AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HY/HY_operons001_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944251650 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 rpsT 89 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 #1 prfA 118 PEPTIDE CHAIN RELEASE FACTOR 1 #2 hemB 21 DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE #3 jhp0151 25 putative histidine kinase sensor protein #4 jhp0152 300 putative TRANSCRIPTIONAL REGULATOR #5 prfB 60 PEPTIDE CHAIN RELEASE FACTOR 2 (RF-2) #6 jhp0160 300 putative #7 jhp0193 96 putative #8 flgI 185 FLAGELLAR P-RING PROTEIN #9 ilvC 248 KETOL-ACID REDUCTOISOMERASE #10 minD 24 cell division inhibitor #11 jhp0324 260 putative #12 fliF 43 FLAGELLAR M-RING PROTEIN #13 flgG_1 55 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN #14 kgtP 300 ALPHA-KETOGLUTARATE PERMEASE #15 flhA_rpsO 135 flhA: FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN, rpsO: 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 #16 jhp0385 55 putative #17 aroD 112 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE #18 rho_rpmE 264 rho: TRANSCRIPTION TERMINATION FACTOR, rpmE: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L31 #19 fliN 81 putative FLAGELLAR MOTOR SWITCH PROTEIN #20 fliP 96 FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN #21 jhp0699 163 putative #22 mobA 85 MOLYBDOPTERIN-GUANINE DINUCLEOTIDE BIOSYNTHESIS PROTEIN A #23 atpB 121 ATP synthase F0, subunit a #24 gatA 58 GLU-TRNA AMIDOTRANSFERASE, SUBUNIT A #25 speE 92 putative spermidine synthase #26 jhp0772 76 putative #27 flgE 208 FLAGELLAR HOOK PROTEIN #28 cdh 276 CDP-DIACYLGLYCEROL PYROPHOSPHATASE #29 jhp0842 180 putative #30 jhp0843 50 putative FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN #31 jhp0999 179 putative ZINC-METALLO PROTEASE #32 atpD 24 ATP synthase F1, subunit beta #33 atpA 22 ATP synthase F1, subunit alpha #34 atpX 104 ATP synthase B' #35 fmt 23 METHIONYL-TRNA FORMYLTRANSFERASE #36 jhp1070 34 putative #37 jhp1071 209 putative #38 rplS 21 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19. #39 rpsP 73 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 #40 valS 137 VALYL-TRNA SYNTHETASE #41 jhp1244 80 putative #42 fumC 174 FUMARASE #43 jhp1318 101 putative #44 flgB 204 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN #45 ribC 74 RIBOFLAVIN SYNTHASE ALPHA CHAIN #46 ydiE 300 putative O-SIALOGLYCOPROTEIN ENDOPEPTIDASE #47 flgG_2 300 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN (DISTAL ROD PROTEIN) Motif 1 TGCTAAAATCAAGCCCTTAAAACATTAACAGA 4 229 1 ATTTGATTTTAAAACCTTAAAAAAATAGCATA 42 138 0 ACAAATTCCTTAAAAAGAGTGGTGG 43 3 1 AGAAGTTAAAAACGCCCTAAAA 1 0 0 ACCCCAACTAAATCCCCTAAAAGACCGCTTTA 14 64 1 CATGATTTAAAATCCCCTAAAAGCGATAGAAA 16 10 0 GGCATGTTAAAATTCCCTAAAATAACCCCATA 20 25 0 CTTAACAAAAAATCGCTTAAAAATTGAGAATA 34 18 0 GCGAACGGCTTAAAAGAATGAAAAT 12 3 1 TTTTATTGACAAAACTTTAAAATCCGCAACCA 27 108 1 AAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAAGAGGGCAAAA 11 57 1 ATCGTTAAAAAACTCGTTAAAAAGCTTGATTT 23 32 1 AAAACAAGACAAATCGTTAAAAAACTCGTTAA 23 20 1 TGCGCTTAAATACCCCTTAAAAAGTGAGTTTA 6 268 1 TTTAATCCTTAAAATGATAGTATT 7 82 0 TTCTTTACAAAAATCTCTAAAAATCGTTTTAA 21 52 1 TTAATTTTGCAAGGGTTTAAAAAGGGGTTTTG 44 182 1 TTTTTAACAAAAAGGTTTAAAAAAGATTTAAA 47 202 0 ATTGATTAAAAATAGTTTAAAAGGTATTTTAT 0 14 0 AGAGATTCGTAAGATCTTAAAAGAGGTA 41 62 1 GATAAGTATCAACCCCTTAAGATCGCTTTTTA 28 80 1 ATACCCCTAAAATACCTTAAGAGAACGCCTAT 44 37 0 CCCCCTTTTAACCCCCCTAAAATAAGAAATTG 4 36 1 TATAGAGCAAACTCGCTTAAAA 30 0 0 AGCGCCCAAAACATGCTTAAAAA 39 1 0 TTAAGCTGATAAAAGGCTAAAATTAAAATCTT 8 48 1 TACAAAAATCTCCTAAAATATTCGTATT 39 55 0 TTACCCCTTAAATCCCCTAAGAACGCACCGCA 17 32 0 ATTTGAGCGATAAGCTTTAAAAAGCGTTATGG 27 27 1 GACTATCCTTTAAAACAACTCTTTT 29 165 0 GCCCTATCCTTTAAAAACGCAAATTT 7 4 1 TCATCGTTTCACTTCTTTAAAAGTGCTCGTAG 9 72 1 AATGATTTTTACAACTTTAAAAACGATTAACT 4 260 0 ACTAACTACAAAAAACTTAAAAAGCGATCTTA 28 97 0 TAAAAACCTTAATTTTTTAAAAACCATTTCCA 42 87 0 TGATTACACTAATTCTTTAAGAATGCTTTAGC 18 180 1 GTGCGAGATGAATCCCTGAAAAAGCCACTCAT 41 25 1 TATTATAATATAAAGTTTAAAAGTATGGCGCA 15 69 0 ATGGGAGCGATAATGTTTAAAAACATGCAGAA 9 181 0 AAGGTTTTTATAGCGTTTAAAAGCGCTAACGC 47 122 1 CTCCTAGTAAAATTACCTAAAAATTTCATGTT 14 267 1 AATGGTAACTAATAACCTAAAATTATACTATA 21 115 0 TTTTCTACAATAGTGGTTAAAATCTTTAATCA 28 203 0 CTTTGATTTTTACTTCTTAAAATTGTAGTCTA 11 24 1 AAAGGATTAAAAAGGATTAAAAAATAGCGCTC 46 199 1 TTACATTACAAAGGGATTAAAACAAGGCT 0 70 1 TATAAACACATCCTTAAGAATAATAAAAT 21 144 0 GCTGAATGCTAACATGCTAAAACTAAAACCCT 43 34 1 TCAAATCTAAAAAATGCTAAAAGCCTTTTTAC 29 85 0 CTTTAGTAATAAAATGCTAAAATCAAGCCCTT 4 215 1 TTGAAATCATTCTCCCCTAAAAACCCCAACTA 14 42 1 AAACGTTACTAATAAGTTAAAATTCGTGAAAA 28 162 1 ATTTTGAATGAACTGACTAAAAGGGTTTTAAA 11 236 1 TTTTGTAAAGAACGCTTGAAAAGGGCTAAATC 21 32 0 TTAAGGATTATAACCATTAAAACGATTTTTAG 21 68 0 TTGTAGCAATTAAGTTTTAAAAACTCATTAAA 23 61 0 ** ******** MAP Score: 72.7523 Motif 2 TTTTAAACTATTTTTAATCAATTTTTAGATAGAATTA 0 24 1 AAATCAAGCTTTTTAACGAGTTTTTTAACGATTTGTC 23 27 0 GCATCGAGAATTTTTGAATCCTTTTTAACATTCTTTT 6 55 0 ATGAGCGCTATTTTTTAATCCTTTTTAATCCTTTTTA 46 196 0 ATTATTTTGATTTTCTAAGCGTTTTTACAACAACACG 47 76 0 AGCATAAGCCTTTTATAAAAACTTTAAACTTAATTGA 8 125 0 GAATTTTTATTTTTAAGACATCTTTAAGGTATCTTTA 4 183 1 TTTTTTTTTTTTTTGAAACCGCTTTAATTTTTGCCCT 11 80 0 TTTTGGAATGTTTTTTGCATGCTTTAATTTTGCAAGG 44 159 1 TTTTAGGGCGTTTTTAACTTCTTTAAG 1 0 1 ACCGCTTTAATTTTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAA 11 63 0 GTTTATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAATTT 42 135 1 AGAATGAAAATTTTATCAAGGTTTTAATA 12 24 1 AATGGTTGGTTTTTGGAACGCCTTTTGCTTTTACGCT 40 74 0 CGTTATAAAATACCTTTTAAACTATTTTT 0 2 1 TTATTATTCTTTATATTTGGTCTTTTAGCATTACATG 6 153 1 TATTCTCAATTTTTAAGCGATTTTTTGTTAAGATAGA 34 18 1 GGTTTAAATCTTTTTTAAACCTTTTTGTTAAAAAGCG 47 200 1 ATCTTAGTTTTTATTTGATTTTTGCTATAATTTT 13 7 1 GGGCGGTAACTTTAAAGCGGTCTTTTAGGGGATTTAG 14 71 0 ATTTCTTCATTTATAATGTAGTTTTTATGCGAAAGGC 37 17 1 CAAAGTCAAATTTTATTTTAACTTTAGAGTGGTTTTA 18 67 0 AAGCCTTTTTTAAACTCACTTTTTAAGGGGTATTT 6 275 0 TTTTAGGGGATTTAGTTGGGGTTTTTAGGGGAGAATG 14 49 0 CTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTAGACTACAATTT 11 43 0 GCGTTTATTTTACCCTATTCTTTAAGTTTTTAGCC 43 76 0 TTATTGTTACTTATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTT 18 28 0 GTTATTCCTTGTTTTTAATTCAA 35 5 0 AAAATCTTAATTTTACTATAAATTTTATAACAAATAA 19 15 0 GTCTTAAAACTTTTAAGAGCAATTTTAAAGTTCGTTG 11 186 1 TTGACCTTGTTTTTATTAAAGATTTAAGGCTAGAATT 20 69 1 TGTCGCTTGCTTATGCAGGCTCTTTTGATGGTAAAAA 4 66 1 TAAAAAGCCATTTAGGAACAACTTTTGCTTTATTTTG 27 147 1 CCCTTATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGTGTAACATG 22 19 1 ATCAAAGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCAGCTTAAA 8 47 0 GACTATCCTTTAAAACAACTCTTTTATTTTACATGG 29 154 0 ATAAAGCGTTTTATAACCTTGCTTTAGGTAATATCAT 28 40 0 CTTATTTAATTTTATGGTAAATTTTTGAAAAATTGTT 31 100 1 GCATTATAAATTAAATTTGCGTTTTTAAAGGATAGGG 7 11 0 ATCCTTCAATTTATGGGGTTATTTTAGGGAATTTTAA 20 14 1 TAGACTTACATTATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTT 21 104 1 CAATTTAATTTTAATTTGAAACTTTAAGCTGATAAAA 8 25 1 TTTCTATCGCTTTTAGGGGATTTTAAATCATGGCGA 16 9 1 TATCAACCCCTTAAGATCGCTTTTTAAGTTTTTTGTA 28 86 1 CTTTCATTTATTTACCCCATCATTTTAGCATAAGCCT 8 151 0 TCTTTATTCTTTATGCCAAGTATTTAATTTCCCATTC 46 18 1 CTTTTTTATCGCTTCAATTTAATCAAAATTAG 26 5 1 CAAGTATCCTTTATTTTTAAATTTAAACTTAAAATT 18 9 1 AATAAGCTTTTTTGCGCCATACTTTTAAACTTTATAT 15 57 1 CTCCTTGTTTTTTGGTGGGAATTTTTACAAACCCTCT 28 241 0 ATCATTCATCTTAAGGAACTCTTTTTGCTTGACTCCC 29 116 1 CTTCGTTATGCTATCATAATTTTTTTAACAAAGTCAA 18 95 0 TACACTAATTCTTTAAGAATGCTTTAGCTTTTTGTAC 18 184 1 TGTAAAAAGGCTTTTAGCATTTTTTAGATTTGATCAT 29 84 1 TAAAAAATGCCTTTGTGCATTTTTTAGATTTTATCAC 14 138 1 TGTTAATGTTTTAAGGGCTTGATTTTAGCATTTTATT 4 222 0 CCTACCAACATTAAGGCATTGATTTTAGATT 15 114 1 AATTTCAAATTTAATACGAATATTTTAGGAGATTTTT 39 43 1 GGCGTTTATTACGACAATTTAGATTTTTTTGG 25 5 1 TTTTTAAAGCTTATCGCTCAAATTTAGAGTTTAACTC 27 13 0 ATAACATTCCTTAGCTTGCTTTTTAACAATATCCAT 25 66 0 TATCCCTGACTTTATTTTTTGATTTAGCCCTTTTCAA 21 12 1 GTCTTTATCTTTGGGTGGTGTTTTTGCTTGAATTAT 46 274 0 TTAGTAACGTTTAGTAACCTATTTTTAAAAAAGGGCT 28 137 0 GCATGTGCCACTTATTAGCATCTTTTGATTACACTAA 18 155 1 TGGGATTTCCTTATTTTGGTTTTTTGAATAGGCGTT 44 9 1 ATTCTAAACTCCTTTTTTTAAATGAATTTA 31 159 0 ATTTAAATGCTTTGTTGTATAATTTTGAAAAAATACG 40 26 1 TTTGACCAAACTTGAAACGCTTTTTAACAAAAAGGTT 47 217 0 ATTGAAACAACTAGAAACCTCTTTTTAATTAAAAGGA 18 231 1 **** ****** MAP Score: 71.5557 Motif 3 CTAAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAAGAGGG 11 53 1 AACCTTTTTGTTAAAAAGCGTTTCAAGTTTG 47 217 1 AAAAAACTCGTTAAAAAGCTTGATTTAATGA 23 38 1 GCGATAAGCTTTAAAAAGCGTTATGGGGGGT 27 33 1 CATAGTTTTGTAAAAAGGCTTTTAGCATTTT 29 76 1 TTTATAGCGTTTAAAAGCGCTAACGCATTCA 47 128 1 GAAAAGAATGTTAAAAAGGATTCAAAAATTC 6 54 1 AGCATTTAAATTAAAAAGGATAGTCCA 40 6 0 TTGCCTAATTTTAAAAAGGATTAAAAAGGAT 46 185 1 CCTTAATTTTTTAAAAACCATTTCCACAATT 42 82 0 TACCTTCTACTTAAAAACCTTAATTTTTTAA 42 99 0 TGCAAGGGTTTAAAAAGGGGTTTTG 44 189 1 AATCCAATCATAAAAAGCCGTGTTGTTCAAC 31 34 0 CCAATCATTCTAAAAAGCCATTTAGGAACAA 27 137 1 TTTTACAACTTTAAAAACGATTAACTCTGTT 4 255 0 TATGATTGGATTAAAAACGCTCAAACGCAAC 31 53 1 ACAAAAAACTTAAAAAGCGATCTTAAGGGGT 28 91 0 AAAGTGAGTTTAAAAAAGGCTT 6 288 1 AATGAACTGACTAAAAGGGTTTTAAATA 11 242 1 TAAAGTTTTTATAAAAGGCTTATGCTAAAAT 8 136 1 ATTTTTTCTTTTAAAAGGATTATTGC 13 39 1 TTAAAATCCCCTAAAAGCGATAGAAA 16 5 0 AGTTAGTATTCAAAAAGCCCTTTTTTAAAAA 28 122 1 AAGTATGGCGCAAAAAAGCTTATTTTACGCT 15 50 0 TTTGATTAAAATAAAAAGCTTTTATGCGTTT 11 145 1 ACAAATTCCTTAAAAAGAGTGGTGGCTGAA 43 9 1 CGTGTTGTTGTAAAAACGCTTAGAAAATCAA 47 76 1 TAAAAAGGATTAAAAAGGATTAAAAAATAGC 46 196 1 TTTAAACGCTATAAAAACCTTGTCAGTGGCA 47 112 0 AGTATGGTAGAAAAAAGGGTTGCGTTTGAGC 31 71 0 TATTGAAAACTAAAAAGCACTTTGAGTGTTT 4 101 0 TAGTTTTTGGTTTAAAGGCTTTAGAGTGTTG 46 233 1 CAAAAAGGTTTAAAAAAGATTTAAACCTAGT 47 196 0 CTACAATTAAATAAAAACGATGATTTTAGGG 29 18 0 CTTTTGATGGTAAAAAACACTCAAAGTGCTT 4 87 1 GGGCGGTAACTTTAAAGCGGTCTTTTAGGGG 14 77 0 CATGCTAAAACTAAAACCCTTATAAGTTATG 43 46 1 GAAATTTGATTTTAAAACCTTAAAAAAATAG 42 142 0 AAGCAAGGTTATAAAACGCTTTATTTTGATA 28 53 1 ATTATAACCATTAAAACGATTTTTAGAGATT 21 63 0 ATCATTCAAATAAAAGGAATAAAT 10 9 1 AGCCCAATAACAAAAACCCATTACTGAGCTT 1 34 0 TAACAATAAATTAAAACCACTCTAAAGTTAA 18 56 1 ATTATAATAGAAAAAACGCATCATTTAAGTG 9 17 1 AATTCATTTAAAAAAAGGAGTTTAGAAT 31 161 1 TTAAAGCATGCAAAAAACATTCCAAAATCAG 44 155 0 CGCACTTGTTATAAAAACATTAGCTCTATCT 34 48 0 GACAATGAAGTTTAAACGCATAAAAGCTTTT 11 158 0 TTGCTTTCATATTAAAGCCCTATTTTACTGA 37 107 1 AAAAAAAAAAAAAAAAACAATTTCAGTTTCT 11 103 1 GAGGGCAAAAATTAAAGCGGTTTCAAAAAAA 11 79 1 TATTAAAACCTTGATAAAATTT 12 31 0 ACAATCCAATAATAAAGGGCTTGCGAAAAGC 14 108 0 TAACATATTAAATAAAACCATAGGATAAAAG 45 11 0 ATGCAGAAACCTTAAACGCCTTTAGCGCTTG 47 162 0 GCGAACGGCTTAAAAGAATGAAAATTTTA 12 8 1 AAATCAAGCCCTTAAAACATTAACAGAGTTA 4 234 1 ********* * MAP Score: 55.7822 Motif 4 TGCGCCATACTTTTAAACTTTATATTATAAT 15 69 1 TAAGATCGCTTTTTAAGTTTTTTGTAGTTAG 28 97 1 TTGGGCTTCTTTTTAAGTTTTGCGTTTTTTG 1 58 1 TTTTAGTCTTTGTGGTATGCT 36 0 1 AAGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCAGCTTA 8 49 0 TTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTT 11 57 0 TTAAATCTTTTTTAAACCTTTTTGTTAAAAA 47 203 1 TGAGACTAGGTTTAAATCTTTTTTAAACCTT 47 192 1 TTGGTGTTAGTTTTATTCTTTTTGGAAAGGA 6 25 1 TTTGTGCATTTTTTAGATTTTATCACCAACG 14 149 1 CTCAATTAAGTTTAAAGTTTTTATAAAAGGC 8 124 1 GGTTGCGGATTTTAAAGTTTTGTCAATAAAA 27 108 0 ATAAAATACCTTTTAAACTATTTTTAATCAA 0 14 1 TTTGAAACCGCTTTAATTTTTGCCCTCTTTT 11 75 0 TTACCCTATTCTTTAAGTTTTTAGCCATAAC 43 71 0 ATTTTATCTTTTGATTTGGTGT 6 1 1 AGATTTGATTTTTTATATTTTATAACAGAAT 37 176 0 TTAATGGGAATTTAAGGCTTTGTTTTCATGG 4 134 0 TATCCTTTATTTTTAAATTTAAACTTAAAAT 18 14 1 TCAAATTTTATTTTAACTTTAGAGTGGTTTT 18 68 0 ACTTCATTGTCTTAAAACTTTTAAGAGCAAT 11 178 1 AATTCTAGCCTTAAATCTTTAATAAAAACA 20 76 0 AATCCTTAAATTTTAGACTTACATTATAGTA 21 91 1 TTTTCACGAATTTTAACTTATTAGTAACGTT 28 163 0 TTTAGAGTGGTTTTAATTTATTGTTACTTAT 18 51 0 AGCGCTATTTTTTAATCCTTTTTAATCCTTT 46 199 0 TTAATGAGTTTTTAAAACTTAATTGCTACAA 23 62 1 ATTATAGTTATTTAAAGCTTAAATAAGGGTC 26 50 1 CATAACGCTTTTTAAAGCTTATCGCTCAAAT 27 27 0 ATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGTGTAACAT 22 24 1 ATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAAT 42 139 1 ATCTCATCTCTTTATTCTTTATGCCAAGTA 46 9 1 TTTAAGAATGCTTTAGCTTTTTGTACTTTTA 18 195 1 CTTATAAGGGTTTTAGTTTTAGCATGTTAGC 43 41 0 CGACACCAACCTTTAACCTATTAATCAAATA 14 217 1 AAATCTTTGATTTAAAGTTTATAAGATTTTT 8 73 1 GCTTTTATCCTATGGTTTTATTT 45 2 1 TTGAGCGCATTTTTATGCTATACTCAAAAAT 8 98 0 TTATCCCTGACTTTATTTTTTGATTTAGCCC 21 11 1 TATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTTACCAT 21 115 1 TGTTTTGAATTTTTATTTTTAAGACATCTTT 4 177 1 GGACTATCCTTTTTAATTTAAATGCTTTGTT 40 11 1 TTTAATCCTTAAAATGATAGT 7 85 0 ACTTAAAAACCTTAATTTTTTAAAAACCATT 42 91 0 TAAATTTAAACTTAAAATTATAGCATAAGTA 18 27 1 ACCATACTTATTTAATTTTATGGTAAATTTT 31 94 1 TTTGGTCAAATTTAATCTTATTTTTGTTATA 47 244 1 CGTTTTGACCTTTAAATTAAGATAACAAGA 42 9 1 AGTTATCCTTTAATTTAAAGAAATTCAA 27 190 0 CATAAAAGCTTTTTATTTTAATCAAACCTAA 11 140 0 CTTTTTGTACTTTTATCTTAATTGAAACAAC 18 211 1 CGCAAAGTCCCTTAATCTTATATAGTAAGCT 6 241 0 CATACCTCAATTTAATTTTAATTTGAAACTT 8 18 1 ****** **** MAP Score: 50.5638 Motif 5 CAAGTATCCTTTATTTTTAAATTTAAACTT 18 8 1 AGAGTTTATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAA 42 132 1 AATTCAAATACTATCATTTTAAGGATTAAA 7 76 1 GTTACTTATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTT 18 28 0 GCATAAAAGCTTTTTATTTTAATCAAACCTAA 11 140 0 TTGCTATAATTTTTTCTTTTAAAAGGATTATT 13 31 1 TGAGAAAAGTTTTTGTTTTTAATGAAGCGTTG 14 175 0 TGTTTTGAATTTTTATTTTTAAGACATCTTTA 4 177 1 GTTATTCCTTGTTTTTAATTCAA 35 5 0 AGTTATCCTTTAATTTAAAGAAATTCAAT 27 189 0 AAATTAAAATCTTTGATTTAAAGTTTATAAGA 8 67 1 CTTTTTTGCGCCATACTTTTAAACTTTATATT 15 63 1 CTTATAAGGGTTTTAGTTTTAGCATGTTAGCA 43 40 0 AAATCAAAGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCA 8 54 0 GACTATCCTTTAAAACAACTCTTT 29 166 0 GCCCTATCCTTTAAAAACGCAAATT 7 3 1 GGACTATCCTTTTTAATTTAAATGCTTTGTTG 40 11 1 GCTCATTAGTTTTTGGTTTAAAGGCTTTAGAG 46 227 1 ATTTGTCTTGTTTTCTTTTAAAAT 23 2 0 ATTCTAAACTCCTTTTTTTAAATGAATTTACC 31 157 0 GATAAAATTTTCATTCTTTTAAGCCGTTCGC 12 9 0 TTTATTTACCCCATCATTTTAGCATAAGCCTT 8 150 0 TTATTTTACCCTATTCTTTAAGTTTTTAGCCA 43 75 0 CACAAAATCGCCATGATTTAAAATCCCCTAAA 16 21 0 GGTTTTCCTTTAAGATTTGATTTT 37 195 0 TTTCTTGTTATCTTAATTTAAAGGTCAAAACG 42 10 0 GTTTTTTCTATTATAATTTAAGGC 9 2 0 TATTGCGTTCCTTTGATTTTTACTTCTTAAAA 11 14 1 TCCCTTATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGTGT 22 18 1 TTTGAAACCGCTTTAATTTTTGCCCTCTTTTA 11 74 0 TTATCCCTGACTTTATTTTTTGATTTAGCCCT 21 11 1 ATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAACCGCTTT 11 92 0 ATCTTAGTTTTTATTTGATTTTT 13 1 1 CTTTTTTGCTCCTTGTTTTTTGGTGGGAATTT 28 254 0 GGTTATAATCCTTAAATTTTAGACTTACATTA 21 85 1 GGTGTTAGTTTTATTCTTTTTGGAAAGGAAAA 6 27 1 CTCCCTAAAATCATCGTTTTTATTTAATTGTA 29 16 1 ACCAGGGTTATTATTCTTTATATTTGGTCTTT 6 146 1 ATTTGATTTTTTATATTTTATAACAGAATGGG 37 173 0 CTTAAAAACCTTAATTTTTTAAAAACCATTTC 42 89 0 ATTAACTCTGTTAATGTTTTAAGGGCTTGATT 4 235 0 GATCTCCATTTCTTCATTTATAATGTAGTTTT 37 10 1 CGTTTAGTAACCTATTTTTAAAAAAGGGCTTT 28 135 0 AAACAAATTGCCTAATTTTAAAAAGGATTAAA 46 178 1 TCTCATCTCTTTATTCTTTATGCCAAGTATTT 46 11 1 GAAAATTTTATCAAGGTTTTAATA 12 29 1 AGACCCTTATTTAAGCTTTAAATAACTATAAT 26 50 0 ATTGTAGCAATTAAGTTTTAAAAACTCATTAA 23 62 0 TAAGATAGAGCTAATGTTTTTATAACAAGTGC 34 46 1 TTAGATATTCTCAATTTTTAAGCGATTTTTTG 34 13 1 TCAATTAAGTTTAAAGTTTTTATAAAAGGCTT 8 125 1 TTAAGAATGCTTTAGCTTTTTGTACTTTTATC 18 196 1 ACTCATTAAATCAAGCTTTTTAACGAGTTTTT 23 39 0 AGATCGCTTTTTAAGTTTTTTGTAGTTAGTAT 28 99 1 TAAACTACCATTAAATTTTTTGTAAGGCTAAA 24 33 1 ACCATACTTATTTAATTTTATGGTAAATTTTT 31 94 1 **** ****** MAP Score: 40.6936 Motif 6 CGTTATAAAATACCTTTTAAACTATTTT 0 6 1 AGCCTTGTTTTAATCCCTTTGTAATGTAAA 0 69 0 TTTTAACTTCTTTAAGCTCAGTAATGGGTTTT 1 21 1 TTCCATGAAAACAAAGCCTTAAATTCCCATTA 4 132 1 TTTAATCCTTAAAATGATAGTA 7 84 0 TTTAAGCTGATAAAAGGCTAAAATTAAAATCT 8 47 1 AGGCTAAAATTAAAATCTTTGATTTAAAGTTT 8 61 1 TCAAAAATCTTATAAACTTTAAATCAAAGATT 8 74 0 TTATAAAAACTTTAAACTTAATTGAGCGCATT 8 118 0 AAAGTTTTTATAAAAGGCTTATGCTAAAATGA 8 137 1 TTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTAGACTACAA 11 46 0 TGATTAAAATAAAAAGCTTTTATGCGTTTAAA 11 147 1 CTTCATTGTCTTAAAACTTTTAAGAGCAATTT 11 179 1 TATTTAAAACCCTTTTAGTCAGTTC 11 245 0 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