AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i PA/PA_operons005_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944249258 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 PAB2311 91 hypothetical protein #1 PAB2299 81 hypothetical TRANSCRIPTIONAL REGULATOR #2 PAB2298 117 hypothetical protein #3 PAB2257 161 PAB2257 #4 rad25-like 115 PAB0128 #5 PAB0180 87 PAB0180 #6 glpk 26 PAB2406 #7 PAB0182 21 hypothetical protein #8 glpA 143 PAB0183 #9 rpl37AE 60 PAB7067 #10 PAB2357 42 hypothetical protein #11 fus 80 PAB0187 #12 PAB0188 50 hypothetical protein #13 PAB0315 300 hypothetical protein #14 mpg 70 PAB0317 #15 srp54 38 PAB0320 #16 PAB0322 49 PAB0322 #17 PAB0389 277 hypothetical protein #18 gdh 286 PAB0391 #19 PAB0392 107 PAB0392 #20 PAB1938 136 PAB1938 #21 PAB1817 53 PAB1817 #22 d1 62 PAB0651 #23 PAB1721 201 hypothetical protein #24 pflX 95 PAB0742 #25 lhr-2 138 PAB0744 #26 PAB1587 181 PAB1587 #27 PAB1586 50 hypothetical protein #28 PAB1585 300 hypothetical protein #29 PAB7359 116 hypothetical protein #30 PAB0973 300 PAB0973 #31 PAB1314 200 PAB1314 #32 PAB1236 38 PAB1236 #33 PAB1234 56 hypothetical protein Motif 1 GCCGATCCCCCTCCTATTTCATCTG 2 5 1 TTTTATCCCCCGCTTAAGACTGGCA 17 262 0 GGCTATCTCCTCCCCCTTCTTCTCGTCCCT 31 149 0 TTTAAATCTTTCCTCAGCCTTTAGTTCAAC 8 81 0 TCCCCATTCTCTTCTTTTAT 14 0 1 TTCTCCTCCCCCCGTTTGTTTCACACA 20 7 1 AAGCTTTTTGCCCCCATTCTGTAGACTTTA 30 127 1 GTCCTCCCCCTGGCTAAAATC 29 1 1 CTTCATGTCCTACCCCTCCTTTACCATGCT 30 52 1 TTTTATACCCCTCCTTAAGTATGGT 4 5 1 TACCCAGCCTCCCTCATTTTTTTGGCCAAT 31 19 0 TTTGACGTTGTACCCAGCCTCCCTCATTTT 31 29 0 TGAACTAACAACCCCAGCTTCTCAGGCAAT 26 142 0 TTGATCCTCTCCTTCTCTTTTTCTCTAAC 28 281 0 TAAAGTCACCTCCTCTTAAAGATACCA 1 64 0 CTCTTCAGCATCCCCATCATAAGTGGCGAG 28 22 1 TGGACTCCCTCGTTTAGAAGG 7 6 0 ATGAAGAAAGTCCTTAGCCTGTTTTTAGCC 30 28 0 TATTTATCACCTCCTTCTCAAATTAATG 3 8 1 GAGGGCCTTTTCCTTATCTTTTCCTGGCAT 18 53 1 GTTTGTGACTTCCGCATCTTCAGTTGCCAC 17 213 0 TTCTTGATAACCCTCACTTTTAG 27 37 1 TTTACCATGCTCCTTAGTTTGCTTGTGCAT 30 71 1 AATCGTTAACTCCTCATTATAGGCCGGTAT 26 73 0 CGACCTTAAATACCCCCTTTGTATGTGGTG 4 90 1 CACCTCAGCTCACTCCGTTTCCAA 18 4 0 TTTTTCTTCCCTTATTTTTGTTACATCG 19 8 1 CGCGATCCCCACTATATGCCCACCA 5 72 0 ********** MAP Score: 19.9765 Motif 2 TTGGTATCTTTAAGAGGAGGTGACTTTA 1 63 1 GCAGATGAAATAGGAGGGGGATCGGC 2 4 0 AACCATACTTAAGGAGGGGTATAAAA 4 4 0 CGGTATAGAGGAGTGTGAATTCCTAA 6 9 0 CCTTCTAAACGAGGGAGTCCA 7 5 1 ATGCCAGTCTTAAGCGGGGGATAAAA 17 261 1 TTGGAAACGGAGTGAGCTGAGGTGTG 18 4 1 CAATCAACTAAAATGGAGGGTTGCAT 18 270 1 TGTGTGAAACAAACGGGGGGAGGAGAA 20 5 0 TTTTAAAAGGAATTGGGGGTAGGTTAACTATT 23 12 0 ATTGCCTGAGAAGCTGGGGTTGTTAGTTCAAT 26 142 1 CTAAAAGTGAGGGTTATCAAGAAAA 27 35 0 TGTTAGAGAAAAAGAGAAGGAGAGGATCAA 28 280 1 CCCCTGGCTAAAATCGGGGTATTCTCTTATTA 29 16 1 GAGCATGGTAAAGGAGGGGTAGGACATGAAGA 30 51 0 ATTGGCCAAAAAAATGAGGGAGGCTGGGTACA 31 19 1 GAGGGACGAGAAGAAGGGGGAGGAGATAGCCA 31 148 1 ATATGTCAATTAAATGAGGGTGAGAGAAA 32 19 1 *** ******* MAP Score: 19.9452 Motif 3 TAAAGTCACCTCCTCTTAAAGATAC 1 66 0 TTCTCCTCCCCCCGTTTGTTT 20 1 1 TTCCTGGCTATCTCCTCCCCCTTCTTCTCG 31 154 0 AGGCTCCACCTCAAAACTAAAA 8 131 0 TATTTATCACCTCCTTCTCAAATTAA 3 6 1 CCTTCACCACCACAACTGTTTTT 33 43 0 GAGCATCACCCCTTGATCGTGA 9 48 0 TTCAACACCTCCAGAGAGGTG 5 1 1 TTTCACCACCCGATAAGCTTGC 11 68 0 GTCTTAAGTCTCTCCTCATCTACCCACTCC 28 139 0 GTTTCCACCTCAGCCGGTAGG 24 1 1 ATAATGATTATCTTCTCCTTGACCTCATCA 17 173 0 TTGATCCTCTCCTTCTCTTTTTCTCTA 28 283 0 CTAATTCTCATCTTCACCACCGGTAAGTTA 17 38 0 ATCTCTCTTAGCACCTCACCGACCTTTCTC 17 131 0 CTCTTGAACGCACCTCCATTGAACTAACA 26 162 0 GGTGCTTCACCTTTCCAAGGTTA 15 25 0 AAGTTTATATTCAACTCCTTGAAAAATTTT 20 101 1 GGGAAGTCGGTCATCACACCTCAGCTCACT 18 20 0 GGCACTTCACCATCTTATGGTTTTGA 2 101 0 AACAAAAGGATTTCCACCCTTGTTTACCGA 18 204 1 GAACAAATCGTTAACTCCTCATTATAGGCC 26 78 0 ********** MAP Score: 17.8932 Motif 4 AAGAACGTTAAAAGGTTTTTCAAAACTAAATAA 0 22 0 GAAACGTACGAAACATTTTTATATCCTTTTGGT 1 35 1 TAGGAGACCAAAACCATTTTCAACTAGGCAGAT 2 30 0 ATATTTCATCAAATCCTTTTAAATATATGTTGC 3 129 0 GATCTTATGCAAATTTTTATAAATTACCGACCT 4 63 1 AAGGCTGAGGAAAGATTTAAAACCTGGAAATCC 8 90 1 AAATATTTATAAACCGTGCATAA 9 0 1 GAACTTGGGAAAAGCTTTATAACTCTACCTTTT 11 23 1 TTGATACAAAAAAGATTTATAACCTCAAGGGTT 13 255 1 GTCGAATCCCAAATAATTTACAAGGGCGGGAAT 14 46 0 AAGGAGAAGATAATCATTATAAATGAGAAAGTG 17 183 1 TTGTTTACCGAAAGTTTTATATAGGCTATTGCT 18 223 1 ACAGATACGGAAAGAGTTATAAACTAACTTCCA 20 43 0 CTTCCCCTCAAAAAATTTTTCAAGGAGTTGAAT 20 109 0 GCTGCTTGACTAATATTTATAAAGTTAAAACTT 22 20 0 ACTCCTCGCGAAAACTTTATAAACCTACCCTCA 23 43 1 ACTCACATTCAAATTTTTATTAACTATCGTTTA 26 15 0 AATGGGGGCAAAAAGCTTATATACGTCATTCAT 30 112 0 CTAGTATTCGAAAACATTAAAAAGCATTCTCAA 30 258 0 *** ******* MAP Score: 16.8912 Motif 5 TACTTAAAGTTCAAAACCATAAGATGGTGAAG 2 91 1 TTCAACACCTCCAGAGAGGTGCA 5 1 1 ACCAATCACCTTAAAAACTTCAAAGACCAAAA 5 44 0 CGTGCATAACTTAAACCCATCAGCTCACGATC 9 24 1 CAAAAAAGATTTATAACCTCAAGGGTTTCTCA 13 261 1 TTCTCTTCTTTTATAACCATAACATTTAATAT 14 16 1 CCCGTTTGTTTCACACACATAATTGGAAGTTA 20 20 1 TAGGCATAACTTAAAAACATCACCATGCTAAA 21 18 0 ATTCGGGGTCTCATAAACTTAACCG 24 80 1 GTGAACACCGTGAGAACCCTCATAGTTATACC 26 46 1 AAAATTTTCTTGATAACCCTCACTTTTAG 27 31 1 CTAATCAATTTCAGAAACTTAAAAAGTCATTG 28 53 1 CTGTCGGTTTTGGCAACCTTAAGAGAAAGCAA 29 50 1 GGGTACAACGTCAAAACCTTAATTCCTGGGAT 31 44 1 AACGCTGACCTCGTAACCGTCAATCTCAACTA 31 84 0 CCTTCACCACCACAACTGTTTTTAG 33 41 0 *** **** *** MAP Score: 12.6421 Motif 6 TGTTGTAATAACTTTTGAATTTTGGGAAACGTA 1 8 1 TCTTGGACCATGACTTTTCAAGTTGTCAGTAAGCG 3 70 0 CGTATATTTTTGGTCTTTGAAGTTTTTAAGGTGAT 5 37 1 TGTCTTATTATACCTTTTTAGGTTGAACTAAAGGC 8 60 1 GAAATCCTATTTCCTTTTTAGTTTTGAGGTGGAGC 8 116 1 GTTTTTAACCTCTTCTTCCAATTTTAAAGGGATTA 10 14 1 TTATGGTGGCTGGAATTTTAGGTTTGGCAACGGTT 13 114 1 AAATATAGCATGACCTTTTACTTTTGAGTTGAAAG 18 144 1 AATTACATAATTATGTTTAAATTTTTGAACTAATT 25 63 1 TCCCCAGTCGCTTTTGATTTTTTAAACTATTA 25 116 0 CGGTGTTCACTCACATTCAAATTTTTATTAACTAT 26 21 0 TATCATCCAATGACTTTTTAAGTTTCTGAAATTGA 28 57 0 AATTTGAGAATGCTTTTTAATGTTTTCGAATACTA 30 255 1 * * *** * **** MAP Score: 12.3803 Motif 7 TTTTGAAAAACCTTTTAACGTTCTTTACCCTA 0 30 1 GTTGTAATAACTTTTGAATTTTGGGAAACGTA 1 11 1 TTCATCAAATCCTTTTAAATATATGTTGCTAA 3 126 0 CATAGTTCTTCCCTTTTATGCTCAAAAATGTC 8 32 1 TCTTATTATACCTTTTTAGGTTGAACTAAAGG 8 62 1 AATCCTATTTCCTTTTTAGTTTTGAGGTGGAG 8 118 1 AGCTAATCCCTTTAAAATTGGAAGAAGAG 10 23 0 TTCCACAACTTTTTTATATTGGGTTCGTTT 12 8 1 GCTTTTTAGGCCCTTTACTCTTATTTTCCCTA 13 188 1 AATATTCCCGCCCTTGTAAATTATTTGGGATT 14 43 1 AAGTTATTAACCTGTTAAAGTTAAATGTATTT 17 12 0 TATAGCATGACCTTTTACTTTTGAGTTGAAAG 18 147 1 ACCCCCAATTCCTTTTAAAACTCCTCGCGAAA 23 24 1 CATCCAATGACTTTTTAAGTTTCTGAAATTGA 28 57 0 TTTGAGAATGCTTTTTAATGTTTTCGAATACT 30 257 1 ******** ** MAP Score: 12.1842 Motif 8 CTTTTAACGTTCTTTACCCTAATTTGGGTATGTA 0 41 1 CTTTAGGTTTTCTCATCGCTTACTGACAACTTGA 3 54 1 TTTTATACCCCTCCTTAAGTATGGT 4 1 1 CTAAGTTTTTAACCTCTTCTTCCAATTTTA 10 6 1 ATAATGATTATCTTCTCCTTGACCTCATCAAATC 17 169 0 TTTTATCCCCCGCTTAAGACTGGC 17 263 0 AACAAAAGGATTTCCACCCTTGTTTACCGAAAGT 18 204 1 TTTTTCTTCCCTTATTTTTGTTACAT 19 2 1 TTCTCCTCCCCCCGTTTGTTTCACA 20 1 1 GTTTCCACCTCAGCCGGTAGGTGGT 24 1 1 TTGATCCTCTCCTTCTCTTTTTCTCTAA 28 282 0 GTCCTCCCCCTGGCTAAAATCGGGG 29 1 1 CTTAGCCTGTTTTTAGCCCTGTTTGTTTTAGCGG 30 12 0 TTTCTTCATGTCCTACCCCTCCTTTACCATGCTC 30 49 1 GTATATAAGCTTTTTGCCCCCATTCTGTAGACTT 30 121 1 TCCCCCTTCTTCTCGTCCCTCAGTTCCTTTATTA 31 135 0 TTCCTGGCTATCTCCTCCCCCTTCTTCTCGTCCC 31 150 0 TTTCTCTCACCCTCATTTAATTGACATA 32 20 0 **** **** ** MAP Score: 11.8415 Motif 9 TAAAGTCACCTCCTCTTAAAGATACCA 1 64 0 GCCGATCCCCCTCCTATTTCATCTG 2 5 1 AGCACCATAGTTCTTCCCTTTTATGCTCAA 8 27 1 TTTAAATCTTTCCTCAGCCTTTAGTTCAAC 8 81 0 ACATTTAATATTCCCGCCCTTGTAAATTAT 14 37 1 TTTTATCCCCCGCTTAAGACTGGCA 17 262 0 GAGGGCCTTTTCCTTATCTTTTCCTGGCAT 18 53 1 ACAAAAGGATTTCCACCCTTGTTTACCGAA 18 205 1 TTTTTCTTCCCTTATTTTTGTTA 19 3 1 TTCTCCTCCCCCCGTTTGTTTCA 20 3 1 CTTGCTTCCCCTCAAAAAATTT 20 124 0 ACAATAGTTAACCTACCCCCAATTCCTTTT 23 10 1 TTGATCCTCTCCTTCTCTTTTTCTCTAAC 28 281 0 GTCCTCCCCCTGGCTAAAATC 29 1 1 ATGAAGAAAGTCCTTAGCCTGTTTTTAGCC 30 28 0 TTTCTTCATGTCCTACCCCTCCTTTACCAT 30 49 1 CCTGGCTATCTCCTCCCCCTTCTTCTCGTC 31 152 0 ********** MAP Score: 11.5725 Motif 10 TTTGGTATCTTTAAGAGGAGGTGACTTTA 1 62 1 GTTCAAAACCATAAGATGGTGAAGTGCC 2 99 1 CATTAATTTGAGAAGGAGGTGATAAATA 3 7 0 TGAACCATACTTAAGGAGGGGTATAAAA 4 7 0 CTTTTTAGTTTTGAGGTGGAGCCT 8 129 1 CCCCTTGATCGTGAGCTGATGGGTTTAAGTT 9 31 0 CTTTAAAATTGGAAGAAGAGGTTAAAAACTT 10 12 0 GAAGTCTTGAAGGAGTTGGGGCTAG 16 34 1 AAGTGGCAACTGAAGATGCGGAAGTCACAAA 17 211 1 TATGCCAGTCTTAAGCGGGGGATAAAA 17 260 1 TGGAAACGGAGTGAGCTGAGGTGTGATGACC 18 11 1 GAGTTTTAAAAGGAATTGGGGGTAGGTTAAC 23 16 0 CTCAATGAGATGGAATTGGGGATTACAGTAG 23 72 1 AGATTGCCTGAGAAGCTGGGGTTGTTAGTTC 26 140 1 GGCTCGCCACTTATGATGGGGATGCTGAAGA 28 23 0 TTCCGGAGTGGGTAGATGAGGAGAGACTTAA 28 135 1 AGAGAAAAAGAGAAGGAGAGGATCAA 28 284 1 AGGAGCATGGTAAAGGAGGGGTAGGACATGA 30 54 0 ATAATAATAAAGGAACTGAGGGACGAGAAGA 31 131 1 CTGAGGGACGAGAAGAAGGGGGAGGAGATAG 31 146 1 ***** ***** MAP Score: 10.1585 Motif 11 GTTCGTTTCTTTTTCTCCTGGGGCTTAA 12 32 1 CACCAGAATTTCTTCTTTAGGGGATTAAG 23 182 1 GTTATGCCAGTCTTAAGCGGGGGATAAAA 17 258 1 GTTTATAAAGTTTTCGCGAGGAGTTTTAAAAGGAATTG 23 29 0 AATACCCCGATTTTAGCCAGGGGGAGGAC 29 1 0 CCCTCAAAAAATTTTTCAAGGAGTTGAATATAAACTTG 20 100 0 CCTATTTCCTTTTTAGTTTTGAGGTGGAGCCT 8 121 1 TAGCATGACCTTTTACTTTTGAGTTGAAAGAAAGGTCA 18 149 1 ATCGCTACCGTTTTAATTCGGGGTCTCATAAACTTAAC 24 65 1 GTGGAAATCCTTTTGTTTAGGGAATTCAGGGCTATGAC 18 183 0 TTCCACAACTTTTTTATATTGGGTTCGTTTCTTTTTCT 12 10 1 CCTTTTGGTATCTTTAAGAGGAGGTGACTTTA 1 59 1 GATGAACCATACTTAAGGAGGGGTATAAAA 4 2 0 TAGGCTCGCCACTTATGATGGGGATGCTGAAGAGGTTT 28 18 0 CAATTCATTAATTTGAGAAGGAGGTGATAAATA 3 5 0 TGATCGTTTTTCTAATGAGCACCATAGTTCTTCC 8 6 1 TTATTATACCTTTTTAGGTTGAACTAAAGGCTGAGGAA 8 64 1 TTTTTAACCTTGAGAAAACTTAAAATTTT 27 1 1 **** **** * * MAP Score: 9.7078 Motif 12 TAGGCAGATGAAATAGGAGGGGGATCGGC 2 4 0 ATCAATTCATTAATTTGAGAAGGAGGTGATAAATA 3 10 0 AATCCCTTTAAAATTGGAAGAAGAGGTTAAAAACT 10 13 0 CCTTTTAAGTAAACCCGAGCAAGCTTATCGGGTGG 11 50 1 AGTTAAAAGGGATCATGCTCTAAGGGGTT 13 4 1 TATGGTTATAAAAGAAGAGAATGGGGA 14 2 0 TACCGGTGGTGAAGATGAGAATTAGATTGATGGGT 17 43 1 TTGGAAACGGAGTGAGCTGAGGTGTGAT 18 3 1 TTGGCGATACAAATTTGAGCAATAGCCTATATAAA 18 238 0 TGTGTGAAACAAACGGGGGGAGGAGAA 20 2 0 TAGTTAATAAAAATTTGAATGTGAGTGAACACCGT 26 22 1 CTAAAAGTGAGGGTTATCAAGAAAATT 27 33 0 TTAAGTTTCTGAAATTGATTAGGCTCGCCACTTAT 28 40 0 TTATGTTAGAGAAAAAGAGAAGGAGAGGATCAA 28 277 1 CCCCTGGCTAAAATCGGGGTATTCTCTTATTAGAC 29 16 1 AAGAGTCCTAAAACCTGATGATGCTAGTCGCTAAC 30 211 1 ACAAAGTGGAAAATTTGAGAATGCTTTTTAATGTT 30 244 1 TATGTCAATTAAATGAGGGTGAGAGAAA 32 20 1 *** *** * *** MAP Score: 9.43593 Motif 13 TTTGGTATCTTTAAGAGGAGGTGACTTTA 1 62 1 TTCAAAACCATAAGATGGTGAAGTGCC 2 100 1 TTCATTAATTTGAGAAGGAGGTGATAAATA 3 7 0 TCTTTGAAGTTTTTAAGGTGATTGGTGGGCATA 5 50 1 TCCTTTTTAGTTTTGAGGTGGAGCCT 8 127 1 CAGCTCACGATCAAGGGGTGATGCTC 9 44 1 AGCAAGCTTATCGGGTGGTGAAA 11 67 1 AATTTAACCTTGGAAAGGTGAAGCACC 15 21 1 AATTTTTGAGTACTTTGGAGAAGTCTTGAAGGA 16 15 1 TTAATAACTTACCGGTGGTGAAGATGAGAATTA 17 34 1 TTCCGAGATTTGATGAGGTCAAGGAGAAGATAA 17 163 1 TTGAAAAATTTTTTGAGGGGAAGCAAG 20 119 1 ACGAAGGATTTAGCATGGTGATGTTTTTAAGTT 21 10 1 GGGTTGTTAGTTCAATGGAGGTGCGTTCAAGAG 26 158 1 GCTCGCCACTTATGATGGGGATGCTGAAGAGGT 28 20 0 GATAGTAACCTTTGGTGGTCATATGAGCAAGGT 28 88 1 AGTGGTAAAATTTTTTGGTGATGTAAAA 29 98 1 AGCTAAAAACAGTTGTGGTGGTGAAGG 33 39 1 * ********* MAP Score: 6.37067 Motif 14 GATAACTTAATTGCTTTGTTAGTTTAGCAACATAT 3 103 1 GGAAATCCTATTTCCTTTTTAGTTTTGAGGTGGAG 8 115 1 TTTTTTATATTGGGTTCGTTTCTTTTTCTCCTGGG 12 19 1 ATTCCTTGACTCAGGCCGTTGCTTTTTAGGCCCTT 13 168 1 TTACGAAATCTTCGTTTGTGACTTCCGCATCTTCA 17 221 0 CTTATTTTTGTTACATCGTAGGTTTCAATGTTGCA 19 20 1 TTCTCCTCCCCCCGTTTGTTTCACACACATA 20 6 1 TAACGATTTGTTCGGTTGTTACTTTGTTAATTTAT 26 95 1 CCTGAGAAGCTGGGGTTGTTAGTTCAATGGAGGTG 26 146 1 TATCATCCAATGACTTTTTAAGTTTCTGAAATTGA 28 57 0 TATTCTCTTATTAGACTGTCGGTTTTGGCAACCTT 29 35 1 AGCCTGTTTTTAGCCCTGTTTGTTTTAGCGGCT 30 8 0 CTTCTTCTCGTCCCTCAGTTCCTTTATTATTATCT 31 129 0 * * **** **** MAP Score: 5.97247 Motif 15 CTTTCAAGGATATTTCATCAAATCCTTTTAAATA 3 137 0 TCACCACATACAAAGGGGGTATTTAAGGTCGGTAATTTAT 4 81 0 GAACTAAAGGCTGAGGAAAGATTTAAAACCTGGAAATCCT 8 84 1 GGATCATGCTCTAAGGGGTTTCCTCTTGGCGTCGTTGGTA 13 19 1 TTTATAACCTCAAGGGTTTCTCATCAACACGACGGCAAAA 13 270 1 GAATTAGATTGATGGGTATTTTCTCTCATCTAGCAGGATC 17 61 1 GGCCCTCAGCGGGAAGTCGGTCATCACACCTCAGCTCACT 18 20 0 GACCTATCTTGCTAGGCATAACTTAAAAACATCACCATGC 21 22 0 CACCTCAGCCGGTAGGTGGTTCATCACAGCTCAGCCGGGA 24 15 1 ACAGCTCAGCCGGGAGTAGTTCATCATCGCTACCGTTTTA 24 40 1 TAAAAACAGGCTAAGGACTTTCTTCATGTCCTACCCCTCC 30 31 1 AATGAGGGAGGCTGGGTACAACGTCAAAACCTTAATTCCT 31 31 1 * *** ** *** * MAP Score: 3.8136 Motif 16 AATTACCGACCTTAAATACCCCCTTTGTATGTGG 4 84 1 ATTTCCAGGTTTTAAATCTTTCCTCAGCCTTTAG 8 87 0 CTTATTTTCCCTAAAATGATGTCTACGATATTTG 13 207 1 CTCCAAAGTACTCAAAAATTACCTC 16 1 0 TGGTGATGTTTTTAAGTTATGCCTAGCAAGATAG 21 25 1 TTTGCTACTAAAGTTTTAACTTTATAAATAT 22 7 1 TTAGGATAGTCTTAAGTCTCTCCTCATCTACCCA 28 143 0 GAACTTTCCCCTAAAGTCATGCCTGTTGATAAGT 28 191 1 TTATTCAAATCTAAAATAATTACTATTTATAAAA 30 154 1 ** **** * *** MAP Score: 1.36315