AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i RP/RP_operons009_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944237683 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 RP391 176 unknown #1 RP392 32 unknown #2 RP394 300 unknown #3 RP407 300 unknown #4 RP420 300 unknown #5 RP421 64 LEUCYL-TRNA SYNTHETASE (leuS) #6 RP536 300 FOLYLPOLYGLUTAMATE SYNTHASE (folC) #7 RP617 300 PROBABLE ISOLEUCYL-TRNA SYNTHETASE (ileS) #8 RP667 39 unknown #9 RP668 85 AMPG PROTEIN (ampG2) #10 RP669 300 PUTATIVE ATP-DEPENDENT RNA HELICASE RHLE (rhlE) #11 RP682 125 unknown #12 RP684 300 THYMIDYLATE KINASE (tmk) #13 RP687 300 VALYL-TRNA SYNTHETASE (valS) Motif 1 AAATTTTAGTATTTTAATCTAAATTTCATGTTC 0 91 1 TAATATGCATATTTTGATTTAAAACTATATTGG 10 269 1 AAAAATTGTTATTTTCTTTTAAATATACCTTAT 7 135 1 TTATGTAGTTATTTTACTATAAACTTATTTTTT 10 128 1 CGTGTAGCCAATTTTTGAATAAAGCTAGTATTC 2 243 1 TATAAACTTATTTTTTATATAAATAAATCTTAT 10 145 1 TTTATTGTAGATTTTAAAGTAAAGTATTTGCTA 12 170 1 TGTTATTGATTTTTTGTATAAAATTTATATAA 6 278 0 TAGTCATAGTTTTTTTCTTTAAAGGTTTTATAT 6 251 1 TTTAAAAAAATTTTTTCATTAAATATCTAAACT 4 75 0 TATGATAATATTTTTTAAATAAATATTGTAATG 3 31 0 CGTGTTAAGAATATTATTATAAAGATTATGTAT 13 267 0 TATGAGTTTTTTATTGATTTAAAATTAATTAAA 3 173 0 ATTTTACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTATAT 3 220 1 AGTTTAAATAATTTTTGACTAATAGTCAAAGCT 4 238 1 TACATTTAATTTTTTCCTGTAATATTTTATTGT 12 87 1 CATTGCTAATTTTTTGTTATAATTAAGTCATTT 9 42 1 TAATAGTAAATATTTTTTTTAAAGATATGATTA 12 248 1 ATAAATACATAATTTATACTAAACTAATAAATT 7 225 0 TTCCTGTAATATTTTATTGTATATTGTTTCTTT 12 100 1 AAACTTCGTCTATTTCTATTAAATTATCATATC 2 117 0 AAATTAACTTATATTTAATTAATTTTAAATCAA 3 160 1 ATCAACAAATTTATTACTGTAATT 8 25 1 AAATTATTATAATTTGGTTTAATATAATAGATA 7 269 0 CAAAACTTTGTTTTTTCTATATATGTATGACAT 4 199 1 AATATAAGTTAATTTTCATTAATATAAATAAGA 3 142 0 CTTATCCTGCAATTTTTATTAATGCTATAAGAT 2 47 0 AACAAATTTAATTAAAGTGCTTGATG 4 284 0 TAAAGTTGTAATATTTTTGTATAAGGTATATTT 7 155 0 AGTCAAAAATTATTTAAACTAATTGTATGTCAT 4 225 0 CTATACTAACATATTTAAGTATACTCTGTTGTT 2 187 0 ATTTAAAACTATATTGGATTATATA 10 285 1 CATGTGTTCAATATTTGAATATATTTTTCTACA 7 60 1 ATGCTTTTTGTATTTTCAATATATATGTAACTA 3 100 0 ATATTTACTATTATTTTTTTATTGCATGATATA 12 228 0 ***** * **** MAP Score: 44.2639 Motif 2 TTCATTATTCATTATCGTTTTATATATTTAGTTGGTATCT 10 47 1 TATTCATGATAATATCATTATTTAAATCTATATTTATTGT 12 138 1 TTGCTGGGTTATGAGTTTTTTATTGATTTAAAATTAATTA 3 175 0 TTATTTTACTATAAACTTATTTTTTATATAAATAAATCTT 10 136 1 AAGCATAGTTATAAATCTTATTTATATTAATGAAAATTAA 3 127 1 TCGTCGTTAAATTACTTTTTTATAATTGAATGCATAAAAG 13 161 0 CTGAAAAAGAAAAATTGTTATTTTCTTTTAAATATACCTT 7 126 1 TTTACTTGAGAACAAATTTGTTTTGCTATATTACCACTTT 13 68 0 CGAAATAAACAAAACTTTGTTTTTTCTATATATGTATGAC 4 190 1 ATTTAGTTAATTATTCTCTTTTAATATTAAAA 1 3 0 GAATATTATTATAAAGATTATGTATGATTATGACAAGATG 13 252 0 TATCCTTGTCATTATGATAATAATTGTATATCTTATAGCA 2 18 1 TATGTGCGCAATAAGTGTTCTTATTTTATACCATGACTCC 13 26 0 AAATTGCAGGATAAGTTTTGTAATTATCTAAATTTGAAAC 2 65 1 TTGATTCAAGATAATTATTATGTAGTTATTTTACTATAAA 10 111 1 TTTTAAAGATATGATTATGCTTTAGTTTTTAAAATTGCAA 12 264 1 TGAAATTTAGATTAAAATACTAAAATTTAATATCAACTTT 0 79 0 CTTCAAAAATATCAATTTCGTATTACTGAAAAAGAAAAAT 7 101 1 TAAATAGAATATTATGATAATATTTTTTAAATAAATATTG 3 36 0 AGTATACTTAAATATGTTAGTATAGTACTACAGCTCTGAT 2 195 1 TCGAGTAAAAAAGACTATTTTAAAAATTAAAAGCTCTAAT 11 34 1 TCCAATCTGGATAATCTTGCTTTTTCATTACTCATTCTTT 6 31 0 AATTACAGTAATAAATTTGTTGATAAATGAT 8 18 0 TTTGATTATGAATAATATGAACTATATATAAAGAAATTAC 3 238 0 CTTGAAATTTATTAGTTTAGTATAAATTATGTATTTATCT 7 220 1 CAAACTCAAAATTATCTTATTATACTTTATAAGCTATTAA 4 25 0 ATGCAATAAAAAAATAATAGTAAATATTTTTTTTAAAGAT 12 234 1 TTGAATGCATAAAAGTTTCTTTAATATCTTTAACCTAATC 13 136 0 TATTGAACACATGAATTTGTAATAAGTTAAATTAAAAGTT 7 33 0 TCAATATTTGAATATATTTTTCTACAAAAATTATCTTCAA 7 67 1 ATGCACAATCAAGAACTTTCTAATGCTAAAGTTGTAATAT 7 174 0 TTTTTGATGCAAAAATATTGATAAGCTTTACATTAACCAC 6 211 1 TTATTCAGATATGATAATTTAATAGAAATAGACGAAGTTT 2 110 1 CCTGATTTAAAAAAATTTTTTCATTAAATATCTAAACTGG 4 73 0 TATATAATCCAATATAGTTTTAAATCAAAATATGCATATT 10 270 0 ATTAATGAAAATTAACTTATATTTAATTAATTTTAAATCA 3 152 1 TGAAATCTATAACACAATATACAATCTTAATGCTTAAACA 0 143 1 TATTCTATTTATGATGTTTTAGAACATATTATTCTTAGTT 3 65 1 TGCTGGTTTGAATAAGATTCTAAAATAGTTTCATTATTCA 10 18 1 AATTTGGTTTAATATAATAGATAATGACTAAGAGATAAAT 7 252 0 ** * * * ** * ** MAP Score: 31.1429 Motif 3 TTAAGATTGTATATTGTGTTATAGATTTCACTTTAA 0 137 0 CGTGTTAAGAATATTATTATAAAGATTATGTATGAT 13 264 0 TTTTAAATAAATATTGTAATGTAAATGGTGAATATA 3 16 0 TTTTCCTGTAATATTTTATTGTATATTGTTTCTTTT 12 98 1 TTAAATAATGATATTATCATGAATATGGTAAAAGAA 12 127 0 TTCAGATATGATAATTTAATAGAAATAGACGAAGTT 2 113 1 ATATTTGAATATATTTTTCTACAAAAATTATCTTCA 7 70 1 AATAATATGCATATTTTGATTTAAAACTATATTGGA 10 267 1 GAATATTATGATAATATTTTTTAAATAAATATTGTA 3 34 0 GTAACTAAGAATAATATGTTCTAAAACATCATAAAT 3 71 0 AGAAAAATTGTTATTTTCTTTTAAATATACCTTATA 7 133 1 CAAAATTATCTTATTATACTTTATAAGCTATTAACT 4 23 0 TACCAATTTTATATTGATATACAAATGACGAGCTGT 6 163 0 TTGATTATGAATAATATGAACTATATATAAAGAAAT 3 241 0 TACGAAATTGATATTTTTGAAGATAATTTTTGTAGA 7 87 0 CAAAATATGCATATTATTGATGAGAACTGCTTACAT 10 249 0 ATAATTTGGTTTAATATAATAGATAATGACTAAGAG 7 258 0 TTTATTATCTAGTGTACAACAAAAGAATG 6 3 1 AAACCAAATTATAATAATTTCTAGAATA 7 282 1 GATAATATCATTATTTAAATCTATATTTATTGTAGA 12 145 1 TAATCATTGTTTTTTCTTTTCGAAATTAAACTTCGT 2 141 0 TTAATTTTCATTAATATAAATAAGATTTATAACTAT 3 131 0 TTTTATATAAATTTTATACAAAAAATCAATAACA 6 276 1 TAACTTATATTTAATTAATTTTAAATCAATAAAAAA 3 164 1 CCCATAAGATTTATTTATATAAAAAATAAGTTTATA 10 145 0 TAATATTATGATTTGTACATGGTGTCGAGT 11 4 1 AACAATGATTATTATAAGGTAAACAACAGAGTATAC 2 166 1 ATAGTAAATATTTTTTTTAAAGATATGATTATGCTT 12 250 1 GAATAACCACTTAATTATTAGCAAATACTTTACTTT 12 185 0 ACACCAGACATTTTTAAAATCAACAAGGAAATTAAT 0 13 0 ATAAAATGACTTAATTATAACAAAAAATTAGCAATG 9 42 0 AAAAAAGACTATTTTAAAAATTAAAAGCTCTAATTT 11 40 1 ATATACAATTATTATCATAATGACAAGGATAGATAA 2 13 0 ***** * * * ** MAP Score: 30.9821 Motif 4 TTCCATATGTTCTTTAGCAAAAGTCAGAATTTTAAAAGCGAA 4 152 1 AAGACTATTTTAAAAATTAAAAGCTCTAATTTATCGTTTTGA 11 44 1 ATAAGGTATATTTAAAAGAAAATAACAATTTTTCTTTTTCAG 7 126 0 GATTATGCTTTAGTTTTTAAAATTGCAATTTTTA 12 276 1 AGATTGGATTTGCAATTTAAAAGGGGTAGTTTACGTATTAAG 6 63 1 TCTACAAAAATTATCTTCAAAAATATCAATTTCGTATTACTG 7 87 1 CCATAAGATTTATTTATATAAAAAATAAGTTTATAGTAAAAT 10 138 0 CTTTTATGCATTCAATTATAAAAAAGTAATTTAACGACGATA 13 161 1 CCAATATAGTTTTAAATCAAAATATGCATATTATTGATGAGA 10 260 0 TTGTACATGGTGTCGAGTAAAAAAGACTATTTTAAAAATTAA 11 22 1 GAACATGAAATTTAGATTAAAATACTAAAATTTAATATCAAC 0 82 0 ATAAAGAAATTACAATAAAAAATTGTAAAATTTTGATTGCTG 3 209 0 AAATATACCTTATACAAAAATATTACAACTTTAGCATTAGAA 7 155 1 ATATGATAATTTAATAGAAATAGACGAAGTTTAATTTCGAAA 2 118 1 CTACAATAAATATAGATTTAAATAATGATATTATCATGAATA 12 138 0 AAATCTGGAGTCCTGATTTAAAAAAATTTTTTCATTAAATAT 4 82 0 TAATAGCTTATAAAGTATAATAAGATAATTTTGAGTTTGTGA 4 26 1 TAAATAAATATTGTAATGTAAATGGTGAATATAATTATT 3 7 0 GATTTAAAATTAATTAAATATAAGTTAATTTTCATTAATATA 3 149 0 CATGAATTTGTAATAAGTTAAATTAAAAGTTAATATTTGTTA 7 22 0 TTTTAATATTAAAAGAGAATAATTAACTAAAT 1 2 1 AAGTTTAATTTCGAAAAGAAAAAACAATGATTATTATAAGGT 2 144 1 TTGAGTTAGATACCATAGTAAAGTCATACTATTACCCTTATT 11 82 1 CAGTAATAAATTTGTTGATAAATGATAATTTAGG 8 2 0 AGAACAAATTTGTTTTGCTATATTACCACTTTGTTATGTGCG 13 58 0 TAATCTACAGTATCAAGAAAAAGTTGATATTAAATTTTAGTA 0 60 1 TATTATCTAGTGTACAACAAAAGAATGAGTAATGAAAAAGCA 6 12 1 TAGCAAATACTTTACTTTAAAATCTACAATAAATATAGATTT 12 161 0 AAGTATATCATGCAATAAAAAAATAATAGTAAATATTTTTTT 12 225 1 ATAATTTTTGTAGAAAAATATATTCAAATATTGAACACATGA 7 59 0 GAAGGAGTCATGGTATAAAATAAGAACACTTATTGCGCACAT 13 23 1 GTGTTAAGAATATTATTATAAAGATTATGTATGATTATGACA 13 257 0 TCCTGTAATATTTTATTGTATATTGTTTCTTTTACCATATTC 12 101 1 TAATCAGAGCTGTAGTACTATACTAACATATTTAAGTATACT 2 195 0 CTAAGAATAATATGTTCTAAAACATCATAAATAGAATATTAT 3 61 0 CAATTTTTGATTATGAATAATATGAACTATATATAAAGAAAT 3 241 0 ATTACAATATTTATTTAAAAAATATTATCATAATATTCTATT 3 32 1 GAATTGAGCCTCCTTATATAAAATGACTTAATTATAACAAAA 9 53 0 GTTATTGATTTTTTGTATAAAATTTATATAAAACCTTTAAAG 6 267 0 ATATTATTCTTAGTTACATATATATTGAAAATACAAAAAGCA 3 90 1 AGTCATTATCTATTATATTAAACCAAATTATAATAATTTCTA 7 263 1 TGAAATTTATTAGTTTAGTATAAATTATGTATTTATCTCTTA 7 222 1 * * **** * *** MAP Score: 29.351 Motif 5 ATGAGTTTTTTATTGATTTAAAATTAATTAAATATAAGTTAAT 3 162 0 AAATATTAACTTTTAATTTAACTTATTACAAATTCATGTGTTC 7 26 1 TCTTCTCAGATTTTGATTGATTCTACATTTAATTTTTTCCTGT 12 64 1 TTCATATTATTCATAATCAAAAATTGATTCAAATAATCTTCGG 3 257 1 TTTATTATCTAGTGTACAACAAAAGAATGAGTAA 6 1 1 GTCATACCATTACTAATCTACAGTATCAAGAAAAAGTTGATAT 0 47 1 TTATTATCTATCCTTGTCATTATGATAATAATT 2 0 1 TATTGTAATTTCTTTATATATAGTTCATATTATTCATAATCAA 3 234 1 CATTAACCACTAGTCATAGTTTTTTTCTTTAAAGGTTTTATAT 6 241 1 ATTTATCTCTTAGTCATTATCTATTATATTAAACCAAATTATA 7 252 1 TAAGCATATTTTTTGATTCAAGATAATTATTATGTAGTTATTT 10 99 1 ATATATCTTCTCCTGATCAAGAATTACATTTAAAACT 12 4 0 TATCCTGCAATTTTTATTAATGCTATAAGATATACAATTATTA 2 35 0 AAATAGAATATTATGATAATATTTTTTAAATAAATATTGTAAT 3 32 0 ACCATTTCATTGCTAATTTTTTGTTATAATTAAGTCATTTTAT 9 35 1 ATTTAGTTAATTATTCTCTTTTAATATTAAAA 1 2 0 ACACATCTTGTCATAATCATACATAATCTTTATAATAATATTC 13 249 1 GAATAATATGTTCTAAAACATCATAAATAGAATATTATGATAA 3 56 0 TAACTTATCGTCGTTAAATTACTTTTTTATAATTGAATGCATA 13 165 0 AAAAGCATAGTTATAAATCTTATTTATATTAATGAAAATTAAC 3 125 1 ATGTAAGCAGTTCTCATCAATAATATGCATATTTTGATTTAAA 10 249 1 AGTTGGTATCTTGTAATCTAGTTTAAGCATATTTTTTGATTCA 10 76 1 CTTTGACTATTAGTCAAAAATTATTTAAACTAATTGTATGTCA 4 226 0 TGTTATTTTCTTTTAAATATACCTTATACAAAAATATTACAAC 7 141 1 CATAATCATATCTTTAAAAAAAATATTTACTATTATTTTTTTA 12 240 0 CTAAATTTCATGTTCAAGTTAGCTAAGATTAAAGTGAAATCTA 0 109 1 TGTCCTGTTCTTATTAATCAATGTAGTATGTAAGCAGTTCTCA 10 222 1 TTATTGTAGATTTTAAAGTAAAGTATTTGCTAATAATTAAGTG 12 171 1 ATAGTTTCATTATTCATTATCGTTTTATATATTTAGTTGGTAT 10 42 1 ATAAGTTTTGTAATTATCTAAATTTGAAACTTAGATTATTCAG 2 75 1 GTTTACCTTATAATAATCATTGTTTTTTCTTTTCGAAATTAAA 2 147 0 TGTTATTGATTTTTTGTATAAAATTTATATAAAACC 6 274 0 CAAAATTATCTTATTATACTTTATAAGCTATTAACTATTTAAT 4 16 0 AGGTTAAAGATATTAAAGAAACTTTTATGCATTCAATTATAAA 13 140 1 TATTTCGCTTTTAAAATTCTGACTTTTGCTAAAGAACATATGG 4 154 0 AAATCAGGACTCCAGATTTAAAATTTATGCTAAGAAATAATTA 4 105 1 CGTCTATTTCTATTAAATTATCATATCTGAATAATCTAAGTTT 2 101 0 * * ** * ** *** MAP Score: 28.4632 Motif 6 TATCTAAATTTGAAACTTAGATTATTCAGATATGATAATTTA 2 89 1 TATGATGTTTTAGAACATATTATTCTTAGTTACATATATATT 3 74 1 AATTAAAAGCTCTAATTTATCGTTTTGAGTTAGATACCATAG 11 58 1 AATATTTTTTTTAAAGATATGATTATGCTTTAGTTTTTAAAA 12 256 1 ATTAATTAAATATAAGTTAATTTTCATTAATATAAATAAGAT 3 141 0 ATAATGAATAATGAAACTATTTTAGAATCTTATTCAAACCAG 10 20 0 TGGTAAAAGAAACAATATACAATAAAATATTACAGGAAAAAA 12 96 0 TGAAATGGTGAATAATATAGAGTTATGAATTAGA 9 2 0 AAACTTATCCTGCAATTTTTATTAATGCTATAAGATATACAA 2 41 0 GTTGGTATCTTGTAATCTAGTTTAAGCATATTTTTTGATTCA 10 77 1 GTTAATAGCTTATAAAGTATAATAAGATAATTTTGAGTTTGT 4 24 1 TATTGTAGATTTTAAAGTAAAGTATTTGCTAATAATTAAGTG 12 172 1 ACTCCAGATTTAAAATTTATGCTAAGAAATAATTAAATCTTC 4 113 1 TAAGTTAAATTAAAAGTTAATATTTGTTATTTTTGCTTGTG 7 9 0 TTATTTTCTTTTAAATATACCTTATACAAAAATATTACAACT 7 143 1 CCATTTACATTACAATATTTATTTAAAAAATATTATCATAAT 3 24 1 TTTTTTCTTTTCGAAATTAAACTTCGTCTATTTCTATTAAAT 2 126 0 TTGTTTAAGCATTAAGATTGTATATTGTGTTATAGATTTCAC 0 142 0 TGTTCAATATTTGAATATATTTTTCTACAAAAATTATCTTCA 7 64 1 TTTATTTATATAAAAAATAAGTTTATAGTAAAATAACTACAT 10 130 0 TATATAATCCAATATAGTTTTAAATCAAAATATGCATAT 10 271 0 CAATTTTTGAATAAAGCTAGTATTCTTACTTTAAACTTTAAT 2 251 1 TCATACCATTACTAATCTACAGTATCAAGAAAAAGTTGATAT 0 48 1 GTTTTTTTCTTTAAAGGTTTTATATAAATTTTATACAAAAAA 6 259 1 ATTGAATGCATAAAAGTTTCTTTAATATCTTTAACCTAATCA 13 135 0 CTAGCTTTATTCAAAAATTGGCTACACGTTTTATTAATCAGA 2 229 0 TAAGAAATAATTAAATCTTCCATATGTTCTTTAGCAAAAGTC 4 135 1 AGCGAAATAAACAAAACTTTGTTTTTTCTATATATGTATGAC 4 188 1 TGACTATTAGTCAAAAATTATTTAAACTAATTGTATGTCATA 4 224 0 TTAACTTATATTTAATTAATTTTAAATCAATAAAAAACTCAT 3 163 1 TATCTTTAAAAAAAATATTTACTATTATTTTTTTATTGCATG 12 233 0 TTTACTTGAGAACAAATTTGTTTTGCTATATTACCACTTTGT 13 66 0 AAAAGAAAATAACAATTTTTCTTTTTCAGTAATACGAAATTG 7 113 0 GATTATTTGAATCAATTTTTGATTATGAATAATATGAACTAT 3 253 0 * ** ** ** *** MAP Score: 25.2006 Motif 7 GCTTTTTCATTACTCATTCTTTTGTTGTACACTAGATAATAAA 6 9 0 ATATTTTTTTTAAAGATATGATTATGCTTTAGTTTTTAAAATTG 12 257 1 AAGAAACTTTTATGCATTCAATTATAAAAAAGTAATTTAACGAC 13 155 1 ATTTAGTTAATTATTCTCTTTTAATATTAAAA 1 1 0 CATAATATTCTATTTATGATGTTTTAGAACATATTATTCTTAGT 3 60 1 TATATTAATTTCCTTGTTGATTTTAAAAATGTCTGG 0 2 1 TTATTCGTGTTAAGAATATTATTATAAAGATTATGTATGATTAT 13 261 0 TCTTCAAAAATATCAATTTCGTATTACTGAAAAAGAAAAATTGT 7 100 1 ATGGCTGAAGTACCAATTTTATATTGATATACAAATGACGAGCT 6 165 0 ATAAATTATGTATTTATCTCTTAGTCATTATCTATTATATTAAA 7 241 1 TAAAATTAATTAAATATAAGTTAATTTTCATTAATATAAATAAG 3 143 0 TGATTCAAGATAATTATTATGTAGTTATTTTACTATAAACTTAT 10 112 1 GTGTTCAATATTTGAATATATTTTTCTACAAAAATTATCTTCAA 7 63 1 CAAGAAAAAGTTGATATTAAATTTTAGTATTTTAATCTAAATTT 0 73 1 CCGAAGATTATTTGAATCAATTTTTGATTATGAATAATATGAAC 3 256 0 AGTTTTAAATGTAATTCTTGATCAGGAGAAGATATAT 12 3 1 AAATAGAATATTATGATAATATTTTTTAAATAAATATTGTAATG 3 31 0 ATCATGCTGGTTTGAATAAGATTCTAAAATAGTTTCATTATTCA 10 14 1 CATTGCACTCTTGAAATTTATTAGTTTAGTATAAATTATGTATT 7 211 1 ACTTAGATTATTCAGATATGATAATTTAATAGAAATAGACGAAG 2 103 1 TGATTGATTCTACATTTAATTTTTTCCTGTAATATTTTATTGTA 12 77 1 AAAAAATATTTACTATTATTTTTTTATTGCATGATATACTTACT 12 222 0 AAATTAAAAGTTAATATTTGTTATTTTTGCTTGTG 7 1 0 ATATATTTAGTTGGTATCTTGTAATCTAGTTTAAGCATATTTTT 10 68 1 AATCAAAATTTTACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTATATATAG 3 213 1 TTATTATCTATCCTTGTCATTATGATAATAATTGTATATCTT 2 8 1 ATCAATGTAGTATGTAAGCAGTTCTCATCAATAATATGCATATT 10 238 1 TTTAGATATTTAATGAAAAAATTTTTTTAAATCAGGACTCCAGA 4 77 1 TTTCTAATGCTAAAGTTGTAATATTTTTGTATAAGGTATATTTA 7 154 0 TTTTTTGTTATAATTAAGTCATTTTATATAAGGAGGCTCAATTC 9 51 1 ACATATTAAATAGTTAATAGCTTATAAAGTATAATAAGATAATT 4 12 1 ATATTGAAAATACAAAAAGCATAGTTATAAATCTTATTTATATT 3 111 1 ATTGCGCACATAACAAAGTGGTAATATAGCAAAACAAATTTGTT 13 54 1 CTTTGACTATTAGTCAAAAATTATTTAAACTAATTGTATGTCAT 4 225 0 TGTATATTGTTTCTTTTACCATATTCATGATAATATCATTATTT 12 117 1 ACTCTGTTGTTTACCTTATAATAATCATTGTTTTTTCTTTTCGA 2 154 0 ATATTAACTTTTAATTTAACTTATTACAAATTCATGTGTTCAAT 7 28 1 CTCAAAACGATAAATTAGAGCTTTTAATTTTTAAAATAGTCTTT 11 43 0 GGATTTGCAATTTAAAAGGGGTAGTTTACGTATTAAGTTGAAAT 6 68 1 CCTAAATTATCATTTATCAACAAATTTATTACTGTA 8 2 1 GACTAGTGGTTAATGTAAAGCTTATCAATATTTTTGCATCAAAA 6 212 0 TATGATTGATTAGGTTAAAGATATTAAAGAAACTTTTATGCATT 13 129 1 ATCTGTCGTTTAATTTATGTGTAATCATGTTGGTTCTCACACTA 5 30 0 TCTTTAAAGGTTTTATATAAATTTTATACAAAAAATCAATAACA 6 266 1 TAGCCAATTTTTGAATAAAGCTAGTATTCTTACTTTAAACTTTA 2 247 1 ** ** ** * * * * MAP Score: 21.8398 Motif 8 ACATATATATTGAAAATACAAAAAGCATAGTTATAAATCTTA 3 105 1 CAGATTGGATTTGCAATTTAAAAGGGGTAGTTTACGTATTAA 6 62 1 GTCATTTGTATATCAATATAAAATTGGTACTTCAGCCATTGT 6 170 1 GAATTGAGCCTCCTTATATAAAATGACTTAATTATAACAAAA 9 53 0 ATAAGATTTATTTATATAAAAAATAAGTTTATAGTAAAATAA 10 136 0 CTTTTTTATAATTGAATGCATAAAAGTTTCTTTAATATCTTT 13 145 0 TTTTGATGCAAAAATATTGATAAGCTTTACATTAACCACTAG 6 212 1 TTACTAATCTACAGTATCAAGAAAAAGTTGATATTAAATTTT 0 56 1 GTAAAGTATTTGCTAATAATTAAGTGGTTATTCAAGTAAGTA 12 188 1 GAAAAATATATTCAAATATTGAACACATGAATTTGTAATAAG 7 47 0 TATAAAGAAATTACAATAAAAAATTGTAAAATTTTGATTGCT 3 210 0 ATGGTAAAAGAAACAATATACAATAAAATATTACAGGAAAAA 12 97 0 TGCAATAAAAAAATAATAGTAAATATTTTTTTTAAAGATATG 12 235 1 AATTTATGCTAAGAAATAATTAAATCTTCCATATGTTCTTTA 4 126 1 CAAGATACCAACTAAATATATAAAACGATAATGAATAATGAA 10 47 0 TATATAGTTCATATTATTCATAATCAAAAATTGATTCAAATA 3 250 1 ATAAATACATAATTTATACTAAACTAATAAATTTCAAGAGTG 7 216 0 AAAGTTGTAATATTTTTGTATAAGGTATATTTAAAAGAAAAT 7 145 0 CTGGTTTGAATAAGATTCTAAAATAGTTTCATTATTCATTAT 10 20 1 TTCGTATTACTGAAAAAGAAAAATTGTTATTTTCTTTTAAAT 7 117 1 AAGTTTAATTTCGAAAAGAAAAAACAATGATTATTATAAGGT 2 144 1 AAAGACTATTTTAAAAATTAAAAGCTCTAATTTATCGTTTTG 11 43 1 AATATTGTAATGTAAATGGTGAATATAATTATT 3 1 0 CCAGTTTAGATATTTAATGAAAAAATTTTTTTAAATCAGGAC 4 73 1 AACTACATAATAATTATCTTGAATCAAAAAATATGCTTAAAC 10 96 0 TGTTATTGATTTTTTGTATAAAATTTATATAAAACCTTTA 6 270 0 TCATACATATATAGAAAAAACAAAGTTTTGTTTATTTCGCTT 4 187 0 AAATCTGAGAAGAATAAGCAAAAGGCTTAGATATATCTTCTC 12 35 0 CCTAAATTATCATTTATCAACAAATTTATTACTGTAATT 8 7 1 TGATTATGCTTTAGTTTTTAAAATTGCAATTTTTA 12 275 1 CATTACAATATTTATTTAAAAAATATTATCATAATATTCTAT 3 31 1 ACAATAAATATAGATTTAAATAATGATATTATCATGAATATG 12 136 0 CAAGCAAAAATAACAAATATTAACTTTTAATTTAACTTATTA 7 12 1 AACAAAAGAATGAGTAATGAAAAAGCAAGATTATCCAGATTG 6 27 1 GATTTAAAATTAATTAAATATAAGTTAATTTTCATTAATATA 3 149 0 AGTTAATAGCTTATAAAGTATAATAAGATAATTTTGAGTTTG 4 23 1 ACGTGTAGCCAATTTTTGAATAAAGCTAGTATTCTTACTTTA 2 242 1 ATTTATATAAAACCTTTAAAGAAAAAAACTATGACTAGTGGT 6 246 0 * *** * ** * ** MAP Score: 21.4127 Motif 9 TCTATTTATGATGTTTTAGAACATATTATTCTTAGTTACATA 3 68 1 TTATGGGATCATCATTTCTACTTTATTTCTATGAGAGAGCAT 10 174 1 AAGATTGTATATTGTGTTATAGATTTCACTTTAATCTTAGCT 0 129 0 TTTGCTAAAGAACATATGGAAGATTTAATTATTTCTTAGCAT 4 131 0 CCAGCAATCAAAATTTTACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTA 3 208 1 TTAGTCAAAAATTATTTAAACTAATTGTATGTCATACATATA 4 218 0 TGTTATTGATTTTTTGTATAAAATTTATATAAAACCTTTA 6 270 0 AATAATTATATTCACCATTTACATTACAATATTTAT 3 4 1 GTTCTCATCAATAATATGCATATTTTGATTTAAAACTATATT 10 258 1 ATTTATTAGTTTAGTATAAATTATGTATTTATCTCTTAGTCA 7 226 1 ATAGTAAATATTTTTTTTAAAGATATGATTATGCTTTAGTTT 12 250 1 ATTCTTTATTCGTGTTAAGAATATTATTATAAAGATTATG 13 270 0 TGACTAGTGGTTAATGTAAAGCTTATCAATATTTTTGCATCA 6 215 0 TAGAAAAAACAAAGTTTTGTTTATTTCGCTTTTAAAATTCTG 4 176 0 ATTAAAAGTTAATATTTGTTATTTTTGCTTGTG 7 1 0 TCATTATTTAAATCTATATTTATTGTAGATTTTAAAGTAAAG 12 152 1 AAAAATTGTTATTTTCTTTTAAATATACCTTATACAAAAATA 7 135 1 GAATATTATGATAATATTTTTTAAATAAATATTGTAATGTAA 3 28 0 TTCTTTTACCATATTCATGATAATATCATTATTTAAATCTAT 12 127 1 AACTATGCTTTTTGTATTTTCAATATATATGTAACTAAGAAT 3 95 0 ACAAAAAGCATAGTTATAAATCTTATTTATATTAATGAAAAT 3 122 1 TGTAGTTATTTTACTATAAACTTATTTTTTATATAAATAAAT 10 131 1 TTTATTGTAATTTCTTTATATATAGTTCATATTATTCATAAT 3 232 1 TGAATGCATAAAAGTTTCTTTAATATCTTTAACCTAATCAAT 13 133 0 TTTTTGATTCAAGATAATTATTATGTAGTTATTTTACTATAA 10 108 1 GTCTTATCACAAACTCAAAATTATCTTATTATACTTTATAAG 4 32 0 TATATTAATTTCCTTGTTGATTTTAAAAATGTC 0 1 1 TTCATTGCTAATTTTTTGTTATAATTAAGTCATTTTATATAA 9 40 1 GATTTAAAAAAATTTTTTCATTAAATATCTAAACTGGTCTTA 4 68 0 ACGAAATTGATATTTTTGAAGATAATTTTTGTAGAAAAATAT 7 80 0 TTAGAGCTTTTAATTTTTAAAATAGTCTTTTTTACTCGACAC 11 31 0 CTTGAATCAAAAAATATGCTTAAACTAGATTACAAGATACCA 10 79 0 TAAAATACTAAAATTTAATATCAACTTTTTCTTGATACTGTA 0 65 0 AAATTAACTTATATTTAATTAATTTTAAATCAATAAAAAACT 3 160 1 GAACTTTCTAATGCTAAAGTTGTAATATTTTTGTATAAGGTA 7 160 0 GAACATATTAAATAGTTAATAGCTTATAAAGTATAA 4 4 1 AGTAAAGTATTTGCTAATAATTAAGTGGTTATTCAAGTAAGT 12 187 1 GAAATTAAACTTCGTCTATTTCTATTAAATTATCATATCTGA 2 114 0 CTTGATTCTTTACTTGAGAACAAATTTGTTTTGCTATATTAC 13 74 0 GTTCATATTATTCATAATCAAAAATTGATTCAAATAATCTTC 3 256 1 TATTTATCTCTTAGTCATTATCTATTATATTAAACCAAATTA 7 251 1 ** * * * ** * * * MAP Score: 20.9514 Motif 10 TACAGTATCAAGAAAAAGTTGATATTAAATTTTAGTATTTTA 0 65 1 TAGTATTTTAATCTAAATTTCATGTTCAAGTTAGCTAAGATT 0 97 1 GTATATTGTGTTATAGATTTCACTTTAATCTTAGCTAACTTG 0 123 0 TCCTTGTCATTATGATAATAATTGTATATCTTATAGCATTAA 2 20 1 TTTAGATAATTACAAAACTTATCCTGCAATTTTTATTAATGC 2 55 0 GATATGATAATTTAATAGAAATAGACGAAGTTTAATTTCGAA 2 117 1 AAGGTAAACAACAGAGTATACTTAAATATGTTAGTATAGTAC 2 181 1 CCAATTTTTGAATAAAGCTAGTATTCTTACTTTAAACTTTAA 2 250 1 TATATTCACCATTTACATTACAATATTTATTTAAAAAATATT 3 16 1 AACATCATAAATAGAATATTATGATAATATTTTTTAAATAAA 3 41 0 TTATGATGTTTTAGAACATATTATTCTTAGTTACATATATAT 3 73 1 TTGAAAATACAAAAAGCATAGTTATAAATCTTATTTATATTA 3 114 1 ATTAATGAAAATTAACTTATATTTAATTAATTTTAAATCAAT 3 152 1 CTCATAACCCAGCAATCAAAATTTTACAATTTTTTATTGTAA 3 200 1 TATGAATAATATGAACTATATATAAAGAAATTACAATAAAAA 3 230 0 TAAGACCAGTTTAGATATTTAATGAAAAAATTTTTTTAAATC 4 68 1 TAAAGAACATATGGAAGATTTAATTATTTCTTAGCATAAATT 4 126 0 TTTAAAAGCGAAATAAACAAAACTTTGTTTTTTCTATATATG 4 182 1 TGACTATTAGTCAAAAATTATTTAAACTAATTGTATGTCATA 4 224 0 GATTTCCATCAAGCACTTTAATTAAATTTGTT 4 278 1 GTCATTTGTATATCAATATAAAATTGGTACTTCAGCCATTGT 6 170 1 TAGTGGTTAATGTAAAGCTTATCAATATTTTTGCATCAAAAA 6 211 0 AGTTTTTTTCTTTAAAGGTTTTATATAAATTTTATACAAAAA 6 258 1 ATAAGTTAAATTAAAAGTTAATATTTGTTATTTTTGCTTGTG 7 10 0 AATTCATGTGTTCAATATTTGAATATATTTTTCTACAAAAAT 7 56 1 AATACGAAATTGATATTTTTGAAGATAATTTTTGTAGAAAAA 7 83 0 ATAAGGTATATTTAAAAGAAAATAACAATTTTTCTTTTTCAG 7 126 0 TAAATATACCTTATACAAAAATATTACAACTTTAGCATTAGA 7 154 1 TAAATACATAATTTATACTAAACTAATAAATTTCAAGAGTGC 7 215 0 CTTAGTCATTATCTATTATATTAAACCAAATTATAATAATTT 7 260 1 CCTAAATTATCATTTATCAACAAATTTATTACTGTA 8 4 1 GATAATGAATAATGAAACTATTTTAGAATCTTATTCAAACCA 10 21 0 TATGTAGTTATTTTACTATAAACTTATTTTTTATATAAATAA 10 129 1 TGTAAGCAGTTCTCATCAATAATATGCATATTTTGATTTAAA 10 250 1 AGAAGATATATCTAAGCCTTTTGCTTATTCTTCTCAGATTTT 12 36 1 TCAGATTTTGATTGATTCTACATTTAATTTTTTCCTGTAATA 12 69 1 TTTTTTCCTGTAATATTTTATTGTATATTGTTTCTTTTACCA 12 96 1 TTCATGATAATATCATTATTTAAATCTATATTTATTGTAGAT 12 140 1 TAGATTTTAAAGTAAAGTATTTGCTAATAATTAAGTGGTTAT 12 177 1 TATCATGCAATAAAAAAATAATAGTAAATATTTTTTTTAAAG 12 230 1 AATTGAATGCATAAAAGTTTCTTTAATATCTTTAACCTAATC 13 136 0 ACTTTTATGCATTCAATTATAAAAAAGTAATTTAACGACGAT 13 160 1 TCATAATCATACATAATCTTTATAATAATATTCTTAACACGA 13 259 1 * * ** * * ** ** MAP Score: 19.1074