AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i MP/MP_sum_all004_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944247913 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 hsdS 300 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #1 hsdS 300 Mycoplasma pneumoniae, restriction-modification enzyme subunit S1B; similar to GenBank Accession Number L25415_6, from M. pulmonis #2 type 119 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #3 putative 300 Mycoplasma pneumoniae, putative lipoprotein, MG260 homolog, from M. genitalium #4 type 300 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #5 hsdR 206 Mycoplasma pneumoniae, Type 1 restriction enzyme (hsdR) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P10486, from E. coli #6 H91_orf115 129 Mycoplasma pneumoniae, H91_orf115 Protein #7 hsdR 300 Mycoplasma pneumoniae, Type 1 restriction enzyme (hsdR) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P10486, from E. coli #8 type 300 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #9 hsdM 140 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme HsdM; similar to Swiss-Prot Accession Number P10484, from E. coli #10 mutB1 62 Mycoplasma pneumoniae, DNA helicase II; similar to GenBank Accession Number H64188, from H. influenzae #11 MG241 243 Mycoplasma pneumoniae, MG241 homolog, from M. genitalium #12 type 138 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae #13 hsdS1B 89 Mycoplasma pneumoniae, HsdS1B protein homolog; similar to GenBank Accession Number S49396, from M. pulmonis #14 putative 300 Mycoplasma pneumoniae, putative lipoprotein, MG260 homolog, from M. genitalium #15 prrB 300 Mycoplasma pneumoniae, protein (prrB) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P17222, from E. coli #16 type 300 Mycoplasma pneumoniae, type I restriction enzyme ecokI specificity protein (hsdS) homolog; similar to GenBank Accession Number E64055, from H. influenzae Motif 1 CGTGGAGATTAAAACTTACAAAATTAAAGATATTT 0 177 1 CTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAATTTGCCCTAAAT 4 255 1 TTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAAT 15 192 1 TTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAAT 16 192 1 TTAAAGCCAAAAAAGACAAAAAATTTAGATGGTGA 5 132 1 TCTTAAGGTAAAAAGTGATGAAATTAATCCTAAGT 1 207 1 TTTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTTTCATCTTAA 3 177 1 ATTAAAACTTACAAAATCAAAGATATTT 4 3 1 AAAACTTACAAAATCAAGGATATTT 8 0 1 TAGATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGATTAC 7 152 1 TTGTAATAATAAAAATGAACAAGTTTTTACCAATT 9 35 1 TTTTAGTAAGAAAAAGAACGAAGTTTATAAATATC 12 78 1 ATAACCTTAAAGAAAAAAGGAAATCAGTAAGAGGA 7 248 1 CAGTGATTAAAGAAGACATAAAATCGAAACTATTA 14 211 0 TTTTGAAACTAGAAGCACCGAAATTCACAAACCGT 15 239 1 TTTTGAAACTAGAAGCACCGAAATTCACAAACCGT 16 239 1 CACTTAGATTAGAAACACCTAAATTTGTTAATTAT 1 254 1 TATCTCCGTGAAAATCAAGGAATTTATCCTGTTTA 0 247 1 TATTTTAGTTAGAATTAAACAATTTAAGCTCTTTG 11 181 0 TTTACCACACAGGATCTAATAAATTTCAAGAGTTA 3 223 1 AAAGACTTTTAAAAGAAATTAAACTGTTACTGTCG 0 144 1 AAAGCCTTTTAAAAGAAATTAAACTTTTATTGTT 2 95 1 TTGACCATTTTGAATGGATAAAATTTCCTTGCAAA 3 83 1 TCTTTTGAATTGAATAAACTAAATTCGCAAAATAT 0 114 0 AATAACCCTTAAAAATAAATAACTTACTGTTTATT 0 50 0 TCTGTTATAAAAAAGGGATAAAATG 10 0 0 TTCAAGCATGAAAAATTATTAATTCCCTAATAGAT 7 122 1 AATGTTTAATGAAAGAAATTAAATTGTTACTGTT 13 65 1 AAACACTAAAAACCCGAAATTTGGAGAAATAT 3 278 0 TCACATTTAAAAAACTAAATCAATTTATTTATTGG 14 66 0 TTTAAAACTTAAAAATAACGAAATAAGTGCTAAGT 8 255 1 TTCTCATTTAAAAAGGATCAAAATTTGTTTTTAAT 14 180 1 AATCTTAATAAAGATTAAACAAGTTTAATTCCTAA 14 251 0 TATTGGGAGCAGGAAAACGAAAATTCTGTGTTGAA 14 37 0 **** * ***** MAP Score: 41.207 Motif 2 ATAAAAGCTTTTAAGATGAAAATTTAATCTCTTTTA 3 186 0 AAATCAAAATTTCAAACCAAAAACTATAACACACCA 14 117 1 TTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAG 15 183 1 TTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAG 16 183 1 TGACGTCAAATTTCAATAAAAATCAAAATTTCAAAC 14 98 1 TCACAATAATTTCAGGTTAAAACAAAACCTTAAAAA 13 31 1 TGTGGAATTCTTAAGGTAAAAAGTGATGAAATTAAT 1 199 1 TTTAAGCTCTTTGAGAAAAAAAATAGTGATCTTTGG 11 158 0 TTCTGATAGATTAAAGCCAAAAAAGACAAAAAATTT 5 122 1 TGGGATAACCTTAAAGAAAAAAGGAAATCAGTAAGA 7 244 1 TTGTGGTGTCTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAATTTG 4 246 1 AAACCTCTCATTGCGGTAAAAAACTATGCCAGCATA 4 196 0 TTTGCGTTTGTTCAAACAAAAAGGTGCAAGTAATCG 7 180 0 GTTACTGTCGTGGAGATTAAAACTTACAAAATTAAA 0 169 1 GAGAAAAAACTGGAGATTAAAATCAATGAGCTTGGT 14 149 0 AAACTTTTCGTTACGATAAAAAACAGTACCTGCATA 8 196 0 AAATTTACCATTACGATAAAAAACAGCCCCTCCATA 16 133 0 AAATTTACCATTACGATAAAAAACAGCCCCTCCATA 15 133 0 ATTTAGATGGTGAAAATAAAAACACAAATGGCTGAG 5 154 1 TCAAAAGACTTTTAAAAGAAATTAAACTGTTACTGT 0 141 1 TTTAAAGCCTTTTAAAAGAAATTAAACTTTTATTGT 2 92 1 AAAGTGAATATTCAGACAAGAATCAAACTCTAGAGA 6 50 1 TAATTTCTATTTGCAAGGAAATTTTATCCATTCAAA 3 91 0 TTTAATCTCTTTTAAATAAGAAAAAAGCCAAGATGA 3 164 0 TTTGATCCTTTTTAAATGAGAAAAAACTGGAGATTA 14 166 0 CAACGAAACCTTTCAAACAAACTTTAGCATTAACAA 5 62 1 ATGCCAAAAATTTAGGGCAAATTTCATTGCTTTTTA 4 263 0 ATCGAAACTATTAAAAACAAATTTTGATCCTTTTTA 14 188 0 TATTAGTAGCTGCCGAATAAACAGGAAAAACTCCTG 15 26 0 TATTAGTAGCTGCCGAATAAACAGGAAAAACTCCTG 16 26 0 CCTTTCATCTTGGCAAATAAATTGCAATTT 7 4 0 GCTGATACTTTTAAAGGTAAATCAAGAATTTTGAAA 2 23 0 AACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTTAACACAT 16 268 1 AACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTTAACACAT 15 268 1 ** *** **** * MAP Score: 37.2432 Motif 3 TTTATCCTGTTTATTCATCAGCAACTTCTA 0 269 1 AATTCCCTGTTTATTCATCAGCAACAGTTA 1 44 1 ACTTAGGATTAATTTCATCACTTTTTACCT 1 212 0 GAACTAAGCAATTTTCATCTTGGCTTTTTT 3 150 1 AAGAGATTAAATTTTCATCTTAAAAGCTTT 3 189 1 AAAAGCTTTTATTTTTACCACACAGGATCT 3 210 1 AATAAACAGGATATTCACCAGGGTTAGCTC 4 80 0 CTATGCGACCTATTTCACCATCATTTAATG 4 119 0 TTCAAGTTACATATTCACCATCAAATTCGC 4 155 0 CATTTTTGTAATATTCATCTAGATTGTTAA 5 91 0 TTGTGTTTTTATTTTCACCATCTAAATTTT 5 151 0 AGGTATGAATAATTTCACCAAATTTACTTC 6 104 0 TGAGGTTATTATATTCATCAATGGCCTTCC 7 42 1 TCTTTGAATTTAATTCACCACTTCAATCAA 7 89 1 AATAAACCGGATATTGACCAGGATTATCCT 8 77 0 AATATCCGGTTTATTCATCTACTACTGCTA 8 92 1 GGAGGGGATCAAATGCACCACCAAAGATCA 11 138 1 AATCAGCAGGTTTTTCACCACCTACTAAAA 12 50 0 TTCAAGTAACATATTCACCATCAAAGTCAT 15 92 0 TTGTGATGCTAAATTTACCATTACGATAAA 15 149 0 AGAAGCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTT 15 249 1 TTCAAGTAACATATTCACCATCAAAGTCAT 16 92 0 TTGTGATGCTAAATTTACCATTACGATAAA 16 149 0 AGAAGCACCGAAATTCACAAACCGTGTTTT 16 249 1 ********** MAP Score: 35.1044 Motif 4 TCTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAATTTGCCCTAAATT 4 254 1 GACATTAAAAAAGATCCAGGAGTTTTTCCTGTTTA 16 8 1 GACATTAAAAAAGATCCAGGAGTTTTTCCTGTTTA 15 8 1 TCTTTGAGAAAAAAAATAGTGATCTTTGGTGGTGCAT 11 150 0 TTTTCTTACTAAAATCAGCAGGTTTTTCACCACCTAC 12 55 0 TTTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTTTCATCTTAAAA 3 177 1 ATTAAAGCCAAAAAAGACAAAAAATTTAGATGGTGAA 5 131 1 ATAGATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGATTACT 7 151 1 TTTCTCATTTAAAAAGGATCAAAATTTGTTTTTAATA 14 179 1 AAAGCCTTTTAAAAGAAATTAAACTTTTATTGTT 2 95 1 AAAACTTACAAAATCAAGGATATTTGCGAGATCTC 8 8 1 TTAAAACTTACAAAATTAAAGATATTTGTGAAGCTTC 0 185 1 TTAAAACTTACAAAATCAAAGATATTTGCGAGATTTC 4 11 1 TGTAATAATAAAAATGAACAAGTTTTTACCAATTTAA 9 36 1 TATTCACCATCAAAGTCATAAGAATTTATTCGACCAA 16 74 0 TATTCACCATCAAAGTCATAAGAATTTATTCGACCAA 15 74 0 ATTTTAGTAAGAAAAAGAACGAAGTTTATAAATATCC 12 77 1 TTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATA 16 191 1 TTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATA 15 191 1 TTCTTAAGGTAAAAAGTGATGAAATTAATCCTAAGTT 1 206 1 GCAGCTACTAATAACGATGGGGAGTTTGGTCGAATAA 16 49 1 GCAGCTACTAATAACGATGGGGAGTTTGGTCGAATAA 15 49 1 TTAGCATCACAAATCTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAA 15 167 1 TTAGCATCACAAATCTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAA 16 167 1 TTATTACTAACAATTAATAAGGATTTTAATTTTAGTT 9 74 0 ACTGCTGTTAGAAAGAATTGGATATTTATAAACTTCG 12 96 0 AAATTTGGAGAAATATTAACAAAGTTTGTACTTGTTT 3 257 0 AGGTCTTGATAAATCCTCAAAGAGTTTTCTAAGTCAA 5 11 1 ACTAAAACCCAAAATTTGGAGAAATCTTAATAAAGAT 14 271 0 AAACACTAAAAACCCGAAATTTGGAGAAATAT 3 278 0 TTATCCATTCAAAATGGTCAAAACTTAAGTAAAAATA 3 67 0 TGAATAAACTAAATTCGCAAAATATTTCAAATGGATT 0 102 0 CCCAATAAATAAATTGATTTAGTTTTTTAAATGTGAC 14 65 1 AAATAACGAAATAAGTGCTAAGTTTTTAACTTATGCA 8 267 1 ATATCTCCGTGAAAATCAAGGAATTTATCCTGTTTAT 0 246 1 TCTAACAGCAGTAAAGCTGAGGAATTT 12 121 1 **** *** *** MAP Score: 34.8403 Motif 5 TTCAAAAGACTTTTAAAAGAAATTAAACTGTT 0 140 1 AATTCCTTGATTTTCACGGAGATATTTAGTAT 0 239 0 AGGATTGTGATTTTAATGGAGAGTACGTCACT 1 98 1 CTGGTAGTGTTTTTTATCGTAACGGTCAATTT 1 152 1 TTGCTGATACTTTTAAAGGTAAATCAAGAATT 2 29 0 TTTTAAAGCCTTTTAAAAGAAATTAAACTTTT 2 91 1 CTTTTTTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTTTC 3 173 1 ATGAATGCGAATTTGATGGTGAATATGTAACT 4 149 1 AGACAAAAAATTTAGATGGTGAAAATAAAAAC 5 145 1 GAACGCCTATTTTTGAAAGTGAATATTCAGAC 6 35 1 CAGGTACTGTTTTTTATCGTAACGAAAAGTTT 8 200 1 TGATTTAGTTTTTTAAATGTGACGTCAAATTT 14 79 1 GAAATTTTGATTTTTATTGAAATTTGACGTCA 14 98 0 TTTTGATCCTTTTTAAATGAGAAAAAACTGGA 14 171 0 ATTCTTATGACTTTGATGGTGAATATGTTACT 15 86 1 GAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGTAAATTT 15 137 1 CTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGA 15 181 1 ATTCTTATGACTTTGATGGTGAATATGTTACT 16 86 1 GAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGTAAATTT 16 137 1 CTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGA 16 181 1 **** ** **** MAP Score: 31.4258 Motif 6 ATAACCCTTAAAAATAAATAACTTACTGTTT 0 53 0 ATTTCCTAAAAAGAGAAATAAATAACCCTTA 0 74 0 CTTCACATGGAAGAGAAATAAATACTAAATA 0 218 1 TTCATCAGCAACAGTTAATAACGGTGAAATC 1 57 1 ATTGACCGTTACGATAAAAAACACTACCAGC 1 151 0 CTAAGTGCATAAGCTAAAAACTTAGGATTAA 1 230 0 TAGAAATTACAAACCAAAAACTATAACAAAA 3 118 1 AAACACTAAAAACCCGAAATTTG 3 287 0 GTGGTGTCTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAAT 4 248 1 TGATAGATTAAAGCCAAAAAAGACAAAAAAT 5 125 1 TTAGATGGTGAAAATAAAAACACAAATGGCT 5 156 1 CGTTCCAGTAAAGCCAAATAAAATCCCATT 6 9 0 AGATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGAT 7 153 1 ACTTTTCGTTACGATAAAAAACAGTACCTGC 8 199 0 CGGTGTTTTAAAACTTAAAAATAACGAAATA 8 249 1 CCTAATGCATAAGTTAAAAACTTAGCACTTA 8 278 0 GTTATTACTAACAATTAATAAGGATTTTAAT 9 81 0 ATTTGACGTCACATTTAAAAAACTAAATCAA 14 78 0 TCAAAATTTCAAACCAAAAACTATAACACAC 14 120 1 GACATTAAAAAAGATCCAGGAG 15 1 1 TGCCGAATAAACAGGAAAAACTCCTGGATCT 15 21 0 ATTTACCATTACGATAAAAAACAGCCCCTCC 15 136 0 TGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATT 15 186 1 GACATTAAAAAAGATCCAGGAG 16 1 1 TGCCGAATAAACAGGAAAAACTCCTGGATCT 16 21 0 ATTTACCATTACGATAAAAAACAGCCCCTCC 16 136 0 TGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATT 16 186 1 *** ******* MAP Score: 30.1203 Motif 7 ATCTTGGCTTTTTTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTTTCATCT 3 166 1 CACTGCGGTGTTTTAAAACTTAAAAATAACGAAATAAGTGCTA 8 244 1 ATCTCCAGTTTTTTCTCATTTAAAAAGGATCAAAATTTGTTTT 14 168 1 ATCACTGAATTTTTAGGAATTAAACTTGTTTAATCTTTATTAA 14 239 1 CTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAA 15 181 1 CTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAA 16 181 1 CAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTTAACACATAAAAC 16 266 1 ATTTCATTGCTTTTTACCTTTAAGACACCACAATGTTGAGAGG 4 236 0 CTTGCTCATATTTTGAAACTAGAAGCACCGAAATTCACAAACC 16 229 1 CTTGCTCATATTTTGAAACTAGAAGCACCGAAATTCACAAACC 15 229 1 CAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTTAACACATAAAAC 15 266 1 TTTTTTGTCTTTTTTGGCTTTAATCTATCAGAAACATTTTTGT 5 112 0 GCAAGGAAATTTTATCCATTCAAAATGGTCAAAACTTAAGTAA 3 72 0 GGATTTTAATTTTAGTTATTAAATTGGTAAAAACTTGTTCATT 9 48 0 ATCTAATAAATTTCAAGAGTTAAACAAGTACAAACTTTGTTAA 3 236 1 AACAATTTAATTTCTTTCATTAAACATTTTTAAGGTTTTGTTT 13 50 0 TCAATCAAGCTTTCAAGCATGAAAAATTATTAATTCCCTAATA 7 111 1 ATTTCATCACTTTTTACCTTAAGAATTCCACAAACATTGGTTG 1 188 0 ATATAGTGAGTTTAGTTATTTAGTTATGTTGAAAGTTGTTATT 9 106 0 GAACGCCTATTTTTGAAAGTGAATATTCAGACAAGAATCAAAC 6 35 1 AAGATCACTATTTTTTTTCTCAAAGAGCTTAAATTGTTTAATT 11 161 1 ATTTGAAATATTTTGCGAATTTAGTTTATTCAATTCAAAAGAC 0 107 1 ACTAAATCAATTTATTTATTGGGAGCAGGAAAACGAAAATTCT 14 45 0 **** * * ** ** MAP Score: 29.8359 Motif 8 TATTTGCGAGATTTCTAGGGGCAAAGCAATTACCAAAGAATA 4 33 1 TATTTGCGAGATCTCAAGAGGCAAAGCAATTACTAAAAAATA 8 30 1 TTCAAGTAACATATTCACCATCAAAGTCATAAGAATTTATTC 15 80 0 TTCAAGTAACATATTCACCATCAAAGTCATAAGAATTTATTC 16 80 0 GTTTGTGGAATTCTTAAGGTAAAAAGTGATGAAATTAATCCT 1 196 1 CATTGTGGTGTCTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAATTTGCCCT 4 244 1 TGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATA 15 186 1 TGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATA 16 186 1 TGCAAATAGAAATTACAAACCAAAAACTATAACAAAATGAAC 3 112 1 TAAAAATCAAAATTTCAAACCAAAAACTATAACACACCAAGC 14 114 1 AATTAGTGTAATCTGTTATAAAAAAGGGATAAAATG 10 4 0 AAAACCTTAAAAATGTTTAATGAAAGAAATTAAATTGTTACT 13 54 1 TTGCAATTTATTTGCCAAGATGAAAGGAATGAGGTTATTATA 7 13 1 TCAAAATTCTTGATTTACCTTTAAAAGTATCAGCAACACAAT 2 25 1 AAGACAAAAAATTTAGATGGTGAAAATAAAAACACAAATGGC 5 144 1 AGTTTTTACCAATTTAATAACTAAAATTAAAATCCTTATTAA 9 56 1 ATCTTGGCTTTTTTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTTTCATC 3 166 1 AATAACAACATGGGATAACCTTAAAGAAAAAAGGAAATCAGT 7 234 1 AATGAGAAAAAACTGGAGATTAAAATCAATGAGCTTGGTGTG 14 146 0 TAAAAAAGAAATTGTAATAATAAAAATGAACAAGTTTTTACC 9 24 1 CAATTTATTTATTGGGAGCAGGAAAACGAAAATTCTGTGTTG 14 39 0 ACAAAAATGTTTCTGATAGATTAAAGCCAAAAAAGACAAAAA 5 112 1 CAAATGGATTTCCTAAAAAGAGAAATAAATAACCCTTAAAAA 0 70 0 ATTAAAACTTACAAAATCAAAGATATTTGCGAGATTTC 4 6 1 GGAGATTAAAACTTACAAAATTAAAGATATTTGTGAAGCTTC 0 180 1 GAAAGAACTTGTTGATAAAAAGCAAGAGACACCAGAG 0 5 1 AAGAGATTAAATTTTCATCTTAAAAGCTTTTATTTTTACCAC 3 189 1 * * * **** ** * MAP Score: 27.9232 Motif 9 TTTCTCAGCCATTTGTGTTTTTATTTTCACCATCTAAATTT 5 152 0 ATTGATGGTTATGCTGGCATAGTTTTTTACCGCAATGAGAG 4 187 1 TTGTAATAATAAAAATGAACAAGTTTTTACCAATTTAATAA 9 35 1 TTTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTTTCATCTTAAAAGCTT 3 177 1 AGATGAAAGGAATGAGGTTATTATATTCATCAATGGCCTTC 7 30 1 TTTTCTTACTAAAATCAGCAGGTTTTTCACCACCTACTAAA 12 51 0 GATGGTATATATGCAGGTACTGTTTTTTATCGTAACGAAAA 8 187 1 GATGGAGCCCAAGCTGGTAGTGTTTTTTATCGTAACGGTCA 1 139 1 GCTGACGGTTATGGAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGTAA 15 124 1 GCTGACGGTTATGGAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGTAA 16 124 1 AATTTTCATCTTAAAAGCTTTTATTTTTACCACACAGGATC 3 198 1 ATGTTGAACCAGAATAAACAGGATATTCACCAGGGTTAGCT 4 81 0 ATTCGCATTCATCTATGCGACCTATTTCACCATCATTTAAT 4 120 0 CTATAACAAAATGAACTAAGCAATTTTCATCTTGGCTTTTT 3 138 1 AACCATCAATTGTTCAAGTTACATATTCACCATCAAATTCG 4 156 0 AACCGTCAGCTGTTCAAGTAACATATTCACCATCAAAGTCA 16 93 0 AACCGTCAGCTGTTCAAGTAACATATTCACCATCAAAGTCA 15 93 0 AAAATCAAGGAATTTATCCTGTTTATTCATCAGCAACTTCT 0 257 1 ATCTATCAGAAACATTTTTGTAATATTCATCTAGATTGTTA 5 92 0 GACCACAAAGATTTGTGATGCTAAATTTACCATTACGATAA 15 150 0 GACCACAAAGATTTGTGATGCTAAATTTACCATTACGATAA 16 150 0 CTAGAGTTTGATTCTTGTCTGAATATTCACTTTCAAAAATA 6 42 0 TGTATAGGTATGAATAATTTCACCAAATTTACTT 6 105 0 ACAATCCAGGAGAATTCCCTGTTTATTCATCAGCAACAGTT 1 32 1 AAACTTAGGATTAATTTCATCACTTTTTACCTTAAGAATTC 1 203 0 CAGTTAATGCATAGCTGTTGGTATTTTTACTTAAGTTTTGA 3 46 1 CCATTAAAGCACAAAAGCTTTACTTTGTACCAACTGCTAAA 11 58 0 ATAATCCTGGTCAATATCCGGTTTATTCATCTACTACTGCT 8 80 1 TATTTTGCTCTGGTGTCTCTTGCTTTTTATCAACAAGTTCT 0 13 0 TTTTAATAAGTATCTTTGAATTTAATTCACCACTTCAATCA 7 77 1 TACCATCTGTAGTTCAGGTAACGTATTCGCCATCAAGATCG 8 153 0 * * ******** MAP Score: 25.7664 Motif 10 AGAAATAAATAACCCTTAAAAATAAATAACTT 0 60 0 GCGGTGTTTTAAAACTTAAAAATAACGAAATA 8 248 1 GGTTAAAACAAAACCTTAAAAATGTTTAATGA 13 45 1 ATAAAATCGAAACTATTAAAAACAAATTTTGA 14 197 0 AAAACTTACAAAATCAAGGATA 8 0 1 CGTGGAGATTAAAACTTACAAAATTAAAGATA 0 177 1 ATTAAAACTTACAAAATCAAAGATA 4 3 1 TCAAGAGTTAAACAAGTACAAACTTTGTTAAT 3 248 1 AAACAAGTTTAATTCCTAAAAATTCAGTGATT 14 238 0 GAGGCAAAGCAATTACTAAAAAATACATTAAG 8 47 1 AAACACTAAAAACCCGAAATTT 3 288 0 TTTCTTTTAAAAGGCTTTAAAAGAGCTCTTGC 2 81 0 ATCTCTTTTAAATAAGAAAAAAGCCAAGATGA 3 164 0 ATCCTTTTTAAATGAGAAAAAACTGGAGATTA 14 166 0 ATAGATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGA 7 151 1 TCAAGCTTTCAAGCATGAAAAATTATTAATTC 7 115 1 ACAAACCAAAAACTATAACAAAATGAACTAAG 3 126 1 GCTGCCGAATAAACAGGAAAAACTCCTGGATC 16 22 0 GCTGCCGAATAAACAGGAAAAACTCCTGGATC 15 22 0 GATTACAACGAAACCTTTCAAACAAACTTTAG 5 57 1 TAAATTCGCAAAATATTTCAAATGGATTTCCT 0 98 0 AAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATATCTTGCT 15 203 1 AAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATATCTTGCT 16 203 1 CTGATAGATTAAAGCCAAAAAAGACAAAAAAT 5 124 1 AAATTTGGAGAAATCTTAATAAAGATTAAACA 14 265 0 TGTTATTACTAACAATTAATAAGGATTTTAAT 9 81 0 GATTTCCTAAAAAGAGAAATAAATAACCCTTA 0 74 0 TAAATTGTTTAATTCTAACTAAAATAATCCTG 11 190 1 ATAAATATCCAATTCTTTCTAACAGCAGTAAA 12 104 1 GCGTTCCAGTAAAGCCAAATAAAATCCCATT 6 9 0 ** ******** MAP Score: 25.3645 Motif 11 GAAAGAACTTGTTGATAAAAA 0 1 1 CCTTAAAAATAAATAACTTACTGTTTATTT 0 49 0 AAGACTTTTAAAAGAAATTAAACTGTTACT 0 145 1 AAGCCTTTTAAAAGAAATTAAACTTTTATT 2 96 1 TTCCTTGCAAATAGAAATTACAAACCAAAA 3 107 1 TTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTTTCATC 3 178 1 TTCTAGGGGCAAAGCAATTACCAAAGAATA 4 45 1 TCATCTTGGCAAATAAATTGCAATTT 7 6 0 CTCAAGAGGCAAAGCAATTACTAAAAAATA 8 42 1 TGCTATTAAAAAAGAAATTGTAATAATAAA 9 18 1 TTTTTTTCTCAAAGAGCTTAAATTGTTTAA 11 172 1 ATGTTTAATGAAAGAAATTAAATTGTTACT 13 66 1 TGCTCCCAATAAATAAATTGATTTAGTTTT 14 61 1 AGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATA 15 198 1 AGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATA 16 198 1 ********** MAP Score: 23.8885 Motif 12 TCAAGGAATTTATCCTGTTTATTCATCAGCAACTTCTAATGAA 0 261 1 TCCAGGAGAATTCCCTGTTTATTCATCAGCAACAGTTAATAAC 1 36 1 CCCTGGTGAATATCCTGTTTATTCTGGTTCAACATTAAATGAT 4 87 1 AGTTTGATTCTTGTCTGAATATTCACTTTCAAAAATAGGCGTT 6 36 0 TCCTGGTCAATATCCGGTTTATTCATCTACTACTGCTAATAAC 8 84 1 CTTACTAAAATCAGCAGGTTTTTCACCACCTACTAAAACTTTT 12 45 0 TTGATTTTAATCTCCAGTTTTTTCTCATTTAAAAAGGATCAAA 14 159 1 TCCAGGAGTTTTTCCTGTTTATTCGGCAGCTACTAATAACGAT 15 24 1 TCCAGGAGTTTTTCCTGTTTATTCGGCAGCTACTAATAACGAT 16 24 1 * * * * *** * ** MAP Score: 21.973 Motif 13 AATAAATAACCCTTAAAAATAAATAACTTAC 0 58 0 AGTTTAATTTCTTTTAAAAGTCTTTTGAATT 0 138 0 CAAAAGCAGTTTTTCAAAATTCTTGATTTAC 2 12 1 TCTTGATTTACCTTTAAAAGTATCAGCAACA 2 32 1 CTTTTAAAAGGCTTTAAAAGAGCTCTTGCAA 2 79 0 CTTTTAAAGCCTTTTAAAAGAAATTAAACTT 2 90 1 AAATTTTATCCATTCAAAATGGTCAAAACTT 3 78 0 GCTTTTTTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTT 3 172 1 ACAACGAAACCTTTCAAACAAACTTTAGCAT 5 61 1 TGAATATTCACTTTCAAAAATAGGCGTTCCA 6 33 0 GATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCGATT 7 154 1 CAAACTTTTAAAAGAAGAGTTTGAC 7 285 0 TTATTTTTAAGTTTTAAAACACCGCAGTGCT 8 242 0 TATGATCTGCTATTAAAAAAGAAATTGTAAT 9 11 1 GTAATAACAACTTTCAACATAACTAAATAAC 9 104 1 TTTAATCGGTGATTTAAAAAAGGCTTTAGCA 11 34 1 TAAAACAAAACCTTAAAAATGTTTAATGAAA 13 48 1 GAAAATCAGGCTTTCAACACAGAATTTTCGT 14 25 1 TTTGACGTCACATTTAAAAAACTAAATCAAT 14 77 0 AGTTTTTTCTCATTTAAAAAGGATCAAAATT 14 174 1 AAATCGAAACTATTAAAAACAAATTTTGATC 14 195 0 TCTTAATAAAGATTAAACAAGTTTAATTCCT 14 253 0 GACATTAAAAAAGATCCAGGAGT 15 2 1 TTATTTTTTACTTTCAAAAGACCACAAAGAT 15 179 0 GGTGCTTCTAGTTTCAAAATATGAGCAAGAT 15 227 0 TTAGGTCTATTTTTAAAAACACGGTTTGTGA 15 263 0 GACATTAAAAAAGATCCAGGAGT 16 2 1 TTATTTTTTACTTTCAAAAGACCACAAAGAT 16 179 0 GGTGCTTCTAGTTTCAAAATATGAGCAAGAT 16 227 0 TTAGGTCTATTTTTAAAAACACGGTTTGTGA 16 263 0 ********* * MAP Score: 18.4086 Motif 14 GTTATTTATTTTTAAGGGTTATTTATTTCTCTT 0 62 1 ACAGTAACAGTTTAATTTCTTTTAAAAGTCTTT 0 144 0 AATTAACAAATTTAGGTGTTTCTAATCTAAGTG 1 254 0 AACAGTTAATTTTATTGTGTTGCTGATACTTTT 2 47 0 ACAATAAAAGTTTAATTTCTTTTAAAAGGCTTT 2 95 0 GCATAGCTGTTGGTATTTTTACTTAAGTTTTGA 3 54 1 ATGGATAAAATTTCCTTGCAAATAGAAATTACA 3 96 1 TGTTATAGTTTTTGGTTTGTAATTTCTATTTGC 3 113 0 AAGATGAAAATTTAATCTCTTTTAAATAAGAAA 3 177 0 TCTTAAAAGCTTTTATTTTTACCACACAGGATC 3 206 1 TCTTTGATTTTGTAAGTTTTAAT 4 0 0 TTAGGGCAAATTTCATTGCTTTTTACCTTTAAG 4 255 0 TTTTTGTCTTTTTTGGCTTTAATCTATCAGAAA 5 121 0 TTCTCAGCCATTTGTGTTTTTATTTTCACCATC 5 159 0 TCTAGTTGTCTTTTGCTGGTTCTCTAGAGTTTG 6 73 0 AATGGCCTTCCTTTTGTTTTAATAAGTATCTTT 7 61 1 CTCTTACTGATTTCCTTTTTTCTTTAAGGTTAT 7 248 0 TTATCCTTAATGTATTTTTTAGTAATTGCTTTG 8 51 0 ATTATTACAATTTCTTTTTTAATAGCAGATCAT 9 12 0 AGGTTTAAGATTGTTTTTTTAATTAGTGTAATC 10 33 0 GCTTTTGTGCTTTAATGGCTTGTACAGCACGCT 11 81 1 ATTAAACATTTTTAAGGTTTTGTTTTAACCTGA 13 42 0 ACAGTAACAATTTAATTTCTTTCATTAAACATT 13 65 0 GGTTTGAAATTTTGATTTTTATTGAAATTTGAC 14 102 0 ATAGTTTCGATTTTATGTCTTCTTTAATCACTG 14 213 1 ATTAAACTTGTTTAATCTTTATTAAGATTTCTC 14 257 1 TTCTCCAAATTTTGGGTTTTAGTGC 14 285 1 ATCCAGGAGTTTTTCCTGTTTATTCGGCAGCTA 15 23 1 ATCACAAATCTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAA 15 172 1 AACTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAAGAC 15 188 0 GGTTTGTGAATTTCGGTGCTTCTAGTTTCAAAA 15 239 0 TGTTTTATGTGTTAACTTAGGTCTAT 15 284 0 ATCCAGGAGTTTTTCCTGTTTATTCGGCAGCTA 16 23 1 ATCACAAATCTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAA 16 172 1 AACTAATTTCTTTATTTTTTACTTTCAAAAGAC 16 188 0 GGTTTGTGAATTTCGGTGCTTCTAGTTTCAAAA 16 239 0 TGTTTTATGTGTTAACTTAGGTCTAT 16 284 0 *** ****** * MAP Score: 14.2214 Motif 15 CTGGTAGTGTTTTTTATCGTAACGGTCAATTTAACGCAACCAAT 1 152 1 CTGGCATAGTTTTTTACCGCAATGAGAGGTTTAATGCCTCTCAA 4 200 1 CATTGTGGTGTCTTAAAGGTAAAAAGCAATGAAATTTGCCCTAA 4 244 1 GAACGCCTATTTTTGAAAGTGAATATTCAGACAAGAATCAAACT 6 35 1 CAGGTACTGTTTTTTATCGTAACGAAAAGTTTAATGCTTCTCAG 8 200 1 CACTGCGGTGTTTTAAAACTTAAAAATAACGAAATAAGTGCTAA 8 244 1 TGATTTAGTTTTTTAAATGTGACGTCAAATTTCAATAAAAATCA 14 79 1 GAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGTAAATTTAGCATCACAAAT 15 137 1 CTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAA 15 181 1 ACAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTTAACACATAAAAC 15 265 1 GAGGGGCTGTTTTTTATCGTAATGGTAAATTTAGCATCACAAAT 16 137 1 CTTTGTGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAA 16 181 1 ACAAACCGTGTTTTTAAAAATAGACCTAAGTTAACACATAAAAC 16 265 1 **** * * * * ** MAP Score: 10.6958 Motif 16 TTTGAATTGAATAAACTAAATTCGCAAAATATTTCAAATGG 0 105 0 TTTTTATCGTAACGGTCAATTTAACGCAACCAATGTTTGTG 1 162 1 TTTAAAGGTAAATCAAGAATTTTGAAAAACTGCTTTTGAA 2 9 0 AACAATAAAAGTTTAATTTCTTTTAAAAGGCTTTAAAA 2 91 0 AGAGCAGAGAAAAAGCTAGCAGCATAAAAATACCAG 3 5 1 TAGAAATTACAAACCAAAAACTATAACAAAATGAACTAAGC 3 118 1 TTTTAAGATGAAAATTTAATCTCTTTTAAATAAGAAAAAAG 3 173 0 AATAAATTTCAAGAGTTAAACAAGTACAAACTTTGTTAATA 3 240 1 AAACACTAAAAACCCGAAATTTGGAGAAATATTAACAAAGT 3 269 0 AAGAATACATAAGAGCTAACCCTGGTGAATATCCTGTTTAT 4 68 1 ACCATCATTTAATGTTGAACCAGAATAAACAGGATATTCAC 4 92 0 AACATTAAATGATGGTGAAATAGGTCGCATAGATGAATGCG 4 117 1 AAAGACAACTAGAAGTAAATTTGGTGAAATTATTCATACCT 6 93 1 ACTTCAATCAAGCTTTCAAGCATGAAAAATTATTAATTCCC 7 108 1 TTCAAACAAAAAGGTGCAAGTAATCGGAAAACTTTTTAAAT 7 165 0 TACTGCTAATAACGGTGAAATTGGCAGAATAAAGGATTACG 8 114 1 ATCTGCTATTAAAAAAGAAATTGTAATAATAAAAATGAACA 9 15 1 TTTTAATTTTAGTTATTAAATTGGTAAAAACTTGTTCATTT 9 47 0 GAAGTTTATAAATATCCAATTCTTTCTAACAGCAGTAAAGC 12 97 1 ATTTCAATAAAAATCAAAATTTCAAACCAAAAACTATAACA 14 107 1 TATTAAAAACAAATTTTGATCCTTTTTAAATGAGAAAAAAC 14 175 0 AAGAAGACATAAAATCGAAACTATTAAAAACAAATTTTGAT 14 196 0 AAATCTTAATAAAGATTAAACAAGTTTAATTCCTAAAAATT 14 246 0 GCACTAAAACCCAAAATTTGGAGAAATCTTAATAAAGA 14 272 0 TTTTTATCGTAATGGTAAATTTAGCATCACAAATCTTTGTG 15 147 1 GAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATATCTTGCTC 15 195 1 CGGTGCTTCTAGTTTCAAAATATGAGCAAGATATTTTGAAC 15 218 0 TTTTTATCGTAATGGTAAATTTAGCATCACAAATCTTTGTG 16 147 1 GAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTTCAAAATATCTTGCTC 16 195 1 CGGTGCTTCTAGTTTCAAAATATGAGCAAGATATTTTGAAC 16 218 0 ** ** ** * ** * MAP Score: 7.23734 Motif 17 TCAAAAGACTTTTAAAAGAAATTAAACTGTTACTG 0 141 1 TTAAGGTAAAAAGTGATGAAATTAATCCTAAGTTT 1 209 1 CTAAGTGCATAAGCTAAAAACTTAGGATTAATTTC 1 226 0 TGCACTTAGATTAGAAACACCTAAATTTGTTAATT 1 252 1 TTTAAAGCCTTTTAAAAGAAATTAAACTTTTATTG 2 92 1 TCCATTCAAAATGGTCAAAACTTAAGTAAAAATAC 3 66 0 TAGAAATTACAAACCAAAAACTATAACAAAATGAA 3 118 1 AAAAACTATAACAAAATGAACTAAGCAATTTTCAT 3 133 1 TTTTTTCTTATTTAAAAGAGATTAAATTTTCATCT 3 174 1 GATCTAATAAATTTCAAGAGTTAAACAAGTACAAA 3 235 1 GTTAACAACAATTAAAATGTCGATTT 5 190 0 CCTAATGCATAAGTTAAAAACTTAGCACTTATTTC 8 274 0 AGTTTTTACCAATTTAATAACTAAAATTAAAATCC 9 56 1 CTTTCAACATAACTAAATAACTAAACTCACTATAT 9 114 1 CTATTTTTTTTCTCAAAGAGCTTAAATTGTTTAAT 11 168 1 ATTTCAGGTTAAAACAAAACCTTAAAAATGTTTAA 13 39 1 AAAAATGTTTAATGAAAGAAATTAAATTGTTACTG 13 62 1 TTGACGTCACATTTAAAAAACTAAATCAATTTATT 14 72 0 TCAAAATTTCAAACCAAAAACTATAACACACCAAG 14 120 1 ATTCAGTGATTAAAGAAGACATAAAATCGAAACTA 14 214 0 TGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTT 15 186 1 AAATAGACCTAAGTTAACACATAAAACA 15 282 1 TGGTCTTTTGAAAGTAAAAAATAAAGAAATTAGTT 16 186 1 AAATAGACCTAAGTTAACACATAAAACA 16 282 1 * ** ******* MAP Score: 5.36171 Motif 18 TGTCGTGGAGATTAAAACTTACAAAATTAAAGAT 0 174 1 TTAAAGGTAAATCAAGAATTTTGAAAAACTGCTT 2 15 0 TGTGGTAAAAATAAAAGCTTTTAAGATGAAAATT 3 198 0 ATTAAAACTTACAAAATCAAAGAT 4 0 1 TCTGATTACAACGAAACCTTTCAAACAAACTTTA 5 54 1 GCCAAAAAAGACAAAAAATTTAGATGGTGAAAAT 5 137 1 GTTAACAACAATTAAAATGTCGATTTC 5 189 0 TCACCACTTCAATCAAGCTTTCAAGCATGAAAAA 7 103 1 CTAATAGATGACGAAAAATTTAAAAAGTTTTCCG 7 148 1 AATTGGCAGAATAAAGGATTACGATCTTGATGGC 8 132 1 ACTAACAATTAATAAGGATTTTAATTTTAGTTAT 9 72 0 ATTGTTAGTAATAACAACTTTCAACATAACTAAA 9 97 1 CCATTAAAGCACAAAAGCTTTACTTTGTACCAAC 11 65 0 GAAAATAAATATTACAAGCTGGGAGAA 12 3 1 TCAGGTTAAAACAAAACCTTAAAAATGTTTAATG 13 42 1 GGGAACAGAAAATCAGGCTTTCAACACAGAATTT 14 18 1 TTTCAATAAAAATCAAAATTTCAAACCAAAAACT 14 108 1 GCACTAAAACCCAAAATTTGGAGAAATCTTAA 14 278 0 GTTTGGTCGAATAAATTCTTATGACTTTGATGGT 15 72 1 GTTTGGTCGAATAAATTCTTATGACTTTGATGGT 16 72 1 * *** **** ** MAP Score: 4.43573