AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i HY/HY_sum_all002_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944235212 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 jhp0160 300 putative #1 jhp0193 96 putative #2 flgI 185 FLAGELLAR P-RING PROTEIN #3 ilvC 248 KETOL-ACID REDUCTOISOMERASE #4 minD 24 cell division inhibitor #5 jhp0324 260 putative #6 fliF 43 FLAGELLAR M-RING PROTEIN #7 flgG_1 55 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN #8 kgtP 300 ALPHA-KETOGLUTARATE PERMEASE #9 flhA_rpsO 135 flhA: FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN, rpsO: 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 #10 jhp0385 55 putative #11 aroD 112 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE #12 rho 264 TRANSCRIPTION TERMINATION FACTOR #13 fliN 81 putative FLAGELLAR MOTOR SWITCH PROTEIN #14 fliP 96 FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN #15 jhp0699 163 putative #16 mobA 85 MOLYBDOPTERIN-GUANINE DINUCLEOTIDE BIOSYNTHESIS PROTEIN A #17 jhp0749 132 putative #18 atpB 121 ATP synthase F0, subunit a #19 gatA 58 GLU-TRNA AMIDOTRANSFERASE, SUBUNIT A #20 speE 92 putative spermidine synthase #21 jhp0772 76 putative #22 flgE 208 FLAGELLAR HOOK PROTEIN #23 cdh 276 CDP-DIACYLGLYCEROL PYROPHOSPHATASE #24 jhp0842 180 putative #25 jhp0843 50 putative FLAGELLAR BIOSYNTHESIS PROTEIN #26 atpD 24 ATP synthase F1, subunit beta #27 atpA 22 ATP synthase F1, subunit alpha #28 atpX 104 ATP synthase B' #29 fmt 23 METHIONYL-TRNA FORMYLTRANSFERASE #30 jhp1070 34 putative #31 jhp1071 209 putative #32 rplS 21 50S RIBOSOMAL PROTEIN L19. #33 rpsP 73 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 #34 valS 137 VALYL-TRNA SYNTHETASE #35 jhp1244 80 putative #36 fumC 174 FUMARASE #37 jhp1318 101 putative #38 flgB 204 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN #39 ribC 74 RIBOFLAVIN SYNTHASE ALPHA CHAIN #40 ydiE 300 putative O-SIALOGLYCOPROTEIN ENDOPEPTIDASE #41 flgG_2 300 FLAGELLAR BASAL-BODY ROD PROTEIN (DISTAL ROD PROTEIN) Motif 1 ATTTGATTTTAAAACCTTAAAAAAATAGCATA 36 138 0 ACAAATTCCTTAAAAAGAGTGGTGG 37 3 1 CATGATTTAAAATCCCCTAAAAGCGATAGAAA 10 10 0 ACCCCAACTAAATCCCCTAAAAGACCGCTTTA 8 64 1 GGCATGTTAAAATTCCCTAAAATAACCCCATA 14 25 0 CTTAACAAAAAATCGCTTAAAAATTGAGAATA 28 18 0 GCGAACGGCTTAAAAGAATGAAAAT 6 3 1 AAAGGGTTAAAAAGCTTTAAAAGAGGGCAAAA 5 57 1 TTTTATTGACAAAACTTTAAAATCCGCAACCA 22 108 1 AAAACAAGACAAATCGTTAAAAAACTCGTTAA 18 20 1 ATCGTTAAAAAACTCGTTAAAAAGCTTGATTT 18 32 1 TGCGCTTAAATACCCCTTAAAAAGTGAGTTTA 0 268 1 TTTAATCCTTAAAATGATAGTATT 1 82 0 ATACCCCTAAAATACCTTAAGAGAACGCCTAT 38 37 0 GATAAGTATCAACCCCTTAAGATCGCTTTTTA 23 80 1 AGAGATTCGTAAGATCTTAAAAGAGGTA 35 62 1 TTCTTTACAAAAATCTCTAAAAATCGTTTTAA 15 52 1 TTAATTTTGCAAGGGTTTAAAAAGGGGTTTTG 38 182 1 TTTTTAACAAAAAGGTTTAAAAAAGATTTAAA 41 202 0 TATAGAGCAAACTCGCTTAAAA 25 0 0 AGCGCCCAAAACATGCTTAAAAA 33 1 0 TTACCCCTTAAATCCCCTAAGAACGCACCGCA 11 32 0 TACAAAAATCTCCTAAAATATTCGTATT 33 55 0 TTAAGCTGATAAAAGGCTAAAATTAAAATCTT 2 48 1 GCCCTATCCTTTAAAAACGCAAATTT 1 4 1 ATTTGAGCGATAAGCTTTAAAAAGCGTTATGG 22 27 1 GACTATCCTTTAAAACAACTCTTTT 24 165 0 CTCCCTTCAAACTAGCCTAAAAAGTCATTACA 17 102 0 TCATCGTTTCACTTCTTTAAAAGTGCTCGTAG 3 72 1 ACTAACTACAAAAAACTTAAAAAGCGATCTTA 23 97 0 TGATTACACTAATTCTTTAAGAATGCTTTAGC 12 180 1 TAAAAACCTTAATTTTTTAAAAACCATTTCCA 36 87 0 TATAAACACATCCTTAAGAATAATAAAAT 15 144 0 CTTTGATTTTTACTTCTTAAAATTGTAGTCTA 5 24 1 GTGCGAGATGAATCCCTGAAAAAGCCACTCAT 35 25 1 CTCCTAGTAAAATTACCTAAAAATTTCATGTT 8 267 1 AATGGTAACTAATAACCTAAAATTATACTATA 15 115 0 TTGAAATCATTCTCCCCTAAAAACCCCAACTA 8 42 1 AAGGTTTTTATAGCGTTTAAAAGCGCTAACGC 41 122 1 TATTATAATATAAAGTTTAAAAGTATGGCGCA 9 69 0 ATGGGAGCGATAATGTTTAAAAACATGCAGAA 3 181 0 TTTTCTACAATAGTGGTTAAAATCTTTAATCA 23 203 0 TCAAATCTAAAAAATGCTAAAAGCCTTTTTAC 24 85 0 GCTGAATGCTAACATGCTAAAACTAAAACCCT 37 34 1 AAACGTTACTAATAAGTTAAAATTCGTGAAAA 23 162 1 TTGTAGCAATTAAGTTTTAAAAACTCATTAAA 18 61 0 ATAAAATTTGACTTTGTTAAAAAAATTATGAT 12 88 1 TTTTGTAAAGAACGCTTGAAAAGGGCTAAATC 15 32 0 ATTGCTCTTAAAAGTTTTAAGACAATGAAGTT 5 177 0 AACTAAACTTAACAACCTAAGATTATAACAAA 41 266 0 ** ******** MAP Score: 62.9405 Motif 2 CATCGAGAATTTTTGAATCCTTTTTAACATTCTTTTC 0 54 0 ACCGCTTTAATTTTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAA 5 63 0 AGAATGAAAATTTTATCAAGGTTTTAATA 6 24 1 GTTTATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAATTT 36 135 1 TTTTTAATCCTTTTTAATCCTTTTTAAAATTAGGCAA 40 185 0 TTGACCTTGTTTTTATTAAAGATTTAAGGCTAGAATT 14 69 1 TAAACTCACTTTTTAAGGGGTATTTAAGCGCAAAGTC 0 263 0 TTATTGTTACTTATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTT 12 28 0 AAATCAAGCTTTTTAACGAGTTTTTTAACGATTTGTC 18 27 0 GTTATTCCTTGTTTTTAATTCAA 29 5 0 ATTATTTTGATTTTCTAAGCGTTTTTACAACAACACG 41 76 0 TCTTAAAACTTTTAAGAGCAATTTTAAAGTTCGTTGG 5 187 1 AAAATCTTAATTTTACTATAAATTTTATAACAAATAA 13 15 0 CCTTTATCCCTTATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGTG 16 12 1 CTTTTTTATCGCTTCAATTTAATCAAAATTAG 21 5 1 TCTTTATTCTTTATGCCAAGTATTTAATTTCCCATTC 40 18 1 AGCATAAGCCTTTTATAAAAACTTTAAACTTAATTGA 2 125 0 TTTTTTTTTTTTTTGAAACCGCTTTAATTTTTGCCCT 5 80 0 TTTTGGAATGTTTTTTGCATGCTTTAATTTTGCAAGG 38 159 1 CAAGTATCCTTTATTTTTAAATTTAAACTTAAAATT 12 9 1 ATTTCTTCATTTATAATGTAGTTTTTATGCGAAAGGC 31 17 1 TATCAACCCCTTAAGATCGCTTTTTAAGTTTTTTGTA 23 86 1 TTTTAGGGGATTTAGTTGGGGTTTTTAGGGGAGAATG 8 49 0 CTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTAGACTACAATTT 5 43 0 AATCCTTCAATTTATGGGGTTATTTTAGGGAATTTTA 14 13 1 CTTTCATTTATTTACCCCATCATTTTAGCATAAGCCT 2 151 0 GCGTTTATTTTACCCTATTCTTTAAGTTTTTAGCC 37 76 0 GCATTATAAATTAAATTTGCGTTTTTAAAGGATAGGG 1 11 0 TAGACTTACATTATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTT 15 104 1 TATTCTCAATTTTTAAGCGATTTTTTGTTAAGATAGA 28 18 1 GGTTTAAATCTTTTTTAAACCTTTTTGTTAAAAAGCG 41 200 1 ATCTTAGTTTTTATTTGATTTTTGCTATAATTTT 7 7 1 TTATTATTCTTTATATTTGGTCTTTTAGCATTACATG 0 153 1 AATTTCAAATTTAATACGAATATTTTAGGAGATTTTT 33 43 1 CCTACCAACATTAAGGCATTGATTTTAGATT 9 114 1 CTTATAAACTTTAAATCAAAGATTTTAATTTTAGCCT 2 61 0 CAATTTAATTTTAATTTGAAACTTTAAGCTGATAAAA 2 25 1 GGGCGGTAACTTTAAAGCGGTCTTTTAGGGGATTTAG 8 71 0 GGCGTTTATTACGACAATTTAGATTTTTTTGG 20 5 1 TTTTTAAAGCTTATCGCTCAAATTTAGAGTTTAACTC 22 13 0 ACTGACAAGGTTTTTATAGCGTTTAAAAGCGCTAACG 41 116 1 CATGCTTTAATTTTGCAAGGGTTTAAAAAGGGGTTTT 38 176 1 TTTCTATCGCTTTTAGGGGATTTTAAATCATGGCGAT 10 10 1 CAAAGTCAAATTTTATTTTAACTTTAGAGTGGTTTTA 12 67 0 TATCCCTGACTTTATTTTTTGATTTAGCCCTTTTCAA 15 12 1 GACTATCCTTTAAAACAACTCTTTTATTTTACATGG 24 154 0 AGTTATCCTTTAATTTAAAGAAATTCAAT 22 189 0 AATGGTTGGTTTTTGGAACGCCTTTTGCTTTTACGCT 34 74 0 ATAAAGCGTTTTATAACCTTGCTTTAGGTAATATCAT 23 40 0 AAAAGCTTGATTTAATGAGTTTTTAAAACTTAATTGC 18 51 1 TTGGGTGGTGTTTTTGCTTGAATTATACCTTGTTAGC 40 263 0 ATCATTCATCTTAAGGAACTCTTTTTGCTTGACTCCC 24 116 1 TAAAAAGCCATTTAGGAACAACTTTTGCTTTATTTTG 22 147 1 GCATAAGTTTTTATCTTACCCCTTAAATCCCCTAAGA 11 42 0 GCATGTTTTGTTTAATTTTGCATTATAAATTAAATTT 1 30 0 TTTATTATTCTTAAGGATGTGTTTATA 15 146 1 CGCCATACTTTTAAACTTTATATTATAATAAGAGACA 9 71 1 TCTTTAAGTTTTTAGCCATAACTTATAAGGGTTTTAG 37 56 0 TTTTTAAACATTATCGCTCCCATTATGGTAAAATAAA 3 190 1 AGTTAATTATTATTTTCCTTATGTTAGAATGCT 39 51 0 **** ****** MAP Score: 59.0171 Motif 3 CTCAATTAAGTTTAAAGTTTTTATAAAAGGCT 2 124 1 TTTAAAGCTTTTTAACCCTTTTTAGACTACAA 5 46 0 TTTAATCCTTTTTAATCCTTTTTAAAATTAGG 40 188 0 TTAAATCTTTTTTAAACCTTTTTGTTAAAAAG 41 203 1 TAAGATCGCTTTTTAAGTTTTTTGTAGTTAGT 23 97 1 GTAAAAAGGCTTTTAGCATTTTTTAGATTTGA 24 85 1 TATGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAAT 36 138 1 AAGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCAGCTTAA 2 48 0 CATAACGCTTTTTAAAGCTTATCGCTCAAATT 22 26 0 GGTTAAAATCTTTAATCATTATGGTTATTTTC 23 189 0 AAATCTTTGATTTAAAGTTTATAAGATTTTTG 2 73 1 GCGCCATACTTTTAAACTTTATATTATAATAA 9 70 1 TAAAAATCGTTTTAATGGTTATAATCCTTAAA 15 69 1 TCTGCATGTTTTTAAACATTATCGCTCCCATT 3 182 1 AAAAGCTTGATTTAATGAGTTTTTAAAACTTA 18 51 1 AATCAAGCTTTTTAACGAGTTTTTTAACGATT 18 31 0 TTTGGTCAAATTTAATCTTATTTTTGTTATAA 41 244 1 AATAAAAAGCTTTTATGCGTTTAAACTTCATT 5 154 1 TTTTCACGAATTTTAACTTATTAGTAACGTTT 23 162 0 GCGTTTATTTTACCCTATTCTTTAAGTTT 37 82 0 TATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTTACCATT 15 115 1 AAACTCACTTTTTAAGGGGTATTTAAGCGCAA 0 267 0 TCTTAAGGTATTTTAGGGGTATTTTACACTAT 38 47 1 CAAGTATTTATTTTACCATAATGGGAGCGATA 3 201 0 GAACGCTCTATTTTAGGATAATAACAATA 34 118 1 CTTTTTGTACTTTTATCTTAATTGAAACAACT 12 211 1 TATTCTCAATTTTTAAGCGATTTTTTGTTAAG 28 18 1 AATACGAATATTTTAGGAGATTTTTGTA 33 55 1 TTTCTATCGCTTTTAGGGGATTTTAAATCATG 10 10 1 TAAAGCGGTCTTTTAGGGGATTTAGTTGGGGT 8 64 0 ATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGTGTAACATG 16 24 1 ATTTATTCCTTTTATTTGAATGA 4 11 0 TGGTGTTAGTTTTATTCTTTTTGGAAAGGAAA 0 26 1 AAGATTTATCCATTTTGATGTTGTTA 16 69 0 CTTTGTGCATTTTTTAGATTTTATCACCAACG 8 148 1 TAACGAGTTTTTTAACGATTTGTCTTGTTTTC 18 19 0 GGTTGCGGATTTTAAAGTTTTGTCAATAAAAA 22 107 0 ATTTTATCTTTTGATTTGGTGTT 0 1 1 TTTAATCCTTAAAATGATAGTA 1 84 0 ATTATAGTTATTTAAAGCTTAAATAAGGGTCT 21 50 1 ATCTCATCTCTTTATTCTTTATGCCAAGTATT 40 10 1 TCCCTTTATCCCTTATGCTCTTTATT 16 4 1 TGACAAGGTTTTTATAGCGTTTAAAAGCGCTA 41 118 1 TATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTTAAAAAT 12 22 0 CCTTGTTTATTTTTTGCTGTTTGCAGGAACGC 31 62 1 AAAAAGCTTATTTTACGCTATAATGCGATCTT 9 37 0 TTGAGCGCATTTTTATGCTATACTCAAAAATC 2 97 0 TCAAATTTTATTTTAACTTTAGAGTGGTTTTA 12 67 0 TCTTAGGGGATTTAAGGGGTAAGATAAAAACT 11 42 1 GCTTTTATCCTATGGTTTTATTTA 39 2 1 GAACATGAAATTTTTAGGTAATTTTACTAGGA 8 268 0 ATTAAAACGATTTTTAGAGATTTTTGTAAAGA 15 53 0 TACCCCATCATTTTAGCATAAGCCTTTTATAA 2 144 0 TTTGCTATAATTTTTTCTTTTAAAAGGATTAT 7 30 1 CCTGACTTTATTTTTTGATTTAGCCCTTTTCA 15 16 1 ATAATGTAGTTTTTATGCGAAAGGCATTTTTC 31 29 1 GATCGCATTCTTTAATGAGAAGCGAGCTGATT 38 129 1 AATCCTTCAATTTATGGGGTTATTTTAGGGAA 14 13 1 CGCTCATTAGTTTTTGGTTTAAAGGCTTTAGA 40 226 1 TTGAACAAAGTTTATTGGTATAAAAAAGTGAA 40 72 0 ***** * **** MAP Score: 55.6444 Motif 4 ATTTTTTCTTTTAAAAGGATTATTGC 7 39 1 TAGTTTTTGGTTTAAAGGCTTTAGAGTGTTG 40 233 1 CATAGTTTTGTAAAAAGGCTTTTAGCATTTT 24 76 1 AAAAGAATGTTAAAAAGGATTCAAAAATTCT 0 55 1 TAAAAAGGATTAAAAAGGATTAAAAAATAGC 40 196 1 AATTGTAGTCTAAAAAGGGTTAAAAAGCTTT 5 44 1 ATGAACTGACTAAAAGGGTTTTAAATA 5 243 1 AAAGAGTTGTTTTAAAGGATAGTC 24 166 1 AATTTGCGTTTTTAAAGGATAGGGC 1 4 0 TTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTT 5 57 0 ATTATAACCATTAAAACGATTTTTAGAGATT 15 63 0 TAAAGTTTTTATAAAAGGCTTATGCTAAAAT 2 136 1 GCATTTAAATTAAAAAGGATAGTCCA 34 5 0 TTGATTAAAATAAAAAGCTTTTATGCGTTTA 5 146 1 ACCTTTTTGTTAAAAAGCGTTTCAAGTTTGG 41 218 1 CGATAAGCTTTAAAAAGCGTTATGGGGGGTG 22 34 1 AAACTCACTTTTTAAGGGGTATTTAAGCGCA 0 268 0 AGCCATAACTTATAAGGGTTTTAGTTTTAGC 37 49 0 TCTTAGGGGATTTAAGGGGTAAGATAAAAAC 11 42 1 AGGGCAAAAATTAAAGCGGTTTCAAAAAAAA 5 80 1 CAATCCAATAATAAAGGGCTTGCGAAAAGCG 8 107 0 ATTATAGTTATTTAAAGCTTAAATAAGGGTC 21 50 1 CGTGTTGTTGTAAAAACGCTTAGAAAATCAA 41 76 1 CTTTAAGCTGATAAAAGGCTAAAATTAAAAT 2 46 1 AAGTGAGTTTAAAAAAGGCTT 0 289 1 ATTCTCAATTTTTAAGCGATTTTTTGTTAAG 28 19 1 CCTATTTTTAAAAAAGGGCTTTTTGAATACT 23 126 0 GCAAGGGTTTAAAAAGGGGTTTTG 38 190 1 CGCTTTTTAACAAAAAGGTTTAAAAAAGATT 41 206 0 AAAAAGCGATCTTAAGGGGTTGATACTTATC 23 80 0 CGTTAGCGCTTTTAAACGCTATAAAAACCTT 41 122 0 ATTTCTTTAAATTAAAGGATAACT 22 194 1 AAGCAAGGTTATAAAACGCTTTATTTTGATA 23 53 1 ACTTCAAGCGCTAAAGGCGTTTAAGGTTTCT 41 158 1 AAATTTGATTTTAAAACCTTAAAAAAATAGC 36 141 0 CTTAATTTTTTAAAAACCATTTCCACAATTT 36 81 0 TTTTCATTCTTTTAAGCCGTTCGC 6 3 0 ACCTACCAACATTAAGGCATTGATTTTAGAT 9 113 1 TAAAATCCCCTAAAAGCGATAGAAA 10 4 0 TGCTTTCATATTAAAGCCCTATTTTACTGAA 31 108 1 TCATGTTACACTAAAAGCTTAAATAAAGAGC 16 26 0 TAAATTTAAAAATAAAGGATACTTG 12 4 0 AGCGTAAAAGCAAAAGGCGTTCCAAAAACCA 34 74 1 ACCTTCTACTTAAAAACCTTAATTTTTTAAA 36 98 0 AGTATGGCGCAAAAAAGCTTATTTTACGCTA 9 49 0 AAATAAAGAGCATAAGGGATAAAGGGA 16 6 0 AACATATTAAATAAAACCATAGGATAAAAGC 39 10 0 GGAAATTTTCAATAAGGCTTAGAGAAACTTT 18 97 1 CAATCATTCTAAAAAGCCATTTAGGAACAAC 22 138 1 ******** ** MAP Score: 51.6326 Motif 5 GAAAATTTTATCAAGGTTTTAATA 6 29 1 TGCTATTTTTTTAAGGTTTTAAAATCAAATTT 36 140 1 CCCCATAAATTGAAGGATTTTA 14 0 0 TTTTAAAAAATTAAGGTTTTTAAGTAGAAGGT 36 97 1 TGAACTGACTAAAAGGGTTTTAAATA 5 244 1 GCCATAACTTATAAGGGTTTTAGTTTTAGCAT 37 47 0 AATGCCACTGACAAGGTTTTTATAGCGTTTAA 41 110 1 TAGTTTTGTAAAAAGGCTTTTAGCATTTTTTA 24 78 1 TACTATCATTTTAAGGATTAAA 1 84 1 CCTAATTTTAAAAAGGATTAAAAAGGATTAAA 40 188 1 CTTTTTAACAAAAAGGTTTAAAAAAGATTTAA 41 203 0 AGTCTAAAATTTAAGGATTATAACCATTAAAA 15 78 0 TTGTAGTCTAAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAAA 5 46 1 AGCAACACTCTAAAGCCTTTAAACCAAAAACT 40 234 0 ACTCATTAAATCAAGCTTTTTAACGAGTTTTT 18 39 0 CTTATCAAAATAAAGCGTTTTATAACCTTGCT 23 54 0 TTAAACGCATAAAAGCTTTTTATTTTAATCAA 5 146 0 TCATTTTAGCATAAGCCTTTTATAAAAACTTT 2 137 0 AGACCCTTATTTAAGCTTTAAATAACTATAAT 21 50 0 AATTTGAGCGATAAGCTTTAAAAAGCGTTATG 22 26 1 AAATTGCTCTTAAAAGTTTTAAGACAATGAAG 5 179 0 CTTGTTTTTATTAAAGATTTAAGGCTAGAATT 14 74 1 AAACTTTAAATCAAAGATTTTAATTTTAGCCT 2 61 0 TCAATTAAGTTTAAAGTTTTTATAAAAGGCTT 2 125 1 ACCATAATGATTAAAGATTTTAACCACTATTG 23 196 1 CATGTTACACTAAAAGCTTAAATAAAGAGCAT 16 24 0 AATCTTTGATTTAAAGTTTATAAGATTTTTGA 2 74 1 TTATTATAATATAAAGTTTAAAAGTATGGCGC 9 70 0 AAGAATGTTAAAAAGGATTCAAAAATTCTCGA 0 57 1 AGTCTCATGCAGAAACCTTAAACGCCTTTAGC 41 167 0 TCTGCATGAGACTAGGTTTAAATCTTTTTTAA 41 186 1 GTTACAATACTTAAGCATTCTAACATAAGGAA 39 38 1 AGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCAGCTTAAA 2 47 0 TTTTATCAGCTTAAAGTTTCAAATTAAAATTA 2 30 0 AATTGTAGCAATTAAGTTTTAAAAACTCATTA 18 63 0 TACCCTATTCTTTAAGTTTTTAGCCATAACTT 37 69 0 TTATAGTAAAATTAAGATTTTATAATCAAAGT 13 31 1 ATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTTAAAAATA 12 21 0 TTATAACAAAAATAAGATTAAATTTGACCAAA 41 244 0 * **** ***** MAP Score: 50.1464 Motif 6 ATCGCTCCCATTATGGTAAAATAAATACTTGCTTAAACACGCT 3 202 1 CACTCTAAAGTTAAAATAAAATTTGACTTTGTTAAAAAAATTA 12 73 1 TATTGTTATTATCCTAAAATAGAGCGTTCCTTCAAAAATGG 34 106 0 TTAATCTTATTTTTGTTATAATCTTAGGTTGTTAAGTTTAGTT 41 255 1 GTTATAAAATTTATAGTAAAATTAAGATTTTATAATCAAAGTC 13 21 1 TTAACATGCCTTATCTTATAATTTGACCTTGTTTTTATTAAAG 14 47 1 TAGACTTACATTATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTTACCATT 15 104 1 AAAGCTTATTTTACGCTATAATGCGATCTTTATTAAATTACCA 9 24 0 TCTCCATTTCTTCATTTATAATGTAGTTTTTATGCGAAAGGCA 31 12 1 TTATTGTTACTTATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTTAAAAAT 12 22 0 TGGGTGGTGTTTTTGCTTGAATTATACCTTGTTAGCAACACTC 40 256 0 AAACGCAAATTTAATTTATAATGCAAAATTAAACAAAACATGC 1 24 1 TTGGGCGCTTTTGTTGTATAATTTCAAATTTAATACGAATATT 33 24 1 AAAGCTAATTTTTCACTTAAATGATGCGTTTTTTCTATTATAA 3 18 0 TTAAAGTTCGTTGGCGTATAATATCCATTTTGAATGAACTGAC 5 210 1 TATGGTTTCGTTTAGGTTTAATTAAAATTTGCTACAATTAAAT 24 37 0 GAGAAAAGTTTTTGTTTTTAATGAAGCGTTGGTGATAAAATCT 8 163 0 TTTATTTGATTTTTGCTATAATTTTTTCTTTTAAAAGGATTAT 7 19 1 GACTATCCTTTTTAATTTAAATGCTTTGTTGTATAATTTTGAA 34 12 1 ATTATTTTCCTTATGTTAGAATGCTTAAGTATTGTAACATATT 39 33 0 TTAATCAAAATTAGATTACAATATTATAGTTATTTAAAGCTTA 21 28 1 TATAAAAGGCTTATGCTAAAATGATGGGGTAAATAAATGAAAG 2 145 1 ACAAAGTTTATTGGTATAAAAAAGTGAATTGATAAAAATACCC 40 57 0 AGATAAAAACTTATGCTATAATGCGGTTTCATTCCATATTCAA 11 63 1 TTAAGCGAGTTTGCTCTATAATAAGACATCTTTAATAAGGAAG 25 12 1 CCTCTCGTTATTTTTCTACAATAGTGGTTAAAATCTTTAATCA 23 203 0 CATAAAAGCTTTTTATTTTAATCAAACCTAACTAATAAGAAAC 5 128 0 TTTTTTGTAGTTAGTATTCAAAAAGCCCTTTTTTAAAAATAGG 23 114 1 TTAAGGGACTTTGCGCTTAAATACCCCTTAAAAAGTGAGTTTA 0 257 1 ATAAGGCGATTTTGACTAGAATAGCGGTCTCTTATGGTTGGTT 17 37 0 TAGGGGTATTTTACACTATAATGGCTCTGAATTGGCTTATCGC 38 60 1 TAAATTTCCTTTTAATTAAAAAGAGGTTTCTAGTTGTTTCAA 12 232 0 ATTGTAGCAATTAAGTTTTAAAAACTCATTAAATCAAGCTTTT 18 51 0 CATACCTCAATTTAATTTTAATTTGAAACTTTAAGCTGATAAA 2 18 1 ** ** *** ** * MAP Score: 50.0534 Motif 7 TTTCCTTTCCAAAAAGAATAAAACTAACACCA 0 26 0 AAAGACCAAATATAAAGAATAATAACCCTGGT 0 146 0 CATGTAATGCTAAAAGACCAAATATAAAGAAT 0 158 0 TTAAGGGGTATTTAAGCGCAAAGTCCCTTAAT 0 256 0 ATACTATCATTTTAAGGATTAAA 1 83 1 AAAGTTTCAAATTAAAATTAAATTGAGGTATG 2 18 0 TTTAAGCTGATAAAAGGCTAAAATTAAAATCT 2 47 1 TCAAAAATCTTATAAACTTTAAATCAAAGATT 2 74 0 AATGCGCTCAATTAAGTTTAAAGTTTTTATAA 2 118 1 AAACGCATCATTTAAGTGAAAAATTAGCTTTT 3 30 1 ATCATTCAAATAAAAGGAATAAAT 4 10 1 ATTGTAGTCTAAAAAGGGTTAAAAAGCTTTAA 5 45 1 AAGCGGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAACAATT 5 93 1 TTAGGTTTGATTAAAATAAAAAGCTTTTATGC 5 140 1 AAATTGCTCTTAAAAGTTTTAAGACAATGAAG 5 179 0 GCAAAAATCAAATAAAAACTAAGAT 7 3 0 ATAATCCTTTTAAAAGAAAAAATTATAGCAAA 7 30 0 AGCGTTGGTGATAAAATCTAAAAAATGCACAA 8 150 0 CAACGCTTCATTAAAAACAAAAACTTTTCTCA 8 175 1 TTATTATAATATAAAGTTTAAAAGTATGGCGC 9 70 0 TAAGTTTAAATTTAAAAATAAAGGATACTTG 12 9 0 ATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTTAAAAATA 12 21 0 AGTTGTTTCAATTAAGATAAAAGTACAAAAAG 12 211 0 GACTTTGATTATAAAATCTTAATTTTACTATA 13 32 0 CTTGTTTTTATTAAAGATTTAAGGCTAGAATT 14 74 1 CATGTTACACTAAAAGCTTAAATAAAGAGCAT 16 24 0 ATTTTAAAAGAAAACAAGACAAAT 18 2 1 TTAATGAGTTTTTAAAACTTAATTGCTACAAT 18 62 1 ATGCTACCCAAAAAAATCTAAATTGTCGTAAT 20 17 0 CAGACCCTTATTTAAGCTTTAAATAACTATAA 21 51 0 ATCTATGCAAAATAAAGCAAAAGTTGTTCCTA 22 159 0 ATTTCTTTAAATTAAAGGATAACT 22 194 1 TACTAACTACAAAAAACTTAAAAAGCGATCTT 23 98 0 AAACGTTACTAATAAGTTAAAATTCGTGAAAA 23 162 1 ATTTGCTACAATTAAATAAAAACGATGATTTT 24 22 0 GCAAATTTTAATTAAACCTAAACGAAACCATA 24 48 1 CCATTCTGTTATAAAATATAAAAAATCAAATC 31 174 1 CAACAAAGCATTTAAATTAAAAAGGATAGTCC 34 11 0 TTATCTTAATTTAAAGGTCAAAACG 36 3 0 GAAATGGTTTTTAAAAAATTAAGGTTTTTAAG 36 89 1 AAGTTATGGCTAAAAACTTAAAGAATAGGGTA 37 69 1 ACGCCTATTCAAAAAACCAAAATAAGGAAATC 38 13 0 AATACTTGGCATAAAGAATAAAGAGATGAGAT 40 10 0 GCCTAATTTTAAAAAGGATTAAAAAGGATTAA 40 187 1 CTCTAAAGCCTTTAAACCAAAAACTAATGAGC 40 227 0 TTATAGCGTTTAAAAGCGCTAACGCATTCACT 41 129 1 AAAAGGTTTAAAAAAGATTTAAACCTAGTCTC 41 193 0 TTATAACAAAAATAAGATTAAATTTGACCAAA 41 244 0 TTAAGTTTAGTTAAAGGGAAAACC 41 286 1 ****** **** MAP Score: 35.2314 Motif 8 TTCTACTTAAAAACCTTAATTTTTTAAAAACCA 36 93 0 CTTTAAAACAACTCTTTTATTTTACATGGTGGG 24 150 0 TGTTTTTTGCATGCTTTAATTTTGCAAGGGTTT 38 167 1 CAAGTATCCTTTATTTTTAAATTTAAA 12 4 1 TTTGATTATAAAATCTTAATTTTACTATAAATT 13 28 0 AAGGTTATAAAACGCTTTATTTTGATAAGTATC 23 57 1 AGTTATTGCGTTCCTTTGATTTTTACTTCTTAA 5 11 1 TTTAAATCAAAGATTTTAATTTTAGCCTTTTAT 2 56 0 AACGCATAAAAGCTTTTTATTTTAATCAAACCT 5 142 0 AGTTATCCTTTAATTTAAAGAAATTCA 22 191 0 TCAAACCCTTTCATTTATTTACCCCAT 2 168 0 GTTATTCCTTGTTTTTAATTCAA 29 7 0 GATCTCCATTTCTTCATTTATAATGTAGTT 31 7 1 AGGAACAACTTTTGCTTTATTTTGCATAGATTG 22 160 1 AACTCGTTAAAAAGCTTGATTTAATGAGTTTTT 18 42 1 GTCAGTGGCATTATTTTGATTTTCTAAGCGTTT 41 89 0 TAAAATCCTTCAATTTATGGGGTTAT 14 3 1 TAATGGTTATAATCCTTAAATTTTAGACTTACA 15 81 1 TCTTATAATTTGACCTTGTTTTTATTAAAGATT 14 60 1 CTAGTCAAAATCGCCTTATTTTTGCGCTATGAT 17 61 1 CCCTGACTTTATTTTTTGATTTAGCCCTTTTCA 15 15 1 TATAGCATGTTTTGTTTAATTTTGCATTATAAA 1 38 0 GATTTTCTTGTTATCTTAATTTAAAGGTCAAAA 36 12 0 TTATCCCTTATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGT 16 15 1 CTTTTATCCTATGGTTTTATTTAATATGTTACA 39 11 1 CATTGAGAAAAGTTTTTGTTTTTAATGAAGCGT 8 177 0 CCTAAAATCATCGTTTTTATTTAATTGTAGCAA 24 19 1 AACTTTAGAGTGGTTTTAATTTATTGTTACTTA 12 52 0 TGGTCAAATTTAATCTTATTTTTGTTATAATCT 41 246 1 AGAAACTGAAATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 5 101 0 TTTTTTTGAAACCGCTTTAATTTTTGCCCTCTT 5 77 0 CTTTTTTATCGCTTCAATTTAATCAAAATT 21 7 1 ATGGCGCAAAAAAGCTTATTTTACGCTATAATG 9 44 0 ATTTATTCCTTTTATTTGAATGAT 4 7 0 TAACAAAGTCAAATTTTATTTTAACTTTAGAGT 12 74 0 TTTTGCTATAATTTTTTCTTTTAAAAGGATTAT 7 29 1 CAGGGTTATTATTCTTTATATTTGGTCTTTTAG 0 148 1 TGGACTATCCTTTTTAATTTAAATGCTTTG 34 7 1 TAAATTTCCTTTTAATTAAAAAGAGGTT 12 246 0 ACGATTTGTCTTGTTTTCTTTTAAAAT 18 4 0 GCTATAATTTTAAGTTTAAATTTAAAAATAAAG 12 18 0 GGGTGGTGTTTTTGCTTGAATTATACCTTGTTA 40 265 0 TTAAGATTTGATTTTTTATATTTTATAACAGAA 31 177 0 CCATACTTTTAAACTTTATATTATAATAAGAGA 9 73 1 ATCTTAGTTTTTATTTGATTTTTGCT 7 3 1 * **** ***** MAP Score: 34.7327 Motif 9 AAATTAAATTTGCGTTTTTAAAGGATAGGG 1 11 0 TTTTCTTTATAGCATGTTTTGTTTAATTTT 1 48 0 ACTTAAATGATGCGTTTTTTCTATTATAAT 3 17 0 CTTAACATTCTGCATGTTTTTAAACATTAT 3 174 1 CAAATCTCCTAGCGTGTTTAAGCAAGTATT 3 225 0 AAGTTATTGCGTTCCTTTGATTTTTAC 5 7 1 AACTTTTAAGAGCAATTTTAAAGTTCGTTG 5 193 1 GTAACTTTAAAGCGGTCTTTTAGGGGATTT 8 73 0 AATGCCTTTGTGCATTTTTTAGATTTTATC 8 143 1 TTTCTTGCGGTGCGTTCTTAGGGGATTTAA 11 27 1 AAAAAGCTAAAGCATTCTTAAAGAATTAGT 12 187 0 AGGGAATTTTAACATGCCTTATCTTATAAT 14 39 1 GCCCTTTTCAAGCGTTCTTTACAAAAATCT 15 38 1 TGACTAGAATAGCGGTCTCTTATGGTTGGT 17 38 0 AACATTCCTTAGCTTGCTTTTTAACAATAT 20 70 0 ATAACATTCCTTAGCTTGCTTT 20 80 0 ACAAATAAATAGGGGGTTTTGTAACACCAC 22 62 0 AAACTTAAAAAGCGATCTTAAGGGGTTGAT 23 87 0 AAATAACGAGAGGGTTTGTAAAAATTCCCA 23 233 1 AAAGGCTTTTAGCATTTTTTAGATTTGATC 24 89 1 TCAATTTTTAAGCGATTTTTTGTTAAGATA 28 23 1 ACTTTTTCTTAGCGTTCCTGCAAACAGCAA 31 75 0 ATTTAACTTAAGCAGGTTTTATCCAATAAG 31 139 0 TTTTTAAGCATGTTTTGGGCGCTTTT 33 6 1 CCTAAAATAGAGCGTTCCTTCAAAAATGGT 34 105 0 TCCAACTTTAAGCATGCTTTGAAATTGATC 38 103 1 GAATGTTTTTTGCATGCTTTAATTTTGCAA 38 164 1 ATAGTCAGCAAGCTAGTTTTGAAAGATGAC 40 115 1 TTCAATGAAAAGCGTGTTGTTGTAAAAACG 41 64 1 TGATTTTCTAAGCGTTTTTACAACAACACG 41 76 0 ********** MAP Score: 4.56663 Motif 10 TTGGAAAGGAAAAGAATGTTAAAAAGGATTCAAA 0 46 1 CTTTGCGCTTAAATACCCCTTAAAAAGTGAGTTT 0 265 1 AAGCCTTTTTTAAACTCACTTTTT 0 286 0 GCCCTATCCTTTAAAAACGCAAATTT 1 2 1 AAAATTAAACAAAACATGCTATAAAGAAAATTCA 1 48 1 TGGTAAAATAAATACTTGCTTAAACACGCTAGGA 3 215 1 ACGAACTTTAAAATTGCTCTTAAAAGTTTTAAGA 5 187 0 ATTTTGAAATCATTCTCCCCTAAAAACCCCAACT 8 39 1 AACCCCAACTAAATCCCCTAAAAGACCGCTTTAA 8 63 1 GCCATGATTTAAAATCCCCTAAAAGCGATAGAAA 10 10 0 GTAAGATAAAAACTTATGCTATAATGCGGTTTCA 11 60 1 CAATAAATTAAAACCACTCTAAAGTTAAAATAAA 12 59 1 TAACAAAGTCAAATTTTATTTTAACTTTAGAGTG 12 73 0 GTTATGCTATCATAATTTTTTTAACAAAGTCAAA 12 94 0 CTTTTGATTACACTAATTCTTTAAGAATGCTTTA 12 176 1 AAGGCATGTTAAAATTCCCTAAAATAACCCCATA 14 25 0 CGTTCTTTACAAAAATCTCTAAAAATCGTTTTAA 15 50 1 TAATAACCTAAAATTATACTATAATGTAAGTCTA 15 104 0 TATAAACACATCCTTAAGAATAATAAAA 15 145 0 CACCCCCCATAACGCTTTTTAAAGCTTATCGCTC 22 31 0 AATCCGCAACCAATCATTCTAAAAAGCCATTTAG 22 128 1 TTATCAAAATAAAGCGTTTTATAACCTTGCTTTA 23 51 0 AGTATTCAAAAAGCCCTTTTTTAAAAATAGGTTA 23 126 1 GGTTTGTAAAAATTCCCACCAAAAAACAAGGAGC 23 245 1 GCCAATCTCCCTAAAATCATCGTTTT 24 2 1 GATCAAATCTAAAAAATGCTAAAAGCCTTTTTAC 24 85 0 TATTATAGAGCAAACTCGCTTAAAA 25 1 0 TATCTTAACAAAAAATCGCTTAAAAATTGAGAAT 28 19 0 GACCTATTTCTTTCATCCTAAAAATATTTGAAA 28 81 0 TTTCGCATAAAAACTACATTATAAATGAAGAAAT 31 17 0 CTTATTGGATAAAACCTGCTTAAGTTAAATTGAT 31 139 1 AAAGCGCCCAAAACATGCTTAAAAA 33 1 0 TACAAAAATCTCCTAAAATATTCGTATT 33 55 0 GTAAAAGCAAAAGGCGTTCCAAAAACCAACCATT 34 77 1 AAACTCTTATACCTTCTACTTAAAAACCTTAATT 36 105 0 TTATAGTGTAAAATACCCCTAAAATACCTTAAGA 38 47 0 GATCAATTTCAAAGCATGCTTAAAGTTGGAGCGA 38 99 0 AAGCATGCAAAAAACATTCCAAAATCAGCTCGCT 38 149 0 CAAAACCCCTTTTTAAACCCTTGCAAA 38 187 0 AATCCTTTTTAATCCTTTTTAAAATTAGGCAATT 40 183 0 GACTAGGTTTAAATCTTTTTTAAACCTTTTTGTT 41 195 1 CTTTTTTAAACCTTTTTGTTAAAAAGCGTTTCAA 41 209 1 ** * * ****** MAP Score: 3.48095 Motif 11 TATATTTGGTCTTTTAGCATTACATGTTATT 0 164 1 AATTTGCGTTTTTAAAGGATAGGGC 1 4 0 AAAGATTTTAATTTTAGCCTTTTATCAGCTT 2 50 0 AAGATTTTTGAGTATAGCATAAAAATGCGCT 2 95 1 CTCAATTAAGTTTAAAGTTTTTATAAAAGGC 2 124 1 TTACCCCATCATTTTAGCATAAGCCTTTTAT 2 146 0 GGGTAAATAAATGAAAGGGTTTGA 2 171 1 TTTGCCCTCTTTTAAAGCTTTTTAACCCTTT 5 57 0 GGGCGGTAACTTTAAAGCGGTCTTTTAGGGG 8 77 0 ACCTACCAACATTAAGGCATTGATTTTAGAT 9 113 1 TCTTAGGGGATTTAAGGGGTAAGATAAAAAC 11 42 1 ATGAAACCGCATTATAGCATAAGTTTTTATC 11 64 0 TATGCTATAATTTTAAGTTTAAATTTAAAAA 12 23 0 TAAAAAAATTATGATAGCATAACGAAGCATT 12 105 1 TAAAATCTTAATTTTACTATAAATTTTATAA 13 22 0 AATCCTTCAATTTATGGGGTTATTTTAGGGA 14 13 1 TTTATTAAAGATTTAAGGCTAGAATT 14 80 1 TAAGTCTAAAATTTAAGGATTATAACCATTA 15 81 0 TTATACTATAATGTAAGTCTAAAATTTAAGG 15 94 0 TTATAGTATAATTTTAGGTTATTAGTTACCA 15 114 1 TATGCTCTTTATTTAAGCTTTTAGTGTAACA 16 23 1 TTGTAATGACTTTTTAGGCTAGTTTGAAGGG 17 101 1 GTGTTTAGCCTTACAAAAAATT 19 46 0 ATTATAGTTATTTAAAGCTTAAATAAGGGTC 21 50 1 CATAACGCTTTTTAAAGCTTATCGCTCAAAT 22 27 0 ATTTCTTTAAATTAAAGGATAACT 22 194 1 TGTAAAAAGGCTTTTAGCATTTTTTAGATTT 24 84 1 AAAGAGTTGTTTTAAAGGATAGTC 24 166 1 TTTTTAAGCATGTTTTGGGCGC 33 1 1 TAATACGAATATTTTAGGAGATTTTTGTA 33 54 1 GGAACGCTCTATTTTAGGATAATAACAATA 34 117 1 TAGTTTTAGCATGTTAGCATTCAGCCACCAC 37 28 0 CTCTTAAGGTATTTTAGGGGTATTTTACACT 38 46 1 ATTCAGAGCCATTATAGTGTAAAATACCCCT 38 61 0 AAAACCCCTTTTTAAACCCTTGCAAAATTAA 38 182 0 AGATGACAACTTTTTAGGCTTGGCTAGTTGC 40 138 1 TAGTTTTTGGTTTAAAGGCTTTAGAGTGTTG 40 233 1 TTCAAGCTGGATTTTGGCGTATTTCTTCAAT 41 39 1 TGACAAGGTTTTTATAGCGTTTAAAAGCGCT 41 118 1 ******** ** MAP Score: 3.37289