGAAAGTGCGGTTATTTTTATGGA 5 38 1 ACTGGAAAAAAAAGCGCGATAAGCGTATTATT 6 18 1 AGATACCTCAAAAGTTAGGTTACAACTTTTCA 12 13 0 AATTCATACAAAAGTGCGGTGAAAGTTTTTCC 23 22 1 TTAATAAGTAAAGGTGCGGTGAAAATCTAGGA 23 51 0 TAATGAAAAGTGCGGTAACTTTAATCTT 24 6 1 TTTAAAAGTGCGGTTATATTCAATTC 27 27 0 AAAAAGCTTGAAAGGGAGTTTACGCTTTCCTA 33 272 1 **** ***** * MAP Score: 33.6126 Motif 4 AAGTTATTCGGGGTTTTGTTTTATCTAAAAAGTTTGA 0 39 1 TATAATGCACGGGCTTTATTTTCTACATTAGCGTGCG 2 152 1 ACTTAGCGTAGAGTTTTCTTTTTTCTAGGTAAAATA 26 77 1 TTTTGAAAGTGCGGTTATTTTTATGGAGAAAAA 5 43 1 GACTAGAATTGCGCTCTATTTTATTCACTCTTAATTG 12 136 1 AAGTGCGGTCAATTTTCTGAAAGTTTTAAAC 28 4 1 GAATAACTTCGGGGTTTCTTTTTTCATTCAAACTGAA 0 11 0 ATTTAAACGGGCGTTTTCTTTTTTGTTTAAATTCTTA 31 23 1 TCATTACTCGGTTTTTTATTTTATAGAGAAAAGAGAA 19 109 1 GCATTTTTTCGCTTTTCTTTTTTTCTATAATTTCTAA 22 23 1 ATTTTACTGTGGTTTTTGTTTTATTTAGTAAAAGGAA 25 131 1 GCACGCTTTAGTTTTTATTTTTGTTAAAATTCGCTAA 3 220 0 CGCCCAAAGTGCGGTCATTTTTTCGAAAGATTTCTTT 2 211 1 AAAAGATTGTTTTTCTCAAAAATCATTAA 0 148 0 TACGCTTATCGCGCTTTTTTTTCCAGTGCTTTATA 6 8 0 GCATATTGATGCCCTTTATTTTGTCTATCAATCAACA 10 22 0 AAGCGAAAAAATGCTCGCTTTTCTCTA 22 0 0 CTTTTTCTATGTGGTTAGATTTTCTGAAATTTAAGAA 33 237 1 GCCCTACTCTACGCTTATTTTTACTTAGCGTAGAGTT 26 55 1 AGGGAAAAGTGCGGTCAAATTTTCAAACTTTTTAGAT 0 61 0 TCTGCCCATGGCCATTTTTTTTCTACTGATAAAGAAT 11 254 0 TATGGCAAGTAGGATTAAATTTTTTAAATGATGATAA 11 137 1 TAGCGTGCTTAATTTCAGTTTTTTGTATAAACGAAGT 33 80 1 GGCACGGAATGTGCTTTCTTTATTATTTGATCTTAAT 13 31 1 TAAAGAGCAGGTTATTTTTTTAATTAATTTTTATAAA 1 138 0 TAGCGAATACGTTATTCCATTTTTATTTTTGATAAGC 19 25 1 TAACGTATTCGCTATTCCATTTTTTCTTG 19 2 0 TTGTTGTTATCCTTTTAATTCAAATCCGAGAA 20 11 0 CCAGTATTCTATCTTCGTTTTTTTATAATAAAGAAGT 8 62 1 * * ** **** * * MAP Score: 30.0855 Motif 5 TGGTATTATCATTACTCGGTTTTTTATTTTATAGAGA 19 101 1 AATAAAGTTTATTTTAAAGTTTTTAATAAACGTTATT 23 145 1 TTGGCGGTGCATTGCCCCTTTTTTTATTCTTAGGGAA 31 118 0 GATGAAAAATTTTTAGGTGTTATTGATCAGTATCTTT 11 73 1 TTCCCACTACTTTAGTATATTATTTATAATTTAAATA 23 205 0 ATTATCGCATATTTAATAGCCTTGTGA 21 79 0 AAATGAAACTATTACGGTGTATTTTATAGTTGCAACA 32 66 0 TAGCCATCATTACATTATATTTCATATAAAAGAAC 2 8 1 TCATTTTAATATTTCAAATTATTTTATATTTATTTGA 1 175 0 TATGACTAGAATTGCGCTCTATTTTATTCACTCTTAA 12 133 1 CGGAATGTGCTTTCTTTATTATTTGATCTTAATATAT 13 35 1 CANACCCCGCATTTTATGGATTTTAATGTGGATGTTA 15 21 1 ATTTTATCCTATTAATAAGTTTTTATTCATTATAAAC 1 11 1 CTAAATTAAAATTCATTAATTTTTAAATAAAATTTAT 1 95 0 TTTTGNTTCCATTTCTTACATTTTTATTACTATTTGT 14 117 1 CAGGTTATTTTTTTAATTAATTTTTATAAATTTGATC 1 131 0 AATAGTTTCATTTGGCTATATTTTAATCTATTGTTTT 32 90 1 TTTAAAAACATTTCAAGGTTTTTTTAATAACTATTGT 33 197 0 TTCAAAAAACTTTCTTTTATTTTTATT 8 0 0 GTGTGGCGGATTTTATCAGTTTTTTTTCACGGAATAT 10 172 1 TTAATATTCGTTTGAAGTTTTTTTTAAAAATTTCCGT 12 72 1 TTTTTCTTTATTAATTCATACAAAAGTGC 23 2 1 TTATTTTCTCATTTCAAGTTTATTTTTGATAATACTG 25 79 1 CGAATACGTTATTCCATTTTTATTTTTGATAAGCCAA 19 28 1 ACTCAATTTCATTCGGGGCTTATTATTGTTCGTCTAA 25 39 0 AGAAAATATCATTATACACATATTTATATAATGATAA 30 19 0 TTAACATTAATTTAACTTTTTATTGAATGAATGTTTT 1 49 0 AAGCCAATGATTTTTCGCATTATTCTTTTACTTTTTA 19 58 1 AAAGTAGCTCTTTTTTCTATTATTAAATTGGACAATC 33 132 0 TGTGCCACTTTTTGGAGCGTTATTCAAATTATCATCA 11 165 0 AAATGTTAAATTTTATGAGATATTGATCACATTTTCT 14 83 0 TATTTTAAAAATTTATTACAATTTAATAAGTAAAGGT 23 68 0 AAAATATTAAATTAATTTCTATTTAAATTATAAATAA 23 186 1 TAACAAGAATATTATAGATATTTTAAAAATTTATTAC 23 86 0 AATGTTTTCCTTAAAATTTATATTAAAAACA 2 277 0 CACCTGATAATTTGTTTGAATATTCAAACTTCCGATA 17 173 0 TATCTATAATATTCTTGTTATTTTTTAATTTTATTAG 23 103 1 TATACGTGTTTTTATGCCGATTTTCTAGTGGATTTTC 21 44 1 ATTTTTATAAATTTGATCTAAATTAAAATTCATTAAT 1 112 0 CTACCCTAAAATTTTTGCCTAATTGTATAGAAATTTT 10 220 0 GGCGTTTTCTTTTTTGTTTAAATTCTTAGTTTTTCTG 31 32 1 TATTAAAATGATTTGATAAAATTTGTACAGTTTTATT 1 201 1 CGCTTTTCTTTTTTTCTATAATTTCTAAGAGTGACTG 22 32 1 *** ***** ** MAP Score: 29.056 Motif 6 TAATGTTAAATTATTGATATAAATTTTATTTAAAAATTAATGAA 1 77 1 TTTTTTTAATTAATTTTTATAAATTTGATCTAAATTAAAATTCA 1 117 0 TAGCCATCATTACATTATATTTCATATAAAAGAACCTAAT 2 6 1 TTGTTGTTATCCTTTTAATTCAAATCCGAGAAA 20 9 0 TAAGGCATTGTTTTTAATATAAATTTTAAGGAAAACATT 2 269 1 TATTTACAGTTTACTGCGTTCCTTTTAAAATAAATATATCAGTT 22 99 1 TCCTATTAATAAGTTTTTATTCATTATAAACAAAAACATTCATT 1 17 1 TACAACAAGCATTTTTAAATGANTTAGACGAAAAACTTTGGGCA 17 45 0 ATTATAGAAAATATTAAATTAATTTCTATTTAAATTATAAATAA 23 179 1 TTTTAATCTATTGTTTTACTATTTCGAATAAAAACAATGACTTA 32 110 1 AAAGATGTGATTATTTTATGGATTTATATGCAAAGCATATACCT 14 33 1 CATTCGGGGCTTATTATTGTTCGTCTAAAAAAAAATAGCAACCA 25 23 0 CCATATCCATTGATTCCGCTGATTTAGTGTTAAAAGATACTGAT 11 98 0 ATTCTTGTTATTTTTTAATTTTATTAGTGGTAAATAAAGTTTAT 23 113 1 TTATCATTACTCGGTTTTTTATTTTATAGAGAAAAGAGAAGCAG 19 106 1 GTCGGAGCAGTCACTCTTAGAAATTATAGAAAAAAAGAAAAGCG 22 32 0 AACTTCGGGGTTTCTTTTTTCATTCAAACTGAAA 0 0 0 CAATAATCAATATCTTAGCGAATTTTAACAAAAATAAAAACTAA 3 206 1 AGAAATTTTGTTTTTACGCTATATTCCGTGAAAAAAAACTGATA 10 185 0 AAATTCTTAGTTTTTCTGGTTCATTTTGACTAAATCAACCAAAG 31 51 1 ATATGCCGATTTTTTATACTTTTGTCAATGGAAAATTTGTGTTG 10 53 1 TCCGCCAGTTAAATTTAATGATTTTTGAGAAAAACAATCTTTT 0 134 1 CTATGTGGTTAGATTTTCTGAAATTTAAGAAAAAGCTTGAAAGG 33 243 1 AACGATACTTACTTTCGGTTGTGTCTCACCGAAATCAACACAAA 10 88 0 CCTTCTGACGTTCTACACTTCGTTTATACAAAAAACTGAAATTA 33 89 0 TGTCGTACTTCTTTATTATAAAAAAACGAAGATAGA 8 69 0 AATATTACTTAAATTAAGATCTATTGATAATAAATTACACAAAT 16 73 0 TATTTCAAATTATTTTATATTTATTTGATAAAGAGCAGGTTATT 1 159 0 AATTTAATATTTTCTATAATAACGTTTATTAAAAACTTTAAAAT 23 155 0 TACTTAGCGTAGAGTTTTCTTTTTTCTAGGTAAAATA 26 76 1 GGTTTAAAAGAGCCTGTATTTTATCTTACAAAAAACAAGTCGTA 28 53 0 AATTTTACTGTGGTTTTTGTTTTATTTAGTAAAAGGAAAAACA 25 130 1 GTAAAACAATAGATTAAAATATAGCCAAATGAAACTATTACGGT 32 85 0 * ** * ** * *** MAP Score: 28.619 Motif 7 GAACGATGTAATAAAAAAGCGCACTATTCTAGCA 3 254 0 AAAGCACTGGAAAAAAAAGCGCGATAAGCGTATT 6 13 1 ATTTAATAATAGAAAAAAGAGCTACTTTAGCTGA 33 141 1 TTATCAGTAGAAAAAAAATGGCCATGGGCAGATC 11 259 1 TGTTCGTCTAAAAAAAAATAGCAACCATAACAAA 25 16 0 TTCCCTAAGAATAAAAAAAGGGGCAATGCACCGC 31 118 1 CTTCGTTTATACAAAAAACTGAAATTAAGCACGC 33 82 0 ATATTCCGTGAAAAAAAACTGATAAAATCCGCCA 10 175 0 ATTTAAACAAAAAAGAAAACGCCCGTTTAAATGG 31 21 0 TGACAAAAGTATAAAAAATCGGCATATTGATGCC 10 46 0 TTAAGAGTGAATAAAATAGAGCGCAATTCTAGTC 12 136 0 ACGCTAATGTAGAAAATAAAGCCCGTGCATTATA 2 152 0 TAGAGAAAAGCGAGCATTTTTTCGC 22 1 1 CCGCTTGGGAAAAAGAAAGTGGGCAGGGGGTAGG 11 218 1 TGATTGATAGACAAAATAAAGGGCATCAATATGC 10 25 1 CGTTCGTCAAATAAGAAACGGAAATTTTTAAAAA 12 92 0 TTATAGAAAAAAAGAAAAGCGAAAAAATGCTCGC 22 19 0 ACGAACAGGCAAAAAGAAAGGCACGGAATGTGCT 13 12 1 CAAAGAAAACAAAAGAAATAGGAATTTGGCGAAA 31 198 0 TCTCTATAAAATAAAAAACCGAGTAATGATAATA 19 104 0 CAAGAAAAAATGGAATAGCGAATACG 19 2 1 TTTTCTCCATAAAAATAACCGCACTTTCAAAAGT 5 41 0 ATTTAGTGTTAAAAGATACTGATCAATAACACCT 11 87 0 TTAAAAAGTAAAAGAATAATGCGAAAAATCATTG 19 62 0 CTATATCCCCATAAAAGACAGCGACATGATAAAA 3 66 0 AATAAAAATAAAAGAAAGTTTTTTGAA 8 3 1 TTTTTGTAAGATAAAATACAGGCTCTTTTAAACC 28 63 1 * ****** ** * MAP Score: 27.8767 Motif 8 TTTTGTTTTATCTAAAAAGTTTGAAAATTTG 0 52 1 GGTCATTTTTTCGAAAGATTTCTTTTGCTAG 2 223 1 AATGTTTTCCTTAAAATTTATATTAAAAA 2 279 0 TTTCCTTAATTCGTAAGAGTTGGAATATTTA 4 10 0 AATTATGTCCTAAATACTTGAGAGAAAGT 6 56 0 CAAATATAATTCAAAAAACTTTCTTTTATTT 8 15 0 TCCTAAAATTTCTGTTGATTG 10 0 1 TTCTTCTCTACCCTAAAATTTTTGCCTAATT 10 233 0 ATCAATAACACCTAAAAATTTTTCATCATCT 11 69 0 GTTAGAGATACCTCAAAAGTTAGGTTACAAC 12 19 0 GATCAATATCTCATAAAATTTAACATTTTGN 14 92 1 TAACACTTGTTCGCAAAACTTGTCGGAGCAG 22 66 0 CCACTTACGTCCGTAAAATTTCGCCAAATTC 31 180 1 TGTATATTATCCGTAATAGTTGCATGTTGCA 32 42 1 ATAAAATACACCGTAATAGTTTCATTTGGCT 32 76 1 GTTTTTAATCCCGTAATAGTTGTAATTATTC 32 181 1 ACCTCTTTAGTCGTAATAGTTGAATAATTAC 32 202 0 TCAAACTTGTTCTAAAGACTTTTCTACATTA 33 17 0 TCCTTAAGTGCCACAATAGTTATTAAAAAAA 33 185 1 ** ******** MAP Score: 16.1224 Motif 9 CCGAAGTTATTCGGGGTTTTGTTTTATCTAAAAAGT 0 36 1 AAATTATTGATATAAATTTTATTTAAAAATTAATGA 1 84 1 ATTTGTACAGTTTTATTATTATTTTCGTGCCAATTA 1 221 1 TCTAGCACGCTTTAGTTTTTATTTTTGTTAAAATTC 3 225 0 TCAAAAAACTTTCTTTTATTTTTATT 8 0 0 CAGTATTCTATCTTCGTTTTTTTATAATAAAGAAGT 8 63 1 GTGGCGGATTTTATCAGTTTTTTTTCACGGAATATA 10 174 1 TTAATATTCGTTTGAAGTTTTTTTTAAAAATTTCCG 12 72 1 GAATACGTTATTCCATTTTTATTTTTGATAAGCCAA 19 29 1 CAATGATTTTTCGCATTATTCTTTTACTTTTTAAGG 19 62 1 TTATCATTACTCGGTTTTTTATTTTATAGAGAAAAG 19 106 1 GCGAGCATTTTTTCGCTTTTCTTTTTTTCTATAATT 22 19 1 ATATCTATAATATTCTTGTTATTTTTTAATTTTATT 23 102 1 TTTGTTATGGTTGCTATTTTTTTTTAGACGAACAAT 25 16 1 TATTTTCTCATTTCAAGTTTATTTTTGATAATACTG 25 80 1 AGAATTTTACTGTGGTTTTTGTTTTATTTAGTAAAA 25 128 1 TTACTTAGCGTAGAGTTTTCTTTTTTCTAGGTAAAA 26 75 1 TAAACGGGCGTTTTCTTTTTTGTTTAAATTCTTAGT 31 26 1 GGCGGTGCATTGCCCCTTTTTTTATTCTTAGGGAAA 31 117 0 GCCAAATTCCTATTTCTTTTGTTTTCTTTGTTTTG 31 202 1 TGGCTATATTTTAATCTATTGTTTTACTATTTCGAA 32 102 1 CGTGCTTAATTTCAGTTTTTTGTATAAACGAAGTGT 33 83 1 TTTAAAAACATTTCAAGGTTTTTTTAATAACTATTG 33 198 0 * **** ***** MAP Score: 12.1826 Motif 10 AAATTTTCAAACTTTTTAGATAAAACAAAACCC 0 49 0 AAATTTAATGATTTTTGAGAAAAACAATCTTTT 0 144 1 AAATTCATTAATTTTTAAATAAAATTTATATCA 1 91 0 ATTTATAAAAATTAATTAAAAAAATAACCTGCT 1 137 1 TTTATCAAATAAATATAAAATAATTTGAAATAT 1 171 1 TTTTAATATAAATTTTAAGGAAAACATT 2 280 1 GTTTCGAACGATGTAATAAAAAAGCGCACTATT 3 260 0 TGGCTCAAATATAATTCAAAAAACTTTCTTTTA 8 18 0 TCAAATTATCATCATTTAAAAAATTTAATCCTA 11 146 0 CTTCAAACGAATATTAAAAAATATATGCACTTT 12 56 0 AGAAACGGAAATTTTTAAAAAAAACTTCAAACG 12 80 0 TCTTTTCTCTATAAAATAAAAAACCGAGTAATG 19 110 0 ACTCTTAGAAATTATAGAAAAAAAGAAAAGCGA 22 31 0 AATTGTAATAAATTTTTAAAATATCTATAATAT 23 82 1 ACCACTAATAAAATTAAAAAATAACAAGAATAT 23 111 0 ATTTCTATTTAAATTATAAATAATATACTAAAG 23 200 1 TCCTTTTACTAAATAAAACAAAAACCACAGTAA 25 134 0 CAGAGTTTAAAACTTTCAGAAAATTGACCGCAC 28 12 0 CCTGTATTTTATCTTACAAAAAACAAGTCGTAA 28 52 0 TAAGAATTTAAACAAAAAAGAAAACGCCCGTTT 31 27 0 AGGGAAAGAAAACTAAGAAAAAATCAGATCTTT 31 91 0 TTCTTTCCCTAAGAATAAAAAAAGGGGCAATGC 31 114 1 GTGGGCGGGAATTATTGAAAACAGGGGCTTTGG 31 151 0 CAAAACAAAGAAAACAAAAGAAATAGGAATT 31 206 0 TCTTTAGAACAAGTTTGAAAAAATGTGTATATA 33 30 1 GTCCAATTTAATAATAGAAAAAAGAGCTACTTT 33 136 1 GTGCCACAATAGTTATTAAAAAAACCTTGAAAT 33 192 1 AAACCTTGAAATGTTTTTAAAAACCTTTTTCTA 33 213 1 GCTTTTTCTTAAATTTCAGAAAATCTAACCACA 33 246 0 * *** ****** MAP Score: 3.63249