AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i PH/PH_fusions001_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944254850 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 PH0154 55 248aa long hypothetical transport system protein #1 PH0194 60 375aa long hypothetical multiple sugar-binding transport ATP-binding protein #2 PH0206 132 544aa long hypothetical protein #3 PH0207 206 428aa long hypothetical protein #4 PH0209 300 131aa long hypothetical protein #5 PH0502 151 641aa long hypothetical protein #6 PH0503 35 330aa long hypothetical oligopeptide transport system permease protein AppB #7 PH0806 85 148aa long hypothetical protein #8 PH0807 174 597aa long hypothetical oligopeptide binding protein APPA #9 PH0808 41 323aa long hypothetical oligopeptide transport permease protein APPB #10 PH0882 127 237aa long hypothetical ABC transporter ATP-binding protein #11 PH0914 175 122aa long hypothetical protein #12 PH0915 76 192aa long hypothetical protein #13 PH0918 55 377aa long hypothetical protein #14 PH0919 35 237aa long hypothetical protein #15 PH0921 300 121aa long hypothetical protein #16 PH1228 300 325aa long hypothetical protein #17 PH1408 233 226aa long hypothetical protein #18 PH1409 250 721aa long hypothetical protein #19 PH1410 117 332aa long hypothetical dipeptide transport system permease protein dppB #20 PH1736 70 580aa long hypothetical ABC transporter ATP-binding protein #21 PH1737 137 237aa long hypothetical protein #22 PH1738 143 111aa long hypothetical protein #23 PH1739 113 212aa long hypothetical protein #24 PH1849 34 318aa long hypothetical ATP-binding transport protein #25 PH1961 198 349aa long hypothetical oligopeptide transport system permease protein appB #26 PH1962 300 841aa long hypothetical protein Motif 1 AAATTAGGAAAAAAGTTCAAAACCAGGGGCCCCA 16 243 0 TTTGATCATAAAACATTCAAAAACATCTCTCTAA 18 57 1 AAGGGTTTCTAAAATTTAAAAATCAAGGAGAAAA 25 27 0 AGGAATTTACAAAGTTTAAAAAGTG 24 1 0 ATTTTTTGGAAAAACTTTAAAAGTTATACCCCTA 22 75 1 AGTTTTTCCAAAAAATTGAGAATCAGAGAAGCAT 22 57 0 AAAGGTAGAAAAAACTTAAGAACCTTTTAATAAC 26 17 0 AATTGTCCAGAAAATTTTAAATTCCCTTCACATG 10 86 1 ATGTACCTAATAATGTTCAAAAATTTAACGTTAA 15 265 0 TACATAGTTTTAAGATTTAAAATTGGGGGTAATC 8 146 1 GAAAGTACACTAAAATTGAAAAGTCCAATGTAAG 2 80 0 TTCAAAAATTTAACGTTAAAAATTGTTTGATAAG 15 250 0 TTTTCAAACAAAATATTTAAAAAATATATCTGAA 21 28 1 CCACTCTCTTAAAATTTAAAAAGATTAT 16 4 0 TTTGTTTGAAAAAGTTTGAAAAAAGGCAAA 21 6 0 GAAGTTATAAAAACATTCAAATTTACAGTAACAT 5 27 0 AGGACATAGTAAATGTTTAGAAAAAATTGAACAT 15 218 0 GACCTTCCCAAAATGTTTAGATATTATTGAACAA 15 102 1 TATTAGTAGCAAATTTTTATAAGCAAGGCTCCTT 4 25 0 TTGAACTTTTAAAAATAAAGGCAAAG 14 19 0 TGGTGGAACTAAGCTTGAGATTCTTAAAATCCT 17 9 1 CCTCTTCACATAACATTCAGATATATTTTTTAAA 21 43 0 GGAAATGCCGAAACATTTATATTTAATTGACGAA 3 174 1 ATTATAATCAAAAAGTTTATATAATGTGAACTTC 5 102 1 *** ** **** * MAP Score: 25.9651 Motif 2 TTCGTCCTCTAAGGGGGGTGAAAG 2 118 1 TATTTCAAGAAAGGAAATATAAAT 3 1 0 AATTGACATCAAGGAGGGCGAAGGAAAGGTTCT 4 184 1 ATTCAGATTTAAGGGAAGTTATAAAAACATTCA 5 42 0 TGAGGATTAAAAGGGGGGATTAATTCAGATTTA 5 64 0 TAACCTATTTAAGGGCGAACAAAGCTATTAAAC 7 25 0 CAACAAAGAAAAGGGGAATAAAAATAAAAA 9 7 0 ATGTCATGTGAAGGGAATTTAAAATTTTCTGGA 10 91 0 CCCAAGTTTAAGGGGCACCTAAAGCTCCTAATA 11 110 1 TTTAAATTTTAAGAGAGTGGAAATCCCATGCCA 16 18 1 AGGCCTCATAAAGGAGGCATATAGAAAGGGGAA 17 142 1 CAATAAAGAAAAGAGAGAAGAAAGATTA 19 5 0 GTGTTTAAATAAGGGCAATAAAGAAAAGAGAGA 19 20 0 AAGAATGTACAAGGAGGGGCAAAT 19 103 1 CAAGGAGATTAAAATAACTGCAGA 21 123 0 AGAAAACTAAAGGGGAGGAGAAA 25 0 0 ACTAACGAGAAAGAGAGCTTAAGAGAAGGGTTT 25 53 0 CCAAAAAAGAAAGGTAGAAAAAACTTAAGAACC 26 27 0 ******* *** MAP Score: 17.1407 Motif 3 ATTTATATTTCCTTTCTTGAAATAATT 3 1 1 TTGAATGTTTTTATAACTTCCCTTAAATCTGAATTA 5 41 1 TTTTTATTTTTATTCCCCTTTTCTTTGTTGGA 9 6 1 GTCCAGAAAATTTTAAATTCCCTTCACATGACATCC 10 90 1 GCCTAATGCTAGAAGTTCCCTTGTTAAGCCTTCA 13 31 0 GGTGATCTTCTTTGCCTTTATTTTTAAAAGT 14 5 1 CAAATTACCCTTTATTTTTCGCTTATGCAAAGAAAA 15 27 1 TGAACATACTTCTAATATAACCTTCTGAAAACGTCT 15 189 0 TTTCTAAACATTTACTATGTCCTTATCAAACAATTT 15 229 1 AGGCCTAACTCTTGTAATTCCTTTATATGCTGATGA 17 112 0 CAAAAACATCTCTCTAATTCCCTTATTTTTTGAGAT 18 74 1 AGCTTTTCGATCTTGGTTCACTTTGTGGAAAATAGA 18 169 0 TTCTCTCTTTTCTTTATTGCCCTTATTTAAACACCA 19 19 1 CTAGTCCTTTTCTACCCTATCCTTCATAAAGGTTCC 23 18 1 TTTCTCCTCCCCTTTAGTTTTCTCCT 25 0 1 GATTTTTAAATTTTAGAAACCCTTCTCTTAAGCTCT 25 37 1 AAACCCTTCTCTTAAGCTCTCTTTCTCGTTAGTTCT 25 53 1 ACTTAAGAACCTTTTAATAACTTTCTAA 26 2 0 GGTTCTTAAGTTTTTTCTACCTTTCTTTTTTGGTTC 26 27 1 *** * ***** * MAP Score: 16.8791 Motif 4 AGGTAGTGCTTACAAGGCATAACTTTATACACAAACT 26 224 0 GATTCTCAATTTTTTGGAAAAACTTTAAAAGTTATAC 22 67 1 CAGGGGCAAGTACATTGGAAAAGTTGATGAAATTGTA 4 148 1 CTAGTGTAAATGAACTTCATAATTTTATTACTAATTG 18 117 1 ATTCCAGTTTTTGAAGGAACAAGTTTGAACATTATCT 25 154 0 ACATAGTAAATGTTTAGAAAAAATTGAACATACTTCT 15 212 0 ATGTACCTAATAATGTTCAAAAATTTAACGTTAAAAA 15 262 0 TATTCAAAAATATAGGGTTAAATTTTAACATATCACT 8 37 1 TCAAGCTAATTATAATCAAAAAGTTTATATAATGTGA 5 94 1 TTTTGGACTTTCAATTCGACAAATTTATTCAAAAATA 8 12 1 AGGCATCATTTGTAACCTACAACTTTACAAAAGTAAA 3 126 1 TTTAAATATTTTGTTTGAAAAAGTTTGAAAAAAGGCA 21 12 0 GAATTTAAAATTTTCTGGACAATTTTGCCCTCACACT 10 73 0 CAAATATTTATAGTAACTAAAAGTTTAATCCCTTTAG 20 42 1 TAACTTACATTGGACTTTTCAATTTTAGTGTACTTTC 2 77 1 AGTTTTCTCCTTGATTTTTAAATTTTAGAAACCCTTC 25 25 1 CGAATACCCATTTATAGCTTAAATTTGCGGAATAGTC 26 169 1 AATTTGCTACTAATACTTTTAAATTTACTAGTTCATA 4 44 1 ATTTTATTACTAATTGTTATAATTTGGATCTTCTATT 18 138 1 ATATTGTAACTTGGAAGAAAAAGTTTAAGGAGGTTAT 22 108 1 CCCCTCATCATGTTACTGTAAATTTGAATGTTTTTAT 5 18 1 ATACTGTTGGTTTTAACGTTAAATTGAACTAAGCGTA 26 92 1 GTACATAGTTTTAAGATTTAAAATTGGGGGTAATCTT 8 145 1 * * * * ** **** MAP Score: 16.6397 Motif 5 CTCTTAAAATTTAAAAAGATTAT 16 3 0 TTTTAACTAGTTAAAAGGATTTCCATCCAC 23 56 0 TAGAAAGTTATTAAAAGGTTCTTAAGTTTT 26 11 1 CTAATTATAATCAAAAAGTTTATATAATGT 5 99 1 TTTTAACTAGTTAAAAATATTTGGTAAATG 23 70 1 GATTGTTAACTTAAAAACATTCTGTTAAGT 0 25 0 ACTAGTAAATTTAAAAGTATTAGTAGCAAA 4 46 0 TTGCTATTAGTTAAAAGCATAAACTTCTCT 11 12 0 ACAAATTTATTCAAAAATATAGGGTTAAAT 8 30 1 TTTACAAGCTTGAAAAAGATAATGTTCAAA 25 138 1 CATAAAACATTCAAAAACATCTCTCTAATT 18 63 1 AGCTACCAAAAGGATGTCATGTGAA 10 112 0 CTAATAATGTTCAAAAATTTAACGTTAAAA 15 263 0 ATATTTTGTTTGAAAAAGTTTGAAAAAAGG 21 14 0 TTTACAAAGTTTAAAAAGTG 24 0 0 TTCGGGGTATTTAAAAAGTGTTTCGGTTAG 2 47 0 TGTTTTATGATCAAAATGATACACCACTGA 18 42 0 CATGAGAAGACTAAAAACATTTCCTGGAAA 1 19 0 TTTATAGTAACTAAAAGTTTAATCCCTTTA 20 48 1 GAGTTCCTTACGAAAAAGTTACAGCAGTTG 4 246 1 TGAAAAATTTATTATCAGGG 12 0 1 ATTCAATCATTTAAAATTATTTTCATATGT 10 26 1 AGATAATAATCTAAAAGGAGAGAAA 20 5 0 AAATTTAACGTTAAAAATTGTTTGATAAGG 15 249 0 TGAAGGGAATTTAAAATTTTCTGGACAATT 10 86 0 CGTGACCTTCCCAAAATGTTTAGATATTAT 15 99 1 ACTTGTTCCTTCAAAAACTGGAATGTTCAG 25 167 1 GGGGCTTGGACTAAAATTATATCTCCAACT 4 271 0 GAACCAAGATCGAAAAGCTTATTAGCGAGG 18 186 1 TATTTAAACACCAAAATTTTTATTTATGCG 19 42 1 GAAGGCTTATTGAAAATCTTGAGTAGAGGG 17 207 1 AAAGTAAACATGAAAATCAGGAAATGCCGA 3 155 1 ********** MAP Score: 16.3687 Motif 6 GCTATTAAACAGGGGGTGAAACTAG 7 4 0 CGTCCTCTAAGGGGGGTGAAAG 2 120 1 CAAGCTAATTGGGGGGAGTGAA 23 101 1 AGAAAACTAAAGGGGAGGAGAAA 25 2 0 AGGATTAAAAGGGGGGATTAATTCAGATTTA 5 64 0 AACAAAGAAAAGGGGAATAAAAATAAAAA 9 8 0 TAAGAAAAAGAGAGGGTGTAAATGGTCTTGA 12 36 1 TCATAATGTTAGGGGATGAAGTTCGTGACCT 15 76 1 GCATATAGAAAGGGGAAGAGGATATATTACA 17 158 1 GGAATGTTCAGGAGGGTGTGAG 25 186 1 ACATGATGAGGGGGAGATTGA 5 0 0 TCAAAAAATAAGGGAATTAGAGAGATGTTTT 18 76 0 TGTCATGTGAAGGGAATTTAAAATTTTCTGG 10 92 0 AAGCTGACTGAGAGAGGTAGAAGGCTTATTG 17 188 1 TTGACATCAAGGAGGGCGAAGGAAAGGTTCT 4 186 1 CTAACGAGAAAGAGAGCTTAAGAGAAGGGTT 25 54 0 AATAATCTAAAAGGAGAGAAA 20 0 0 ACTAAAGGGATTAAACTTTTAGTTA 20 55 0 ACCTATTCTGAGAGAAATTAATATCTAACCG 2 23 1 GGTTATCTCTAGAGAATTTAAGCTTATGGTA 7 56 0 CAAGGAGATTAAAATAACTGCA 21 125 0 TCCCATGCCAAGAGGATTTGGAAGAGGCCCA 16 41 1 TAAAATCCTCGAGGAAAGAGAGATGTACGCC 17 34 1 ****** **** MAP Score: 14.5158 Motif 7 TTTTTATTTTTATTCCCCTTTTCTTTGTTGGAGGTG 9 7 1 GGTTCTTAAGTTTTTTCTACCTTTCTTTTTTGGTTCTAC 26 27 1 TATATTTTATTTTTGTTATTTGTTAATTTGATTTACTAA 15 148 0 TTCAGATATATTTTTTAAATATTTTGTTTGAAAAAGTTT 21 23 0 GGTGATCTTCTTTGCCTTTATTTTTAAAAGTTCA 14 5 1 ATGTTCAATTTTTTCTAAACATTTACTATGTCCTTATCA 15 218 1 AACTTCATAATTTTATTACTAATTGTTATAATTTGGATC 18 129 1 CCCCCGCATCTTTTCTAGATATTTTACATTTGAGGCATC 3 94 1 TAATCTTTCTTCTCTCTTTTCTTTATTGCCCTTA 19 5 1 GAGGCCTAACTCTTGTAATTCCTTTATATGCTGATGAAC 17 110 0 GCTCTCTCTTTTATTATTTTGTTGGGGGGAATA 6 4 1 CCTTTAGTTTTCTCCTTGATTTTTAAATTTTAGAAACCC 25 20 1 TCAATTACAATTTCATCAACTTTTCCAATGTACTTGCCC 4 151 0 TGGTTTTGAACTTTTTTCCTAATTTTCTTAAGCATCATA 16 252 1 AAGACTCAATTTTTATAAGAAGTTCACATTATATAAACT 5 115 0 TCCTTAAACTTTTTCTTCCAAGTTACAATATAGGGGTAT 22 100 0 TTTCTCTCCTTTTAGATTATTATCTTAACCGACAAA 20 7 1 ACGTCATAGCCCTTGTAGTTGTTTACATTATCTGGAGGC 16 178 1 TTTTTAGTCTTCTCATGCAATTTTATTTTTAAGAAGAG 1 32 1 TATATAAACTTTTTGATTATAATTAGCTTGAGGATTAAA 5 86 0 GTCCAGAAAATTTTAAATTCCCTTCACATGACATCCTTT 10 90 1 CTAATAAGCTTTTCGATCTTGGTTCACTTTGTGGAAAAT 18 172 0 CAAAAACATCTCTCTAATTCCCTTATTTTTTGAGATGTT 18 74 1 **** * * ** ** MAP Score: 14.3915 Motif 8 GGGCGGGTTATTACCCCCGCATCTTTTCTAGATAT 3 81 1 TAAATCTGAATTAATCCCCCCTTTTAATCCTCAAG 5 64 1 TATAATTAAGACTCAATTTTTATAAGAAGT 5 131 0 ATGTTAAAATTTAACCCTATATTTTTGAATAAATT 8 33 0 CTAAGATTACCCCCAATTTTAAATCTTAAA 8 154 0 CAAGACCATTTACACCCTCTCTTTTTCTTACTAAA 12 31 0 GGTGATCTTCTTTGCCTTTATTTTTAAAAGTTCA 14 9 1 CTAAAAACAAATTACCCTTTATTTTTCGCTTATGC 15 20 1 GGTTTTGAACTTTTTTCCTAATTTTCTTAAGCATC 16 253 1 AACATCTCTCTAATTCCCTTATTTTTTGAGATGTT 18 78 1 TAATCTTTCTTCTCTCTTTTCTTTATTGCC 19 5 1 ATTTGCCCCTCCTTGTACATTCTTGT 19 101 0 GTGTACTTAGTTGGATCTCTATATTATTTATTCTG 21 92 1 GAATGCTTCTCTGATTCTCAATTTTTTGGAAAAAC 22 55 1 ACTTTAAAAGTTATACCCCTATATTGTAACTTGGA 22 88 1 TTTCTCCTCCCCTTTAGTTTTCTCC 25 0 1 CCCCTTTAGTTTTCTCCTTGATTTTTAAATTTTAG 25 18 1 CTTAAGTTTTTTCTACCTTTCTTTTTTGGTTCTAC 26 31 1 AACCAACAGTATCACTCCATATTTTTCCCAAAAGT 26 69 0 ** *** ***** MAP Score: 11.1439 Motif 9 GGTTTTGAACTTTTTTCCTAATTTTCTTAAGCATC 16 253 1 TTTGCCTTTTTTCAAACTTTTTCAAACAAAA 21 6 1 CCCCCGCATCTTTTCTAGATATTTTACATTTGAGG 3 94 1 TTCAGATATATTTTTTAAATATTTTGTTTGAAAAA 21 27 0 GAGGGCAAAATTGTCCAGAAAATTTTAAATTCCCT 10 78 1 TCTTTTTTGGTTCTACGTTACTTTTGGGAAAAATA 26 50 1 CTAAGCGTAATTGTTAATAAATTTGAGCTATAGCC 26 120 1 AACCCTATATTTTTGAATAAATTTGTCGAATTGAA 8 21 0 ATATTATTTATTCTGCAGTTATTTTAATCTCCTTG 21 112 1 GAATACCCATTTATAGCTTAAATTTGCGGAATAGT 26 170 1 TACTATGTCCTTATCAAACAATTTTTAACGTTAAA 15 241 1 GTTTTTAGTCTTCTCATGCAATTTTATTTTTAAGA 1 31 1 TATGTTCAATTTTTTCTAAACATTTACTATGTCCT 15 217 1 TTTATTTTTGTTATTTGTTAATTTGATTTACTAAC 15 147 0 TATATTTCCTTTCTTGAAATAATTTATGAAGCCCG 3 13 1 GTTTTCTCCTTGATTTTTAAATTTTAGAAACCCTT 25 26 1 CTTAAGTTTTTTCTACCTTTCTTTTTTGGTTCTAC 26 31 1 ATAATCTTTTTAAATTTTAAGAGAGTGG 16 3 1 CTTTTAAAGTTTTTCCAAAAAATTGAGAATCAGAG 22 63 0 TAATGTGAACTTCTTATAAAAATTGAGTCTTAATT 5 123 1 GTCAATTACAATTTCATCAACTTTTCCAATGTACT 4 156 0 TAAGGAGCCTTGCTTATAAAAATTTGCTACTAATA 4 24 1 AGTAATAAAATTATGAAGTTCATTTACACTAGGTT 18 114 0 CCCCTCATCATGTTACTGTAAATTTGAATGTTTTT 5 18 1 ** * ******* MAP Score: 10.8573 Motif 10 CTTTTCCAATGTACTTGCCCCTGGTGTTATATATCAGC 4 133 0 TAAATCTGAATTAATCCCCCCTTTTAATCCTCAAGCTA 5 64 1 CTAGTTTCACCCCCTGTTTAATAGCTTTGTTCG 7 5 1 ATATGTTAAAATTTAACCCTATATTTTTGAATAAATTT 8 32 0 TAATGCAATCTTGAGAATCTATGATCTTCAATGCCAAA 8 73 1 TTTTTATTTTTATTCCCCTTTTCTTTGTTGGAGGT 9 7 1 TTCAAGACCATTTACACCCTCTCTTTTTCTTACTAAAG 12 30 0 GGTGATCTTCTTTGCCTTTATTTTTAAAAGTTCAA 14 7 1 AGCTCCCTACGTCATAGCCCTTGTAGTTGTTTACATTA 16 170 1 AAAACATCTCTCTAATTCCCTTATTTTTTGAGATGTTT 18 76 1 TAATCTTTCTTCTCTCTTTTCTTTATTGCCCTT 19 5 1 GTGTACTTAGTTGGATCTCTATATTATTTATTCTGCAG 21 92 1 ACTTTAAAAGTTATACCCCTATATTGTAACTTGGAAGA 22 88 1 TTTAAACTTTGTAAATTCCTTTCATATTG 24 15 1 TTTCTCCTCCCCTTTAGTTTTCTCCTTGA 25 1 1 TTCTTAAGTTTTTTCTACCTTTCTTTTTTGGTTCTACG 26 29 1 AAAACCAACAGTATCACTCCATATTTTTCCCAAAAGTA 26 68 0 ** *** * ** ** MAP Score: 8.60919 Motif 11 GACTAAAAACATTTCCTGGAAAAACATTGCT 1 8 0 ATGCAATTTTATTTTTAAGAAGAG 1 46 1 TCAAATGTAAAATATCTAGAAAAGATGCGGGGG 3 94 0 GGAATTTAAAATTTTCTGGACAATTTTGCCCTC 10 78 0 ATATCAGGTGATAATTTGGAAAAGCCCAAGTTT 11 86 1 CTAATACTGAAGCTCCTGGAAGAAAACCCCCTG 11 137 1 GGACATAGTAAATGTTTAGAAAAAATTGAACAT 15 218 0 CCATGCCAAGAGGATTTGGAAGAGGCCCAGGAA 16 43 1 GATGCTTAAGAAAATTAGGAAAAAAGTTCAAAA 16 255 0 AAATTTGGCAAGCACTAGGAAAACCCCTAAAGT 17 69 1 ATCTTGGTTCACTTTGTGGAAAATAGAAGATCC 18 163 0 TTTGTTTGAAAAAGTTTGAAAAAAGGCAAA 21 7 0 TTTCAAACAAAATATTTAAAAAATATATCTGAA 21 29 1 CTGATTCTCAATTTTTTGGAAAAACTTTAAAAG 22 65 1 ACTAGTTAAAAATATTTGGTAAATGTCAAGCTA 23 75 1 GTTCTACGTTACTTTTGGGAAAAATATGGAGTG 26 59 1 * ********* MAP Score: 7.35975 Motif 12 AGGGGGTTTTCTTCCAGGAGCTTCAGTATT 11 139 0 TTGTAATTGACATCAAGGAGGGCGAAGGAA 4 180 1 AATACTTGCACTACCAGGAGAAAGGGTTGG 4 217 1 GAACAAGAATGTACAAGGAGGGGCAAAT 19 99 1 TTTTAAGCATCTTCAAGGTGAAACAATAAG 18 11 0 GGAAGAAAAAGTTTAAGGAGGTTATGAACG 22 120 1 AAAATTTAAAAATCAAGGAGAAAACTAAAG 25 21 0 AAAAGCCCAAGTTTAAGGGGCACCTAAAGC 11 105 1 AGATAATAATCTAAAAGGAGAGAAA 20 5 0 CAAAGGGGCTATTTAAGGAGCCTTGCTTAT 4 11 1 CTTGTTAAGCCTTCATGGGGATACCTTGAG 13 16 0 AGTTAGGCCTCATAAAGGAGGCATATAGAA 17 138 1 TTAATTCGTCCTCTAAGGGGGGTGAAAG 2 114 1 AAAAAGTTCAAAACCAGGGGCCCCAGGGAG 16 238 0 TACAGGAGGCCTCCCTGGGGCCCCTGGTTT 16 228 1 ********** MAP Score: 6.33883 Motif 13 GACTTTTCAATTTTAGTGTACTTTCTTAATTCGTCCT 2 89 1 ATTTATATTTCCTTTCTTGAAATAATTT 3 1 1 TTTCCTGATTTTCATGTTTACTTTTGTAAAGTTGTAG 3 142 0 AAAGGGGCTATTTAAGGAGCCTTGCTTATAAAAATTT 4 12 1 TCCATAACCATTTAGTTCACCATTCCCTAACTATGAA 4 75 0 TCATCAACTTTTCCAATGTACTTGCCCCTGGTGTTAT 4 141 0 TATTAGAACCTTTCCTTCGCCCTCCTTGATGTCAATT 4 184 0 AAATTTGAATGTTTTTATAACTTCCCTTAAATCTGAA 5 37 1 TTTTTATTTTTATTCCCCTTTTCTTTGTTGGAGG 9 7 1 TATTCAATCATTTAAAATTATTTTCATATGTTTTAGT 10 25 1 GTCCAGAAAATTTTAAATTCCCTTCACATGACATCCT 10 90 1 ACTCAAGATTTTCAATAAGCCTTCTACCTCTCTCAGT 17 194 0 GTTATATCTCTTTGGATAACCTTCCCTGGTGATGTAA 18 222 1 TAATCTTTCTTCTCTCTTTTCTTTATTGCCCTT 19 6 1 TTTGCCTTTTTTCAAACTTTTTCAAACAAAATA 21 6 1 TTTCTTCCCTAGTCCTTTTCTACCCTATCCT 23 4 1 TTTTTAAACTTTGTAAATTCCTTTCATATTG 24 13 1 TTTCTCCTCCCCTTTAGTTTTCTCCTTG 25 1 1 GATTTTTAAATTTTAGAAACCCTTCTCTTAAGCTCTC 25 37 1 GGTTCTTAAGTTTTTTCTACCTTTCTTTTTTGGTTCT 26 27 1 *** ****** * MAP Score: 6.31819 Motif 14 AAGCTCCTGGAAGAAAACCCCCTGCACGGATAT 11 146 1 CTAAGATTACCCCCAATTTTAAATC 8 159 0 AATATTCCCCCCAACAAAATAAT 6 22 0 CTTAAATCTGAATTAATCCCCCCTTTTAATCCT 5 62 1 AAAACTTTAAAAGTTATACCCCTATATTGTAAC 22 85 1 CTAGTTTCACCCCCTGTTTAATAGC 7 2 1 GGCACTCTCAAGGTATCCCCATGAAGGCTTAA 13 9 1 AGATCCAACTAAGTACACCTCCCATATACTTTG 21 77 0 TCAATCTCCCCCTCATCATGTTACT 5 2 1 TTTTCTGGACAATTTTGCCCTCACACTCTTGGT 10 67 0 CAGGGGCCCCAGGGAGGCCTCCTGTACGGCCTA 16 221 0 ACATACTTCTAATATAACCTTCTGAAAACGTCT 15 189 0 CTTGAACCCAAAGATAAGCTCCTG 12 62 1 AAATTTTTATAAGCAAGGCTCCTTAAATAGCCC 4 16 0 CCAGGGCCGTAATAATAACCTCTTCCTGGGCCT 16 65 0 TGGCAAGCACTAGGAAAACCCCTAAAGTATCAA 17 74 1 *** * ****** MAP Score: 4.65918 Motif 15 CTTACATTGGACTTTTCAATTTTAGTGTACTTT 2 80 1 TGAACTAGTAAATTTAAAAGTATTAGTAGCAAA 4 46 0 CATTATATAAACTTTTTGATTATAATTAGCTTG 5 95 0 ATCTCTAGAGAATTTAAGCTTATGGTAACCTAT 7 50 0 GATTTTTAGGTTATCTCTAGAGAA 7 71 0 TATAGGGTTAAATTTTAACATATCACTAATGCA 8 47 1 GCGTATATTTAATTTTTATGGATCGGAATTTGG 8 106 0 ATATGAAAATAATTTTAAATGATTGAATACTAG 10 21 0 ATGTGAAGGGAATTTAAAATTTTCTGGACAATT 10 86 0 AGAGAGAAGTTTATGCTTTTAACTAATAGC 11 7 1 TTGATATATCAGTTTATAAGTGTTTTTATTGTC 11 48 0 TTGAACTTTTAAAAATAAAGGCAAAGA 14 18 0 ATTACCCTTTATTTTTCGCTTATGCAAAGAAAA 15 30 1 CTTATCAAACAATTTTTAACGTTAAATTTTTGA 15 250 1 ACTCTCTTAAAATTTAAAAAGATTAT 16 3 0 TTCCTCGAGGATTTTAAGAATCTCAAGCTTAGT 17 17 0 TTTCTCTCCTTTTAGATTATTATCTTAACC 20 7 1 ATTCAGATATATTTTTTAAATATTTTGTTTGAA 21 30 0 TAGGGGTATAACTTTTAAAGTTTTTCCAAAAAA 22 76 0 TTTACCAAATATTTTTAACTAGTTAAAAGGATT 23 65 0 CACTTTTTAAACTTTGTAAATTCCT 24 2 1 TTTCTCCTTGATTTTTAAATTTTAGAAACCCTT 25 28 1 * ******* * * MAP Score: 1.17733