AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HP/HP_operons002_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944245527 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 HP0350 259 H. pylori predicted coding region HP0350 #1 HP0351 43 flagellar basal-body M-ring protein (fliF) #2 HP0364 205 ribonucleoside diphosphate reductase, beta subunit (nrdB) #3 HP0477 117 outer membrane protein (omp12) #4 HP0480 45 GTP-binding protein, fusA-homolog (yihK) #5 HP0616 77 chemotaxis protein (cheV) #6 HP0617 34 aspartyl-tRNA synthetase (aspS) #7 HP1050 53 homoserine kinase (thrB) #8 HP1051 72 H. pylori predicted coding region HP1051 #9 HP1054 63 H. pylori predicted coding region HP1054 #10 HP1057 148 H. pylori predicted coding region HP1057 #11 HP1197 88 ribosomal protein S12 (rps12) #12 HP1198 223 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit (rpoB) #13 HP1199 45 ribosomal protein L7/L12 (rpl7/l12) #14 HP1200 108 ribosomal protein L10 (rpl10) #15 HP1201 44 ribosomal protein L1 (rpl1) #16 HP1203 300 transcription termination factor NusG (nusG) #17 HP1204 35 ribosomal protein L33 (rpL33) #18 HP1205 300 translation elongation factor EF-Tu (tufB) #19 HP1295 22 ribosomal protein S11 (rps11) #20 HP1297 78 ribosomal protein L36 (rpl36) #21 HP1300 42 preprotein translocase subunit (secY) #22 HP1318 34 ribosomal protein L4 (rpl4) #23 HP1319 36 ribosomal protein L3 (rpl3) #24 HP1320 164 ribosomal protein S10 (rps10) #25 HP1514 101 transcription termination factor NusA (nusA) Motif 1 TCCTAACAAGCAAAATTGAAATTAGAAGTAT 4 19 0 ATTTAAGAAGCAAAAATTAAAGGAACGCAAT 0 15 0 TAAATTAAAACAAAAATTAAAT 6 1 0 TAAAAGAGGGCAAAAATTAAAGCGATTTCAA 0 73 1 ACAATAAAATAAAAACTGAAATACTACTCAA 24 93 0 TTTTAATAGAAAAAAGTGAAACCATTTTTAA 3 57 0 ATGCTAGTTTTAAAAATGAAAGGGTATCAAC 7 16 1 AAAGCCCTATCAAAGATTAAATGCTATAATA 5 44 0 TCCTTATTCTAAAAATTTAAAACTAAAAGTT 11 61 0 AAAAATCCAACAAAGCTAAAAACAGCGTGAT 16 221 0 TAGGCGTCTCAAAAACTAAAATGTTATCCTA 18 83 0 GTTCTAACCTTAAAAATAAAATACTCTTATT 3 11 1 ATAACCCCCTAAAATTAAAACGACTAACGC 9 43 0 TAGCTTAAACTAAAATTAAAAAATT 16 4 0 TCACCACCACCAAAACAGAAATAAGTGCGTT 16 185 0 TGGATGGTTCTAAAGTTTAAAGATCCTTTTG 12 142 1 GTAAGAGCTAAAAAGCTTAAAATTTCTTTTT 14 42 1 AATCCAATTCCAAAAAATAAACCCTAATTCA 8 13 0 TAAAGGATTAAAAAGCTAAAATACTGCTTCT 2 55 0 AAAGCGATTTCAAAAAAAAAAAAAAACAATT 0 91 1 CTAATTTTTTCAAAGGAGAAAAATC 20 63 1 ATTATCTTTTTAAAAAAGAAATTTTAAGCTT 14 54 0 GACTTAAAAACAGAAAGGCCTTTGCG 12 5 1 GAACGGCTTAAAAGAATGAAAATTTTATCAA 1 12 1 AATGCTACCACAAAATTTAAGACATTTTTGT 18 211 0 TTAAGATTTTTAAAAGAAAAATTAGGGTAAA 11 23 1 AAAAATACTGAAAAATTGAAGTTTTTTAAAA 2 85 1 ATCTTCAGCCTAAGATTAAAAACTCCTAACG 14 10 0 AATCCATTTCAAAAAATTAAGGAGAAATACA 18 278 1 ATCTTGGAGTTAAGGTTTAAAATTTTAGCGT 9 16 1 TGTAGTCTAAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAAA 0 46 1 TGAATGGCGATAAGACAAAAATGTCTTAAAT 18 197 1 GTTTTAATTTAAAGGGATAAAAC 6 21 1 ***** ***** MAP Score: 46.0899 Motif 2 TCCTTAATTTTTTGAAATGGATTTTAGAATTATACTA 18 264 0 CTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTAGACTACAATTT 0 42 0 AAATTTGGAGTTTTTTCTGGCTTTTAGGGGGTTTTAA 2 113 1 ACTTTTGCTATTTTTAGGGCTTTTTAGAGATTTTTAC 24 36 0 ATTTTATTGTTTTATTCTGTTTTTTAGTAACGGATAA 24 114 1 AGAATGAAAATTTTATCAAGGTTTTAATA 1 24 1 TCTTAAAACTTTTAAGAGCAATTTTAAAATTCGTTGG 0 184 1 ATTTAATTTTTGTTTTAATTTAAAGGGA 6 1 1 TGGTGAGCGCTATCACGCTGTTTTTAGCTTTGTTGGA 16 210 1 AAAACTTCAATTTTTCAGTATTTTTAAAGGATTAAAA 2 73 0 ATCGCTTTAATTTTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAA 0 62 0 TGTATAATGCTAGTTTTAAAAATGAAAGG 7 2 1 ACATTTATACATTAAAAGAATTTTTAATTCTATCCAA 16 37 0 AATTTTTTAATTTTAGTTTAAGCTATTTTGGA 16 5 1 TTTTAGGGGGTTTTAAATTCTTTTAAGGTATTCTAAC 2 134 1 TTTGTTGGAATTGAAAGAAATTTTTAAGGATTAGAAT 15 16 1 GTTTGTAAAAACCTTTTAAACTAAATTAG 5 2 1 TTTAGTATAATTGAAAGAAACTTTTAACAAACAATTC 10 105 1 AATGGCGCATTTTGAGTAGTATTTCAGTTTTTATTTT 24 82 1 GTGGGTAAAAATTTTACTCCATTTTAACCGGTCATTT 10 61 1 AAAATATGTTAATATAAAAGTTTTTAGTAGTGCCTAA 20 30 1 TTAAAAAAGAAATTTTAAGCTTTTTAGCTCTTACGAT 14 39 0 AATTCGCTATAATAAAATTTCTTTTAAACGCGCCATA 25 11 1 GCCCCTGTTGTATCAGCTTGATTTAAGAGGAATAAGT 21 11 1 AGACTATATCATTGAGATAGTTTTAAGGAAATTAAGG 2 172 1 GGGGAACTTTTAGTTTTAAATTTTTAGAATAAGGAAA 11 57 1 TGAAACCATTTTTAAGCCATTTTTGAATACAATAAGA 3 35 0 ATTTAAGGGTTATTTCAATGAAAATATG 20 1 1 GTAGAAAATAAAGAAGCAGTATTTTAGCTTTTTAATC 2 44 1 CTGAAATTGTTTTTTTTTTTTTTTGAAATCGCTTTAA 0 89 0 TTTTAGAGATTTTTACTTCCTTTTTATAAGGAAATAT 24 15 0 AAAAAAACAATTTCAGTTTCTTATTAGCTAGGTTTGA 0 110 1 TCTTGGAGTTAAGGTTTAAAATTTTAGCGTTAGTCGT 9 17 1 TTAATGTATAAATGTATTAAGTTTAAGTGAGGGCGAA 16 59 1 *** * ****** MAP Score: 41.0818 Motif 3 GTCTTGTTAGAATACCTTAAAAGAATTTAAAA 2 144 0 GTTTGTAAAAACCTTTTAAACTAAATTAGG 5 8 1 AAGAATTTAAAACCCCCTAAAAGCCAGAAAAA 2 124 0 AAATCTCTAAAAAGCCCTAAAAATAGCAAAAG 24 40 1 ATAACCCCCTAAAATTAAAACGAC 9 49 0 TTAGCTTTTTAATCCTTTAAAAATACTGAAAA 2 67 1 AAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAAGAGGGCAAAA 0 56 1 TTTCATTGAAATAACCCTTAAAT 20 1 0 TTGTTCCTTAATTTCCTTAAAACTATCTCAAT 2 182 0 CTATAATAAAATTTCTTTTAAACGCGCCATAT 25 17 1 GTTTTATCCCTTTAAATTAAAACAAA 6 18 0 AATAACTTATTCCTCTTAAATCAAGCTGAT 21 22 0 GAATTTTAAAATTGCTCTTAAAAGTTTTAAGA 0 184 0 AATCGCCAAATCCCTTGAATTGTTTGTTA 10 129 0 GATTCTAATCCTTAAAAATTTCTTTCA 15 27 0 GTAAGAGCTAAAAAGCTTAAAATTTCTTTTTT 14 42 1 TGTATTCAAAAATGGCTTAAAAATGGTTTCAC 3 41 1 ACGAACGGCTTAAAAGAATGAAAAT 1 3 1 CTACTAAAAAAAGGGTTTTAAATA 0 245 1 TGAAAAATTGAAGTTTTTTAAAATTTGGAGTT 2 93 1 AAAATCGGTTAAGATTTTTAAAAGAAAAATTA 11 15 1 GATAAGACAAAAATGTCTTAAATTTTGTGGTA 18 205 1 AATAGGAAATATCACTTTAGAAAGCTCTTCTC 16 138 0 TTTAAACTTCATTGTCTTAAAACTTTTAAGAG 0 170 1 TCTTAAGTTCCTTTAAATTGATGTTCT 25 84 0 GATTTTTCTCCTTTGAAAAAATTAGGC 20 61 0 CTCCAGTTTATAATCTCTTGAATGGCGATAAG 18 179 1 CTGCAAGATTATCTTTTTAAAAAAGAAATTTT 14 60 0 AAAGGATCTTTAAACTTTAGAACCATCCATGA 12 139 0 TTTGTTTAGTATAATTCTAAAATCCATTTCAA 18 258 1 ATCTTGGAGTTAAGGTTTAAAATTTTAGCGTT 9 16 1 TTTTAGTTTTAAATTTTTAGAATAAGGAAAAA 11 64 1 GGCGTATAATATCCGTTTTGAATGAACTACTA 0 219 1 TTGATACCCTTTCATTTTTAAAACTAGCATTA 7 14 0 ** ******** MAP Score: 35.9702 Motif 4 TGTAGTCTAAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAA 0 46 1 TGTATTCAAAAATGGCTTAAAAATGGTTTCAC 3 41 1 ACGAACGGCTTAAAAGAATGAAAAT 1 3 1 CAGTATTTTTAAAGGATTAAAAAGCTAAAATA 2 63 0 GACCGGTTAAAATGGAGTAAAATTTTTACCCA 10 62 0 GTTTTAATTTAAAGGGATAAAAC 6 21 1 GTAAGAGCTAAAAAGCTTAAAATTTCTTTTTT 14 42 1 CTACTAAAAAAAGGGTTTTAAATA 0 245 1 ATCTTGGAGTTAAGGTTTAAAATTTTAGCGTT 9 16 1 ATTTTTGATCAAAGGCTTGAAAT 12 210 1 TCCTTATAAAAAGGAAGTAAAAATCTCTAAAA 24 20 1 GTTACTAAAAAACAGAATAAAACAATAAAATA 24 113 0 AATACCTTAAAAGAATTTAAAACCCCCTAAAA 2 134 0 TCCTTATTCTAAAAATTTAAAACTAAAAGTTC 11 60 0 GTATCAACAATAGGGGTTTAAAAT 7 39 1 GCTATTTTGGATAGAATTAAAAATTCTTTTAA 16 31 1 AGAATAAAACAATAAAATAAAAACTGAAATAC 24 100 0 TAAAAGAAAAATTAGGGTAAAATGGGGGAACT 11 33 1 TCTAGTCTAGAAAGGAGGAAAAG 14 95 1 TAATTTTTTCAAAGGAGAAAAATC 20 64 1 ** ** ****** MAP Score: 26.7875 Motif 5 TTATTGCGTTCCTTTAATTTTTGCTTCTTA 0 13 1 TAATTTTTGCTTCTTAAATTGTAGTCTAAA 0 27 1 TTTTGAAATCGCTTTAATTTTTGCCCTCTT 0 76 0 AACTTCATTGTCTTAAAACTTTTAAGAGCA 0 174 1 CGCCAACGAATTTTAAAATTGCTCTTAAAA 0 193 0 AAATACTGCTTCTTTATTTTCTACTTCTTA 2 38 0 CTTTTTAATCCTTTAAAAATACTGAAAAAT 2 71 1 AATTGAAGTTTTTTAAAATTTGGAGTTTTT 2 98 1 CTTTTAGGGGGTTTTAAATTCTTTTAAGGT 2 133 1 TTCAAAAATGGCTTAAAAATGGTTTCACTT 3 45 1 TGGTTTCACTTTTTTCTATTAAAATTAGTG 3 64 1 TTGTAAAAACCTTTTAAACTAAATTAGGGT 5 12 1 TTTAATTTTTGTTTTAATTTAAAGGGATAA 6 11 1 ACCCTTTCATTTTTAAAACTAGCATTATAC 7 11 0 TGGAGTTAAGGTTTAAAATTTTAGCGTTAG 9 20 1 AGCGTTAGTCGTTTTAATTTTAGGGGGTTA 9 42 1 GTTAAAAGTTTCTTTCAATTATACTAAAAT 10 103 0 TTTACCCTAATTTTTCTTTTAAAAATCTTA 11 24 0 GGAACTTTTAGTTTTAAATTTTTAGAATAA 11 59 1 TGCAAAAGGATCTTTAAACTTTAGAACCAT 12 145 0 GCCTGTGATGGCTTTAATTTAAAAAAATGT 13 12 1 GAGCTAAAAAGCTTAAAATTTCTTTTTTAA 14 46 1 CTTAAAAATTTCTTTCAATTCCAACAAAAC 15 14 0 GATTCTAATCCTTAAAAATTTCTTTCAAT 15 25 0 AATTTTTTAATTTTAGTTTAAGC 16 3 1 TTAAAAGAATTTTTAATTCTATCCAAAATA 16 33 0 GACAAAAATGTCTTAAATTTTGTGGTAGCA 18 210 1 TTGTATTTCTCCTTAATTTTTTGAAATGGA 18 280 0 CTACTAAAAACTTTTATATTAACATATTTT 20 30 0 ATCAAACCCTTTATATTATATTCAATG 22 17 0 TTTTTATATTTCCTTATAAA 24 0 1 AGTATTTCAGTTTTTATTTTATTGTTTTAT 24 99 1 TCTTAAGTTCCTTTAAATTGATGTTCTGT 25 82 0 ********** MAP Score: 24.6199 Motif 6 CTTAAATTGTAGTCTAAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAA 0 39 1 AAAGAGGGCAAAAATTAAAGCGATTTCAAAAAAAAAAAA 0 75 1 ATTTCAAAAAAAAAAAAAAACAATTTCAGTTTCTTATTA 0 97 1 TGAAGTTTAAACACATAAAAGCTTTTCATTTTAATCAAA 0 142 0 TGAATGAACTACTAAAAAAAGGGTTTTAAATA 0 237 1 ATTTTTCAGTATTTTTAAAGGATTAAAAAGCTAAAATAC 2 62 0 AAAATACTGAAAAATTGAAGTTTTTTAAAATTTGGAGTT 2 86 1 ACCTTAAAAGAATTTAAAACCCCCTAAAAGCCAGAAAAA 2 124 0 ACAAGACTATATCATTGAGATAGTTTTAAGGAAATTAAG 2 169 1 CTCTTATTGTATTCAAAAATGGCTTAAAAATGGTTTCAC 3 34 1 GTTTGTAAAAACCTTTTAAACTAAATTAG 5 0 1 TGCTAGTTTTAAAAATGAAAGGGTATCAACAATAGGGGT 7 17 1 ATTTTAGTATAATTGAAAGAAACTTTTAACAAACAATTC 10 103 1 TCAAGTAAGCATTGCAAAAGGATCTTTAAACTTTAGAAC 12 148 0 GAAGATCGTAAGAGCTAAAAAGCTTAAAATTTCTTTTTT 14 35 1 GTTTTGTTGGAATTGAAAGAAATTTTTAAGGATTAGAAT 15 14 1 ATTTTGGATAGAATTAAAAATTCTTTTAATGTATAAATG 16 34 1 GAATGGCGATAAGACAAAAATGTCTTAAATTTTGTGGTA 18 198 1 GTTTAGTATAATTCTAAAATCCATTTCAAAAAATTAAGG 18 261 1 TTATAAAAAGGAAGTAAAAATCTCTAAAAAGCCCTAAAA 24 23 1 AAATTCGCTATAATAAAATTTCTTTTAAACGCGCCATA 25 9 1 * **** *** ** MAP Score: 13.9761 Motif 7 AGGGTTAAAAAGCTTTAAAAGAGGGCAAAA 0 58 1 TGCTCTTAAAAGTTTTAAGACAATGAAGTT 0 174 0 TTTTAAGAGCAATTTTAAAATTCGTTGGCG 0 193 1 ACTAAAAAAAGGGTTTTAAATA 0 247 1 ACGAACGGCTTAAAAGAATGAAAATT 1 6 1 AATTTTATCAAGGTTTTAATA 1 32 1 ATTTTTCAGTATTTTTAAAGGATTAAAAAG 2 71 0 AAAAATTGAAGTTTTTTAAAATTTGGAGTT 2 95 1 GGCTTTTAGGGGGTTTTAAATTCTTTTAAG 2 131 1 TCATTGAGATAGTTTTAAGGAAATTAAGGA 2 180 1 AGAGTATTTTATTTTTAAGGTTAGAACA 3 8 0 ATTCAAAAATGGCTTAAAAATGGTTTCACT 3 44 1 ACCCTAATTTAGTTTAAAAGGTTTTTACAA 5 12 0 GTATAATGCTAGTTTTAAAAATGAAAGGGT 7 11 1 TCAACAATAGGGGTTTAAAAT 7 42 1 CTTGGAGTTAAGGTTTAAAATTTTAGCGTT 9 18 1 AATCGGTTAAGATTTTTAAAAGAAAAATTA 11 17 1 GGGAACTTTTAGTTTTAAATTTTTAGAATA 11 58 1 AGGCCTTTCTGTTTTTAAGTC 12 1 0 ATGGTTCTAAAGTTTAAAGATCCTTTTGCA 12 145 1 CGTTAGGAGTTTTTAATCTTAGGCTGA 14 7 1 AGAGCTAAAAAGCTTAAAATTTCTTTTTTA 14 45 1 ATTGAAAGAAATTTTTAAGGATTAGAATC 15 25 1 AATTTTTTAATTTTAGTTTAA 16 1 1 ACATTAAAAGAATTTTTAATTCTATCCAAA 16 36 0 TAAATGTATTAAGTTTAAGTGAGGGCGAAA 16 67 1 ATAGGTTGGTGGCTTTAAATAAGGAGAATA 16 280 1 TATAGGCTCCAGTTTATAATCTCTTGAATG 18 173 1 TTAATATAAAAGTTTTTAGTAGTGCCTAAT 20 38 1 ********** MAP Score: 13.0349 Motif 8 TTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTAGACTACAAT 0 44 0 ACTGAAATTGTTTTTTTTTTTTTTTGAAATCGC 0 94 0 AAAAAAACAATTTCAGTTTCTTATTAGCTAGGT 0 110 1 ACTTCATTGTCTTAAAACTTTTAAGAGCAATTT 0 175 1 TTGATAAAATTTTCATTCTTTTAAGCCGTTCGT 1 10 0 ATGAAAATTTTATCAAGGTTTTAATA 1 27 1 AGAAGCAGTATTTTAGCTTTTTAATCCTTTAAA 2 55 1 AACTTCAATTTTTCAGTATTTTTAAAGGATTAA 2 75 0 ATACTGAAAAATTGAAGTTTTTTAAAATTTGGA 2 89 1 TTTTTTAAAATTTGGAGTTTTTTCTGGCTTTTA 2 106 1 TTTTCTGGCTTTTAGGGGGTTTTAAATTCTTTT 2 125 1 TGAAACCATTTTTAAGCCATTTTTGAATACAAT 3 39 0 TTAGGGTAGTATTATAGCATTTAATCTTTGATA 5 35 1 TGGAGTTAAGGTTTAAAATTTTAGCGTTAGTCG 9 20 1 ATATTTAACACTTAGGATTTTTA 10 0 0 TAACCGGTCATTTTAATTATTTTAGTATAATTG 10 85 1 TGAAAAATCGGTTAAGATTTTTAAAAGAAAAAT 11 12 1 GAACTTTTAGTTTTAAATTTTTAGAATAAGGAA 11 60 1 GCAGGTGGGTTTTTGGTATTTTTATCATGGATG 12 115 1 GATCAAAAATTTTGAGTTATTTAATGCATTAAT 12 187 0 CGTTAGGAGTTTTTAATCTTAGGC 14 1 1 AAAAAGAAATTTTAAGCTTTTTAGCTCTTACGA 14 40 0 TTAATTTTAGTTTAAGCTATTTTGGATAGAATT 16 16 1 TAGGATAACATTTTAGTTTTTGAGACGCCTATA 18 83 1 ACCACAAAATTTAAGACATTTTTGTCTTATCGC 18 203 0 ATTTAAGGGTTATTTCAATGAAAA 20 1 1 AATATGTTAATATAAAAGTTTTTAGTAGTGCCT 20 32 1 TTTAGGGCTTTTTAGAGATTTTTACTTCCTTTT 24 28 0 TCAGTTTTTATTTTATTGTTTTATTCTGTTTTT 24 105 1 *** ** ***** MAP Score: 9.12538 Motif 9 ACAATTTAAGAAGCAAAAATTAAAGGAACG 0 19 0 AGCGATTTCAAAAAAAAAAAAAAACAATTT 0 93 1 GGCTTAAAAGAATGAAAATTTTATCAAGGT 1 16 1 CGCACATAAGAAGTAGAAAATAAAGAAGCA 2 32 1 AAGGATTAAAAAGCTAAAATACTGCTTCTT 2 54 0 CTAACCTTAAAAATAAAATACTCTTATTGT 3 14 1 CTCTTATTGTATTCAAAAATGGCTTAAAAA 3 34 1 GGTTGATCCTAATCAAAAATAATCTCAATC 3 97 0 ATGTCCTAACAAGCAAAATTGAAATTAGAA 4 23 0 ATAGGGCTTTAGGGGAAAATAG 5 65 1 CTTTAAATTAAAACAAAAATTAAAT 6 5 0 AAGATTTTTAAAAGAAAAATTAGGGTAAAA 11 25 1 TTTTTAGAATAAGGAAAAATA 11 77 1 TCAAGCCTTTGATCAAAAATTTTGAGTTAT 12 200 0 TGATGGCTTTAATTTAAAAAAATGTGAAGG 13 17 1 TTAAACTAAAATTAAAAAATT 16 1 0 TTTTGGATAGAATTAAAAATTCTTTTAATG 16 35 1 ACCACCACCAAAACAGAAATAAGTGCGTTG 16 184 0 AAATCCAACAAAGCTAAAAACAGCGTGATA 16 220 0 AAAAGCCCCTAGAGAAAAATCCAACAAAGC 16 236 0 GGCGTCTCAAAAACTAAAATGTTATCCTAA 18 82 0 AATGGCGATAAGACAAAAATGTCTTAAATT 18 199 1 TCAAAAAATTAAGGAGAAATACAA 18 286 1 GGGTTATTTCAATGAAAATATGTTAATATA 20 16 1 AATTTTTTCAAAGGAGAAAAATC 20 65 1 TATAAAAAGGAAGTAAAAATCTCTAAAAAG 24 24 1 ********** MAP Score: 4.59498 Motif 10 AAGTTATTGCGTTCCTTTAATTTTTGCTTC 0 9 1 AAACAATTTCAGTTTCTTATTAGCTAGGTTT 0 114 1 TTTTTTTAGTAGTTCATTCAAAACGGATATT 0 226 0 ATAAAATTTTCATTCTTTTAAGCCGTTCGT 1 9 0 GCAGTATTTTAGCTTTTTAATCCTTTAAAAA 2 59 1 GAAAAATTGAAGTTTTTTAAAATTTGGAGTT 2 94 1 GGGGGTTTTAAATTCTTTTAAGGTATTCTAA 2 139 1 TTGTTCCTTAATTTCCTTAAAACTATCTCAA 2 183 0 AAATGGTTTCACTTTTTTCTATTAAAATTAG 3 61 1 CGGTCATTTTAATTATTTTAGTATAATTGAA 10 89 1 GTTTGTTAAAAGTTTCTTTCAATTATACTAA 10 106 0 AAATCGGTTAAGATTTTTAAAAGAAAAATTA 11 16 1 AATCCTTCACATTTTTTTAAATTAAAGCCAT 13 19 0 AAAGCTTAAAATTTCTTTTTTAAAAAGATAA 14 53 1 ATCCTTAAAAATTTCTTTCAATTCCAACAAA 15 16 0 AATTTTTTAATTTTAGTTTAA 16 0 1 TAGAATTAAAAATTCTTTTAATGTATAAATG 16 42 1 ATTTCTCCTTAATTTTTTGAAATGGATTTTA 18 275 0 AGTAGTGCCTAATTTTTTCAAAGGAGAAAAA 20 55 1 GGATAAAACGAGTTCTTTTAGGAGAGTTT 24 145 1 TCTTAAGTTCCTTTAAATTGATGTTC 25 85 0 ******** ** MAP Score: 1.09665