AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HY/HY_operons004_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944251854 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 jhp0303 71 putative #1 jhp0305 141 putative #2 jhp0449 231 putative transporter #3 dnaN 57 DNA POLYMERASE III, BETA CHAIN #4 jhp0462 137 putative #5 rplI 62 50S RIBOSOMAL PROTEIN L9 #6 folD 85 METHYLENETETRAHYDROFOLATE DEHYDROGENASE/METHENYLTETRAHYDROFOLATE CYCLOHYDROLASE #7 fliN 81 putative FLAGELLAR MOTOR SWITCH PROTEIN #8 jhp0599 298 putative #9 jhp0600 82 putative Outer membrane protein #10 feoB 120 FERROUS IRON TRANSPORT PROTEIN B #11 jhp0639 264 putative #12 jhp0773 76 putative #13 jhp0774 140 DNA-BINDING PROTEIN HU #14 ksgA 252 DIMETHYLADENOSINE TRANSFERASE #15 ppiA 123 PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE #16 rpmH 71 50S RIBOSOMAL PROTEIN L34 #17 jhp1383 129 putative #18 jhp1384 140 putative PHOSPHATE PERMEASE #19 dnaA 152 CHROMOSOMAL REPLICATION INITIATOR PROTEIN #20 dniR 83 putative REGULATORY PROTEIN #21 jhp1481 74 putative Motif 1 TATTTTTTAAAAAAGCTATAATTCAAACAAAA 0 21 1 AATTTTCTTAAAATTATACAATATGTAACTTA 2 34 1 AAGCGTTCTTTTATGCTATAATTAAGACCAAA 3 12 1 TTTACCCCATAAATGCTATAATCACCCCTATC 4 45 0 AAACCCAACTTGTTAAAATAAAGAGTATA 5 7 1 AACGCATGATTTTTGCTACAATAATAGGATTT 6 40 1 AGTAAAATTAAGATTTTATAATCAAAGTCAAA 7 35 1 TCATTATCATTTATGCTATAATTATGGGACAA 8 35 0 GAGTATGAAAATTTTTTAAAATTTACAAAAAT 8 79 1 AAATAGATTTTTATGATAAAATCTAAGCTTTA 8 138 0 AAAGGGGATATTTTTATATAATATATAAAAAG 8 217 1 TTAAATCTAAAAATGCTACAATGTTTATCTTT 8 254 1 TTTAAGAATGATTAGTTATAATATCGCTACTA 9 24 1 CTAACAACACTCAAGCTAAAATCCATTAAGGA 9 53 1 AATAATCATTGAATGCTAAAATAATATTTTTG 11 133 0 TTAAGCGCGATTATGCTACAATTAGGGACATT 11 220 1 GGCTAGGATTTCATTCTATAATGCAAAATCTA 14 47 1 TTTGAATGAAAAAAGCTATAATAAAGAAGTTG 14 165 1 TGTTTTAATTTATTGCTATAATAGAGCATTTG 15 71 1 TTTAGCATTCTTTAGCTAAAATCTACTCTTAT 16 22 1 GCTTAATCTTTTATGTTAAAATTCTAGGATTT 17 40 1 AAATATAAAATAAAGATAAAATCCTAGAATTT 17 58 0 TTAAAAACCTTATTTTTAAAATTTTACTTTAA 18 12 1 CACCACTTATTCACGCTATAATAACGCC 19 134 1 GTTATTCAAGTTTAGTTATAATCAAGGCCATT 20 32 1 ATTATTTTCCTTATGTTAGAATGCTTAAGTAT 21 18 1 GTTTTATTTAATATGTTACAATACTTAAGCAT 21 38 0 * ****** *** MAP Score: 43.1274 Motif 2 AATAATGAAATTTTCTTAAAATTATACAATATGTA 2 26 1 AACGCATGATTTTTGCTACAATAATAGGATTTTAA 6 40 1 ATTATTTTCCTTATGTTAGAATGCTTAAGTATTGT 21 18 1 TCATTATCATTTATGCTATAATTATGGGACAACTT 8 32 0 GCTTAATCTTTTATGTTAAAATTCTAGGATTTTAT 17 40 1 ATTGGTTGGTTTTTGTTTGAATTATAGCTTTTTTA 0 28 0 GAAAGTGGGTTTTTTCTTAAATCTTAAGATCTTTA 2 114 1 AAAATCTTAATTTTACTATAAATTTTATAACAAAT 7 17 0 AGCTTAGATTTTATCATAAAAATCTATTTAATGAG 8 141 1 GATTTTATCTTTATTTTATATTTATCGTTAGGTTT 17 67 1 GAAAAAGCGTTTTTGCTTGATTTATCTTTAGGATT 13 33 1 ATACCAATTGTTTTAATTTATTGCTATAATAGAGC 15 63 1 ATTATAGCTTTTTTCATTCAAAGATGTTGGTAGTT 14 152 0 AAAGGGGATATTTTTATATAATATATAAAAAGCAT 8 217 1 TTTTTAAATCTTTTATTATAATCAAAAATCCACTT 1 58 0 TTTAAAAACCTTATTTTTAAAATTTTACTTTAAGA 18 11 1 AAATCTACTCTTATGTTTAATTTTTATCAAGGGAG 16 40 1 AAGCGTTCTTTTATGCTATAATTAAGACCAAAAAT 3 12 1 CTTTTAAGGGTTTGTCTATAATGCTTGCTTTATAA 19 40 0 GCCAACCCCTTTTTTGTACATAATTCTCATTAAAT 8 166 0 TGTAATCTAATTTTGATTAAATTGAAGCGATAAAA 12 48 1 TTAATCAAAATTAGATTACAATATTATAGTTATTT 12 33 0 TATCCTATGGTTTTATTTAATATGTTACAATACTT 21 44 0 ATTAAAATCTTTTTCGTTAATAATTGGTTAGATTT 14 72 0 TTCTTTCTCATTTTTGTAAATTTTAAAAAATTTTC 8 85 0 AAATATTATTTTAGCATTCAATGATTATTGCACGA 11 136 1 CAAATGATCCTTATTTTAAATTACACTCTATGATA 1 10 1 TGAGCGGTAATTATAATCAAATCCTAAAGATAAAT 13 52 0 AACCTATCAATTATTTTTTAAAAAAGCTATAATTC 0 10 1 GCTACAATGTTTATCTTTAAAACGAAAGGGCAATT 8 268 1 CTTGTCTCGCTTTTATTATATAACAATTAGTCTTA 10 19 1 TTTTAGTCAATTTTTAGCATTCTTT 16 0 1 GTGTTAAAAATTAGTATTAAAATCTTTTTCGTTAA 14 87 0 TTTTTTAATTTTTGGTTATATAGTTTTTAAAAGTT 10 69 0 **** ** *** * MAP Score: 39.2133 Motif 3 TTTGTTTGAATTATAGCTTTTTTAAAAAATAATTG 0 17 0 CTATCCATTTTTATCGCTTTTTTTAAATCTTTTAT 1 77 0 TTGGTCTTAATTATAGCATAAAAGAACGCTTTT 3 8 0 ATAGGGGTGATTATAGCATTTATGGGGTAAAAAAG 4 46 1 AAACGCATGATTTTTGCTACAATAATAGGATTTTA 6 39 1 TGTCCCATAATTATAGCATAAATGATAATGAAAAA 8 36 1 AAGATAAACATTGTAGCATTTTTAGATTTAAGAAT 8 250 0 TAATTTTTAGCGTTTTTAAGAATGATTAG 9 4 1 AAAAATATTATTTTAGCATTCAATGATTATTGCAC 11 134 1 GGGGACTCATTTAAAGCGTTCTTTTAATTTTAAGC 11 191 1 TTATAGTTATTTAAAGCTTAAATAAGGGTCTGGCA 12 10 0 CTTTTTTATCGCTTCAATTTAATCAAAATT 12 56 0 TCAAGGGGGTTTAATGCATAAAAAA 13 0 0 TGAAAAAGCGTTTTTGCTTGATTTATCTTTAGGAT 13 32 1 AATCGCTTGGTTTTGGCATCCATTAGAAAAGGGGT 13 108 1 AACTTCTTTATTATAGCTTTTTTCATTCAAAGATG 14 161 0 TTGTTTTAATTTATTGCTATAATAGAGCATTTGAA 15 70 1 TTTAGTCAATTTTTAGCATTCTTTAGCTAAAATCT 16 11 1 GAAAATCCTTTTTTCGCATCCATTAGCTTATTATA 19 10 1 CACCTTAATTTTAAGGCTTCATTCACATTTCATTC 19 78 1 GGCGTTATTATAGCGTGAATAAGTGGTGAATG 19 130 0 **** ** * ** * MAP Score: 34.8726 Motif 4 TTGAATTATAGCTTTTTTAAAAAATAATTGAT 0 15 0 GTTGGTTTTTGTTTGAATTATAGCTTTTTTAA 0 27 0 CAAATGATCCTTATTTTAAATTACACTCTA 1 8 1 TTTTTTAAATCTTTTATTATAATCAAAAATCC 1 62 0 CATTTTTATCGCTTTTTTTAAATCTTTTATTA 1 75 0 CTTAAAGAAGCGTTTCTTGTAAATAAGGAGTC 1 113 1 AATCTAGGGGCGTTGCTTTATAATTTTTAGGT 2 76 1 GGACATAGCTCCTTAATTTTAATCATTGACAA 2 190 1 TAACCACCTTTAATTGTTATGAATTGAGT 4 7 1 TATGAATTGAGTTTGATTGATAGGGGTGATTA 4 27 1 TGGCTTTATTTGTTATAAAATTTAT 7 3 1 AATGATTTGACTTTGATTATAAAATCTTAATT 7 40 0 GCTTGATAAAGCTTAGATTTTATCATAAAAAT 8 132 1 TTAAATTGCCCTTTCGTTTTAAAGATAAACAT 8 274 0 TTCTTGTCTCGCTTTTATTATATAACAATTAG 10 17 1 TTAAAGCGTTCTTTTAATTTTAAGCGCGATTA 11 201 1 AAACACCCTTTATTGAAAGCATAATGTC 11 246 0 CTTTTTTATCGCTTCAATTTAATCAAAATTAG 12 54 0 GATGACTCCTTTAATTGAAATTTAATTCTA 14 8 1 CTACCAACATCTTTGAATGAAAAAAGCTATAA 14 154 1 GGGGATTTGTCTTTCCTTTTTAATGCAACTTC 14 190 0 CTACTCTTATGTTTAATTTTTATCAAGGGAGT 16 44 1 GTTTTTGAAGGCTTGATTTTTAAAGTTAGGCT 17 11 1 AGGATTTTATCTTTATTTTATATTTATCGTTA 17 65 1 TTTTAAAAACCTTATTTTTAAAATTTTACTT 18 9 1 TCTTAAAAAGCGTTGTTTGATAAAAATGGCTC 18 57 0 TGTCTATAATGCTTGCTTTATAATAAGCTAAT 19 31 0 AAAAGAAACACCTTAATTTTAAGGCTTCATTC 19 70 1 TTTAAAATGGCCTTGATTATAACTAAACTTGA 20 37 0 TTTATCCTATGGTTTTATTTAATATGTTACAA 21 49 0 **** ****** MAP Score: 32.9479 Motif 5 AAAAATCCACTTGGTTGGTTGTTTTTATCATAGAGTGTAA 1 30 0 TTTAACATTCTTGTCTCGCTTTTATTATATAACAATT 10 7 1 ACTGATTTCCTTAATGGATTTTAGCTTGAGTGTTGT 9 56 0 TTATTTTATATTTATCGTTAGGTTTTAGGTTTAAAGTCAT 17 77 1 TGGTTTTTGTTTGAATTATAGCTTTTTTAAAAAATAATTG 0 17 0 GGTTTTTGAAGGCTTGATTTTTAAAGTTAGGCTTA 17 5 1 GCTTTTATCCTATGGTTTTATTTAATATGTTAC 21 51 0 AAGTAAAATTTTAAAAATAAGGTTTTTAAAA 18 1 0 AGAGCCACTATTAGAATAAGGTTTTGATGACGAT 18 116 1 TTTGCTTGATTTATCTTTAGGATTTGATTATAATTACCGC 13 44 1 TTTAGGTACTTTTGAAAGTGGGTTTTTTCTTAAATCTTAA 2 101 1 TTTAATTCCATTAAACGCATGATTTTTGCTACAATAATAG 6 27 1 TTTTAATTTTTGGTTATATAGTTTTTAAAAGTTGGCACTA 10 62 0 CATAAACCTTTGCGATAAGCTTTTGTCATTCAAATGCT 15 95 0 CGAAAAAGATTTTAATACTAATTTTTAACACGAGTGCCAA 14 91 1 AAAATCTTAATTTTACTATAAATTTTATAACAAATAAAGC 7 12 0 AACTCTACTCTTTCAAGAATGATTTGACTTTGATTATAAA 7 49 0 ATTAAGGTGTTTCTTTTAAGGGTTTGTCTATAATGCTTGC 19 47 0 TAATTTGTAATTATACTCTTTATTTTAACAAGTTGGGTTT 5 10 0 ATAAGTTTTATTCTGTTTTAGGTTTTGTTTTGGATTAAGG 11 72 1 TAATAGCTTGATAAAGCTTAGATTTTATCATAAAAATCTA 8 127 1 TTTTTATCGCTTTTTTTAAATCTTTTATTATAATCAAAAA 1 65 0 GCCCAACTATTGCTGTATTAGTTTTTTGAAATCCCTAAAG 2 144 0 TCTAGGGGCGTTGCTTTATAATTTTTAGGTACTTTTGAAA 2 78 1 GGTTAAATTGCCCTTTCGTTTTAAAGATAAACATTGT 8 271 0 AACTATAATATTGTAATCTAATTTTGATTAAATTGAAGCG 12 37 1 ATTTTTAAAGTTAGGCTTAATCTTTTATGTTAAAATTCTA 17 26 1 GCTAAGCGATTGAATCGCTTGGTTTTGGCATCCATTAGAA 13 96 1 GCATTTTTAGATTTAAGAATGCTTTTTATATATTATATAA 8 230 0 ** * * ***** * MAP Score: 28.9682 Motif 6 AGTATGAAAATTTTTTAAAATTTACAAAAATGA 8 80 1 GATTTTATCTTTATTTTATATTTATCGTTAGGT 17 67 1 TGCCAGACCCTTATTTAAGCTTTAAATAACTAT 12 10 1 GATGACTCCTTTAATTGAAATTTAATTCTAGCT 14 10 1 ATTTTAAGGCTTCATTCACATTTCATTCACATG 19 85 1 TTTATCGCTTTTTTTAAATCTTTTATTATAATC 1 70 0 TGCAACTTCTTTATTATAGCTTTTTTCATTCAA 14 166 0 CAAATGATCCTTATTTTAAATTACACTCTATGA 1 10 1 GCGTTTTTGCTTGATTTATCTTTAGGATTTGAT 13 39 1 TTAATCAAACTTGATACAAATTTTACTTTTTTA 4 73 0 TTAAGAATGCTTTTTATATATTATATAAAAATA 8 225 0 AGTGGGTTTTTTCTTAAATCTTAAGATCTTTAG 2 117 1 TTAGCTGGTGTTCTTTCTCATTTTTGTAAATTT 8 97 0 GCATTAAAGTTTTTTTAATTTTTGGTTATATAG 10 81 0 ATTTAAAGCGTTCTTTTAATTTTAAGCGCGATT 11 199 1 TAAAACTCCCTTGATAAAAATTAAACATAAGAG 16 47 0 GCTTATTTGTCCTTTATCCATTAAA 6 70 0 AAAAACCTTATTTTTAAAATTTTACTTTAAGAT 18 14 1 AGCTAATAGCTTGATAAAGCTTAGATTTTATCA 8 124 1 AGTTAATTATTATTTTCCTTATGTT 21 2 1 CATTTACTTTTTCATTATCATTTATGCTATAAT 8 45 0 AAAATACCAATTGTTTTAATTTATTGCTATAAT 15 60 1 CACAAAAATATTATTTTAGCATTCAATGATTAT 11 131 1 TGGCTTTATTTGTTATAAAATTTATAGTAAAA 7 9 1 GAAAAAGATTTTAATACTAATTTTTAACACGAG 14 92 1 TCTTTAGGATTTGATTATAATTACCGCTCAATC 13 57 1 AATTATAGCTTTTTTAAAAAATAATTGATAGGT 0 11 0 ATAAGACTAATTGTTATATAATAAAAGCGAGAC 10 22 0 ATAATGAAATTTTCTTAAAATTATACAATATGT 2 27 1 CCTAATAAGTTTTATTCTGTTTTAGGTTTTGTT 11 68 1 TTTTTTATGCATTAAACCCCCTT 13 0 1 TGCCAACCCCTTTTTTGTACATAATTCTCATTA 8 169 0 TCTAGGGGCGTTGCTTTATAATTTTTAGGTACT 2 78 1 ** *** * **** MAP Score: 28.1809 Motif 7 CGTTTCTTGTAAATAAGGAGTCCCTAAA 1 123 1 CAATGATTAAAATTAAGGAGCTATGTCCTTAA 2 186 0 TTTTAATCATTGACAAGGAGTTTGGTAGTTAG 2 206 1 AAGACCAAAAATTCAAGGGGATTATTTTAGCT 3 35 1 ATTCATAACAATTAAAGGTGGTTA 4 2 0 AAATCCGCTAAATCAAGGAGTGTTATTT 4 119 1 TTACTTACAACTTAAAGGGGATATG 5 47 1 AATTATGTACAAAAAAGGGGTTGGCATCAATT 8 176 1 AATTAGGGGGTTAAAAGGGGATATTTTTATAT 8 204 1 TTATCATTCCATTAAAGGGGACTCATTTAAAG 11 175 1 TTATGCTTTCAATAAAGGGTGTTT 11 250 1 TTTAAAGCTTAAATAAGGGTCTGGCA 12 4 0 AAAAACGCTTTTTCAAGGGGGTTTAATGCATA 13 15 0 GGCATCCATTAGAAAAGGGGTTATCCAC 13 122 1 TTAAATTTCAATTAAAGGAGTCATC 14 3 0 TATTATACCTTAAAAAGGGGATTTGTCTTTCC 14 206 0 CATGGGGAGGAATCAAGGAGCTTAT 17 114 1 AAAATTTTAAAAATAAGGTTTTTAAAA 18 5 0 AATGGATGCGAAAAAAGGATTTTC 19 2 0 AAGGTGTTTCTTTTAAGGGTTTGTCTATAATG 19 52 0 GAAGCCTTAAAATTAAGGTGTTTCTTTTAAGG 19 66 0 *** ****** * MAP Score: 27.8376 Motif 8 AAAAGCATTCTTAAATCTAAAAATGCTACAA 8 244 1 CCCCATGACTTTAAACCTAAAACCTAACGAT 17 90 0 ATGGCCTTGATTATAACTAAACTTGAATAAC 20 32 0 ATAATCGCGCTTAAAATTAAAAGAACGCTTT 11 203 0 ATATGGTATCTTAAAGTAAAATTTTAAAAAT 18 23 0 GGATTTTTGATTATAATAAAAGATTTAAAAA 1 62 1 GTTATAAAATTTATAGTAAAATTAAGATTTT 7 21 1 CCCTTTCGTTTTAAAGATAAACATTGTAGCA 8 267 0 TTTTTATATATTATATAAAAATATCCCCTTT 8 217 0 TGAGCGGTAATTATAATCAAATCCTAAAGAT 13 56 0 AATTAAGATTTTATAATCAAAGTCAAATCAT 7 40 1 TTGTCAATGATTAAAATTAAGGAGCTATGTC 2 191 0 GAATGAAGCCTTAAAATTAAGGTGTTTCTTT 19 71 0 GGGTTTTTTCTTAAATCTTAAGATCTTTAGG 2 120 1 TTATAGTTATTTAAAGCTTAAATAAGGGTCT 12 14 0 ATTCCTCATATTATACCTTAAAAAGGGGATT 14 215 0 AAAGCAAGCATTATAGACAAACCCTTAAAAG 19 44 1 ACCCAACTTGTTAAAATAAAGAGTATAATTA 5 12 1 TTGATAAAAATTAAACATAAGAGTAGATTTT 16 39 0 AAGTAAAATTTTAAAAATAAGGTTTTTAAAA 18 10 0 TTGGTCTTAATTATAGCATAAAAGAACGCTT 3 12 0 TGTCCCATAATTATAGCATAAATGATAATGA 8 36 1 GCTTAATCTTTTATGTTAAAATTCTAGGATT 17 40 1 AAATAGATTTTTATGATAAAATCTAAGCTTT 8 139 0 TATGCTATAATTAAGACCAAAAATTCAAGGG 3 23 1 TATAGCTTTTTTAAAAAATAATTGATAGGTT 0 10 0 AGACTAATTGTTATATAATAAAAGCGAGACA 10 21 0 TTAATGAGAATTATGTACAAAAAAGGGGTTG 8 168 1 CGCCCCTAGATTATACTATAGTTAAGTTACA 2 57 0 GGCACTCGTGTTAAAAATTAGTATTAAAATC 14 98 0 TTTTTTATGCATTAAACCCCCTTGA 13 4 1 ***** ***** MAP Score: 25.5204 Motif 9 ATCCAAAACAAAACCTAAAACAGAATAAAACTTAT 11 72 0 CCATGACTTTAAACCTAAAACCTAACGATAAATAT 17 84 0 ATTATAGACAAACCCTTAAAAGAAACACCTTAATT 19 53 1 AATGTGAATGAAGCCTTAAAATTAAGGTGTTTCTT 19 72 0 TTGAATGAAAAAAGCTATAATAAAGAAGTTGCATT 14 166 1 ATTTTTTAAAAAAGCTATAATTCAAACAAAAACCA 0 22 1 AAATTAAAAGAACGCTTTAAATGAGTCCCCTTTAA 11 186 0 TTAGCTAAAGAATGCTAAAAATTGACTAAAA 16 6 0 ATAGTTATTTAAAGCTTAAATAAGGGTCTGGCA 12 8 0 CTTAAAGTAAAATTTTAAAAATAAGGTTTTTAAAA 18 10 0 ACCTAACGATAAATATAAAATAAAGATAAAATCCT 17 65 0 GATTAAGCCTAACTTTAAAAATCAAGCCTTCAAAA 17 13 0 ATATAAAAAGCATTCTTAAATCTAAAAATGCTACA 8 239 1 ATTATAATAAAAGATTTAAAAAAAGCGATAAAAAT 1 71 1 ACTCCTTGTCAATGATTAAAATTAAGGAGCTATGT 2 192 0 CTCCCTTGATAAAAATTAAACATAAGAGTAGATTT 16 40 0 ATTATAATCAAATCCTAAAGATAAATCAAGCAAAA 13 43 0 GCTAGGATTTCATTCTATAATGCAAAATCTAACCA 14 48 1 AAAAATTAAAAAAACTTTAATGCGGAGCATTCAAA 10 91 1 AAAGTACCTAAAAATTATAAAGCAACGCCCCTAGA 2 78 0 AACTTTTAAAAACTATATAACCAAAAATTAAAAAA 10 69 1 TAATCAAGGCCATTTTAAAAGCTAGATTAATTATT 20 50 1 CTCAATTCATAACAATTAAAGGTGGTTA 4 3 0 ATAATCATTGAATGCTAAAATAATATTTTTGTGAA 11 129 0 TAAAGATCTTAAGATTTAAGAAAAAACCCACTTTC 2 114 0 AAGAAAATTTCATTATTTAAGTAAGGGGAATTA 2 8 0 ATTTGTTATAAAATTTATAGTAAAATTAAGATTTT 7 17 1 TTGGATAAATCAACTTAAAGGCAAAGAC 11 3 0 ** ****** ** MAP Score: 20.0502 Motif 10 TTGTTTGAATTATAGCTTTTTTAAAAAATAAT 0 19 0 TATCCATTTTTATCGCTTTTTTTAAATCTTTT 1 79 0 ATAGGCTTAAAGAAGCGTTTCTTGTAAATAAG 1 108 1 AAAAGCGTTCTTTTATGCTATA 3 0 1 TAGGGGTGATTATAGCATTTATGGGGTAAAAA 4 47 1 GTAGCAAAAATCATGCGTTTAATGGAATTAAA 6 27 0 TTGCTACAATAATAGGATTTTAATGGATAAAG 6 52 1 ATTCTCATTAAATAGATTTTTATGATAAAATC 8 147 0 ATAATATATAAAAAGCATTCTTAAATCTAAAA 8 234 1 AGATAAACATTGTAGCATTTTTAGATTTAAGA 8 252 0 TAATTTTTAGCGTTTTTAAGAATGATT 9 5 1 CTTAATGGATTTTAGCTTGAGTGTTGTTAGTA 9 51 0 AACATTCTTGTCTCGCTTTTATTATATAACAA 10 13 1 TTTATTCTGTTTTAGGTTTTGTTTTGGATTAA 11 78 1 AAAATATTATTTTAGCATTCAATGATTATTGC 11 135 1 GGGACTCATTTAAAGCGTTCTTTTAATTTTAA 11 192 1 ATTAGGGACATTATGCTTTCAATAAAGGGTGT 11 240 1 ACCCCCTTGAAAAAGCGTTTTTGCTTGATTTA 13 25 1 TTGATTTATCTTTAGGATTTGATTATAATTAC 13 49 1 ACTTCTTTATTATAGCTTTTTTCATTCAAAGA 14 163 0 AGGGGATTTGTCTTTCCTTTTTAATGCAACTT 14 191 0 ATTGCTATAATAGAGCATTTGAATGACAAAAG 15 82 1 AACCTTTGCGATAAGCTTTTGTCATTCAAATG 15 97 0 TTAGTCAATTTTTAGCATTCTTTAGCTAAAAT 16 12 1 ACTTTAAAAATCAAGCCTTCAAAAACC 17 5 0 AAAGTTAGGCTTAATCTTTTATGTTAAAATTC 17 32 1 ATGTTAAAATTCTAGGATTTTATCTTTATTTT 17 52 1 AATTTTAAAAATAAGGTTTTTAAAA 18 3 0 TAAACTTGAATAACGCTTTCTAACACAGCCCT 20 14 0 TAATAATTAATCTAGCTTTTAAAATGGCCTTG 20 54 0 GTTACAATACTTAAGCATTCTAACATAAGGAA 21 24 0 * **** ***** MAP Score: 13.089 Motif 11 TATCGCTTTTTTTAAATCTTTTATTATAATCAAAAATCC 1 62 0 CTTACTTAAATAATGAAATTTTCTTAAAATTATACAATA 2 18 1 TCCCTAAAGATCTTAAGATTTAAGAAAAAACCCACTTTC 2 114 0 AATCTTAAGATCTTTAGGGATTTCAAAAAACTAATACAG 2 133 1 GCTTTATTTGTTATAAAATTTATAGTAAAATTAAGATTT 7 12 1 TTCATACTCTCATTTACTTTTTCATTATCATTTATGCTA 8 49 0 GTATGAAAATTTTTTAAAATTTACAAAAATGAGAAAGAA 8 81 1 GCTAATAGCTTGATAAAGCTTAGATTTTATCATAAAAAT 8 125 1 AAAATCTATTTAATGAGAATTATGTACAAAAAAGGGGTT 8 159 1 TAAGAATGCTTTTTATATATTATATAAAAATATCCCCTT 8 218 0 AATGCTACAATGTTTATCTTTAAAACGAAAGGGCAATTT 8 265 1 TAATTTTTAGCGTTTTTAAGAATGATTAGTTA 9 3 1 CATTAAAGTTTTTTTAATTTTTGGTTATATAGTTTTTAA 10 74 0 AGAATAAAACTTATTAGGGTTTCAATCACTTAAAAGTGA 11 47 0 GCCAGACCCTTATTTAAGCTTTAAATAACTATAATATTG 12 11 1 CTTTTTTATCGCTTCAATTTAATCAAAATTA 12 55 0 GCTTGATTTATCTTTAGGATTTGATTATAATTACCGCTC 13 47 1 TTGGCACTCGTGTTAAAAATTAGTATTAAAATCTTTTTC 14 92 0 CAAATCCCCTTTTTAAGGTATAATATGAGGAATTTTAGA 14 213 1 ATACCAATTGTTTTAATTTATTGCTATAATAGAGCATTT 15 63 1 AAAACTCCCTTGATAAAAATTAAACATAAGAGTAGATTT 16 40 0 GAAGGCTTGATTTTTAAAGTTAGGCTTAATCTTTTATGT 17 17 1 CTTTATTTTATATTTATCGTTAGGTTTTAGGTTTAAAGT 17 75 1 AAAAACCTTATTTTTAAAATTTTACTTTAAGATACCATA 18 14 1 AAGGTGTTTCTTTTAAGGGTTTGTCTATAATGCTTGCTT 19 45 0 TAGAAAGCGTTATTCAAGTTTAGTTATAATCAAGGCCAT 20 24 1 * ** * *** * ** MAP Score: 7.42056 Motif 12 TTATAGCTTTTTTAAAAAATAATTGATAGGTT 0 10 0 AAAGCTATAATTCAAACAAAAACCAACCAATA 0 32 1 AAATCTTTTATTATAATCAAAAATCCACTTGG 1 56 0 TTAAGAAAATTTCATTATTTAAGTAAGGGGAA 2 13 0 GATCTTAAGATTTAAGAAAAAACCCACTTTCA 2 113 0 AAAGCGTTCTTTTATGCTATAATTAAGACCAA 3 11 1 AAACCCAACTTGTTAAAATAAAGAGTATAAT 5 9 1 TAATAGGATTTTAATGGATAAAGGACAAATAA 6 61 1 TGTTATAAAATTTATAGTAAAATTAAGATTTT 7 20 1 AAATTAAGATTTTATAATCAAAGTCAAATCAT 7 39 1 TTCATTATCATTTATGCTATAATTATGGGACA 8 36 0 TAAATAGATTTTTATGATAAAATCTAAGCTTT 8 139 0 AAAAGCATTCTTAAATCTAAAAATGCTACAAT 8 244 1 TTGTCTCGCTTTTATTATATAACAATTAGTCT 10 20 1 AAATAATATTTTTGTGAAAAAAATAAACGGAT 11 115 0 TGAGTCCCCTTTAATGGAATGATAAAAGATCG 11 168 0 ATAATCGCGCTTAAAATTAAAAGAACGCTTTA 11 202 0 CAGACCCTTATTTAAGCTTTAAATAACTATAA 12 13 1 TCAAGGGGGTTTAATGCATAAAAAA 13 3 0 ACCAACATCTTTGAATGAAAAAAGCTATAATA 14 156 1 AAATCCCCTTTTTAAGGTATAATATGAGGAAT 14 214 1 TTGTTTTAATTTATTGCTATAATAGAGCATTT 15 70 1 TTTTGAAGGCTTGATTTTTAAAGTTAGGCTTA 17 13 1 GGCTTAATCTTTTATGTTAAAATTCTAGGATT 17 39 1 ATATGGTATCTTAAAGTAAAATTTTAAAAATA 18 22 0 ATCCTATGGTTTTATTTAATATGTTACAATAC 21 46 0 ** *** ***** MAP Score: 0.473727