AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i PA/PA_operons003_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944249113 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 PAB2292 23 PAB2292 #1 PAB2145 55 PAB2145 #2 PAB0315 300 hypothetical protein #3 mpg 70 PAB0317 #4 PAB0378 246 PAB0378 #5 PAB1981 277 PAB1981 #6 PAB1971 62 PAB1971 #7 neac 49 PAB0443 #8 PAB0645 300 PAB0645 #9 PAB1679 46 PAB1679 #10 PAB1675 40 PAB1675 #11 PAB1674 221 PAB1674 #12 PAB1673 174 PAB1673 #13 PAB1665 46 hypothetical protein #14 ugd 55 PAB0770 #15 PAB0773 78 PAB0773 #16 PAB0780 300 hypothetical protein #17 graD-3 77 PAB0784 #18 PAB7298 300 hypothetical protein #19 rfbC 56 PAB0787 #20 PAB0788 300 hypothetical protein #21 PAB0795 67 PAB0795 #22 PAB0816 300 hypothetical protein #23 PAB0824 300 PAB0824 #24 PAB0825 61 PAB0825 #25 PAB0826 109 hypothetical protein #26 PAB1410 151 PAB1410 #27 PAB1409 300 hypothetical protein #28 PAB1299_graD-1 112 PAB1299: PAB1299, graD-1: PAB1053 #29 PAB1246 35 hypothetical protein #30 trpS 173 PAB1111 #31 PAB1112 21 hypothetical protein #32 PAB1113 50 hypothetical protein Motif 1 CATCTCCCATCTTCATCCCCCACTTCCCTCT 16 220 1 ACTTCCTTCGCTTCGCCCTCCTTTATCCCTA 8 54 1 TCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCAAGCTTGCTA 16 69 1 GTCGATATTACTTTTCCTTCCTCTAGCACAT 23 162 0 CCTCACCGACCTTTCTCTTCCCATTAATTTG 5 149 1 GCTTTTTCTTCCCTTTCAAAT 31 1 1 TTAACCTTCTCCTCTTCCTCCTCTGTGAAAA 16 36 1 TCTGTGAAAACCTCTTCCTCCTCTTCCTCCT 16 57 1 ACAAACTTCTCCTCATCTCCCATCTTCATCC 16 207 1 TATCTTTCTCCCCTTGTACTTATA 14 41 0 CGATTGTCAACTTTTCCTCCTTGGAGGATAC 8 157 1 TTTTATCCCCCGCTTAAGACT 5 0 1 AATATTTTAACATTATCCCCCTCATGGCACA 18 249 0 CACAAATTCGCTTTCTCCTTCGATTTATATA 4 59 1 CTCAATCATACTTACCCTCCCGATCATCTTA 20 16 0 CAATCTAAATTCTTGCCCCCCCCCATTGCCA 22 180 1 TTTTATCTCCCAAAATCTCTT 1 0 1 CGCCTAAGCGTTTCTTCTCCCGCAATCATCT 23 55 1 CTATTTAACTCCTTTCCTCTCAGAAATCTTA 8 242 1 TCATAATTACCCTTGCCTCTCTCTCGAGGAG 20 213 0 TGCCCACATTTTTCACCTTCCGTATCTTTAA 20 129 0 GACGCTTTTCCTTTTTCCCTTTAAAATTCCA 20 278 0 ACTTTCTTAACTTTCCCCTTTTATTCAAAAT 9 14 1 ATTCGAATCTCATCACCCTCTGAGAAACCGT 27 46 0 TTTTTTCTTCTTTTTCTTTTTGAAAGTCGT 11 9 1 TAAGCCTCTCCTTAACCTTCTCCTCTTCCTC 16 25 1 TCCCCATTCTCTTCTTTTATAACCA 3 4 1 **** ****** MAP Score: 28.9721 Motif 2 TTCGATCTCCTCCTTAATTTTGTTC 12 159 0 ATAATGATTATCTTCTCCTTGACCTCATCA 5 94 1 CTCTCCTTAACCTTCTCCTCTTCCTCCTCT 16 30 1 AATTCTTGCCCCCCCCCATTGCCACAACAC 22 187 1 CCCCTCTCATTTCTGTCAAAA 21 56 0 TTTATATATCCCTTCTCATTTTAATCATTC 32 25 1 ATGTACTGTTTCCCTTCCTTCGTTAGTACG 22 67 1 TCTGTGAAAACCTCTTCCTCCTCTTCCTCC 16 57 1 CACAAATTCGCTTTCTCCTTCGATTTATAT 4 59 1 CCGACCTTTCTCTTCCCATTAATTTGAATT 5 154 1 ACTTTCTTAACTTTCCCCTTTTATTCAAAA 9 14 1 TTGCGTAAATTCTTTCCCTTAAACTTCCCA 20 67 0 ATTGTCAACTTTTCCTCCTTGGAGGATACC 8 159 1 GTTACAAACTTCTCCTCATCTCCCATCTTC 16 204 1 TCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCAAGCTTGCT 16 69 1 TATCTTTCTCCCCTTGTACTTATAC 14 40 0 ACTATTTAACTCCTTTCCTCTCAGAAATCT 8 241 1 TTCAATAATCCCTTTCCATTCACTAACATT 18 163 0 TTAACATTATCCCCCTCATGGCACAACTTT 18 244 0 TCAGTTGCCACTTTCTCATTTATAATGATT 5 73 1 TCACAAATAGCCCCTCCATCACCCAACTTC 27 81 0 TCGTTAAGTCTCTTTTCATTTTTAAAATTT 26 81 1 TCTAAGTAAGCCTCTCCCTGGTGAGAAA 4 228 1 ACGGCTATTGTCTTTCCATTAA 27 288 1 AGATTAACAATTTCCTCATTCATGCCCCCG 23 194 1 CCGATTCCCGCCCCATCCTTAACTTCTATA 22 13 1 GCTTTTTCTTCCCTTTCAAAT 31 5 1 ACGCTTTTCCTTTTTCCCTTTAAAATTCCA 20 278 0 AGGAAGTTCTTCTTTTCCTGGAAGATGCTG 8 31 0 GATATTACTTTTCCTTCCTCTAGCACATGG 23 160 0 GATGGGTATTTTCTCTCATCTAGCAGGATC 5 196 0 GACACTTCCCTCATGCCAAACCTTT 6 47 0 AACATAAAACTCCCACCATTCACAAATAGC 27 100 0 ATTACGATCCCCCTATCATCAAGTAACCCG 18 117 0 GTGCGGAAGGCTTCATCATTGCCATTTATA 25 43 1 CCATTTATATTTTCTTCATGTAAGTTTTAT 25 64 1 AGGGATGCGCCTTTATCATTATCCACCATT 23 101 0 TTGATGAAAATTTTATCCTCGTACTAACGA 22 86 0 ATGAACAAGATCTCATCATGCATTA 19 5 0 ACCCTGATACCTCCATCCTGGTGGACGTTT 28 10 0 ********** MAP Score: 27.9671 Motif 3 TCCCCATTCTCTTCTTTTATAACCAT 3 5 1 AACATTTAATATTCCCGCCCTTGTAAATTAT 3 36 1 CATCTAAGTAAGCCTCTCCCTGGTGAGAAA 4 226 1 TATAATGATTATCTTCTCCTTGACCTCATCA 5 93 1 CTCACCGACCTTTCTCTTCCCATTAATTTGA 5 150 1 ATTTCCTATCAACTTCCTCCCAATAAGGTTC 8 85 1 GATTGTCAACTTTTCCTCCTTGGAGGATACC 8 158 1 GAATTTCTTGTATTCCTCCCTAAGTGACATG 8 191 1 AACTTTCTTAACTTTCCCCTTTTATTCAAAA 9 13 1 TTTTTTCTTCTTTTTCTTTTTG 11 1 1 TTCGATCTCCTCCTTAATTTTGTTC 12 159 0 TATCTTTCTCCCCTTGTACTTAT 14 42 0 AAGGGCTCTAAGCCTCTCCTTAACCTTCTCC 16 17 1 CCTCTCCTTAACCTTCTCCTCTTCCTCCTCT 16 29 1 CCTCTGTGAAAACCTCTTCCTCCTCTTCCTC 16 55 1 CTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCAAGCTTGCT 16 68 1 AATTGTTACAAACTTCTCCTCATCTCCCATC 16 200 1 TTCATCCCCCACTTCCCTCTTTTATTAATGG 16 231 1 GACGTTGTTAAGTCCCTCCTCGAGAGAGAGG 20 198 1 ATCCCGATTCCCGCCCCATCCTTAACT 22 6 1 TTATGTACTGTTTCCCTTCCTTCGTTAGTAC 22 65 1 TCTAAATTCTTGCCCCCCCCCATTGCCACAA 22 183 1 TCGATATTACTTTTCCTTCCTCTAGCACATG 23 161 0 ATTCACAAATAGCCCCTCCATCACCCAACTT 27 82 0 CCTACAAAACAGCCCCGCCCTGGAAGTCCAA 27 174 0 GCTTTTTCTTCCCTTTCAAAT 31 2 1 TAATTTTATATATCCCTTCTCATTTTAATCA 32 21 1 * ********* MAP Score: 21.0797 Motif 4 ATAAATCGAAGGAGAAAGCGAATTTGTGGG 4 57 0 GGTTTGGCATGAGGGAAGTGTC 6 50 1 AGGGCGAAGCGAAGGAAGTTCTTCTTTTCC 8 43 0 AACCTTATTGGGAGGAAGTTGATAGGAAAT 8 85 0 TATCCTCCAAGGAGGAAAAGTTGACAATCG 8 157 0 AATAAAATCAGGTGGACGAT 8 290 1 TTGAATAAAAGGGGAAAGTTAAGAAAGTTT 9 12 0 ACGCCCAAGAGGGGAACGTGAG 11 209 1 AAGTACAAGGGGAGAAAGATA 14 44 1 TTTTCACAGAGGAGGAAGAGGAGAAGGTTA 16 37 0 AGGAGGAAGAGGAGGAAGAGGTTTTCACAG 16 58 0 ACTCAGAGACGGAGGAAAATCCAGTATCCT 16 127 1 GGGAAGTGGGGGATGAAGATGGGAGATGAG 16 218 0 ATTAATAAAAGAGGGAAGTGGGGGATGAAG 16 230 0 CGGATGGTATGGAGGACGTTGTTAAGTCCC 20 184 1 TCGTACTAACGAAGGAAGGGAAACAGTACA 22 68 0 TGTGCTAGAGGAAGGAAAAGTAATATCGAC 23 163 1 CCTCCATCCTGGTGGACGTTT 28 1 0 ********** MAP Score: 17.8887 Motif 5 CTCACGTATAAGTACAAGGGGAGAAAGATA 14 35 1 AGTTAAAAGGGATCATGCTCTA 2 0 1 CCGAATTTTGAATAAAAGGGGAAAGTTAAGAA 9 17 0 AATGTTAGTGAATGGAAAGGGATTATTGAAAA 18 163 1 ATTTGAAAGGGAAGAAAAAGC 31 9 0 TACGTTTGGAATTTTAAAGGGAAAAAGGAAAA 20 272 1 AATGTATATAAATCGAAGGAGAAAGCGAATTT 4 62 0 AAATTTTAAAAATGAAAAGAGACTTAACGAAA 26 79 0 AGATTTGATGAGGTCAAGGAGAAGATAATCAT 5 97 0 GAAGAGGAGAAGGTTAAGGAGAGGCTTAGAGC 16 21 0 GGCTACGAACCGTTTAAAGAGATTTAGAGATT 18 80 1 GAATGATTAAAATGAGAAGGGATATATAAAAT 32 23 0 TCTCAGAAATCTTATAAAGGGAAAACTTTAGA 8 259 1 AATTCAAATTAATGGGAAGAGAAAGGTCGGTG 5 152 0 TTCACAGAGGAGGAAGAGGAGAAGGTTAAGGA 16 33 0 TTAAATCCCTCTTTTAAAGAGATTTTGGGAGA 1 15 0 CTCCATGGGAAGTTTAAGGGAAAGAATTTACG 20 62 1 CGCCAAGAGGATTTTAAAGGAACTAATCAAGC 8 127 0 *** ******* MAP Score: 15.675 Motif 6 GCAAGCTTGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAGGTTTT 16 63 0 CATTAATAAAAGAGGGAAGTGGGGGATGAAGATGG 16 226 0 GGGATAAAGGAGGGCGAAGCGAAGGAAGTTCTTCT 8 48 0 TTCACAGAGGAGGAAGAGGAGAAGGTTAAGGAGAG 16 30 0 AGGTTATGCCAGTCTTAAGCGGGGGATAAAA 5 6 0 AGATTTGATGAGGTCAAGGAGAAGATAATCATTAT 5 94 0 TAAAAAGAAAACGCCCAAGAGGGGAACGTGAG 11 199 1 GCAGGTGTTGTGGCAATGGGGGGGGGCAAGAATTT 22 186 0 TTCTTAAAGTTGTGCCATGAGGGGGATAATGTTAA 18 239 1 GATCGTTAAGATGATCGGGAGGGTAAGTATGAT 20 8 1 TTTTAGAAGTTGGGTGATGGAGGGGCTATTTGTGA 27 76 1 TCCCTCCTCGAGAGAGAGGCAAGGGTAATTATGAG 20 210 1 CCTCACGTATAAGTACAAGGGGAGAAAGATA 14 34 1 GGGATGAAGATGGGAGATGAGGAGAAGTTTGTAAC 16 204 0 ATATTTTTTGACAGAAATGAGAGGGG 21 51 1 TCATATATAGAAGTTAAGGATGGGGCGGGAATCGG 22 13 0 ATAATCCACCAATTAAAAGCGGAGGTGGTAGCA 19 33 1 TCAAAATGTTAGTGAATGGAAAGGGATTATTGAAA 18 159 1 ATTGAGAACAAAATTAAGGAGGAGATCGAA 12 154 1 TTACTACACCAAGTTTTAGTAAGGGAAATTTTGTA 17 52 0 TTTGAATAAAAGGGGAAAGTTAAGAAAGTTTTG 9 8 0 GTTGAAATTCAAATTAATGGGAAGAGAAAGGTCGG 5 154 0 CCTTATTGGGAGGAAGTTGATAGGAAATTAGGGAT 8 78 0 CTCCATGGGAAGTTTAAGGGAAAGAATTTACGCAA 20 62 1 GTCACAAACGAAGATTTCGTAAAGGTTATGCCAGT 5 28 0 TTGAACGTGGTGTCTTAAGCTAGGGTTGGACTTCC 27 149 1 *** * * ***** MAP Score: 14.7189 Motif 7 CTTGATACAAAAAAGATTTATAACCTCAAGGGTTTCTCATC 2 254 1 GAAAGTGTGAGGAATGTATATAAATCGAAGGAGAAAGCGAA 4 65 0 GTTGAAATTCAAATTAATGGGAAGAGAAAGGTCGGTGAGGT 5 148 0 TCACTTAGGGAGGAATACAAGAAATTCAAGGTATCCTCCAA 8 177 0 TCACCACCGAATTTTGAATAAAAGGGGAAAGTTAAGAAAGT 9 14 0 TAAAGGTAAAACGACTTTCAAAAAGAAAAAGAAGAAAAAA 11 9 0 AATATGTCGAAAATTATATAAAAAGAAAACGCCCAAGAGGG 11 181 1 GGGATATAGAGCAACAAAAATAACCGAAAGGTTTATAAGTT 12 95 1 ATATTAGTTCATATTGAGAACAAAATTAAGGAGGAGATCGA 12 142 1 TTCACAGAGGAGGAAGAGGAGAAGGTTAAGGAGAGGCTTAG 16 24 0 AAAATGTTAAAAATTCTAATAAACAGGAAGGC 16 278 1 CCGACTATCAAAATGTTAGTGAATGGAAAGGGATTATTGAA 18 152 1 AGTGTTAGAAAGCTCCATGGGAAGTTTAAGGGAAAGAATTT 20 50 1 TGATTTTAAGAGTACGTTTGGAATTTTAAAGGGAAAAAGGA 20 260 1 GAAGGGAAACAGTACATAATCAACAAGAAGGCAATTTCATA 22 43 0 TATCCATTCCGAATGGTGGATAATGATAAAGGCGCATCCCT 23 90 1 CCCCGTCCATATTACTTTATCAAGTTTAAAGTTGTTGCTAT 23 219 1 AGCCCAAAAGGATTGTTAGTTAATTTCAAGGTAGAAAAGCT 26 33 0 GAGACATTTTTAATAACTTAAAGGCTAAAAAAGT 29 3 1 TGCCAGAATGATTAAAATGAGAAGGGATATATAAA 32 25 0 * * * * ** **** MAP Score: 14.5883 Motif 8 TCTCCCGTCCAAAGGTTTAAAAATTGGGCAAT 6 11 1 AGCTTTAGCTAAAATGTTAAAAATTCTAATAA 16 268 1 TTTCTGTCAAAAAATATTAAAAGGCTTTTCGG 21 36 0 TGGCATTACTAAAATTTTAAAAATGAAAAGAG 26 90 0 AATGCCACCAAAAACATTAAAATAATGCCCAT 26 115 1 GTGGAAGGATTAAAAGTACCTCGTT 13 31 0 TTGATACAAAAAAGATTTATAACCTCAAGGGT 2 255 1 AAAATAACCGAAAGGTTTATAAGTTCGAACTA 12 111 1 GGCATGTTTTAAAAAATTATAAAACCCCGAAG 15 29 1 AATAATAACTAAAGACTAAAAAGATTACGCAA 20 99 0 TTAATAACTTAAAGGCTAAAAAAGTT 29 19 1 TAGGAATATTAAAGTCCTAAAAATATGTCGAA 11 160 1 ACATTTTAGCTAAAGCTTAAAAGCCATTAATA 16 253 0 TCCATGACCATAAACTTTAAAACTAAAAGACT 30 64 1 TTTCCTCTCAGAAATCTTATAAAGGGAAAACT 8 254 1 TTTCTTCATGTAAGTTTTATAAATTAACCCGA 25 74 1 GAACATCGATGAAATATAAAAACCTTATTTGA 7 19 0 GCTTTATATTAAAACTCAAAAACTCGATA 12 7 0 TAACTGACTCAAAACCCAATAATTGGTGGGTA 4 17 0 **** ****** MAP Score: 14.2226 Motif 9 CCGAGATTTGATGAGGTCAAGGAGAAGATAATCATTA 5 95 0 CAAATTAATGGGAAGAGAAAGGTCGGTGAGGTGCTAA 5 143 0 GAAGATGCTGGCGAGATTAGGATTAGGAGGG 8 4 0 TAGGGATAAAGGAGGGCGAAGCGAAGGAAGTTCTTCT 8 48 0 GACAATTTGGAGAACAGTAAGTACAGGATCTGCCTTG 11 65 0 GAGGAAGAGGAGAAGGTTAAGGAGAGGCTTAGAGCCC 16 19 0 GCTTGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAGGTTTTCACAGA 16 57 0 ACGCTTTACGAGAAGATAGAGAACAGGATCAAGGATA 16 151 0 GGATGAAGATGGGAGATGAGGAGAAGTTTGTAACAAT 16 201 0 AATAAAAGAGGGAAGTGGGGGATGAAGATGGGAGATG 16 220 0 TTATATTCGGGTTACTTGATGATAGGGGGATCGTAAT 18 110 1 CTATCAAAATGTTAGTGAATGGAAAGGGATTATTGAA 18 156 1 GCTTTTAATTGGTGGATTATGAACAAGATCTCATCAT 19 16 0 TAAGATGATCGGGAGGGTAAGTATGATTGAGTACAGT 20 16 1 AAGCTCCATGGGAAGTTTAAGGGAAAGAATTTACGCA 20 59 1 CATACCATCCGGAACATTAAGTGTGATTACAACTTTG 20 158 0 TTTCATATATAGAAGTTAAGGATGGGGCGGGAATCGG 22 13 0 CATTCCGAATGGTGGATAATGATAAAGGCGCATCCCT 23 94 1 TTCGCCATGTGCTAGAGGAAGGAAAAGTAATATCGAC 23 156 1 AGTAATATGGACGGGGGCATGAATGAGGAAATTGTTA 23 198 0 AATTTTAGAAGTTGGGTGATGGAGGGGCTATTTGTGA 27 74 1 TATTGAACGTGGTGTCTTAAGCTAGGGTTGGACTTCC 27 147 1 ** ** * * * *** MAP Score: 13.6733 Motif 10 GATAACTCCCCAAGGGGATTTAC 0 5 1 TTTTATCTCCCAAAATCTCTTTAAAAGAGGGATT 1 6 1 CAACGCCCCCTAACTATTTTAAATCCCTCTTTT 1 32 0 AGTCGAATCCCAAATAATTTACAAGGGCGGGAAT 3 46 0 CACTTCCCTCATGCCAAACCTTTATAAATTGCCCAATT 6 32 0 CCCTCCTAATCCTAATCTCGCCAGCATCT 8 1 1 CTATCAACTTCCTCCCAATAAGGTTCACTTTCCGAAAG 8 90 1 TCTTGTATTCCTCCCTAAGTGACATGAATAATCCTTCG 8 196 1 ATCGTCCACCTGATTTTATTCTAAAGTTTTCCC 8 277 0 CTCACCACCGAATTTTGAATAAAAGGGGAAAG 9 24 0 CTTCACCACCAAAACCGATTTAACGAGGTACTT 13 5 1 AAATTATAAAACCCCGAAGGGTATAAACACTGAACGGT 15 42 1 AACAATTGAGATTCCAAAAACGCTTTACGAGAAGATAG 16 169 0 GTTGTTGCAGATGCCAGACAAAAATTACAGTTAAGCTT 17 10 1 TCATACTTACCCTCCCGATCATCTTAACGATC 20 4 0 ACATGTGATACTACCGAAAAGCCTTTTAATATTTTTTG 21 23 1 GGGTATCACCGAATAAAATTGAACTTGAGAAAT 24 38 0 TTTAGTAATGCCACCAAAAACATTAAAATAATGCCCAT 26 109 1 ACAGAATCCCCCCTAGATGGATCAATTAAAGTAGT 30 148 0 ** ** ** ** ** MAP Score: 12.4362 Motif 11 GATACAAAAAAGATTTATAACCTCAAGGGTTTC 2 257 1 TAACTTTAACAGGTTAATAACTTACCGGTGGTG 5 243 0 TCCCGTCCAAAGGTTTAAAAATTGGGCAATTTA 6 13 1 CTCATGCCAAACCTTTATAAATTGCCCAATTTT 6 30 0 TATCGAGTTTTTGAGTTTTAATATAAAG 12 5 1 AATAACCGAAAGGTTTATAAGTTCGAACTATAT 12 113 1 TACCCTTCGGGGTTTTATAATTTTTTAAAACAT 15 32 0 CCGTTTAAAGAGATTTAGAGATTATATTCGGGT 18 89 1 AATATCGACAAGATTAACAATTTCCTCATTCAT 23 184 1 GAGAAATAAAAAGTTTAAAGTTTAAGCGCTAAG 24 12 0 TCTTCATGTAAGTTTTATAAATTAACCCGATTA 25 76 1 GTCTCTTTTCATTTTTAAAATTTTAGTAATGCC 26 88 1 ATGAGATTCGAATTTTAGAAGTTGGGTGATGGA 27 64 1 GCACCATTCCAATTTAATAGTTTTAACACTAAC 28 69 0 TAAGTCTTTTAGTTTTAAAGTTTATGGTCATGG 30 65 0 ** **** ** ** MAP Score: 10.7629 Motif 12 TCTTTAAAAGAGGGATTTAAAATAGTTAGGGG 1 27 1 ATAAGAGTAAAGGGCCTAAAAAGCAACGGCCT 2 180 0 TTGATACAAAAAAGATTTATAACCTCAAGGGT 2 255 1 TTATAACCTCAAGGGTTTCTCATCAACACGAC 2 271 1 TCTCCCGTCCAAAGGTTTAAAAATTGGGCAAT 6 11 1 TCGTTGCCAAAAGGTTTTCGAGAGA 10 3 0 AAAATAACCGAAAGGTTTATAAGTTCGAACTA 12 111 1 GTGGAAGGATTAAAAGTACCTCGTTA 13 30 0 AAGGTTAAGGAGAGGCTTAGAGCCCTTGGCTA 16 12 0 CATTTTAGCTAAAGCTTAAAAGCCATTAATAA 16 252 0 TATATCTGAAAAGGGCTACGAACCGTTTAAAG 18 67 1 AACCGTTTAAAGAGATTTAGAGATTATATTCG 18 87 1 AATAATAACTAAAGACTAAAAAGATTACGCAA 20 99 0 TCTCTCGAGGAGGGACTTAACAACGTCCTCCA 20 193 0 TAATTATGAGAAGGCTTTCAAGGGCTGATTTT 20 235 1 TAAAAAGTTTAAAGTTTAAGCGCTAAGCG 24 7 0 AAAAATGAAAAGAGACTTAACGAAACCCTAAG 26 72 0 CGAGTGGTGCAAAGGCTTCAAAAGTAACGGAT 27 249 1 TTAATAACTTAAAGGCTAAAAAAGTT 29 19 1 **** **** ** MAP Score: 7.99171 Motif 13 TTCCCATTAATTTGAATTTCAACTTCCTGGGATCC 5 166 1 AGATAAGTCTTTTAGTTTTAAAGTTTATGGTCATG 30 66 0 GCTTTTCCTTTTTCCCTTTAAAATTCCAAACGTAC 20 271 0 CTTTAAACTTTTTATTTCTCAAGTTCAATTTTATT 24 25 1 GTCCACCTGATTTTATTCTAAAGTTTTCCCTTTAT 8 272 0 TATCGAGTTTTTGAGTTTTAATATAAAGCTTGCC 12 9 1 TTAAGTCTCTTTTCATTTTTAAAATTTTAGTAATG 26 84 1 TCCTCCTTAATTTTGTTCTCAATATGAACTAATAT 12 142 0 AACTTTTTTAGCCTTTAAGTTATTAAAAATG 29 14 0 TTTTCTTCTTTTTCTTTTTGAAAGTCGTTTTACCT 11 12 1 CCTTTAGACCTTAATTTTATATATCCC 32 2 1 CGCTTAGCGCTTAAACTTTAAACTTTTTATTTCTC 24 10 1 TCAAGAGGAATTTGAATTCAAATATCGTAGACATC 2 224 0 TTTTATCTCCCAAAATCTCTTTAAAA 1 1 1 *** *** ** ** MAP Score: 6.49312 Motif 14 GATAACTCCCCAAGGGGATTTAC 0 7 1 AGGGATCATGCTCTAAGGGGTTTCCTCTTGGC 2 17 1 AGATTTATAACCTCAAGGGTTTCTCATCAACA 2 267 1 CTCTCCCGTCCAAAGGTTTAAAAATTGGG 6 7 1 GTTGACAATCGCCAAGAGGATTTTAAAGGAAC 8 136 0 TCACCTCGTTGCCAAAAGGTTTTCGAGAGA 10 8 0 AACAAAAATAACCGAAAGGTTTATAAGTTCGA 12 107 1 ATTATAAAACCCCGAAGGGTATAAACACTGAA 15 44 1 TGCACATTGCGCCTAAGCGTTTCTTCTCCCGC 23 46 1 AAACCCTAAGCCCAAAAGGATTGTTAGTTAAT 26 50 0 *** ***** ** MAP Score: 6.12595 Motif 15 ATTTTAAATCCCTCTTTTAAAGAGATTTTGGGAGATAAAA 1 10 0 TAAGGGGTTTCCTCTTGGCGTCGTTGGTAGAGTTTATTTG 2 30 1 ACCTCATTACCCACCAATTATTGGGTTTTGA 4 1 1 TTCGCTTCGCCCTCCTTTATCCCTAATTTCCTATCAACTT 8 60 1 GTCAACTTTTCCTCCTTGGAGGATACCTTGAATTTCTTGT 8 162 1 TCTTAACTTTCCCCTTTTATTCAAAATTCGGTGGTGAG 9 18 1 TTTTAGTTCACCTCGTTGCCAAAAGGTTTTCGAGAGA 10 7 0 CTCACGTTCCCCTCTTGGGCGTTTTCTTTTTATATAATTT 11 191 0 TTCGATCTCCTCCTTAATTTTGTTCTCAATATGAACTA 12 146 0 ATTAAAAGTACCTCGTTAAATCGGTTTTGGTGGTGAAG 13 8 0 TTCTCCTCTTCCTCCTCTGTGAAAACCTCTTCCTCCTCTT 16 42 1 AAAACCTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCCAAGCTTGCTAAGA 16 63 1 CCCCCACTTCCCTCTTTTATTAATGGCTTTTAAGCTTTAG 16 236 1 TCTTGCCCCCCCCCATTGCCACAACACCTGCCAAGGTAAA 22 190 1 CTAAGAACACCTCATTTAATATTAACTTGACTTTGGGTT 30 9 1 ATATATCCCTTCTCATTTTAATCATTCTGGCA 32 28 1 **** *** ** * MAP Score: 0.681799