AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HY/HY_operons001_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944251603 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 prfA 118 PEPTIDE CHAIN RELEASE FACTOR 1 #1 hemB 21 DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE #2 jhp0151 25 putative histidine kinase sensor protein #3 jhp0152 300 putative TRANSCRIPTIONAL REGULATOR #4 prfB 60 PEPTIDE CHAIN RELEASE FACTOR 2 (RF-2) #5 jhp0160 300 putative #6 jhp0193 96 putative #7 flgI 185 FLAGELLAR P-RING PROTEIN #8 ilvC 248 KETOL-ACID REDUCTOISOMERASE #9 minD 24 cell division inhibitor #10 jhp0324 260 putative #11 fliF 43 FLAGELLAR M-RING PROTEIN #12 flgG_1 55 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN #13 kgtP 300 ALPHA-KETOGLUTARATE PERMEASE #14 flhA 135 FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN #15 aroD 112 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE #16 rho_rpmE 264 rho: TRANSCRIPTION TERMINATION FACTOR, rpmE: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L31 #17 fliN 81 putative FLAGELLAR MOTOR SWITCH PROTEIN #18 fliP 96 FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN #19 jhp0699 163 putative #20 mobA 85 MOLYBDOPTERIN-GUANINE DINUCLEOTIDE BIOSYNTHESIS PROTEIN A #21 atpB 121 ATP synthase F0, subunit a #22 flgE 208 FLAGELLAR HOOK PROTEIN #23 jhp0842 180 putative #24 jhp0843 50 putative FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN #25 jhp0999 179 putative ZINC-METALLO PROTEASE #26 atpD 24 ATP synthase F1, subunit beta #27 atpA 22 ATP synthase F1, subunit alpha #28 atpX 104 ATP synthase B' #29 fmt 23 METHIONYL-TRNA FORMYLTRANSFERASE #30 jhp1070 34 putative #31 jhp1071 209 putative #32 rplS 21 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19. #33 rpsP 73 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 #34 valS 137 VALYL-TRNA SYNTHETASE #35 jhp1244 80 putative #36 fumC 174 FUMARASE #37 jhp1318 101 putative #38 flgB 204 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN #39 ribC 74 RIBOFLAVIN SYNTHASE ALPHA CHAIN #40 ydiE 300 putative O-SIALOGLYCOPROTEIN ENDOPEPTIDASE #41 flgG_2 300 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN (DISTAL ROD PROTEIN) Motif 1 TCTGTTAATGTTTTAAGGGCTTGATTTTAGCA 3 229 0 TATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAAT 36 138 1 CCACCACTCTTTTTAAGGAATTTGT 37 3 0 TTTTAGGGCGTTTTTAACTTCT 0 0 1 TAAAGCGGTCTTTTAGGGGATTTAGTTGGGGT 13 64 0 TATGGGGTTATTTTAGGGAATTTTAACATGCC 18 25 1 TTTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTT 10 57 0 TGGTTGCGGATTTTAAAGTTTTGTCAATAAAA 22 108 0 TATTCTCAATTTTTAAGCGATTTTTTGTTAAG 28 18 1 ATTTTCATTCTTTTAAGCCGTTCGC 11 3 0 TAAACTCACTTTTTAAGGGGTATTTAAGCGCA 5 268 0 AATACTATCATTTTAAGGATTAAA 6 82 1 AAATCAAGCTTTTTAACGAGTTTTTTAACGAT 21 32 0 TTAACGAGTTTTTTAACGATTTGTCTTGTTTT 21 20 0 TACCTCTTTTAAGATCTTACGAATCTCT 35 62 0 TTAAAACGATTTTTAGAGATTTTTGTAAAGAA 19 52 0 CAATTTCTTATTTTAGGGGGGTTAAAAGGGGG 3 36 0 ATAGGCGTTCTCTTAAGGTATTTTAGGGGTAT 38 37 1 AGTTAATCGTTTTTAAAGTTGTAAAAATCATT 3 260 1 CTACGAGCACTTTTAAAGAAGTGAAACGATGA 8 72 0 CAAAACCCCTTTTTAAACCCTTGCAAAATTAA 38 182 0 TTTAAATCTTTTTTAAACCTTTTTGTTAAAAA 41 202 1 AAAAGAGTTGTTTTAAAGGATAGTC 23 165 1 AAATTTGCGTTTTTAAAGGATAGGGC 6 4 0 CCATAACGCTTTTTAAAGCTTATCGCTCAAAT 22 27 0 AATACGAATATTTTAGGAGATTTTTGTA 33 55 1 TGGAAATGGTTTTTAAAAAATTAAGGTTTTTA 36 87 1 TTTTAAGCGAGTTTGCTCTATA 24 0 1 TTTTTAAGCATGTTTTGGGCGCT 33 1 1 TGCGGTGCGTTCTTAGGGGATTTAAGGGGTAA 15 32 1 GCTAAAGCATTCTTAAAGAATTAGTGTAATCA 16 180 0 TAGACTACAATTTTAAGAAGTAAAAATCAAAG 10 24 0 ATTTTATTATTCTTAAGGATGTGTTTATA 19 144 1 TAGTTGGGGTTTTTAGGGGAGAATGATTTCAA 13 42 0 AAGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCAGCTTAA 7 48 0 TGCGCCATACTTTTAAACTTTATATTATAATA 14 69 1 GCGTTAGCGCTTTTAAACGCTATAAAAACCTT 41 122 0 TTCTGCATGTTTTTAAACATTATCGCTCCCAT 8 181 1 AGGGTTTTAGTTTTAGCATGTTAGCATTCAGC 37 34 0 AAGGGCTTGATTTTAGCATTTTATTACTAAAG 3 215 0 GTAAAAAGGCTTTTAGCATTTTTTAGATTTGA 23 85 1 TAGTTTTTGGTTTAAAGGCTTTAGAGTGTTGC 40 233 1 TTTAATGAGTTTTTAAAACTTAATTGCTACAA 21 61 1 ATGAGTGGCTTTTTCAGGGATTCATCTCGCAC 35 25 0 ATCATAATTTTTTTAACAAAGTCAAATTTTAT 16 88 0 AACTTCATTGTCTTAAAACTTTTAAGAGCAAT 10 177 1 AATTTTTTCTTTTAAAAGGATTATTGC 12 38 1 GATTTAGCCCTTTTCAAGCGTTCTTTACAAAA 19 32 1 AATTGCCTAATTTTAAAAAGGATTAAAAAGGA 40 183 1 TATCCTTTAATTTAAAGAAATTCAATCTATGC 22 183 0 TATTTAAAACCCTTTTAGTCAGTT 10 246 0 ******** ** MAP Score: 65.8306 Motif 2 TCTTAAAACTTTTAAGAGCAATTTTAAAGTTCGTTGG 10 187 1 AATCAAGCTTTTTAACGAGTTTTTTAACGATTTGTCT 21 26 0 GCGTTTATTTTACCCTATTCTTTAAGTTTTTAGCC 37 76 0 CATCGAGAATTTTTGAATCCTTTTTAACATTCTTTTC 5 54 0 GTTTATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAATTT 36 135 1 TTTTAGGGCGTTTTTAACTTCTTTAAG 0 0 1 ACCGCTTTAATTTTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAA 10 63 0 TTTTTAATCCTTTTTAATCCTTTTTAAAATTAGGCAA 40 185 0 AGAATGAAAATTTTATCAAGGTTTTAATA 11 24 1 CAAGTATCCTTTATTTTTAAATTTAAACTTAAAATT 16 9 1 AGCATAAGCCTTTTATAAAAACTTTAAACTTAATTGA 7 125 0 GAATTTTTATTTTTAAGACATCTTTAAGGTATCTTTA 3 183 1 TTTTGGAATGTTTTTTGCATGCTTTAATTTTGCAAGG 38 159 1 TTTTTTTTTTTTTTGAAACCGCTTTAATTTTTGCCCT 10 80 0 TTTTAGGGGATTTAGTTGGGGTTTTTAGGGGAGAATG 13 49 0 AAGCCTTTTTTAAACTCACTTTTTAAGGGGTATTT 5 275 0 TTGACCTTGTTTTTATTAAAGATTTAAGGCTAGAATT 18 69 1 GGGCGGTAACTTTAAAGCGGTCTTTTAGGGGATTTAG 13 71 0 ATTATTTTGATTTTCTAAGCGTTTTTACAACAACACG 41 76 0 AATCCTTCAATTTATGGGGTTATTTTAGGGAATTTTA 18 13 1 CTTTCATTTATTTACCCCATCATTTTAGCATAAGCCT 7 151 0 TTTAACCCTTTTTAGACTACAATTTTAAGAAGTAAAA 10 31 0 AAAATCTTAATTTTACTATAAATTTTATAACAAATAA 17 15 0 TGAGACTAGGTTTAAATCTTTTTTAAACCTTTTTGTT 41 192 1 AAAAGCTTGATTTAATGAGTTTTTAAAACTTAATTGC 21 51 1 CAATTTAATTTTAATTTGAAACTTTAAGCTGATAAAA 7 25 1 TTATTGTTACTTATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTT 16 28 0 GTTATTCCTTGTTTTTAATTCAA 29 5 0 ACTGACAAGGTTTTTATAGCGTTTAAAAGCGCTAACG 41 116 1 CATGCTTTAATTTTGCAAGGGTTTAAAAAGGGGTTTT 38 176 1 AACACGGCTTTTTATGATTGGATTAAAAACGCTCAAA 25 41 1 TTTTCAAAAATTTACCATAAAATTAAATAAGTATGGT 25 94 0 GCATTATAAATTAAATTTGCGTTTTTAAAGGATAGGG 6 11 0 CCTTTATCCCTTATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGTG 20 12 1 TCTTTATTCTTTATGCCAAGTATTTAATTTCCCATTC 40 18 1 ATCAAAGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCAGCTTAAA 7 47 0 GACTATCCTTTAAAACAACTCTTTTATTTTACATGG 23 154 0 ATTTCTTCATTTATAATGTAGTTTTTATGCGAAAGGC 31 17 1 AATTTCAAATTTAATACGAATATTTTAGGAGATTTTT 33 43 1 TGTTAATGTTTTAAGGGCTTGATTTTAGCATTTTATT 3 222 0 CCTACCAACATTAAGGCATTGATTTTAGATT 14 114 1 TCTTTAAGTTTTTAGCCATAACTTATAAGGGTTTTAG 37 56 0 TGCTTTGAAATTGATCGCATTCTTTAATGAGAAGCGA 38 117 1 TTATTATTCTTTATATTTGGTCTTTTAGCATTACATG 5 153 1 GCATGTTTTGTTTAATTTTGCATTATAAATTAAATTT 6 30 0 ATCCTTAAATTTTAGACTTACATTATAGTATAATTTT 19 92 1 ATTTGTGAATTTGACTGATCTTTTTTATTGACAAAAC 22 86 1 TTGGGTGGTGTTTTTGCTTGAATTATACCTTGTTAGC 40 263 0 AAGGATTTTCTTGTTATCTTAATTTAAAGGTCAAAAC 36 11 0 AGTTATCCTTTAATTTAAAGAAATTCAAT 22 189 0 AACCATAGTTTTGTAAAAAGGCTTTTAGCATTTTTTA 23 73 1 GCATAAGTTTTTATCTTACCCCTTAAATCCCCTAAGA 15 42 0 TTTATTATTCTTAAGGATGTGTTTATA 19 146 1 CGCCATACTTTTAAACTTTATATTATAATAAGAGACA 14 71 1 GAGTGGGGTTTTAAACTCACCATTATAGCATTGTTAG 4 18 0 ATTAAAATCTTTGATTTAAAGTTTATAAGATTTTTGA 7 69 1 **** ****** MAP Score: 59.2922 Motif 3 CAACACTCTAAAGCCTTTAAACCAAAAACTA 40 233 0 CCCCTAAAAGACCGCTTTAAAGTTACCGCCC 13 77 1 GCAATAATCCTTTTAAAAGAAAAAATT 12 38 0 CTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAATTTC 36 142 1 ACTGACTAAAAGGGTTTTAAATA 10 247 1 TGAATGCGTTAGCGCTTTTAAACGCTATAAA 41 128 0 ATCCTTTTTAATCCTTTTTAAAATTAGGCAA 40 185 0 GAATTTTTGAATCCTTTTTAACATTCTTTTC 5 54 0 CAAACTTGAAACGCTTTTTAACAAAAAGGTT 41 217 0 TCATTAAATCAAGCTTTTTAACGAGTTTTTT 21 38 0 ACCCCCCATAACGCTTTTTAAAGCTTATCGC 22 33 0 CCCTCTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTAG 10 53 0 TGGACTATCCTTTTTAATTTAAATGCT 34 6 1 TTAAAAAATTAAGGTTTTTAAGTAGAAGGTA 36 99 1 AACAGAGTTAATCGTTTTTAAAGTTGTAAAA 3 255 1 GTTGCGTTTGAGCGTTTTTAATCCAATCATA 25 53 0 AATTGTGGAAATGGTTTTTAAAAAATTAAGG 36 82 1 GCGCTTAAATACCCCTTAAAAAGTGAGTTTA 5 269 1 GCTAAAATCAAGCCCTTAAAACATTAACAGA 3 230 1 GCGAACGGCTTAAAAGAATGAAAAT 11 4 1 TTAACAAAAAATCGCTTAAAAATTGAGAATA 28 18 0 GCCCTATCCTTTAAAAACGCAAATTT 6 5 1 GACTATCCTTTAAAACAACTCTTTT 23 165 0 TTTTTTTGAAACCGCTTTAATTTTTGCCCTC 10 79 0 TCAGTAAAATAGGGCTTTAATATGAAAGCAA 31 107 0 TAATTTTGCAAGGGTTTAAAAAGGGGTTTTG 38 183 1 TTTTAACAAAAAGGTTTAAAAAAGATTTAAA 41 202 0 CTAAAACTAAAACCCTTATAAGTTATGGCTA 37 50 1 AAATTTTATCAAGGTTTTAATA 11 31 1 ATCTCTAAAAATCGTTTTAATGGTTATAATC 19 64 1 ATTTTAGCATAAGCCTTTTATAAAAACTTTA 7 136 0 AAACGCATAAAAGCTTTTTATTTTAATCAAA 10 145 0 CCCTAAAATCATCGTTTTTATTTAATTGTAG 23 18 1 TGCCACTGACAAGGTTTTTATAGCGTTTAAA 41 112 1 AAAATGCTAAAAGCCTTTTTACAAAACTATG 23 76 0 CATGAAAACAAAGCCTTAAATTCCCATTAAT 3 135 1 TTTTTATCTTACCCCTTAAATCCCCTAAGAA 15 41 0 TTGTTCCTAAATGGCTTTTTAGAATGATTGG 22 137 0 GTTGAACAACACGGCTTTTTATGATTGGATT 25 34 1 AAGCCTTTTTTAAACTCACTTT 5 288 0 GCTTTTCGCAAGCCCTTTATTATTGGATTGT 13 108 1 CTTTTATCCTATGGTTTTATTTAATATGTTA 39 11 1 GCTCAAACGCAACCCTTTTTTCTACCATACT 25 71 1 TGTTTTTTGCATGCTTTAATTTTGCAAGGGT 38 167 1 AGTTATCCTTTAATTTAAAGAAATT 22 193 0 CAAGTATCCTTTATTTTTAAATTTAA 16 5 1 * ********* MAP Score: 58.3419 Motif 4 ATTTTATCTTTTGATTTGGTGT 5 1 1 AAGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCAGCTTA 7 49 0 TTGGGCTTCTTTTTAAGTTTTGCGTTTTTTG 0 58 1 CGCCTTTTGCTTTTACGCTTTCAATTGTTGC 34 62 0 TTTTAGTCTTTGTGGTATGCT 30 0 1 TTGGTGTTAGTTTTATTCTTTTTGGAAAGGA 5 25 1 ATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGTGTAACAT 20 24 1 TTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTAGACTACA 10 47 0 TTTAATCCTTTTTAATCCTTTTTAAAATTAG 40 189 0 TTAAATCTTTTTTAAACCTTTTTGTTAAAAA 41 203 1 GGTTGCGGATTTTAAAGTTTTGTCAATAAAA 22 108 0 CTCAATTAAGTTTAAAGTTTTTATAAAAGGC 7 124 1 ATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAAT 36 139 1 TACCCTATTCTTTAAGTTTTTAGCCATAACT 37 70 0 TCAAATTTTATTTTAACTTTAGAGTGGTTTT 16 68 0 TTAATGGGAATTTAAGGCTTTGTTTTCATGG 3 134 0 TGAGACTAGGTTTAAATCTTTTTTAAACCTT 41 192 1 TATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTTAAAAA 16 23 0 TGTTTTGAATTTTTATTTTTAAGACATCTTT 3 177 1 CTTATAAGGGTTTTAGTTTTAGCATGTTAGC 37 41 0 GCTTTTATCCTATGGTTTTATTT 39 2 1 GCGTTTATTTTACCCTATTCTTTAAGTT 37 83 0 GCGCCATACTTTTAAACTTTATATTATAATA 14 70 1 TATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTTACCAT 19 115 1 TTTAATCCTTAAAATGATAGT 6 85 0 TTTAGAGTGGTTTTAATTTATTGTTACTTAT 16 51 0 TTTAAGAATGCTTTAGCTTTTTGTACTTTTA 16 195 1 TTGAGCGCATTTTTATGCTATACTCAAAAAT 7 98 0 AAAAAGCTTATTTTACGCTATAATGCGATCT 14 38 0 AAATCTTTGATTTAAAGTTTATAAGATTTTT 7 73 1 CATAACGCTTTTTAAAGCTTATCGCTCAAAT 22 27 0 TTTGGTCAAATTTAATCTTATTTTTGTTATA 41 244 1 TTATCCCTGACTTTATTTTTTGATTTAGCCC 19 11 1 TTTGAAACCGCTTTAATTTTTGCCCTCTTTT 10 75 0 ATCTCATCTCTTTATTCTTTATGCCAAGTA 40 9 1 TTTGCTATAATTTTTTCTTTTAAAAGGATTA 12 30 1 ACCATACTTATTTAATTTTATGGTAAATTTT 25 94 1 CTTTTTGTACTTTTATCTTAATTGAAACAAC 16 211 1 CTCAAAGTGCTTTTTAGTTTTCAATATTCCA 3 106 1 GTTCTCTCTTTTTGTTTTTCT 1 2 0 AATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACCGCT 10 94 0 TTGAGAAAAGTTTTTGTTTTTAATGAAGCGT 13 177 0 ACTTAAAAACCTTAATTTTTTAAAAACCATT 36 91 0 GGACTATCCTTTTTAATTTAAATGCTTTGTT 34 11 1 CATAAAAGCTTTTTATTTTAATCAAACCTAA 10 140 0 AATTCTAGCCTTAAATCTTTAATAAAAACA 18 76 0 ATTTATTCCTTTTATTTGAATG 9 12 0 CAAGTATCCTTTATTTTTAAATTTAAACT 16 8 1 CGACACCAACCTTTAACCTATTAATCAAATA 13 217 1 CATACCTCAATTTAATTTTAATTTGAAACTT 7 18 1 CGCTCATTAGTTTTTGGTTTAAAGGCTTTAG 40 226 1 GGTTATAATCCTTAAATTTTAGACTTACATT 19 85 1 ATAGCATAAGTTTTTATCTTACCCCTTAAAT 15 51 0 CGCAAAGTCCCTTAATCTTATATAGTAAGCT 5 241 0 TCCCTTTATCCCTTATGCTCTTTAT 20 4 1 GATTTGATTTTTTATATTTTATAACAGAATG 31 175 0 AGTTATCCTTTAATTTAAAGAAATTCAA 22 190 0 TTTTAAGCGATTTTTTGTTAAGATAGAGCTA 28 28 1 AAAATCATCGTTTTTATTTAATTGTAGCAAA 23 22 1 TTAGGAACAACTTTTGCTTTATTTTGCATAG 22 158 1 TAAAACAACTCTTTTATTTTACATGGTGGGA 23 149 0 ***** ***** MAP Score: 49.5049 Motif 5 AAACGCAAATTTAATTTATAATGCAAAATTAAACAAAACA 6 24 1 AAAGCTTATTTTACGCTATAATGCGATCTTTATTAAATTA 14 27 0 TCTCCATTTCTTCATTTATAATGTAGTTTTTATGCGAAAG 31 12 1 TTGGGCGCTTTTGTTGTATAATTTCAAATTTAATACGAAT 33 24 1 TTAATCTTATTTTTGTTATAATCTTAGGTTGTTAAGTTTA 41 255 1 TTATTGTTACTTATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTTAAA 16 25 0 TTAAAGTTCGTTGGCGTATAATATCCATTTTGAATGAACT 10 210 1 TTAACATGCCTTATCTTATAATTTGACCTTGTTTTTATTA 18 47 1 TTTATTTGATTTTTGCTATAATTTTTTCTTTTAAAAGGAT 12 19 1 TAGACTTACATTATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTTACC 19 104 1 TATTGTTATTATCCTAAAATAGAGCGTTCCTTCAAAAA 34 109 0 ATCGCTCCCATTATGGTAAAATAAATACTTGCTTAAACAC 8 202 1 CACTCTAAAGTTAAAATAAAATTTGACTTTGTTAAAAAAA 16 73 1 GTTATAAAATTTATAGTAAAATTAAGATTTTATAATCAAA 17 21 1 ACAAAGTTTATTGGTATAAAAAAGTGAATTGATAAAAATA 40 60 0 TATTGGTAAATTCATTTAAAAAAAGGAGTTTAGAAT 25 153 1 AGATAAAAACTTATGCTATAATGCGGTTTCATTCCATATT 15 63 1 TTAAGCGAGTTTGCTCTATAATAAGACATCTTTAATAAGG 24 12 1 TGTGTTTGTCTCTTATTATAATATAAAGTTTAAAAGTATG 14 74 0 AATTAGCTTTTCTTGCTATAATCATCGTTTCACTTCTTTA 8 51 1 GCCAATCTCCCTAAAATCATCGTTTTTATTTAATT 23 5 1 GAGAAAAGTTTTTGTTTTTAATGAAGCGTTGGTGATAAAA 13 166 0 TATGGTTTCGTTTAGGTTTAATTAAAATTTGCTACAATTA 23 40 0 GACTATCCTTTTTAATTTAAATGCTTTGTTGTATAATTTT 34 12 1 AAAGCTAATTTTTCACTTAAATGATGCGTTTTTTCTATTA 8 21 0 GTGGAAATGGTTTTTAAAAAATTAAGGTTTTTAAGTAGAA 36 86 1 CCTAGTAAAATTACCTAAAAATTTCATGTTCAAGGATAGC 13 269 1 TAAATTTCCTTTTAATTAAAAAGAGGTTTCTAGTTGTTTC 16 234 0 TATCCAATAAGTTCAGTAAAATAGGGCTTTAATATGAAAG 31 110 0 ATTAGTTAGGTTTGATTAAAATAAAAAGCTTTTATGCGTT 10 135 1 ATTGTAGCAATTAAGTTTTAAAAACTCATTAAATCAAGCT 21 54 0 ** ****** ** MAP Score: 45.4289 Motif 6 TAGTAATAAAATGCTAAAATCAAGCCCTTA 3 218 1 TAAAAGGCTTATGCTAAAATGATGGGGTAA 7 147 1 ATAAAAACTTATGCTATAATGCGGTTTCAT 15 65 1 ATTGTTACTTATGCTATAATTTTAAGTTTA 16 33 0 GCCTCTAACAATGCTATAATGGTGAGTTTA 4 14 1 TAAACAAAACATGCTATAAAGAAAATTCAA 6 53 1 TATTGTTATTATCCTAAAATAGAGCGTTCC 34 117 0 TATTTGATTTTTGCTATAATTTTTTCTTTT 12 21 1 TGTTTTTTGCATGCTTTAATTTTGCAAGGG 38 167 1 TTAGCTTTTCTTGCTATAATCATCGTTTCA 8 53 1 AAGATAAGGCATGTTAAAATTCCCTAAAAT 18 34 0 CGCCCAAAACATGCTTAAAAA 33 1 0 TATTTCTTTCATCCTAAAAATATTTGAAAC 28 80 0 AAGGAAAAGAATGTTAAAAAGGATTCAAAA 5 51 1 ATAACATGTAATGCTAAAAGACCAAATATA 5 164 0 AATCTAAAAAATGCTAAAAGCCTTTTTACA 23 84 0 AATGGTTATAATCCTTAAATTTTAGACTTA 19 82 1 AGTTATCCTTTAATTTAAAGAAAT 22 194 0 TAAAACTTAATTGCTACAATTAAGGAAATT 21 74 1 TAATTAAAATTTGCTACAATTAAATAAAAA 23 32 0 AATCTTATTTTTGTTATAATCTTAGGTTGT 41 257 1 TTTTGAAAAATTGTTATAATTCCTACACTT 25 122 1 AACATGCCTTATCTTATAATTTGACCTTGT 18 49 1 TTTAATCCTTAAAATGATAGTATT 6 82 0 TTTATTTAATATGTTACAATACTTAAGCAT 39 26 1 GCCCTATCCTTTAAAAACGCAAATT 6 5 1 GACTATCCTTTAAAACAACTCTTT 23 166 0 AAATTTGACTTTGTTAAAAAAATTATGATA 16 91 1 TTAAACCTTTTTGTTAAAAAGCGTTTCAAG 41 214 1 GGGAGCGATAATGTTTAAAAACATGCAGAA 8 181 0 AAACTCGCACTTGTTATAAAAACATTAGCT 28 54 0 TGGCTTTATTTGTTATAAAATTTATAGTA 17 9 1 ATACTCAAAAATCTTATAAACTTTAAATCA 7 80 0 ATTTCAAAGCATGCTTAAAGTTGGAGCGAT 38 98 0 TGATTTTTACTTCTTAAAATTGTAGTCTAA 10 27 1 TAAAATCCTTCAATTTATGGGGTT 18 4 1 ACAAATTCCTTAAAAAGAGTGGTGG 37 5 1 GATTCGTAAGATCTTAAAAGAGGTA 35 65 1 AACTCTGTTAATGTTTTAAGGGCTTGATTT 3 234 0 AGGTTTCTAGTTGTTTCAATTAAGATAAAA 16 221 0 ATCGTTTCACTTCTTTAAAAGTGCTCGTAG 8 74 1 AAATAGAGCGTTCCTTCAAAAATGGTTGGT 34 101 0 CTATAATTTTTTCTTTTAAAAGGATTATTG 12 34 1 TTGTCTTGTTTTCTTTTAAAAT 21 2 0 AAAAGTTGTCATCTTTCAAAACTAGCTTGC 40 122 0 GGTTTTCCTTTAAGATTTGATTTT 31 195 0 AAAATTTTCATTCTTTTAAGCCGTTCGC 11 8 0 ********** MAP Score: 39.8614 Motif 7 TTTTAGGGCGTTTTTAACTTCTT 0 2 1 TTAAGCTCAGTAATGGGTTTTTGTTATTGGG 0 32 1 TATTCTAATAAGGAGTTAAGGGGTT 2 7 1 ATTAACAGAGTTAATCGTTTTTAAAGTTGTA 3 252 1 CGAGAATTTTTGAATCCTTTTTAACATTCTT 5 57 0 ACTCACTTTTTAAGGGGTATTTAAGCGCAAA 5 266 0 TCAATTAAGTTTAAAGTTTTTATAAAAGGCT 7 125 1 TCATTTTAGCATAAGCCTTTTATAAAAACTT 7 138 0 TTCACTTAAATGATGCGTTTTTTCTATTATA 8 19 0 TGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTT 10 55 0 GGGCAAAAATTAAAGCGGTTTCAAAAAAAAA 10 81 1 TTAAACGCATAAAAGCTTTTTATTTTAATCA 10 147 0 TTGGCGTATAATATCCATTTTGAATGAACTG 10 220 1 TGAACTGACTAAAAGGGTTTTAAATA 10 244 1 GCAATAATCCTTTTAAAAGAAAAA 12 41 0 GGGGATTTAGTTGGGGTTTTTAGGGGAGAAT 13 50 0 AAGCGGTCTTTTAGGGGATTTAGTTGGGGTT 13 63 0 AAAAATGCACAAAGGCATTTTTTACAATCCA 13 131 0 ATAGCGTAAAATAAGCTTTTTTGCGCCATAC 14 48 1 CGGTGCGTTCTTAGGGGATTTAAGGGGTAAG 15 34 1 ACTTATGCTATAATGCGGTTTCATTCCATAT 15 71 1 TTAAGAATGCTTTAGCTTTTTGTACTTTTAT 16 196 1 TGGGGTTATTTTAGGGAATTTTAACATGCCT 18 27 1 AATTATAAGATAAGGCATGTTAAAATTCCCT 18 39 0 ATTTTTTGATTTAGCCCTTTTCAAGCGTTCT 19 25 1 AAAATCTCTAAAAATCGTTTTAATGGTTATA 19 61 1 AAGATTTATCCATTTTGATGTTGTTA 20 69 0 AAAGTTTCTCTAAGCCTTATTGAAAATTTCC 21 97 0 ACCACCCCCCATAACGCTTTTTAAAGCTTAT 22 36 0 TCACAAATAAATAGGGGGTTTTGTAACACCA 22 63 0 AAAAATGCTAAAAGCCTTTTTACAAAACTAT 23 77 0 TTTTAAGCGAGTTTGCTCTATAAT 24 3 1 GGGTTGCGTTTGAGCGTTTTTAATCCAATCA 25 55 0 TTCATTTAAAAAAAGGAGTTTAGAAT 25 163 1 TTCTCAATTTTTAAGCGATTTTTTGTTAAGA 28 20 1 TTTTTATGCGAAAGGCATTTTTCACCTTGTT 31 38 1 GTTCAGTAAAATAGGGCTTTAATATGAAAGC 31 109 0 AAAATTGTGGAAATGGTTTTTAAAAAATTAA 36 80 1 TTTTAAAAAATTAAGGTTTTTAAGTAGAAGG 36 97 1 GTATAAGAGTTTATGCTATTTTTTTAAGGTT 36 127 1 TGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAATT 36 140 1 ACCACTCTTTTTAAGGAATTTGT 37 2 0 GCCATAACTTATAAGGGTTTTAGTTTTAGCA 37 48 0 GATTTCCTTATTTTGGTTTTTTGAATAGGCG 38 13 1 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