AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i RP/RP_profile001_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239095 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 RP011 300 NIFR3-LIKE PROTEIN (nifR3) #1 RP015 300 POLY(A) POLYMERASE (pcnB) #2 RP185 287 DNAK PROTEIN (dnaK) #3 RP319 264 HEAT SHOCK PROTEIN HSLV (hslV) #4 RP510 300 TRNA DELTA(2)-ISOPENTENYLPYROPHOSPHATE TRANSFERASE (miaA) #5 RP520 152 ATP-DEPENDENT CLP PROTEASE PROTEOLYTIC SUBUNIT (clpP) #6 RP521 249 30S RIBOSOMAL PROTEIN S1 (rpsA) #7 RP522 300 CYTIDYLATE KINASE (cmk) #8 RP761 300 RECA PROTEIN (recA) #9 RP763 151 ACYL CARRIER PROTEIN (acpP) #10 RP879 137 50S RIBOSOMAL PROTEIN L33 (rpmG) #11 RP880 300 DNA MISMATCH REPAIR PROTEIN MUTL (mutL) Motif 1 GCTTTTGCAGAGTAAATAAGTATCAAATAATCA 0 76 1 GCTTTACTTGAGTAAAATATCATTCCTAAGCTA 0 207 0 TTCTGTTTGTAGTAAAAAAATATATCTTTTAAA 1 125 0 GTGCTTTTAAAAGAAATAATAATCGTTATTAAA 1 228 0 CACTATATCAAATAAAAAGTCATAATACAATAA 2 18 1 CCCAGGATCTAGAAATAAATTATAAGTTGTTTT 2 170 0 TCCACACTGGAATAATATAGAATACAACGCTAA 2 235 1 AAATTCAAGGAACAATAATTAATTAAATTGAAT 3 30 1 TCTACTTTAGAATAAAATATTATGTTATAGTAC 3 207 1 TGCACAGTATAATAATTAAAAATACTAAATACT 4 165 0 CAACACCATTAGAAAAAACATATATGATATCAG 4 241 1 ACCACAACTAAATAATTATAGATTTATAA 4 281 1 TTTAAAGGTTAATAAAATTGGATGTTATTGCAT 6 179 0 ATTAACCTTTAAAAAATTTTTATTAGCTTATGC 6 199 1 AAAACGTATCAAGAAAATGGAATTTATACTTTT 7 42 1 TAACGATGCAAACAATTAAAGATATGATGTACG 7 168 0 TTATATAATCAAAAATTAATTATTTGCAGTTTT 7 211 0 AGTTACAAATAATAATTATTTATATTTAATACA 7 256 0 GTTTTATTTAAATAATATGGTATCGCAATTTCC 8 97 0 TTTACTATGTAAAAATTAGTTATGTTATTTATT 8 181 0 ACGCACAATAAATAAAATTTGATTTTTCTTTCT 8 235 1 ATTTTATGCTAGCAAAAAATAATTTTTTGTGCT 9 11 1 GAATATTTGAAATAAATATTCATAAGCATTTTC 9 61 0 TAGCAATGAAAATAAAATCTAATAGTTGAATAA 9 95 1 ACCTTCCTTAAGGAAAATAATATCTTAATTTAA 10 103 1 GATTTCTCTTAGAAATAATGTATAACTATGGAA 11 134 1 ATAGATAAAGAAAAAAATGAAATCATTTGCCCA 11 245 1 ATATTGTAGTAAGAAATTTAAATTAGTAACAAA 11 277 1 ** ***** * ** MAP Score: 32.2422 Motif 2 GCTTTTGCAGAGTAAATAAGTATCAAATAATCATTGTATG 0 76 1 ATTTTACTCAAGTAAAGCAATATAACTAAAACTTATAATA 0 222 1 GTACTTAATTAACAACTTAATATCAATAAATTTTATAT 3 236 1 TTTTTTAAGTAATAAGTTAGTATTAATTAAGTATATGCTG 10 13 1 GAAATCTAATATTAAGTTACTTTTAAATAAAATACAAGTT 11 100 0 TGCGTCATGCAATAACGCAATAAAATAACAGAGCACTTTT 6 10 0 CAATACATCCATAAAATAACTAAAACAGTAATCAGTTTAG 6 98 0 TTACAGTAAAAAGAATGTAGTTTAAAATCAAACC 1 276 1 TTGCATCGTTAAAAATACACTAAAACTGCAAATAATTAAT 7 190 1 AAGCAATGAGAAAAATCAATTAATAAATAACATAACTAAT 8 160 1 AAACACAATTAACAACGAAATTAAACTAGATCTTAATTAC 1 165 1 ACGGTATTCAAAAAAACAACTTATAATTTATTTCTAGATC 2 158 1 AAATGCTTAAAATAATTAAATATAAGATGTAAATATATAG 8 43 1 AGCATACTTGACTAATTCAATTTAATTAATTATTGTTCCT 3 37 0 TGGTATCTAAATCAAAAGACTAACATTGTTATTATTTTTG 5 67 0 TATACGCACAATAAATAAAATTTGATTTTTCTTTCTCAAA 8 232 1 CCCATATTGTAGTAAGAAATTTAAATTAGTAACAAA 11 274 1 TTTTTTTACTACAAACAGAAAATTAATAAACACAATTAAC 1 138 1 ATTTTCCTTAAGGAAGGTAGAATAAAACAAAATTGGGGAA 10 81 0 ATACAACGCTAATAATAAACAAAAAGAAAACGAGGAATAT 2 256 1 TTATATATGCATAAATCGATATTAAAACTAAGCAAATGCT 8 10 1 TTAAGTTGTTAATTAAGTACTATAACATAATATTTTATTC 3 216 0 AAATATTCATAGCAATGAAAATAAAATCTAATAGTTGAAT 9 86 1 TATATTATAAACTTATCAATTAAGATATAAGTTTGAGAAA 8 263 0 TACATAGTAAAGAAATGAAGATTTAATCTTATACGCACAA 8 203 1 TGTCTCCAATAGCAAGTTACAAATAATAATTATTTATATT 7 263 0 ATGTTATTGCATCAATTGAGAAACAAACGTGTTGTCATAA 6 151 0 TCTAGGAAGCATATAGACAATATTAGTATTGTCTTAAGTT 4 49 0 ACATATATTAAAAAAGAGAAATAAACTAGTAACTTGTTCT 1 48 1 GTACAACAAGATTTATTCACTTTAAAAGATATATTTTTTT 1 105 1 TTATCACTGTATCTAAAAAATTAAAAAACTAGACCATGTA 11 43 1 TATATACCACAACTAAATAATTATAGATTTATAA 4 276 1 ACTAGATCTTAATTACAAAGTTATAAATGTATATAGAGCT 1 189 1 TGCTATTATAAAATATATAAAATAAATGATTT 9 129 1 * ** * *** * * * MAP Score: 28.4286 Motif 3 GCACTATATCAAATAAAAAGTCATAATACAATAATTAAAG 2 17 1 TAATAATTAAAAATACTAAATACTATTTAAACCGTAAATA 4 149 0 ACGGTATTCAAAAAAACAACTTATAATTTATTTCTAGATC 2 158 1 AAGTTCTTTTAAAGAGAAAATGCTTATGAATATTTATTTC 9 46 1 AGCAAGTTACAAATAATAATTATTTATATTTAATACAGAA 7 253 0 TTTGAGAAAGAAAAATCAAATTTTATTTATTGTGCGTATA 8 232 0 TTATGCTAGCAAAAAATAATTTTTTGTGCTAGAAGTTCTT 9 14 1 ATAGCAATGAAAATAAAATCTAATAGTTGAATAATTGCTA 9 94 1 CTTTAGAATAAAATATTATGTTATAGTACTTAATTAACAA 3 211 1 TAAAACTGCAAATAATTAATTTTTGATTATATAATAGGCT 7 210 1 ATAGTAAAGAAATGAAGATTTAATCTTATACGCACAATAA 8 206 1 AAGCAATGAGAAAAATCAATTAATAAATAACATAACTAAT 8 160 1 TGACACCTTAAATTAAGATATTATTTTCCTTAAGGAAGGT 10 103 0 AGTCTCATACAATGATTATTTGATACTTATTTACTCTGCA 0 81 0 AGTGCTTTTAAAAGAAATAATAATCGTTATTAAAGCTCTA 1 222 0 TTTTTTAAGTAATAAGTTAGTATTAATTAAGTATATGCTG 10 13 1 AATTCAATTTAATTAATTATTGTTCCTTGAATTTTCAAGG 3 24 0 ATAAATCTATAATTATTTAGTTGTGGTATATATTCTGATA 4 268 0 CTTTTACAGTAAAAAGAATGTAGTTTAAAATCAAACC 1 273 1 ATACTTTTTTAAAAAGCTTATTTTAATCTTGATGCAGAAA 7 67 1 ACTAGATCTTAATTACAAAGTTATAAATGTATATAGAGCT 1 189 1 ATTCACTTTAAAAGATATATTTTTTTACTACAAACAGAAA 1 119 1 TGCATAAGCTAATAAAAATTTTTTAAAGGTTAATAAAATT 6 193 0 GATCAACTGCAAAAAGATAGTAGTTCACATCAAGAGGAAC 3 151 0 CAAAAAAGTTATTATCAAACACCCAAGTAAA 7 1 1 CTAGCTTAGGAATGATATTTTACTCAAGTAAAGCAATATA 0 206 1 TATAGTACTTAATTAACAACTTAATATCAATAAATTTTAT 3 232 1 TTTTTACTACAAACAGAAAATTAATAAACACAATTAACAA 1 140 1 AAATCATTTATTTTATATATTTTATAATAGC 9 130 0 AAATGCTTAAAATAATTAAATATAAGATGTAAATATATAG 8 43 1 *** * ** * * * * MAP Score: 26.421 Motif 4 ATACTTAACTTTTACAGTAAAAAGAATGTAGTTTAAAATCAAACC 1 265 1 AATAATTATTTATATTTAATACAGAATTAAGCCTATTATATAATC 7 234 0 TTGCAAATAATATAATTAATAGAAAAGCAATGAGAAAAATCAATT 8 136 1 ATTTCAAATATTCATAGCAATGAAAATAAAATCTAATAGTTGAAT 9 81 1 TATATGAAGATCAACTGCAAAAAGATAGTAGTTCACATCAAGAGG 3 154 0 TCTTTTGATTTAGATACCATTGACAATGGATGGTATAACATCTTT 5 88 1 ATATGAAACTTGTATTTTATTTAAAAGTAACTTAATATTAGATTT 11 94 1 AGAAAATTAATAAACACAATTAACAACGAAATTAAACTAGATCTT 1 154 1 TATCACTGTATCTAAAAAATTAAAAAACTAGACCATGTAGTCAAG 11 44 1 AAAAATTTTTTAAAGGTTAATAAAATTGGATGTTATTGCATCAAT 6 175 0 AAAAGATAGTTTTATTTAAATAATATGGTATCGCAATTTCCACAC 8 93 0 TCTACCTTCCTTAAGGAAAATAATATCTTAATTTAAGGTGTCATC 10 100 1 AGTAAAGCAATATAACTAAAACTTATAATAGATTAATCAGCTTTT 0 232 1 CAGCACTATATCAAATAAAAAGTCATAATACAATAATTAAAGGGC 2 15 1 AATATAGAATACAACGCTAATAATAAACAAAAAGAAAACGAGGAA 2 248 1 AATAATTGCTATTATAAAATATATAAAATAAATGATTT 9 123 1 AATGAGAAAAATCAATTAATAAATAACATAACTAATTTTTACATA 8 164 1 CAACAACACCATTAGAAAAAACATATATGATATCAGAATATATAC 4 238 1 GCAGTTGATCTTCATATAATAATCATTCTACTTTAGAATAAAATA 3 181 1 TGCGTCATGCAATAACGCAATAAAATAACAGAGCACTTTT 6 5 0 TAATTATATAAAAACTCAAATGATATGGAAACATATATTAAAAAA 1 18 1 GAAATTAAACTAGATCTTAATTACAAAGTTATAAATGTATATAGA 1 181 1 AACAGTGCTTTTAAAAGAAATAATAATCGTTATTAAAGCTCTATA 1 220 0 TCGATTAGAGAACAGCATATACTTAATTAATACTAACTTATTACT 10 20 0 GTACTTAATTAACAACTTAATATCAATAAATTTTATAT 3 236 1 TTATATATGCATAAATCGATATTAAAACTAAGCAAATGCTTAAAA 8 10 1 ATTTTCTGTTTGTAGTAAAAAAATATATCTTTTAAAGTGAATAAA 1 116 0 AAGCCTATTATATAATCAAAAATTAATTATTTGCAGTTTTAGTGT 7 206 0 AGAGTAAATAAGTATCAAATAATCATTGTATGAGACTAAGGTATT 0 84 1 ACTATATATTTACATCTTATATTTAATTATTTTAAGCATTTGCTT 8 39 0 AAATTTCTATATTATAAACTTATCAATTAAGATATAAGTTTG 8 268 0 TATTTGCAGTTTTAGTGTATTTTTAACGATGCAAACAATTAAAGA 7 179 0 CCCATATTGTAGTAAGAAATTTAAATTAGTAACAAA 11 274 1 AATATATACCACAACTAAATAATTATAGATTTATAA 4 274 1 * * *** * ** * * MAP Score: 25.5298 Motif 5 CAACAAGCCCTTTAATTATTGTATTATGAC 2 36 0 ACATCTTATATTTAATTATTTTAAGCATTT 8 43 0 ATTTAGTATTTTTAATTATTATACTGTGCA 4 168 1 TTATAAATCTATAATTATTTAGTTGTGGT 4 281 0 TATTCTAGCTTTTGATTATTATCTCACGCG 5 24 1 ATAATCAAAAATTAATTATTTGCAGTTTTA 7 210 0 ATTCAATTTAATTAATTATTGTTCCTTGAA 3 33 0 ATTAAATATAAATAATTATTATTTGTAACT 7 259 1 GGTCTAGTTTTTTAATTTTTTAGATACAGT 11 48 0 TCTAAAGTAGAATGATTATTATATGAAGAT 3 188 0 ATAAATAAAATTTGATTTTTCTTTCTCAAA 8 242 1 AGTCTCATACAATGATTATTTGATACTTAT 0 91 0 AAAATCAAATTTTATTTATTGTGCGTATAA 8 231 0 GCTAGCAAAAAATAATTTTTTGTGCTAGAA 9 18 1 TCGTTTTCTTTTTGTTTATTATTAGCGTTG 2 259 0 GTATAACATCTTTAATTAATCAAATTTTGG 5 120 1 TTGCAAATAATATAATTAATAGAAAAGCAA 8 136 1 TTATTTATTAATTGATTTTTCTCATTGCTT 8 160 0 CTTTAAAAGATATATTTTTTTACTACAAAC 1 124 1 AATGCTTATGAATATTTATTTCAAATATTC 9 64 1 TGATATCATATATGTTTTTTCTAATGGTGT 4 243 0 AAAAACAACTTATAATTTATTTCTAGATCC 2 169 1 AATAATTATTTATATTTAATACAGAATTAA 7 249 0 AAATCATTTATTTTATATATTTTATA 9 135 0 ATTCCCCAATTTTGTTTTATTCTACCTTCC 10 80 1 ACTATAACATAATATTTTATTCTAAAGTAG 3 208 0 ********** MAP Score: 25.0308 Motif 6 GATATCAGAATATATACCACAACTAAATAATTATAGATTTA 4 266 1 TAGAGATAGATAAAGAAAAAAATGAAATCATTTGCCCATAT 11 240 1 CTTAATTCTGTATTAAATATAAATAATTATTATTTGTAACT 7 248 1 AATCAATTAATAAATAACATAACTAATTTTTACATAGTAAA 8 173 1 AAAGAAAACGTATCAAGAAAATGGAATTTATACTTTTTTAA 7 38 1 TTTAATCTTATACGCACAATAAATAAAATTTGATTTTTCTT 8 224 1 TTTATCACTGTATCTAAAAAATTAAAAAACTAGACCATGTA 11 42 1 TAATTGCTATTATAAAATATATAAAATAAATGATTT 9 125 1 AGTTGTTAATTAAGTACTATAACATAATATTTTATTCTAAA 3 212 0 CAAATATTCATAGCAATGAAAATAAAATCTAATAGTTGAAT 9 85 1 TAAACACAATTAACAACGAAATTAAACTAGATCTTAATTAC 1 164 1 TTAAAATAATTAAATATAAGATGTAAATATATAGTAGTAAG 8 49 1 CCATGTAGTCAAGTCACGATATGAAACTTGTATTTTATTTA 11 76 1 AAGGAACAATAATTAATTAAATTGAATTAGTCAAGTATGCT 3 36 1 ACAACGCTAATAATAAACAAAAAGAAAACGAGGAATATT 2 258 1 CACAAGTCATTATATAACATATCGTATATTTCACATATCAT 4 196 1 TTACTCAAGTAAAGCAATATAACTAAAACTTATAATAGATT 0 225 1 GTGCACAGTATAATAATTAAAAATACTAAATACTATTTAAA 4 158 0 TAAATCACCGAATAAAGGAGATAAAACAGGTCCACACTGGA 2 205 1 TAGTTTTATCTAGGAAGCATATAGACAATATTAGTATTGTC 4 56 0 GCTTCTAGCTTAGGAATGATATTTTACTCAAGTAAAGCAAT 0 202 1 CTACCTTCCTTAAGGAAAATAATATCTTAATTTAAGGTGTC 10 101 1 AGCAGCACTATATCAAATAAAAAGTCATAATACAATAATTA 2 13 1 TTGTCCACGGTATTCAAAAAAACAACTTATAATTTATTTCT 2 152 1 GCAGAGTAAATAAGTATCAAATAATCATTGTATGAGACTAA 0 82 1 ACGCGTGAGATAATAATCAAAAGCTAGAATAGAACATAAAA 5 14 0 TTTCTGTTTGTAGTAAAAAAATATATCTTTTAAAGTGAATA 1 118 0 ** * * ** ** * * MAP Score: 23.0939 Motif 7 TCATTGCTTTTCTATTAATTATATTATTTGCAAAAGA 8 132 0 AACTTATATCTTAATTGATAAGTTTATAATATAGAAA 8 270 1 AAGCTCTATATACATTTATAACTTTGTAATTAAGATC 1 193 0 GGCAAATGATTTCATTTTTTTCTTTATCTATCTCTAA 11 239 0 AAACTTATAATAGATTAATCAGCTTTTGTCTATCCTT 0 250 1 TATAACATCTTTAATTAATCAAATTTTGGGAGAAAAT 5 121 1 AGTTATGTTATTTATTAATTGATTTTTCTCATTGCTT 8 160 0 TTTCTTTTTGTTTATTATTAGCGTTGTATTCTATATT 2 248 0 ATGTACGCTTTGCATTCTTACTATTGTAACTTGCGCA 7 138 0 CTTAAGTTTGTGCATTGTTCATTTTTTCTGTAATCTG 4 20 0 CTTGACTAATTCAATTTAATTAATTATTGTTCCTTGA 3 34 0 TCTTTTAAAGTGAATAAATCTTGTTGTACAACCAATT 1 97 0 AAGTGCTCTGTTATTTTATTGCGTTATTGCATGACGC 6 12 1 CAACAAGCCCTTTAATTATTGTATTATGACTTTTTAT 2 29 0 ATCTAATAGTTGAATAATTGCTATTATAAAATATATA 9 111 1 TTATAAATCTATAATTATTTAGTTGTGGTATATATT 4 274 0 AATTAAGATCTAGTTTAATTTCGTTGTTAATTGTGTT 1 166 0 AATTCTGTATTAAATATAAATAATTATTATTTGTAAC 7 251 1 ACAGCGACAATGCATTCTATGCATTGTTCTGGGGGCA 2 86 1 AAATCATTTATTTTATATATTTTATAATAGCAA 9 128 0 AGTTATAATGTTATTACATGAATTTATCACTGTATCT 11 20 1 AACAAGTTACTAGTTTATTTCTCTTTTTTAATATATG 1 49 0 CTACATGGTCTAGTTTTTTAATTTTTTAGATACAGTG 11 47 0 AGATGACACCTTAAATTAAGATATTATTTTCCTTAAG 10 109 0 GAATTTATACTTTTTTAAAAAGCTTATTTTAATCTTG 7 61 1 TTTATTCACTTTAAAAGATATATTTTTTTACTACAAA 1 116 1 ACTTGGGTGTTTGATAATAACTTTTTTG 7 1 0 TTGATAAACTTCAAAAATTTGCGTTGTTGTTCTACAA 3 76 1 AATCAAAAATTAATTATTTGCAGTTTTAGTGTATTTT 7 201 0 TCCACGGTATTCAAAAAAACAACTTATAATTTATTTC 2 155 1 ATTTGCTTAGTTTTAATATCGATTTATGCATATATAA 8 10 0 GATTAATCTATTATAAGTTTTAGTTATATTGCTTTAC 0 233 0 ATTAACAACTTAATATCAATAAATTTTATAT 3 243 1 TATTTACATCTTATATTTAATTATTTTAAGCATTTGC 8 41 0 ACGGTTTAAATAGTATTTAGTATTTTTAATTATTATA 4 154 1 * *** ** **** MAP Score: 22.5216 Motif 8 CAACAAGCCCTTTAATTATTGTATTATGACTTTTTATTTGATA 2 23 0 TGATTACTGTTTTAGTTATTTTATGGATGTATTGAACATAAGT 6 104 1 ACATCTTATATTTAATTATTTTAAGCATTTGCTTAGTTTTAAT 8 30 0 AAAATCAAATTTTATTTATTGTGCGTATAAGATTAAATCTTCA 8 218 0 TTATTTACGGTTTAAATAGTATTTAGTATTTTTAATTATTATA 4 148 1 AATCATTTATTTTATATATTTTATAATAGCAATTATTCAACTA 9 117 0 GATAGTTTTATTTAAATAATATGGTATCGCAATTTCCACACTA 8 91 0 TTTTTAATTTTTTAGATACAGTGATAAATTCATGTAATAACAT 11 27 0 AGTCTTTTGATTTAGATACCATTGACAATGGATGGTATAACAT 5 86 1 ATTCAATTTAATTAATTATTGTTCCTTGAATTTTCAAGGCTTA 3 20 0 ACAAATAATAATTATTTATATTTAATACAGAATTAAGCCTATT 7 242 0 CTATGTAAAAATTAGTTATGTTATTTATTAATTGATTTTTCTC 8 167 0 AGATGACACCTTAAATTAAGATATTATTTTCCTTAAGGAAGGT 10 103 0 TGCACAAGTCATTATATAACATATCGTATATTTCACATATCAT 4 194 1 GTTAATTGTGTTTATTAATTTTCTGTTTGTAGTAAAAAAATAT 1 135 0 TTTCTCTTTTTTAATATATGTTTCCATATCATTTGAGTTTTTA 1 26 0 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TGACTTGTGCACAGTATAATAATTAAAAATACT 4 172 0 CAACACCATTAGAAAAAACATATATGATATCAG 4 241 1 AAAAGCTAGAATAGAACATAAAAACTG 5 4 0 CACGCGTGAGATAATAATCAAAAGCTAGAATAG 5 23 0 TCGCTGAATCACAACAGAGAAATTGCGTCATGC 6 40 0 ATGATCCAGTAAAATACTAAACTGATTACTGTT 6 82 1 TGCATCGTTAAAAATACACTAAAACTGCAAATA 7 191 1 GCAAATGCTTAAAATAATTAAATATAAGATGTA 8 41 1 AAAAGCAATGAGAAAAATCAATTAATAAATAAC 8 158 1 TAATTTTTACATAGTAAAGAAATGAAGATTTAA 8 196 1 TCTTATACGCACAATAAATAAAATTTGATTTTT 8 229 1 AACTTCTAGCACAAAAAATTATTTTTTGCTAGC 9 18 0 TTGCTATTATAAAATATATAAAATAAATGATTT 9 128 1 GGAAGGTAGAATAAAACAAAATTGGGGAATAGT 10 77 0 CACTGTATCTAAAAAATTAAAAAACTAGACCAT 11 47 1 ATAGATAAAGAAAAAAATGAAATCATTTGCCCA 11 245 1 * **** * **** MAP Score: 8.35232 Motif 10 CCGCTTTTGCAGAGTAAATAAGTATCAAATAATCA 0 74 1 TACTCAAGTAAAGCAATATAACTAAAACTTATAAT 0 226 1 TTTACTACAAACAGAAAATTAATAAACACAATTAA 1 142 1 AATTCAAGGAACAATAATTAATTAAATTGAATTAG 3 31 1 ATATTATGTTATAGTACTTAATTAACAACTTAATA 3 223 1 TGGATGGTATAACATCTTTAATTAATCAAATTTTG 5 114 1 ATGCAATAACATCCAATTTTATTAACCTTTAAAAA 6 179 1 ATACACTAAAACTGCAAATAATTAATTTTTGATTA 7 204 1 TTAATTCTGTATTAAATATAAATAATTATTATTTG 7 249 1 CTAAGCAAATGCTTAAAATAATTAAATATAAGATG 8 37 1 TTGCGATACCATATTATTTAAATAAAACTATCTTT 8 102 1 TATCTTTTGCAAATAATATAATTAATAGAAAAGCA 8 130 1 AAAAGCAATGAGAAAAATCAATTAATAAATAACAT 8 158 1 ATCAATTAATAAATAACATAACTAATTTTTACATA 8 174 1 TTAATCTTATACGCACAATAAATAAAATTTGATTT 8 225 1 ATTATAAAATATATAAAATAAATGATTT 9 133 1 TGTAGTAAGAAATTTAAATTAGTAACAAA 11 281 1 * ** **** *** MAP Score: 8.25288