AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HI/HI_operons018_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944237917 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 HI0244 300 tRNA-guanine transglycosylase (tgt) #1 HI0245 123 queuosine biosynthesis protein (queA) #2 HI0246 300 H. influenzae predicted coding region HI0246 #3 HI0249 153 excinuclease ABC, subunit A (uvrA) #4 HI0301 300 hemolysin, putative #5 HI0313 62 Holliday junction DNA helicase (ruvA) #6 HI0314 46 crossover junction endodeoxyribonuclease (ruvC) #7 HI0315 159 conserved hypothetical protein #8 HI0316 21 datP pyrophosphohydrolase (ntpA) #9 HI0317 218 aspartyl-tRNA synthetase (aspS) #10 HI0440 98 penicillin-binding protein 1A (ponA) #11 HI0441 87 orfJ protein #12 HI0442 116 conserved hypothetical protein #13 HI0443 61 recombination protein (recR) #14 HI0457 69 conserved hypothetical protein #15 HI0458 70 stationary phase survival protein SurA, putative #16 HI0459 131 pyrimidine operon regulatory protein (pyrR) #17 HI1230 147 adenine phosphoribosyltransferase (apt) #18 HI1231 113 dihydrolipoamide dehydrogenase (lpdA) #19 HI1232 62 dihydrolipoamide acetyltransferase (aceF) #20 HI1233 299 pyruvate dehydrogenase, E1 component (aceE) #21 HI1590 60 conserved hypothetical protein #22 HI1593 34 H. influenzae predicted coding region HI1593 #23 HI1596 58 leucine responsive regulatory protein (lrp) #24 HI1597 84 DNA repair protein (radA) #25 HI1598 300 conserved hypothetical protein Motif 1 GGTTAAATAAAATAGGCGGTAAGTCTAGTTTG 1 90 0 TTTATCTAAAAAAGTGCGGTTATTTTGCCTGA 3 25 1 CAGATATTAAAATATGCGATAATGATCGCAAA 3 98 1 GTTTAAACCTAAAGTGCGGTTAAAAATACACA 4 172 0 GTTTAAACCCAATGTGCGGTTATTTTTTATTG 4 196 1 ATTACACACTAAAGTGCGGTCATTT 11 3 0 TTTAAGCTATAAAGTGCGGTGAAATTTAGTGG 12 26 0 TTATAGCTTAAAAGTGCGGTAAGATTTTCTAA 12 46 1 ATAATGCTCAAAAGTGCGGTAAAAAAAGAAAC 17 123 0 AAAGACCGTAAAAGTGCGGTCAATATTTTTAA 18 73 1 TTGATGAAAACTGCGGTCAAAAAACATTG 19 7 1 TGTTCCTTTTAAAGTGCGGTCATAAAACACAA 19 36 0 TAATTATTTGAAAGTGCGGTAATTTTTTTGTG 20 103 0 ** ******* * MAP Score: 53.1242 Motif 2 AGTGCGGTTAAAAATACACAATTTTTACGGAGAGGG 4 156 0 TTGACGGCGAAAAATTATCATATTTTAGAAAAAATC 4 251 0 AAAATCTTCTAAAATTTACAAGATTTGTTAAATGTT 20 194 1 GAGTAAGATGAAAATATTCATATTTTCATCTTACTT 25 15 1 AATTTCAGGCAAAATAACCGCACTTTTTTAGATAAA 3 25 0 AAAACACAAAAAAATTACCGCACTTTCAAATAATTA 20 99 1 TGTTAAGTATAAAAGATTCAGCCTTTAAAGAATAGG 10 17 0 TTTTTTATTTAAAAGTCGCAATATTTTAATCACAAT 25 175 1 TCTAGACAACAAAATATTCTTATTTTGTTTATATGA 4 114 0 TGATTTGATGAAAATTCACTATCTTTATCTCAAAAA 20 161 1 AATACGCCTAAAAAGCGACGGCATTTGCACCATTTT 16 58 0 ATCGTTGGTAAAAATCAACATAATTGTATCGTTTAT 2 161 1 CGGGGAAGATAAAATAACCAGCAATTATGCTGGTCA 1 21 0 TAATGATCGCAAAATTTACATTTATTTCATACTTTT 3 117 1 AAATCAATAAAAAATAACCGCACATTGGGTTTAAAC 4 196 0 AAAGCCTGTTAAAAAATACAGGCTTTGTGATATCAT 0 231 0 AAAAAAACCTCATTTTTTATCTAAAAAA 3 2 1 TTTAGATTAGTAAATATTCACATTTTAATCTGGCTT 25 82 1 AAAAAGGAACAACTATTCTACAGAATT 23 41 0 GATATGGCACAAAAAAGCCTTTATTTTGAATATTTA 9 70 1 TTTTGTTTAAAAAATCTTCGAACTGTTTATTCGTTG 0 266 1 TTATATGACGAAAAGTATCTATGTTGTGGATAACTT 4 86 0 CACAGATATTAAAATATGCGATAATGATCGCAAAAT 3 96 1 TTTGTTATTTAAAATTATCAATATTATCCGATGAAA 25 116 1 TTTACTAATCTAAATTAGCAATAATTGTGAAATGTC 25 60 0 TAGGTTAAATAAAATAGGCGGTAAGTCTAGTTTGAA 1 88 0 CTTAATTAAATAAAGTTCCATTATTGAAATAAAAAA 2 225 0 GTGCGGTAAAAAAAGAAACGTTTTTAGATTGGCATT 17 106 0 ***** ** *** MAP Score: 42.4621 Motif 3 AAGCCTGTATTTTTTAACAGGCTTTTTTGTTTAAAA 0 242 1 AAATTGTGTATTTTTAACCGCACTTTAGGTTTAAAC 4 168 1 AAACGTTTCTTTTTTTACCGCACTTTTGAGCATTAT 17 119 1 AACACAATGTTTTTTGACCGCAGTTTTCATCAA 19 7 0 AAGTGCGGTTATTTTGCCTGAAATTTTTTAAAAGAT 3 36 1 CATCTTACTTATTTTAATTGACATTTCACAATTATT 25 41 1 ATAAATCAAGATTTTTGTGGTGTTTTACTTTACATA 25 239 0 GGAATGCAATATTTTACTGGTTATTTTAGCGAACAA 20 62 1 ATGCCGTCGCTTTTTAGGCGTATTTTCTTTATACTT 16 70 1 AGTGCGGTAATTTTTTTGTGTTTTTTTGTTCGCTAA 20 87 0 CTTTTGTTGTTTTTTATTTTCTCTTTCTTATAGCTT 14 43 1 ATTCTACAGAATTTTCCTTTCATTTTCAGTAGGCGA 23 18 0 CCAATTGGGGATTTTTATTTAAGTTTGAATTTACAA 17 31 0 AAATATTCACATTTTAATCTGGCTTTGTTATTTAAA 25 93 1 AACATTGTGTTTTATGACCGCACTTTAAAAGGAACA 19 32 1 TCTGTTTATGTTTTTCGGATTATTTTTTTATTTAAA 25 152 1 GTTTTAAAGTTTTTTCAGATTTTTTTCAAAAAGGAC 20 16 0 ATTTTGAATATTTATTACTTTTCTTTGCTTTTTTGA 9 92 1 AAAATTTACATTTATTTCATACTTTTGAGTTATTTT 3 127 1 AACGTTAAAAATATTGACCGCACTTTTACGGTCTTT 18 73 0 TTTATTTCCTTCTGTTTTGATCTTATT 7 142 0 TTGGGGATTTTTATTTTCCTCTCTTTCTATTTTTTT 17 63 1 AACGCCACTAAATTTCACCGCACTTTATAGCTTAAA 12 22 1 ATAACCAGCAATTATGCTGGTCATTTGGGATTAA 1 8 0 AATCTTGTAAATTTTAGAAGATTTTTTGAGATAAAG 20 183 0 GTGATATCATATTTTCAATGCTCTTTGAGCAGAGGC 0 205 0 CCGCCTATTTTATTTAACCTAAATTTTGTT 1 103 1 AGATCTATATATTTTAACTGGATATTTGCACAGATA 3 68 1 TGTTTTGATCTTATTGATCTTGATTTAATTAAACGT 7 121 0 GAATAATGGATTTTTGATTGTGAATTGATCTCGTAA 4 48 0 ATGTGCGGTTATTTTTTATTGATTTTCCTCTTTTCG 4 207 1 TTTTACGGTCTTTATAGGATGGGTTTCTGCCCACCA 18 50 0 ***** * * *** MAP Score: 39.5478 Motif 4 GCTCTTAATTAAATAAAGTTCCATTATTGAAATAAAAA 2 226 0 TAATCACAATAAATAAAAATTCATTTATAGCTATTTAA 25 201 1 AATACAATAGAAATAAATCAAGATTTTTGTGGTGTTTT 25 249 0 GGGGAAGATAAAATAACCAGCAATTATGCTGGTCATTT 1 18 0 CAAAAGTATGAAATAAATGTAAATTTTGCGATCATTAT 3 116 0 AATCAATAAAAAATAACCGCACATTGGGTTTAAACCTA 4 193 0 TAAATATTCAAAATAAAGGCTTTTTTGTGCCATATCAT 9 68 0 ATTTCAGGCAAAATAACCGCACTTTTTTAGATAAAAAA 3 22 0 CATATAAACAAAATAAGAATATTTTGTTGTCTAGAATT 4 115 1 TGCGACTTTTAAATAAAAAAATAATCCGAAAAACATAA 25 157 0 AAAGTATCAAAAATAAAGGGGCTTAATTGCCCCTTTTG 14 11 1 AAAAAAACCTCATTTTTTATCTAAAAAA 3 0 1 TGAGATTTAGAAATAAAAGCAGAAAGTTGGAAATGTAA 2 76 0 TTGTTCGCTAAAATAACCAGTAAAATATTGCATTCCAT 20 60 0 TGTGAAAAGCAAATATTGCCGTATTCGTGTTTAGCCTT 20 230 1 CTAAGGATAAAAATATGACTAAATTTATGATTAAGTTG 0 97 0 GTTATTAAACAAATAAGGAATATATAAGGAATATATT 11 60 1 TCTAGCGAAAAAATGGGCTTTTGGGAACTGTGGGA 12 91 0 CTCATCCAAAAAAGAGTCAATAACGTTGGTTAGAG 15 45 0 AAATAATGCTCAAAAGTGCGGTAAAAAA 17 129 0 TCTTTATCTCAAAAAATCTTCTAAAATTTACAAGATTT 20 182 1 CAAATCAATCAAAAAAGCAAAGAAAAGTAATAAATATT 9 98 0 TTTAGCGAACAAAAAAACACAAAAAAATTACCGCACTT 20 86 1 TCCTTTTTGAAAAAAATCTGAAAAAACTTTAAAACAAA 20 17 1 TTAGATTAGTAAATATTCACATTTTAATCTGGCTTTGT 25 83 1 AGTAAGATGAAAATATTCATATTTTCATCTTACTTATT 25 16 1 AAAGTGCGGTAAAAAAAGAAACGTTTTTAGATTGGCAT 17 107 0 ATTTTTTCTAAAATATGATAATTTTTCGCCGTCAATAA 4 252 1 TATCGTTGGTAAAAATCAACATAATTGTATCGTTTATT 2 160 1 GCTTTGCCATAAATAATTATTTGAAAGTGCGGTAATTT 20 110 0 AAGCCTGTTAAAAAATACAGGCTTTGTGATATCATATT 0 228 0 TAATATAACAAAAAATCTGATGATATGGCACAAAAAAG 9 49 1 AATTTCTATAAAAAATGGGTAATTAAATTACCCATTTA 6 18 0 ****** *** * MAP Score: 25.8094 Motif 5 AAATCAATAAAAAATAACCGCACATTGGGTTTAAAC 4 196 0 TATGTAAAGTAAAACACCACAAAAATCTTGATTTAT 25 239 1 TTTAGCGAACAAAAAAACACAAAAAAATTACCGCAC 20 86 1 TTAATCCCAAATGACCAGCATAATTGCTGGTTAT 1 8 1 TTGTTCGCTAAAATAACCAGTAAAATATTGCATTCC 20 62 0 AAAAAAACCTCATTTTTTATCTAAAA 3 0 1 AATTTCAGGCAAAATAACCGCACTTTTTTAGATAAA 3 25 0 ACTAAGGATAAAAATATGACTAAATTTATGATTAAG 0 100 0 AAAATAACTCAAAAGTATGAAATAAA 3 137 0 GAAATTTTTTAAAAGATCTATATATTTTAACTGGAT 3 55 1 AAGTATAAAGAAAATACGCCTAAAAAGCGACGGCAT 16 70 0 TCCTTTTTGAAAAAAATCTGAAAAAACTTTAAAACA 20 17 1 TCGTTGGTAAAAATCAACATAATTGTATCGTTTATT 2 162 1 TTGTTATTTAAAATTATCAATATTATCCGATGAAAT 25 117 1 TTTTTTAAACAAAAAAGCCTGTTAAAAAATACAGGC 0 244 0 ATGGGTAATTAAATTACCCATTTATTGCATCA 6 6 0 TCATATAAACAAAATAAGAATATTTTGTTGTCTAGA 4 114 1 GATTTTTTCTAAAATATGATAATTTTTCGCCGTCAA 4 251 1 AAGTAAGATGAAAATATGAATATTTTCATCTTACTC 25 15 0 GATATGGCACAAAAAAGCCTTTATTTTGAATATTTA 9 70 1 TAGGTTAAATAAAATAGGCGGTAAGTCTAGTTTGAA 1 88 0 GTTATTAAACAAATAAGGAATATATAAGGAATATAT 11 60 1 TTTGAATTGAAAATGATCTCAAGAAAAAATCTCCCC 1 58 0 AATTTTCATCAAATCATCATATCAAATCAGCTTTGC 20 141 0 AAGAGCATTGAAAATATGATATCACAAAGCCTGTAT 0 216 1 ATAATATAACAAAAAATCTGATGATATGGCACAAAA 9 48 1 TCTTTATCTCAAAAAATCTTCTAAAATTTACAAGAT 20 182 1 ACGTTTAATTAAATCAAGATCAATAAGATCAAAACA 7 121 1 TTAAATAAAAAAATAATCCGAAAAACATAAACAGAT 25 151 0 TTAAATTAACTGGTTAAATATACAATAC 25 282 0 **** * ** * * * MAP Score: 22.2284 Motif 6 AGACTTACCGCCTATTTTATTTAACCTAAATTTT 1 96 1 GCAGATCCCACCTTTTTTATTTCAATAATGGAAC 2 213 1 CTTATATATTCCTTATTTGTTTAATAACGAAGGC 11 54 0 GCTTTTTAGGCGTATTTTCTTTATACTTTGTGCA 16 78 1 ACAAAATATTCTTATTTTGTTTATATGACGAAAA 4 108 0 TTTTTAACAGGCTTTTTTGTTTAAAAAATCTTCG 0 252 1 CCACAAAAATCTTGATTTATTTCTATTGTATTGT 25 255 1 TTTCATCTTACTTATTTTAATTGACATTTCACAA 25 38 1 TATCACAAAGCCTGTATTTTTTAACAGGCTTTTT 0 235 1 GGATGTTCGTCCAGTTTTATTTTATTCTATGCGT 5 12 1 AATAATGGAACTTTATTTAATTAAGAGCATCTAA 2 236 1 TCTTATTGATCTTGATTTAATTAAACGTTTTGAC 7 115 0 AATCTAAAAACGTTTCTTTTTTTACCGCACTTTT 17 112 1 TTGAAAGTGCGGTAATTTTTTTGTGTTTTTTTGT 20 94 0 ATGTTTTTCGGATTATTTTTTTATTTAAAAGTCG 25 159 1 TATTCTATGCGTTAATTTTTTTATCATTCGGAAG 5 34 1 GAAATACGCCCTTCAATTTTTTGAGAAATAAAA 21 37 1 ACTTTTCTTTGCTTTTTTGATTGATTTGTCAGCA 9 108 1 TTAATTGCCCCTTTTGTTGTTTTTTATTTTCTCT 14 33 1 TTTTAATCTGGCTTTGTTATTTAAAATTATCAAT 25 104 1 AAAAAAACCTCATTTTTTATCTAAAAAAGTGCGG 3 10 1 CCCCAATTGGGGATTTTTATTTAAGTTTGAATTT 17 35 0 AGCTATAAATGAATTTTTATTTATTGTGATTAAA 25 199 0 GAAGTTTTAATTCATCTTAAATTG 17 0 1 TGTGAATAATGGATTTTTGATTGTGAATTGATCT 4 53 0 * * **** *** * MAP Score: 21.6194 Motif 7 AAAAATACAGGCTTTGTGATATCATATTTTCAAT 0 222 0 TTTTTAACAGGCTTTTTTGTTTAAAAAATCTTCG 0 252 1 AGACTTACCGCCTATTTTATTTAACCTAAATTTT 1 96 1 GCAGATCCCACCTTTTTTATTTCAATAATGGAAC 2 213 1 AAAAAAACCTCATTTTTTATCTAAAAAAGTGCGG 3 10 1 AAAAAGTGCGGTTATTTTGCCTGAAATTTTTTAA 3 33 1 TTTTGCCTGAAATTTTTTAAAAGATCTATATATT 3 47 1 GAAAAATTATCATATTTTAGAAAAAATCGCAAAA 4 245 0 TTTAATTACCCATTTTTTATAGAAATT 6 29 1 CATATCATCAGATTTTTTGTTATATTATGCCGCT 9 42 0 CAAAATAAAGGCTTTTTTGTGCCATATCATCAGA 9 64 0 ACTTTTCTTTGCTTTTTTGATTGATTTGTCAGCA 9 108 1 AATTGCGACAGATTTTTGAGCATAATTAAAAGAG 9 178 1 CTCTCTTTCTATTTTTTTATGATAGAATGCCAAT 17 81 1 AAAAACGTTTCTTTTTTTACCGCACTTTTGAGCA 17 117 1 AAAACACAATGTTTTTTGACCGCAGTTTTCATCA 19 11 0 TGCTGAGTCCTTTTTGAAAAAAATCTGAAAAA 20 8 1 TATTTTACTGGTTATTTTAGCGAACAAAAAAACA 20 71 1 AATTTTAGAAGATTTTTTGAGATAAAGATAGTGA 20 176 0 CAAGTGATTATTTTAAATAAGGGCGTAGAA 21 6 1 TACGCCCTTCAATTTTTTGAGAAATAAAA 21 41 1 TTCATCTTTTGTTAGCAAAGAAACTTGAG 22 15 0 TTTCATCTTACTTATTTTAATTGACATTTCACAA 25 38 1 TTTTAATCTGGCTTTGTTATTTAAAATTATCAAT 25 104 1 TTTTCGGATTATTTTTTTATTTAAAAGTCGCAAT 25 163 1 ********* * MAP Score: 21.2061 Motif 8 GTTATAGTGGTTCCCCTTTGGGGAACATCAAAC 24 50 0 GTAAAAGTGTTACCCCGTTGGGAGTGGATGTAG 7 58 0 ATCTCAGTGCTACTCCGTTGGGGTAGTTTGATG 24 25 1 TAAATAAAAATCCCCAATTGGGGATTTTTATTT 17 46 1 CAAGAAAAAATCTCCCCTCGGGGAAGATAAAAT 1 42 0 TCTTAATTAATCCCCTATATGGGGTGCTACTTA 2 267 0 GTGATAGCGGTTCTCTTTTGGGAAAAGCTACAT 7 31 1 GCAATTATGCTGGTCATTTGGGATTAA 1 4 0 * **** * **** MAP Score: 6.23933 Motif 9 AAATTTTACATTTCCAACTTTCTGCTTTTATTT 2 71 1 GATCGCAAAATTTACATTTATTTCATACTTTTG 3 121 1 ATTTCATACTTTTGAGTTATTTT 3 140 1 GATAAGGATCTTTGCCCTCTTTTTACGAGATCA 4 26 1 TTTTATTGATTTTCCTCTTTTCGCGTTTTGCGA 4 220 1 CTTTTCGCGTTTTGCGATTTTTTCTAAAATATG 4 236 1 GGTAATTTAATTACCCATTTTTTATAGAAATT 6 24 1 TTCAAAATCCTTTGTACTCTTTTAATTATGCTC 9 195 0 ATTCTTTCCTATTCTTTAAAGGCTGAA 10 4 1 AATTGCCCCTTTTGTTGTTTTTTATTTTCTCTT 14 35 1 AATTTGGTTTCCTTTGATGGAATGT 16 2 1 TTTTCCTCTCTTTCTATTTTTTTATGATAGAAT 17 76 1 GGTCAATATTTTTAACGTTTTTACGAGGTAAAA 18 90 1 TTTAAAGTTTTTTCAGATTTTTTTCAAAAAGGA 20 17 0 ATGCAATATTTTACTGGTTATTTTAGCGAACAA 20 65 1 CGGTAATTTTTTTGTGTTTTTTTGTTCGCTAAA 20 86 0 TGTTTATGTTTTTCGGATTATTTTTTTATTTAA 25 154 1 **** ****** MAP Score: 4.54572 Motif 10 TTTTTTGTTTAAAAAATCTTCGAACTGTTT 0 264 1 TGATCTCAAGAAAAAATCTCCCCTCGGGGA 1 51 0 GAAATTTTTTAAAAGATCTATATATTTTAA 3 55 1 ATAATATAACAAAAAATCTGATGATATGGC 9 48 1 TTGTCAGCATAAATAACCTTTTTATCTCTC 9 133 1 TAATTATGCTCAAAAATCTGTCGCAATTAT 9 176 0 AACTGCGGTCAAAAAACATTGTGTTTTATG 19 18 1 TCCTTTTTGAAAAAAATCTGAAAAAACTTT 20 17 1 TCTTTATCTCAAAAAATCTTCTAAAATTTA 20 182 1 TAAAACACCACAAAAATCTTGATTTATTTC 25 248 1 ********** MAP Score: 3.83613 Motif 11 CTTAATCATAAATTTAGTCATATTTTTATCCTTAGT 0 100 1 GCTATTTCGTAGATCCTGAGTTTGTTAATCATACTA 0 132 0 GCCTGTATTTTTTAACAGGCTTTTTTGTTTAAAAAA 0 244 1 TGACCAGCATAATTGCTGGTTATTTTATCTTCCCCG 1 21 1 TTCAAACTAGACTTACCGCCTATTTTATTTAACCTA 1 88 1 GGAAATGTAAAATTTCTGCCTTTAATCCCACTTCTT 2 50 0 TACATTTCCAACTTTCTGCTTTTATTTCTAAATCTC 2 77 1 AAATCAACATAATTGTATCGTTTATTGATAAACAAG 2 172 1 AAGGTGGGGCAGATCCCACCTTTTTTATTTCAATAA 2 205 1 AAAAAAACCTCATTTTTTATCTAAAAAA 3 2 1 TTCAGGCAAAATAACCGCACTTTTTTAGATAAAAAA 3 22 0 TTTATTTCATACTTTTGAGTTATTTT 3 137 1 AGACAACAAAATATTCTTATTTTGTTTATATGACGA 4 111 0 ATGGGTAATTAAATTACCCATTTATTGCATCA 6 6 0 TATTTTGAATATTTATTACTTTTCTTTGCTTTTTTG 9 91 1 CGTAAAATTCTCGCTTCGTTAATGAATATT 10 78 0 AAAGGGGCTTAATTGCCCCTTTTGTTGTTTTTTATT 14 25 1 AAGCGACGGCATTTGCACCATTTTTCTTGTTCGTTA 16 46 0 ATGCCGTCGCTTTTTAGGCGTATTTTCTTTATACTT 16 70 1 TGCGGTCAATATTTTTAACGTTTTTACGAGGTAAAA 18 87 1 TGTTTTAAAGTTTTTTCAGATTTTTTTCAAAAAGGA 20 17 0 GAATGCAATATTTTACTGGTTATTTTAGCGAACAAA 20 63 1 ATCTTCTAAAATTTACAAGATTTGTTAAATGTTTGT 20 197 1 GAGTAAGATGAAAATATTCATATTTTCATCTTACTT 25 15 1 AGATTAGTAAATATTCACATTTTAATCTGGCTTTGT 25 85 1 TCTGTTTATGTTTTTCGGATTATTTTTTTATTTAAA 25 152 1 AAACACCACAAAAATCTTGATTTATTTCTATTGTAT 25 250 1 * ** * * *** ** MAP Score: 3.64199 Motif 12 GTCATATTTTTATCCTTAGTATGATTAACAAACTCAGG 0 116 1 TTAAAAAATACAGGCTTTGTGATATCATATTTTCAATG 0 221 0 TATTTTTTAACAGGCTTTTTTGTTTAAAAAATCTTCGA 0 249 1 TTTTACATTTCCAACTTTCTGCTTTTATTTCTAAATCT 2 74 1 GGGGCAGATCCCACCTTTTTTATTTCAATAATGGAACT 2 210 1 GCTACTTAGATGCTCTTAATTAAATAAAGTTCCATTAT 2 237 0 AAAAAAACCTCATTTTTTATCTAAAAAAGTGCGGTTAT 3 10 1 AAGAGGGCAAAGATCCTTATCACATCAAACTTCAAAA 4 9 0 GACAACAAAATATTCTTATTTTGTTTATATGACGAAAA 4 108 0 ATTACTTTTCTTTGCTTTTTTGATTGATTTGTCAGCAT 9 105 1 TAAATTTCACCGCACTTTATAGCTTAAAAGTGCGGTAA 12 30 1 GTATTTTCTTTATACTTTGTGCATTGAAATACTATTGA 16 89 1 TTTTCCCAGCTTTATCAATAGTATTTCAATGCA 16 108 0 TTTTATTTTCCTCTCTTTCTATTTTTTTATGATAGAAT 17 71 1 ATTCATATTTTCATCTTACTTATTTTAATTGACATTTC 25 30 1 ACATTTTAATCTGGCTTTGTTATTTAAAATTATCAATA 25 101 1 * **** * ** ** MAP Score: 1.22501