AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i PA/PA_operons015_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944249752 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 PAB2400_purF 58 PAB2400: PAB2400, purF: PAB0151 #1 PAB2201 77 PAB2201 #2 PAB2199 72 PAB2199 #3 hypE-like 53 PAB0403 #4 asnB 113 PAB0750 #5 PAB1605 22 PAB1605 #6 PAB1604 55 PAB1604 #7 PAB1344 40 PAB1344 #8 PAB1343_bgal 185 PAB1343: PAB1343, bgal: PAB2376 #9 PAB1271 142 PAB1271 #10 purM 300 PAB1083 #11 PAB1201 300 PAB1201 #12 PAB3433 65 hypothetical protein #13 PAB1195 22 PAB1195 #14 PAB1194 186 PAB1194 Motif 1 ATATCCGGTTACATTAAAAAATTTCCTGGGCGAT 1 33 0 GTCAAAACAAACCTTAAAAATTTTAAATTTTTAC 11 247 1 TACCTTGAAGACTTTCAAAATTTTACTTAGTATT 14 50 1 TCCCCAAATTAATTTAATAACTTTCCCGAAACTT 3 19 1 AATACTCTCCATTTTTACAAATTTTTGGTAATGG 12 39 1 AAAACCCTTAATATTCAAAAATTTTGACTTAAAC 9 106 1 TAAATTGCCATCTTTTATAAATTTGAACGAAATT 8 143 1 TTAAGGGTTTTCGTTTACAAATTTATGTCAAATA 9 83 0 AAATTTCACCATTTTCATGTAAAAA 0 43 0 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