AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HP/HP_operons001_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944245480 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 HP0116 165 DNA topoisomerase I (topA) #1 HP0174 300 H. pylori predicted coding region HP0174 #2 HP0246 188 flagellar basal-body P-ring protein (flgI) #3 HP0330 248 ketol-acid reductoisomerase (ilvC) #4 HP0331 24 cell division inhibitor (minD) #5 HP0350 259 H. pylori predicted coding region HP0350 #6 HP0351 43 flagellar basal-body M-ring protein (fliF) #7 HP0444 115 H. pylori predicted coding region HP0444 #8 HP0446 107 H. pylori predicted coding region HP0446 #9 HP0550 263 transcription termination factor Rho (rho) #10 HP0584 81 flagellar switch protein (fliN) #11 HP0585 228 endonuclease III (nth) #12 HP0667 300 H. pylori predicted coding region HP0667 #13 HP0671 121 outer membrane protein (omp14) #14 HP0672 158 solute-binding signature and mitochondrial signature protein (aspB) #15 HP0673 81 H. pylori predicted coding region HP0673 #16 HP0685 300 flagellar biosynthetic protein (fliP) #17 HP0762 169 H. pylori predicted coding region HP0762 #18 HP0769 87 molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A (mobA) #19 HP0828 121 ATP synthase F0, subunit a (atpB) #20 HP0830 58 Glu-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit A (gatA) #21 HP0832 91 spermidine synthase (speE) #22 HP0833 76 H. pylori predicted coding region HP0833 #23 HP0870 207 flagellar hook (flgE) #24 HP0871 300 CDP-diglyceride hydrolase (cdh) #25 HP0906 259 H. pylori predicted coding region HP0906 #26 HP0907 50 hook assembly protein, flagella (flgD) #27 HP1010 300 polyphosphate kinase (ppk) #28 HP1011 36 dihydroorotate dehydrogenase (pyrD) #29 HP1015 111 H. pylori predicted coding region HP1015 #30 HP1017 97 amino acid permease (rocE) #31 HP1018 47 H. pylori predicted coding region HP1018 #32 HP1038 128 3-dehydroquinase type II (aroQ) #33 HP1039 30 H. pylori predicted coding region HP1039 #34 HP1040_HP1041 140 HP1040: ribosomal protein S15 (rps15), HP1041: flagellar biosynthesis protein (flhA) #35 HP1085 66 H. pylori predicted coding region HP1085 #36 HP1088 46 transketolase A (tktA) #37 HP1091 259 alpha-ketoglutarate permease (kgtP) #38 HP1092 52 flagellar basal-body rod protein (flgG) #39 HP1132 22 ATP synthase F1, subunit beta (atpD) #40 HP1137 110 ATP synthase F0, subunit b' (atpF') #41 HP1141 23 methionyl-tRNA formyltransferase (fmt) #42 HP1142 39 H. pylori predicted coding region HP1142 #43 HP1143 243 H. pylori predicted coding region HP1143 #44 HP1147 21 ribosomal protein L19 (rpl19) #45 HP1151 73 ribosomal protein S16 (rpS16) #46 HP1153 130 valyl-tRNA synthetase (valS) #47 HP1324 21 H. pylori predicted coding region HP1324 #48 HP1325 174 fumarase (fumC) #49 HP1422 24 isoleucyl-tRNA synthetase (ileS) #50 HP1423 101 conserved hypothetical protein #51 HP1559 207 flagellar basal-body rod protein (flgB) (proximal rod protein) #52 HP1574 74 riboflavin synthase alpha subunit (ribC) #53 HP1582 126 pyridoxal phosphate biosynthetic protein J (pdxJ) #54 HP1584 64 sialoglycoprotease (gcp) #55 HP1585 179 flagellar basal-body rod protein (flgG) Motif 1 ATTTTTCCTTTTAAATTCATTTAG 15 67 0 AAAAATGGGGTTTTTCGTTTTAAAAACACCTTT 25 134 1 CAAACATTATTTTTGATTTTTAAAAAGTTACCG 37 33 1 TTGAGAAAAGTTTTTGTTTTTAATGAAGGATTG 37 134 0 GATCGTGGTGTTTTCTTTTTTAAGGACCGCTTT 16 230 1 CAAATTTTTCCATTTTTAAGGTTTTTGA 36 28 0 TGCTTTAGCTTTTTGTATTTTTATCTTAATTGC 9 202 1 GTGCAAGCTATTTAATTTTTTAAAAAATTCTTT 24 80 1 CCTTAGAAAATTTAAAATTTTAAGTTTTAGGGG 13 14 1 GCCTTTTGCTTTTACGCTTTTAATTGTTGCGTA 46 59 0 ATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAATTT 48 139 1 GTTACAATAATTTAGATTTTTTAGCTAGCATGT 21 16 1 AAAAAATTCTTTTAGCTTTTTTAATGTTATCAA 24 101 1 TAAAAACACCTTTAGCATTTTTAGATTTGATCA 25 154 1 TTCTTAAGAATTTAGGTTTTTTATAGATTATTA 13 52 1 CTCAATTAGGTTTAAAGTTTTTATAAAAGGCTT 2 123 1 AGATTTGATTTTTTATATTTTATAATAGAATGA 43 208 0 TGGACTATCCTTTTTAATTTAAATGCTTTGTTG 46 10 1 TATCCTTTATTTTTAAATTTAAACTTAAAATTA 9 14 1 TAACGACAACTTTTATTTTTAAAAAATGGGGTT 25 113 1 TTTGCTATAATTTTTCCTTTAAAAGGATTCTTG 38 28 1 GATTTTCCCTTTAAACTAAAACTTA 55 164 0 CTGAAATTGTTTTTTTTTTTTTTTGAAATCGCT 5 93 0 ATTTTTTGCCTTTTTTATTTTTTGTTGTTTGTA 43 117 1 AAGGCTAGAATTTTGCGTTTTTTCATTTTTTTA 16 12 1 AGATTTTAATTTTAGCCTTTTATTAGCTTTTTA 2 45 0 TACCCTATTCTTTAAGTTTTTATCCATAACTTA 50 68 0 TTTCTTCATTTTTTTTATTTATAATGTAGTTTT 43 72 1 TAGACCCTTATTTAAGCTTTAAATAACTATAAT 22 50 0 TCTTTTACTATTTAATCTTTAAAAA 30 82 1 TTGAATCTTCTTTAACATTTTTTTTCTTTCCAA 1 88 0 TTTTAAGCGTTTTAAGGTTTTTTTAAAGAACGC 30 30 0 AAATCTTTGATTTAAAGTTTATAAGATTTTTGA 2 72 1 ACATAAAAGCTTTTCATTTTAATCAAACCTAGC 5 136 0 TGTTATGGTTTTTATGGTTTAATGAATCGTTTA 0 81 1 GGTTATCCTTTTTAAAACAACTCTT 25 244 0 ACGATGCGTTTTTTCTATTATAATTTAAGGC 3 8 0 GTGTGCATTTTTTAGACTTTATTATCAATCCTT 37 109 1 TATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTTACCATTT 17 121 1 TTTTAATGAATTTTAACTTATTAGTAACTTTTA 24 186 0 TTGGTTACAATTTTAGGTTATTAAGTTTTAGTT 55 143 1 TTTAGAGTGGTTTTAATTTATTATGACTTATGC 9 49 0 ATCATAATGATTAAAGATTTTAACCACTATTGT 24 221 1 CTTCATTGTCTTAAAACTTTTAAGAGCAATTTT 5 176 1 TTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTA 5 53 0 GGTTTGTCTTTTTAGGCTTATTATAATATAAAG 34 41 1 CTCTCTAAAATTATCGTTTTTATTTAATTGTAG 25 16 1 TGAAAAGCTTTTATGTGTTTAAACTTCATTGTC 5 153 1 TAGGAACAACTTTTGCTTTATTTTGCATAGATT 23 158 1 TAAGATAGAGTTAATGTTTTTATAACAAATGCG 40 46 1 AACAACTCTTTTATTTCTTTATATTTTACATGG 25 221 0 AAAAGATCGCTTAAAATTTTTTTAGCGTTT 27 7 0 AAAATTAGAATTAAAATTTTTTTGATCATGTTA 14 104 1 TATAGTAAAATTAAGATTTTATAATCAAAGTCA 10 32 1 TTTTTTAATGTTATCAATTTAATTTTTTTCTAG 24 117 1 AAAGAATTTTTATTTAAATGGTTTGATTT 15 6 1 ATGATTCCTTTTATTTTAAATGAT 4 3 0 ATCTGTTTTTATTTAATTTTTGCTATAA 38 5 1 TAAGCGATCTTTTAGGGTTAAATGAAGTTTTAT 27 27 1 TGGCTTTATTTGTTATAAAATTTATAGT 10 5 1 TATGGTTTCGTTTAGGTTTAATTAAATTTCGCT 25 47 0 AGTCTAAAATTTAAGGGTTATAACCATTAAAAC 17 83 0 ACCAGGGTTATTATTCTTTATATTTGGTTTTTT 1 188 1 TATCATACGCTTAAACTTTATATTATAATAAGC 34 56 0 ATTGTAGCAATTAAGTTTTAAAAACTCATTAAA 19 61 0 **** ****** MAP Score: 63.105 Motif 2 AAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAAGAGGGCAA 5 54 1 GCGTTCTTTAAAAAAACCTTAAAACGCTTAAA 30 30 1 GATAACCTTTAAAAAGCGTTATGGGGTGGTGT 23 36 1 TTACAATTCCAAAAATCATTATTATAAAATAA 53 95 1 TTAAGTTTTAAAAACTCATTAAACCAAGCTTT 19 52 0 AAATCGTTAAAAAACTCGTTAAAAAGCTTGGT 19 30 1 TTATAAAACGCTTTATTTTGACAAGT 24 4 1 AATAATCTATAAAAAACCTAAATTCTTAAGAA 13 52 0 AATGACTCTCAAAAACCTTAAAAATGGAAAAA 36 20 1 AGCGCTGAATAAAAAGCCTTTTTAACCCCATT 12 223 1 CCTTCTACTTAAAAACCCTAATTTTTTAAACA 48 96 0 AAAAATCTCTAAAAATCGTTTTAATGGTTATA 17 66 1 GCATTTGTTATAAAAACATTAACTCTATCTTA 40 46 0 AAGCCTTTTATAAAAACTTTAAACCTAATTGA 2 124 0 CAATAGTGGTTAAAATCTTTAATCATTATGAT 24 221 0 TTTCGTTTTAAAAACACCTTTAGCATTTTTAG 25 146 1 ATGCTAAAACTAAAACCCTTATAAGTTATGGA 50 47 1 AATAAAACCCCTTTTTCAAACCCTT 51 192 0 TATTTAAAACCCTTTTTTTAGTAGTTC 5 242 0 TTGTTGTTTAAAAACTCTTTTTTGTAAAACTT 27 70 0 TGCTATACTCAAAAATCTTATAAACTTTAAAT 2 81 0 GTATGATACAAAAAAGCTTATTTTACGCTATA 34 81 1 ACGCCTATTCAAAAACCAAAAATAAGGAAATC 51 13 0 GTAACTTTTTAAAAATCAAAAATAATGTTTGC 37 32 0 GATAACATTAAAAAAGCTAAAAGAATTTTTTA 24 100 0 AGCGCATGATAAAACGCCCTAAAATTTATCAA 55 26 1 ATGCAATGCTAAAAAACCAAATATAAAGAATA 1 199 0 ATGCTAGCTAAAAAATCTAAATTATTGTAACA 21 15 0 CAAAAAAAAAAAAAAACAATTTCAGTTTCTTA 5 101 1 CAATCATTCTAAAAAGCTATTTAGGAACAACT 23 137 1 AAGTTATGGATAAAAACTTAAAGAATAGGGTA 50 69 1 AATTTGATTTTAAAACCTTAAAAAAATAGCAT 48 139 0 TATGTTACACTAAAAGCTTAAATAAAAGGGCA 18 25 0 ACGCAACAATTAAAAGCGTAAAAGCAAAAGGC 46 60 1 GTGGTGTTGCAAAACCCCCTATTTTCTTATGA 23 61 1 TAAAAAAATGAAAAAACGCAAAATTCTAGCCT 16 13 0 TATCTTAACAAAAAATCGCTTAAAATTTGAGA 40 21 0 ACTTTGATTATAAAATCTTAATTTTACTATAA 10 31 0 TGAAGCCCTTAAAAAACGCTTTCTCTCTTTTG 11 73 1 GTTAGTATTCAAAAATCTCTTTTTAAAAATAG 24 149 1 CATTAAACCATAAAAACCATAACAGCGTTAAA 0 73 0 CGCCACACCCTAAAACCGATAAAAA 33 3 0 TACAATTAAATAAAAACGATAATTTTAGAGAG 25 16 0 TTAGCTAAAATAAAATCTATATTATAACTAAA 35 20 0 TTTAAAACGAAAAACCCCATTTTTTAAAAATA 25 126 0 GAAACTTTATAAAAAGCTAATAAAAGGCTAAA 2 36 1 CAATGAAGTTTAAACACATAAAAGCTTTTCAT 5 152 0 TGTTTGTATTTAAAATCCCTATTTTACTGAAC 43 142 1 AGCTTGATGATAAAATCTTATAGGTGTAAGAG 53 51 1 AAATTTGACTAAAACGCGCTTTTTTAACACCC 55 102 0 AAAACCCCCTTTTAGTTATAAT 35 0 1 AATCCTTCATTAAAAACAAAAACTTTTCTCAA 37 135 1 TCTATGCAAGAAAACTCTAATTGAAAATTCAA 14 34 0 AAAAATAGCATAAACTCTTATACCTTCTACTT 48 118 0 AGGGTTTGCAAAAACTCTCATTAAAAACAAGG 24 268 1 CCTAATTTTTTAAACACCATTTCCACAATTTT 48 80 0 TTTGCTTGACTAAAATCAAATATCTATGCAAA 0 20 0 ***** * **** MAP Score: 58.5705 Motif 3 CGTTCTTTACAAAAATCTCTAAAAATCGTTTTAA 17 56 1 AACTCCTAGTAAAATTACCTAAAAATTTCATATT 37 224 1 TACAAAAATCTCCTAAAATATTCGTATT 45 55 0 AGCGCATGATAAAACGCCCTAAAATTTATCAATA 55 26 1 AACAAAAAATAAAAAAGGCAAAAAATACCCTTCG 43 109 0 TAATTTTCAAAAAACTTTCAAAAATGTTTCAAAA 14 77 0 GCGTTCTTTAAAAAAACCTTAAAACGCTTAAAAA 30 30 1 ATCTTAACAAAAAATCGCTTAAAATTTGAGAATA 40 18 0 CTAATAAGTTAAAATTCATTAAAATAATCATAAT 24 195 1 ATTGTAGTCTAAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAA 5 44 1 AAATCGTTAAAAAACTCGTTAAAAAGCTTGGTTT 19 30 1 GCCACACCCTAAAACCGATAAAAA 33 0 0 AATGACTCTCAAAAACCTTAAAAATGGAAAAATT 36 20 1 TAAAAAGCTAATAAAAGGCTAAAATTAAAATCTT 2 45 1 AATTATAGCAAAAATTAAATAAAAACAGAT 38 6 0 TGAGATTAGCCAAAGAGATTAAAAAGAATAGATT 7 78 1 ACAAATTCCTTAAAAAGAGTGGTGG 50 1 1 TTGCAAATTCATAACATGCAAAAAGCATTCCAAT 51 160 0 AGCATAAGTCATAATAAATTAAAACCACTCTAAA 9 48 1 TTGATAACATTAAAAAAGCTAAAAGAATTTTTTA 24 100 0 AAGCGATTTCAAAAAAAAAAAAAAACAATTTCAG 5 92 1 ATTTGATTTTAAAACCTTAAAAAAATAGCATAAA 48 136 0 ATGAGGATTAAAAAAATGAAAAAACGCAAAATTC 16 19 0 AGGATTGATAATAAAGTCTAAAAAATGCACACAG 37 107 0 TCATTCTATTATAAAATATAAAAAATCAAATCTT 43 208 1 TAATAACATAATAATCTATAAAAAACCTAAATTC 13 59 0 AATGGGAGCGATAATGTTTAAAAACATGCAGAAT 3 180 0 AGCTTGAGCGATAACCTTTAAAAAGCGTTATGGG 23 27 1 TGGCTGAATGCTAACATGCTAAAACTAAAACCCT 50 32 1 AAAATGGTAACTAATAACCTAAAATTATACTATA 17 121 0 GCAATTAAGATAAAAATACAAAAAGCTAAAGCAT 9 201 0 TTTTTCTTTCCAAAAAGAATAAAACTAACACCAA 1 67 0 CATGTAAAATATAAAGAAATAAAAGAGTTGTTTT 25 222 1 GAACTCATCGCTAAAGCCTTAAAAAGCGCTGAAT 12 199 1 ATTTTAAATACAAACAACAAAAAATAAAAAAGGC 43 124 0 AAACTAAAACTTAATAACCTAAAATTGTAACCAA 55 143 0 AAACTACATTATAAATAAAAAAAATGAAGAAATT 43 70 0 GTGAAAATACTAAATCCAATAAAAA 53 1 0 AGACTACAATTTAAGAAGCAAAAATTAAAGGAAC 5 20 0 CGGTAACTTTTTAAAAATCAAAAATAATGTTTGC 37 32 0 TGCAAGCTATTTAATTTTTTAAAAAATTCTTTTA 24 81 1 CTTTTACTATTTAATCTTTAAAAA 30 83 1 AAACGATTCATTAAACCATAAAAACCATAACAGC 0 79 0 ATTGTAGCAATTAAGTTTTAAAAACTCATTAAAC 19 60 0 TTTTTGAATACTAACTAGAAAAAAATTAAATTGA 24 130 0 AAGAATAAAACTAACACCAAAAAAGACAATAAAT 1 53 0 TTCTTAAGAAAAACACCCCTAAAACTTAAAATTT 13 28 0 ACAATGAAGTTTAAACACATAAAAGCTTTTCATT 5 151 0 ATTATAGAGCAAACTTGCTTAAAA 26 0 0 AAAGCACCCAAAACATGCTTAAAAG 45 1 0 ATTTAATTTGAAACTTTATAAAAAGCTAATAAAA 2 27 1 TATTAAAACCTTGATAAAATTTTCATTCT 6 24 0 AAACGCTAAAAAAATTTTAAGCGA 27 0 1 ATAAAAACCATAACAGCGTTAAAAATCAAAGAGT 0 62 0 CATGGTTACTTCCTTAAAATTTGCTAAAC 31 28 0 **** ****** MAP Score: 57.8619 Motif 4 CAAAAAAGAGTTTTTAAACAACAACTAAGCA 27 78 1 AAGCGATAGTTTTTTAAGCGTTTTAAGGTTT 30 43 0 ATCCAACCATTTTTTAAGGAACGCTCTATTT 46 99 1 GCCACCACTCTTTTTAAGGAATTTGT 50 5 0 AACAAACTGATTTTTAAACATGATGATTTAA 27 269 1 ATTCTGCATGTTTTTAAACATTATCGCTCCC 3 180 1 TTTTAAGGTTTTTTTAAAGAACGCTAAAAAC 30 23 0 TATTCAGCGCTTTTTAAGGCTTTAGCGATGA 12 203 0 AATTTTTCCATTTTTAAGGTTTTTGAGAGTC 36 23 0 TTATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAA 48 137 1 CTAAAGGTGTTTTTAAAACGAAAAACCCCAT 25 138 0 GGTTATCCTTTTTAAAACAACTCTTTTATT 25 239 0 GAACAGAGGTTTTTAAAACTATGGTTTCGTT 25 68 0 TTTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAACCCTT 5 57 0 ACAACTTTTATTTTTAAAAAATGGGGTTTTT 25 118 1 CGACCATGACTTTTTAAAAAAGCTTCAATGA 27 211 1 GCTATTTAATTTTTTAAAAAATTCTTTTAGC 24 86 1 ATAATTTAGATTTTTTAGCTAGCATGTTAGC 21 22 1 GCAAGAATCCTTTTAAAGGAAAAATTATAGC 38 31 0 TTACACTAATTTTTTAAGAATGCTTTAGCTT 9 182 1 TTTTTAAAGATTAAATAGTAA 30 86 0 CCCATAACGCTTTTTAAAGGTTATCGCTCAA 23 30 0 TTTAATGAGTTTTTAAAACTTAATTGCTACA 19 61 1 TTTTAACGAGTTTTTTAACGATTTGTCTTGT 19 23 0 CTATCATAATTTTTTTAACAAAGTCAAATTT 9 90 0 GAAGCCCCACTTTTAAAGAAAATCCCGCCTT 12 37 0 TATTTTAAAAGAAGTTTTTAGCG 30 2 1 AAGCGGTAACTTTTTAAAAATCAAAAATAAT 37 38 0 CAAAAATCTCTTTTTAAAAATAGGTTACTAA 24 158 1 CGCTTAAAATTTTTTTAGCGTTT 27 2 0 TTATATTTGGTTTTTTAGCATTGCATGTTAT 1 205 1 TGGTGTTTTCTTTTTTAAGGACCGCTTTGGG 16 235 1 ATATTCTCAAATTTTAAGCGATTTTTTGTTA 40 17 1 CGCTAAAAAAATTTTAAGCGATCTTTTAGGG 27 13 1 GAGTTAATGTTTTTATAACAAATGCGAGTTT 40 53 1 TTACTATAAATTTTATAACAAATAAAGCCA 10 9 0 AAAACCCTAATTTTTTAAACACCATTTCCAC 48 86 0 CCTGTGTGCATTTTTTAGACTTTATTATCAA 37 106 1 TAACACCCTCTTTTTTAAGCTCTTGCCTCAA 55 79 0 AGTTTAGCAAATTTTAAGGAAGTAACCATG 31 27 1 AGCATAAGCCTTTTATAAAAACTTTAAACCT 2 130 0 AATTTAGGTTTTTTATAGATTATTATGTTAT 13 60 1 TATTATAGTTATTTAAAGCTTAAATAAGGGT 22 49 1 AGATTTTAAAATACAAGCCAACA 54 2 1 AACCCATGCCATTTTTAGCTAAAATAAAATC 35 35 0 TTGGTTGCGGATTTTAAAGTTTTGTTAATCA 23 109 0 TTTATTAGCTTTTTATAAAGTTTCAAATTAA 2 29 0 TTATCCTTTAATTTAAAGAAATTCAATCTAT 23 184 0 AACTAAATGAATTTAAAAGGAAAAAT 15 65 1 ACGCCAACGAATTTTAAAATTGCTCTTAAAA 5 193 0 TTTATGATTGATTTTAAAAATGCCTGTGTGC 37 84 1 AAACATGATGATTTAAAGGATTTCTA 27 284 1 TGAATATGAAATTTTTAGGTAATTTTACTAG 37 229 0 TTAAGTTTAAATTTAAAAATAAAGGATACTT 9 11 0 AAATGGTTTGATTTAAAAGTTTGAAAAGTGC 15 25 1 CATTAAAACGATTTTTAGAGATTTTTGTAAA 17 61 0 CACCTTTAGCATTTTTAGATTTGATCACGCG 25 160 1 ********* * MAP Score: 47.4671 Motif 5 TTATAAAACGCTTTATTTTGACAAGT 24 4 1 GACTAATGTCAAACCCCTTGATG 32 1 0 AAAAAACCTTAAAACGCTTAAAAAACTATCGC 30 40 1 TCTTAACAAAAAATCGCTTAAAATTTGAGAAT 40 19 0 TTTTTTTTTGAAATCGCTTTAATTTTTGCCCT 5 79 0 TATTTAAAACCCTTTTTTTAGTAGTTC 5 242 0 AATAAAACCCCTTTTTCAAACCCTTG 51 191 0 TTTAAAACGCTTGTTTTTCTCTAAT 14 3 1 TGCTAAAACTAAAACCCTTATAAGTTATGGAT 50 48 1 TTAAATAGTAAAAGAGCTTGATCAAGCGATAG 30 65 0 TGACTTTTTAAAAAAGCTTCAATGATTATCAT 27 217 1 AATGACTCTCAAAAACCTTAAAAATGGAAAAA 36 20 1 AAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAAGAGGGCAA 5 54 1 GTATGATACAAAAAAGCTTATTTTACGCTATA 34 81 1 AGTTGTTCCTAAATAGCTTTTTAGAATGATTG 23 137 0 TAATGATCCTAAACAGCTTGTAACCACCCTTA 16 125 1 TAGAAATCCTTTAAATCATCATGTT 27 285 0 AAATCTCTAAAAATCGTTTTAATGGTTATAAC 17 68 1 CAAAAGAGAGAAAGCGTTTTTTAAGGGCTTCA 11 73 0 TCAAACCCTTTCTTATTCCCTAAA 2 174 0 TAGTATTCAAAAATCTCTTTTTAAAAATAGGT 24 151 1 TTGTTGTTTAAAAACTCTTTTTTGTAAAACTT 27 70 0 AACAAACTAGAAATCTCTTTTTGTTAAAAGGA 9 235 1 CGCTGAATAAAAAGCCTTTTTAACCCCATTCT 12 225 1 TTTGTATTTAAAATCCCTATTTTACTGAACTT 43 144 1 CTTCTACTTAAAAACCCTAATTTTTTAAACAC 48 95 0 AGCCTTTTATAAAAACTTTAAACCTAATTGAG 2 123 0 CTAATTTTCAAAAAACTTTCAAAAATGTTTCA 14 80 0 AGGGTCGTCTAAAGACTTTAAAGCGTTGTTTA 12 140 0 TGCTATACTCAAAAATCTTATAAACTTTAAAT 2 81 0 ATAATCTATAAAAAACCTAAATTCTTAAGAAA 13 51 0 GATAACATTAAAAAAGCTAAAAGAATTTTTTA 24 100 0 TAAACACATAAAAGCTTTTCATTTTAATCAAA 5 142 0 GAAACTTTATAAAAAGCTAATAAAAGGCTAAA 2 36 1 ATTTGATTTTAAAACCTTAAAAAAATAGCATA 48 138 0 AAAACAAGACAAATCGTTAAAAAACTCGTTAA 19 20 1 ACTCATCGCTAAAGCCTTAAAAAGCGCTGAAT 12 201 1 TCTATGCAAGAAAACTCTAATTGAAAATTCAA 14 34 0 ACTTTAAATCAAAGATTTTAATTTTAGCCTTT 2 58 0 ACATGATCAAAAAAATTTTAATTCTAATTTTC 14 103 0 TAATAGGTATAAACATTTTATTAAAGGCGTTC 0 142 1 TGCGAGTTTCAAATATTTTGTAGGATTTTAGG 40 75 1 ATGCTAGCTAAAAAATCTAAATTATTGTAACA 21 15 0 TTTGATTAACAAAACTTTAAAATCCGCAACCA 23 107 1 *** ***** ** MAP Score: 37.1157 Motif 6 GTTTTTATGGTTTAATGAATCGTTTAGTCAAAATT 0 88 1 TGTAATAATATTTATTGTCTTTTTTGGTGTTAGTT 1 44 1 GTTATTATTCTTTATATTTGGTTTTTTAGCATTGC 1 194 1 ATACCTCAATTTAATTTGAAACTTTATAAAAAGCT 2 19 1 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