AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HI/HI_operons027_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944238418 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 HI0041 47 exodeoxyribonuclease III (xthA) #1 HI0043 59 conserved hypothetical transmembrane protein #2 HI0044 300 conserved hypothetical transmembrane protein #3 HI0176 107 sfhB protein (sfhB) #4 HI0412_HI0413 372 HI0412: conserved hypothetical protein, HI0413: ribonuclease E (rne) #5 HI0616 197 ATP-dependent helicase (hepA) #6 HI0997 300 H. influenzae predicted coding region HI0997 #7 HI0998 180 ribosomal protein L34 (rpL34) #8 HI1002 130 thiophene and furan oxidation protein (thdF) #9 HI1004 272 peptidyl-prolyl cis-trans isomerse, putative #10 HI1005 87 conserved hypothetical protein #11 HI1006 69 lipoprotein signal peptidase (lspA) #12 HI1353 115 cytoplasmic axial filament protein (cafA) #13 HI1436 300 conserved hypothetical protein Motif 1 AAATCTCTGTATAATAAAGCCAATTTCACTCTTTAA 0 5 1 TTGATGATTTAACTTTAGATGATGATAATTTATTCATTTTG 2 180 1 AAAAAGTCAATGGTATTAATGGAATTAATTTCATCAAAATG 2 214 0 TTTTACGAAAACCAATAAATAAGATACAATTGTCCGCTATT 3 25 1 AAATATTTGCTTGATAAAACAACGCGATATTCCGCACGCGT 4 97 1 GCCTAAGAATTTGCGTAAAAAAGGATAAGTTTTGTTGGTGA 4 209 0 AGGCTCTATTATCCATAGAAAACGATTAATTAGCAAGGCGA 4 258 1 GACGTATATCTTCCTAAAAGTGCGGTCAATTTTTTGTGAGT 5 95 1 TTTATCAATGTAAATCAGAAAGAGAATAATT 5 176 1 AATTACGTACAGAGGTAGATGATGAAAAATTTTTAGGTGTT 6 53 1 TAGGATTAAATTTTTTAAATGATGATAATTTGAATAACGCT 6 146 1 TATCTCTAACTTTAGCAAAGTGCATATATTTTTTAATATTC 7 40 1 TACGCGTTCGTCAAATAAGAAACGGAAATTTTTAAAAAAAA 7 89 0 CAATTAAGAGTGAATAAAATAGAGCGCAATTCTAGTCATAA 7 132 0 ATTCTGCATTTTGTAGAGATAGAGTTTTTTTAGTAGAAACA 8 70 1 GAAGCGTAAAGTGCGGTCATTTTTTGGCAAAA 9 1 1 TTTTACGTTTAGATTATAATCGGGAAAATTTTATATTTATA 9 142 1 TATAGAATGTTAATTGAAAAAATGCACAATTTAACAAACTC 9 191 1 TAGGTTAAATTATAATTTGAGATAAATTCTGCTCAAAA 10 7 1 AGATAAATTCTGCTCAAAAGTGCGGTAAATTTCACCGCACT 10 29 1 TTTATCGGCTTGTGCTAGAATGAGCGGAATTTTTTTAAAAG 11 29 1 ATGGGTTAAAAATTTCAGAAAGGGTGCATTTTACCTTATTT 12 24 1 GNAAAAGCAGTCGTGGAAGTCGAGGCAATTTCTGTGTTAGG 13 11 1 ATTTCTGTGTTAGGTGAAAATGAAGTGATTTTGGATATTCG 13 38 1 AGAAAATGGTTTTTCAAATGTGCGTGTATTTGCAAAAAACA 13 247 1 * *** * * **** MAP Score: 20.5148 Motif 2 ATCTGCCCATGGCCATTTTTTTTCTACTGATAAAGAATACC 6 251 0 GCCATGGGCAGATCATTTTTTTAGTAAAACT 6 279 1 TTTTTAAGATGCTAATTTTTTACGTTTAGATTATAATCGGG 9 125 1 TTGTTAAATTGTGCATTTTTTCAATTAACATTCTATAACCC 9 187 0 TAAAAGTGCGGTCAATTTTTTGTGAGTTTCTTTTCAAGAGT 5 109 1 CGTAAAGTGCGGTCATTTTTTGGCAAAATTTAAATCAAAAG 9 14 1 TTTGACGAACGCGTATTTTATGACTAGAATTGCGCTCTATT 7 115 1 GTAGTATAATGAATATTTTATTGATGTAAATAGAAATTTGA 2 143 1 GGTAGATGATGAAAAATTTTTAGGTGTTATTGATCAGTATC 6 66 1 GCACTTTTGAGCAGAATTTATCTCAAATTATAATTTAACCT 10 11 0 TATTTAGTGGGGTTATTTTTTGGGATAGGCA 1 38 1 GCAAGTAGGATTAAATTTTTTAAATGATGATAATTTGAATA 6 141 1 AGCAAAGTGCATATATTTTTTAATATTCGTTTGAAGTTTTT 7 53 1 TTATAATCGGGAAAATTTTATATTTATAACAAGGGTTATAG 9 155 1 GCTAGAATGAGCGGAATTTTTTTAAAAGGGAAATAGT 11 42 1 CTACCTCTGTACGTAATTTTTCAAATTGAATTTTGGCAGCT 6 30 0 AAGCCAACTTTTAAAATTTTTGAGAGCTATTT 3 85 1 AATAAGAAACGGAAATTTTTAAAAAAAACTTCAAACGAATA 7 76 0 CTTTAGATGATGATAATTTATTCATTTTGATGAAATTAATT 2 192 1 CGTCACCCCAATATAATTTATCCTTGGATTTTCAATATACT 5 58 0 * ******* * * MAP Score: 18.8962 Motif 3 ATAATGAATATTTTATTGATGTAAATAGAAATTTGA 2 148 1 CGCCCCCAAGTTTTATCAATGTAAATCAGAAAGAGA 5 165 1 TTTTTTAACTATGAAAATGAAGCTGCCA 6 2 1 GAGTTTTCACTTTTTAAGATGCTAATTTTTTACGTT 9 115 1 TTTGGTGGTGTTTTGTTGATAGGAATTGCTATTAGC 9 63 1 GATTAAATTTTTTAAATGATGATAATTTGAATAACG 6 149 1 ATGATTTAACTTTAGATGATGATAATTTATTCATTT 2 183 1 AATTTATTCATTTTGATGAAATTAATTCCATTAATA 2 206 1 TTTCCTTAATTTTTACGAAAACCAATAAATAAGATA 3 15 1 TAATCAACATTTTTCTTAAAATAAATCAGCCGTTTG 4 140 0 ATATCGCGTTGTTTTATCAAGCAAATATTTATGCTT 4 91 0 TAGAGCCTCTTTTTGCGCCTAAGAATTTGCGTAAAA 4 230 0 TGAGCGGAATTTTTTTAAAAGGGAAATAGT 11 49 1 TTTTTTTCCTTTTGAAAATCGCTGCAAAT 4 353 0 ATGGCCATTTTTTTTCTACTGATAAAGAATACCCTA 6 248 0 TATAACAAGGGTTATAGAATGTTAATTGAAAAAATG 9 179 1 AGTTTTACTAAAAAAATGATCTGCCCA 6 283 0 TTTTGTTCCTATTAAAGAGTGAAATT 0 31 0 AAATATAAAATTTTCCCGATTATAATCTAAACGTAA 9 144 0 **** *** *** MAP Score: 18.6697 Motif 4 TTTGACTTTATAACCCCACTATTTAGTGGGGT 1 19 1 TCCCAAAAAATAACCCCACTAAATAGTGGGGT 1 31 0 CATTAATCAATAAGCCAACTTTTAAAATTTTT 3 74 1 AAGATATACGTCACCCCAATATAATTTATCCT 5 75 0 CACAAAAAATTGACCGCACTTTTAGGAAGATA 5 101 0 TGAAAAGTTGTAACCTAACTTTTGAGGTATCT 7 13 1 TGCCAAAAAATGACCGCACTTTACGCTTC 9 7 0 GGAATTGCTATTAGCTGGCTTTGTGAGGATGG 9 84 1 ACCGCACTTTTGAGCAGAATTTATCTCAAATT 10 23 0 GCGGTGAAATTTACCGCACTTTTGAGCAGAAT 10 35 0 GCGGTAAATTTCACCGCACTTTTTTACTTTTG 10 50 1 TGTGCTAGAATGAGCGGAATTTTTTTAAAAGG 11 39 1 * *** ****** MAP Score: 17.3939 Motif 5 ATCTCTGTATAATAAAGCCAATTTCACTCTTTAA 0 12 1 CCCACTATTTAGTGGGGTTATTTTTTGGGATAGG 1 33 1 TTTAACTTTAGATGATGATAATTTATTCATTTTG 2 187 1 CAATGGTATTAATGGAATTAATTTCATCAAAATG 2 214 0 TCTTCCTAAAAGTGCGGTCAATTTTTTGTGAGTT 5 103 1 AAATTTTTTAAATGATGATAATTTGAATAACGCT 6 153 1 ACTTTAGCAAAGTGCATATATTTTTTAATATTCG 7 48 1 GAAGCGTAAAGTGCGGTCATTTTTTGGCAAAAT 9 9 1 TTTAGATTATAATCGGGAAAATTTTATATTTATA 9 149 1 TCTGCTCAAAAGTGCGGTAAATTTCACCGCACTT 10 37 1 CTTGTGCTAGAATGAGCGGAATTTTTTTAAAAGG 11 37 1 CAGTCGTGGAAGTCGAGGCAATTTCTGTGTTAGG 13 18 1 GTTAGGTGAAAATGAAGTGATTTTGGATATTCGT 13 46 1 **** * ***** MAP Score: 14.8859 Motif 6 TGAAATTGGCTTTATTATACAGAGATTT 0 3 0 AATTTCACTCTTTAATAGGAACAAAA 0 31 1 ATAATGAATATTTTATTGATGTAAATAGAAATTTG 2 148 1 ATGGAATTAATTTCATCAAAATGAATAAATTATCA 2 202 0 AGACTTTTTATTTATTTTACAAGGAGCTTTT 2 279 1 TAATCAACATTTTTCTTAAAATAAATCAGCCGTTT 4 141 0 AAAGGATAAGTTTTGTTGGTGAAAACTCAATGCAG 4 196 0 AAAGAGGCTCTATTATCCATAGAAAACGATTAATT 4 254 1 CGCCCCCAAGTTTTATCAATGTAAATCAGAAAGAG 5 165 1 GCAGCTTCATTTTCATAGTTAAAAAA 6 1 0 ATTCCGCTGATTTAGTGTTAAAAGATACTGATCAA 6 95 0 TGGCCATTTTTTTTCTACTGATAAAGAATACCCTA 6 248 0 ATATTCTGCATTTTGTAGAGATAGAGTTTTTTTAG 8 68 1 AGAGATAGAGTTTTTTTAGTAGAAACAGGGATAAG 8 84 1 TTTTAATTTAGAGGGATAAGGCTTAT 8 114 0 TTTGGTGGTGTTTTGTTGATAGGAATTGCTATTAG 9 63 1 ACTTTTTTACTTTTGTGCGAAAGGAAGTTA 10 67 1 ATGAGCGGAATTTTTTTAAAAGGGAAATAGT 11 48 1 TCATCAAATATTTAGTCTAAATAGAATAATAGCCC 12 66 0 TTACAAGCCTTATATTTGAAAGAAAATGGTTTTTC 13 227 1 TTAATGAATGTTTTTTGCAAATACACGCACATTTG 13 261 0 **** * * * *** MAP Score: 14.83 Motif 7 CTGTACGTAATTTTTCAAATTGAATTTTGG 6 35 0 AAGAAAATGGTTTTTCAAATGTGCGTGTAT 13 246 1 TAGGATTAAATTTTTTAAATGATGATAATT 6 146 1 ATATTCCTAATTTCTTAAATTTCATCAAAT 12 92 0 AATGAATGTTTTTTGCAAATACACGCACAT 13 264 0 TGAGCGGAATTTTTTTAAAAGGGAAATAGT 11 49 1 GTTTGAAGTTTTTTTTAAAAATTTCCGTTT 7 81 1 AATCTTTGAGTTTGTTAAATTGTGCATTTT 9 209 0 AATCAACATTTTTCTTAAAATAAATCAGCC 4 145 0 ATTTATTGGTTTTCGTAAAAATTAAGGAAA 3 15 0 AATTGTGCATTTTTTCAATTAACATTCTAT 9 192 0 TTTTGGAGCGTTATTCAAATTATCATCATT 6 163 0 GACTTAGGGATTTCTTAATTCTGATGGCGG 2 16 1 GCGGTCATTTTTTGGCAAAATTTAAATCAA 9 22 1 TTTTTTAACTATGAAAATGA 6 0 1 AGTGCATATATTTTTTAATATTCGTTTGAA 7 58 1 TTATCCTTTTTTACGCAAATTCTTAGGCGC 4 222 1 TTAATTGTATTTAGGTAAATTAAA 7 166 1 AAATGCACCCTTTCTGAAATTTTTAACCCA 12 25 0 ********** MAP Score: 13.5065 Motif 8 CCACTATTTAGTGGGGTTATTTTTTGGGATAGGC 1 34 1 CCTTGTGACTTAGGGATTTCTTAATTCT 2 4 1 ATGCCAATTGCTGCATTGAGTTTTCACCAACAAA 4 186 1 CGTTCATAGAGTGACGTTCATATTACGTTTATAG 4 304 1 TTATATTGGGGTGACGTATATCTTCCTAAAAGTG 5 83 1 CTTCCTAAAAGTGCGGTCAATTTTTTGTGAGTTT 5 104 1 TCAATTTTTTGTGAGTTTCTTTTCAAGAGTATGC 5 120 1 CTTTAGCAAAGTGCATATATTTTTTAATATTCGT 7 49 1 TAATATTCGTTTGAAGTTTTTTTTAAAAATTTCC 7 73 1 ATGACTAGAATTGCGCTCTATTTTATTCACTCTT 7 134 1 AGCACATTCCGTGCCTTTCTTTTTGCCTGTTCGT 8 12 0 GGCACGGAATGTGCTTTCTTTATTATTTGATCTT 8 31 1 GAAGCGTAAAGTGCGGTCATTTTTTGGCAAAATT 9 10 1 ATTGCCGCTTTTGATTTAAATTTTGCCAAAAAAT 9 28 0 TTAGGTTTGATTGCTGTATCGTTTTTAGTTG 9 251 1 CTGCTCAAAAGTGCGGTAAATTTCACCGCACTTT 10 38 1 ATGAGATCGTGCTTTATCATTTATCGGCTTGT 11 8 1 **** ** **** MAP Score: 13.3269 Motif 9 TGGAATTAATTTCATCAAAATGAATAAATTATCAT 2 201 0 ATAAAAAGTCTTCTGTAAAGTAAGGGCTAGGGATA 2 255 0 TTTATTGGTTTTCGTAAAAATTAAGGAAAAAACA 3 9 0 AATCAACATTTTTCTTAAAATAAATCAGCCGTTTG 4 140 0 TTTGCAGCGATTTTCAAAAGGAAAAAAA 4 354 1 CGCCCCCAAGTTTTATCAATGTAAATCAGAAAGAG 5 165 1 CTGTACGTAATTTTTCAAATTGAATTTTGGCAGCT 6 30 0 ATTATCATCATTTAAAAAATTTAATCCTACTTGCC 6 140 0 GTTGGACCGCTTGGGAAAAAGAAAGTGGGCAGGGG 6 212 1 ATATATGCACTTTGCTAAAGTTAGAGATACCTCAA 7 34 0 CTTAATTGTATTTAGGTAAATTAAA 7 165 1 AAACTCTATCTCTACAAAATGCAGAATATATTAAG 8 62 0 CGGTCATTTTTTGGCAAAATTTAAATCAAAAGCGG 9 23 1 AAAATTAGCATCTTAAAAAGTGAAAACTCCATCCT 9 109 0 AGAATGTTAATTGAAAAAATGCACAATTTAACAAA 9 194 1 AAATGCACAATTTAACAAACTCAAAGATTTCTAAA 9 210 1 TAACTTCCTTTCGCACAAAAGTAAAAAAGTGCGGT 10 62 0 GAGCGGAATTTTTTTAAAAGGGAAATAGT 11 50 1 GACTAAATATTTGATGAAATTTAAGAAATTAGGAA 12 84 1 TTTGGTAGCCTTGATCAAAGTAAAAGTTACGTGTT 13 164 1 *** *** * *** MAP Score: 11.9688 Motif 10 AATAAAGCCAATTTCACTCTTTAATAGGAAC 0 22 1 TTTTGTTCCTATTAAAGAGTGAA 0 34 0 TGATTGATTTTTGACTTTATAACCCCACT 1 8 1 TTTTTTTCCTTTTGAAAATCGCT 4 359 0 CTCTTTTCCCTATACGGTGGATTT 5 3 1 CGCTCTATTTTATTCACTCTTAATTGTATTT 7 147 1 GTGCCTTTCTTTTTGCCTGTTCGTGA 8 5 0 GGGATAAGGCTTATCCCTGTTTCTACTAAAA 8 97 0 GGGATAAGCCTTATCCCTCTAAATTAAAA 8 111 1 CACCACCAAATATTGCCGCTTTTGATTTAAA 9 42 0 GAGGATGGAGTTTTCACTTTTTAAGATGCTA 9 108 1 AGATGCTAATTTTTTACGTTTAGATTATAAT 9 131 1 AAATATAAAATTTTCCCGATTATAATCTAAA 9 149 0 TCACCGCACTTTTTTACTTTTGTGCGAAAGG 10 60 1 ACTATTTCCCTTTTAAAAAAATTC 11 55 0 ******** ** MAP Score: 11.8789 Motif 11 AACCCCACTATTTAGTGGGGTTATTTTTTGGGATAGGC 1 30 1 TAGAACATTAATCAATAAGCCAACTTTTAAAATTTTTG 3 69 1 AAATAGCTCTCAAAAATTTTAAAAGTTGG 3 88 0 CCGCACGCGTTGCAAACGGCTGATTTATTTTAAGAAAA 4 128 1 AGAATTTGCGTAAAAAAGGATAAGTTTTGTTGGTGAAA 4 207 0 AAAACGATTAATTAGCAAGGCGAATTTGCGTTCATAGA 4 276 1 ATATCTTCCTAAAAGTGCGGTCAATTTTTTGTGAGTTT 5 100 1 GGGGGCGTATTGTAGCTTGCATACTCTTGAAAAGAAAC 5 134 0 CTCTAACTTTAGCAAAGTGCATATATTTTTTAATATTC 7 43 1 GTTCGTCAAATAAGAAACGGAAATTTTTAAAAAAAACT 7 87 0 GAAGCGTAAAGTGCGGTCATTTTTTGGCAAAATT 9 6 1 AAAATTTAAATCAAAAGCGGCAATATTTGGTGGTGTTT 9 38 1 GTTTTCACTTTTTAAGATGCTAATTTTTTACGTTTAGA 9 117 1 ACGTTTAGATTATAATCGGGAAAATTTTATATTTATAA 9 146 1 ACAAAAGTAAAAAAGTGCGGTGAAATTTACCGCACTTT 10 45 0 CGGCTTGTGCTAGAATGAGCGGAATTTTTTTAAAAGGG 11 34 1 GGTTAAAAATTTCAGAAAGGGTGCATTTTACCTTATTT 12 27 1 AAATGGTTTTTCAAATGTGCGTGTATTTGCAAAAAACA 13 250 1 * ** ** * **** MAP Score: 10.7082 Motif 12 TGATTGATTTTTGACTTTATAACC 1 3 1 ATTTGATGATTTAACTTTAGATGATGATAAT 2 178 1 ATGATAATTTATTCATTTTGATGAAATTAAT 2 201 1 ATCCCTAGCCCTTACTTTACAGAAGACTTTT 2 256 1 AGACTTTTTATTTATTTTACAAGGAGCTTTT 2 279 1 AATTGCTGCATTGAGTTTTCACCAACAAAAC 4 191 1 TTTTTTTCCTTTTGAAAATCGCTGC 4 357 0 ATTTTGGCAGCTTCATTTTCATAGTTAAAAA 6 11 0 CCCTGCCCACTTTCTTTTTCCCAAGCGGTCC 6 215 0 AAGTTGTAACCTAACTTTTGAGGTATCTCTA 7 17 1 TGAGGTATCTCTAACTTTAGCAAAGTGCATA 7 35 1 TTTAATTTACCTAAATACAAT 7 169 0 ATTCCGTGCCTTTCTTTTTGCCTGTTCGTGA 8 10 0 TTTTAATTTAGAGGGATAAGGC 8 118 0 CGCTTTTGATTTAAATTTTGCCAAAAAATGA 9 26 0 TGCTAATTTTTTACGTTTAGATTATAATCGG 9 134 1 CAAACCTAAGATAAATTTAGAAATCTTTGAG 9 229 0 TCCAAAATCACTTCATTTTCACCTAACACAG 13 42 0 **** ****** MAP Score: 9.51471 Motif 13 ACTTATCCTTTTTTACGCAAATTCTTAGGCG 4 220 1 TTAATGAATGTTTTTTGCAAATACACGCACA 13 265 0 GTGCGGTCATTTTTTGGCAAAATTTAAATCA 9 20 1 GGCTGATTTATTTTAAGAAAAATGTTGATTA 4 145 1 TTTCCTTAATTTTTACGAAAACCAATAAATA 3 15 1 ATGAGCGGAATTTTTTTAAAAGGGAAATAGT 11 48 1 CAGATCATTTTTTTAGTAAAACT 6 287 1 CGTTTGAAGTTTTTTTTAAAAATTTCCGTTT 7 80 1 GAAAAACCATTTTCTTTCAAATATAAGGCTT 13 231 0 TTATCCCTGTTTCTACTAAAAAAACTCTATC 8 87 0 TTGACCGCACTTTTAGGAAGATATACGTCAC 5 93 0 TTGAGCAGAATTTATCTCAAATTATAATTTA 10 15 0 TTTGGCAAAATTTAAATCAAAAGCGGCAATA 9 32 1 ***** ***** MAP Score: 9.05029 Motif 14 AATAACCCCACTAAATAGTGGGGTTATAAAGTC 1 22 0 AAAAAGTCTTCTGTAAAGTAAGGGCTAGGGATA 2 255 0 AAATTCTTAGGCGCAAAAAGAGGCTCTATTATC 4 238 1 CGTATATCTTCCTAAAAGTGCGGTCAATTTTTT 5 97 1 TTGAATAACGCTCCAAAAAGTGGCACAAAAATT 6 175 1 TTAGAGATACCTCAAAAGTTAGGTTACAACTTT 7 16 0 TCACGAACAGGCAAAAAGAAAGGCACGGAATGT 8 10 1 AACTCTATCTCTACAAAATGCAGAATATATTAA 8 63 0 GAAGCGTAAAGTGCGGTCATTTTTTG 9 3 1 ATAAATTCTGCTCAAAAGTGCGGTAAATTTCAC 10 31 1 TCGGCTTGTGCTAGAATGAGCGGAATTTTTTTA 11 33 1 ** ****** ** MAP Score: 7.6165 Motif 15 AACCCCACTAAATAGTGGGGTTATAAAGTC 1 22 0 TGGTTTTCGTAAAAATTAAGGAAAAAACA 3 9 0 CAAAAATTTTAAAAGTTGGCTTATTGATTA 3 77 0 TTTGCGCCTAAGAATTTGCGTAAAAAAGGA 4 225 0 ATATCTTCCTAAAAGTGCGGTCAATTTTTT 5 100 1 TTACATTGATAAAACTTGGGGGCGTATTGT 5 159 0 ATTCAATTTGAAAAATTACGTACAGAGGTA 6 40 1 AAAGTGGCACAAAAATTGGTAGTTGGACCG 6 191 1 TTGGGAAAAAGAAAGTGGGCAGGGGGTAGG 6 222 1 TCAGTAGAAAAAAAATGGCCATGGGCAGAT 6 262 1 GTTTTACTAAAAAAATGATCTGCCCATGGC 6 279 0 GAGATACCTCAAAAGTTAGGTTACAACTTT 7 16 0 GTTTTTTTTAAAAATTTCCGTTTCTTATTT 7 88 1 GAAGCGTAAAGTGCGGTCATTTTTTG 9 6 1 AAACACCACCAAATATTGCCGCTTTTGATT 9 46 0 TCTAAACGTAAAAAATTAGCATCTTAAAAA 9 125 0 TGTTAATTGAAAAAATGCACAATTTAACAA 9 198 1 AATTCTGCTCAAAAGTGCGGTAAATTTCAC 10 34 1 ACAAAAGTAAAAAAGTGCGGTGAAATTTAC 10 53 0 TCCCTTTTAAAAAAATTCCGCTCATTCTAG 11 43 0 AAATGGGTTAAAAATTTCAGAAAGGGTGCA 12 22 1 ATGAAATTTAAGAAATTAGGAATATAAA 12 97 1 CACCTAACACAGAAATTGCCTCGACTTCCA 13 24 0 TGATCAAAGTAAAAGTTACGTGTTGTATTG 13 175 1 ********** MAP Score: 5.25353 Motif 16 TGCCTATCCCAAAAAATAACCCCACTAAATA 1 38 0 CTTAGGCGCAAAAAGAGGCTCTATTATCCAT 4 243 1 GAAACTCACAAAAAATTGACCGCACTTTTAG 5 108 0 TAACGCTCCAAAAAGTGGCACAAAAATTGGT 6 180 1 ATCAGTAGAAAAAAAATGGCCATGGGCAGAT 6 261 1 AGTTTTACTAAAAAAATGATCTGCCCATGGC 6 279 0 AATTCTAGTCATAAAATACGCGTTCGTCAAA 7 115 0 ATTTTATGACTAGAATTGCGCTCTATTTTAT 7 129 1 AACAGGCAAAAAGAAAGGCACGGAATGTGCT 8 15 1 AAATTTTGCCAAAAAATGACCGCACTTTACG 9 14 0 ATGTTAATTGAAAAAATGCACAATTTAACAA 9 197 1 TCCCTTTTAAAAAAATTCCGCTCATTCTAGC 11 42 0 ********* * MAP Score: 2.88231 Motif 17 CCTATCCCAAAAAATAACCCCACTAAATAGTGG 1 34 0 TTCTTAGGCGCAAAAAGAGGCTCTATTATCCAT 4 241 1 AACTCACAAAAAATTGACCGCACTTTTAGGAAG 5 104 0 CATACTCTTGAAAAGAAACTCACAAAAAATTGA 5 120 0 AATAACGCTCCAAAAAGTGGCACAAAAATTGGT 6 178 1 TATCAGTAGAAAAAAAATGGCCATGGGCAGATC 6 260 1 TTTACTAAAAAAATGATCTGCCCATGGCCATTT 6 274 0 CGAATATTAAAAAATATATGCACTTTGCTAAAG 7 49 0 TTCTAGTCATAAAATACGCGTTCGTCAAATAAG 7 111 0 CGAACAGGCAAAAAGAAAGGCACGGAATGTGCT 8 13 1 ATTTTGCCAAAAAATGACCGCACTTTACGCTTC 9 10 0 AAAACACCACCAAATATTGCCGCTTTTGATTTA 9 44 0 TCCCTTTTAAAAAAATTCCGCTCATTCTAGCAC 11 40 0 TAGTCTAAATAGAATAATAGCCCGAAATAAGGT 12 56 0 ATGTTTTTTGCAAATACACGCACATTTGAAAAA 13 256 0 ****** *** * MAP Score: 2.20021