AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i RP/RP_operons001_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944236929 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 RP130 161 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 (rpsL) #1 RP131 33 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 (rpsG) #2 RP134 300 unknown (secE) #3 RP136 132 50S RIBOSOMAL PROTEIN L11 (rplK) #4 RP138 87 50S RIBOSOMAL PROTEIN L10 (rplJ) #5 RP139 188 50S RIBOSOMAL PROTEIN L7/L12 (rplL) #6 RP140 300 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE BETA CHAIN (rpoB) #7 RP141 156 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE BETA PRIME CHAIN (rpoC) #8 RP219 138 MITOCHONDRIAL PROTEASE (mpp) #9 RP263 300 unknown #10 RP275 173 GTP-BINDING PROTEIN LEPA (lepA) #11 RP345 112 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 (rpsD) #12 RP482 82 unknown #13 RP483 169 PUTRESCINE-ORNITHINE ANTIPORTER (potE) #14 RP501 215 TRNA PSEUDOURIDINE 55 SYNTHASE (truB) #15 RP503 21 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 (rpsO) #16 RP504 154 POLYRIBONUCLEOTIDE NUCLEOTIDYLTRANSFERASE (pnp) #17 RP552 213 TRANSLATION INITIATION FACTOR IF-2 (infB) #18 RP553 300 N UTILIZATION SUBSTANCE PROTEIN A (nusA) #19 RP554 300 unknown #20 RP628 211 RIBONUCLEASE PH (rph) #21 RP636 23 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 (rpsK) #22 RP637 57 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 (rpsM) #23 RP641 24 50S RIBOSOMAL PROTEIN L30 (rpmD) #24 RP649 60 50S RIBOSOMAL PROTEIN L14 (rplN) #25 RP655 24 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 (rpsS) #26 RP658 241 50S RIBOSOMAL PROTEIN L4 (rplD) #27 RP660 93 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 (rpsJ) #28 RP661 300 ELONGATION FACTOR TU (tuf) #29 RP814 300 TRANSLATION INITIATION FACTOR IF-1 (infA) #30 RP824 300 METHIONINE AMINOPEPTIDASE (map) #31 RP857 72 PSEUDOURIDYLATE SYNTHASE I (truA) #32 RP860 270 unknown Motif 1 TAAATTATAAAATTTTTTGAAAATGAATCACT 18 205 0 ACTAAAGTTAAATTTTTAGAAATTTTTATAGA 18 249 1 TTTAACTTTATATTTTTATAAAACTACATACT 19 171 0 TATAATTTTTCTAAATCATAGTCAT 30 3 1 CAGATTATTCTTTTTTTAAAAAATCTCATAAT 5 89 1 AAATCATAAGATTTTTTTGAAAAAGTAACATT 6 181 0 AGTTTTCACTTTTATTTAAAAATTTATTACTC 3 16 0 CTGTAAAATGATTATTTAGAAAATAAAAATAA 8 113 1 TATGATGAAAAATTATTATAAACTTGTAAAAA 9 269 1 TTTATTGATTTATTATTAAAAATATGATAGGA 2 63 1 TACAAATACCTATTATTAAAAAATAATAGGTA 27 17 1 CATGTTAAATAATTATTACAAATATATCTAAA 30 159 1 CTGAAATCAATATTATTGAAAATAGTATACTA 32 38 0 GCGATACCTATTTTATTACAAATTCTTTAAAA 9 19 1 TCAGTTTCAATTTTATTAAAAAATGTGTTAAA 4 47 1 ATTTATTATAAATTATAAGTAA 6 0 1 GGAAACACTAAATAATTAAAAAGGCTTATTTG 32 98 0 ATTATAAGTAATTTATTGGAAATAGGTATCTA 6 21 1 TGTCTTGTTGTATAATTTAAAAATTGTTATTG 7 34 1 ATTATAAAGCTATTTCTTTAAATATTTCTTTA 13 133 1 TTTCTTTAAATATTTCTTTAAATCAAATTTTG 13 145 1 AATGAATCACTATTTCTTCAAAAATCTTATAA 18 184 0 ATATTTTGTCTATTTCTTTAAATTTTTTAGAT 30 86 0 ATTTTTTATATTTAATTAAAAAATATTGCAT 11 9 0 GTAAGAGTTTATTAATTTAAAAGGAAAATAAG 3 99 1 TCCTTAACTTTTTAATTACAAAAAAATATATA 11 82 0 GATATACTCGTTTAATTTTAAAATTGGCTAAG 14 76 1 TTGATTTTAATTTAATTAGAAATGCTAATCTG 18 65 1 AAAATAATACATTAATTAGAAAATTTCTAAGA 18 133 0 GGTATAATCATTTAATTTGAAAAATTTGCTAC 20 73 1 CCAATACCTAATTAATTAAAAAT 25 1 0 TTTGTATTTTAATATCTGAAAAACATCTTGCT 27 49 1 TATATCTATATATATCTTAAAAAAGAACACTA 20 24 0 ACGCATTTCATTTTTCTGTAAAATGATTATTT 8 98 1 AAAAAGTAACATTATCTCAAAAATCGTATTAA 6 162 0 AAGAGCCTAATAATTTTTTAAATACTTCTTCA 18 105 0 TCATTAGTCCTTATTTTTAAAAGTTGTAAAAT 9 161 1 TAAACTTGTAAAAATTTCTAAAA 9 287 1 ATTTATTATTAAAATTTATAAACTGCACTTCT 2 23 0 TTTATTTTACAAATACCTATTAT 27 1 1 TCTTGTTAATTTTTACTATAAAAGCTCTTTAA 5 46 0 GCCATTGTAATAATATTACAAAGTAATTTATA 17 57 1 ATTTAAATTATTATATTTTAAACAGTAAAGCT 6 63 0 GAACAATAAAATATATTTAAAATGTGCAGAAC 18 21 1 ACTTAGTAAAAAATTCTGTAAATAAGAATTTT 8 14 0 TAAGCATTATATAAATTATAAACAGCAGGGTG 19 243 1 ACTACATACTATAAATTGCAAATACTCTATAA 19 149 0 TATATTGTGCAAAATCTATAAATTTTTACATA 29 129 1 CCAAGAGCTTTTTTTTACGAAATAAGGTGTTT 26 34 1 AAATAATCTCCAAATTTTACTAGT 22 43 0 GTTATTTTTTATAATCTGAAAAATGATATAGC 28 95 1 CATCTAAGAGATTATTATTAAATAAACTTACG 26 123 0 TACATTACATAAATACTATAAATATTTAGTGA 26 65 1 ACATACTTGCTTTTATAGGAAAAATAATTATA 0 11 1 GTGATGTTTATATAATAAAAAAGGTGGAAAAC 19 276 0 TTGTACTCCTAATAATATTAAAGAATCGGTAT 20 181 0 GTAACTAGAAAATAATATAAAAATCTTTGATG 22 13 0 GTTAGATCATTATTTCAATAAAATCTAGCAGT 2 245 1 GGTAACAAATAAATTTAGCAAAAAAAATGCAC 28 236 1 AGAACTTGTAAATTACAGTAAACTTAAATTAT 0 40 0 TAATAGAATATAAATTATGAAATGAGATAAAT 16 130 1 TTTAGGATTTAAAATTAACAAAGCGTCATGCA 26 164 1 ATAGTATACTAAAATTACTAAATCTATACAAT 32 17 0 TGGAGAAGTTATTTACATTAAAAGAAGCATTT 30 228 1 AAATTTTATAATTTACAGCAAATAATAACTAA 18 222 1 AAACTCTCTATTTTACAATAAACTTTGGCAGG 2 160 0 AAAAGAACACTAATATAAAAAATATT 20 4 0 TATTATACACTAAAATATCAAAATTGGAATAA 9 239 0 TTGGCTAGAATTATATATTAAAGATTTTCTAC 14 32 1 CTCAGTATCTAAAAATATTAAATGGACACAAT 12 34 0 ATACAAATGCTTAAATAACAAAATTTGTGCTA 4 16 0 ACTCCATAGCTTAAATACAAAATAACATTATG 7 94 0 ATTTTAATAATAAATCAATAAATTTTATTGAT 2 40 1 TTTTGCACTATAAATCACTAAATATTTATAGT 26 79 0 ******* *** MAP Score: 50.4691 Motif 2 ACTACTTCCTTTTATACATGAGAGTTAAAATAAACAATTTAC 24 26 0 ATGGAGAAGTTATTTACATTAAAAGAAGCATTTTGTATTATG 30 227 1 TTGTGGCAAGTGTCTAGATAACAATTAAAATACTCAAATTTG 32 170 1 ATAAAGTTTTTGTTTAGAAAACACGAATAAAATTAATTAATA 13 55 1 TTCAAAAAATTTTATAATTTACAGCAAATAATAACTAAAGTT 18 216 1 CTAATTAGATTATATAAGCAATATTTAACTTTATATTTTTAT 19 184 0 TTATAAAAACTCTCTATTTTACAATAAACTTTGGCAGGAGCG 2 156 0 GTAAAATGATTATTTAGAAAATAAAAATAAATT 8 115 1 TATTTAGTGATTTATAGTGCAAAATAATTAAATTATCGTAAG 26 87 1 CAGGGAAATATATCTATTTAAAAGATAGATTTATATGTTATT 28 59 1 TACAAAGTAATTTATAAACTAATCTTAGGATATTTGATAGAT 17 73 1 AAACCTAGGTTCTATATAAAATTTAAATTATTATATTTTAAA 6 73 0 AATCTCATAATTTGTAGTACAGAGGAATTTAATTAATGTTAA 5 110 1 TCTATATAATAAAGTGACTTATTCATTGTGTC 12 0 1 TTAGTGTTCTTTTTTAAGATATATATAGATATAATAAATTTT 20 23 1 AATAATAGAGTATATAGTGTAGACATAATTAATTTTCGGGGC 29 180 1 TATAATTTTTCTAAATCATAGTCATATAACTGCCAGAAA 30 7 1 ATGCAATATTTTTTAATTAAATATAAAAAATATTAGGTTAA 11 9 1 GATCTCATTATATATATTGCAATATGAGATTAAGTGTTTGAT 16 69 1 ATATTCCTAGTATATAAGAAATTCCAATGTTAGATCATTATT 2 217 1 GTAAGAGTGATTTATAGAGTATTTGCAATTTATAGTATGTAG 19 138 1 AATAGTCTTTTTTTTAAAGAATTTGTAATAAAATAGGTATCG 9 20 0 AAACAAAAACTTTATATTGAATAGTATTAATATCATTATTTT 13 28 0 ATCTAAAACTTCTATATAAATCATTTAATATTGCATGACGCT 26 185 0 TATTAAAAAATGTGTTAAAAAGAAGGAGCATTAAAAG 4 60 1 TTAGTGTATTTTTATTACGGATAAGCATTATATAAATTATAA 19 222 1 TTTATTTTACAAATACCTATTATTAAAAAATAAT 27 2 1 CTGAATGATATCTTTAATAGAATATAAATTATGAAATGAGAT 16 116 1 ATCTTGTTAATTTTTACTATAAAAGCTCTTTAATTATTAATG 5 37 0 ATGTGATGTTTATATAATAAAAAAGGTGGAAAACCCACCCTG 19 268 0 CAAGAGCTTTTTTTTACGAAATAAGGTGTTTACATTACATAA 26 35 1 ATAGCACTGTTATATATTTAATAGTGTCCAATGCGGGTGTAG 28 122 1 ATGAAAACTGTATGTAGCAATAAATTAGTAATTTT 32 245 1 TTATTTTTTCTCTCTATCTCTAACTAAATAAAT 1 1 0 TCCTATCATATTTTTAATAATAAATCAATAAAATTTATTGAT 2 53 0 CTTAATAAGCTCTGTAGTACTCATGCATTAATAATGCTCCTT 14 112 1 AGAAGTGCAGTTTATAAATTTTAATAATAAATCAATAAATTT 2 23 1 CTCTCTACAATTTTTAGGTTTAATACAAGTTATTAGTGCATT 28 261 0 TTTAAAGAAATATTTAAAGAAATAGCTTTATAATAGATGAAA 13 125 0 AAATAGAGAGTTTTTATAAAACTCCTTATATATAAGAGATAT 2 179 1 AGAAGCATTTTGTATTATGAAAATATATTTTTGTACTTGAGG 30 250 1 TTTCAGCAAGTATATTTGTAATAGTTAAATTTGTCAAATAAG 32 64 1 AATCATAAGATTTTTTTGAAAAAGTAACATTATCTCAAAAAT 6 170 0 AAATTATATTGTATAGATTTAGTAATTTTAGTATAC 32 4 1 TTTTTACAAGTTTATAATAATTTTTCATCATATTATACACTA 9 259 0 GTTTTTAGGTTCTATAAAAATTTCTAAAAATTTAACTTTAGT 18 249 0 TGAATCACTATTTCTTCAAAAATCTTATAATTTGTACTAAAA 18 172 0 CATTAGTCCTTATTTTTAAAAGTTGTAAAATTCTTAGTAATT 9 162 1 CATACTTGCTTTTATAGGAAAAATAATTATAATTTAAGTTTA 0 12 1 TTTTTATAGCACAAATTTTGTTATTTAAGCATTT 4 2 1 TTTGTCTTGTTGTATAATTTAAAAATTGTTATTGCAAGCCAA 7 32 1 TTACAAAATTTCTTTATCAAAATTTGTAATTTTCCTTCACAA 10 63 0 ATAATAGGTATTTGTATTTTAATATCTGAAAAACATCTTGCT 27 39 1 TCATCAAAGATTTTTATATTATTTTCTAGTTACTAGTAAAAT 22 12 1 TTATAAGTAATTTATTGGAAATAGGTATCTATCCCAACAAAA 6 22 1 CTAACCTATGTCTATTGGCTAGAATTATATATTAAAGATTTT 14 18 1 AGGTTTTAGATATATTTGTAATAATTATTTAACATGATGGGT 30 153 0 ATAAAGAAATTTTGTAAGAATGTATAAGATTTTGCATTTCTT 10 88 1 TACAAAAAAATATATACATTTCTTGTATCAAAGTCAATCATT 11 56 0 AATTAAACTGTGTCTATCAATTTTGCATTTTATATCATATAT 14 181 1 TTTAAAGCTATTTTTACTACTGTCGAAACTTTAAGTTTCTAT 29 14 0 ACTATTTTAATGTGTATTGTTCAACCTAAATTATCATTATAT 9 56 1 AATGTATATATTTTTTTGTAATTAAAAAGTTAAGGATATTAA 11 78 1 ATTTATATGTTATTTTTTATAATCTGAAAAATGATATAGCAC 28 87 1 AGCAAAATGTTTTATTGATCACAACATACATATTTAGTACGA 20 118 0 GGAAAATTCTTATTTACAGAATTTTTTACTAAGTTGCTTCGT 8 12 1 ATCTATTAAATTTGTAGCCCTCATTCTTTTTATAATCATGTA 19 16 1 ACTCACAATATATATTGTGCAAAATCTATAAATTTTTACATA 29 119 1 AATATAATTTGTACTCCTAATAATATTAAAGAATCGGTA 20 182 0 TTGTATATTTTGTCTATTTCTTTAAATTTTTTAGATGCAGTA 30 80 0 TATTTTTCCCTGTTCTAAATTTCAATTTTGTA 10 0 1 TATTTAAGCATTTGTATCAGTTTCAATTTTATTAAAAAATGT 4 31 1 * * ** * * * *** MAP Score: 47.4264 Motif 3 TTGGAAAATTCTTATTTACAGAATTTTT 8 0 1 TTTTTAAAAGTTGTAAAATTCTTAGTAATTTTACTTTA 9 174 1 CATTGCAATCTAAAAAAATTCTTATTTAAAGCTATTTT 29 42 0 TTTTAGGTTCTATAAAAATTTCTAAAAATTTAACTTTA 18 251 0 ATTGATTTATTATTAAAATTTATAAACTGCACTTCTAA 2 21 0 AATTTGTTTATGTAAAAATTTATAGATTTTGCACAATA 29 131 0 AAAATTTCTTTATCAAAATTTGTAATTTTCCTTCACAA 10 63 0 GAAGAAGTATTTAAAAAATTATTAGGCTCTTAGAAATT 18 106 1 TATTAGGCTCTTAGAAATTTTCTAATTAATGTATTATT 18 125 1 TCACTTTTATTTAAAAATTTATTACTCTAATTT 3 5 0 TCATTTAATTTGAAAAATTTGCTACGTTATTTTATTTT 20 80 1 ATTTACAAGTTCTTATAATTTGTATTTAGATATGATTT 0 59 1 ACCCATCATGTTAAATAATTATTACAAATATATCTAAA 30 153 1 TCTTCAAAAATCTTATAATTTGTACTAAAAAATACCTA 18 164 0 ATTTATCTCATTTCATAATTTATATTCTATTAAAGATA 16 124 0 AGTAACATTATCTCAAAAATCGTATTAATTTTCGCTTT 6 152 0 ATGCAATATTTTTTAATTAAATATAAAAA 11 1 1 TTTAATTAAATATAAAAAATATTAGGTTAAAAATCAAT 11 21 1 GTGATTCATTTTCAAAAAATTTTATAATTTACAGCAAA 18 206 1 TGTTACTTTTTCAAAAAAATCTTATGATTTACAGCTAC 6 183 1 TATAGCACTGTTATATATTTAATAGTGTCCAATGCGGG 28 121 1 AAACTAATCTTAGGATATTTGATAGATTGCCTCACAGT 17 88 1 ATAAATTACTTTGTAATATTATTACAATGGCTATTTTT 17 50 0 AGCTTTACTGTTTAAAATATAATAATTTAAATTTTATA 6 63 1 GGTGTTTACATTACATAAATACTATAAATATTTAGTGA 26 59 1 ATTTATTATAAATTATAAGTAATTTATTGGA 6 3 1 CGGATAAGCATTATATAAATTATAAACAGCAGGGTGGG 19 239 1 TTTGTATCAGTTTCAATTTTATTAAAAAATGTGTTAAA 4 41 1 AAATAATCTCCAAATTTTACTAGTAACTAGAAAATA 22 31 0 AAGAACTTTATTCCAATTTTGATATTTTAGTGTATAAT 9 232 1 TGTATAGATTTAGTAATTTTAGTATACTATTTTCAATA 32 19 1 ATAGTATTAATATCATTATTTTTATCTAAATGAAGTTG 13 12 0 TAATTTGTACTCCTAATAATATTAAAGAATCGGTATAC 20 179 0 TCTGCACATTTTAAATATATTTTATTGTTCTCAGCTTT 18 13 0 TACACTCCTATCATATTTTTAATAATAAATCAATAAAA 2 62 0 TGCTACGTTATTTTATTTTTCGTACTAAATATGTATGT 20 99 1 TAGATTTATATGTTATTTTTTATAATCTGAAAAATGAT 28 84 1 ATACAGTCAATCACAATTATTATATCTAGGGAAACACT 32 121 0 TTTGAACACTTTTGATTAATATTATATTAGGCAATATT 6 112 1 TACAGAGGAATTTAATTAATGTTAAAATACCTGATTTA 5 127 1 ATAGAGTATTTGCAATTTATAGTATGTAGTTTTATAAA 19 151 1 * ****** ** * MAP Score: 46.9717 Motif 4 GTTTTCCACCTTTTTTATTATATAAACATC 19 276 1 ATATAACTTGTATTTTATTATCCATGTGAT 10 143 0 ATAATTATGGTTATTTATTAAGAGTGCATA 6 229 1 ATGCGATACCTATTTTATTACAAATTCTTT 9 17 1 TTTCATCATGTAATTTATTATGAGATCCAT 32 221 0 TTATATGTTATTTTTTATAATCTGAAAAAT 28 89 1 TATTACAAAGTAATTTATAAACTAATCTTA 17 70 1 AAATTACTTATAATTTATAATAAAT 6 5 0 ATGTTTCCCCTTTTTTTTTATTGAGCGATT 5 167 0 CAAATACCTATTATTTTTTAATAATAGGTA 27 23 0 AAGAGCCTAATAATTTTTTAAATACTTCTT 18 107 0 AATTTATTGATTTATTATTAAAATTTATAA 2 34 0 ATTTTATTGATTTATTATTAAAAATATGAT 2 61 1 TAATTAGTGTATTTTTATTACGGATAAGCA 19 219 1 TATCAGTTTCAATTTTATTAAAAAATGTGT 4 45 1 TAAAAGCTCTTTAATTATTAATGAAAATCA 5 30 0 TTTTATTTAAAAATTTATTACTCTAATTT 3 9 0 CGTTGAAAAAAAATTTATTATATCTATATA 20 44 0 ATATAAAATTTAAATTATTATATTTTAAAC 6 72 0 TAAAATAGTCTTTTTTTTAAAGAATTTGTA 9 35 0 TCATTAGTCCTTATTTTTAAAAGTTGTAAA 9 161 1 ATGCAATATTTTTTAATTAAATATAA 11 6 1 TTAACTTTATATTTTTATAAAACTACATAC 19 172 0 GAAAATAAGGATATTTATAA 3 122 1 ATTTTCAAAAAATTTTATAATTTACAGCAA 18 213 1 CTAGCAGTAGAATTTTATAAGTAAATTACC 2 269 1 TTTATTATTAAAATTTATAAACTGCACTTC 2 24 0 AAGCATTATATAAATTATAAACAGCAGGGT 19 244 1 ACAGTAAACTTAAATTATAATTATTTTTCC 0 28 0 AATTTATTTTTATTTTCTAAAT 8 126 0 TTTTAACCTAATATTTTTTATATTTAATTA 11 23 0 AAAAATCTTGTTAATTTTTACTATAAAAGC 5 53 0 AATATTTTTTATATTAGTGTT 20 1 1 TTTAAATAAGAATTTTTTTAGATTGCAATG 29 50 1 AAGGGTGAAGTATATTTTTACCCTTTAATC 0 107 1 GCAAAATCTATAAATTTTTACATAAACAAA 29 137 1 TAACTAAAGTTAAATTTTTAGAAATTTTTA 18 247 1 CTATTTCTTTAAATTTTTTAGATGCAGTAG 30 79 0 CATCTAAGAGATTATTATTAAATAAACTTA 26 125 0 ATTACTTTGTAATATTATTACAATGGCTAT 17 54 0 CCGATTCTTTAATATTATTAGGAGTACAAA 20 184 1 ATCATGTTAAATAATTATTACAAATATATC 30 157 1 AATATGATGAAAAATTATTATAAACTTGTA 9 267 1 ATGTAAATTGTTTATTTTAACTCTCATGTA 24 24 1 ATATACTCGTTTAATTTTAAAATTGGCTAA 14 77 1 TGACGCTTTGTTAATTTTAAATCCTAAATC 26 162 0 TATTAATATCATTATTTTTATCTAAATGAA 13 16 0 GTGTCCATTTAATATTTTTAGATACTGAGA 12 37 1 TATATTAGGCAATATTTTAAAGCGAAAATT 6 134 1 ********** MAP Score: 37.0239 Motif 5 GAGATTTTTTAAAAAAAGAATAATCTGCATA 5 85 0 AAATTCTTTAAAAAAAAGACTATTTTAATGT 9 38 1 TTTTGTTTAGAAAACACGAATAAAATTAATT 13 62 1 AGTAGATAGAAAAACAGGAATACAAAGGTTT 17 187 1 TAAAATGTGCAGAACAAGAAGTATCAATTGA 18 38 1 GTACATGATTATAAAAAGAATGAGGGCTACA 19 28 0 ACTCTCATGTATAAAAGGAAGTAGTTT 24 43 1 ATATACAATTAAAACAGGAAGAGCTAATAAC 30 114 1 ATCAAATAATACAACAGGACTTCTCAATAAA 30 197 1 ATATTGTATCATAGCAAGAATTCTGAGGTCC 31 50 1 * ********* MAP Score: 1.47818 Motif 6 GTTGCGGGTTCGATTCCTGTCGCTCCTGCCAAAGTTTATTG 2 136 1 TTCGAAGGTTCGAATCCTTCTCCCTCCACCACTTAATGGTT 28 18 1 TGTGTGGGTTCGATTCCCATCACCCGCTCCAGAGATAGTGG 28 197 1 TTCGAACTCCCGACCCTCTGGTCCCAAACCAGATGCGCTAC 29 235 0 GTCGGGAGTTCGAATCTCTCCGCCCCGACCATACAAACAAA 29 262 1 *** * *** *** MAP Score: 1.3676