AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HY/HY_operons005_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944251926 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 dnaG 287 DNA PRIMASE #1 jhp0012 89 putative #2 jhp0013 146 putative #3 jhp0016 239 putative #4 cheV_1 106 putative chemotaxis protein #5 jhp0075 149 methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) #6 rplM 300 50S RIBOSOMAL PROTEIN L13 #7 jhp0091 193 methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) #8 jhp0095 215 methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) #9 cpdB 140 2',3'-CYCLIC-NUCLEOTIDE 2'-PHOSPHODIESTERASE #10 jhp0097 37 putative #11 metB 24 putative CYSTATHIONINE GAMMA-SYNTHASE #12 cysK 118 CYSTEINE SYNTHASE #13 jhp0151 25 putative histidine kinase sensor protein #14 jhp0152 300 putative TRANSCRIPTIONAL REGULATOR #15 jhp0156 69 putative #16 prfB 60 PEPTIDE CHAIN RELEASE FACTOR 2 (RF-2) #17 jhp0160 300 putative #18 cheY 293 response regulator #19 jhp0381 300 putative TRANSCRIPTIONAL REGULATOR #20 htrA 44 PROTEASE DO #21 jhp0406 195 amino acid permease #22 pyrD 38 DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE #23 ppk 300 polyphosphate kinase #24 jhp0546 71 methyl-accepting chemotaxis protein (MCP) #25 jhp0547 166 putative secretion/efflux abc transporter, ATP-binding protein #26 cheV_2 70 putative chemotaxis protein #27 pheS 81 PHENYLALANYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA CHAIN #28 rpsA 121 30S RIBOSOMAL PROTEIN S1 #29 jhp0983 28 putative #30 jhp0986 22 putative #31 cheA 56 histidine kinase #32 jhp1282 133 putative histidine kinase sensor protein #33 putative 108 putative TRANSCRIPTIONAL REGULATOR #34 fbp 70 FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATASE #35 jhp1442 66 TYPE II RESTRICTION ENZYME #36 jhp1443 86 putative TRANSCRIPTIONAL REGULATOR Motif 1 AAAACCCTATTTTTAAACTTTAAACTTTCCTTA 6 214 1 TCTTTTTTTAATTTTGAAGTTTAGCACA 20 5 1 TCTTTCGTTTTTTTAAAATTTTATTTTCAATAT 21 95 1 AGTTAATCGTTTTTAAAGTTGTAAAAATCATTG 14 260 1 TCTAACCCTTTTAATTTTTTTGCTTGTTTGC 3 218 0 TTTTACTCCCTTTTAAGGTTTTTCTTTTATTAA 27 15 1 AACCACCGGATTTTAATTTTATTTAGCGCCACT 8 107 1 TTTGAATCCTTTTTAACATTCTTTTCCTTTCCA 17 47 0 TAATTTTATTTTTTAAAAATAAAGCCCTTTAAA 25 88 0 TATTATAGCTTTTTAAAAATAAAATATAAGGAT 27 53 1 TTTTTACCCCTTTTAAAGATAAAAACCACCCCT 2 37 1 ATAAAGAAAATTTTATTATTGAATACGAACACC 25 142 1 ACAAACTGATTTTTAAACATGATGATTTAAAGG 23 270 1 TAGCAAATGATTTTAAAAATTATCCATAAAAAA 19 131 1 TTCAAGCTATTTTTATTTTTAATCTAAGGAGGT 21 167 1 GATTTTTTATTTTTATTATTTTATTTTTAAGCC 8 10 1 TTTCGTATCGTTTTATAATTATATCGTGTTTGT 4 63 0 TTAAGCGATCTTTTAGGGTTAAATGAAGTTTTA 23 45 1 GTGATTAGCGTTTTAGCGTTTAACTATGAAAAA 32 71 1 TCAAAGTGCTTTTTAGTTTTCAATATTCCATGA 14 107 1 CCAAAGAAATTTTTAGTTTTTAAGTGTCGTTGG 4 22 1 AATCATTTTATTTTATTTTTGTTATAATTCAAG 21 140 1 CCCTAAGGAATTTTATATTTATTTTATAGTAAG 28 91 1 TTTAGAGGATTTTTATGGTTTTTTTGAGATAAT 2 81 1 TTGGTGTTAGTTTTATTCTTTTTGGAAAGGAAA 17 25 1 TATACATTATTTTGAAATTTTAATAAAACAAGA 5 86 0 TCGGTTAAAGTTTGAAATTTTAAAGGGCTTTAT 25 70 1 ATGATAATGTTTTGAATTTTTATTTTTAAGACA 14 170 1 AAGGGCTTGATTTTAGCATTTTATTACTAAAGA 14 214 0 TTAAAATAATTTTTAGCGTTCTTTAAAAAACAC 21 14 1 AACAAACCTTTTTGAAGATTTTATTTATTGAGT 0 209 1 ATTTTTTAAAATAAATACAATAAAAG 6 3 1 TAAAAACCTTTTAAACTAAATTAGGGTAGTA 26 8 1 TATTTTACAATTTTATCAATAAAAA 31 2 0 TAAATTTCTATTTTATTTATCAAAACTTAGGAG 0 17 0 GATAACTCAATTTTAGCGATTATGCCTAAACTC 12 71 0 TCTTATTATTTTTGAACTATTATGATAGCAAAC 18 84 1 AAAAAAGAGTTTTTAAACAACAACTAAGCAAAC 23 79 1 AAAATCACCATTTTATTGTATAATTACAATCCA 19 98 0 GGGGTTTTCTTTTTATGCTATAATGGAAAAAGC 1 33 1 TTAGCGGTTTTTTTAAAGAAAATTTTCAAAATG 28 12 0 AAAAAATTTGTTTGATTGTTTTTGATTTTATAG 6 180 0 AATACATAAATTTGATCGTTTTTCTCATATCCA 35 32 0 GTTTAGCACATTTTAAGGAAGTAACC 20 28 1 AAGGGGAGTTTTTGAGAATTTTAGGGGTTTTCT 1 10 1 AAAATAGGGTTTTTAAAAAATTTGTTTGATTGT 6 194 0 TTTTGTTTAATTTTAATTAACTTTCTAAGGTTT 2 115 0 TAAAAAGCACTTTGAGTGTTTTTTACCATCAAA 14 89 0 TCAGCGTTAATTTTATGTAAAAATAATGCTATG 9 92 1 AGATCTTTGGTTTTATAAAATAAAGCGGTGTCT 33 17 1 AAGGTTTTTCTTTTATTAAAGTTGTATTATAGC 27 29 1 TAACTAAAGCTTTTATTAAAATTTTCTTAAACT 19 216 1 GTTTTTCCTTTTTTATTGAATTT 11 0 0 CTAAAAAGAGTTTGAGGGATTTTTTT 32 3 0 CATTGGATGGTTTGAAAAAAGAAAGACAAGGAT 18 21 0 CCTTTTATGATTTGATTAAAGATGCTAATATTT 34 41 0 AAGAATCCTTTGATAAAATTAAAGCACCCAT 6 279 0 AATAGCATGTTTTGATTAAAATTACCTTGACCG 18 178 0 ****** ** ** MAP Score: 54.8573 Motif 2 CTTTTCACTTTTTCAGCGGTTTTCAAACCACCG 8 82 1 ATTGTTAATTTTTAAACGATTTTGTAAGTCAAA 28 44 1 AATACATAAATTTGATCGTTTTTCTCATATCCA 35 32 0 AAAAAATGCCTTTAAGCGTTTTTTATGGATAAT 19 149 0 CTTAAAATTTTTTCAGCGTTTTTTGGGTTGATT 23 17 0 CTAAAAAGAGTTTGAGGGATTTTTTT 32 3 0 TTTAGAGGATTTTTATGGTTTTTTTGAGATAAT 2 81 1 TTTTTGAGAATTTTAGGGGTTTTCTTTTTATGC 1 18 1 AACATGATGATTTAAAGGATTTTTA 23 285 1 TTTTACTCCCTTTTAAGGTTTTTCTTTTATTAA 27 15 1 TAAAAAGCACTTTGAGTGTTTTTTACCATCAAA 14 89 0 AAAAAATTTGTTTGATTGTTTTTGATTTTATAG 6 180 0 AGCTTTGCTTTTTTACCCCTTTTAAAGATAAAA 2 28 1 CCCTTACCCATTTTAGGCGTTTTAGGCGTTACA 9 39 1 GAGAGCAAAGTTTTAAGGTGTTTTTTAAAGAAC 21 31 0 CTAATTTAGTTTAAAAGGTTTTTA 26 1 0 TTAAAATAATTTTTAGCGTTCTTTAAAAAACAC 21 14 1 CTGAAAAAATTTTAAGCGATCTTTTAGGGTTAA 23 34 1 AGTTTGAAATTTTAAAGGGCTTTATTTTTAAAA 25 78 1 TTGGTGTTAGTTTTATTCTTTTTGGAAAGGAAA 17 25 1 ATCGAGAATTTTTGAATCCTTTTTAACATTCTT 17 57 0 CATTAACAGAGTTAATCGTTTTTAAAGTTGTAA 14 251 1 GAATGCAACCTTAAAATGGTTTTTAATGAGAAT 7 57 1 TTAAACCCCTTTTTAGCGTTTGA 31 43 0 CGTTTTATAATTATATCGTGTTTGTGTTTAATG 4 55 0 TAAAAATTTCTTTGGGGGGTTTTGGAA 4 4 0 ATCATTTTGATTTTTTCGTTTTTTTCATAGTTA 32 91 0 GATAACTCAATTTTAGCGATTATGCCTAAACTC 12 71 0 TGATTTATTATTATAAGGCGTTTAGGACGCTTT 18 219 1 AACCACCCCTTTTGACCCCCTTTTAGAGGATTT 2 60 1 CGATCGTTTTTTTAATTCAGTTTAATTTTGGAT 7 93 1 GTTTTTCCTTTTTTATTGAATTT 11 0 0 ATGCAAGCTCTTTTATTGTATTTATTTTAAAAA 6 12 0 TATTCTCGGGTTAGGGGGTTTTTAGTTGGGGGC 6 74 1 TAAACTCACTTTTTAAGGGGTATTTAAGCGCAA 17 267 0 AAGATTATAATTATAAGGATTATTAAGTCTATT 0 121 1 *** * ** **** MAP Score: 53.7031 Motif 3 GAATACCGCTTTTTAAAGAGATTATCACTTATTTA 6 44 0 AAAATAGGGTTTTTAAAAAATTTGTTTGATTGTTT 6 192 0 TGTTTTAAAATAATTTTTAGCGTTCTT 21 2 1 TCTTTCGTTTTTTTAAAATTTTATTTTCAATATTC 21 95 1 AAGTTTGAAATTTTAAAGGGCTTTATTTTTAAAAA 25 77 1 AGTTAATCGTTTTTAAAGTTGTAAAAATCATTGAA 14 260 1 GAGAGCAAAGTTTTAAGGTGTTTTTTAAAGAACGC 21 29 0 TTTTACTCCCTTTTAAGGTTTTTCTTTTATTAAAG 27 15 1 TCTGTTAATGTTTTAAGGGCTTGATTTTAGCATTT 14 226 0 ATTCTCATGCTTTTAAAATCACTCT 29 0 0 TGAATTTTTATTTTTAAGACATCTTTAAGGTATCT 14 182 1 TTAAACTCACTTTTTAAGGGGTATTTAAGCGCAAA 17 266 0 ATGAGTGGGGTTTTAAACTCACCATTATAGCATTG 16 22 0 TTAAAAACCATTTTAAGGTTGCATTCGCTCTTTTA 7 48 0 AGCGGTGTCTTTTTAAGGGAGCGTTTTTCATGATC 33 40 1 AGCGGTGTCTTTTTAAGGGAGCGTTTTTCATGATC 36 18 1 TTAGCGGTTTTTTTAAAGAAAATTTTCAAAATGTG 28 10 0 TATATTTTATTTTTAAAAAGCTATAATACAACTTT 27 46 0 CCCTTTGCCTTTTTAAAACTATTGATAGAGAACGA 5 123 0 AAATTTTTAGTTTTTAAGTGTCGTTGGCATTAAAC 4 28 1 ATCCTTATATTTTTAAACTAATGAAACTTGATACA 0 154 0 AATTGGAGCTTTTTTAAAAAGTCATGGTCGGAGTA 23 206 0 TAATTGTTAATTTTTAAACGATTTTGTAAGTCAAA 28 42 1 CAACAAACCTTTTTGAAGATTTTATTTATTGAGTA 0 208 1 ATTAGGCTCTTTTTAAACAGCCAAAGCGTCCTAAA 18 239 0 GCACTTCTCCTTTTAAGATTGCATTTAAATTAGGC 18 267 0 CCTCAAACTCTTTTTAGGGACTTATTTAGGCTCTT 32 19 1 GCTGAAAAAATTTTAAGCGATCTTTTAGGGTTAAA 23 33 1 AAAAAAGAGTTTTTAAACAACAACTAAGCAAACTC 23 79 1 TTTTGAATCCTTTTTAACATTCTTTTCCTTTCCAA 17 46 0 TTTTTACCCCTTTTAAAGATAAAAACCACCCCTTT 2 37 1 TATTATTTTATTTTTAAGCCTAACTTAAAAAAGGG 8 23 1 TTATACATTATTTTGAAATTTTAATAAAACAAGAG 5 85 0 GATAGGGGTATTTTGAAATCATTCTCCCCCTTTTA 14 11 1 AAAAACCCTATTTTTAAACTTTAAACTTTCCTTAA 6 213 1 AAGGGCTTTATTTTTAAAAAATAAAATTAGGGGCA 25 92 1 ATTTTTAACTCCTTTATTCATAAATT 10 21 0 AAAATGGTGATTTTTAGCAAATGATTTTAAAAATT 19 117 1 ACAAACTGATTTTTAAACATGATGATTTAAAGGAT 23 270 1 TGCGGCAAAATTTTAAACCGCATTATAGTATTATA 7 133 0 TAAAAACCTTTTAAACTAAATTAGGGTAGTATT 26 8 1 CTATAGCGCATTTTTAGGGATAAGTCAAGCCATAA 0 76 1 ATTTTTTAAAATAAATACAATAAAAGA 6 2 1 TATAAAACGCTTTTTAAACGCATAAGGAACAACA 15 45 1 CTTTTTTTAATTTTGAAGTTTAGCACATTTTAAGG 20 11 1 GTATAATCCCTTTTGAGAAAGTCAAACTAAAAAGC 0 240 1 TTTATGGTTTTTTTGAGATAATTAAACCTTAGAAA 2 92 1 CTTACTATAATTTTTAGCCGTAGCATACCCTAAAA 7 18 1 CACCCCTAACTTTTGAGCGTGATAAAGGGTCATTG 18 49 0 ******** * * MAP Score: 49.1488 Motif 4 TTCCAAAACCCCCCAAAGAAATTTTT 4 4 1 CCCCCAACTAAAAACCCCCTAACCCGAGAATA 6 74 0 TTGATGGTAAAAAACACTCAAAGTGCTTTTTA 14 90 1 TCCTTGTTATAAAAAACCCAAAGGCATCCTTG 25 19 1 TGACTTTTTAAAAAAGCTCCAATTACTATCAT 23 217 1 GCTATAATGGAAAAAGCTCTAATCATTAAGCT 1 49 1 GCATAAAAAGAAAACCCCTAAAATTCTCAAAA 1 19 0 CGTTCTTTAAAAAACACCTTAAAACTTTGCTC 21 30 1 TGTAACGCCTAAAACGCCTAAAATGGGTAAGG 9 40 0 AAAAAAATCCCTCAAACTCTTTTT 32 2 1 GCGATCATGAAAAACGCTCCCTTAAAAAGACA 33 45 0 GCGATCATGAAAAACGCTCCCTTAAAAAGACA 36 23 0 AAAGAGAGCCAAAGCTCTCCAAAGCTCCCCCA 5 35 0 TTATCCATAAAAAACGCTTAAAGGCATTTTTT 19 150 1 AAAAACCATAAAAATCCTCTAAAAGGGGGTCA 2 72 0 AAAATTCTCAAAAACTCCCCTT 1 0 0 AAAGGATTCAAAAATTCTCGATGCAATTATGA 17 68 1 TTAATAAAAGAAAAACCTTAAAAGGGAGTAAA 27 16 0 AAGTCAAACTAAAAAGCCCATTTGAAGAAAGC 0 258 1 GGATATGAGAAAAACGATCAAATTTATGTATT 35 33 1 TATAAAATCAAAAACAATCAAACAAATTTTTT 6 181 1 GAATGATTTCAAAATACCCCTATCC 14 3 0 GAGCTATTGTAAAATACCCCCTATCCCCTTAA 6 116 1 AAAAACCCTTTTATGATTTGATT 34 57 0 ATAAAATTGTAAAATACTCTTATCTCAAACGC 31 19 1 TTATAAAACCAAAGATCTCTATTAT 33 3 0 TTTTAAAAATAAAGCCCTTTAAAATTTCAAAC 25 79 0 TGATAAAATTAAAGCACCCATTATAAGGAAAT 6 268 0 ACCATACACAAAAAATCTTGATCTTAACTAAA 19 192 1 TAAAAATCCTTTAAATCATCATGT 23 286 0 CTGAATTAAAAAAACGATCGATCATTCTCATT 7 81 0 TGAAAGCTCCTTATCAATCTTAAT 12 2 1 TTTAAAGATAAAAACCACCCCTTTTGACCCCC 2 48 1 TTGTTGTTTAAAAACTCTTTTTTGTAAAACTT 23 70 0 TGGTTACTATAAAACGCTTTTTAAACGCATAA 15 38 1 GATTATACCCAAAATTACCAAACATTTTAAGC 24 15 0 TAAAAACCTTTTAAACTAAATTA 26 1 1 CAAATTTTTTAAAAACCCTATTTTTAAACTTT 6 203 1 GGCTGTTTAAAAAGAGCCTAATTTAAATGCAA 18 252 1 ATTTAAGCGCAAAGTCCCTTAATCTTATATAG 17 247 0 TTTACCATCAAAAGAGCCTGCATAAGCAAGCG 14 69 0 TAATTATCTCAAAAAAACCATAAAAATCCTCT 2 84 0 AATTTTCTTTAAAAAAACCGCTAATTGTTAAT 28 21 1 AAATACAATAAAAGAGCTTGCATAAATAAGTG 6 22 1 TTGCCTTTTTAAAACTATTGATAGAGAACGAT 5 122 0 AATGATTTTAAAAATTATCCATAAAAAACGCT 19 136 1 CATTCTAATCAAAATCATCGCATCAGCGTTAA 9 70 1 GCAAACAAGCAAAAAAATTAAAAGGGTTAGA 3 218 1 TATTCAATTAAAAAAAATCATTTTATTTTATT 21 125 1 ATTCTCATTAAAAACCATTTTAAGGTTGCATT 7 58 0 TAAAGTTGTAAAAATCATTGAAGGAGTTAATT 14 273 1 TCATTTGCTAAAAATCACCATTTTATTGTATA 19 109 0 TTTTATTACTAAAGATACCTTAAAGATGTCTT 14 197 0 GCTCCCTTAAAAAGACACCGCTTTATTTCA 36 8 0 GCTCCCTTAAAAAGACACCGCTTTATTTTATA 33 30 0 GTTTGACTTAAAAATGATTGATAGGAGATAAA 8 191 1 AAGAACGCTAAAAATTATTTTAAAACA 21 5 0 TTTCCTAGTGAAAGATATTCATAGCATTATTT 9 112 0 ***** *** ** MAP Score: 47.4471 Motif 5 TTTATTGAGTATAATCCCTTTTGAGAAAGTCAAA 0 232 1 AAAGATAAAAACCACCCCTTTTGACCCCCTTTTA 2 51 1 TTAAACCCCTTTTTAGCGTTTGAGA 31 41 0 GCTTTGCTTTTTTACCCCTTTTAAAGATAAAAAC 2 29 1 TCTAACCCTTTTAATTTTTTTGCT 3 225 0 CTCGCGCTACAATACCCCTTTTTGATTGCGGAGT 23 111 1 CTAACCCGAGAATACCGCTTTTTAAAGAGATTAT 6 54 0 ATGGTTACTATAAAACGCTTTTTAAACGCATAAG 15 37 1 AGAATTATAGAACACCCTTTTTTAAGTTAGGCTT 8 38 0 GGCGTTATCAACAAACCTTTTTGAAGATTTTATT 0 200 1 CGAGAATTTTTGAATCCTTTTTAACATTCTTTTC 17 54 0 TTTTTAAAAATAAAGCCCTTTAAAATTTCAAACT 25 78 0 AGCGTTTTTCATGATCGCTTTTGGTATAAAGGCT 33 59 1 AGCGTTTTTCATGATCGCTTTTGGTATAAAGGCT 36 37 1 TTAGGGGGATTGTATCCTTTTTTGACTTACAAAA 28 63 0 ATTAACAGAGTTAATCGTTTTTAAAGTTGTAAAA 14 252 1 AAAAATGCCTTTAAGCGTTTTTTATGGATAATTT 19 147 0 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107 0 TAAAGATGTCTTAAAAATAAAAATTCAAAACAT 14 176 0 TGTGCTAAACTTCAAAATTAAAAAAAGA 20 5 0 CCTCCTTAGATTAAAAATAAAAATAGCTTGAAT 21 166 0 AAATTCAATAAAAAAGGAAAAACT 11 8 1 TGGGTTTGACTATAAAATCAAAAACAATCAAAC 6 171 1 AAATAAAATAATAAAAATAAAAAATC 8 3 0 ATACAACTTTAATAAAAGAAAAACCTTAAAAGG 27 23 0 TTTAACTATGAAAAAAACGAAAAAATCAAAATG 32 89 1 AGTGGCGCTAAATAAAATTAAAATCCGGTGGTT 8 107 0 GCAAACAAGCAAAAAAATTAAAAGGGTTAGA 3 218 1 CTTGAATTATAACAAAAATAAAATAAAATGATT 21 140 0 ATTGGATGGTTTGAAAAAAGAAAGACAAGGATT 18 20 0 AATAAAATTTTAAAAAAACGAAAGAATACTAAA 21 87 0 TTAAGTTAGGCTTAAAAATAAAATAATAAAAAT 8 18 0 TCCATTATAGCATAAAAAGAAAACCCCTAAAAT 1 27 0 ATCAATAGTTTTAAAAAGGCAAAGGGA 5 132 1 AGTTTTGATAAATAAAATAGAAATTTAGCGCTT 0 23 1 CTCCTTGTTATAAAAAACCCAAAGGCATCCTTG 25 18 1 ACAAAATCGTTTAAAAATTAACAATTAGCGGTT 28 36 0 TTCCAAAAAGAATAAAACTAACACCAAATCAAA 17 19 0 ATCATAATAGTTCAAAAATAATAAGACACCCCT 18 77 0 ATTTTTTAAAATAAATACAATAAAAGA 6 4 1 ** **** **** MAP Score: 37.2303 Motif 7 TAAAATAGAAATTTAGCGCTTATTGTTATTA 0 35 1 TATAGCGCATTTTTAGGGATAAGTCAAGCCA 0 77 1 TTTTTGAGAATTTTAGGGGTTTTCTTTTTAT 1 18 1 TTACTATAATTTTTAGCCGTAGCATACCCTA 7 19 1 ATTATTTTATTTTTAAGCCTAACTTAAAAAA 8 24 1 CTTTTCACTTTTTCAGCGGTTTTCAAACCAC 8 82 1 TTTTAATTTTATTTAGCGCCACTCATTTTTC 8 117 1 TGAACTCTCAAATTAGGGTTTGACTTAAAAA 8 174 1 CCCTTACCCATTTTAGGCGTTTTAGGCGTTA 9 39 1 CATTTAACGAGTTTAGGCATAATCGCTAAAA 12 63 1 TTAAAATAATTTTTAGCGTTCTTTAAAAAAC 21 14 1 AATCATCAAATATTAAGGATTAAA 22 24 1 CTGAAAAAATTTTAAGCGATCTTTTAGGGTT 23 34 1 TTAAGCGATCTTTTAGGGTTAAATGAAGTTT 23 45 1 TGGTTGGAACTATTATCGGTTAAAGTTTGAA 25 55 1 TTTTACTCCCTTTTAAGGTTTTTCTTTTATT 27 15 1 ATTGTTAATTTTTAAACGATTTTGTAAGTCA 28 44 1 CTCAAACTCTTTTTAGGGACTTATTTAGGCT 32 20 1 TTAGGGACTTATTTAGGCTCTTCGTTTGTGT 32 32 1 GTGATTAGCGTTTTAGCGTTTAACTATGAAA 32 71 1 AAGGCTATAGAATTAGCGCTACAATACCCCC 33 87 1 AAGGCTATAGAATTAGCGCTACAATACCCCC 36 65 1 ******** ** MAP Score: 2.15842