AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i RP/RP_profile002_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239165 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 RP053 300 ADP,ATP CARRIER PROTEIN (tlc1) #1 RP054 72 GLYCEROL-3-PHOSPHATE TRANSPORTER (glpT) #2 RP055 162 NUCLEOSIDE DIPHOSPHATE KINASE (ndk) #3 RP379 300 3-DEOXY-MANNO-OCTULOSONATE CYTIDYLYLTRANSFERASE (kdsB) #4 RP382 300 unknown #5 RP384 141 PROLYL-TRNA SYNTHETASE (proS) #6 RP425 150 unknown #7 RP427 121 PETR PROTEIN (ompR) #8 RP476 300 LIPOPOLYSACCHARIDE 1,2-GLUCOSYLTRANSFERASE (rfaJ) #9 RP477 68 ADP,ATP CARRIER PROTEIN (tlc3) #10 RP478 103 unknown #11 RP479 77 OCTAPRENYL-DIPHOSPHATE SYNTHASE (ispB) #12 RP501 215 TRNA PSEUDOURIDINE 55 SYNTHASE (truB) #13 RP503 21 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 (rpsO) #14 RP504 154 POLYRIBONUCLEOTIDE NUCLEOTIDYLTRANSFERASE (pnp) #15 RP746 52 ENDONUCLEASE III (nth) Motif 1 TATTTTATATTTTAGATGTTGCTTTA 6 134 0 GTGTCTATCAATTTTGCATTTTATATCATATATTC 12 190 1 ACCTATACCCAATTTCTATTATTAAAAATTAAAAT 4 82 1 GTTAAAAAATAATTTTAATTGTTAATTTAAAAAAT 4 187 0 TTTTAAAAACAACTTAGATTATTAATGAATAATCA 8 146 0 TGCTCTTTTTATTTTGAATTGTTAAAATTTGTACA 8 255 1 TTTTTACTTAATTTTGATTTCTATATATTAACTGT 0 145 0 CCTGATATAAATATTATTTTCTAAAATACACTTTC 15 16 1 TAAAACCTGAATCTTACTTTTTATAGTTGAGGAGA 1 38 1 TATAAAGAGGAATTTGAATTGGAGACATCACATAC 2 85 0 AGTTATATTTATATTAGATTAGAAACTCATCCCGT 7 12 1 ATTGCAAGAAAAATTAGATTTTAGTAAAACAAGTA 10 41 0 CTCATTTCATAATTTATATTCTATTAAAGATATCA 14 121 0 ACTTAATCTCATATTGCAATATATATAATGAGATC 14 69 0 CTATTATTAAAAATTAAAATATTGATACTGATATA 4 97 1 TAAATCTAATAATTTATTATATATAAAGGTTATAA 2 135 1 GTCAACAATTATTTTTTAATTTTAAATATAGGCAG 3 272 1 AGTTCACTAAATTTTCATTTAGTTAGTTAACAGTT 0 116 1 AATTTAGTGAACTTTAAATTGTAAAGGCTTATTTG 0 94 0 CTCTGTGTTAAAATTTATATCTTGAGCCTATAAAA 2 13 1 TTTATAGGTTATATTTAATTTTTTTGTAATC 4 279 1 AATTAAGTAAAAATTGTTTTCTTTTTCACATCCTA 0 167 1 GAAGTCAAACAAATTGATTTTTTCTAGAAAGAACT 0 223 0 AAAAATTTTTACTTTAAATTTTTTAAATTAACAAT 4 170 1 CTTATACCGCAACTTAAATTAGTGTAAGCACGTAA 14 23 1 TTACATATTAAAGTTAACTTTTAAATCGCTTAAGT 9 30 0 ATATTGCTATAGAAAGTGTATTTTA 15 37 0 AACAGCATAAAACTTATTATCGTGACTAAATACTT 4 45 1 AGTAAAACATATTTTTGAATATATTCAATATTCGA 3 214 0 GTATGGGATGAAATTTTAATATTTTACCTTCAATA 0 21 1 AATTAAATTTTCTATTTATTTGAAGATAAA 0 280 0 AAAATTGTTTTAGTTTAATAATTTTC 5 125 0 TAAAATTTGTACATTAATTTTGATAAAATATAA 8 277 1 ATTTAAAAATATTTTTCCTTTGATAAGGTACATAA 4 233 0 TTAAAGTAAAAATTTTTTATAGAATGTTATTCATT 4 152 0 ** ** *** ** * MAP Score: 31.7862 Motif 2 AAATAAGCCTTTACAATTTAAAGTTCACTAAATTT 0 95 1 TATAAAAAATTTTTACTTTAAATTTTTTAAATTAA 4 166 1 TTGTTAAAATTTGTACATTAATTTTGATAAAATAT 8 273 1 TATTGTAACCTTACATATTAAAGTTAACTTTTAAA 9 40 0 GATATACTCGTTTAATTTTAAAATTGGCTAAGTTG 12 76 1 ATAATGCTCCTTGCATTATAAACTTTTTGCTCTTG 12 142 1 AAAGTGTATTTTAGAAAATAATATTTATATCAGGT 15 15 0 CTATCATATATTTTAGTATAATGTTTATCTTCAAA 0 257 1 TATATGACTGTTAAAAAATAATTTTAATTGTTAAT 4 196 0 CGTGAGCTATTTATAGGTTATATTTAATTTTTTTG 4 270 1 CTGTCAACAATTATTTTTTAATTTTAAATATAGGC 3 270 1 AAGAAAACAATTTTTACTTAATTTTGATTTCTATA 0 155 0 TTGTATGGGATGAAATTTTAATATTTTACCTTCAA 0 19 1 AAAATTGTTTTAGTTTAATAATTTTCCTATTA 5 119 0 TTGGCTAGAATTATATATTAAAGATTTTCTACATT 12 32 1 ATGCTGTTTCTTGTAGTTTGATATTGAATTGTGAT 4 18 0 CTTTGCTCTTTTTAAAATTGATCTTCATATTGCTA 3 100 0 GCTCACGGTATTTAAAAATATTTTTCCTTTGATAA 4 242 0 TTTGTTTATTTTTATGCATAAAATTATACGGAATG 6 26 0 AGCAATCTCATGAAATAATAAAATTTATTAGATTG 5 53 1 AACCTGAATCTTACTTTTTATAGTTGAGGAGAGTT 1 41 1 ATGTATGATTTGCTAGTTTATAATTGCAAGAAAAA 10 63 0 AGCCTCTCCTTTTTCTTTTAATTTTGTATCAAAAA 8 106 1 TGACCACGGGTTCAAAATTATTAATATCATAGTTG 7 70 0 TATCAATATTTTAATTTTTAATAATAGAAATTGGG 4 89 0 AATATTTTGATTATTCATTAATAATCTAAGTTGTT 8 139 1 ATGGCTACGTTGTCTTAATAAAGTTTGTAGTTTTT 3 167 0 GAATAACAACTTTAATAATGTTTTTTGTTTATTTT 6 49 0 TAAAAATTTTTTATAGAATGTTATTCATTCTAGGT 4 146 0 ** * ***** ** MAP Score: 30.9566 Motif 3 CAAATTCCTCTTTATAAGATAGTTTATGCAGTAAATC 2 104 1 TTTATCTCATTTCATAATTTATATTCTATTAAAGATA 14 124 0 TATTTTTCCTTTGATAAGGTACATAATCTATATGACT 4 222 0 TGATTATTCATTAATAATCTAAGTTGTTTTTAAAAAA 8 146 1 TTGTTTTAGTTTAATAATTTTCCTATTATTATAAGGA 5 110 0 AATAACAACTTTAATAATGTTTTTTGTTTATTTTTAT 6 46 0 CTACGTTGTCTTAATAAAGTTTGTAGTTTTTTGTGTT 3 161 0 TTTAGTCACGATAATAAGTTTTATGCTGTTTCTTGTA 4 38 0 TGCTCCTTGCATTATAAACTTTTTGCTCTTGTTGAAA 12 146 1 TTGTGCATATTTTAAAAAGTACATAATTTGAAGCCTC 8 75 1 CTCACGGTATTTAAAAATATTTTTCCTTTGATAAGGT 4 239 0 TATATTTAAAATTAAAAAATAATTGTTGACAGATTAG 3 265 0 ATTATTAAAAATTAAAATATTGATACTGATATACTAT 4 99 1 TTAATGAATAATCAAAATATTTTTGATACAAAATTAA 8 123 0 CTAAGTTGTCTTAATAAGCTCTGTAGTACTCATGCAT 12 103 1 CATTCCTCAATTGATAAACTCTTTGCTCTTTTTAAAA 3 118 0 CATCCTATAGTTAATAAAATGTTTATTGAGTTCTTTC 0 195 1 ATGAAGCAATCTAATAAATTTTATTATTTCATGAGAT 5 57 0 AGATTCAGGTTTTAGAAGCTTTTTTATATTTTTTTAC 1 15 0 TTTAATTGACTTTAAAACTTAAGCGATTTAAAAGTTA 9 14 1 CTAAGTTGTTTTTAAAAAATACACTATAGACTAGTGG 8 164 1 TGACTGTTAAAAAATAATTTTAATTGTTAATTTAAAA 4 190 0 AATAACATTCTATAAAAAATTTTTACTTTAAATTTTT 4 156 1 ACCTTTATATATAATAAATTATTAGATTTACTGCATA 2 128 0 TTTTCTTGCAATTATAAACTAGCAAATCATACATCAA 10 64 1 TATTTTATATTTTAGATGTTGCTTTATAGA 6 130 0 TTCAAAATTATTAATATCATAGTTGTTTTTGGCTTTC 7 58 0 TTATAATTGCAAGAAAAATTAGATTTTAGTAAAACAA 10 44 0 ATAAAATCGAATCATAACTTATATCTATGTACTGCAG 2 42 1 ATTGTGGATAATCATATGCTACTTGTTTTACTAAAAT 10 22 1 ** **** ** * * MAP Score: 30.4194 Motif 4 ATATATAGAAATCAAAATTAAGTAAAAATTG 0 152 1 TTATATTTTATCAAAATTAATGTACAAATT 8 280 0 ATTTCTATTATTAAAAATTAAAATATTGATA 4 93 1 TTAATTGACTTTAAAACTTAAGCGATTTAAA 9 15 1 CTTAAGCGATTTAAAAGTTAACTTTAATATG 9 31 1 AAGAAACAGCATAAAACTTATTATCGTGACT 4 41 1 TCATGAAATAATAAAATTTATTAGATTGCTT 5 60 1 TATATGACTGTTAAAAAATAATTTTAATTGT 4 200 0 ATATTTAAAATTAAAAAATAATTGTTGACAG 3 270 0 AATCTCTGTGTTAAAATTTATATCTTGAGCC 2 10 1 CTCCTCAACTATAAAAAGTAAGATTCAGGTT 1 41 0 TGACCACGGGTTCAAAATTATTAATATCATA 7 74 0 AATTTTATGCATAAAAATAAACAAAAAACAT 6 36 1 CTTAGCCAATTTTAAAATTAAACGAGTATAT 12 77 0 GAATTTAGCAATAAAAAATATC 11 65 1 ATTTTAACAATTCAAAATAAAAAGAGCAAAT 8 252 0 CAAATCATACATCAATGTTAATTTAAA 10 86 1 CAATATGAAGATCAATTTTAAAAAGAGCAAA 3 103 1 TTAATTTTGTATCAAAAATATTTTGATTATT 8 123 1 ATTGAATATATTCAAAAATATGTTTTACTTT 3 220 1 TTACAAAAAAATTAAATATAACCTATAAATA 4 277 0 TGATACAAAATTAAAAGAAAAAGGAGAGGCT 8 106 0 AAAACCTGATATAAATATTATTTTCTAAAAT 15 12 1 ATTTAGTTAGTTAACAGTTAATATATAGAAA 0 132 1 ATTTTTTAAATTAACAATTAAAATTATTTTT 4 187 1 AGATTGCTTCATCAAAACTAATGGTTTTTCC 5 82 1 TATGTACCTTATCAAAGGAAAAATATTTTTA 4 234 1 TAGGAAAATTATTAAACTAAAACAATTTT 5 122 1 TTAGTGAACTTTAAATTGTAAAGGCTTATTT 0 95 0 ATTTAAAAAATTTAAAGTAAAAATTTTTTAT 4 167 0 TTTATATTCTATTAAAGATATCATTCAGTAA 14 113 0 GCTCACGGTATTTAAAAATATTTTTCCTTTG 4 246 0 AATGTTTATCTTCAAATAAATAGAAAATTTA 0 276 1 ****** **** MAP Score: 26.3802 Motif 5 TTTCGGCGATAAAGTAAAACATATTTTTGAATA 3 228 0 CCTATATTTAAAATTAAAAAATAATTGTTGACA 3 271 0 AGCAACATCTAAAATATAAAATA 6 137 1 CTATTATTAAAAATTAAAATATTGATACTGATA 4 97 1 GATTACAAAAAAATTAAATATAACCTATAAAT 4 278 0 AATTTGTAAAAAAATATAAAAAAGCTTCTAAAA 1 10 1 ATTCAATATCAAACTACAAGAAACAGCATAAAA 4 24 1 TTTTGATACAAAATTAAAAGAAAAAGGAGAGGC 8 107 0 GTATGGGATGAAATTTTAATATTTTACCTTCAA 0 21 1 GAAAATTATTAAACTAAAACAATTTT 5 125 1 ACATTATACTAAAATATATGATAGAAGTCAAAC 0 248 0 TTGTTTTTAAAAAATACACTATAGACTAGTGGG 8 169 1 ATTAATGTACAAATTTTAACAATTCAAAATAAA 8 262 0 CATATTTTAAAAAGTACATAATTTGAAGCCTCT 8 80 1 TTTAATTGTTAATTTAAAAAATTTAAAGTAAAA 4 176 0 AAATGTAGAAAATCTTTAATATATAATTCTAGC 12 35 0 AAACAGATCGAATATTGAATATATTCAAAAATA 3 207 1 GCAATCTAATAAATTTTATTATTTCATGAGATT 5 56 0 TATATGATATAAAATGCAAAATTGATAGACACA 12 189 0 TTTATGCATAAAAATAAACAAAAAACATTATTA 6 39 1 CTCAAGATATAAATTTTAACACAGAGATT 2 6 0 TTTACAATTTAAAGTTCACTAAATTTTCATTTA 0 104 1 *** ** ** *** MAP Score: 23.1263 Motif 6 GACAATACAAAATATTGAAGGTAAAATATTAAAATTTCATCCC 0 25 0 TATGACAACTAATACTGGAATTTAGCAATAAAAAATATC 11 48 1 TCCTTATAATAATAGGAAAATTATTAAACTAAAACAATTTT 5 110 1 AATTCCTCTTTATAAGATAGTTTATGCAGTAAATCTAATAATT 2 106 1 TACTTTTACCTATACCCAATTTCTATTATTAAAAATTAAAATA 4 75 1 TTAACAGTCATATAGATTATGTACCTTATCAAAGGAAAAATAT 4 217 1 GAATAATCAAAATATTTTTGATACAAAATTAAAAGAAAAAGGA 8 112 0 ATTATTCATTAATAATCTAAGTTGTTTTTAAAAAATACACTAT 8 148 1 CTAGTGGGAATATAGTTATCGTGTCCTAAGAAAATCGGTATTG 8 194 1 TATATTTTAGTATAATGTTTATCTTCAAATAAATAGAAAATTT 0 263 1 GAATATATTCAATATTCGATCTGTTTAAAGAATGGCTACGTTG 3 190 0 AAACTGCCTATATTTAAAATTAAAAAATAATTGTTGACAGA 3 269 0 TTTTACTTTAAATTTTTTAAATTAACAATTAAAATTATTTTTT 4 176 1 TATGCATAAAAATAAACAAAAAACATTATTAAAGTTGTTATTC 6 41 1 CTCATGCATTAATAATGCTCCTTGCATTATAAACTTTTTGCTC 12 131 1 GATTGCAAGCAATAGCCGATCTTTACCTTGAATAAGATTAAGG 8 19 0 TTTTATAACCTTTATATATAATAAATTATTAGATTT 2 136 0 TGTGGATAATCATATGCTACTTGTTTTACTAAAATCTAATTTT 10 24 1 ACAGTTAATATATAGAAATCAAAATTAAGTAAAAATTGTTTTC 0 145 1 ATAAAATGTTTATTGAGTTCTTTCTAGAAAAAATCAATTTGTT 0 208 1 ATTTATATTCTATTAAAGATATCATTCAGTAATCATCAAACAC 14 102 0 TATACTAAAATATATGATAGAAGTCAAACAAATTGATTTTTTC 0 234 0 AATTTGTAAAAAAATATAAAAAAGCTTCTAAAA 1 0 1 GAATATATGATATAAAATGCAAAATTGATAGACA 12 191 0 CATTTTATTAACTATAGGATGTGAAAAAGAAAACAATTTTTAC 0 173 0 TCTGTGTTAAAATTTATATCTTGAGCCTATAAAATCGAATCAT 2 14 1 GACCCCAAGAAATATCAAATAAGCCTTTACAATTTAAAGTTCA 0 79 1 TCTTACTTTTTATAGTTGAGGAGAGTTTATAAT 1 49 1 **** * * * *** MAP Score: 22.7237 Motif 7 ATGTGAAAAAGAAAACAATTTTTACTTAATTTT 0 165 0 CCTATAGTTAATAAAATGTTTATTGAGTTCTTT 0 198 1 ATATATTTTAGTATAATGTTTATCTTCAAATAA 0 262 1 AATTAAATTTTCTATTTATTTGA 0 287 0 TTTAGAAGCTTTTTTATATTTTTTTACAAATT 1 9 0 AAAACCTGAATCTTACTTTTTATAGTTGAGGAG 1 39 1 AATCTCTGTGTTAAAATTTATATCTTGAGCC 2 8 1 TTTTATAACCTTTATATATAATAAA 2 147 0 TACGTTGTCTTAATAAAGTTTGTAGTTTTTTGT 3 164 0 GGCGATAAAGTAAAACATATTTTTGAATATATT 3 224 0 ATTTAAAATTAAAAAATAATTGTTGACAGATTA 3 266 0 AGAAACAGCATAAAACTTATTATCGTGACTAAA 4 42 1 ATAACATTCTATAAAAAATTTTTACTTTAAATT 4 157 1 AAATTAACAATTAAAATTATTTTTTAACAGTCA 4 194 1 CTCACGGTATTTAAAAATATTTTTCCTTTGATA 4 243 0 TTATAGGTTATATTTAATTTTTTTGTAATC 4 280 1 TCTCATGAAATAATAAAATTTATTAGATTGCTT 5 58 1 AATTGTTTTAGTTTAATAATTTTCCTATTATTA 5 116 0 ATAACAACTTTAATAATGTTTTTTGTTTATTTT 6 49 0 ACAACTATGATATTAATAATTTTGAACCCGTGG 7 69 1 TTATACTCATTTTACATCTCGTG 7 108 0 TAATTTTGTATCAAAAATATTTTGATTATTCAT 8 124 1 TATTTTGAATTGTTAAAATTTGTACATTAATTT 8 264 1 TAGAATTATATATTAAAGATTTTCTACATTTAA 12 37 1 GCTCCTTGCATTATAAACTTTTTGCTCTTGTTG 12 147 1 TCAAAACCTGATATAAATATTATTTTCTAAAAT 15 10 1 TTATTTTCTAAAATACACTTTCTATAGCAATAT 15 29 1 * ***** *** * MAP Score: 12.246 Motif 8 TTTCTAGAAAAAATCAATTTGTTTGACTTCTATCATATAT 0 228 1 ACAAAAAACTACAAACTTTATTAAGACAACGTAGCCATTC 3 164 1 ATATTCAAAAATATGTTTTACTTTATCGCCGAAAAAGGCT 3 227 1 TTTATCGCCGAAAAAGGCTAATCTGTCAACAATTATTTTT 3 248 1 AAACATTATTAAAGTTGTTATTCTGTATACCGTGGTCAAA 6 61 1 GTACCTGGTATCATATAGTAGTTTGACCACGGTATACAGA 6 82 0 GATTAGAAACTCATCCCGTGGTTTGACCACGAAAGCCAAA 7 28 1 TACTCATTTTACATCTCGTGGTTTGACCACGGGTTCAAAA 7 88 0 CATATTTTAAAAAGTACATAATTTGAAGCCTCTCCTTTTT 8 80 1 CCACTAGTCTATAGTGTATTTTTTAAAAACAACTTAGATT 8 161 0 GATATAGCGGTTAAGCTATAGTATGACAACTAATACTGGA 11 27 1 CATGAGTACTACAGAGCTTATTAAGACAACTTAGCCAATT 12 97 0 * * * * **** ** MAP Score: 7.63895 Motif 9 TGGGATGAAATTTTAATATTTTACCTTCAATA 0 24 1 TTAATTTTGATTTCTATATATTAACTGTTAAC 0 141 0 AAGAACTCAATAAACATTTTATTAACTATAGG 0 198 0 AAGTCAAACAAATTGATTTTTTCTAGAAAGAA 0 225 0 CTATCATATATTTTAGTATAATGTTTATCTTC 0 257 1 AATTAAATTTTCTATTTATTTGAAGATAAA 0 280 0 TAGAAGCTTTTTTATATTTTTTTACAAATT 1 8 0 ATAAGTTATGATTCGATTTTATAGGCTCAAGA 2 32 0 TTTTATAACCTTTATATATAATAAATTATTAG 2 140 0 CAGATCGAATATTGAATATATTCAAAAATATG 3 210 1 GCGATAAAGTAAAACATATTTTTGAATATATT 3 224 0 AGTATATCAGTATCAATATTTTAATTTTTAAT 4 102 0 AAATTTTTACTTTAAATTTTTTAAATTAACAA 4 172 1 TTAACAATTAAAATTATTTTTTAACAGTCATA 4 197 1 TCACGGTATTTAAAAATATTTTTCCTTTGATA 4 243 0 TATAGGTTATATTTAATTTTTTTGTAATC 4 281 1 ACTAATGGTTTTTCCTTATAATAATAGGAAAA 5 98 1 AAAATTGTTTTAGTTTAATAATTTTCCTA 5 122 0 TTAATAATGTTTTTTGTTTATTTTTATGCATA 6 41 0 TATTTTATATTTTAGATGTTGCTTT 6 135 0 TAATAAGACTTGTGCATATTTTAAAAAGTACA 8 66 1 AGCCTCTCCTTTTTCTTTTAATTTTGTATCAA 8 106 1 TTAACCGCTATATCCATATTTTGTGATCAGA 11 9 0 GTCTATCAATTTTGCATTTTATATCATATATT 12 192 1 ATTTGATCTCATTATATATATTGCAATATGAG 14 65 1 CAAAACCTGATATAAATATTATTTTCTAAAAT 15 11 1 *** ******* MAP Score: 4.51227 Motif 10 TGACCCCAAGAAATATCAAATAAGCCTTTAC 0 78 1 TAATATATAGAAATCAAAATTAAGTAAAAAT 0 150 1 CATTATACTAAAATATATGATAGAAGTCAAA 0 249 0 ATCTTCAAATAAATAGAAAATTTAATT 0 283 1 ATTTGTAAAAAAATATAAAAAAGCTTCTAAA 1 11 1 TATAGGCTCAAGATATAAATTTTAACACAGA 2 14 0 TGCAGTACATAGATATAAGTTATGATTCGAT 2 47 0 TTTATGCAGTAAATCTAATAATTTATTATAT 2 126 1 TATAACCTTTATATATAATAAATTATTAGAT 2 138 0 TTCTTTAAACAGATCGAATATTGAATATATT 3 201 1 TAATTTTTAATAATAGAAATTGGGTATAGGT 4 82 0 GTCGATTAATAAATAGTATATCAGTATCAAT 4 117 0 TTTAACAGTCATATAGATTATGTACCTTATC 4 216 1 TACTAGAGACAAATCGATTATCAAGATT 5 7 0 GTTGCTTTATAGATCAAAAATGTACCTGGTA 6 112 0 GCAACATCTAAAATATAAAATA 6 138 1 AATCTAATATAAATATAACTTA 7 1 0 GATGAGTTTCTAATCTAATATAAATATAACT 7 12 0 TATTCATTAATAATCTAAGTTGTTTTTAAAA 8 150 1 TGTTTTACTAAAATCTAATTTTTCTTGCAAT 10 45 1 ATAAACTAGCAAATCATACATCAATGTTAAT 10 77 1 TGGAATTTAGCAATAAAAAATATC 11 63 1 AGAAAATCTTTAATATATAATTCTAGCCAAT 12 31 0 GAATATATGATATAAAATGCAAAATTGA 12 197 0 ATCAAACACTTAATCTCATATTGCAATATAT 14 80 0 ATGATATCTTTAATAGAATATAAATTATGAA 14 120 1 ******** ** MAP Score: 2.46533 Motif 11 TCTGTGTTAAAATTTATATCTTGAGCCTATAA 2 14 1 ATTAATCACAATTCAATATCAAACTACAAGAA 4 14 1 TAACACAATTTAGCAATCTCATGAAATAATAA 5 42 1 CTTTTATTTGCCATATCATTCCGTATAAT 6 7 1 GGTTCAAAATTATTAATATCATAGTTGTTTTT 7 65 0 CGGCTATTGCTTGCAATCTCTTTAATAAGACT 8 44 1 TCAATTTTGCATTTTATATCATATATTC 12 197 1 TAACTTGACCATTTGATCTCATTATATATATT 14 55 1 ATCATCAAACACTTAATCTCATATTGCAATAT 14 82 0 CTATTTATCTCATTTCATAATTT 14 141 0 * ** ******* MAP Score: 2.26571 Motif 12 ATGATAGAAGTCAAACAAATTGATTTTTTCTAGA 0 230 0 ATGTTTATCTTCAAATAAATAGAAAATTTAATT 0 277 1 GCAGCTTAACACAAAAAACTACAAACTTTATTAA 3 154 1 CAATTCAATATCAAACTACAAGAAACAGCATAAA 4 22 1 ATAAAAATAAACAAAAAACATTATTAAAGTTGTT 6 46 1 TATACCGTGGTCAAACTACTATATGATACCAGGT 6 86 1 GCTTTCGTGGTCAAACCACGGGATGAGTTTCTAA 7 30 0 GAACCCGTGGTCAAACCACGAGATGTAAAATGAG 7 92 1 ***** ** *** MAP Score: 2.20181