AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i MJ/MJ_operons002_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239803 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 MJ0006 300 formate dehydrogenase, alpha subunit #1 MJ0030 300 coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit (frcD) #2 MJ0100 226 conserved hypothetical protein #3 MJ0153 239 acetyl-CoA decarbonylase/synthase, subunit alpha (cdhA) #4 MJ0154 43 acetyl-CoA decarbonylase/synthase, subunit epsilon (cdhB) #5 MJ0199 113 ferredoxin #6 MJ0264 41 carbon monoxide dehydrogenase, iron sulfur subunit CooF-1 (cooF1) #7 MJ0265 42 carbon monoxide dehydrogenase, iron sulfur subunit CooF-1 (cooF2) #8 MJ0266 27 pyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit beta (porB) #9 MJ0267 21 pyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha (porA) #10 MJ0269 283 pyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit gamma (porG) #11 MJ0514 43 polyferredoxin (mvhB) #12 MJ0516 113 carbon monoxide dehydrogenase, hydrogenase subunit CooL (cooL) #13 MJ0519 181 M. jannaschii predicted coding region MJ0519 #14 MJ0520 192 NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 1 #15 MJ0522 108 NADH dehydrogenase I #16 MJ0524 123 conserved hypothetical protein #17 MJ0528 74 conserved hypothetical protein #18 MJ0529 132 repressor protein, putative #19 MJ0870 176 coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit (frhB) #20 MJ0934 300 polyferredoxin (mvhB) #21 MJ1027 125 formate hydrogenlyase, subunit 5 #22 MJ1165 238 formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E (tungsten) (fwdE) #23 MJ1167 47 formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G (tungsten) (fwdG) #24 MJ1169 26 formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A (tungsten) (fwdA) #25 MJ1170 32 conserved hypothetical protein #26 MJ1171 25 formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten) (fwdC) #27 MJ1190.1 300 vhuD protein #28 MJ1191 300 methylviologen-reducing hydrogenase, gamma chain (vhuG) #29 MJ1192 33 methylviologen-reducing hydrogenase, alpha chain (vhuA) #30 MJ1193 176 polyferredoxin (mvhB) #31 MJ1306 21 conserved hypothetical protein #32 MJ1309 37 carbon monoxide dehydrogenase, hydrogenase anchor subunit CooM (cooM) #33 MJ1310 83 conserved hypothetical protein #34 MJ1350 114 formylmethanofuran dehydrogenase, subunt C (tungsten) #35 MJ1351 300 glutamate synthase (gltB) #36 MJ1363 300 formate hydrogenlyase, subunit 7 #37 MJ1682 108 heat shock protein HtpX, possibly protease (htpX) Motif 1 TAAAACTTAGACAAAAATAAACACAGAGAATTT 0 247 1 AAGGGATTAAAAAAGATAAAAAGTTATAATAT 6 19 0 AAAAATATCAAAAAATATAAATACACATTTGGG 19 46 1 AAAAGCTATTAAAAACATAAATATTAAT 33 5 0 CAATTAATCGATAAATTTAAATATTTTTAAAAT 20 266 1 TAGAAAGTTAAAAAATAATTAAAA 27 1 1 AATCTTTTAGAGAAAGTTAAATAGAA 32 3 0 TTAAAAATTAAAAAATTTAAATAGAACTTTCAC 34 89 0 TTGAGAATTTAAAATAATAAAAAGTGGCCGGCG 20 107 0 CCAACAATTATAAACATGATAATAGG 21 109 0 AGTGTCATTCTCAAAAATAAATACAACATCATT 10 113 1 AATACAACCATAAAAAATAAATATTATAATGAT 22 30 0 GATTAAAAGATTAAAAATAAAAACATGAGGAAG 35 270 1 TAGTGATGTATAAAATATAAATAGATTATGCTT 36 247 0 AATACCTTAAAGAATATTAAAAATCATTAAAAG 23 16 1 TAAATAAGATAGAATTTTAAATAAGTATTACTA 0 64 0 CAACCTACTTATAATCTTAAAAATCCGAAAGAT 36 134 1 CATTGACATAATAAATATTAAAAAAGGTATCAA 0 171 1 TTGGAAATAAACAAAGATTAAAAGATTAAAAAT 35 255 1 ATTCCTCCCAATAAATTTTAAGAGGCATTGCTT 12 86 0 TCAATCATTAACAATTATTAAAAGTAATATATA 10 237 0 ATATCGGAAAACAATAATTAAAATTTAAAATAA 5 19 0 TCCCTACAAAACAATTTTTAAAATGCGTAATTT 3 87 1 GGTTAGTTTTTAAAACTTTAATATATAAAGTTT 3 179 0 CTCTTAAAAATAAAACTTTAAAATTGAAAAATT 36 62 1 TAGAACTTTCACAAATAAAAATACTTTATTGAA 34 11 1 TATCGAGTTTATAAAATTAATAATATATAGGGG 27 213 1 ATTGCTAAATAGAAAATAAAAAAGAA 2 3 0 AATTATTAAATCAATTATTAACATTTTAGAG 5 92 1 GTAATCCCTAAAATATATAAAAAGAGATATAAA 2 83 0 ATCATAATTAATAATGATAATTAGCTTAACCTT 21 42 0 TAAAAAATAATAAGCCGGTGATG 26 0 1 TTAATTGTTCTAAAATAAAAAGAAGCCCGGCAA 20 240 0 ATAGTGTTTTTCAAACTTAATAAAATTTCTAAG 2 118 1 TGGTATTGGAAAATTAATAAAAAGTATTACTAA 36 93 0 TCTTGCTCACATATTTATAAATAGTTCAACATA 22 124 0 CTTTTTTTACTAAAATTAAAATAGTTTTTGGTG 7 19 1 CTTCAGAAATTTAAAGTAAAAGAATTAGGAG 4 8 0 TAATTAAAATTTAAAATAAAATATGGAG 5 5 0 AAGCAAGAAATTAAATTAAAAAATCTATTATGC 36 196 1 TTTAGGCATAAGAAAAAATAAAATTAATTTACA 10 170 0 AAAGTTACCCACAAAAAATAAGACGAAAAGTTT 18 48 0 ATTAAGCATAAATAATAAAATAAGGGTGAA 29 7 1 CTATTTGTCATTAATGATAATGATAAATTACTG 36 277 1 AAACTAACCTTAAATTATAATGATTAATCATGA 3 203 1 TGTATTTACAATATTTTTAAACAAAGTTTTAAA 37 70 1 GGCATAAAATATAAAGTTTATGATAGGGCAT 3 8 0 GCAACACACGTTATAGTTAAAGATGAAGAGACA 1 75 1 GCCGCCCACATAATAGTTAAAGATGAAAAAGGA 30 19 1 TGAGTATCTATTAATTTAAAAAAATAAATTAGT 3 44 0 TTGATGATTTTCATTTATAAATACTATGTATGA 22 191 0 TTACTTAAGATATTTTAAAAATATTTAAAT 20 280 0 ATAAACACAGAGAATTTTTATGACAAATAGAAC 0 263 1 ATAGCCGATTTGATTTTTAAACAGCTTTATTGT 10 48 0 TAATAGATACTCATTTTTAAAAATCCCTACAAA 3 64 1 TTTATATATTAGATTGATTAAAAGTTCCCATAG 18 18 0 ATGATATTACTAATATATTAATACTATTTTCAA 0 141 0 CTACTTAATTTAAATTATTATTACTTAAATAAG 0 89 0 TCTTCTAATCTAAATCATTATAATATTTATTTT 22 17 1 TTACTACTTGATATATATAATTATCGGAAATGA 5 51 0 TCCTCAAGGTTTAATCTTTATGAATGGAGATAT 35 45 1 AAAAAATTATTTAAATAAAATTAT 8 1 0 AAATATTAAAATAAAAATCTGGG 14 0 1 ATTGATTTAATAATTGATTAAGATTACTACTTG 5 74 0 GGTTGTGAGCTTATTCTTTAATAACCTCAATAA 30 59 0 GTAAAGCTAATAATATAAAAATACAACCATAAA 22 49 0 TCCAAACAAATTAATCAAAATTAATTTACACCT 16 95 0 TAATTGTTAATGATTGATAATGACAGTTTAAGG 10 253 1 GGTAATGAATAGATAATTTATCATAATTAATAA 21 61 0 * *** ***** * MAP Score: 56.2161 Motif 2 ACAATAATTAAAATTTAAAATAAAATATGGAG 5 10 0 TTTTTTTACTAAAATTAAAATAGTTTTTGGTG 7 20 1 AAATATTAAAATAAAAATCTGGG 14 1 1 TAGTTTTTAAAACTTTAATATATAAAGTTTGT 3 177 0 TAAAAATTAAAAAATTTAAATAGAACTTTCAC 34 89 0 ATTAAGTAGTAAATTTTATATATGATAGTTGA 0 113 1 TTGCTAACGTAATGTTTATATACTGTTAAACC 33 48 1 TAAATCTCCAAAACTTTATATATTACTTTTAA 10 221 1 AATAAGACGAAAAGTTTATATATTAGATTGAT 18 33 0 TTTTGTGGGTAACTTTTATATATTTCCCAGAG 18 65 1 ACACATTAGTAAGTTTTATATAGTTTTATTAA 19 106 1 TAGAAAGTTAAAAAATAATTAAAAA 27 3 1 TGACATAATAAATATTAAAAAAGGTATCAAAA 0 174 1 ACCAAATATTAATAAATGGTGATAAG 24 4 1 TTGGTATTGGAAAATTAATAAAAAGTATTACT 36 95 0 AGTGTTTTTCAAACTTAATAAAATTTCTAAGG 2 120 1 TTAAAAATAAAACTTTAAAATTGAAAAATTAG 36 65 1 AATACTTTAGAAGTTTAAAATTTTTATATCTC 2 61 1 ATATTTTAAAAATATTTAAATTTATCGATTAA 20 269 0 CCTAAAAAGTTTAAATTAGTTTTGCAA 28 283 0 TAAAGCTAATAATATAAAAATACAACCATAAA 22 49 0 GCCCTATCATAAACTTTATATTTTATGCCAAC 3 12 1 TTTGGTAGAAAAGCTTTATATTGGTAAAGCTA 22 73 0 TACCTTAAAGAATATTAAAAATCATTAAAAGG 23 18 1 CAAAGATTAAAAGATTAAAAATAAAAACATGA 35 266 1 ACCTACTTATAATCTTAAAAATCCGAAAGATT 36 136 1 TCGAGTTTATAAAATTAATAATATATAGGGGG 27 215 1 CTCTAAAATGTTAATAATTGATTTAATA 5 95 0 AGTGATGTATAAAATATAAATAGATTATGCTT 36 247 0 AAAATATCAAAAAATATAAATACACATTTGGG 19 47 1 CCTACAAAACAATTTTTAAAATGCGTAATTTT 3 89 1 GTTTCTTTGGAAGCTTAAATTAAACCCTTAAA 1 269 1 TTTAAAAACTAACCTTAAATTATAATGATTAA 3 198 1 AGTATCTATTAATTTAAAAAAATAAATTAGTG 3 43 0 AAGAAAAAATAAAATTAATTTACATGGATTAC 10 162 0 CAAATTAATCAAAATTAATTTACACCTCCGAG 16 90 0 TAATCCCTAAAATATATAAAAAGAGATATAAA 2 83 0 ACAACCATAAAAAATAAATATTATAATGATTT 22 28 0 AGCTATTAAAAACATAAATATTAAT 33 3 0 AATAAGATAGAATTTTAAATAAGTATTACTAC 0 63 0 TATTAAAACAAAACTATATAAAAGGTTAAGCT 21 21 1 CATCCAAATTAAATTATAAATTTAATTCTCAT 27 176 1 TTAAAAATTAAATTTTAGAAAGAAA 25 17 0 GCAAGAAATTAAATTAAAAAATCTATTATGCA 36 198 1 ATTTTTGTCTAAGTTTTAATTTTGATTTCTAG 0 233 0 TTACCTTGAGAATTTAAAATAATAAAAAGTGG 20 113 0 ** ******** MAP Score: 48.946 Motif 3 CTCCTAATTCTTTTACTTTAAATTTCTGAAGTTGGTG 4 10 1 ACTCTAAGAGTTTTCGTTCAACTTTTTCTAAAAGTTT 14 71 0 ATATATAAACTTTTCGTCTTATTTTTTGTGGGTAACT 18 42 1 TCTGTGTTTATTTTTGTCTAAGTTTTAATTTTGATTT 0 237 0 CTCCATATTTTATTTTAAATTTTAATTATTGTTT 5 7 1 TGCTTTTTAATTATTTTTTAACTTTCTA 27 1 0 TCTTATCTTCAAAATTTTTAATGGTTTAG 0 2 1 TATTTATTTTTTATGGTTGTATTTTTATATTATTAGC 22 40 1 ATTTTTAATCTTTTAATCTTTGTTTATTTCCAAGGTC 35 251 0 AAGTTTAAAATTTTTATATCTCTTTTTATATATTTTA 2 71 1 ACCTCAATAATTTTGTTTCCTTTTTCATCTTTAACTA 30 32 0 AATCTTAGATTTTTGATACCTTTTTTAATATTTATTA 0 179 0 TAAAGTTTTATTTTTAAGAGAATTTATGAGTTTGTTT 36 45 0 CATAATAGATTTTTTAATTTAATTTCTTGCTTCTTGT 36 191 0 TTTACAATATTTTTAAACAAAGTTTTAAATGAGTGTG 37 74 1 TTAAAAATTGTTTTGTAGGGATTTTTAAAAATGAGTA 3 71 0 TACGCCGTTATATTTTTGAGATTTTTATTAGAATGTA 27 45 0 AATTAAAAAATTTAAATAGAACTTTCACAGTTTATAT 34 80 0 TCTCCAAAACTTTATATATTACTTTTAATAATTGTTA 10 225 1 ATTACTAATATATTAATACTATTTTCAACTATCATAT 0 132 0 GAGTTTGTTTTTATTTTGTATGTTTTAGGGTTCGAAA 36 18 0 GCAACGTAAATTATTTAAGCATTTTGTATTTACAATA 37 46 1 ATAATTTTATTTAAATAATTTTTTAAG 8 6 1 ATGGATCCAGTAATAATTGCATTTTGTTGCTATCAGT 27 253 1 ATTGTTGTAATATTATAACTTTTTATCTTTTTTA 6 7 1 CTCATCCAAATTAAATTATAAATTTAATTCTCATGTT 27 174 1 TTGTCATGATTAATCATTATAATTTAAGGTTAGTTTT 3 202 0 AAAGTATTACTAATTTTTCAATTTTAAAGTTTTATTT 36 69 0 TGTGTATTTATATTTTTTGATATTTTTTGAATTGAGA 19 36 0 CTTTTAATGATTTTTAATATTCTTTAAGGTATTTTCA 23 12 0 CTCTACAAATTTTTATAGTGTTTTTCAAATGTTTTAC 2 196 0 ATTAATATTTATGTTTTTAATAGCTTTT 33 1 1 TTAAAATTTCTTTTTTTACTAAAATTA 7 0 1 TCCATGTAAATTAATTTTATTTTTTCTTATGCCTAAA 10 166 1 ATATATAAAATTTACTACTTAATTTAAATTATTATTA 0 99 0 TAACAAACTTTATATATTAAAGTTTTAAAAACTAACC 3 175 1 TGTATGAAGTTTAAGTAGAAACTTTTTTATATAGGTG 22 161 0 TGCCCTATCATAAACTTTATATTTTATGCCAACACTA 3 11 1 TTAAAAATTAAATTTTAGAAAGAAAAG 25 15 0 ATTTATATTTTATACATCACTATTTGTCATTAATGAT 36 258 1 AATCCCCCTATATATTATTAATTTTATAAACTCGATA 27 213 0 AATTAATCGATAAATTTAAATATTTTTAAAATATCTT 20 267 1 **** * * *** * MAP Score: 31.0861 Motif 4 TCCCAATAGAGGGGCGAAGCCCCTCTATGGGT 13 139 1 GTATCCCAATAGGGCGAAGCCCT 17 61 1 GTATCCCAATAGGGCGAAGCCCTATGGTTTCT 12 30 0 GGGATGGGTTCGGGTGTGGCCCCCCCGCTAT 20 9 0 AAAGTGGCCGGCGGCGTCGCCCCTTTCCCGCC 20 88 0 AGTAAGATTTGGGGAGTATCCCAATAGAGGGG 13 121 1 TCATCCCAATAGGGGGTTTCCCCTATGGATAC 13 26 0 AGGAGGTGTTAGGGTGTATCCCAATAGAGGGT 16 50 0 CTATGCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCAT 20 157 1 GTATCCCAATAGAGGGTTTCCCTCTATGGTTT 16 35 0 GTTAAGCCCCCCAGCGATGCCCCGAGTACTGC 20 51 1 GGGGCTGAACGTAGTGAAGCCCCGCTCTGGGT 17 31 1 ACTTTATTGAAGGGTGATGCCTTTGGCATCTA 34 33 1 TTTTGCAATGCCGGAGAACCCCTTACTTATGG 28 259 0 CCCGAACTCGGAAGTTAAGCCCCCCAGCGATG 20 38 1 **** ** **** MAP Score: 22.8686 Motif 5 TATAAGCCTCGAGGGGAACCCGAAAGGGACCCGAGAGGCATA 1 136 1 ATTTATTTTTGAGAATGACACTATAGCAGTTCCTTTTTTAAC 10 93 0 AGAAACCATAGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGGATGCA 12 30 1 GTATCCATAGGGGAAACCCCCTATTGGGATGAACCTTTTAGT 13 26 1 GTAAGATTTGGGGAGTATCCCAATAGAGGGGCGAAGCCCCTC 13 122 1 AAAGCATAGGAGGAGACCTCCTATTGCTATACCACCCGTCCA 15 15 1 AAACCATAGAGGGAAACCCTCTATTGGGATACACCCTAACAC 16 35 1 AGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGAGCGGG 17 51 0 TTCCGAGTTCGGGATGGGTTCGGGTGTGGCCCCCCCGCTAT 20 9 0 CCGAACTCGGAAGTTAAGCCCCCCAGCGATGCCCCGAGTACT 20 39 1 CCTATCATACGGGACTGTCACTCCCGTGACTCGGGTTCAAAT 20 181 1 AAACCAGATGAGGCACCACTCGAAGGCAATGCCAAAGTGGTG 27 111 1 GGAGATTAAAGGGATGAGTTCTCTCGGGAACCCGTCAAGGGA 28 200 1 CATAAGTAAGGGGTTCTCCGGCATTGCAAAACTAATTTAAAC 28 260 1 *** * * * * ** * MAP Score: 19.1989 Motif 6 TCTGTATAAGACCCATAGAGGGGCTTCGCCCC 13 149 0 AAAACTTGGAAACCATAGAGGGAAACCCTCTA 16 26 1 CATAGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGGA 12 36 1 AGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGAG 17 55 0 ATAGGGGAAACCCCCTATTGGGATGAACCTTT 13 32 1 CGAATTCCCCCTGCATAGAGGGAGAGAGCTCA 30 111 0 AAAATGTTATAAGCCTCGAGGGGAACCCGAAA 1 129 1 CTATTGGGATACCCAGAGCGGGGCTTCACTAC 17 41 0 ACTTATATAAAAGCCTATAGGGCTTTTATAAA 2 153 1 TAGGGTGTATCCCAATAGAGGGTTTCCCTCTA 16 41 0 TGGGGAGTATCCCAATAGAGGGGCGAAGCCCC 13 130 1 AAGTCCTGTTATGCCTCTCGGGTCCCTTTCGG 1 155 0 TTGACAAAGCATAGGAGGAGACCTCCTA 15 6 1 CGGGTGGTATAGCAATAGGAGGTCTCCTCCTA 15 21 0 CCTCGAGGGGAACCCGAAAGGGACCCGAGAGG 1 142 1 CAGATGAGGCACCACTCGAAGGCAATGCCAAA 27 115 1 GGGCAGACAAAACCAGATGAGGCACCACTCGA 27 102 1 GCTACATTGTATCCATAGGGGAAACCCCCTAT 13 18 1 * ****** *** MAP Score: 18.6915 Motif 7 CAATAGAGGGGCGAAGCCCCTCTATGGGTCTTATACAG 13 142 1 GCTGAACGTAGTGAAGCCCCGCTCTGGGTATCCCAATA 17 34 1 GTATCCATAGGGGAAACCCCCTATTGGGATGAACCTTT 13 26 1 AGAAACCATAGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGGA 12 30 1 AGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGAG 17 55 0 AGGTGTTAGGGTGTATCCCAATAGAGGGTTTCCCTCTA 16 41 0 AAGATTTGGGGAGTATCCCAATAGAGGGGCGAAGCCCC 13 124 1 ATGATAGGCCGGGCTACACCACCAGGGCATAGTAATGC 20 151 0 GTGGCCGGCGGCGTCGCCCCTTTCCCGCCAGATGGCAG 20 79 0 AAAACCAGATGAGGCACCACTCGAAGGCAATGCCAAAG 27 110 1 ATGAGTTCTCTCGGGAACCCGTCAAGGGACCGAGAGAA 28 213 1 TTAGAAAAATGTTATAAGCCTCGAGGGGAACCCGAAAG 1 124 1 CGTAGGTTATGAGCTCAACATTGGGGGCAGACAAAACC 27 78 1 * * **** * *** MAP Score: 18.5922 Motif 8 CTTTCGGGTTCCCCTCGAGGCTTATAACATTTT 1 129 0 CATAAATCTTAATCTCCCAGCTTTCAT 10 4 0 CAAAACCTAACACCTCCTCGCTTACGCTCGGAG 13 79 1 TACTAATTTACACCTCCGAGCGTAAGCGAGGAG 13 92 0 CAAAAACTAACACCTCCTCGCTTCGCTCGGAAG 14 142 1 TACACCCTAACACCTCCTCGCTTACGCTCGGAG 16 64 1 AATTAATTTACACCTCCGAGCGTAAGCGAGGAG 16 77 0 ******* ** * MAP Score: 13.591 Motif 9 AAAATGTTATAAGCCTCGAGGGGAACCCGAAAG 1 129 1 ACTTATATAAAAGCCTATAGGGCTTTTATAAAT 2 153 1 CATCCTGGGTATCCCAATAGGGCGAAGCCCTAT 12 37 0 TAAAAGGTTCATCCCAATAGGGGGTTTCCCCTA 13 33 0 TTTGGGGAGTATCCCAATAGAGGGGCGAAGCCC 13 128 1 TCTGTATAAGACCCATAGAGGGGCTTCGCCCCT 13 148 0 AAAACTTGGAAACCATAGAGGGAAACCCTCTAT 16 26 1 GTTAGGGTGTATCCCAATAGAGGGTTTCCCTCT 16 42 0 CGCTCTGGGTATCCCAATAGGGCGAAGCCCT 17 53 1 TCGGAAGTTAAGCCCCCCAGCGATGCCCCGAGT 20 45 1 TTCTCTCGGGAACCCGTCAAGGGACCGAGAGAA 28 218 1 CTCACAACCGAACCCATTTGGGAGGTTGTGAGC 30 83 1 ATACGCTAAAATCCCAAAAAAGGATTTTAGCGA 30 140 0 * *** * ***** MAP Score: 12.9533 Motif 10 AATGTTATAAGCCTCGAGGGGAACCCGAAAGGGACC 1 131 1 TATTCAGAAACCATAGGGCTTCGCCCTATTGGGATA 12 25 1 CAGAAGCAATGCATCCTGGGTATCCCAATAGGGCGA 12 45 0 TACATTGTATCCATAGGGGAAACCCCCTATTGGGAT 13 20 1 CTAATTTACACCTCCGAGCGTAAGCGAGGAGGTGTT 13 87 0 TGTATAAGACCCATAGAGGGGCTTCGCCCCTCTATT 13 143 0 AACTTGGAAACCATAGAGGGAAACCCTCTATTGGGA 16 28 1 TTAATTTACACCTCCGAGCGTAAGCGAGGAGGTGTT 16 72 0 TAGTGAAGCCCCGCTCTGGGTATCCCAATAGGGCGA 17 42 1 GGAAGTTAAGCCCCCCAGCGATGCCCCGAGTACTGC 20 47 1 CATTACTATGCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCA 20 152 1 TTTGGCATTGCCTTCGAGTGGTGCCTCATCTGGTTT 27 111 0 TCTCTCGGTCCCTTGACGGGTTCCCGAGAGAACTCA 28 214 0 ** * * *** *** MAP Score: 11.0161 Motif 11 GAGAGGCATAACAGGACTTTCGCAGGAATAAATA 1 168 1 TTCCAAAGAAACAGGACTTTCGCAGTTTATATAT 1 247 0 GGCCTATCATACGGGACTGTCACTCCCGTGACTC 20 179 1 AATTTGGATGAGGGCACTTACCCTCTCCATCAGC 27 152 0 TTCTATTTAACTTTCTCTAAAAGATTGG 32 4 1 ATAGAACTTTCACAAATAAAAATA 34 0 1 AAAAATTTAAATAGAACTTTCACAGTTTATATGC 34 78 0 ATGCTAAATGGTCCTTTCGCAATAGCAGTTG 35 7 1 GATTTCACTTCCTCATGTTTTTATT 35 285 0 * * ****** ** MAP Score: 6.02439 Motif 12 TAAGCCTCGAGGGGAACCCGAAAGGGACCCGAGAGGCATAAC 1 138 1 ATATATTTTAGGGATTACCTATAGTGTTTTTCAAACTTAATA 2 98 1 GAGTTAAAAAAGGAACTGCTATAGTGTCATTCTCAAAAATAA 10 91 1 AGAAACCATAGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGGATGCA 12 30 1 GTATCCATAGGGGAAACCCCCTATTGGGATGAACCTTTTAGT 13 26 1 TCCCAATAGAGGGTTTCCCTCTATGGTTTCCAAGTTTTTTCA 16 22 0 GCCCCGCTCTGGGTATCCCAATAGGGCGAAGCCCT 17 49 1 AAACCAGATGAGGCACCACTCGAAGGCAATGCCAAAGTGGTG 27 111 1 TGAGTTCTCTCGGGAACCCGTCAAGGGACCGAGAGAACAACC 28 214 1 CATAAGTAAGGGGTTCTCCGGCATTGCAAAACTAATTTAAAC 28 260 1 *** *** * ** * MAP Score: 5.68675