AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i MP/MP_sum_all004_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944247883 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 hsdS 300 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #1 hsdS 300 Mycoplasma pneumoniae, restriction-modification enzyme subunit S1B; similar to GenBank Accession Number L25415_6, from M. pulmonis #2 type 119 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #3 type 300 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #4 hsdR 206 Mycoplasma pneumoniae, Type 1 restriction enzyme (hsdR) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P10486, from E. coli #5 hsdR 300 Mycoplasma pneumoniae, Type 1 restriction enzyme (hsdR) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P10486, from E. coli #6 type 300 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #7 hsdM 140 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme HsdM; similar to Swiss-Prot Accession Number P10484, from E. coli #8 type 138 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #9 hsdS1B 89 Mycoplasma pneumoniae, HsdS1B protein homolog; similar to GenBank Accession Number S49396, from M. pulmonis #10 putative 300 Mycoplasma pneumoniae, putative lipoprotein, MG260 homolog, from M. genitalium #11 prrB 300 Mycoplasma pneumoniae, protein (prrB) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P17222, from E. coli #12 type 300 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae Motif 1 AATAACCCTTAAAAATAAATAACTTACTGTTTATT 0 50 0 CGTGGAGATTAAAACTTACAAAATTAAAGATATTT 0 177 1 TATCTCCGTGAAAATCAAGGAATTTATCCTGTTTA 0 247 1 TCTTAAGGTAAAAAGTGATGAAATTAATCCTAAGT 1 207 1 ATCTAAGTGCATAAGCTAAAAACTTAGGATTAATT 1 228 0 TAGGGCAAGCATAATTAACAAATTTAGGTGTTTCT 1 264 0 ATTAAAACTTACAAAATCAAAGATATTT 3 3 1 CTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAATTTGCCCTAAAT 3 255 1 TAAAGCCAAAAAAGACAAAAAATTTAGATGGTGAA 4 133 1 TTCAAGCATGAAAAATTATTAATTCCCTAATAGAT 5 122 1 TAGATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGATTAC 5 152 1 AAAACTTACAAAATCAAGGATATTT 6 0 1 TTTAAAACTTAAAAATAACGAAATAAGTGCTAAGT 6 255 1 TCCTAATGCATAAGTTAAAAACTTAGCACTTATT 6 276 0 TTGTAATAATAAAAATGAACAAGTTTTTACCAATT 7 35 1 AACTTTCAACATAACTAAATAACTAAACTCACTAT 7 112 1 GCTGGGAGAAATAGCTCAAAAAGTTTTAGTAGGTG 8 27 1 TTTTAGTAAGAAAAAGAACGAAGTTTATAAATATC 8 78 1 TAACAGCAGTAAAGCTGAGGAATTT 8 123 1 TCACATTTAAAAAACTAAATCAATTTATTTATTGG 10 66 0 AATCTTAATAAAGATTAAACAAGTTTAATTCCTAA 10 251 0 TTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAAT 11 192 1 TTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAAT 12 192 1 **** * * ** ** MAP Score: 41.3811 Motif 2 CAGCAACTTCTAATGAAGGTGAA 0 287 1 CAGCAACAGTTAATAACGGTGAAATCGGTAAGA 1 62 1 GTGTTTTTTATCGTAACGGTCAATTTAACGCAA 1 158 1 GTTTGTGGAATTCTTAAGGTAAAAAGTGATGAA 1 196 1 TTGCTGATACTTTTAAAGGTAAATCAAGAATTT 2 28 0 GTTCAACATTAAATGATGGTGAAATAGGTCGCA 3 113 1 ATGAATGCGAATTTGATGGTGAATATGTAACTT 3 149 1 CATTGTGGTGTCTTAAAGGTAAAAAGCAATGAA 3 244 1 TCATCTAGATTGTTAATGCTAAAGTTTGTTTGA 4 74 0 AGACAAAAAATTTAGATGGTGAAAATAAAAACA 4 145 1 CTACTACTGCTAATAACGGTGAAATTGGCAGAA 6 110 1 AGGATTACGATCTTGATGGCGAATACGTTACCT 6 146 1 ATTCTTATGACTTTGATGGTGAATATGTTACTT 11 86 1 CTGTTTTTTATCGTAATGGTAAATTTAGCATCA 11 143 1 CCACAAAGATTTGTGATGCTAAATTTACCATTA 11 156 0 CTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAA 11 181 1 ATTCTTATGACTTTGATGGTGAATATGTTACTT 12 86 1 CTGTTTTTTATCGTAATGGTAAATTTAGCATCA 12 143 1 CCACAAAGATTTGTGATGCTAAATTTACCATTA 12 156 0 CTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAA 12 181 1 * *** ****** MAP Score: 36.3826 Motif 3 TGTCTCTTGCTTTTTATCAACAAGTTCTTTC 0 10 0 TTATCCTGTTTATTCATCAGCAACTTCTAAT 0 270 1 ATTCCCTGTTTATTCATCAGCAACAGTTAAT 1 45 1 CTTAGGATTAATTTCATCACTTTTTACCTTA 1 210 0 ATAAACAGGATATTCACCAGGGTTAGCTCTT 3 78 0 TATGCGACCTATTTCACCATCATTTAATGTT 3 117 0 TCAAGTTACATATTCACCATCAAATTCGCAT 3 153 0 TGTGTTTTTATTTTCACCATCTAAATTTTTT 4 149 0 GAGGTTATTATATTCATCAATGGCCTTCCTT 5 43 1 CTTTGAATTTAATTCACCACTTCAATCAAGC 5 90 1 CTTTTTAAATTTTTCGTCATCTATTAGGGAA 5 144 0 ATATCCGGTTTATTCATCTACTACTGCTAAT 6 93 1 TCAGGTAACGTATTCGCCATCAAGATCGTAA 6 150 0 ATCAGCAGGTTTTTCACCACCTACTAAAACT 8 48 0 AAATTCCTCAGCTTTACTGCTG 8 126 0 TTTTCCTGTTTATTCGGCAGCTACTAATAAC 11 33 1 TCAAGTAACATATTCACCATCAAAGTCATAA 11 90 0 GAAGCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTTTA 11 250 1 TTTTCCTGTTTATTCGGCAGCTACTAATAAC 12 33 1 TCAAGTAACATATTCACCATCAAAGTCATAA 12 90 0 CGTAATGGTAAATTTAGCATCACAAATCTTT 12 154 1 GAAGCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTTTA 12 250 1 ********* * MAP Score: 34.7048 Motif 4 GATCAAAATTTGTTTTTAATAGTTTCGATTTTAT 10 195 1 TTCAAAAGCAGTTTTTCAAAATTCTTGATTTAC 2 9 1 TAATCGGAAAACTTTTTAAATTTTTCGTCATCTA 5 152 0 GTAAGTTATTTATTTTTAAGGGTTATTTATTTCT 0 58 1 CTTATTTCGTTATTTTTAAGTTTTAAAACACCGC 6 248 0 TCACAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTT 11 263 1 ATGGAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGTAAATT 12 134 1 ATGCAGGTACTGTTTTTTATCGTAACGAAAAGTT 6 197 1 AAGCTGGTAGTGTTTTTTATCGTAACGGTCAATT 1 149 1 TCACAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTT 12 263 1 ATGGAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGTAAATT 11 134 1 GGGAATTAATAATTTTTCATGCTTGAAAGCTTGA 5 115 0 AAGATCCAGGAGTTTTTCCTGTTTATTCGGCAGC 11 20 1 AAGATCCAGGAGTTTTTCCTGTTTATTCGGCAGC 12 20 1 AAAATGAACAAGTTTTTACCAATTTAATAACTAA 7 46 1 TTTAATCTCCAGTTTTTTCTCATTTAAAAAGGAT 10 164 1 AAATTTTTTGTCTTTTTTGGCTTTAATCTATCAG 4 124 0 TCTCCTGGATTGTTTTTGATATATAGTTTGCTGA 1 11 0 AACTCCTGGATCTTTTTTAATGTC 11 0 0 AACTCCTGGATCTTTTTTAATGTC 12 0 0 ATAAGTGCTAAGTTTTTAACTTATGCATTAGGA 6 277 1 AAAAACTTGTTCATTTTTATTATTACAATTTCTT 7 29 0 CTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAAGACCAC 12 185 0 CTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAAGACCAC 11 185 0 TTAATCACTGAATTTTTAGGAATTAAACTTGTTT 10 236 1 TGAGAAATCGACATTTTAATTGTTGTTAAC 4 186 1 CTTTCATTAAACATTTTTAAGGTTTTGTTTTAAC 9 46 0 ACCTACTAAAACTTTTTGAGCTATTTCTCCCAGC 8 27 0 CAAATTTCATTGCTTTTTACCTTTAAGACACCAC 3 248 0 ATCCTTAATGTATTTTTTAGTAATTGCTTTGCCT 6 48 0 AAATTGATTTAGTTTTTTAAATGTGACGTCAAAT 10 75 1 TTTTGGTTTGAAATTTTGATTTTTATTGAAATTT 10 105 0 ATTAATCCTAAGTTTTTAGCTTATGCACTTAGAT 1 229 1 TATTTATTTCTCTTTTTAGGAAATCCATTTGAAA 0 81 1 ATAAGGATTTTAATTTTAGTTATTAAATTGGTAA 7 61 0 AGATTTCTCCAAATTTTGGGTTTTAGTGC 10 281 1 ATTTGCCCTAAATTTTTGGCATATGCATTGGGG 3 277 1 ******* * ** MAP Score: 32.2829 Motif 5 AGAAATAAATAACCCTTAAAAATAAATAACT 0 61 0 AAATTCGCAAAATATTTCAAATGGATTTCCT 0 98 0 GTGGAGATTAAAACTTACAAAATTAAAGATA 0 178 1 TTCCATGTGAAGCTTCACAAATATCTTTAAT 0 199 0 TTACCTTAAGAATTCCACAAACATTGGTTGC 1 187 0 TTCAAAAGCAGTTTTTCAAAATTCTTGATT 2 9 1 TTCTTTTAAAAGGCTTTAAAAGAGCTCTTGC 2 81 0 ATTAAAACTTACAAAATCAAAGATA 3 4 1 TGCCCCTAGAAATCTCGCAAATATCTTTGAT 3 25 0 AGGTCTTGATAAATCCTCAAAGAGTTTTCTA 4 11 1 ATTACAACGAAACCTTTCAAACAAACTTTAG 4 58 1 AATCTAGATGAATATTACAAAAATGTTTCTG 4 96 1 TGGTGAAAATAAAAACACAAATGGCTGAGAA 4 161 1 TAGATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGA 5 152 1 CAAACTTTTAAAAGAAGAGTTTG 5 287 0 AAAACTTACAAAATCAAGGATA 6 1 1 CGTTATTTTTAAGTTTTAAAACACCGCAGTG 6 244 0 GTTAAAACAAAACCTTAAAAATGTTTAATGA 9 46 1 AATAAAAATCAAAATTTCAAACCAAAAACTA 10 112 1 AAACAAGTTTAATTCCTAAAAATTCAGTGAT 10 239 0 TGGTAAATTTAGCATCACAAATCTTTGTGGT 11 159 1 TTACTTTCAAAAGACCACAAAGATTTGTGAT 11 172 0 AGAAGCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTTT 11 249 1 TGGTAAATTTAGCATCACAAATCTTTGTGGT 12 159 1 TTACTTTCAAAAGACCACAAAGATTTGTGAT 12 172 0 AGAAGCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTTT 12 249 1 ** ******** MAP Score: 25.6308 Motif 6 ACCAGAGCAAAATAAACAGTAAGTTATTTATTTTT 0 40 1 ATGGAAGAGAAATAAATACTAAATATCTCCGTGAA 0 224 1 GTTGCTGATGAATAAACAGGATAAATTCCTTGATT 0 259 0 GTTGCTGATGAATAAACAGGGAATTCTCCTGGATT 1 34 0 GTTGAACCAGAATAAACAGGATATTCACCAGGGTT 3 85 0 TCTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAATTTGCCCTAAA 3 254 1 GATTAAAGCCAAAAAAGACAAAAAATTTAGATGGT 4 130 1 GTTAACAACAATTAAAATGTCGATTTCT 4 188 0 GATAACCTTAAAGAAAAAAGGAAATCAGTAAGAGG 5 247 1 TTTTAAAACTTAAAAATAACGAAATAAGTGCTAAG 6 254 1 TTGTAATAATAAAAATGAACAAGTTTTTACCAATT 7 35 1 CCAATTTAATAACTAAAATTAAAATCCTTATTAAT 7 64 1 TTTTAGTAAGAAAAAGAACGAAGTTTATAAATATC 8 78 1 GTCAAATTTCAATAAAAATCAAAATTTCAAACCAA 10 102 1 TTTCTCATTTAAAAAGGATCAAAATTTGTTTTTAA 10 179 1 TCAGTGATTAAAGAAGACATAAAATCGAAACTATT 10 212 0 GTAGCTGCCGAATAAACAGGAAAAACTCCTGGATC 11 22 0 TTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAA 11 191 1 TCTAGTTTCAAAATATGAGCAAGATATTTTGAACT 11 217 0 ATTTTGAAACTAGAAGCACCGAAATTCACAAACCG 11 238 1 GTAGCTGCCGAATAAACAGGAAAAACTCCTGGATC 12 22 0 TTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAA 12 191 1 TCTAGTTTCAAAATATGAGCAAGATATTTTGAACT 12 217 0 ATTTTGAAACTAGAAGCACCGAAATTCACAAACCG 12 238 1 ** ** * ***** MAP Score: 25.3702 Motif 7 AAAAGAGAAATAAATAACCCTTAAAAATAAATAACTT 0 60 0 TGCGAATTTAGTTTATTCAATTCAAAAGACTTTTAAA 0 120 1 ACAGTAACAGTTTAATTTCTTTTAAAAGTCTTTTGAA 0 140 0 GCGTTAAATTGACCGTTACGATAAAAAACACTACCAG 1 152 0 TTCAAAATTCTTGATTTACCTTTAAAAGTATCAGCAA 2 24 1 ACAATAAAAGTTTAATTTCTTTTAAAAGGCTTTAAAA 2 91 0 TTTGATGGTGAATATGTAACTTGAACAATTGATGGTT 3 160 1 CCTAATAGATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGAT 5 147 1 GAGGATTGTCAAACTCTTCTTTTAAAAGTTTG 5 278 1 GCATTAAACTTTTCGTTACGATAAAAAACAGTACCTG 6 200 0 TCCTAATGCATAAGTTAAAAACTTAGCACTT 6 279 0 TTATGATCTGCTATTAAAAAAGAAATTGT 7 2 1 TTAAAAAAGAAATTGTAATAATAAAAATGAACAAGTT 7 23 1 TTACCAATTTAATAACTAAAATTAAAATCCTTATTAA 7 61 1 AATTGTTAGTAATAACAACTTTCAACATAACTAAATA 7 96 1 TTTCAGGTTAAAACAAAACCTTAAAAATGTTTAATGA 9 40 1 TAACAATTTAATTTCTTTCATTAAACATTTTTAAGGT 9 57 0 ATTGAAATTTGACGTCACATTTAAAAAACTAAATCAA 10 78 0 AATCTCCAGTTTTTTCTCATTTAAAAAGGATCAAAAT 10 167 1 GAAGACATAAAATCGAAACTATTAAAAACAAATTTTG 10 198 0 TTTGATGGTGAATATGTTACTTGAACAGCTGACGGTT 11 97 1 ATGCTAAATTTACCATTACGATAAAAAACAGCCCCTC 11 137 0 TAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAAGACCACAAAG 11 181 0 GTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATATCTTGCTC 11 199 1 CGAAATTCACAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAA 11 257 1 TTTGATGGTGAATATGTTACTTGAACAGCTGACGGTT 12 97 1 ATGCTAAATTTACCATTACGATAAAAAACAGCCCCTC 12 137 0 TAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAAGACCACAAAG 12 181 0 GTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATATCTTGCTC 12 199 1 CGAAATTCACAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAA 12 257 1 ** * * ** **** MAP Score: 25.1544 Motif 8 ATAACCCTTAAAAATAAATAACTTACTGTTTATTTTGCTC 0 44 0 CTCTTTTTAGGAAATCCATTTGAAATATTTTGCGAATTTA 0 90 1 ACATGGAAGAGAAATAAATACTAAATATCTCCGTGAAAAT 0 222 1 AAAAAGTGATGAAATTAATCCTAAGTTTTTAGCTTATGCA 1 216 1 GCAGTTTTTCAAAATTCTTGATTTACCTTTAAAAGTATCA 2 17 1 CCTTTTAAAAGAAATTAAACTTTTATTGTT 2 99 1 TTTGCCCCTAGAAATCTCGCAAATATCTTTGATTTTGTAA 3 18 0 AAAAAGCAATGAAATTTGCCCTAAATTTTTGGCATATGCA 3 264 1 TAAAAATAACGAAATAAGTGCTAAGTTTTTAACTTATGCA 6 264 1 CAAGCTGGGAGAAATAGCTCAAAAAGTTTTAGTAGGTGGT 8 24 1 TTTAATGAAAGAAATTAAATTGTTACTGTT 9 69 1 AAAAAGGATCAAAATTTGTTTTTAATAGTTTCGATTTTAT 10 189 1 AAGATATTTTGAACTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAA 11 192 0 AAATTAGTTCAAAATATCTTGCTCATATTTTGAAACTAGA 11 212 1 TAGAAGCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTTTAAAAATAG 11 248 1 AAGATATTTTGAACTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAA 12 192 0 AAATTAGTTCAAAATATCTTGCTCATATTTTGAAACTAGA 12 212 1 TAGAAGCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTTTAAAAATAG 12 248 1 ***** ** *** MAP Score: 22.8759 Motif 9 TTTGCGAATTTAGTTTATTCAATTCAAAAG 0 118 1 GGAATTTATCCTGTTTATTCATCAGCAACT 0 265 1 GGAGAATTCCCTGTTTATTCATCAGCAACA 1 40 1 CAAGCTGGTAGTGTTTTTTATCGTAACGGT 1 148 1 TTCAAAAGCAGTTTTTCAAAATTCTTGA 2 8 1 GGTGAATATCCTGTTTATTCTGGTTCAACA 3 91 1 TATGCAGGTACTGTTTTTTATCGTAACGAA 6 196 1 TAAATTGATTTAGTTTTTTAAATGTGACGT 10 74 1 TTTTAATCTCCAGTTTTTTCTCATTTAAAA 10 163 1 GGAGTTTTTCCTGTTTATTCGGCAGCTACT 11 28 1 TATGGAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGT 11 133 1 GGAGTTTTTCCTGTTTATTCGGCAGCTACT 12 28 1 TATGGAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGT 12 133 1 ********** MAP Score: 20.9831 Motif 10 TTTATTCAATTCAAAAGACTTTTAAAAGAAAT 0 131 1 ACTTACAAAATTAAAGATATTTGTGAAGCTTC 0 190 1 TCCATTAAAATCACAATCCTTTATCTTACCGA 1 86 0 TTCAAAAGCAGTTTTTCAAAATT 2 1 1 AAGCAGTTTTTCAAAATTCTTGATTTACCTTT 2 15 1 TTAATTTCTTTTAAAAGGCTTTAAAAGAGCTC 2 85 0 ACTTACAAAATCAAAGATATTTGCGAGATTTC 3 16 1 TGATAAATCCTCAAAGAGTTTTCTAAGTCAAA 4 17 1 CTTTAATCTATCAGAAACATTTTTGTAATATT 4 106 0 TGAATTAAATTCAAAGATACTTATTAAAACAA 5 74 0 GACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGATTACTT 5 157 1 ATTTTTATTATTACAATTTCTTTTTTAATAGC 7 19 0 GAGAAATAGCTCAAAAAGTTTTAGTAGGTGGT 8 32 1 AGCTAACTAATCACAATAATTTCAGGTTAAAA 9 21 1 AAACAAAACCTTAAAAATGTTTAATGAAAGAA 9 50 1 TTAAAAAGGATCAAAATTTGTTTTTAATAGTT 10 187 1 ACCATCAAAGTCATAAGAATTTATTCGACCAA 11 74 0 AAATTTAGCATCACAAATCTTTGTGGTCTTTT 11 163 1 AGAAATTAGTTCAAAATATCTTGCTCATATTT 11 210 1 GCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTTTAAAAA 11 253 1 ACCATCAAAGTCATAAGAATTTATTCGACCAA 12 74 0 AAATTTAGCATCACAAATCTTTGTGGTCTTTT 12 163 1 AGAAATTAGTTCAAAATATCTTGCTCATATTT 12 210 1 GCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTTTAAAAA 12 253 1 ******* *** MAP Score: 20.6754 Motif 11 TTAGGAAATCCATTTGAAATATTTTGCGAATTTAGTTTA 0 96 1 AATTCAAAAGACTTTTAAAAGAAATTAAACTGTTACTGT 0 138 1 GGAGATTAAAACTTACAAAATTAAAGATATTTGTGAAGC 0 180 1 TGTTGCTGATACTTTTAAAGGTAAATCAAGAATTTTGAA 2 24 0 AGTTTAATTTCTTTTAAAAGGCTTTAAAAGAGCTCTTGC 2 81 0 ATTAAAACTTACAAAATCAAAGATATTTGCGAGAT 3 6 1 GATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGATTACTTGCAC 5 154 1 AAAACTTACAAAATCAAGGATATTTGCGAGAT 6 3 1 GCACTGCGGTGTTTTAAAACTTAAAAATAACGAAATAAG 6 243 1 TTGACGTCACATTTAAAAAACTAAATCAATTTATTTATT 10 68 0 TAAAAATCAAAATTTCAAACCAAAAACTATAACACACCA 10 114 1 AATTTTGATCCTTTTTAAATGAGAAAAAACTGGAGATTA 10 166 0 TTTATTTTTTACTTTCAAAAGACCACAAAGATTTGTGAT 11 172 0 CGGTGCTTCTAGTTTCAAAATATGAGCAAGATATTTTGA 11 220 0 CACAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTTAACACA 11 264 1 TTTATTTTTTACTTTCAAAAGACCACAAAGATTTGTGAT 12 172 0 CGGTGCTTCTAGTTTCAAAATATGAGCAAGATATTTTGA 12 220 0 CACAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTTAACACA 12 264 1 * *** *** * * * MAP Score: 20.2734 Motif 12 GGAGATTAAAACTTACAAAATTAAAGATATTTGTGAAGCTT 0 180 1 ACTAAATATCTCCGTGAAAATCAAGGAATTTATCCTGTTTA 0 241 1 TAACGGTGAAATCGGTAAGATAAAGGATTGTGATTTTAATG 1 75 1 CGTTAAATTGACCGTTACGATAAAAAACACTACCAGCTTGG 1 147 0 TGGAATTCTTAAGGTAAAAAGTGATGAAATTAATCCTAAGT 1 201 1 ATTAAAACTTACAAAATCAAAGATATTTGCGAGATTT 3 6 1 TTCTAGGGGCAAAGCAATTACCAAAGAATACATAAGAGCTA 3 45 1 TGGTGTCTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAATTTGCCCTAAAT 3 249 1 AAAACTTACAAAATCAAGGATATTTGCGAGATCT 6 3 1 CTCAAGAGGCAAAGCAATTACTAAAAAATACATTAAGGATA 6 42 1 TAACGGTGAAATTGGCAGAATAAAGGATTACGATCTTGATG 6 123 1 CATTAAACTTTTCGTTACGATAAAAAACAGTACCTGCATAT 6 195 0 ATCCTTATTAATTGTTAGTAATAACAACTTTCAACATAACT 7 87 1 AAAACCTTAAAAATGTTTAATGAAAGAAATTAAATTGTTAC 9 54 1 TGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAAT 11 186 1 TGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAAT 12 186 1 * * * * ** ** * * MAP Score: 14.2917 Motif 13 AATCCATTTGAAATATTTTGCGAATTTAGTTTATTCA 0 102 1 ACAAATATCTTTAATTTTGTAAGTTTTAATCTCCACG 0 177 0 AACTTAGGATTAATTTCATCACTTTTTACCTTAAGAA 1 206 0 CTTAGATTAGAAACACCTAAATTTGTTAATTATGCTT 1 256 1 AACAATAAAAGTTTAATTTCTTTTAAAAGGCTTT 2 95 0 GAAATCTCGCAAATATCTTTGATTTTGTAAGTTTTAA 3 11 0 AATTTAGGGCAAATTTCATTGCTTTTTACCTTTAAGA 3 254 0 TTGACTTAGAAAACTCTTTGAGGATTTATCAAGACCT 4 11 0 AATCTATCAGAAACATTTTTGTAATATTCATCTAGAT 4 97 0 TTCACCATCTAAATTTTTTGTCTTTTTTGGCTTTAAT 4 131 0 AGTAATCGGAAAACTTTTTAAATTTTTCGTCATCTAT 5 151 0 AAAACTTACAAAATCAAGGATATTTGCGAGATCTC 6 8 1 TGCATAAGTTAAAAACTTAGCACTTATTTCGTTATTT 6 267 0 TTGTAATAATAAAAATGAACAAGTTTTTACCAATTTA 7 35 1 AACTAAAATTAAAATCCTTATTAATTGTTAGTAATAA 7 74 1 GTAGGTGGTGAAAAACCTGCTGATTTTAGTAAGAAAA 8 55 1 TTGGATATTTATAAACTTCGTTCTTTTTCTTACTAAA 8 79 0 TTCTTTCATTAAACATTTTTAAGGTTTTGTTTTAACC 9 45 0 GTCACATTTAAAAAACTAAATCAATTTATTTATTGGG 10 65 0 TTTAGGAATTAAACTTGTTTAATCTTTATTAAGATTT 10 250 1 ATCTTTATTAAGATTTCTCCAAATTTTGGGTTTTAGT 10 271 1 TAAACAGGAAAAACTCCTGGATCTTTTTTAATGTC 11 8 0 TTTGGTCGAATAAATTCTTATGACTTTGATGGTGAAT 11 73 1 TTTACTTTCAAAAGACCACAAAGATTTGTGATGCTAA 11 167 0 TATTTTGAACTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAA 11 191 0 AATTAGTTCAAAATATCTTGCTCATATTTTGAAACTA 11 213 1 TAAACAGGAAAAACTCCTGGATCTTTTTTAATGTC 12 8 0 TTATTCGACCAAACTCCCCATCGTTATTAGTAGCTGC 12 49 0 TTTGGTCGAATAAATTCTTATGACTTTGATGGTGAAT 12 73 1 TTTACTTTCAAAAGACCACAAAGATTTGTGATGCTAA 12 167 0 TATTTTGAACTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAA 12 191 0 AATTAGTTCAAAATATCTTGCTCATATTTTGAAACTA 12 213 1 *** **** *** MAP Score: 13.0806 Motif 14 TAAACAGTAAGTTATTTATTTTTAAGGGTTA 0 52 1 ATTTTTAAGGGTTATTTATTTCTCTTTTTAG 0 69 1 CATCTAAATTTTTTGTCTTTTTTGGCTTTAA 4 132 0 TTCTCAGCCATTTGTGTTTTTATTTTCACCA 4 161 0 ACTGATTTCCTTTTTTCTTTAAGGTTATCCC 5 245 0 TTTCGTTATTTTTAAGTTTTAAAACACCGCA 6 247 0 ATTATTACAATTTCTTTTTTAATAGCAGATC 7 14 0 GTAAAAACTTGTTCATTTTTATTATTACAAT 7 34 0 GGATTTTAATTTTAGTTATTAAATTGGTAAA 7 60 0 AATAAATTGATTTAGTTTTTTAAATGTGACG 10 72 1 GGTTTGAAATTTTGATTTTTATTGAAATTTG 10 104 0 ATTAAACTTGTTTAATCTTTATTAAGATTTC 10 257 1 TTCTCCAAATTTTGGGTTTTAGTGC 10 285 1 AACTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAAG 11 190 0 AACTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAAG 12 190 0 *** ******* MAP Score: 3.76158