AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i MJ/MJ_operons002_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239868 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 MJ0006 300 formate dehydrogenase, alpha subunit #1 MJ0030 300 coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit (frcD) #2 MJ0100 226 conserved hypothetical protein #3 MJ0101 93 signal recognition particle, subunit SRP54 #4 MJ0102 300 Phenylacrylic acid decarboxylase #5 MJ0150 65 M. jannaschii predicted coding region MJ0150 #6 MJ0152 256 carbon monoxide dehydrogenase, subunit alpha #7 MJ0153 239 acetyl-CoA decarbonylase/synthase, subunit alpha (cdhA) #8 MJ0154 43 acetyl-CoA decarbonylase/synthase, subunit epsilon (cdhB) #9 MJ0189 300 SSU ribosomal protein S13P (rpsM) #10 MJ0190 57 SSU ribosomal protein S4P (rpsD) #11 MJ0191 25 SSU ribosomal protein S11P (rpsK) #12 MJ0193 77 LSU ribosomal protein L18E #13 MJ0194 31 LSU ribosomal protein L13P (rplM) #14 MJ0196 57 DNA-directed RNA polymerase, subunit N (rpoN) #15 MJ0197 140 DNA-directed RNA polymerase, subunit K (rpoK) #16 MJ0198 200 M. jannaschii predicted coding region MJ0198 #17 MJ0199 113 ferredoxin #18 MJ0264 41 carbon monoxide dehydrogenase, iron sulfur subunit CooF-1 (cooF1) #19 MJ0265 42 carbon monoxide dehydrogenase, iron sulfur subunit CooF-1 (cooF2) #20 MJ0266 27 pyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit beta (porB) #21 MJ0267 21 pyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha (porA) #22 MJ0269 283 pyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit gamma (porG) #23 MJ0270 300 M. jannaschii predicted coding region MJ0270 #24 MJ0514 43 polyferredoxin (mvhB) #25 MJ0516 113 carbon monoxide dehydrogenase, hydrogenase subunit CooL (cooL) #26 MJ0519 181 M. jannaschii predicted coding region MJ0519 #27 MJ0520 192 NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 1 #28 MJ0522 108 NADH dehydrogenase I #29 MJ0524 123 conserved hypothetical protein #30 MJ0525 122 conserved hypothetical protein #31 MJ0528 74 conserved hypothetical protein #32 MJ0529 132 repressor protein, putative #33 MJ0870 176 coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit (frhB) #34 MJ0934 300 polyferredoxin (mvhB) #35 MJ1027 125 formate hydrogenlyase, subunit 5 #36 MJ1165 238 formylmethanofuran dehydrogenase, subunit E (tungsten) (fwdE) #37 MJ1167 47 formylmethanofuran dehydrogenase, subunit G (tungsten) (fwdG) #38 MJ1169 26 formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A (tungsten) (fwdA) #39 MJ1170 32 conserved hypothetical protein #40 MJ1171 25 formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten) (fwdC) #41 MJ1190.1 300 vhuD protein #42 MJ1191 300 methylviologen-reducing hydrogenase, gamma chain (vhuG) #43 MJ1192 33 methylviologen-reducing hydrogenase, alpha chain (vhuA) #44 MJ1192.1 44 methylviologen-reducing hydrogenase subunit #45 MJ1193 176 polyferredoxin (mvhB) #46 MJ1306 21 conserved hypothetical protein #47 MJ1309 37 carbon monoxide dehydrogenase, hydrogenase anchor subunit CooM (cooM) #48 MJ1310 83 conserved hypothetical protein #49 MJ1350 114 formylmethanofuran dehydrogenase, subunt C (tungsten) #50 MJ1351 300 glutamate synthase (gltB) #51 MJ1363 300 formate hydrogenlyase, subunit 7 #52 MJ1682 108 heat shock protein HtpX, possibly protease (htpX) Motif 1 CCATAAATCTAAAAAAATAAATATAACAACC 4 214 0 AAGGGATTAAAAAAGATAAAAAGTTATAAT 18 21 0 AAAAATATCAAAAAATATAAATACACATTTG 33 46 1 CTATTAATTTAAAAAAATAAATTAGTGTTGG 7 39 0 AAAAGCTATTAAAAACATAAATATTAAT 48 7 0 TAAACCCTTAAAAAACTTAAA 1 289 1 TTAAAAATTAAAAAATTTAAATAGAACTTTC 49 91 0 AAACTTTTAGAAAAAGTTAAACAAAATCTTT 4 140 0 AGTTAAGATTTAAAAAATAAATACTATTTAA 4 256 0 AATACAACCATAAAAAATAAATATTATAATG 36 32 0 AGTGTTGGCATAAAATATAAAGTTTATGATA 7 16 0 AAATAGATATTAAAAAATAAAAAGAAGTGGC 9 235 0 TAGTGATGTATAAAATATAAATAGATTATGC 51 249 0 ATCCTCTGGGAAATATATAAAAGTTACCCAC 32 69 0 GTAATCCCTAAAATATATAAAAAGAGATATA 2 85 0 CTCACCTCTGAAATATATAAAATATCAAATG 15 116 0 AAACAATAATTAAAATTTAAAATAAAATATG 17 13 0 TTAAAAATTAAATTTTAGAAAG 39 20 0 TTGAGAATTTAAAATAATAAAAAGTGGCCGG 34 109 0 AACCTAAAATAAAATAATAAAATGGTGCCGA 4 187 0 TTTTTCATAAAAATATTTAAATACTTAGAAT 23 155 1 GATATTTTAAAAATATTTAAATTTATCGATT 34 271 0 GAAAGTTAAAAAATAATTAAAAAGCACAAGC 41 12 1 AAGAGATATAAAAATTTTAAACTTCTAAAGT 2 64 0 TTTATATACAAAAATGTTAAACATACTTAAC 23 123 0 TTATTAAAAGTAATATATAAAGTTTTGGAGA 22 225 0 TTAATCAATCTAATATATAAACTTTTCGTCT 32 30 1 TTTAAAACTTTAATATATAAAGTTTGTTATG 7 173 0 ATTTTATTACTAAATAATAAACAAAAAAATC 6 11 1 TCATCCAAATTAAATTATAAATTTAATTCTC 41 175 1 ATTAAGCATAAATAATAAAATAAGGGTGA 43 8 1 GCCGCCCACATAATAGTTAAAGATGAAAAAG 45 19 1 TTAAAAGATTAAAAATAAAAACATGAGGAAG 50 272 1 TGGTATTGGAAAATTAATAAAAAGTATTACT 51 95 0 ATTGACATAATAAATATTAAAAAAGGTATCA 0 172 1 TAGGCATAAGAAAAAATAAAATTAATTTACA 22 170 0 ACGCATTGCGAAAAATTTAATACAAATAACT 6 170 0 AAATATTAAAATAAAAATCTGGGTGAG 27 6 1 TTAATTGTTCTAAAATAAAAAGAAGCCCGGC 34 242 0 ATTTTTTTGTTAAAAGAAAAATTCAGTCCTT 7 116 1 CCACCTCAATTAAAAAATAATTATAATTTAA 16 173 0 TAAAAAATAATAAGCCGGTGA 40 0 1 TAAATTCTCTTAAAAATAAAACTTTAAAATT 51 56 1 CTTTTTTTACTAAAATTAAAATAGTTTTTGG 19 19 1 TTAAATTTTTTAATTTTTAAAG 49 102 1 TGCTAAATAGAAAATAAAAAAGAA 2 3 0 TATGACTTGCAAAATAAAAAATAGGGCTTTT 6 77 0 TACTATTTAAAAATAGTTAATCCATAAATCT 4 235 0 GTAAAGCTAATAATATAAAAATACAACCATA 36 51 0 CTCTAAAATGTTAATAATTGATTTA 17 98 0 AGCAAGAAATTAAATTAAAAAATCTATTATG 51 197 1 AAACCGAAAATAATATATAATATGGTATCCA 9 51 1 TAAAACTTTAAAATTGAAAAATTAGTAATAC 51 72 1 AAACTAACCTTAAATTATAATGATTAATCAT 7 203 1 CGAGTTTATAAAATTAATAATATATAGGGGG 41 216 1 ATCTTTCCAAAAATTGTAAAATAAAT 14 5 0 ATTACTGTCATAAATCTTAATCTCCCAGCTT 22 14 0 CTTATCTTCAAAATTTTTAATGGTTTAGTTG 0 11 1 CAAGTCATAGAAATTTTTAATTAATGCTTAG 6 99 1 GAAAACAATAAAATTTTTAATTGAAGAAATA 3 30 1 TAATTTATCATAATTAATAATGATAATTAGC 35 50 0 AGTATAATTCTAAAATTTCTGAAAA 3 4 1 AACCTTATAATAATTATAAAAGGTTTGAAGG 12 39 1 AAAATATTGTAAATACAAAATGCTTAAATAA 52 56 0 TTACTTTTAATAATTGTTAATGATTGATAAT 22 243 1 GCTCTAATTATTAATGCCCTACGGA 52 4 1 ATAGTATTTATAAATGAAAATCATCAACTAA 36 197 1 ***** ***** MAP Score: 65.5606 Motif 2 AGCTTAAATTAAACCCTTAAAAAACTTAAA 1 280 1 AAGGGATTAAAAAAGATAAAAAGTTATA 18 23 0 TATTATATTGAAGGAGTTAAAAAAGGAACTGCTATAGT 22 78 1 ATATAAAAAGAATATATAAAAAATGAAACACGTTTCAG 9 111 1 GAAAGTTAAAAAATAATTAAAAAGCACAAGCTCTACAT 41 12 1 AAAAAGCTAAAAGCTATTAAAAACATAAATATTAAT 48 8 0 CTTTAAAAATTAAAAAATTTAAATAGAACTTT 49 92 0 AACAAAGATTAAAAGATTAAAAATAAAAACATGAGGAA 50 264 1 TTGACATAATAAATATTAAAAAAGGTATCAAAAATCTA 0 173 1 CTGTTAAGTTAAGATTTAAAAAATAAATACTATTTAAA 4 255 0 ATCAAATAGAAACATTTAAAAAAGCCCTATTTTTTATT 6 58 1 CACTATAGGTAATCCCTAAAATATATAAAAAGAGATAT 2 86 0 TGTAAATACAAAATGCTTAAATAATTTACGTTGCTAAT 52 42 0 TCACCTCTGAAATATATAAAATATCAAATGGTGGGGCC 15 108 0 AACAATAATTAAAATTTAAAATAAAATATGGAG 17 5 0 TTCAACAATAAAGCTGTTTAAAAATCAAATCGGCTATT 22 44 1 TATTAAAACAAAACTATATAAAAGGTTAAGCTAATTAT 35 21 1 TGGTAAAGCTAATAATATAAAAATACAACCATAAAAAA 36 46 0 TAAAAAGAATAATAAGTTTAAAAATCTAA 15 1 0 CTTAAAAAATTATTTAAATAAAATTAT 20 2 0 TTATAATTCTAAGTATTTAAATATTTTTATGAAAAATT 23 153 0 AAATATTAAAATAAAAATCTGGGTGAGG 27 0 1 ATTAAGCATAAATAATAAAATAAGGGTGAATTT 43 9 1 ACATTTGAAAAACACTATAAAAATTTGTAGAGGTT 2 201 1 AAACTGTGGAAAATCCTATAAAACCACT 23 282 1 GTTAATCCATAAATCTAAAAAAATAAATATAACAACCT 4 213 0 GATAAATTTAAATATTTTTAAAATATCTTAAGTAA 34 275 1 AATATATAAAAAGAGATATAAAAATTTTAAACTTCTAA 2 67 0 TGGTATTGGAAAATTAATAAAAAGTATTACTAATTTTT 51 88 0 CAAACCTTATAATAATTATAAAAGGTTTGAAGGAAAAC 12 37 1 AAAAAAGATAAAAAGTTATAATATTACAACAAT 18 5 0 TTTTTAATTGAAGAAATATAATATTTTATTAAGTGTTG 3 43 1 TTCAATTCTCAATTCAAAAAATATCAAAAAATATAAAT 33 30 1 CATGGATATTAAAATCTTTAATAAGTTATTTGTATTAA 6 147 1 AAATGTTAATAATTGATTTAATAATTGATTAAGATTAC 17 80 0 CTAATATTATTAAAATAACATTCAATTCTC 33 2 1 AAGAATATTAAAAATCATTAAAAGGTGAGGAA 37 25 1 TTCTAATCTAAATCATTATAATATTTATTTTTTATGGT 36 19 1 AGAAGCAAGAAATTAAATTAAAAAATCTATTATGCATA 51 194 1 AGTGTTTTTCAAACTTAATAAAATTTCTAAGGCACTTA 2 120 1 GATAGTTGAAAATAGTATTAATATATTAGTAATATCAT 0 136 1 ATATATGTTGAACTATTTATAAATATGTGAGCAAGACA 36 121 1 ATTTTTATGAAAAATTTTATATACAAAAATGTTAAACA 23 131 0 AAATAAGACGAAAAGTTTATATATTAGATTGATTAAAA 32 28 0 ACAGTCAAAGATTTATATAACAAATGTAGGATTA 5 41 0 TGATATTAGAAAATCTAATAATAGTAGTAATACTTATT 0 40 1 GTTTAGGCATAAGAAAAAATAAAATTAATTTACATGGA 22 166 0 GCTATTTAATAAAACTATATAAAACTTACTAATGTGTT 33 105 0 ATCAATCATTAACAATTATTAAAAGTAATATATAAAGT 22 233 0 AAAATTGCTAAATAGAAAATAAAAAAGAA 2 1 0 TTTTATAGTAAATAGATATTAAAAAATAAAAAGAAGTG 9 237 0 GATTAGGTTTAACAGTATATAAACATTACGTTAGCAAC 48 47 0 TAAATATAACAACCTAAAATAAAATAATAAAATGGTGC 4 190 0 CGCAATGCGTAACCACTATTATATAGTAATGCATAAAC 6 191 1 AAATATAAATTAAAGGTGAAACACT 11 1 1 GAAAGCTAGAAATCAAAATTAAAACTTAGACAAAAATA 0 228 1 GTTTAAGTAGAAACTTTTTTATATAGGTGTGTGTCTTG 36 152 0 CGGCATTGCAAAACTAATTTAAACTTTTTAGG 42 278 1 ACAACATGAGAATTAAATTTATAATTTAATTTGGATGA 41 175 0 ACCTCAATTAAAAAATAATTATAATTTAATTGTTTATG 16 164 0 ** ******* * MAP Score: 41.966 Motif 3 ATAAATCTAAAAAAATAAATATAACAACCTAAAA 4 209 0 GTAAATAGATATTAAAAAATAAAAAGAAGTGGCG 9 234 0 TGTCATTCTCAAAAATAAATACAACATCATTTTT 22 115 1 GTTTAGGCATAAGAAAAAATAAAATTAATTTACA 22 170 0 TTCAAAAAATATCAAAAAATATAAATACACATTT 33 42 1 AAAGCTAATAATATAAAAATACAACCATAAAAAA 36 46 0 TATTGTGGGAATATATAAAAAGAATATATAAAAA 9 99 1 GTATCTATTAATTTAAAAAAATAAATTAGTGTTG 7 40 0 ACAACCTAAAATAAAATAATAAAATGGTGCCGAG 4 186 0 TTTGTTTATTATTTAGTAATAAAATT 6 2 0 ATTAAGCATAAATAATAAAATAAGGGTGAATTT 43 9 1 AAATATTAAAATAAAAATCTGGGT 27 0 1 GTGATGTATAAAATATAAATAGATTATGCTTTAT 51 244 0 TTAAAAGATTAAAAATAAAAACATGAGGAAGTGA 50 272 1 TTACTAAATAATAAACAAAAAAATCAGATATTAC 6 17 1 GATGATTTTCATTTATAAATACTATGTATGAAGT 36 188 0 AAGCTATTAAAAACATAAATATTAAT 48 2 0 TTAAGATTTAAAAAATAAATACTATTTAAAAATA 4 251 0 TACAACCATAAAAAATAAATATTATAATGATTTA 36 27 0 ACCAAATATTAATAAATGGTGATAAG 38 3 1 GAGTTTATAAAATTAATAATATATAGGGGGATTA 41 217 1 GTATTGGAAAATTAATAAAAAGTATTACTAATTT 51 90 0 TAGAAAGTTAAAAAATAATTAAAAAGCACAAGCT 41 10 1 ACCTCAATTAAAAAATAATTATAATTTAATTGTT 16 168 0 GATATCGGAAAACAATAATTAAAATTTAAAATAA 17 19 0 GAAAGCTAGAAATCAAAATTAAAACTTAGACAAA 0 228 1 GGAAATAAACAAAGATTAAAAGATTAAAAATAAA 50 257 1 CTTTAAAAATTAAAAAATTTAAATAGAA 49 96 0 GAGTGTTATTATATAATAAAATATTTCCTCATGC 23 217 0 GATATTACTAATATATTAATACTATTTTCAACTA 0 138 0 ATATTAGAAAATCTAATAATAGTAGTAATACTTA 0 42 1 AAATTGCTAAATAGAAAATAAAAAAGAA 2 4 0 ACCCTAAAACATACAAAATAAAAACAAACTCATA 51 24 1 CGGCCCCGTTAAAAAGAATAATAAGTTTAAAAAT 15 14 0 TACCTTGAGAATTTAAAATAATAAAAAGTGGCCG 34 110 0 AAAGCTTTTCTACCAAAAATAGAACTTTTATTCA 36 88 1 AGAGAATTTTTATGACAAATAGAACATTTAGGTG 0 271 1 ATAGAACTTTCACAAATAAAAATACTTTATT 49 7 1 AAATTTTTAATTGAAGAAATATAATATTTTATTA 3 40 1 AATCATTAACAATTATTAAAAGTAATATATAAAG 22 234 0 AATGTCCATTATTTAATAAAATTAGGTGAGATAA 28 83 1 CTTTAATGCTATTTAATAAAACTATATAAAACTT 33 116 0 AAAATACCTTAAAGAATATTAAAAATCATTAAAA 37 14 1 CTTTTAATTCATCTATTATTAAAAACTCTGTTAA 23 28 1 TCATTGACATAATAAATATTAAAAAAGGTATCAA 0 170 1 AAATTAAAACTTAGACAAAAATAAACACAGAGAA 0 243 1 ATTTTAATTTTAGTAAAAAAAGAAATTTTAA 19 7 0 TTAATTGTTCTAAAATAAAAAGAAGCCCGGCAAA 34 239 0 AACATTTGAAAAACACTATAAAAATTTGTAGAGG 2 200 1 CTTCAGAAATTTAAAGTAAAAGAATTAGGAG 8 7 0 CTAATATTATTAAAATAACATTCAATTC 33 4 1 AAAAATCAGATATTACTAAAAAAATCAAATAGAA 6 35 1 AAATACTTAGAATTATAAATAATTGGAAATAAAA 23 173 1 TTGCTCACATATTTATAAATAGTTCAACATATAT 36 121 0 AGGGATTAAAAAAGATAAAAAGTTATAATATTAC 18 16 0 TATCTTATTTAAGTAATAATAATTTAAATTAAGT 0 86 1 ATTAGTATGGATCCAGTAATAATTGCATTTTGTT 41 247 1 AAATTTCTGAAAACAATAAAATTTTTAATTGAAG 3 22 1 ATATCAACTAAACCATTAAAAATTTTGAAGATAA 0 12 0 AAACCTAAGCATTAATTAAAAATTTCTATGACTT 6 100 0 TATATATTAGATTGATTAAAAGTTCCCATAGGTG 32 15 0 AGGTTCGCTAAACAATTATTAGATGAATTAGGAA 42 37 1 AGTAATCTTAATCAATTATTAAATCAATTATTAA 17 79 1 CGCAATGCGTAACCACTATTATATAGTAATGCAT 6 191 1 GAATTTTTCTTTTAACAAAAAAATTACGCATTTT 7 106 0 ATATAAAATTTTTCATAAAAATATTTAAATACTT 23 147 1 TGTCAAACCTTATAATAATTATAAAAGGTTTGAA 12 34 1 TAATTAAAATTTAAAATAAAATATGGAG 17 4 0 AAGCAAGAAATTAAATTAAAAAATCTATTATGCA 51 196 1 TTTCTATGACTTGCAAAATAAAAAATAGGGCTTT 6 78 0 TAAAAAATTATTTAAATAAAATTAT 20 1 0 CAAACAAATTAATCAAAATTAATTTACACCTCCG 29 92 0 TATTATAAGGTTTGACAAATAATTAGAATGAAAA 12 17 0 ACTTAAGATATTTTAAAAATATTTAAATTTATCG 34 274 0 TATATTGGATATGCACTATTAATTATTGGAACTC 30 55 1 CAAACGAAACTTTTAGAAAAAGTTAAACAAAATC 4 143 0 TAGCATAACATTCAACAAAAAATTATTGAAGGTG 10 28 1 TAAACGAAACTTTTAGAAAAAGTTGAACGAAAAC 27 65 1 TGTCATGATTAATCATTATAATTTAAGGTTAGTT 7 204 0 AACTTTAAAATTGAAAAATTAGTAATACTTTTTA 51 75 1 ATAGATAATTTATCATAATTAATAATGATAATTA 35 52 0 TAAATTCTCTTAAAAATAAAACTTTAAAATTGAA 51 56 1 ** * ***** ** MAP Score: 32.1268 Motif 4 TAAGAGGCATTGCCGAGCGTAGCGAGG 4 3 1 ATCAAAATAGGATGCATTGCCTCGCTACGCTCGG 4 22 0 CAGAGCGGAGGTAGCCTAGCCCGGCCAAGGCGTG 9 146 1 GAGATCCCATGGGGCTTTGCCCCGCGGGGGTTCA 9 186 1 TAACGGGGCCGTGGGGTAGCCTGGATATCCTGTG 15 37 1 ATATCAAATGGTGGGGCCGCCGGGACTTGAACCC 15 92 0 ACCTCAGAGTGGAGCTTCACTACGTTCAGCCCCA 16 26 0 TAATGAAACCGAAGCGTAGCTTCGAGCTACAAAA 16 82 1 GGATACCCAGGATGCATTGCTTCTGCAAAGAAGC 25 56 1 TAAATTTTAAGAGGCATTGCTTCTTTGCAGAAGC 25 74 0 GACCCATAGAGGGGCTTCGCCCCTCTATTGGGAT 26 138 0 TATCCCAATAGAGGGTTTCCCTCTATGGTTTCCA 29 32 0 TACCCAGAGCGGGGCTTCACTACGTTCAGCCCCA 31 30 0 GGGTTCGGGTGTGGCCCCCCCGCTAT 34 2 0 GGCAGTACTCGGGGCATCGCTGGGGGGCTTAACT 34 50 0 AAAGTGGCCGGCGGCGTCGCCCCTTTCCCGCCAG 34 86 0 CTATGCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCATAC 34 157 1 CCGGCAAATGGCGCCCTGGCCGGGATTTGAACCC 34 213 0 AGGCTGAGGAGAGGGTTAGGTTCGCTAAACAATT 42 20 1 TGAGCTTTGAGAGGGTTAGGTCCGAGTTTTTCAA 42 158 0 * *** * *** ** MAP Score: 28.1452 Motif 5 CCAATAGAGGGGCGAAGCCCCTCTATGGGTC 26 141 1 AGTGGCCGGCGGCGTCGCCCCTTTCCCGCCA 34 87 0 ATCCCAATAGGGCGAAGCCCTATGGTTTCTG 25 29 0 ATCCCAATAGGGCGAAGCCCT 31 63 1 TAAGCCCCCCAGCGATGCCCCGAGTACTGCC 34 53 1 GATGGGTTCGGGTGTGGCCCCCCCGCTAT 34 8 0 ACCCCCGCGGGGCAAAGCCCCATGGGATCTC 9 186 0 GGCTGAACGTAGTGAAGCCCCGCTCTGGGTA 31 33 1 CGCTACGCTCGGCAATGCCTCTTA 4 3 0 TTTATTGAAGGGTGATGCCTTTGGCATCTAA 49 35 1 GGCTGAACGTAGTGAAGCTCCACTCTGAGGT 16 29 1 TCTGCAAAGAAGCAATGCCTCTTAAAATTTA 25 77 1 ATGAAACCGAAGCGTAGCTTCGAGCTACAAA 16 84 1 GCACCACTTTGGCATTGCCTTCGAGTGGTGC 41 123 0 ATGCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCATA 34 159 1 GTTAGGTTTTGGTGAAGCTTTTACTAAAAGG 26 59 0 CGAACTCGGAAGTTAAGCCCCCCAGCGATGC 34 40 1 ATAGCTGGAAAGCGTAGCTTTCCATTTCATC 4 53 0 ATAGCTGGAAAGCATAGCTCTCCATTTCATC 27 112 1 ***** ***** MAP Score: 25.7263 Motif 6 ATTGCCTCGCTACGCTCGGCAATGCCTCTTA 4 7 0 ATTGCCGAGCGTAGCGAGGCAATGCATCCTATTT 4 18 1 ATAAAAAGAAGTGGCGCGGAGGGGGGGATTTGAA 9 216 0 CCTCCGAGCGTAAGCGAGGAGGTGTTAGGTTTTG 26 79 0 CCTCCTCGCTTACGCTCGGAGGTGTAAATTAGTA 26 91 1 AATAAAAATCTGGGTGAGGATATGGATACTTCAC 27 19 1 ACTTCCGAGCGAAGCGAGGAGGTGTTAGTTTTTG 27 142 0 ACCTCCTCGCTTCGCTCGGAAGTGTAAATTTACA 27 153 1 CCTCCGAGCGTAAGCGAGGAGGTGTTAGGGTGTA 29 64 0 CCTCCTCGCTTACGCTCGGAGGTGTAAATTAATT 29 76 1 GAGTTCGGGATGGGTTCGGGTGTGGCCCCCCCGC 34 13 0 TTTGTTGCTATCAGTGAGGATATGGGGCTGCTGA 41 275 1 ACCTCCCAAATGGGTTCGGTTGTGAGCTTATTCT 45 75 0 ACCGAACCCATTTGGGAGGTTGTGAGCTCTCTCC 45 89 1 * ****** *** MAP Score: 22.9225 Motif 7 TTTTTATGACAAATAGAACATTTAGGTGATATT 0 277 1 CAACCTAAAATAAAATAATAAAATGGTGCCGAGGGAGGG 4 180 0 AATCTTAACTTAACAGTTTTTAATGGTGAATTT 4 277 1 CTTTTACTTTAAATTTCTGAAGTTGGTGATAGTA 8 19 1 AGATATTAAAAAATAAAAAGAAGTGGCGCGGAGGGGGGG 9 223 0 ATTTACTATAAAACACGAAATTATGGAGGTGCAACCTTG 9 262 1 AACATTCAACAAAAAATTATTGAAGGTGATTAG 10 34 1 AAATATAAATTAAAGGTGAAACACT 11 0 1 GAAATATATAAAATATCAAATGGTGGGGCCGCCGGGACT 15 99 0 ATTAAAAGTAATATATAAAGTTTTGGAGATTTAAGCAAT 22 215 0 CGGAGGTGTAAATTAGTAAGATTTGGGGAGTATCCCAAT 26 107 1 AAATATTAAAATAAAAATCTGGGTGAGGATATGGAT 27 7 1 AATGTCCATTATTTAATAAAATTAGGTGAGATAAA 28 83 1 ATCAGGGAAATAAAAGAAAGTGGGGCTGAACGTAGT 31 7 1 TCAAAAAATATAAATACACATTTGGGGGAAATTTATATG 33 53 1 AAAGAATATTAAAAATCATTAAAAGGTGAGGAA 37 24 1 ACCAAATATTAATAAATGGTGATAAG 38 3 1 TAAAAAATAATAAGCCGGTGATGGT 40 2 1 AGGCAATGCCAAAGTGGTGCTGATGGAGAGGGTAAGTGC 41 134 1 TTATTAGATGAATTAGGAATTGGCGGAGACAGAATTGAC 42 52 1 ATTAAGCATAAATAATAAAATAAGGGTGAATTT 43 10 1 *** * * * ** ** MAP Score: 20.6988 Motif 8 CATCAAAATAGGATGCATTGCCTCGCTACGCTCGGC 4 21 0 CTAAAAGTTTCGTTTGTATCCCTCCCTCGGCACCAT 4 161 1 TCAGAGCGGAGGTAGCCTAGCCCGGCCAAGGCGTGG 9 145 1 TGAACCCCCGCGGGGCAAAGCCCCATGGGATCTCCA 9 184 0 TGCCCCGCGGGGGTTCAAATCCCCCCCTCCGCGCCA 9 203 1 ACTTGAACCCGGGTCGCACGCCCCCCAAGCGCACAG 15 66 0 CGTGCGACCCGGGTTCAAGTCCCGGCGGCCCCACCA 15 82 1 GCTTCTGCAAAGAAGCAATGCCTCTTAAAATTTATT 25 74 1 AGACCCATAGAGGGGCTTCGCCCCTCTATTGGGATA 26 137 0 TGGGGCTGAACGTAGTGAAGCCCCGCTCTGGGTATC 31 30 1 GATGGGTTCGGGTGTGGCCCCCCCGCTAT 34 3 0 TCCCGAACTCGGAAGTTAAGCCCCCCAGCGATGCCC 34 37 1 AAAAGTGGCCGGCGGCGTCGCCCCTTTCCCGCCAGA 34 85 0 ACTATGCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCATACG 34 156 1 CCCGTGACTCGGGTTCAAATCCCGGCCAGGGCGCCA 34 203 1 ATTTGGATGAGGGCACTTACCCTCTCCATCAGCACC 41 149 0 GTCAGCAGCCCCATATCCTCACTGATAGCAAC 41 278 0 AATTGTTTAGCGAACCTAACCCTCTCCTCAGCCTTT 42 18 0 TTGAAAAACTCGGACCTAACCCTCTCAAAGCTCAGT 42 158 1 ACTTAGATAGAGTTTGGATGCCTGACGCTGGAATGC 50 203 1 ** * * ***** * MAP Score: 20.4829 Motif 9 AAAACCTAACACCTCCTCGCTTACGCTCGGA 26 80 1 ACACCCTAACACCTCCTCGCTTACGCTCGGA 29 65 1 AAAAACTAACACCTCCTCGCTTCGCTCGGAA 27 143 1 TTCGGGTGTGGCCCCCCCGCTAT 34 2 0 GGGCTAGGCTACCTCCGCTCTGAAACGTGTT 9 137 0 ATTAATTTACACCTCCGAGCGTAAGCGAGGA 29 78 0 ACTAATTTACACCTCCGAGCGTAAGCGAGGA 26 93 0 GGGGATTTGAACCCCCGCGGGGCAAAGCCCC 9 196 0 CGGAAGTTAAGCCCCCCAGCGATGCCCCGAG 34 46 1 AACGTAGTGAAGCCCCGCTCTGGGTATCCCA 31 38 1 GGGTCGCACGCCCCCCAAGCGCACAGGATAT 15 61 0 AACGTAGTGAAGCTCCACTCTGAGGTATAGT 16 34 1 CATAGGGGAAACCCCCTATTGGGATGAACCT 26 31 1 ATTCTCCCTCCAATCTTTTAGAGAAA 47 21 0 CACTACGTTCAGCCCCACTGTAGTTAAAAAC 16 12 0 ATAGGAGGAGACCTCCTATTGCTATACCACC 28 20 1 GGTTTTGTCTGCCCCCAATGTTGAGCTCATA 41 85 0 CACTACGTTCAGCCCCACTTTCTTTTATTTC 31 16 0 TCAAATCCCCCCCTCCGCGCCACTTCTTTTT 9 217 1 ****** **** MAP Score: 20.3084 Motif 10 AGAAACCATAGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGGATGCA 25 30 1 AAACCATAGAGGGAAACCCTCTATTGGGATACACCCTAACAC 29 35 1 AGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCCAGAGCGGG 31 51 0 GTAAGATTTGGGGAGTATCCCAATAGAGGGGCGAAGCCCCTC 26 122 1 CCTATCATACGGGACTGTCACTCCCGTGACTCGGGTTCAAAT 34 181 1 TATAAGCCTCGAGGGGAACCCGAAAGGGACCCGAGAGGCATA 1 136 1 AGATCCCATGGGGCTTTGCCCCGCGGGGGTTCAAATCCCCCC 9 187 1 GGAGATTAAAGGGATGAGTTCTCTCGGGAACCCGTCAAGGGA 42 200 1 GTATCCATAGGGGAAACCCCCTATTGGGATGAACCTTTTAGT 26 26 1 ATTTATTTTTGAGAATGACACTATAGCAGTTCCTTTTTTAAC 22 93 0 AAACCAGATGAGGCACCACTCGAAGGCAATGCCAAAGTGGTG 41 111 1 CATAAGTAAGGGGTTCTCCGGCATTGCAAAACTAATTTAAAC 42 260 1 TTCCGAGTTCGGGATGGGTTCGGGTGTGGCCCCCCCGCTAT 34 9 0 CTGTGCGCTTGGGGGGCGTGCGACCCGGGTTCAAGTCCCGGC 15 66 1 CCGAACTCGGAAGTTAAGCCCCCCAGCGATGCCCCGAGTACT 34 39 1 ATGGTGCCGAGGGAGGGATACAAACGAAACTTTTAGAAAAAG 4 155 0 *** * * * * ** * MAP Score: 19.7351 Motif 11 ATAAAAGCCTATAGGGCTTTTATAAATACCTTATACC 2 159 1 AAAATAAAAAATAGGGCTTTTTTAAATGTTTCTATTT 6 61 0 TTCCAAAGAAACAGGACTTTCGCAGTTTATATATGCA 1 244 0 AAATCCCAAAAAAGGATTTTAGCGAATTCCCCCTGCA 45 128 0 TACAAAATCCAAAGGATTTTGTTAAATCCGTAGGATT 16 109 1 AGTGGTTTTATAGGATTTTCCACAGTTTATATATTG 23 274 0 TCTACCAAAAATAGAACTTTTATTCATATATGTTGAA 36 96 1 ATAGAACTTTCACAAATAAAAATACTT 49 0 1 AAAAATTTAAATAGAACTTTCACAGTTTATATGCTGA 49 75 0 TTCAGAAACCATAGGGCTTCGCCCTATTGGGATACCC 25 27 1 ATGAAAACTAAAAGAGTTTTCATAGCTGGAAAGCGTA 4 68 0 CGGATTTTTAACAGAGTTTTTAATAATAGATGAATTA 23 32 0 TGGAAATAAAATAGGACTTTCGCATGAGGAAATATTT 23 196 1 GAGAGGCATAACAGGACTTTCGCAGGAATAAATATTC 1 168 1 GTATCCCAATAGAGGGTTTCCCTCTATGGTTTCCAAG 29 30 0 GTCCATTAAGTTAGGGCTTTCAGCCCTAATTAATGTC 28 52 1 GGGATTACCTATAGTGTTTTTCAAACTTAATAAAATT 2 108 1 AAATAAACACAGAGAATTTTTATGACAAATAGAACAT 0 261 1 ACGAAAACTCTTAGAGTTTTCATAGCTGGAAAGCATA 27 91 1 * ******** * MAP Score: 14.5618 Motif 12 CTATATAATAGTGGTTACGCATTGCGAAAAAT 6 185 0 GAGATCCCATGGGGCTTTGCCCCGCGGGGGTT 9 186 1 TAACGGGGCCGTGGGGTAGCCTGGATATCCTG 15 37 1 CTGTGCGCTTGGGGGGCGTGCGACCCGGGTTC 15 66 1 ATATCAAATGGTGGGGCCGCCGGGACTTGAAC 15 94 0 TTTAACTACAGTGGGGCTGAACGTAGTGAAGC 16 15 1 ATACCTCAGAGTGGAGCTTCACTACGTTCAGC 16 30 0 CAGAAACCATAGGGCTTCGCCCTATTGGGATA 25 29 1 TCATCCCAATAGGGGGTTTCCCCTATGGATAC 26 26 0 AGTAAGATTTGGGGAGTATCCCAATAGAGGGG 26 121 1 TCCCAATAGAGGGGCGAAGCCCCTCTATGGGT 26 139 1 GTATCCCAATAGAGGGTTTCCCTCTATGGTTT 29 35 0 AGGAGGTGTTAGGGTGTATCCCAATAGAGGGT 29 50 0 ATAAAAGAAAGTGGGGCTGAACGTAGTGAAGC 31 19 1 GGGGCTGAACGTAGTGAAGCCCCGCTCTGGGT 31 31 1 GTATCCCAATAGGGCGAAGCCCT 31 61 1 ATAGCGGGGGGGCCACACCCGAACCCAT 34 6 1 TGGCGGGAAAGGGGCGACGCCGCCGGCCACTT 34 87 1 CTATGCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCCTATCAT 34 157 1 TTGCCTTCGAGTGGTGCCTCATCTGGTTTTGT 41 108 0 ACTTTATTGAAGGGTGATGCCTTTGGCATCTA 49 33 1 **** ** **** MAP Score: 12.4785 Motif 13 TAGAGGAAAAAGATGGGTAAATTACTTCTCGG 23 66 0 GCGTAAGCGAGGAGGTGTTAGGTTTTGGTGAA 26 74 0 GCTTACGCTCGGAGGTGTAAATTAGTAAGATT 26 98 1 AGCGAAGCGAGGAGGTGTTAGTTTTTGATGAA 27 137 0 CGCTTCGCTCGGAAGTGTAAATTTACAACTGA 27 160 1 GCGTAAGCGAGGAGGTGTTAGGGTGTATCCCA 29 59 0 GCTTACGCTCGGAGGTGTAAATTAATTTTGAT 29 83 1 TCCGAGTTCGGGATGGGTTCGGGTGTGGCCCC 34 18 0 CCCGAGTCACGGGAGTGACAGTCCCGTATGAT 34 184 0 GGTGCTGATGGAGAGGGTAAGTGCCCTCATCC 41 149 1 AAAGGCTGAGGAGAGGGTTAGGTTCGCTAAAC 42 18 1 ACTGAGCTTTGAGAGGGTTAGGTCCGAGTTTT 42 162 0 ACAACCTCCCAAATGGGTTCGGTTGTGAGCTT 45 80 0 *** **** *** MAP Score: 3.98181 Motif 14 AGGTAGCCTAGCCCGGCCAAGGCGTGGGACTGGAGAT 9 154 1 ATCCCATGGGGCTTTGCCCCGCGGGGGTTCAAATCCC 9 189 1 ATAAAAAGAAGTGGCGCGGAGGGGGGGATTTGAACCC 9 213 0 ATTCTTTTTAACGGGGCCGTGGGGTAGCCTGGATATC 15 29 1 ACACCTCCTCGCTTACGCTCGGAGGTGTAAATTAGTA 26 88 1 TTGACAAAGCATAGGAGGAGACCTCCTATT 28 3 1 ACACCTCCTCGCTTACGCTCGGAGGTGTAAATTAATT 29 73 1 ATGGCAGTACTCGGGGCATCGCTGGGGGGCTTAACTT 34 49 0 CCTTGGCATTACTATGCCCTGGTGGTGTAGCCCGGCC 34 146 1 TAGGTTATGAGCTCAACATTGGGGGCAGACAAAACCA 41 80 1 CCACTCGAAGGCAATGCCAAAGTGGTGCTGATGGAGA 41 126 1 CCCTCTCAAAGCTCAGTAAAGCCGGAGATTAAAGGGA 42 177 1 ** *** ** ** * MAP Score: 3.0853