AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i MP/MP_operons002_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944246798 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 dnaJ 45 Mycoplasma pneumoniae, heat shock protein DnaJ; similar to Swiss-Prot Accession Number P17631, from B. subtilis #1 pmd1_mtd1 335 pmd1: Mycoplasma pneumoniae, transport ATP-binding protein; similar to Swiss-Prot Accession Number P36619, from S. pombe, mtd1: Mycoplasma pneumoniae, 5,10-methylene-tetrahydrofolate dehydrogenase; similar to GenBank Accession Number A64081, from H. influenzae #2 D02_orf128 300 Mycoplasma pneumoniae, D02_orf128 Protein #3 groES 187 Mycoplasma pneumoniae, heat shock protein GroES; similar to Swiss-Prot Accession Number P28599, from B. subtilis #4 lcnDR3 103 Mycoplasma pneumoniae, lactococcin transport ATP-binding protein; similar to Swiss-Prot Accession Number P37608, from L. lactis #5 MG388 121 Mycoplasma pneumoniae, MG388 homolog, from M. genitalium #6 P200 99 Mycoplasma pneumoniae, protein P200; similar to GenBank Accession Number L38997_6, from M. pneumoniae #7 H03_orf152 169 Mycoplasma pneumoniae, H03_orf152 Protein #8 adh 213 Mycoplasma pneumoniae, NADP-dependent alcohol dehydrogenase; similar to Swiss-Prot Accession Number P14941, from T. brockii #9 obg 203 Mycoplasma pneumoniae, GTP-binding protein Obg; similar to Swiss-Prot Accession Number P20964, from B. subtilis #10 ileS 42 Mycoplasma pneumoniae, isoleucine-tRNA ligase; similar to GenBank Accession Number S40178, from S. aureus #11 yihA 287 Mycoplasma pneumoniae, hypothetical protein (yihA) (era like) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P24253, from E. coli #12 MG269 300 Mycoplasma pneumoniae, MG269 homolog, from M. genitalium #13 yaaF 147 Mycoplasma pneumoniae, hypothetical protein (yaaF) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P37529, from B. subtilis #14 MG267 34 Mycoplasma pneumoniae, MG267 homolog, from M. genitalium #15 rpl21 146 Mycoplasma pneumoniae, ribosomal protein L21; similar to Swiss-Prot Accession Number P26908, from B. subtilis #16 nrdE 23 Mycoplasma pneumoniae, ribonucleoside-diphosphate reductase; similar to Swiss-Prot Accession Number Q08698, from S. typhimurium #17 thyA 300 Mycoplasma pneumoniae, thymidylate synthase; similar to Swiss-Prot Accession Number P13954, from S. aureus #18 rplK 55 Mycoplasma pneumoniae, ribosomal protein L11; similar to Swiss-Prot Accession Number P29395, from T. maritima #19 oppB 275 Mycoplasma pneumoniae, oligopeptide transport system permease protein OppB; similar to Swiss-Prot Accession Number P24138 and P24691, from B. subtilis Motif 1 ATCAAAGCAGTTTTATAATTAACAC 0 4 1 CTCTTAAGTTGTTGTTTTTTGTCAAG 1 5 1 GCTAGTTTTTAAGCGGTCTTATAATTAAAGC 1 303 1 TAATTAAAGCAAGTAGTTTTT 1 324 1 TCGCTAATGAAAACGGTTTTAACTCGATAAA 2 14 0 CTACTTGTTTAAGCGCTTTTTTGGCAAAAAC 5 22 1 AGAAAGCTGCAAGCTGTCTTTAATAATTTGC 5 79 0 CTTGGAGCAGTTTTTTCAATCAACC 7 4 1 TTGTAGTTAAAAGCTGTGTTAATAAAACACT 8 66 0 AAAGAATGGTAAGCAGTTGTAGTTAAAAGCT 8 82 0 ATCTCATGTCAAGCTGCTTTTTAATTAATAA 9 116 1 GGTTATCACGAATCTGTTTTTTAAAGATTTT 11 152 0 TGCTAAGATTAAGCACTTTTATGCGTGTTAT 12 137 1 ATACCAAAAGAAACGGTTTTATTGAAA 15 129 1 AGACACTAAAAAGCCGTTTTAGCAGCTCAAT 17 76 0 AAGGCTTTCTAAGCGCTTATAAGACACTAAA 17 97 0 GGGGGCTTACAAGCGGTTATTAACATTGTTT 17 180 1 ATAAGCTTTAAAGCGGTTTTAACACTGCAAA 17 255 0 **** ****** MAP Score: 25.7286 Motif 2 CCTAATGCTAATTTCTTTTAAACCCTAAAAA 2 56 0 TTGGTTTTTTAGTTGTTTTAAGTATTTGTTA 2 259 1 ACAGGCTTTCAATAAGCAGATA 4 1 1 CTACTACAACCCTTCTTTTATCTGCTTATTG 4 19 0 GTAGTACAGCCCTTTTTTTATTGGCACCTTA 4 46 1 TGGCATCGAGCTTTGTTTGCAAATTATTAAA 5 61 1 CAGCTTGCAGCTTTCTTTTCAACCAGAATTT 5 94 1 CTTGGAGCAGTTTTTTCAATCAACCGCA 7 7 1 CCATTTTCTCCAGTGTTTTATTAACACAGCT 8 55 1 AACTGCTTACCATTCTTTGAAGCCATTTGAA 8 95 1 GTTTGAGACGCTTGCTTTTAATAATTTTTGT 8 143 1 TACCAACATGCTTTTTTTGAAAGCTAACTTA 9 16 0 GCAGCTATCCCAGTGTTTCAAGTACGGGGAA 9 71 0 GATAGCTGCTCTTTGTTTGAACAATCTCATG 9 93 1 AACTTACTAACCTGGTTTTAATAACCAACAT 9 146 1 GTTGAGCTCGCTTGGTTTTAATTTTCGTATT 9 181 0 TATCACGAATCTGTTTTTTAAAGATTTTGAT 11 149 0 TTAATTACTTCTGGTTTTTAATGGAGCGCAT 11 263 0 CGGTTATTAACATTGTTTTAACAGGTTATTA 17 193 1 AGGTTATTAACATTGTTTTAAAAGGCTCCAT 17 215 1 TTAAACGCCTTTTTTTAAAGCTTTATAA 17 282 0 * ********* MAP Score: 21.5253 Motif 3 ATCCCCATTATTGGTGGAAGTAAATGGACTTGAACCATCGA 1 164 1 TAGATTTATCGAGTTAAAACCGTTTTCATTAGCGA 2 4 1 CCAATTAATTTTTTAGGGTTTAAAAGAAATTAGCATTAGGC 2 47 1 TTTTAAGCCTTTAATGGGTGTTGAAAAGTTTGTGGTAGTTT 2 154 1 CCTGATTTATTTACTAGTAGATTAAGCGTTTATTGCCAATA 3 51 0 TAAATTATTTTTATTTGCACTTTAAGCATTTAACTGCTAAT 3 128 1 CAGCTTCAAAGTTTTTGCCAAAAAAGCGCTTAAACAAGTAG 5 22 0 CCTTGAGGCGTTTTGCGATTAATAAAATTTTAATTTTTAAT 6 43 0 GTGGGTGTTATTAGGGGAAATTAATGCCTTAGGTTTTAACT 7 109 1 TTCAAATGGCTTCAAAGAATGGTAAGCAGTTGTAGTTAAAA 8 85 0 GGTTGCCTGTTTCCCCGTACTTGAAACACTGGGATAGCTGC 9 61 1 TCCGCGTGATTTTAGCGATGTAGAAACTTTTAAAAGTACTA 12 92 1 TTTATGCGTGTTATTCGAGCAAAATCCCCTTCTTTTTGTTT 12 154 1 ATTAAGACTATTTAATGAGTGTGATGGTTTTTTATTGCATA 13 84 1 AAAACGGCTTTTTAGTGTCTTATAAGCGCTTAGAAAGCCTT 17 87 1 TACAGGCCGTTTTGGGGGCTTACAAGCGGTTATTAACATTG 17 167 1 TTAGCTCATTTTTGCAGTGTTAAAACCGCTTTAAAGCTTAT 17 245 1 AACGCCTTTTTTTAAAGCTTTATAAGCTTTAAAGCGGTTTT 17 266 0 GCTAAAAACATTGTTAGTGGTTCAAAACATTCTACAAAAAA 19 27 0 TAACAATGTTTTTAGCGACTAAAATGCTGTTTGACTCCGAG 19 52 1 TTTTTCTTTTTTATTAGTATTCGAAAGTGTTCAAGTATATT 19 214 1 ** * * **** ** MAP Score: 20.8942 Motif 4 ATAAGATTAAGTTAGGCGTTTTTTGTTTAGCT 1 34 0 AAAGCTAGTTTTTAAGCGGTCTTATAATTAAA 1 300 1 TTTATCGAGTTAAAACCGTTTTCATTAGCGAG 2 14 1 GTTGAAACTTTTTAAGCCTTTAATGGGTGTTG 2 145 1 TTACTAGTAGATTAAGCGTTTATTGCCAATAA 3 50 0 GTTGTAGTAGTACAGCCCTTTTTTTATTGGCA 4 40 1 TAACTACTTGTTTAAGCGCTTTTTTGGCAAAA 5 19 1 ACTAAATGCCTTGAGGCGTTTTGCGATTAATA 6 60 0 TTACCATTCTTTGAAGCCATTTGAAGGCGTTC 8 101 1 GAAAACCAAATTAAGGCGATGTATGCCAAAAT 11 194 1 TTAAGGCCTTTTCACGGAAAAA 12 288 0 TAAGACACTAAAAAGCCGTTTTAGCAGCTCAA 17 77 0 TTTAGTGTCTTATAAGCGCTTAGAAAGCCTTT 17 97 1 AAATGAGCCCTACAGGCCGTTTTGGGGGCTTA 17 157 1 TTTGGGGGCTTACAAGCGGTTATTAACATTGT 17 177 1 TTTGCAGTGTTAAAACCGCTTTAAAGCTTATA 17 255 1 AAGCTTTAAAAAAAGGCGTTTAA 17 287 1 ** ***** *** MAP Score: 15.4922 Motif 5 GATTTATCGAGTTAAAACCGTTTTCATTAGCGAG 2 12 1 AAATAGTGCTGCTAAATTAGCGTGCCTGATTTAT 3 82 0 GGCATTTAGTGCTAAGCATGTTTGTTA 6 82 1 CCAGTGTTTTATTAACACAGCTTTTAACTACAAC 8 64 1 TTACCTGATAGTTTGAGACGCTTGCTTTTAATAA 8 133 1 CCAAATTAAGTTAGCTTTCAAAAAAAGC 9 4 1 TAATAAACTTACTAACCTGGTTTTAATAACCAAC 9 141 1 GGTTGAGCTCGCTTGGTTTTAATTTTCGTA 9 183 0 AGGATTATTTGCTCAATCCGCGTGATTTTAGCGA 12 76 1 CTTTTTGTTTACTAGTTTTGTGTTAGCAATCTTT 12 185 1 TAATTGAGCTGCTAAAACGGCTTTTTAGTGTCTT 17 74 1 TCTTATAAGCGCTTAGAAAGCCTTTTCTGTGCCA 17 104 1 ACAAGCGGTTATTAACATTGTTTTAACAGGTTAT 17 188 1 TTAACAGGTTATTAACATTGTTTTAAAAGGCTCC 17 210 1 GCAAAAATGAGCTAATGGAGCCTTTTAAAACAAT 17 226 0 TTTTTGCAGTGTTAAAACCGCTTTAAAGCTTATA 17 253 1 CCGCTTTAAAGCTTATAAAGCTTTAAAAAAAGGC 17 270 1 AATTGTGGGAGCTAGTTTAGCGTTATTACCACAC 18 26 1 GTACTTACTAGTATCGTTTTTTTGTAGAAT 19 6 1 GTTTTGAACCACTAACAATGTTTTTAGCGACTAA 19 40 1 ***** ***** MAP Score: 15.3347 Motif 6 GATGTAGTAGACAAAGACCAAAAAGAAGCTAAAGCTC 7 67 0 TCGAATACTAATAAAAAAGAAAAAGGAACCTGGTTCT 19 201 0 TTAAATAAACAAAAATTATTAAAAGCAAGCGTCTCAA 8 145 0 TTAGCGATGTAGAAACTTTTAAAAGTACTATGCGTGC 12 103 1 TTTTGTTTATACAAAATACCAAAAGAAACGGTTTTAT 15 114 1 GCCATAAGACAAAAAATACAAAAAGCATTCAGCGTTT 17 11 1 TTTGGAAATAACAAATACTTAAAACAACTAAAAAACC 2 261 0 GTTTTTGCCAAAAAAGCGCTTAAACAAGTAGTTAGAG 5 16 0 GATTGCTAACACAAAACTAGTAAACAAAAAGAAGGGG 12 179 0 CAGGCTTTCAATAAGCAGATAAAAGAAGGGTTGTAGT 4 11 1 AACAATGTTAATAACCTGTTAAAACAATGTTAATAAC 17 195 0 TTTAAAGCTTATAAAGCTTTAAAAAAAGGCGTTTAA 17 274 1 AGTTTCAACAATAAAAACTAAAAACTCTACGCCATCA 2 117 0 TTAACACTGCAAAAATGAGCTAATGGAGCCTTTTAAA 17 231 0 AAAACACTGGAGAAAATGGCAAATAAACTAATCCAGC 8 37 0 * *** ***** * MAP Score: 15.0432 Motif 7 AATTTAGCCAAAGCTAGTTTTTAAGCGGTCTTATAATTA 1 291 1 CTCGCTAATGAAAACGGTTTTAACTCGATAAATCTA 2 7 0 TAGCGAGTCCAATTAATTTTTTAGGGTTTAAAAGAAATT 2 39 1 TACTACTACAACCCTTCTTTTATCTGCTTATTGAAAGCC 4 13 0 CCGGGAGCTTTAGCTTCTTTTTGGTCTTTGTCTACTACA 7 63 1 ATCTCATGTCAAGCTGCTTTTTAATTAATAAACTTACTA 9 116 1 TAATTACGCTATTCTGATTTTATAAGATTCTAGAGAGGA 11 10 1 GGTTATCACGAATCTGTTTTTTAAAGATTTTGATAGAAA 11 144 0 ATTCGAGCAAAATCCCCTTCTTTTTGTTTACTAGTTTTG 12 166 1 TTTCAATAAAACCGTTTCTTTTGGTATTTTGTATAAA 15 119 0 TGAGCTGCTAAAACGGCTTTTTAGTGTCTTATAAGCGCT 17 78 1 AGCGGTTATTAACATTGTTTTAACAGGTTATTAACATTG 17 191 1 ACAGGTTATTAACATTGTTTTAAAAGGCTCCATTAGCTC 17 213 1 AAGGCTCCATTAGCTCATTTTTGCAGTGTTAAAACCGCT 17 236 1 TTAAACGCCTTTTTTTAAAGCTTTATAAGCTTT 17 277 0 TACTTACTAGTATCGTTTTTTTGTAGAATGTTTTGAACC 19 11 1 TTGAACCACTAACAATGTTTTTAGCGACTAAAATGCTGT 19 43 1 ** * ***** * * MAP Score: 12.2392 Motif 8 AACTACTTGCTTTAATTATAAGACCGCTTAA 1 311 0 AACAGGAAAATTTAATTTTTAAGCCTAATGC 2 79 0 GGTTAGGAAATTTAATTGAAAAACTACCACA 2 184 0 GAAAAATATTTGTTTGGAAATAACAAATA 2 281 0 TTAGTTTTAATTACTAACCACATATA 3 5 1 GCGTGCCTGATTTATTTACTAGTAGATTAAG 3 66 0 GCTAAATTATTTTTATTTGCACTTTAAGCAT 3 126 1 ACAGCCCTTTTTTTATTGGCACCTTAGCCTC 4 51 1 GGCATCGAGCTTTGTTTGCAAATTATTAAAG 5 62 1 TTAATAAAATTTTAATTTTTAATATTAATAT 6 35 0 GCTGGATTAGTTTATTTGCCATTTTCTCCAG 8 37 1 TTCTCCAGTGTTTTATTAACACAGCTTTTAA 8 60 1 ATAATTTTTGTTTATTTAAAATTCAGTTATT 8 163 1 ACCAACATGCTTTTTTTGAAAGCTAACTTAA 9 15 0 CAAGCTGCTTTTTAATTAATAAACTTACTAA 9 125 1 AGCATAGTAATTTTATTAATATTTAACTAAC 10 19 0 TTATTGGCTATTTTATTTCTATCAAAATCTT 11 129 1 TCCCCTTCTTTTTGTTTACTAGTTTTGTGTT 12 178 1 AAAGAAACGGTTTTATTGAAA 15 135 1 CCTTTTTCTTTTTTATTAGTATTCGAAAGTG 19 212 1 ******** ** MAP Score: 12.1099 Motif 9 TAGCTCAACTGATAGAGCACCTGATTTGCACTCAGGAGGTTG 1 121 0 TGTTGAAACTTTTTAAGCCTTTAATGGGTGTTGAAAAGTTTG 2 144 1 ACATATACAAGGTTGAGTGCCTTATTGGCAATAAACGCTTAA 3 29 1 CTAACTACTTGTTTAAGCGCTTTTTTGGCAAAAACTTTGAAG 5 18 1 GCTCCCGGTTAATCAAGCTGGAGTTTTGCGCTTTGCGGTTGA 7 29 0 TTAACCGGGAGCTTTAGCTTCTTTTTGGTCTTTGTCTACTAC 7 59 1 TTGTATTAGTGCTGGATTAGTTTATTTGCCATTTTCTCCAGT 8 27 1 CTTACCATTCTTTGAAGCCATTTGAAGGCGTTCTTACCTGAT 8 100 1 CTAAAACGGCTTTTTAGTGTCTTATAAGCGCTTAGAAAGCCT 17 85 1 TATAAGCGCTTAGAAAGCCTTTTCTGTGCCATTTTCCTAGCT 17 107 1 CATTTTCCTAGCTTGAGCCTAAAATGAGCCCTACAGGCCGTT 17 136 1 TTAGCTCATTTTTGCAGTGTTAAAACCGCTTTAAAGCTTATA 17 245 1 TTTAAAATTTCTAGCAAATTGTGGGAGCTAGTTTAGCGT 18 7 1 ACTAACAATGTTTTTAGCGACTAAAATGCTGTTTGACTCCGA 19 50 1 * * *** * * ** * MAP Score: 7.19546 Motif 10 CTTTAGCTTCTTTTTGGTCTTTGTCTACTACA 7 70 1 CAGCATTGGTTTTTTAGTTGTTTTAAGTATTT 2 254 1 TGGCGTAGAGTTTTTAGTTTTTATTGTTGAAA 2 120 1 GCTAAAAACATTGTTAGTGGTTCAAAACATTC 19 36 0 CTTAATTTGGTTTTCGGTGATTGGTGGGTTAT 11 177 0 TGTTGAAAAGTTTGTGGTAGTTTTTCAATTAA 2 172 1 CTTTTAATAATTTTTGTTTATTTAAAATTCAG 8 157 1 CTAAAACGGCTTTTTAGTGTCTTATAAGCGCT 17 85 1 AAAACCGTTTCTTTTGGTATTTTGTATAAACA 15 117 0 CTCTTAAGTTGTTGTTTTTTGTCAAGCTAA 1 8 1 CGTATTGCTTATGTTGGTTATTAAAACCAGGT 9 155 0 AATCCCCTTCTTTTTGTTTACTAGTTTTGTGT 12 176 1 TAACTTATTGTCAGTTTTTGTATTAGTGC 8 7 1 GTCAAACAGCATTTTAGTCGCTAAAAACATTG 19 55 0 CTGAATGCTTTTTGTATTTTTTGTCTTATGGC 17 11 0 TCCAATTAATTTTTTAGGGTTTAAAAGAAATT 2 46 1 ******** ** MAP Score: 7.14113 Motif 11 CTAATTTAGCAGCACTATTTCGGTAGTGTTGCT 3 96 1 TACTTGTTTAAGCGCTTTTTTGGCAAAAACTTT 5 23 1 CGGGAGCTTTAGCTTCTTTTTGGTCTTTGTCTA 7 64 1 GAAAGCTTACGACCCATTTTGGCATACATCGCC 11 208 0 GCTAAGATTAAGCACTTTTATGCGTGTTATTCG 12 138 1 AGACACTAAAAAGCCGTTTTAGCAGCTCAATTA 17 74 0 CGGCCTGTAGGGCTCATTTTAGGCTCAAGCTAG 17 143 0 TGAGCCCTACAGGCCGTTTTGGGGGCTTACAAG 17 160 1 AGGCTCCATTAGCTCATTTTTGCAGTGTTAAAA 17 237 1 *** * **** ** MAP Score: 6.09163 Motif 12 TCATATAAGATTAAGTTAGGCGTTTTTTGTTTAGCTTGAC 1 30 0 CACATATACAAGGTTGAGTGCCTTATTGGCAATAAACGCT 3 28 1 TAGTAAATAAATCAGGCACGCTAATTTAGCAGCACTATTT 3 76 1 TGCTAAATTATTTTTATTTGCACTTTAAGCATTTAACTGC 3 125 1 GTACAGCCCTTTTTTTATTGGCACCTTAGCCTCATTGGGT 4 49 1 TCTAACTACTTGTTTAAGCGCTTTTTTGGCAAAAACTTTG 5 17 1 ACTTTGAAGCTGGCATCGAGCTTTGTTTGCAAATTATTAA 5 51 1 TGTCAGTTTTTGTATTAGTGCTGGATTAGTTTATTTGCCA 8 18 1 AGGCGATGTATGCCAAAATGGGTCGTAAGCTTTCTGAAAC 11 207 1 AACGGGTTAGTGATGTCAAGGATTATTTGCTCAATCCGCG 12 58 1 TAAGCATGACTTTAGCAGGGGTTAATTTGTTATAATTTCA 15 44 1 TTAATTGAGCTGCTAAAACGGCTTTTTAGTGTCTTATAAG 17 73 1 ATTAACATTGTTTTAAAAGGCTCCATTAGCTCATTTTTGC 17 220 1 TTAAACGCCTTTTTTTAAAGCTTTATAAGCTTTAAAGCGG 17 270 0 TTTCTAGCAAATTGTGGGAGCTAGTTTAGCGTTATTACCA 18 17 1 TCTTAAACGTTTGGGTTTGGCAGTGTTAGCG 19 254 1 ** * ** ***** MAP Score: 5.87496 Motif 13 ATAATTATATTAATTTAGCCAAAGCTAGTTTTTAAGCGGT 1 280 1 TTAGTTTTAATTACTAACCACATATACAAGGTT 3 3 1 GGAAATTAATGCCTTAGGTTTTAACTTTGTCATTGCCCCA 7 124 1 TATTAACACAGCTTTTAACTACAACTGCTTACCATTCTTT 8 73 1 GTACCAACATGCTTTTTTTGAAAGCTAACTTAATTTGG 9 8 0 TGGGATAGCTGCTCTTTGTTTGAACAATCTCATGTCAAGC 9 90 1 TATTGCTTATGTTGGTTATTAAAACCAGGTTAGTAAGTTT 9 145 0 TCCAACACGACTTTGACCCTAACCAGTTTCCGTATGAC 12 8 1 GCACTTTTATGCGTGTTATTCGAGCAAAATCCCCTTCTTT 12 149 1 TTTTGTTTACTAGTTTTGTGTTAGCAATCTTTAACAGTGT 12 187 1 ACTTTACTAATCCTGATGCTGTAACTATCTTTTTCCGTGA 12 259 1 ACGCAAATAAGCGTGAAATTATAACAAATTAACCCCTGCT 15 57 0 GTTTCTTTTGGTATTTTGTATAAACAAAATTTAGGAACCG 15 103 0 TTAAACGCCTTTTTTTAAAGCTTTATAAGCTTTAAA 17 274 0 TTGTAGAATGTTTTGAACCACTAACAATGTTTTTAGCGAC 19 31 1 ATTATAAATCGCGTTTCCCTGTAGCCATCTGCACTTTTAG 19 102 1 TTAGCATGCTGAGGGACCTGAGAACCAGGTTCCTTTTTCT 19 181 1 * *** * *** * * MAP Score: 4.59407 Motif 14 CTCTTAAGTTGTTGTTTTTTGTCAAGC 1 6 1 TACTGTCAGCATTGGTTTTTTAGTTGTTTTA 2 248 1 TGTTTTAAGTATTTGTTATTTCCAAACAAAT 2 272 1 AATTATTTTTATTTGCACTTTAAGCATTTAA 3 130 1 CTTGGAGCAGTTTTTTCAATCAACCG 7 5 1 GGATTAGTTTATTTGCCATTTTCTCCAGTGT 8 40 1 ACACTGGGATAGCTGCTCTTTGTTTGAACAA 9 86 1 TCTCATGTCAAGCTGCTTTTTAATTAATAAA 9 117 1 CGGTGTCATTATTGGCTATTTTATTTCTATC 11 121 1 GTTATCACGAATCTGTTTTTTAAAGATTTTG 11 151 0 GAGCTGCTAAAACGGCTTTTTAGTGTCTTAT 17 79 1 GGGGCTTACAAGCGGTTATTAACATTGTTTT 17 181 1 ACTTACTAGTATCGTTTTTTTGTAGAATGTT 19 12 1 CCCTGTAGCCATCTGCACTTTTAGTTGGACT 19 118 1 ******* *** MAP Score: 3.30237 Motif 15 TTTGTTTAGCTTGACAAAAAACAACAACTTAAGAG 1 3 0 AACGCCTAACTTAATCTTATATGACTAGTTAGACGTTTGGAT 1 46 1 CAATTAATTTTTTAGGGTTTAAAAGAAATTAGCATTAGGCTT 2 48 1 AGTTTTTAGTTTTTATTGTTGAAACTTTTTAAGCCTTTAATG 2 128 1 AAAATATTTGTTTGGAAATAACAAATACTTAAAACAACTAAA 2 266 0 AGATTAAGCGTTTATTGCCAATAAGGCACTCAACCTTGTATA 3 32 0 AGCTTCAAAGTTTTTGCCAAAAAAGCGCTTAAACAAGTAGTT 5 20 0 CTTGAGGCGTTTTGCGATTAATAAAATTTTAATTTTTAATAT 6 41 0 TAACTGAATTTTAAATAAACAAAAATTATTAAAAGCAAGCGT 8 150 0 AATTACGCTATTCTGATTTTATAAGATTCTAGAGAGGATTAA 11 11 1 TATGCGCTCCATTAAAAACCAGAAGTAATTAATAA 11 262 1 CCGCGTGATTTTAGCGATGTAGAAACTTTTAAAAGTACTATG 12 93 1 TTTGCTCGAATAACACGCATAAAAGTGCTTAATCTTAGCACG 12 135 0 TGTAACTATCTTTTTCCGTGAAAAGGCCTTAA 12 278 1 GGTTCCTAAATTTTGTTTATACAAAATACCAAAAGAAACGGT 15 104 1 AAAAGGCTTTCTAAGCGCTTATAAGACACTAAAAAGCCGTTT 17 88 0 ACAGGCCGTTTTGGGGGCTTACAAGCGGTTATTAACATTGTT 17 168 1 TTAAAACCGCTTTAAAGCTTATAAAGCTTTAAAAAAAGGCGT 17 264 1 GTTCAAAACATTCTACAAAAAAACGATACTAGTAAGTAC 19 7 0 ** * *** **** MAP Score: 1.67772 Motif 16 TTGCTTTAATTATAAGACCGCTTAAAAACTAGCTTTGGCTAA 1 294 0 TAGATTTATCGAGTTAAAACCGTTTTCATTAGCG 2 2 1 GTCCAATTAATTTTTTAGGGTTTAAAAGAAATTAGCATTAGG 2 45 1 TTAGTTTTTATTGTTGAAACTTTTTAAGCCTTTAATGGGTGT 2 133 1 TCAGCATTGGTTTTTTAGTTGTTTTAAGTATTTGTTATTTCC 2 253 1 GCTAAATTATTTTTATTTGCACTTTAAGCATTTAACTGCTAA 3 126 1 AACCCTTCTTTTATCTGCTTATTGAAAGCCTGT 4 1 0 AAGCGCTTTTTTGGCAAAAACTTTGAAGCTGGCATCGAGCTT 5 32 1 AGTTTTGCGCTTTGCGGTTGATTGAAAAAACTGCTCCAAG 7 8 0 CTTACCATTCTTTGAAGCCATTTGAAGGCGTTCTTACCTGAT 8 100 1 TGGTTGCCTGTTTCCCCGTACTTGAAACACTGGGATAGCTGC 9 60 1 TCGTATTGCTTATGTTGGTTATTAAAACCAGGTTAGTAAGTT 9 146 0 ATTTTATTTCTATCAAAATCTTTAAAAAACAGATTCGTGATA 11 138 1 TCAAGGAAATTATGCGCTCCATTAAAAACCAGAAGTAATTAA 11 252 1 CTAAAACGGCTTTTTAGTGTCTTATAAGCGCTTAGAAAGCCT 17 85 1 CCTACAGGCCGTTTTGGGGGCTTACAAGCGGTTATTAACATT 17 165 1 AAAAATGAGCTAATGGAGCCTTTTAAAACAATGTTAATAACC 17 216 0 CATTAGCTCATTTTTGCAGTGTTAAAACCGCTTTAAAGCTTA 17 243 1 TAAACGCCTTTTTTTAAAGCTTTATAAGCTTTAAAGCGGTTT 17 267 0 TATCGTTTTTTTGTAGAATGTTTTGAACCACTAACAATGTTT 19 21 1 *** ** **** * MAP Score: 1.20036