AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HP/HP_operons013_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944246120 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 HP0031 108 H. pylori predicted coding region HP0031 #1 HP0032 30 conserved hypothetical protein #2 HP0262 157 H. pylori predicted coding region HP0262 #3 HP0263 111 adenine specific DNA methyltransferase (hpaim) #4 HP0264 72 ATP-dependent protease binding subunit (clpB) #5 HP0513 290 H. pylori predicted coding region HP0513 #6 HP0514 60 ribosomal protein L9 (rpl9) #7 HP0795 111 trigger factor (tig) #8 HP0796 28 outer membrane protein (omp18) #9 HP0797 118 flagellar sheath adhesin hpaA #10 HP0801 72 molybdopterin converting factor, subunit 1 (moaD) #11 HP0802 88 GTP cyclohydrolase II (ribA) #12 HP0803 88 H. pylori predicted coding region HP0803 #13 HP0804 170 GTP cyclohydrolase II/3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase (ribA, ribB) #14 HP0805 81 lipooligosaccharide 5G8 epitope biosynthesis-associated protein (lex2B) #15 HP1376 171 (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase (fabZ) #16 HP1377_HP1378 357 HP1377: H. pylori predicted coding region HP1377, HP1378: competence lipoprotein (comL) #17 HP1379 41 ATP-dependent protease (lon) Motif 1 CTCAAAGATAAAGCGCTACAATCTCGCTTAGAA 0 22 0 ATTAGGGTTTATTTGGTATAATACCAAAACTTC 0 68 1 AATCATATATTTTCACTAAAATAATATTGAAAG 2 31 0 ATTTTGATCAAAGCTCTAAAATCAAGAGCATAG 3 57 1 GAGGGTTAAAATAGTGTAAAATAGTAAAGATTT 4 27 1 TTTGCCCCATAAATGCTATAATCACCCCTATCA 5 44 0 TATGGGGCAAAAAAAGTAGAATCTGTATCAAGT 5 66 1 ATTAAGATGCATGCGGTAAAATCCGCTAAATCA 5 102 1 TTAAAACAAATTAAGCTATAATGATACAAAAAT 7 61 1 TCTAAAGATGTTAGGGTAAAATAACATTTTGAC 9 24 1 TTATAAAGAGTTTTGATAGAATACCTTTTTTTA 11 30 1 TGTAATGTTTTTAAGGTATAATAAACTCTTTTT 12 38 1 CTAGCGCAAATTTTAGTAAAATACGCATC 14 6 0 TTACTAAAATTTGCGCTAGAATGTAAGTCTGTT 14 20 1 AGCGGTTTTCTTATGGTATAATAGCGGTTATTT 15 86 1 AGACGCCACCTACCGCTAAAATGAGATTTACTG 16 129 1 CCGAATCATTATAAAATATAATAAGGAGTTGAG 16 202 0 TTTCGCTAGTTTTGGATATAATCCCAATAACTT 16 254 0 TATCAAACAATTTTGGTAAAATCAATTTTCGCT 16 280 0 ** **** **** MAP Score: 20.3416 Motif 2 TTCATTTTTATTATAAGCTTGTTTCAAACACCAGCC 2 104 1 TTTTAAGGTATAATAAACTCTTTTTAAGTCAAGCAA 12 46 1 CAAATTATAATACAAAATTTTGATAATGGCTGG 2 134 0 TAAGCTATAATGATACAAAAATTTAATTTTTTAGCC 7 72 1 ATCTTTACTATTTTACACTATTTTAACCCTCAAAGG 4 22 0 GCAACCACACTATTAGGATTTTTTGAAGAAAATCAA 5 159 1 TTTAAAGAGGTTTTAAAAATATTTAAAATCATGCTT 10 23 1 GCGTTTTAAAAACCTTTGAGGGTTAAAAT 4 3 1 AAATTAGTTTTAAAACGCATCTTTTAAAAAAAGGTA 11 51 0 TTCCAGTTTATAAAAAGCGGTTTTAATTCTAGTTTT 7 25 0 GATGTTAGGGTAAAATAACATTTTGACAACAAAAGC 9 30 1 CATAGAAAATTTATTAGAAGATTTAAAAAGGCTTTT 3 85 1 TCTAGCCCTTTGATTAAATTCTTTCAATATTATTTT 2 11 1 TAACCATGAGTTATTCAAAAATTTAACTTTATAAGA 16 18 0 TTATTGAATGTGTTGTAATGTTTTTAAGGTATAATA 12 25 1 TTTTTTAAATTTTTGAAAACTAGAAT 7 0 1 TGGATTCAATTAAAGCGCTATTTTTAGCGTTGGTTA 15 127 0 AGACTTACATTCTAGCGCAAATTTTAGTAAAATACG 14 14 0 TTACCCTTATATTAAATCTTTTAAAGCATGATT 10 49 0 GATTGTAATATTTTAGACTTCTATAACAACAAACCC 9 80 0 ATGCGAACAATTATGGGATGATATTATAAAAATTGG 5 251 1 GAGCTTAAAATTTAAGAAAATTATAAAGAGTTTTGA 11 10 1 TATAGCATGTTTAATAACGATTATTACTTTATTGCT 13 93 0 * *** ** *** * MAP Score: 20.0493 Motif 3 TTAATTGAATCCAAAACAAGGAGTTTATTT 15 150 1 GTAAAATCCGCTAAATCAAGGAGTGTTATT 5 117 1 CGATTTGTATCTAAATAAAGCAATAAAGTA 13 75 1 TGGTTTTTGGCTAAATAAAGGCCATCTCAT 3 28 0 CACCATTTCTCCAAATCAAGCCCAGCCGCA 16 93 1 ATAACCAACGCTAAAAATAGCGCTTTAATT 15 126 1 GGATACTCCTAAAATTAGTTTTAAAACG 11 70 0 GGGATTATATCCAAAACTAGCGAAAATTGA 16 262 1 CAAATAACGCATAAAAAAAGAACGC 8 13 1 GTTGGTTATTCTAAAAAAATAACCGCTATT 15 105 0 TATATTTTCACTAAAATAATATTGAAAGAA 2 29 0 ATATTATTGAATAAAACTAGGGAGTTAGA 13 151 1 CCACCTACCGCTAAAATGAGATTTACTGGG 16 134 1 GCGTATTTTACTAAAATTTGCGCTAGAATG 14 13 1 CTTATTCCCACCAAATAATGTCAGCACCAT 16 69 1 AAATAAAACCACAAATCAAGAAAAATAATC 16 163 0 GCTAAAGCCTCTAAATTAATTGAATGAAAC 13 46 0 TGGAATTAAAACAAATTAAGCTATAATGAT 7 56 1 TCCTTAATGGCTAAAAAATTAAATTTTTGT 7 86 0 TTATAGAAGTCTAAAATATTACAATCAAGG 9 90 1 AACGCATCTTTTAAAAAAAGGTATTCTATC 11 44 0 ATGCATCTTAATAAAACTTGATACAGATTC 5 84 0 GGATGATATTATAAAAATTGGTGGGAATGA 5 266 1 ********** MAP Score: 18.4638 Motif 4 TTCCCACCAATTTTTATAATATCATCCCATAA 5 261 0 CTGTATCAAGTTTTATTAAGATGCATGCGGTA 5 88 1 CTAGCGCAAATTTTAGTAAAATACGCATC 14 7 0 TATCAAACAATTTTGGTAAAATCAATTTTCGC 16 281 0 AAAAATTAAATTTTTGTATCATTATAGCTTAA 7 71 0 TTAAATGAAGTTTTGGTATTATACCAAATAAA 0 75 0 CTCTTTATAATTTTCTTAAATTTTAAGCTC 11 8 0 TTTAAAGAGGTTTTAAAAATATTTAAAATCAT 10 23 1 AGAATACCTTTTTTTAAAAGATGCGTTTTAAA 11 47 1 TTATAAAGAGTTTTGATAGAATACCTTTTTTT 11 30 1 CATGGTTATTTTTTCTTATCTTTCTTATTCCC 16 46 1 TTAATTCTAGTTTTCAAAAATTTAAAAAA 7 7 0 ATAGCGGTTATTTTTTTAGAATAACCAACGCT 15 106 1 CCTTATTATATTTTATAATGATTCGGTTAAAC 16 209 1 TTTCGCTAGTTTTGGATATAATCCCAATAACT 16 255 0 TACTCTTTATTTTGAATAAGTTGGGTTT 6 6 0 CCTTTTTGAGTTTTAAAATCTTTACTATTTTA 4 43 0 AAAAGCCTTTTTAAATCTTCTAATAAATT 3 92 0 TTAAAACCGCTTTTTATAAACTGGAATTAAAA 7 35 1 GTCTAGCCCTTTGATTAAATTCTTTCAATAT 2 9 1 GCGTTTTAAAAACCTTTGAGGGTTA 4 3 1 **** **** ** MAP Score: 18.1347 Motif 5 ACTTATTCAAAATAAAGAGTATAATTACAAATTA 6 17 1 AGACAAATAACGCATAAAAAAAGAACGC 8 5 1 AAATATTTAAAATCATGCTTTAAAAGATTTAATA 10 39 1 CATCTTTTAAAAAAAGGTATTCTATCAAAACTCT 11 36 0 AAAATATTACAATCAAGGATAGAACG 9 102 1 CTGGTGTTTGAAACAAGCTTATAATAAAAATGAA 2 104 0 TAGCATGTTTAATAACGATTATTACTTTATTGCT 13 93 0 TAAGTCAAGCAATAAAGTTTGCAACCTG 12 70 1 TTTGAGGGTTAAAATAGTGTAAAATAGTAAAGAT 4 24 1 TTTAAAACTCAAAAAGGATTGATA 4 58 1 CGCTTTTTATAAACTGGAATTAAAACAAATTAAG 7 42 1 AAATTTTTGAAAACTAGAATTAAAACCGCTTTTT 7 16 1 TTTGTATCTAAATAAAGCAATAAAGTAATAATCG 13 78 1 TTTATTCAATAATATTGAGTTTTATAGAAAAAAG 13 132 0 AAAGCGCTACAATCTCGCTTAGAAAAAGGACACA 0 12 0 TGGAAAAAGGAATAATGCGAACAATTATGGGATG 5 237 1 TGAGTGCTTTAAAGAGGTTTTAAAAATATTTAAA 10 16 1 AGCTTATAATAAAAATGAAATTTAAATTTTAGAT 2 89 0 AGTTTTATAGAAAAAAGAAATATAGCATGTTTAA 13 115 0 CCTTTTTTTAAAAGATGCGTTTTAAAACTAATTT 11 53 1 TAAAACCACAAATCAAGAAAAATAATCCCAGTAA 16 156 0 TGATTTTACCAAAATTGTTTGATATAATACAGAG 16 289 1 TATAAAATATAATAAGGAGTTGAGGAATGAGCAA 16 192 0 ***** * ** ** MAP Score: 17.6743 Motif 6 AACCTTTGAGGGTTAAAATAGTGTAAAATAGTAAAGAT 4 20 1 TTAAAATCATGCTTTAAAAGATTTAATATAAGGGTAA 10 45 1 CTAGCCCTTTGATTAAATTCTTTCAATATTATTTTAGT 2 12 1 TTTAAAGAGGTTTTAAAAATATTTAAAATCATGCTTTA 10 23 1 TTTTTTAAATTTTTGAAAACTAGAATTAA 7 1 1 AAAAGCCTTTTTAAATCTTCTAATAAATTTTCTAT 3 86 0 AAATAGTAAAGATTTTAAAACTCAAAAAGGATTGATA 4 45 1 ATCTATCAGAGGTTGTATAGTTGGAAAAAGGAATAATG 5 216 1 GGGTCATTAGGGTTTATTTGGTATAATACCAAAACTTC 0 63 1 TCGGGTTTGTTGTTATAGAAGTCTAAAATATTACAATC 9 78 1 AAATTGATTGTTTTGATTTTCTTCAAAAAATCCTAATA 5 169 0 GTATAATAGCGGTTATTTTTTTAGAATAACCAACGCTA 15 101 1 TGTGTTGTAATGTTTTTAAGGTATAATAAACTCTTTTT 12 33 1 AAGCGAGCGGTTTTCTTATGGTATAATAGCGGTTATTT 15 81 1 GAGCTTAAAATTTAAGAAAATTATAAAGAG 11 2 1 TAATAAACTCTTTTTAAGTCAAGCAATAAAGTTTGCAA 12 56 1 TTTTTTCCTTAATGGCTAAAAAATTAAATTTTT 7 88 0 AAAAATAGCGCTTTAATTGAATCCAAAACAAGGAGTTT 15 138 1 TTTGTAATTATACTCTTTATTTTGAATAAGTTGGGTTT 6 10 0 TTAGCCTTAATTCTTAATGCAAATAAAATCAATATCAA 14 52 0 * ** ** * **** MAP Score: 16.7684 Motif 7 GATTAAATTCTTTCAATATTATTTTAGTGAAAATATATGATT 2 22 1 GCGTTTTAAAAACCTTTGAGGGTTAAAATAGTGTA 4 3 1 GCTTTTGTTGTCAAAATGTTATTTTACCCTAACATCTTTAGA 9 24 0 AAAGATGCGTTTTAAAACTAATTTTAGGAGTATCC 11 63 1 AAGCTTATAATAAAAATGAAATTTAAATTTTAGATATTCTGC 2 82 0 TATCAATCCTTTTTGAGTTTTAAAATCTTTAC 4 50 0 TTTTAAGGTATAATAAACTCTTTTTAAGTCAAGCAATAAAGT 12 46 1 CTTTAATTGTTATGAATTGAGTTTGATTGATAGGGGTGATTA 5 17 1 TAACCAACGCTAAAAATAGCGCTTTAATTGAATCCAAAACAA 15 127 1 ACCGCATGCATCTTAATAAAACTTGATACAGATTCTACTTTT 5 77 0 AAGAGTATAATTACAAATTACTTACAACTTAAAGGGGAT 6 31 1 TCAAAACTCTTTATAATTTTCTTAAATTTTAAGCTC 11 4 0 TTACCCTTATATTAAATCTTTTAAAGCATGATTTTAAATAT 10 41 0 ATTCCAGTTTATAAAAAGCGGTTTTAATTCTAGTTTTCAAAA 7 20 0 AAATAATCCCAGTAAATCTCATTTTAGCGGTAGGTGGCGTCT 16 129 0 TTTAAATATTTTTAAAACCTCTTTAAAGCACTCATAATTT 10 8 0 ATATGATTCATTAGCAATACTTTTAAGCAGAATATCTAAAAT 2 56 1 TGTAAGTCTGTTTGATATTGATTTTATTTGCATTAAGAATTA 14 41 1 * * *** *** * * MAP Score: 15.777 Motif 8 AAGATGCGTTTTAAAACTAATTTTAGGAGTATCC 11 64 1 ATTGCTTGACTTAAAAAGAGTTTATTATACCTTA 12 49 0 TTTTTAAATCTTCTAATAAATTTTCTATGCTCTT 3 80 0 TAAAGCATGATTTTAAATATTTTTAAAACCTCTT 10 27 0 TTTAAGAAAATTATAAAGAGTTTTGATAGAATAC 11 20 1 TCTTTACTATTTTACACTATTTTAACCCTCAAAG 4 23 0 AAAACTAGAATTAAAACCGCTTTTTATAAACTGG 7 25 1 TTATGAGTGCTTTAAAGAGGTTTTAAAAATATTT 10 13 1 ATTAGAAGATTTAAAAAGGCTTTT 3 97 1 CCCCTTTAAGTTGTAAGTAATTTGTAATTATACT 6 34 0 AGAACCAACCTTAAATGAAGTTTTGGTATTATAC 0 83 0 TTAATTCTAGTTTTCAAAAATTTAAAAAA 7 5 0 ACACCAGCCATTATCAAAATTTTGTATTATAATT 2 131 1 TAAAATAATATTGAAAGAATTTAATCAAAGGGCT 2 14 0 TAAACTGGAATTAAAACAAATTAAGCTATAATGA 7 51 1 AAAATCATGCTTTAAAAGATTTAATATAAGGGTA 10 47 1 TGGCTGGTGTTTGAAACAAGCTTATAATAAAAAT 2 107 0 GCGTTTTAAAAACCTTTGAGGGTTAAA 4 3 1 ATATGATTCATTAGCAATACTTTTAAGCAGAATA 2 56 1 CTCTTTATAATTTTCTTAAATTTTAAGCTC 11 6 0 GATGCGTATTTTACTAAAATTTGCGCTAGAATG 14 9 1 GTAAGTCTGTTTGATATTGATTTTATTTGCATTA 14 42 1 GGGAGTTTCATTCAATTAATTTAGAGGCTTTAGC 13 42 1 TTACAACACATTCAATAAAACTTAACGAGCCTC 12 9 0 ** *** * **** MAP Score: 15.2131 Motif 9 CGGGTCATTAGGGTTTATTTGGTATAATACCAAAACT 0 62 1 AAATTCTTTCAATATTATTTTAGTGAAAATATATGAT 2 26 1 GAATGAGATGGCCTTTATTTAGCCAAAAACCATTTTG 3 26 1 CAAATTGATTGTTTTGATTTTCTTCAAAAAATCCTAA 5 171 0 GAACAATTATGGGATGATATTATAAAAATTGGTGGGA 5 255 1 TGTAATTATACTCTTTATTTTGAATAAGTTGGGTTT 6 9 0 TTGTTGTCAAAATGTTATTTTACCCTAACATCTTTAG 9 25 0 AATCTTTTAAAGCATGATTTTAAATATTTTTAAAACC 10 31 0 GATGCGTATTTTACTAAAATTTGCGCTA 14 1 1 GTTTGATATTGATTTTATTTGCATTAAGAATTAAGGC 14 50 1 AAAACCGCTCGCTTGTATTTGCAAAAACACCGATGCA 15 58 0 TGGTATAATAGCGGTTATTTTTTTAGAATAACCAACG 15 99 1 TGAATAACTCATGGTTATTTTTTCTTATCTTTCTTAT 16 37 1 AAATGGTGCTGACATTATTTGGTGGGAATAAGAAAGA 16 64 0 GGTGCGGCTGGGCTTGATTTGGAGAAATGGTGCTGAC 16 88 0 GAGATTTACTGGGATTATTTTTCTTGATTTGTGGTTT 16 151 1 CTTGATTTGTGGTTTTATTTTGCTCATTCCTCAACTC 16 173 1 TCCTCAACTCCTTATTATATTTTATAATGATTCGGTT 16 200 1 AAACTAGCGAAAATTGATTTTACCAAAATTGTTTGAT 16 275 1 * ******* ** MAP Score: 13.2748 Motif 10 TCATGCTTTAAAAGATTTAATATAAGGGTA 10 51 1 TCTAGTTTTCAAAAATTTAAAAAA 7 4 0 TGAGTTATTCAAAAATTTAACTTTATAAGA 16 18 0 ATAATGATACAAAAATTTAATTTTTTAGCC 7 78 1 GAGCTTAAAATTTAAGAAAATTATA 11 5 1 GCAGAATATCTAAAATTTAAATTTCATTTT 2 82 1 AAATTTATTAGAAGATTTAAAAAGGCTTTT 3 91 1 GAGGTTTTAAAAATATTTAAAATCATGCTT 10 29 1 GTAAAATAGTAAAGATTTTAAAACTCAAAA 4 42 1 TTATTTGCATTAAGAATTAAGGCTAAC 14 64 1 CGAATCATTATAAAATATAATAAGGAGTTG 16 204 0 ATAATATTGAAAGAATTTAATCAAAGGGCT 2 14 0 ACACATTCAATAAAACTTAACGAGCCTC 12 8 0 TCCTTGATTGTAATATTTTAGACTTCTATA 9 91 0 ********** MAP Score: 13.1944 Motif 11 TTTCAATATTATTTTAGTGAAAATATATGATTCATTAGCA 2 32 1 AGCATAGAAAATTTATTAGAAGATTTAAAAAGGCTTTT 3 83 1 TGAGGGTTAAAATAGTGTAAAATAGTAAAGATTTTAAAAC 4 26 1 TATCAATCCTTTTTGAGTTTTAAAATCTTTACTAT 4 47 0 AAAAAGTAGAATCTGTATCAAGTTTTATTAAGATGCATGC 5 76 1 GAGGTTGTATAGTTGGAAAAAGGAATAATGCGAACAATTA 5 224 1 ATCCCCTTTAAGTTGTAAGTAATTTGTAAT 6 40 0 ACTGGAATTAAAACAAATTAAGCTATAATGATACAAAAAT 7 54 1 AAAAAGACCAATAATCTAAAGATGTTAGGGTAAAATAAC 9 9 1 ATTTAAAATCATGCTTTAAAAGATTTAATATAAGGGTAA 10 43 1 GAGGCTCGTTAAGTTTTATTGAATGTGTTGT 12 1 1 AATGTGTTGTAATGTTTTTAAGGTATAATAAACTCTTTTT 12 31 1 AATAAACTCTTTTTAAGTCAAGCAATAAAGTTTGCAACCT 12 57 1 AGCGATTTGTATCTAAATAAAGCAATAAAGTAATAATCGT 13 73 1 AGTTTTATTCAATAATATTGAGTTTTATAGAAAAAAGAAA 13 129 0 TATTGATTTTATTTGCATTAAGAATTAAGGCTAAC 14 56 1 AGTTTAACCGAATCATTATAAAATATAATAAGGAGTTGAG 16 202 0 * * *** * *** * MAP Score: 11.2703 Motif 12 CTTGACTTAAAAAGAGTTTATTATACCTTA 12 49 0 AGAAAATTATAAAGAGTTTTGATAGAATAC 11 24 1 TGAGTGCTTTAAAGAGGTTTTAAAAATATT 10 16 1 AATCCAAAACAAGGAGTTTATTTT 15 157 1 CAGTTTATAAAAAGCGGTTTTAATTCTAGT 7 28 0 TTTGACAACAAAAGCGTGTTGGTTGCTTCG 9 51 1 GTTTCTATGCAAAGCGTTTCTTGAAGCTTA 15 20 1 TTGATATAATACAGAGTTTAGCTTAGAAAT 16 307 1 GTAAAATAGTAAAGATTTTAAAACTCAAAA 4 42 1 TATTCAAAATAAAGAGTATAATTACAAATT 6 20 1 CCGCTAAATCAAGGAGTGTTATTATGGAAG 5 124 1 AATAATATTGAAAGAATTTAATCAAAGGGC 2 15 0 AAAAGCCTTTTTAAATCTTCT 3 100 0 CCAATAATCTAAAGATGTTAGGGTAAAATA 9 17 1 TTATGGTATAATAGCGGTTATTTTTTTAGA 15 96 1 ********** MAP Score: 11.1233 Motif 13 ATTTCTAAGCTAAACTCTGTATTATATCAAACA 16 304 0 TAAGGTATAATAAACTCTTTTTAAGTCAAGCAA 12 49 1 TTTTTTCTATAAAACTCAATATTATTGAATAAA 13 133 1 GTATAATACCAAAACTTCATTTAAGGTTGGTTC 0 83 1 GATGCGTTTTAAAACTAATTTTAGGAGTATCC 11 66 1 CCGCTTTTTATAAACTGGAATTAAAACAAATTA 7 41 1 GTATTCTATCAAAACTCTTTATAATTTTCTTAA 11 21 0 TAAATTTTTGAAAACTAGAATTAAAACCGCTTT 7 15 1 ACAATTTTGGTAAAATCAATTTTCGCTAGTTTT 16 274 0 GATGTTAGGGTAAAATAACATTTTGACAACAAA 9 30 1 CACCTACCGCTAAAATGAGATTTACTGGGATTA 16 135 1 TTAATGGCTAAAAAATTAAATTTTTGTATCATT 7 80 0 AGCTTATAATAAAAATGAAATTTAAATTTTAGA 2 90 0 AAAATAAACTCCTTGTTTTGGATTCAA 15 154 0 ATTTTCTTCAAAAAATCCTAATAGTGTGGTTGC 5 159 0 TAATCGTTATTAAACATGCTATATTTCTTTTTT 13 106 1 GAAGAAAATCAAAACAATCAATTTGTCATTCCT 5 183 1 TTAGAAGATTTAAAAAGGCTTTT 3 98 1 CGCATCTTTTAAAAAAAGGTATTCTATCAAAAC 11 39 0 ****** **** MAP Score: 10.1793 Motif 14 TAAATTTTAGATATTCTGCTTAAAAGTATTGCTAAT 2 65 0 GATCGTCATGGAGCATGAATGAGATGGCCTT 3 5 1 ATTATAGCATTTATGGGGCAAAAAAAGTAGAATCTG 5 55 1 GAATTAAAACAAATTAAGCTATAATGATACAAAAAT 7 58 1 AGACAAATAACGCATAAAAAAAGAACGC 8 4 1 AAAATATTTAAAATCATGCTTTAAAAGATTTAATAT 10 38 1 AACTCTTTTTAAGTCAAGCAATAAAGTTTGCAACCT 12 61 1 GTCTTTGAGCATTTCTTGCATGATAGGGGGAGTTTC 13 15 1 ATTTGTATCTAAATAAAGCAATAAAGTAATAATCGT 13 77 1 ATTTTACTAAAATTTGCGCTAGAATGTAAGTCTGTT 14 17 1 CCAACGCTAAAAATAGCGCTTTAATTGAATCCAAAA 15 130 1 AAAAGACGCCACCTACCGCTAAAATGAGATTTACTG 16 126 1 * * **** **** MAP Score: 8.54729 Motif 15 CAGCGGGTCATTAGGGTTTATTTGGTATAATACCAAAACTT 0 59 1 CATGAATGAGATGGCCTTTATTTAGCCAAAAACCATTTTGA 3 23 1 AGGGGTGATTATAGCATTTATGGGGCAAAAAAAGTAGAATC 5 48 1 AACCACACTATTAGGATTTTTTGAAGAAAATCAAAACAATC 5 161 1 TAGAATTAAAACCGCTTTTTATAAACTGGAATTAAAACAAA 7 30 1 TGTTGGTTGCTTCGGGTTTGTTGTTATAGAAGTCTAAAATA 9 67 1 CTTGACTTAAAAAGAGTTTATTATACCTTAAAAACATTACA 12 38 0 AATAAGTCTTTGAGCATTTCTTGCATGATAGGGGGAGTTTC 13 10 1 TTATTACTTTATTGCTTTATTTAGATACAAATCGCTAAAGC 13 68 0 TCTGTTTGATATTGATTTTATTTGCATTAAGAATTAAGGCT 14 47 1 GTTTCTATGCAAAGCGTTTCTTGAAGCTTATGGCGCAATGC 15 20 1 AATACAAGCGAGCGGTTTTCTTATGGTATAATAGCGGTTAT 15 76 1 TTATGGTATAATAGCGGTTATTTTTTTAGAATAACCAACGC 15 96 1 CGCTAAAAATAGCGCTTTAATTGAATCCAAAACAAGGAGTT 15 134 1 * ** *** ** ** MAP Score: 8.01073 Motif 16 GAACCAACCTTAAATGAAGTTTTGGTATTATACCA 0 81 0 TATGATTCATTAGCAATACTTTTAAGCAGAATATC 2 57 1 TTAAGCAGAATATCTAAAATTTAAATTTCATTTTT 2 78 1 CAAATTATAATACAAAATTTTGATAATGGCTGG 2 134 0 TAGAAAATTTATTAGAAGATTTAAAAAGGCTTTT 3 87 1 TAGTGTAAAATAGTAAAGATTTTAAAACTCAAAAA 4 38 1 AGGAATGACAAATTGATTGTTTTGATTTTCTTCAA 5 181 0 TTTGTAATTATACTCTTTATTTTGAATAAGTTGGG 6 13 0 TTTTTTAAATTTTTGAAAACTAGAAT 7 1 1 ATGTTAGGGTAAAATAACATTTTGACAACAAAAGC 9 31 1 TCTATCCTTGATTGTAATATTTTAGACTTCTATAA 9 90 0 AAAGCATGATTTTAAATATTTTTAAAACCTCTTTA 10 25 0 TTACCCTTATATTAAATCTTTTAAAGCATGATTT 10 48 0 CTTTATAATTTTCTTAAATTTTAAGCTC 11 3 0 GTTTTGATAGAATACCTTTTTTTAAAAGATGCGTT 11 39 1 AGATGCGTTTTAAAACTAATTTTAGGAGTATCC 11 65 1 ATTGAATGTGTTGTAATGTTTTTAAGGTATAATAA 12 27 1 ACTTACATTCTAGCGCAAATTTTAGTAAAATACGC 14 13 0 GATTCAATTAAAGCGCTATTTTTAGCGTTGGTTAT 15 126 0 AAAATAAACTCCTTGTTTTGGATTCAATTAA 15 150 0 CTGTCTTATAAAGTTAAATTTTTGAATAACTCATG 16 15 1 ATAATCCCAGTAAATCTCATTTTAGCGGTAGGTGG 16 134 0 TAAAATCAATTTTCGCTAGTTTTGGATATAATCCC 16 262 0 TCTGTATTATATCAAACAATTTTGGTAAAATCAAT 16 287 0 ** ** ****** MAP Score: 7.92856 Motif 17 AACCAACCTTAAATGAAGTTTTGGTATTATACCAAATAA 0 76 0 ATATTTTCACTAAAATAATATTGAAAGAATTTAATCAAA 2 19 0 CTTATAATAAAAATGAAATTTAAATTTTAGATATTCTGC 2 82 0 AGCTTTGATCAAAATGGTTTTTGGCTAAATAAAGGCCAT 3 33 0 AAAAGCCTTTTTAAATCTTCTAATAAATT 3 92 0 AACCACACTATTAGGATTTTTTGAAGAAAATCAAAACAA 5 161 1 ATTGTTCGCATTATTCCTTTTTCCAACTATACAACCTCT 5 223 0 CCAGTTTATAAAAAGCGGTTTTAATTCTAGTTTTCAAAA 7 20 0 TCATTATAGCTTAATTTGTTTTAATTCCAGTTTATAAAA 7 46 0 AATGGCTAAAAAATTAAATTTTTGTATCATTATAGCTTA 7 72 0 TTTGTTGTCAAAATGTTATTTTACCCTAACATCTTTAGA 9 24 0 ATGAGTGCTTTAAAGAGGTTTTAAAAATATTTAAAATCA 10 15 1 TAAGAAAATTATAAAGAGTTTTGATAGAATACCTTTTTT 11 22 1 CTTTTTTTAAAAGATGCGTTTTAAAACTAATTTTAGGAG 11 54 1 ATTGAATGTGTTGTAATGTTTTTAAGGTATAATAAACTC 12 27 1 TTAAGGTATAATAAACTCTTTTTAAGTCAAGCAATAAAG 12 48 1 TAAACATGCTATATTTCTTTTTTCTATAAAACTCAATAT 13 116 1 TGCATAAGCGGTTTCTATGCAAAGCGTTTCTT 15 3 1 CTGTCTTATAAAGTTAAATTTTTGAATAACTCATGGTTA 16 15 1 TAATCCCAGTAAATCTCATTTTAGCGGTAGGTGGCGTCT 16 129 0 AAAACTAGCGAAAATTGATTTTACCAAAATTGTTTGATA 16 274 1 **** **** * * MAP Score: 5.91403