AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i RP/RP_operons008_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944237561 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 RP071 196 TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR PROTEIN CZCR (czcR) #1 RP170 300 ACRIFLAVIN RESISTANCE PROTEIN D (acrD) #2 RP229 205 HISTIDINE KINASE SENSOR PROTEIN (barA) #3 RP307 130 CATIONIC AMINO ACID TRANSPORTER-1 (atrc1) #4 RP427 121 PETR PROTEIN (ompR) #5 RP465 300 ALKALINE PHOSPHATASE SYNTHESIS SENSOR PROTEIN PHOR (phoR) #6 RP483 169 PUTRESCINE-ORNITHINE ANTIPORTER (potE) #7 RP562 300 NITROGEN ASSIMILATION REGULATORY PROTEIN NTRX (ntrX) #8 RP614 227 NITROGEN REGULATION PROTEIN NTRY (ntrY) Motif 1 TTCTCCATAAAATTCAATTTTGATAATAATTTAGTTAATAAT 0 159 0 GTTTTCTAAGAGCTTTATTTATATCATTTTTTGGATCATTGT 8 125 1 CTTTATATTGAATAGTATTAATATCATTATTTTTATCTAAAT 6 19 0 TTAGTTAATAATTATTAACTAAATTATAATTTTTTATCTAGT 0 129 0 ATATAATTAAAAGATGAAAAACATCATACTTTATATTCAAAC 1 203 1 CGGGTTCAAAATTATTAATATCATAGTTGTTTTTGGCTTTCG 4 57 0 TATATAATATAGATTAAATATTATATTAATTTTGCTTAAGCA 5 47 1 TCTTTTAATTATATATAACTATATATTGTTTTGTAATTAAAC 1 175 0 GTGACAAAAATGTTATAAAAAAATGTTGCTTTCTTTTACATT 7 218 1 AATTACCTAATTATCCAATAATATTGTTGTTTTTCAATTAAA 0 12 1 AACCAAAAAGATTTTAATACTAAATTAAAGCTAGAA 8 4 1 TATAAAATTAAATGTCATTAACATCCTGAATTTTGTATAAGA 5 152 0 TGCAGTTTATAGTGTTATAAATATAATGAATTATGTGGATAC 7 79 0 CTTTAGTGTTATATAGATTATATTGGTAATTTTCTATAGTTG 8 56 1 TAAGTTATATTTATATTAGATTAGAAACTCAT 4 0 1 ACTAATTCTGTAAAAAATATAAATGTTTAATTACAAAACAAT 1 151 1 GGTAGAATTTAATAGTAAAAATTTTATAATTTGATTAAATAT 0 54 1 TTGGATTTAATTTTTAAACTTGATTCTAAATTAATGCGAATA 1 268 0 TAATCTATATTATATAAAATATATTATGAATTTCTTTAGCAT 5 21 0 AAACTACTATTAATTAATTTTATTCGTGTTTTCTAAACAAAA 6 62 0 AAATTAGAGTTGTAATAATGAATTTTTGGTTTTAATCACTTG 1 85 0 TGAGAAGTCTTATATAAATTTATTAGTTGTTTTTATAAATCT 7 148 0 CTTCTTTAACTCGATAAAAATATTGTTTGTTTCTTTTTTTCT 5 226 1 TATATATGTTATTATATTAATTTATAGAAAAAT 1 1 1 TTTCAAGCTTATTCTAATTGTATTGCTTTATTAGGAATTTTA 3 52 1 AAATAGCTTTATAATAGATGAAATAATACTTTTTAGCAATAG 6 106 0 TGAGATAAGTCGAGATAATAAATTCTCGGCTTTG 2 2 1 TGCTTAAGCAATATAAAAAGGAATAGTAGTTTATAGCTTTTT 5 79 1 AACACTAAAATTATCAGTATTCTTATTATTTTATGTCACAAA 7 10 1 * ** * ** * *** MAP Score: 34.6653 Motif 2 ACGAAAGCCAAAAACAACTATGATATTAATAATTTTGAAC 4 56 1 TATATAATATAGATTAAATATTATATTAATTTTGCTTAAG 5 47 1 CTTCATTTAGATAAAAATAATGATATTAATACTATTCAAT 6 15 1 TACAGTATCCACATAATTCATTATATTTATAACACTATAA 7 75 1 TTTTGTTTAGAAAACACGAATAAAATTAATTAATAGTAGT 6 62 1 ACATAAAATAATAAGAATACTGATAATTTTAGTGTT 7 6 0 ATGTTTAATTACAAAACAATATATAGTTATATATAATTAA 1 173 1 CTTTATATTCAAACTAAATAACATATTAATAATGCGCTAT 1 231 1 TTCTCCATAAAATTCAATTTTGATAATAATTTAGTTAATA 0 161 0 ATAAAAAATTATAATTTAGTTAATAATTATTAACTAAATT 0 134 1 TATATATGTTATTATATTAATTTATAGAAAA 1 1 1 TAGATTTATAAAAACAACTAATAAATTTATATAAGACTTC 7 147 1 AGTTATATTTATATTAGATTAGAAACTCATCCCGTGGTTT 4 12 1 ATTGTTTTGTAATTAAACATTTATATTTTTTACAGAATTA 1 153 0 TATAAACTGCAAATCAAATTTAAAAATTAAAATCTTATAG 7 110 1 TAGCTTTATAATAGATGAAATAATACTTTTTAGCAATAGT 6 105 0 AAGAATATTTAATCAAATTATAAAATTTTTACTATTAAAT 0 60 0 CTGACAATAAATTAGAGTTGTAATAATGAATTTTTGGTTT 1 95 0 TGAGATAAGTCGAGATAATAAATTCTCGGCTT 2 2 1 ATTGTCAGTAACAAATTATCAAAAACTAATTCTGTAAAAA 1 127 1 AATTTGATTTAAAGAAATATTTAAAGAAATAGCTTTATAA 6 134 0 CGGCTTTGATACATTATAGATTGTAGTTATAAGTTATGGG 2 36 1 ATTTCCGAATAAAAGAATTGTTGTAATTATAAAGTATAAT 2 101 0 AAAATTACCTAATTATCCAATAATATTGTTGTTTTTCAAT 0 10 1 CTAGTGCTTTATACGTTCATTAATAATATAAGTAAAGAAT 0 94 0 ATTGTGACAAAAATGTTATAAAAAAATGTTGCTTTCTTTT 7 215 1 GAAGCATTTCATACCTAACTTAATACAAATGAATGTTATA 5 190 0 AGTTATATATAATTAAAAGATGAAAAACATCATACTTTAT 1 197 1 TTTTAATACTAAATTAAAGCTAGAAATATTTCTAGCTTTA 8 21 1 ATTAATTTAGAATCAAGTTTAAAAATTAAATCCAA 1 275 1 GACAATTTACCTTAAAAATATTAAAAACCTA 7 279 0 ACAACTATAGAAAATTACCAATATAATCTATATAACACTA 8 59 0 TGATATTAATACTATTCAATATAAAGTTTTTGTTTAGAAA 6 35 1 CACTCTACATAATTATGGACAAAAAATATTGTGACAAAAA 7 188 1 AAAGAAATTCATAATATATTTTATATAATATAGATTAAAT 5 26 1 ATGAACGTATAAAGCACTAGATAAAAAATTATAATTTAGT 0 114 1 AATAATGCCTACTTTATCATTCATACAGAAACAATGATCC 8 157 0 AGAGTTAAATTATAGAAATTTTCTATGCAAAT 5 278 0 * * * * *** * ** MAP Score: 32.8463 Motif 3 CTTCATTTAGATAAAAATAATGATATTAATA 6 15 1 GAAAACACGAATAAAATTAATTAATAGTAGT 6 71 1 AATGAATGTTATAAAATTAAATGTCATTAAC 5 172 0 CTTTAACTCGATAAAAATATTGTTTGTTTCT 5 229 1 ATATAGTTATATATAATTAAAAGATGAAAAA 1 193 1 CCAAAAAATGATATAAATAAAGCTCTTAGAA 8 128 0 TTCATTAATAATATAAGTAAAGAATATTTAA 0 88 0 ACTAAATAACATATTAATAATGCGCTATTCG 1 243 1 AACAACTATGATATTAATAATTTTGAACCCG 4 68 1 TTCTAATCTAATATAAATATAACTTA 4 5 0 TAATCAAATTATAAAATTTTTACTATTAAAT 0 60 0 CAAAATTAATATAATATTTAATCTATATTAT 5 50 0 AATAGATGAAATAATACTTTTTAGCAATAGT 6 105 0 GAGAAGTCTTATATAAATTTATTAGTTGTTT 7 158 0 ACAATTTACCTTAAAAATATTAAAAACCTAA 7 278 0 TTCAATTTTGATAATAATTTAGTTAATAATT 0 158 0 CAAAAAGATTTTAATACTAAATTAAAGCTAG 8 13 1 CAAATCAAATTTAAAAATTAAAATCTTATAG 7 119 1 AGAATCAAGTTTAAAAATTAAATCCAA 1 283 1 ATATGTTATTATATTAATTTATAGAAAAATG 1 13 1 AATAATGATATTAATACTATTCAATATAAAG 6 30 1 GTTTATAGTGTTATAAATATAATGAATTATG 7 86 0 TAGATTGTAGTTATAAGTTATGGGAAAACTG 2 52 1 TATAATTTAGTTAATAATTATTAACTAAATT 0 143 1 TTTTTTCTCGTTATTATTATTTGCATAGAAA 5 260 1 TATAATCTATATAACACTAAAGCTAGAAATA 8 47 0 ATTAACTAAATTATAATTTTTTATCTAGTGC 0 127 0 GGGAAAACTGATATATGTAATTTCTTGAATT 2 73 1 ATCAGTATTCTTATTATTTTATGTCACAAAC 7 22 1 AGTTGTTTTTATAAATCTATAAGATTTTAAT 7 135 0 ACATTTTTTTATAACATTTTTGTCACAATAT 7 213 0 CGCAGTTATGATATCAGTTAAGCTAAAAATG 2 168 1 GAAATTCATAATATATTTTATATAATATAGA 5 29 1 TATATATGTTATTATATTAATT 1 1 1 TGTAAAAAATATAAATGTTTAATTACAAAAC 1 159 1 AACACTAAAATTATCAGTATTCTTATTATTT 7 10 1 ATTTCTTTAAATATTTCTTTAAATCAAATTT 6 144 1 TTAATTATATATAACTATATATTGTTTTGTA 1 182 0 ****** **** MAP Score: 28.0384 Motif 4 TTTTTCTATAAATTAATATAATAACATATATA 1 2 0 AACTATAGAAAATTACCAATATAATCTATATAACACTAAA 8 57 0 TTTAAATGCTAAAGAAATTCATAATATATTTTATATAATA 5 16 1 ATAGTAGTTTAACTATTGCTAAAAAGTATTATTTCATCTA 6 94 1 CACTCTACATAATTATGGACAAAAAATATTGTGACAAAAA 7 188 1 AACGAGAAAAAAAGAAACAAACAATATTTTTATCGAGTTA 5 232 0 AATTTTGCTTAAGCAATATAAAAAGGAATAGTAGTTTATA 5 74 1 TTTGTTTAGAAAACACGAATAAAATTAATTAATAGTAGTT 6 63 1 ATAAACTGCAAATCAAATTTAAAAATTAAAATCTTATAGA 7 111 1 AGATTTATAAAAACAACTAATAAATTTATATAAGACTTCT 7 148 1 ATTAATTTAGAATCAAGTTTAAAAATTAAATCCAA 1 275 1 AATTTACCTTAAAAATATTAAAAACCTAAATGTATAGGTT 7 267 0 GTTGTTTTTCAATTAAAGGTAGAATTTAATAGTAAAAATT 0 37 1 TCTATAATGTATCAAAGCCGAGAATTTATTATCTCGACTT 2 16 0 TTTAATACTAAATTAAAGCTAGAAATATTTCTAGCTTTAG 8 22 1 ACTTAATACAAATGAATGTTATAAAATTAAATGTCATTAA 5 173 0 AAGAATATTTAATCAAATTATAAAATTTTTACTATTAAAT 0 60 0 TTTTCCCATAACTTATAACTACAATCTATAATGTATCAAA 2 40 0 ATTTGATTTAAAGAAATATTTAAAGAAATAGCTTTATAAT 6 133 0 TTTTGGTTTTAATCACTTGATTAAGATAATGTGATCAGTA 1 64 0 TGAACGTATAAAGCACTAGATAAAAAATTATAATTTAGTT 0 115 1 CAATTTTGATAATAATTTAGTTAATAATTATTAACTAAAT 0 147 0 AGCCAAAAACAACTATGATATTAATAATTTTGAACCCGTG 4 61 1 ATACAGAAACAATGATCCAAAAAATGATATAAATAAAGCT 8 135 0 CAATATTTTTATCGAGTTAAAGAAGCATTTCATACCTAAC 5 211 0 ATTGTCAGTAACAAATTATCAAAAACTAATTCTGTAAAAA 1 127 1 ** * * ** **** MAP Score: 28.0015 Motif 5 TATAATATAGATTAAATATTATATTAATTTTGC 5 49 1 TAATCAAGTGATTAAAACCAAAAATTCATTATT 1 81 1 AGAATATTTAATCAAATTATAAAATTTTTACTA 0 66 0 AAAGCACTAGATAAAAAATTATAATTTAGTTAA 0 124 1 TGTTAATGACATTTAATTTTATAACATTCATTT 5 171 1 GCAAATCAAATTTAAAAATTAAAATCTTATAGA 7 118 1 TAGAATCAAGTTTAAAAATTAAATCCAA 1 282 1 GATCTTTTTAAATGCTAAAGAAATTCATA 5 6 1 CTTAAGCAATATAAAAAGGAATAGTAGTTTATA 5 81 1 TTAAAGAAATATTTAAAGAAATAGCTTTATAAT 6 133 0 TAAAGGTAGAATTTAATAGTAAAAATTTTATAA 0 50 1 ATACTTTATATTCAAACTAAATAACATATTAAT 1 228 1 TCGAGCGCTTTTAAAAAGCTATAAACTACTATT 5 100 0 GTTTTTCATCTTTTAATTATATATAACTATATA 1 192 0 AATTTCTTGAATTATACTTTATAATTACAACAA 2 91 1 CTTAAAAATATTAAAAACCTAAATGTATAGGTT 7 267 0 ACCAAAAAGATTTTAATACTAAATTAAAGCTAG 8 11 1 AATATAATCTATATAACACTAAAGCTAGAAATA 8 47 0 TTTAATCTATATTATATAAAATATATTATGAAT 5 32 0 GATGAAAAACATCATACTTTATATTCAAACTAA 1 215 1 CGGGATGAGTTTCTAATCTAATATAAATATAAC 4 13 0 TTCATTATATTTATAACACTATAAACTGCAAAT 7 91 1 TTAGTTGTTTTTATAAATCTATAAGATTTTAAT 7 135 0 TTGATTCTAAATTAATGCGAATAGCGCATTATT 1 258 0 ATAAATTAATATAATAACATATATA 1 2 0 TTTATTAGGAATTTTAGCATATACGAGAATGGA 3 78 1 TATTCGTGTTTTCTAAACAAAAACTTTATATTG 6 51 0 AAACAAAAACTTTATATTGAATAGTATTAATAT 6 37 0 TAACAGTTTCTTATAACAGAAAAAACTCATTGG 8 197 0 AAAACAACTAATAAATTTATATAAGACTTCTCA 7 157 1 AAATTCTACCTTTAATTGAAAAACAACAATATT 0 31 0 AATATAAATGTTTAATTACAAAACAATATATAG 1 166 1 GTTTTTAATATTTTTAAGGTAAATTGTC 7 282 1 TATTATATTAATTTATAGAAAAATGTAGCCATT 1 19 1 CACTTACACTATCTTATACAAAATTCAGGATGT 5 141 1 TTAGTTAATAATTATTAACTAAATTATTATCAA 0 149 1 TATAGAAATTTTCTATGCAAATAATAATAACGA 5 267 0 CAGTATCCACATAATTCATTATATTTATAACAC 7 77 1 TAATATCATTATTTTTATCTAAATGAAGTTGGA 6 10 0 GCTTTATACGTTCATTAATAATATAAGTAAAGA 0 96 0 ****** **** MAP Score: 26.9316 Motif 6 GACAATTTACCTTAAAAATATTAAAAACCTAAA 7 277 0 TTATATAATATAGATTAAATATTATATTAATTTTGC 5 46 1 TGTAATTTCTTGAATTATACTTTATAATTACAACAA 2 88 1 TCGGCTTTGATACATTATAGATTGTAGTTATAAGTT 2 35 1 ATTTTAATACTAAATTAAAGCTAGAAATATTTCTAG 8 20 1 TTGTTGTTTTTCAATTAAAGGTAGAATTTAATAGTA 0 35 1 ATTTTATAATTTGATTAAATATTCTTTACTTATATT 0 74 1 ATCCACATAATTCATTATATTTATAACACTATAAAC 7 81 1 AATTATTAACTAAATTATAATTTTTTATCTAGTGCT 0 126 0 AAAGGAATAGTAGTTTATAGCTTTTTAAAAGCGCTC 5 95 1 TAAGTTATATTTATATTAGATTAGAA 4 0 1 TAATCTATATTATATAAAATATATTATGAATTTCTT 5 27 0 AGTTTAACTATTGCTAAAAAGTATTATTTCATCTAT 6 99 1 GATAATAATTTAGTTAATAATTATTAACTAAATTAT 0 144 0 GTGAGAAGTCTTATATAAATTTATTAGTTGTTTTTA 7 155 0 TTTTATCTAGTGCTTTATACGTTCATTAATAATATA 0 104 0 TTATTTCATCTATTATAAAGCTATTTCTTTAAATAT 6 122 1 AAAAACTAATTCTGTAAAAAATATAAATGTTTAATT 1 147 1 CTAGCTTTAGTGTTATATAGATTATATTGGTAATTT 8 52 1 GAATAGCGCATTATTAATATGTTATTTAGTTTGAAT 1 237 0 TATTAGTTGTTTTTATAAATCTATAAGATTTTAATT 7 134 0 CAATATATAGTTATATATAATTAAAAGATGAAAAAC 1 189 1 TACAAATGAATGTTATAAAATTAAATGTCATTAACA 5 171 0 CTTTAAATATTTCTTTAAATCAAATTTTGAT 6 148 1 TCACTTACACTATCTTATACAAAATTCAGGATGTTA 5 140 1 AGAGTTAAATTATAGAAATTTTCTATGCAAA 5 279 0 AAAAATATTGTGACAAAAATGTTATAAAAAAATGTT 7 209 1 TAGAATTTAATAGTAAAAATTTTATAATTTGATTAA 0 56 1 TCTAAGAGCTTTATTTATATCATTTTTTGGATCATT 8 129 1 GTTATTATATTAATTTATAGAAAAATGTAGCCATTT 1 17 1 CTTAATCAAGTGATTAAAACCAAAAATTCATTATTA 1 79 1 AGTGTGTTTGTGACATAAAATAATAAGAATACTGAT 7 22 0 * ***** ** ** MAP Score: 25.4176 Motif 7 TAATTATCCAATAATATTGTTGTTTTTCAATTAAAGGTAGAA 0 19 1 AATTAAAGGTAGAATTTAATAGTAAAAATTTTATAATTTGAT 0 47 1 TAATGAACGTATAAAGCACTAGATAAAAAATTATAATTTAGT 0 112 1 ATAAAAAATTATAATTTAGTTAATAATTATTAACTAAATTAT 0 134 1 TTTTCTCCATAAAATTCAATTTTGATAATAATTTAGTTAATA 0 161 0 ACATTTTTCTATAAATTAATATAATAACATATATA 1 3 0 TAGAGTTGTAATAATGAATTTTTGGTTTTAATCACTTGATTA 1 81 0 ACAAATTATCAAAAACTAATTCTGTAAAAAATATAAATGTTT 1 137 1 ATGTTTAATTACAAAACAATATATAGTTATATATAATTAAAA 1 173 1 GCATTAATTTAGAATCAAGTTTAAAAATTAAATCCAA 1 273 1 ATCAAAGCCGAGAATTTATTATCTCGACTTATCTCA 2 4 0 TGATTTCCGAATAAAAGAATTGTTGTAATTATAAAGTATAAT 2 101 0 AAAATTCCTAATAAAGCAATACAATTAGAATAAGCTTGAAAT 3 51 0 ACCACGGGTTCAAAATTATTAATATCATAGTTGTTTTTGGCT 4 61 0 TTTTTAAATGCTAAAGAAATTCATAATATATTTTATATAATA 5 14 1 TTAAAAAGCTATAAACTACTATTCCTTTTTATATTGCTTAAG 5 81 0 CTAACTTAATACAAATGAATGTTATAAAATTAAATGTCATTA 5 174 0 CTTTAACTCGATAAAAATATTGTTTGTTTCTTTTTTTCTCGT 5 229 1 AACTTCATTTAGATAAAAATAATGATATTAATACTATTCAAT 6 13 1 AAACACGAATAAAATTAATTAATAGTAGTTTAACTATTGCTA 6 73 1 TTCATCTATTATAAAGCTATTTCTTTAAATATTTCTTTAAAT 6 126 1 TGTTTGTGACATAAAATAATAAGAATACTGATAATTTTAGTG 7 12 0 TTTAAAAATTAAAATCTTATAGATTTATAAAAACAACTAATA 7 128 1 ATAAAAACAACTAATAAATTTATATAAGACTTCTCACTCTAC 7 154 1 CATTTTTGTCACAATATTTTTTGTCCATAATTATGTAGAGTG 7 188 0 CACTAAAGCTAGAAATATTTCTAGCTTTAATTTAGTATTAAA 8 22 0 AATGATATAAATAAAGCTCTTAGAAAACTTTAGGGGATGACA 8 111 0 TTCTTATAACAGAAAAAACTCATTGGAATAATGCCTACTTTA 8 181 0 * *** * * * * ** MAP Score: 17.2532 Motif 8 TATTGTTGTTTTTCAATTAAAGGTAGAATTTAATAGTAAAAATTT 0 33 1 AGTAAAGAATATTTAATCAAATTATAAAATTTTTACTATTAAATT 0 59 0 TTTACTTATATTATTAATGAACGTATAAAGCACTAGATAAAAAAT 0 98 1 TAGTTAATAATTATTAACTAAATTATAATTTTTTATCTAGTGCTT 0 125 0 ATTTTTCTCCATAAAATTCAATTTTGATAATAATTTAGTTAATAA 0 160 0 ATCTTAATCAAGTGATTAAAACCAAAAATTCATTATTACAACTCT 1 77 1 TAACAAATTATCAAAAACTAATTCTGTAAAAAATATAAATGTTTA 1 135 1 TTAATTACAAAACAATATATAGTTATATATAATTAAAAGATGAAA 1 177 1 CATACTTTATATTCAAACTAAATAACATATTAATAATGCGCTATT 1 227 1 TAATTTTTAAACTTGATTCTAAATTAATGCGAATAGCGCATTATT 1 258 0 TGTAGTTATAAGTTATGGGAAAACTGATATATGTAATTTCTTGAA 2 57 1 CGCAGTTATGATATCAGTTAAGCTAAAAATGAATACTAGGGCTCG 2 168 1 CGGGATGAGTTTCTAATCTAATATAAATATAACTTA 4 1 0 TCCCGTGGTTTGACCACGAAAGCCAAAAACAACTATGATATTAAT 4 41 1 TCTTTTTAAATGCTAAAGAAATTCATAATATATTTTATATAATAT 5 12 1 ATATTAATTTTGCTTAAGCAATATAAAAAGGAATAGTAGTTTATA 5 69 1 TAGGTATGAAATGCTTCTTTAACTCGATAAAAATATTGTTTGTTT 5 213 1 TTTCTATGCAAATAATAATAACGAGAAAAAAAGAAACAAACAATA 5 246 0 TATTATTATTTGCATAGAAAATTTCTATAATTTAACTCT 5 271 1 CCAACTTCATTTAGATAAAAATAATGATATTAATACTATTCAATA 6 11 1 ATAAAGTTTTTGTTTAGAAAACACGAATAAAATTAATTAATAGTA 6 55 1 TCAAAATTTGATTTAAAGAAATATTTAAAGAAATAGCTTTATAAT 6 133 0 TGTGACATAAAATAATAAGAATACTGATAATTTTAGTGTT 7 5 0 TTATATTTATAACACTATAAACTGCAAATCAAATTTAAAAATTAA 7 95 1 AAATCAAATTTAAAAATTAAAATCTTATAGATTTATAAAAACAAC 7 120 1 CATAATTATGTAGAGTGAGAAGTCTTATATAAATTTATTAGTTGT 7 160 0 TAATGCTGAATGTAAAAGAAAGCAACATTTTTTTATAACATTTTT 7 223 0 ATTTACCTTAAAAATATTAAAAACCTAAATGTATAGGTTAATGCT 7 261 0 TTACCAATATAATCTATATAACACTAAAGCTAGAAATATTTCTAG 8 40 0 ATACAGAAACAATGATCCAAAAAATGATATAAATAAAGCTCTTAG 8 130 0 ACAGTTTCTTATAACAGAAAAAACTCATTGGAATAATGCCTACTT 8 183 0 * * ** *** * ** MAP Score: 13.6229 Motif 9 AAAATTACCTAATTATCCAATAATATTGTTGTTT 0 3 1 GGTAGAATTTAATAGTAAAAATTTTATAATTTGATTAAATA 0 54 1 AAAGCACTAGATAAAAAATTATAATTTAGTTAATAATTATT 0 124 1 TTTCTCCATAAAATTCAATTTTGATAATAATTTAGTTAATA 0 161 0 ACATTTTTCTATAAATTAATATAATAACATATATA 1 4 0 GTTACTGACAATAAATTAGAGTTGTAATAATGAATTTTTGG 1 98 0 CAAATTATCAAAAACTAATTCTGTAAAAAATATAAATGTTT 1 138 1 TAATTACAAAACAATATATAGTTATATATAATTAAAAGATG 1 178 1 TAGTTTGAATATAAAGTATGATGTTTTTCATCTTTTAATTA 1 206 0 TTATATTCAAACTAAATAACATATTAATAATGCGCTATTCG 1 233 1 TGTTGTAATTATAAAGTATAATTCAAGAAATTACATATATC 2 82 0 TATACTTTATAATTACAACAATTCTTTTATTCGGAAATCAC 2 103 1 CCACGGGATGAGTTTCTAATCTAATATAAATATAACTTA 4 8 0 CACGAAAGCCAAAAACAACTATGATATTAATAATTTTGAAC 4 55 1 TATATTATATAAAATATATTATGAATTTCTTTAGCATTTAA 5 17 0 TATATTTTATATAATATAGATTAAATATTATATTAATTTTG 5 40 1 TGAATGTTATAAAATTAAATGTCATTAACATCCTGAATTTT 5 160 0 AATAATAACGAGAAAAAAAGAAACAAACAATATTTTTATCG 5 237 0 ACTTCATTTAGATAAAAATAATGATATTAATACTATTCAAT 6 14 1 ACTTTTTAGCAATAGTTAAACTACTATTAATTAATTTTATT 6 80 0 AACTATTGCTAAAAAGTATTATTTCATCTATTATAAAGCTA 6 104 1 GATTTAAAGAAATATTTAAAGAAATAGCTTTATAATAGATG 6 128 0 TTTGATTTGCAGTTTATAGTGTTATAAATATAATGAATTAT 7 87 0 AATCAAATTTAAAAATTAAAATCTTATAGATTTATAAAAAC 7 121 1 AATTATGTAGAGTGAGAAGTCTTATATAAATTTATTAGTTG 7 161 0 AATTATGGACAAAAAATATTGTGACAAAAATGTTATAAAAA 7 198 1 GACAATTTACCTTAAAAATATTAAAAACCTAA 7 278 0 ACAACTATAGAAAATTACCAATATAATCTATATAACACTAA 8 58 0 AAAAAATGATATAAATAAAGCTCTTAGAAAACTTTAGGGGA 8 116 0 TCATTCATACAGAAACAATGATCCAAAAAATGATATAAATA 8 140 0 GTTTCTTATAACAGAAAAAACTCATTGGAATAATGCCTACT 8 184 0 TTTTTCTGTTATAAGAAACTGTTATAGCAAT 8 206 1 * ** ** * ** ** MAP Score: 12.4912 Motif 10 AAATTCTACCTTTAATTGAAAAACAACAATATTATTGGATAATTAG 0 18 0 AGGTAGAATTTAATAGTAAAAATTTTATAATTTGATTAAATATTCT 0 53 1 CTTTATACGTTCATTAATAATATAAGTAAAGAATATTTAATCAAAT 0 82 0 AATGAACGTATAAAGCACTAGATAAAAAATTATAATTTAGTTAATA 0 113 1 TATAATTTAGTTAATAATTATTAACTAAATTATTATCAAAATTGAA 0 143 1 ATGGCTACATTTTTCTATAAATTAATATAATAACATATATA 1 5 0 AGAGTTGTAATAATGAATTTTTGGTTTTAATCACTTGATTAAGATA 1 76 0 TAACAAATTATCAAAAACTAATTCTGTAAAAAATATAAATGTTTAA 1 135 1 ATATAAATGTTTAATTACAAAACAATATATAGTTATATATAATTAA 1 167 1 TATAGTTATATATAATTAAAAGATGAAAAACATCATACTTTATATT 1 194 1 AACATCATACTTTATATTCAAACTAAATAACATATTAATAATGCGC 1 222 1 TTCGCATTAATTTAGAATCAAGTTTAAAAATTAAATCCAA 1 270 1 TGTTGTAATTATAAAGTATAATTCAAGAAATTACATATATCAGTTT 2 77 0 AACTGCGCATTGATTGTGTACGTATTAAATTGTGATTTCCGAATAA 2 129 0 AATATCTCCATTCTCGTATATGCTAAAATTCCTAATAAAGCAATAC 3 71 0 ACGAAAGCCAAAAACAACTATGATATTAATAATTTTGAACCCGTGG 4 56 1 AAATATATTATGAATTTCTTTAGCATTTAAAAAGATC 5 1 0 AATATAATATTTAATCTATATTATATAAAATATATTATGAATTTCT 5 28 0 TTCCTTTTTATATTGCTTAAGCAAAATTAATATAATATTTAATCTA 5 56 0 CCTAACTTAATACAAATGAATGTTATAAAATTAAATGTCATTAACA 5 171 0 AATAATAATAACGAGAAAAAAAGAAACAAACAATATTTTTATCGAG 5 235 0 AGTTAAATTATAGAAATTTTCTATGCAAATAATAATAACGAGAAAA 5 262 0 TCCAACTTCATTTAGATAAAAATAATGATATTAATA 6 0 1 TTAGCAATAGTTAAACTACTATTAATTAATTTTATTCGTGTTTTCT 6 70 0 AACACTAAAATTATCAGTATTCTTATTATTTTATGT 7 0 1 TAAACTGCAAATCAAATTTAAAAATTAAAATCTTATAGATTTATAA 7 112 1 CTTATAGATTTATAAAAACAACTAATAAATTTATATAAGACTTCTC 7 143 1 GACTTCTCACTCTACATAATTATGGACAAAAAATATTGTGACAAAA 7 181 1 AGGACAACTATAGAAAATTACCAATATAATCTATATAACACTAAAG 8 56 0 * * * * *** * ** MAP Score: 2.86035