AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i RP/RP_profile005_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239383 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 RP008 190 (3R)-HYDROXYMYRISTOYL-[ACYL CARRIER PROTEIN] DEHYDRATASE (fabZ) #1 RP009 300 UDP-3-O-[3-HYDROXYMYRISTOYL] GLUCOSAMINE N-ACYLTRANSFERASE (lpxD) #2 RP114 71 PROTEIN-EXPORT MEMBRANE PROTEIN SECF (secF) #3 RP115 163 NADH DEHYDROGENASE I CHAIN F (nuoF) #4 RP116 169 SIGNAL PEPTIDASE I (lepB) #5 RP407 300 unknown #6 RP408 148 LIPOPROTEIN SIGNAL PEPTIDASE (lspA) #7 RP849 40 GLYCYL-TRNA SYNTHETASE BETA CHAIN (glyS) #8 RP850 186 GLYCYL-TRNA SYNTHETASE ALPHA SUBUNIT (glyQ) #9 RP851 21 unknown #10 RP852 211 PROLINE/BETAINE TRANSPORTER (proP6) #11 RP854 163 unknown #12 RP855 190 unknown Motif 1 TAGATCCAGAAAAATATATTTAATTGGGTCCC 0 70 1 TTTACATTACAATATTTATTTAAAAAATATTA 5 27 1 CTGTTATTCAATTATTTATTCACGGGACCCAA 0 93 0 AAATATCAATATTATTTATTCACATAATATGC 8 14 0 AATAAAGGCAAATTTATATTAAACAAGAGACC 0 161 1 AATGAAAATTAACTTATATTTAATTAATTTTA 5 155 1 TTCTTAGTTACATATATATTGAAAATACAAAA 5 96 1 TCATTAGGTCCAGATATATTAATAGTTTTTAG 11 58 0 TTTGTATTTATAAATATATTAATTATCT 6 130 1 ATACAAATATAACTTTTATTCAACATAATTAT 2 45 1 GGTAAGATATATTATTTAATGTTAT 12 3 1 TTATATTTGTATTATATAGTAAATTCAAAAAG 2 25 0 AATTTTAGTTCTAATATATTAACTTTTT 8 168 1 GCAAGAATCAAAAATTTATTTTGTCATACTGT 11 97 0 TACAACAATAAAGTTATAGTAAA 0 1 0 TCAGTTACTTTATTTATTTAAAAAGATAAT 10 191 0 AATAATTATATTCACCATTTACAT 5 2 1 TTATAAATCTTATTTATATTAATGAAAATTAA 5 135 1 GATAACAATAAAAATTGATTCATACAACAATA 0 23 0 TTAAATTAATAATATTGATTTATTTGAGATTC 1 80 0 TTCATAATCAAAAATTGATTCAAATAATCTTC 5 266 1 ATCATACCGTATAATATATTGTGTCCTGTGAG 4 54 1 AAAAATTATTTATTATATTTTGTAAG 4 153 0 TATAAAAATACTAATATAGTAATTTTAAACTA 1 162 0 TATATCATTAAACATTTAGTATCCAATAATTT 10 44 0 TTTTGTGTAGTTCTTTTATTTAGAGATTACTT 1 29 0 AAAATACTAGTATTTTTAGTTATTTTTCCTTC 3 55 1 AAATTTTACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTA 5 218 1 TATATTAGTATTTTTATAGTCAAGTCACTGTA 1 176 1 ACTTGAATCTCAAATTTAGTTTAAAATTACTA 1 146 1 TTATGAGTTTTTTATTGATTTAAAATTAATTA 5 175 0 ** ******* * MAP Score: 28.7291 Motif 2 CTCACAGGACACAATATATTATACGGTATGATA 4 53 0 TTGAGTGCTTACAAAATATAATAAATAATTTTT 4 146 1 ATGATGTTTTAGAACATATTATTCTTAGTTACA 5 75 1 AAAAAGTTAATATATTAGAACTAA 8 172 0 CTATATATAAAGAAATTACAATAAAAAATTGTA 5 224 0 TTTGCCATATAAAACTTACAATTTTATTGCATA 1 224 1 CCACAGTATGACAAAATAAATTTTTGATTCTTG 11 95 1 TTAACCTTTTTGAATTTACTATATAATACAAAT 2 20 1 AAATTTAGTTTAAAATTACTATATTAGTATTTT 1 157 1 TTAATTAAATATAAGTTAATTTTCATTAATATA 5 149 0 TATTTATTTAAAAAGATAATAAAAGGAATAGTG 10 178 0 CAGTAAAACAATAAAATACTAAAAACTATTAAT 11 40 1 AGATAATTACAGAACTTATATTTCATTATTAAT 8 77 1 TATGTTGAATAAAAGTTATATTTGTATTATATA 2 39 0 GGGACCCAATTAAATATATTTTTCTGGATCTAA 0 69 0 GGTCTCTTGTTTAATATAAATTTGCCTTTATTA 0 160 0 ATCAATATTATTAATTTAAATTTCTCACATTAC 1 93 1 TTTGTATTTATAAATATATTAATTATCT 6 130 1 ACATATATATTGAAAATACAAAAAGCATAGTTA 5 105 1 AACACCGTAGATAAGATAAATATGGTACAC 11 7 0 AAATATTATCATAATATTCTATTTATGATGTTT 5 51 1 TTAGAATGCAATAACATTAAATAATATATCTTA 12 12 0 GCACTAAACATGAACTTATTAAAGCAATAACGA 3 132 1 CAACAAAACATCAATTTATAAAATTGA 6 4 0 AATTTGAGATTCAAGTTATTAATTGAAGTAGAA 1 129 0 TAATAAAAGCATAACTTATATAATATCGCTAGT 1 255 1 ATAGAGCTTGAAAATTTTCTATATCATCTTTGA 10 11 1 TAACTTTTATTCAACATAATTATAATA 2 54 1 ATGTAAATGGTGAATATAATTATT 5 1 0 TTAATTTTCATTAATATAAATAAGATTTATAAC 5 134 0 TTGCCCCGTCACAATTTTCAATTTTCCAGCTCA 12 62 0 GAATATTATGATAATATTTTTTAAATAAATATT 5 37 0 TTTATTGATTTAAAATTAATTAAATATAAGTTA 5 164 0 AATGAAATTGTTAATTTTAAATATCAATATTAT 8 31 0 ATTTTAAATATCAATATTATTTATTCACATAAT 8 18 0 ATTTTTTAAATAAATATTGTAATGTAAATGGTG 5 22 0 TAGATGAGGATCAACTTTTAAAAAAGCAAGCTA 10 99 0 TAATACTCATTAAATATTAATAATGAAATATAA 8 92 0 * ** *** **** MAP Score: 25.8308 Motif 3 GAATCAATTTTTATTGTTATCTCATGGTTTAACCATTAGA 0 34 1 AATTTTATCTCTGTTATTCAATTATTTATTCACGGGACCC 0 95 0 TAGAGATTACTTAGTATTCATAGATACGATA 1 1 0 GAAATTTAAATTAATAATATTGATTTATTTGAGATTCATC 1 77 0 ATAAGTTATGCTTTTATTATGCAATAAAATTGTAAGTTTT 1 234 0 AAAAGTTATATTTGTATTATATAGTAAATTCAAAAAGGTT 2 22 0 GTTCAAAATACTAGTATTTTTAGTTATTTTTCCTTCGATA 3 51 1 TTTCTAGAAACTCGTACTTTTTTATATCATACCGTATAAT 4 29 1 TGATAATATTTTTTAAATAAATATTGTAATGTAAATGGTG 5 22 0 GAACATATTATTCTTAGTTACATATATATTGAAAATACAA 5 86 1 AAAAGCATAGTTATAAATCTTATTTATATTAATGAAAATT 5 125 1 TATGAGTTTTTTATTGATTTAAAATTAATTAAATATAAGT 5 166 0 AATCAAAATTTTACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTATAT 5 213 1 GTTCATATTATTCATAATCAAAAATTGATTCAAATAATCT 5 256 1 ATACGGTGTACACTTATTAAAGGATCTGTTTTTCTCCTTT 6 40 1 ATGATTAGACTTACTATTGTCCATTTTGATAATTAACATT 6 85 1 ACATTCCTTTTTTGTATTTATAAATATATTAATTATCT 6 120 1 AATATTGATATTTAAAATTAACAATTTCATTTACAAAGAT 8 33 1 TCATTAAATATTAATAATGAAATATAAGTTCTGTAATTAT 8 79 0 AATAGAGCTTGAAAATTTTCTATATCATCTTTGAAAAT 10 8 1 TATCATTAAACATTTAGTATCCAATAATTTTCAAAGATGA 10 34 0 GATCCTCATCTATCTACTCTCTTATTTTATTTGGGTTATG 10 120 1 TACACTATTCCTTTTATTATCTTTTTAAATAAATAAAGTA 10 176 1 ATATTAATAGTTTTTAGTATTTTATTGTTTTACTGAACAC 11 35 0 TTACCTTGGGTTATTAGTAAGACTTTCATTCATGTTGCAG 11 128 0 CTTACTGATATTTGTAATGACAGTTCTTATACCCATGCAG 12 128 1 ** ** * * ** ** MAP Score: 25.0778 Motif 4 AATTATGTTGAATAAAAGTTATATTTGTATTATATA 2 39 0 CTGCAACATGAATGAAAGTCTTACTAATAACCCAAG 11 128 1 AAAGCTAGACAATTTTAGTTCTAATATATTAACTTT 8 158 1 ATGCAATAAAATTGTAAGTTTTATATGGCAAAAACG 1 220 0 TAAATAATTGAATAACAGAGATAAAATTGCTCTATG 0 107 1 CATTAATATAAATAAGATTTATAACTATGCTTTTTG 5 123 0 TATGTGAATAAATAATATTGATATTTAAAATTAACA 8 20 1 TATCTTTGTAAATGAAATTGTTAATTTTAAATATCA 8 38 0 GTAAGCACTCAATTAAATTCCTAGCTAAAATCTGCA 4 122 0 TGATATTTGTAATGACAGTTCTTATACCCATGCAGA 12 133 1 ATTATTATTAGAGCTATTTAGTGAAGAAA 7 3 1 GTCCAGATATATTAATAGTTTTTAGTATTTTATTGT 11 47 0 AAATACTAGTATTTTTAGTTATTTTTCCTTCGATAC 3 56 1 ATATGGAGATAATTACAGAACTTATATTTCATTATT 8 71 1 GTGCTTACAAAATATAATAAATAATTTTT 4 150 1 ATAACCCAGCAATCAAAATTTTACAATTTTTTATTG 5 203 1 TTGCAGCAAGAATCAAAAATTTATTTTGTCATACTG 11 98 0 AGGATACGGCAATATCAGAACTTTGATACGAGGTTG 12 92 0 TAGAACATGTAATGTGAGAAATTTAAATTAATAATA 1 98 0 AATTTAAATTAATAATATTGATTTATTTGAGATTCA 1 79 0 TAATAACTTGAATCTCAAATTTAGTTTAAAATTACT 1 141 1 GTATGAATCAATTTTTATTGTTATCTCATGGTTTAA 0 30 1 CACGGGACCCAATTAAATATATTTTTCTGGATCTAA 0 69 0 TCAATTTTATAAATTGATGTTTTGTTGC 6 2 1 CATTTTGATAATTAACATTCCTTTTTTGTATTTATA 6 106 1 TCAATTTTTGATTATGAATAATATGAACTATATATA 5 248 0 ACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTATATATAGTTCA 5 225 1 CTTATATTTCATTATTAATATTTAATGAGTATTAGA 8 91 1 AGATAATTAATATATTTATAAATACAAAAAA 6 127 0 TACTTTATTTATTTAAAAAGATAATAAAAGGAATAG 10 180 0 TATATAGTAAATTCAAAAAGGTTAAACGTTTTTTT 2 9 0 *** * *** ** * MAP Score: 23.506 Motif 5 GTCCCGTGAATAAATAATTGAATAACAGAGATAAA 0 97 1 GTTCATATTATTCATAATCAAAAATTGATTCAAAT 5 256 1 TCATTAAATATTAATAATGAAATATAAGTTCTGTA 8 84 0 GAGATTCAAGTTATTAATTGAAGTAGAACATGTAA 1 122 0 AAGTTAATTTTCATTAATATAAATAAGATTTATAA 5 135 0 AAACATGAACTTATTAAAGCAATAACGAGAATTTT 3 137 1 TTTTATTATCTTTTTAAATAAATAAAGTAACTGA 10 187 1 TTGAATTTACTATATAATACAAATATAACTTTTAT 2 29 1 ATTAATATATTTATAAATACAAAAAAGGAATGTTA 6 118 0 ATTGAGTGCTTACAAAATATAATAAATAATTTTT 4 145 1 TACATATATATTGAAAATACAAAAAGCATAGTTAT 5 104 1 ATGATAATATTTTTTAAATAAATATTGTAATGTAA 5 28 0 TAAATCAATATTATTAATTTAAATTTCTCACATTA 1 90 1 CTAGGTCTCTTGTTTAATATAAATTTGCCTTTATT 0 161 0 CAATAAAAATTGATTCATACAACAATAAAGTTATA 0 15 0 TTCTAAAACATCATAAATAGAATATTATGATAATA 5 54 0 GACAAGTTACTGTTTAAACAAAGTATTGCTTTACC 3 96 1 CGTCATGAGCTGGAAAATTGAAAATTGTGACGGGG 12 57 1 AAGTAATCTCTAAATAAAAGAACTACACAAAAACC 1 29 1 ATATGAACTATATATAAAGAAATTACAATAAAAAA 5 229 0 AGGGACAGCGTATATCATTAAACATTTAGTATCCA 10 51 0 TAATTAATTTTAAATCAATAAAAAACTCATAACCC 5 175 1 AAGTTATGCTTTTATTATGCAATAAAATTGTAAGT 1 237 0 * ***** ** ** MAP Score: 22.1729 Motif 6 TGAATAACAGAGATAAAATTGCTCTATGCAATCAACG 0 115 1 AAATTTAAATTAATAATATTGATTTATTTGAGATTCA 1 79 0 CTCAAATTTAGTTTAAAATTACTATATTAGTATTTTT 1 154 1 AGTATTTTTATAGTCAAGTCACTGTATGACACTGAAC 1 182 1 GTTTTTGCCATATAAAACTTACAATTTTATTGCATAA 1 221 1 CGTTTAACCTTTTTGAATTTACTATATAATACAAATA 2 17 1 CTGAATCTAATGAACAAATTACGGTATAATTAGTTGT 3 15 0 TTCGATACCGTGGACAAGTTACTGTTTAAACAAAGTA 3 84 1 CGTTATTGCTTTAATAAGTTCATGTTTAGTGCAGGTA 3 127 0 CTCGTACTTTTTTATATCATACCGTATAATATATTGT 4 39 1 GTCCTGTGAGTGATAAAGTTGCCATATGACATTAAAG 4 76 1 AAAAAATATTATCATAATATTCTATTTATGATGTTTT 5 48 1 TAACTATGCTTTTTGTATTTTCAATATATATGTAACT 5 101 0 AACCCAGCAATCAAAATTTTACAATTTTTTATTGTAA 5 205 1 TACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTATATATAGTTCA 5 224 1 TTTTTGATTATGAATAATATGAACTATATATAAAGAA 5 243 0 TCAATTTTATAAATTGATGTTTTGTTGCAGAT 6 5 1 TCCATTTTGATAATTAACATTCCTTTTTTGTATTTAT 6 104 1 GTAAATGAAATTGTTAATTTTAAATATCAATATTATT 8 30 0 ATAATTACAGAACTTATATTTCATTATTAATATTTAA 8 79 1 AATAGAGCTTGAAAATTTTCTATATCATCTTTGAA 10 8 1 ATGTTTTTACTTGAGAAAGTACACTATTCCTTTTATT 10 157 1 AGGTTGCCCCGTCACAATTTTCAATTTTCCAGCTCAT 12 61 0 CGTATCAAAGTTCTGATATTGCCGTATCCTCTTACTG 12 98 1 * * ** ** * *** MAP Score: 21.4031 Motif 7 TAATGAAAATTAACTTATATTTAATTAATTT 5 154 1 GTTATAAATCTTATTTATATTAATGAAAATT 5 134 1 ATGTTGAATAAAAGTTATATTTGTATTATAT 2 40 0 TAATAAAGGCAAATTTATATTAAACAAGAGA 0 160 1 AATAATTATATTCACCATTTAC 5 1 1 ATTATGTGAATAAATAATATTGATATTTAAA 8 18 1 GAAATTTAAATTAATAATATTGATTTATTTG 1 86 0 TTATATTTCATTATTAATATTTAATGAGTAT 8 92 1 ACTAGTATTTTTAGTTATTTTTCCTTCGATA 3 60 1 CAAGAATCAAAAATTTATTTTGTCATACTGT 11 97 0 CAAAATATAATAAATAATTTTT 4 157 1 AACTTATATTTAATTAATTTTAAATCAATAA 5 165 1 AAATACTAATATAGTAATTTTAAACTAAATT 1 158 0 GGTAAGATATATTATTTAATGTT 12 2 1 AATAAAAGCATAACTTATATAATATCGCTAG 1 256 1 CGGGACCCAATTAAATATATTTTTCTGGATC 0 72 0 CCGTATCCTCTTACTGATATTTGTAATGACA 12 119 1 TTTTGTATTTATAAATATATTAATTATCT 6 129 1 AATATTTATTTAAAAAATATTATCATAATAT 5 37 1 TATTATAATTATGTTGAATAAAAGT 2 56 0 TCAGTTACTTTATTTATTTAAAAAGATAAT 10 191 0 TTATTCTTAGTTACATATATATTGAAAATAC 5 93 1 TACTAAATGTTTAATGATATACGCTGTCCCT 10 55 1 *** ******* MAP Score: 20.8172 Motif 8 AAAAAGTTAATATATTAGAACTAAAATTGTCTAGCTTTGC 8 156 0 AATTGCTCCGAAGATTATTTGAATCAATTTTTGATTATGAAT 5 265 0 CAAATAAATCAATATTATTAATTTAAATTTCTCACATTACAT 1 86 1 ATATTATCATAATATTCTATTTATGATGTTTTAGAACATATT 5 53 1 CACAGGACACAATATATTATACGGTATGATATAAAAAAGTAC 4 42 0 TTTATTTAAAAAGATAATAAAAGGAATAGTGTACTTTCTCAA 10 167 0 TTAATAATGAAATATAAGTTCTGTAATTATCTCCATATCTTT 8 67 0 AAAAATTATTTATTATATTTTGTAAGCACTCAA 4 146 0 GCAAGAATCAAAAATTTATTTTGTCATACTGTGGATTTATCA 11 87 0 GGTAAGATATATTATTTAATGTTATTGCATTCTAA 12 3 1 TAAAGAAATTACAATAAAAAATTGTAAAATTTTGATTGCTGG 5 208 0 TCATGGTTTAACCATTAGATCCAGAAAAATATATTTAATTGG 0 55 1 TTTAAAATTAACAATTTCATTTACAAAGATATGGAGATAATT 8 43 1 GTTCAGTAAAACAATAAAATACTAAAAACTATTAATATATCT 11 37 1 CATTTACATTACAATATTTATTTAAAAAATATTATCATAATA 5 25 1 ATATATATTGAAAATACAAAAAGCATAGTTATAAATCTTATT 5 107 1 CTTGACTATAAAAATACTAATATAGTAATTTTAAACTAAATT 1 158 0 TTTGATAATTAACATTCCTTTTTTGTATTTATAAATATATTA 6 109 1 ATCATCTTTGAAAATTATTGGATACTAAATGTTTAATGATAT 10 33 1 AATCACTAGCGATATTATATAAGTTATGCTTTTATTATGCAA 1 250 0 TATGACATTAAAGATTATTCGATGCAGATTTTAGCTAGGAAT 4 100 1 ** *** * ** * * MAP Score: 19.4998 Motif 9 TTTACTATAACTTTATTGTTGTATGAATCAATTTTTATTG 0 9 1 CACGGGACCCAATTAAATATATTTTTCTGGATCTAATGGTT 0 64 0 TTTAGAGATTACTTAGTATTCATAGATACGATA 1 2 0 TAATGTGAGAAATTTAAATTAATAATATTGATTTATTTGAG 1 84 0 AAAAATACTAATATAGTAATTTTAAACTAAATTTGAGATTC 1 150 0 AAAATTACTATATTAGTATTTTTATAGTCAAGTCACTGTAT 1 168 1 AAAAAAACGTTTAACCTTTTTGAATTTACTATATAATA 2 7 1 TATATAATACAAATATAACTTTTATTCAACATAATTATAAT 2 39 1 ATACTAGTATTTTTAGTTATTTTTCCTTCGATACCGTGGAC 3 58 1 AAAAATTCTCGTTATTGCTTTAATAAGTTCATG 3 140 0 AAACTCGTACTTTTTTATATCATACCGTATAATATATTGTG 4 36 1 TGCCATATGACATTAAAGATTATTCGATGCAGATTTTAGCT 4 95 1 AAAAATTATTTATTATATTTTGTAAGCACTCAAT 4 145 0 AATATTTTTTAAATAAATATTGTAATGTAAATGGTGAATAT 5 17 0 CATAATATTCTATTTATGATGTTTTAGAACATATTATTCTT 5 60 1 TTTTAGAACATATTATTCTTAGTTACATATATATTGAAAAT 5 81 1 ATTAAATATAAGTTAATTTTCATTAATATAAATAAGATTTA 5 138 0 ATGAAAATTAACTTATATTTAATTAATTTTAAATCAATAAA 5 156 1 ATTGTAATTTCTTTATATATAGTTCATATTATTCATAATCA 5 235 1 AAAGGATCTGTTTTTCTCCTTTTTGGAATGATTAGACTTAC 6 58 1 AATTAACATTCCTTTTTTGTATTTATAAATATATTAATTAT 6 115 1 TTTTAAATATCAATATTATTTATTCACATAATATGCAGTT 8 9 0 TAATTACAGAACTTATATTTCATTATTAATATTTAATGAGT 8 80 1 ATTTATATCTAATTTACTAAA 9 0 0 TACACTATTCCTTTTATTATCTTTTTAAATAAATAAAGTAA 10 176 1 AGTTTTTAGTATTTTATTGTTTTACTGAACACCGTAGATAA 11 26 0 TTAGGTCCAGATATATTAATAGTTTTTAGTATTTTATTGTT 11 46 0 TGCCGTATCCTCTTACTGATATTTGTAATGACAGTTCTTAT 12 117 1 * *** * * ** * * MAP Score: 19.3274 Motif 10 TCAAATTTAGTTTAAAATTACTATATTAGTATTTTTATAGTCA 1 155 1 ATTGTCCATTTTGATAATTAACATTCCTTTTTTGTATTTATAA 6 100 1 AATAATTATATTCACCATTTACATTACAATATTTATTTAAAAA 5 10 1 TAATATTCTATTTATGATGTTTTAGAACATATTATTCTTAGTT 5 62 1 AATAGAGCTTGAAAATTTTCTATATCATCTTTGAAAATTAT 10 8 1 AGGTCTCTTGTTTAATATAAATTTGCCTTTATTACGAGAACGC 0 151 0 AATATTGATATTTAAAATTAACAATTTCATTTACAAAGATATG 8 33 1 CTAATACTCATTAAATATTAATAATGAAATATAAGTTCTGTAA 8 83 0 ACATCATAAATAGAATATTATGATAATATTTTTTAAATAAATA 5 39 0 TTGAATTTACTATATAATACAAATATAACTTTTATTCAACATA 2 29 1 CGGGACCCAATTAAATATATTTTTCTGGATCTAATGGTTAAAC 0 60 0 TTTACTATAACTTTATTGTTGTATGAATCAATT 0 0 1 TGATTTAAAATTAATTAAATATAAGTTAATTTTCATTAATATA 5 149 0 ATATAGTAAATTCAAAAAGGTTAAACGTTTTTTT 2 1 0 CGTACTTTTTTATATCATACCGTATAATATATTGTGTCCTGTG 4 41 1 ATTGAGTGCTTACAAAATATAATAAATAATTTTT 4 145 1 CTTGAGAAAGTACACTATTCCTTTTATTATCTTTTTAAATAAA 10 166 1 TACATATATATTGAAAATACAAAAAGCATAGTTATAAATCTTA 5 104 1 CAATCAAAATTTTACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTATATAT 5 212 1 GAATCAATTTTTGATTATGAATAATATGAACTATATATAAAGA 5 244 0 GTGAGAAATTTAAATTAATAATATTGATTTATTTGAGATTCAT 1 78 0 ATCTACGGTGTTCAGTAAAACAATAAAATACTAAAAACTATTA 11 28 1 ** * ** ** * ** MAP Score: 19.2613 Motif 11 TTTACATTACAATATTTATTTAAAAAATATTATCATA 5 27 1 ACCTGCACTAAACATGAACTTATTAAAGCAATAACGA 3 128 1 TTGTAAATGAAATTGTTAATTTTAAATATCAATATTA 8 32 0 AATACTCATTAAATATTAATAATGAAATATAAGTTCT 8 87 0 GAAAATACAAAAAGCATAGTTATAAATCTTATTTATA 5 116 1 AAGAAATTACAATAAAAAATTGTAAAATTTTGATTGC 5 211 0 TCTGCAACAAAACATCAATTTATAAAATTGA 6 4 0 ATTAATATTTAATGAGTATTAGATAATGAATTAGATG 8 104 1 GGTAAGATATATTATTTAATGTTATTGCAT 12 3 1 GTAATGTGAGAAATTTAAATTAATAATATTGATTTAT 1 89 0 GAGTGCTTACAAAATATAATAAATAATTTTT 4 148 1 GGGTCCCGTGAATAAATAATTGAATAACAGAGATAAA 0 95 1 AATGAAAATTAACTTATATTTAATTAATTTTAAATCA 5 155 1 CATTTCTAGAAACTCGTACTTTTTTATATCATACCGT 4 27 1 TTGACTATAAAAATACTAATATAGTAATTTTAAACTA 1 162 0 TGCATAATAAAAGCATAACTTATATAATATCGCTAGT 1 251 1 ATAAAATACTAAAAACTATTAATATATCTGGACCTAA 11 50 1 TATGCAATAAAATTGTAAGTTTTATATGGCAAAAACG 1 220 0 CAAATTACGGTATAATTAGTTGTAAATT 3 1 0 TTATAAATCTTATTTATATTAATGAAAATTAACTTAT 5 135 1 ATTTGTATTATATAGTAAATTCAAAAAGGTTAAACGT 2 16 0 AATCTCTAAATAAAAGAACTACACAAAAACCTTAGCT 1 33 1 ATTTATATCTAATTTACTAAA 9 1 0 TAGACAATTTTAGTTCTAATATATTAACTTTTT 8 163 1 AGTAAAAACATAACCCAAATAAAATAAGAGAGTAGAT 10 131 0 ACAGTATGACAAAATAAATTTTTGATTCTTGCTGCAA 11 97 1 TTCTCGTAATAAAGGCAAATTTATATTAAACAAGAGA 0 154 1 TAGTAATTTTAAACTAAATTTGAGATTCAAGTTATTA 1 141 0 GTATCGAAGGAAAAATAACTAAAAATACTAGTATTTT 3 55 0 GATTATGAATAATATGAACTATATATAAAGAAATTAC 5 238 0 TGTTGAATAAAAGTTATATTTGTATTATATAGTAAAT 2 33 0 ** ** ** * *** MAP Score: 19.2123 Motif 12 AAATTGTTAATTTTAAATATCAATATTATTTATTCACATAATA 8 17 0 TGTTTTTACTTGAGAAAGTACACTATTCCTTTTATTATCTTTT 10 158 1 TATTTATAAATACAAAAAAGGAATGTTAATTATCAAAATGGAC 6 103 0 ATCCACAGTATGACAAAATAAATTTTTGATTCTTGCTGCAACA 11 93 1 GTGATAAAGTTGCCATATGACATTAAAGATTATTCGATGCAGA 4 85 1 TTAGATTCAGTTCAAAATACTAGTATTTTTAGTTATTTTTCCT 3 42 1 AAGATGAATCTCAAATAAATCAATATTATTAATTTAAATTTCT 1 75 1 TACTTTTTTATATCATACCGTATAATATATTGTGTCCTGTGAG 4 43 1 ATTTATGATGTTTTAGAACATATTATTCTTAGTTACATATATA 5 71 1 TTAATATAAATAAGATTTATAACTATGCTTTTTGTATTTTCAA 5 114 0 GGTAAGATATATTATTTAATGTTATTGCATTCTAA 12 2 1 AACACGTTTTTGCCATATAAAACTTACAATTTTATTGCATAAT 1 216 1 ATCAAAATTTTACAATTTTTTATTGTAATTTCTTTATATATAG 5 214 1 TTTGGAATGATTAGACTTACTATTGTCCATTTTGATAATTAAC 6 79 1 ATGGAGATAATTACAGAACTTATATTTCATTATTAATATTTAA 8 73 1 TTGAATTTACTATATAATACAAATATAACTTTTATTCAACATA 2 29 1 ATTGAGTGCTTACAAAATATAATAAATAATTTTT 4 145 1 CTCCGAAGATTATTTGAATCAATTTTTGATTATGAATAATATG 5 259 0 AATATTGTAATGTAAATGGTGAATATAATTATT 5 0 0 AACGCGTTGATTGCATAGAGCAATTTTATCTCTGTTATTCAAT 0 113 0 CCAATAATTTTCAAAGATGATATAGAAAATTTTCAAGCTCTAT 10 11 0 AAATCTTATTTATATTAATGAAAATTAACTTATATTTAATTAA 5 139 1 AACTTTATTGTTGTATGAATCAATTTTTATTGTTATCTCATGG 0 18 1 * * * * *** ** * MAP Score: 17.3847