AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i PH/PH_operons008_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944255614 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 PH0359 300 443aa long hypothetical glutamine synthetase #1 PH0572 300 445aa long hypothetical NADH oxidase #2 PH0878 300 285aa long hypothetical protein #3 PH0893 52 161aa long hypothetical protein #4 PH1290 300 372aa long hypothetical cytochrome-c3 hydrogenase alpha chain #5 PH1361 274 537aa long hypothetical proline permease #6 PH1363 211 493aa long hypothetical protein #7 PH1426 209 336aa long hypothetical thioredoxin reductase #8 PH1509 300 440aa long hypothetical NADH oxidase #9 PH1516 149 303aa long hypothetical dihydroorotate dehydrogenase #10 PH1748 271 192aa long hypothetical protein #11 PH1749 50 482aa long hypothetical D-nopaline dehydrogenase #12 PH1751 259 377aa long hypothetical sarcosine oxidase #13 PH1874 80 298aa long hypothetical protein Motif 1 CGAGAAGCTCCTTGCACCCTTTAATTAAACTCAAGAAGGTC 1 128 0 CCCTGGTTTAAAAACCTTCAGTTAAAAATTTTTAAGAA 1 272 0 TTTAGACATTTTTAAAACCAAAAGTTTTCAACCTATCCCCT 2 105 1 TATAGCGGTTTTTAAAACCATTAGTTTAAAACCCTCTAAAA 2 219 0 CATTTTCATATTTAAAACCAAAAGTTATGGACAAAATTGGG 3 14 0 AAACCAAAGGTTGAGAACTCTTTTTTTCAAAGACCAAGCTT 4 177 0 AAAAAGCGTTTTTAAACCCGAAAATTGAAAACCAAAGGTTG 4 205 0 TAAAAACGCTTTTTTATCCTGGACTTTAACTCGTTATCGAG 4 232 1 ATAGTTTTCACCCCCTAATTTATGATATTTTTTTC 5 4 1 GCTCTTTGCCCTTGCAACCTTTATTTTCTCACTCTTTTCTA 6 54 0 TAACCTTTTTTTGCTAACCTAATGTTTTATAAATTATGACT 6 140 1 TAAAATAGCGTTTTAAACCAATGGTTGAGGAGGTTTGGAG 7 9 0 AAAAGGGTTTTTTAAAGCTTAGAATTGAAAATAAAAGTGTT 7 96 1 AAAATAAAAGTGTTCAACCTTTGGTTTAATATCTTTGGTTT 7 123 1 ATGCCCTCATTTTCTCCCCAACATTTTAATATCTCTTAACC 8 246 1 CCCACAAGAATTTTAAGCTATAATTTATTAATTTTAATCGC 10 39 1 ACAATAAAGTTTAATATCCCCTTCTTAATTAATAGATGGAG 10 232 1 TTTTATTTATTATCCAACCAATAGTTTACAATAAGTTTATA 13 12 1 *** * ** * ** * MAP Score: 21.791 Motif 2 TTTAGACATTTTTAAAACCAAAAGTTTTCA 2 105 1 TATAGCGGTTTTTAAAACCATTAGTTTAAA 2 230 0 CATTTTCATATTTAAAACCAAAAGTTATGG 3 25 0 AAACCATTAGTTTAAAACCCTCTAAAAGGA 2 216 0 AACTGAAGGTTTTTAAACCAGGG 1 287 1 TAAAATAGCGTTTTAAACCAATGGTTGAGG 7 20 0 AAAAAAGCGTTTTTAAACCCGAAAATTGAA 4 217 0 AAACCAAAGATATTAAACCAAAGGTTGAAC 7 134 0 AACCCGAAAATTGAAAACCAAAGGTTGAGA 4 202 0 TTAGTGAATATTTAAAAGCATTTTGGGGCA 7 180 0 ACAATAAGTTTATAAAAACAAAATGTTCAG 13 39 1 TACAGTTTAATATAAAAACCTTATTTGAAA 9 123 1 TTCTAAGCTTTAAAAAACCCTTTTAAGATT 7 90 0 AAGTCATAATTTATAAAACATTAGGTTAGC 6 152 0 ********** MAP Score: 18.3003 Motif 3 TAATTTCTCTAATAGTCAGGGAGCACTTCCGAG 0 43 1 ACTAGGGGAGAATTGGAGAGGAACCCAAGCGCT 1 170 1 TTGATATTGAAATCGAGAGGGAGGGAATATTTT 1 206 1 AAGAAGATTTAAATGCCAGGGAAAGCTTTGCCT 1 244 0 AAACCCTCTAAAAGGAAAGGAAGCGTTTTTCAT 2 199 0 AAGGAGACCAATTCGGAAAGGAGCTCCAGTACA 4 76 1 TCACCAAATAAAAGGTCAAGGTGCGGGGCTTAA 4 119 1 TTTGGGACAAAATTACGGGGAAGGAGTACTATG 5 199 1 TTCCGATAGAAAAGAGTGAGAAAATAAAGGTTG 6 48 1 GTTTTAAACCAATGGTTGAGGAGGTTTGGAG 7 8 0 CTGAAGAAGAAAAAATAAGGAAGTAAAATAGCG 7 40 0 TTGACTCCCGAAAAGCTGAGAAGCTCGCTATGA 8 30 1 ATGAGCTAGCATTCGATAAGGAGAGGTTTATCG 8 86 1 GGTTTATCGAAATAAGGAAGGAAAGGCCAACAA 8 110 1 CGATAAAGATAATCGGAGAGATGCTCCTGAACT 8 169 1 AAACTCACTGAAATATGAAGGAAAAATTTGAAC 8 211 1 AGAGATATTAAAATGTTGGGGAGAAAATGAGGG 8 249 0 GCCTCCATCTATTAATTAAGAAGGGGATATTAA 10 242 0 CTAAATATAGGTTAGGGAAAATGAAATTT 11 31 0 TGAAAAGCTCATAGATGAAGGAGTCACTGATCT 12 50 1 TGAAGCTTTCATTGAGGAGGAAGATGAAAA 12 239 1 *** * ****** MAP Score: 18.1563 Motif 4 AAACTGCATAAGGAGCTCTTTAAAAAAGTTCCGA 6 20 1 CTTTCCTTTTAGAGGGTTTTAAACTAATGGTTTT 2 213 1 AGATGTTGTTAAACTGCATAAGGA 6 0 1 TTAATTAAGAAGGGGATATTAAACTTTATTGTGG 10 230 0 CCGTCCCAGGAAAGGTTCTTGAAATTAAAGGAAA 2 28 0 GAAATCTTAAAAGGGTTTTTTAAAGCTTAGAATT 7 88 1 AGAAAGGGTTAAGAGATATTAAAATGTTGGGGAG 8 259 0 CAGGATAAAAAAGCGTTTTTAAACCCGAAAATTG 4 219 0 AATTTTTAACTGAAGGTTTTTAAACCAGGG 1 280 1 CCAAGCGCTTAGTTGATATTGAAATCGAGAGGGA 1 194 1 CAATATTTTTAGACATTTTTAAAACCAAAAGTTT 2 98 1 ATAATCGGAGAGATGCTCCTGAACTCTAGACAAA 8 177 1 ATGTAACCCTAGAGGAAATTGAAAAGCTCATAGA 12 31 1 ATAAAGATTTAGGGGGTATTTATATGAAAAAAAT 5 36 0 GGTTTTAAACTAATGGTTTTAAAAACCGCTATAA 2 227 1 TTGTGCCCCAAAATGCTTTTAAATATTCACTAAA 7 177 1 CCTTTTTATTAAAAAATTTTCAAATTTCATTTTC 11 10 1 GACTTTACATAGGTAATGTTGAATTTGTTTCAAT 6 177 1 *** * * ** *** MAP Score: 14.7038 Motif 5 ATAGCGTTTTAAACCAATGGTTGAGGAGGTTTGGAG 7 7 0 CGAAAATTGAAAACCAAAGGTTGAGAACTCTTTTTTTCA 4 189 0 CAAAGATATTAAACCAAAGGTTGAACACTTTTATTTTCA 7 121 0 AAAGAGTGAGAAAATAAAGGTTGCAAGGGCAAAGAGCCA 6 58 1 TTTAAAACCAAAAGTTATGGACAAAATTGGGAAAT 3 6 0 AAACCCTCTAAAAGGAAAGGAAGCGTTTTTCATGCTTAT 2 193 0 GTTTTGGGACAAAATTACGGGGAAGGAGTACTATGTAGA 5 197 1 AAGGTTCTTGAAATTAAAGGAAACATCGGGATAGTTGAT 2 12 0 TTATTTGGTGAAAAGTATGGATGTACTGGAGCTCCTTTC 4 91 0 ATAACGAGTTAAAGTCCAGGATAAAAAAGCGTTTTTAAA 4 230 0 AAGAAGATTTAAATGCCAGGGAAAGCTTTGCCTGCTCTA 1 238 0 CTGAAGAAGAAAAAATAAGGAAGTAAAATAGCGTTTTAA 7 34 0 AGAGATATTAAAATGTTGGGGAGAAAATGAGGGCATTCG 8 243 0 AAAATATCATAAATTAGGGGGTGAAAACTAT 5 2 0 ACTTTTCACCAAATAAAAGGTCAAGGTGCGGGGCTTAAA 4 114 1 TCCACCCAAGAGAGAAAGGGTTAAGAGATATTAAAATGT 8 266 0 AAAAGGTTAAAGAAGGCCGGAAGCAATTGCAAAATCAAA 6 110 0 AACTCACTGAAATATGAAGGAAAAATTTGAACGAATGCC 8 212 1 *** * ** *** * MAP Score: 12.9448 Motif 6 TAATTTCTCTAATAGTCAGGGAGCACTTCCGAGAGTCAAGGCT 0 43 1 TTTTGAAGACAGGTAGAAGGGTTCATGATCATGGGGGGACCTT 1 91 1 AGGAGCTTCTCGTACTAGGGGAGAATTGGAGAGGAACCCAAGC 1 157 1 TATTGAAATCGAGAGGGAGGGAATATTTTAGAGCAGGCAAAGC 1 210 1 TTATAGGCCTGGAATTCAGGGTTTATAGCGGTTTTTAAAACCA 2 240 0 TTATTTGGTGAAAAGTATGGATGTACTGGAGCTCCTTTCCGAA 4 87 0 ATAAAAGGTCAAGGTGCGGGGCTTAAATATATTTATCATATAT 4 126 1 ATAACGAGTTAAAGTCCAGGATAAAAAAGCGTTTTTAAACCCG 4 226 0 ACTCGTTATCGAGGATCAGGGATGAGCATCATGGTTAATCCTG 4 260 1 ATAGTATATAAAGATTTAGGGGGTATTTATATGAAAAAAATAT 5 34 0 ACAAAAGCAAGAATCGTTGGAACTAGCAGCGTGGCCCAAGCTG 5 136 0 GATAGTTTATGGGTTTTGGGACAAAATTACGGGGAAGGAGTAC 5 185 1 AGAAAATAAAGGTTGCAAGGGCAAAGAGCCAAGCTGAAAACGT 6 66 1 CTGAAGAAGAAAAAATAAGGAAGTAAAATAGCGTTTTAAACCA 7 30 0 CTGAGAAGCTCGCTATGAGGGATGATAATGGATAAAGCAGTAT 8 45 1 AACTCACTGAAATATGAAGGAAAAATTTGAACGAATGCCCTCA 8 212 1 AGAGATATTAAAATGTTGGGGAGAAAATGAGGGCATTCGTTCA 8 239 0 CGCCCCCGCAAGGTTTCGGGGTCGATGAGCGGGGTGTGCTCAC 10 122 1 CCGGTGCATCCGCCCGCGGGATTAATGACCGCTGGGTCTCTGT 10 180 1 ** * **** * * * MAP Score: 9.56543 Motif 7 AGTCAGGGAGCACTTCCGAGAGTCAAGGCTATA 0 56 1 TCACCTTTTTTAGAGTTTAGCAAAAA 1 3 1 CATGGGGGGACCTTCTTGAGTTTAATTAAAGGG 1 120 1 CGCTTCCTTTCCTTTTAGAGGGTTTTAAACTAA 2 207 1 AGGGATTAAGCCTTCTAAAGAGTGCCCAAGGTT 4 19 0 AGGCTTAATCCCTTTATTAGGGTCATTGACGGT 4 39 1 ATCTAAGTCACCTCCAATAAATTTCAAAATGTA 5 89 0 CCCTCCAAAAATTGAAACAAATT 6 198 0 CTTTAAAAAACCCTTTTAAGATTTCTACGCTAT 7 80 0 ATTTTATCTCCCTCTATCAGGATATCAGCCCTA 9 11 1 ATAAGGCCTCCCTTTAATAGAATTGACAAGTCA 9 71 1 GTTGACCGAGCCCTTGCGAGGGTATTGTACCCT 10 88 0 GGTCAACCCGCCCCCGCAAGGTTTCGGGGTCGA 10 114 1 TTGGAATGGGCCCTTGTCAAGGTAGAACTTGCA 12 109 1 ***** ***** MAP Score: 9.46283 Motif 8 GTTTATATAGCCTTGACTCTCGGAAGTGCTC 0 63 0 CTTCCTAACCCTCTTACTTGCTGGGGCTTTT 0 107 1 TCGACGAATGCTTTTTATTGCTTTTTGCTAA 1 26 0 GCAGAGCAACCTCTTGCTATCTTCATAATCG 1 54 0 CTAAAATATTCCCTCCCTCTCGATTTCAATA 1 210 0 GCAGGCAAAGCTTTCCCTGGCATTTAAATCT 1 242 1 CCCGATGTTTCCTTTAATTTCAAGAACCTTT 2 21 1 GCATGAAAAACGCTTCCTTTCCTTTTAGAGG 2 197 1 AGGTTGAGAACTCTTTTTTTCAAAGACCAAG 4 180 0 AGTTCTCAACCTTTGGTTTTCAATTTTCGGG 4 199 1 GCCCTTGCAACCTTTATTTTCTCACTCTTTT 6 57 0 CCTTCTTTAACCTTTTTTTGCTAACCTAATG 6 133 1 AGGTTGAACACTTTTATTTTCAATTCTAAGC 7 112 0 TTCGATAAACCTCTCCTTATCGAATGCTAGC 8 90 0 ATTTTGTTGGCCTTTCCTTCCTTATTTCGAT 8 115 0 TGAACGAATGCCCTCATTTTCTCCCCAACAT 8 239 1 TATCTCTTAACCCTTTCTCTCTTGGGTGGAG 8 275 1 GGGTATTGTACCCTCGCTGTCGGCGATTAAA 10 71 0 ***** ***** MAP Score: 8.71477 Motif 9 AAAAATCAGTTAAAATTTGGGGGTTATTGTG 0 161 0 TCTTTAATAAACCTTGGGCACTCTTTAG 4 7 1 AAATAAAAGGTCAAGGTGCGGGGCTTAAATA 4 124 1 TATATAATCATCAAAGCTTGGTCTTTGAAAA 4 164 1 AAAAGAGTTCTCAACCTTTGGTTTTCAATTT 4 194 1 CCTTTGGTTTTCAATTTTCGGGTTTAAAAAC 4 208 1 TGAATTTGTTTCAATTTTTGGAGGG 6 196 1 CCAAACCTCCTCAACCATTGGTTTAAAACGC 7 12 1 ATAAAAGTGTTCAACCTTTGGTTTAATATCT 7 126 1 CAACAAAATGTCAACATTTGGAGATCTTTGC 8 137 1 AAACTTATTGTAAACTATTGGTTGGATAATA 13 19 0 ***** ***** MAP Score: 8.15241 Motif 10 CCTCTTACTTGCTGGGGCTTTTATCATAATTT 0 116 1 AAGACAGGTAGAAGGGTTCATGATCATGGGGG 1 96 1 TCAACTAAGCGCTTGGGTTCCTCTCCAATTCT 1 178 0 GCCGTCCCAGGAAAGGTTCTTGAAATTAAAGG 2 31 0 AATCATCAAAGCTTGGTCTTTGAAAAAAAGAG 4 169 1 AGGTGACTTAGATGGGTTTTAGTGGAGCAGCT 5 109 1 TAGTGGAGCAGCTTGGGCCACGCTGCTAGTTC 5 128 1 AATAAAGGTTGCAAGGGCAAAGAGCCAAGCTG 6 70 1 ACCCAAGAGAGAAAGGGTTAAGAGATATTAAA 8 270 0 CAATACCCTCGCAAGGGCTCGGTCAACCCGCC 10 94 1 ACCCGCCCCCGCAAGGTTTCGGGGTCGATGAG 10 119 1 GCGGGCGGATGCACCGGCCCTGTAGGCTCGGC 10 165 0 ATTAATGACCGCTGGGTCTCTGTTGCCGGCCC 10 200 1 CTCAGGATTGGAATGGGCCCTTGTCAAGGTAG 12 102 1 *** ****** * MAP Score: 7.68553 Motif 11 GGTCAACCCGCCCCCGCAAGGTTTCGGGGTCG 10 114 1 AGCACAATAACCCCCAAATTTTAACTGATTTT 0 159 1 CATATAAATACCCCCTAAATCTTTATATACTA 5 44 1 CACAATTGTGCCCCAAAATGCTTTTAAATATT 7 172 1 CTCAAGAAGGTCCCCCCATGATCATGAACCCT 1 108 0 AGTACTCCTTCCCCGTAATTTTGTCCCAAAAC 5 197 0 CTCATTTTCTCCCCAACATTTTAATATCTCTT 8 251 1 ATAGTTTTCACCCCCTAATTTATGATATTTTT 5 10 1 ATGATAAAAGCCCCAGCAAGTAAGAGGGTTAG 0 111 0 GAGGATTGACTCCCGAAAAGCTGAGAAGCTCG 8 25 1 GATCATCATCCGCCCACAAGAATTTTAAGCTA 10 27 1 TTTGAACGAATGCCCTCATTTTCTCCCCAACA 8 237 1 GTCTTGCCGTCCCAGGAAAGGTTCTTGAAATT 2 36 0 TTTTCATCTTCCTCCTCAATGAAAGCTTCAAT 12 237 0 CGCGCAAAGATCTCCAAATGTTGACATTTTGT 8 139 0 ***** **** * MAP Score: 7.47833 Motif 12 TGCTTTAAATTGACAAAATTATGATAAAAGCCC 0 130 0 GGCCTATAACGGATAAAATTATTTTAATGAACA 2 274 1 CAAAAGTTATGGACAAAATTGGGAAAT 3 4 0 GCTTGGTCTTTGAAAAAAAGAGTTCTCAACCTT 4 179 1 TTAAAGTCCAGGATAAAAAAGCGTTTTTAAACC 4 228 0 ATGGGTTTTGGGACAAAATTACGGGGAAGGAGT 5 193 1 TAGAAAAGAGTGAGAAAATAAAGGTTGCAAGGG 6 54 1 TCTCTGAAGAAGAAAAAATAAGGAAGTAAAATA 7 43 0 AAAATGTTGGGGAGAAAATGAGGGCATTCGTTC 8 240 0 GAAAGAAGCCGGAAGAAATTAGTTTGCCAAATG 12 178 1 *** ***** * * MAP Score: 7.26588 Motif 13 TTTGAAGACAGGTAGAAGGGTTCATGATCATGGGGGGACCTT 1 92 1 GCTTAATCCCTTTATTAGGGTCATTGACGGTGTTAAAGGAGA 4 41 1 AAAGACGTTTTCAGCTTGGCTCTTTGCCCTTGCAACCTTTAT 6 71 0 GCGGGGGCGGGTTGACCGAGCCCTTGCGAGGGTATTGTACCC 10 89 0 GCCCCCGCAAGGTTTCGGGGTCGATGAGCGGGGTGTGCTCAC 10 123 1 CTCACGCCGAGCCTACAGGGCCGGTGCATCCGCCCGCGGGAT 10 160 1 CGGGATTAATGACCGCTGGGTCTCTGTTGCCGGCCCACAATA 10 196 1 AAAGCTCATAGATGAAGGAGTCACTGATCTAGAGGAATTGAG 12 53 1 CTCCTCAGGATTGGAATGGGCCCTTGTCAAGGTAGAACTTGC 12 99 1 * * ***** ** * MAP Score: 6.58602 Motif 14 GCCCCAGCAAGTAAGAGGGTTAGGAAGGCAAGTA 0 100 0 TTGAAGACAGGTAGAAGGGTTCATGATCATGGGG 1 93 1 TTGAAATCGAGAGGGAGGGAATATTTTAGAGCAG 1 212 1 TTCCCTTTTGGGATAAGGGGATAGGTTGAAAACT 2 127 0 TCCCCTTATCCCAAAAGGGAATGTTGTCGGAGCA 2 140 1 TCGTTATCGAGGATCAGGGATGAGCATCATGGTT 4 262 1 AAGAGCTTACCAAGGAGGGTAGAGC 5 259 1 AAAATAAAGGTTGCAAGGGCAAAGAGCCAAGCTG 6 68 1 GAGAAGCTCGCTATGAGGGATGATAATGGATAAA 8 47 1 CCACCCAAGAGAGAAAGGGTTAAGAGATATTAAA 8 270 0 AGCTATCATCCAACTAGGGCTGATATCCTGATAG 9 24 0 TAATCGCCGACAGCGAGGGTACAATACCCTCGCA 10 73 1 TACAATACCCTCGCAAGGGCTCGGTCAACCCGCC 10 92 1 ATCTATTAATTAAGAAGGGGATATTAAACTTTAT 10 235 0 CTAAATATAGGTTAGGGAAAATGAAATTTGAA 11 28 0 * * ***** * ** MAP Score: 4.51235 Motif 15 TTACTTGCCTTCCTAACCCTCTTACTTGCTGGGGCT 0 99 1 AGGATAAGCATGAAAAACGCTTCCTTTCCTTTTAGA 2 190 1 AAAAAAAGAGTTCTCAACCTTTGGTTTTCAATTTTC 4 191 1 ATTTTCGGGTTTAAAAACGCTTTTTTATCCTGGACT 4 221 1 ATAGTTTTCACCCCCTAATTTATGATATTT 5 4 1 TTTTTTCATATAAATACCCCCTAAATCTTTATATAC 5 38 1 CTTCCGGCCTTCTTTAACCTTTTTTTGCTAACCTAA 6 126 1 CTCCAAACCTCCTCAACCATTGGTTTAAAACGCTA 7 9 1 AAAATAAAAGTGTTCAACCTTTGGTTTAATATCTTT 7 123 1 TTTTAATATCTCTTAACCCTTTCTCTCTTGGGTGGA 8 269 1 * * **** ** ** MAP Score: 1.4879 Motif 16 AAAGCCCCAGCAAGTAAGAGGGTTAGGAAGG 0 106 0 AAATCAGTTAAAATTTGGGGGTTATTGTGCT 0 159 0 AATAAAAGGTCAAGGTGCGGGGCTTAAATAT 4 125 1 CTTTGGTTTTCAATTTTCGGGTTTAAAAACG 4 209 1 AAAATATCATAAATTAGGGGGTGAAAACTAT 5 10 0 TAGTATATAAAGATTTAGGGGGTATTTATAT 5 45 0 GTTTTGGGACAAAATTACGGGGAAGGAGTAC 5 197 1 CGAGCTTCTCAGCTTTTCGGGAGTCAATCCT 8 26 0 AGAGATATTAAAATGTTGGGGAGAAAATGAG 8 251 0 CCGCCCCCGCAAGGTTTCGGGGTCGATGAGC 10 121 1 GTTTCGGGGTCGATGAGCGGGGTGTGCTCAC 10 134 1 ****** **** MAP Score: 0.785094 Motif 17 AAGCACAATAACCCCCAAATTTTAACTGATT 0 158 1 TTTTCAACCTATCCCCTTATCCCAAAAGGGA 2 129 1 AACCGCTATAAACCCTGAATTCCAGGCCTAT 2 250 1 AGAAGGCTTAATCCCTTTATTAGGGTCATTG 4 36 1 ATAGTTTTCACCCCCTAATTTATGATATTT 5 9 1 TCATATAAATACCCCCTAAATCTTTATATAC 5 43 1 TATTTCGATAAACCTCTCCTTATCGAATGCT 8 93 0 ATTTGAACGAATGCCCTCATTTTCTCCCCAA 8 236 1 GACAAGTCAGATCACCTAATTTTAGAATTAC 9 95 1 AAAGTTTAATATCCCCTTCTTAATTAATAGA 10 237 1 ******* *** MAP Score: 0.653002 Motif 18 AATTTCTCTAATAGTCAGGGAGCACTTCCGAG 0 44 1 AGCAAGTAAGAGGGTTAGGAAGGCAAGTAAAC 0 97 0 AAAATCAGTTAAAATTTGGGGGTTATTGTGCT 0 159 0 AGAAGGGTTCATGATCATGGGGGGACCTTCTT 1 105 1 CACCAAATAAAAGGTCAAGGTGCGGGGCTTAA 4 120 1 AAAAATATCATAAATTAGGGGGTGAAAACTAT 5 10 0 TAGTATATAAAGATTTAGGGGGTATTTATATG 5 44 0 TGTAGTAATGATAGTTTATGGGTTTTGGGACA 5 176 1 GTTTTGGGACAAAATTACGGGGAAGGAGTACT 5 197 1 TTTTAAACCAATGGTTGAGGAGGTTTGGAG 7 8 0 TTTAATATCTTTGGTTTTGGTGATACACAATT 7 147 1 AATATTTAAAAGCATTTTGGGGCACAATTGTG 7 172 0 TTTTTTGTCTAGAGTTCAGGAGCATCTCTCCG 8 182 0 GAGATATTAAAATGTTGGGGAGAAAATGAGGG 8 249 0 CCGCCCCCGCAAGGTTTCGGGGTCGATGAGCG 10 121 1 CTAAATATAGGTTAGGGAAAATGAAATTT 11 31 0 ****** **** MAP Score: 0.245456