AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i RP/RP_profile006_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239472 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 RP090 124 unknown #1 RP091 174 ASPARTATE AMINOTRANSFERASE A (aatA) #2 RP254 225 UDP-3-O-[3-HYDROXYMYRISTOYL] N-ACETYLGLUCOSAMINE DEACETYLASE (lpxC) #3 RP255 300 unknown #4 RP321 300 LIPID-A-DISACCHARIDE SYNTHASE (lpxB) #5 RP379 300 3-DEOXY-MANNO-OCTULOSONATE CYTIDYLYLTRANSFERASE (kdsB) #6 RP501 215 TRNA PSEUDOURIDINE 55 SYNTHASE (truB) #7 RP503 21 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 (rpsO) #8 RP504 154 POLYRIBONUCLEOTIDE NUCLEOTIDYLTRANSFERASE (pnp) #9 RP505 184 KPSF PROTEIN (kpsF) #10 RP719 300 unknown Motif 1 ACTATAATAAAGCATATCTTAATAAATTTTTAAATAAAATAAT 1 39 1 CTTATTGTATATAAATTATTATTTAATTTAAAAATAATGAATT 3 119 0 TAATTAAAAAATGAAATTTTAGATAAACTTTAAATAACACCTC 3 17 1 TAATTTAAAAATAATGAATTAAATAATATGAAAATATTTTAAT 3 96 0 AGCGATTAAAAACAGAAATTAAGAACCTTTTAAAATAACTATC 4 263 1 GCAATTAAATATTAACATTTAAATATATTTAAACAACCTCGT 2 193 1 AGAGCTTATTAAGACAACTTAGCCAATTTTAAAATTAAACGAG 6 82 0 CTAATCTGTCAACAATTATTTTTTAATTTTAAATATAGGCAGT 5 265 1 TGATTACTGAATGATATCTTTAATAGAATATAAATTATGAAAT 8 110 1 AACTTTAAATAACACCTCTTTAAAATACTAAAAAATATATTAT 3 42 1 TAAAAAATATATTATTACTTTCTTACATTAAAATATTTTCATA 3 70 1 CATATTTCGTAACAAATTTTAATCCCAATACAATTCCCATAAT 10 91 0 ATTGGCTAGAATTATATATTAAAGATTTTCTACATTTAAGTCA 6 31 1 CAACTGAGCTACGAGCTCTTAAATATGTAGCAATATGAAGATC 5 73 1 CTTAATTATAATTATGAGTTATATACCATGTACCTATGTTTAG 3 253 1 TTTCTTTTCAATGATAATTTAGGTATCAACAAATACTCCTAAT 9 97 1 ATTATCATTGAAAAGAAATTACGCACTGAGTAACACATAATCT 9 72 0 TTTTTAAATAAAATAATTTTATTGAGATTAAAATTGCTGTATT 1 65 1 TTAATTACTAAATTCATATTATTTACACTATAATAAAGCATAT 1 13 1 TGAAGCATACAACACCACTTATTGATGCTCACAATGGTGATTA 2 113 1 TCCTCAATTGATAAACTCTTTGCTCTTTTTAAAATTGATCTTC 5 109 0 TCCTTGCATTATAAACTTTTTGCTCTTGTTGAAATTAAACTGT 6 149 1 AAACTTTATTAAGACAACGTAGCCATTCTTTAAACAGATCGAA 5 176 1 ATAAAATAATATGAATAATTATAAATATTTATATTGATACTGC 0 56 1 TATACAAATAATATTTTGTTACAAAATATTACATAATCACCAT 2 146 0 CTTCCGTATCATTACCTGTTTTTCCTTGTATACTGATAAATTA 10 184 0 TTTTTCATTAAAATCTTTTTTGCTATTTTTACAACTTTGTGTT 4 176 0 ACTATATAGTATCTGTAATTATTTCCAGTAGACCGGTAAACAA 2 17 0 * * * *** * * ** MAP Score: 34.1035 Motif 2 TATTTATAATTATTCATATTATTTTATTTTTAGCTACC 0 45 0 AATCTCAATAAAATTATTTTATTTAAAAATTTATTAAG 1 56 0 TATCGTTTATTATTAATGTTATTCTAAAGTATATAAGA 1 107 1 AACAAAATATTATTTGTATAATTTGCAATTAAATATTA 2 169 1 GTAATAATATATTTTTTAGTATTTTAAAGAGGTGTTAT 3 50 0 CATTAAAATATTTTCATATTATTTAATTCATTATTTTT 3 95 1 TGTATATAAATTATTATTTAATTTAAAAATAATGAATT 3 119 0 TAATCCAGTATGGTAGTCTTATTGTATATAAATTATTA 3 141 0 ATTACGAATCTCTTTATTTAATTTTTAAGATAATAATC 3 216 1 TCAAGTTTTTTTATGTTTTTATTCAAAATGTTTTCATG 4 31 0 ACATAAAAAAACTTGATATGATTTAAAATTACTTTACA 4 53 1 GATATAATCGATCTTTTTTCATTAAAATCTTTTTTGCT 4 195 0 CTGTCAACAATTATTTTTTAATTTTAAATATAGGCAGT 5 270 1 GTCAAGGATATACTCGTTTAATTTTAAAATTGGCTAAG 6 70 1 GCATTAATAATGCTCCTTGCATTATAAACTTTTTGCTC 6 136 1 TAACTTGACCATTTGATCTCATTATATATATTGCAATA 8 55 1 CTATTTATCTCATTTCATAATTTATATTC 8 135 0 TAGGAATTGATGATGGTTTCATTTGATTACCACACAGC 9 34 0 ATTATGGGAATTGTATTGGGATTAAAATTTGTTACGAA 10 91 1 * * * * *** *** MAP Score: 29.1336 Motif 3 TACTAAATTCATATTATTTACACTATAATAAAGCATATC 1 18 1 AAATATTTTCATATTATTTAATTCATTATTTTTAAATTA 3 100 1 AAAGTCAAACATATTTATTGCTTTATTATCTAATATAAT 10 244 0 ACGGAAGAACATTTGCATTTTACGATTATATTAGATAAT 10 220 1 GAATCTCTTTATTTAATTTTTAAGATAATAATCTTAATT 3 221 1 TCAGTGCGTAATTTCTTTTCAATGATAATTTAGGTATCA 9 86 1 TGATCTCATTATATATATTGCAATATGAGATTAAGTGTT 8 68 1 CTTTAATAGAATATAAATTATGAAATGAGATAAATAG 8 127 1 GCTTACACTAATTTAAGTTGCGGTATAAGTATAATACTT 8 13 0 GAAAGTAATAATATATTTTTTAGTATTTTAAAGAGGTGT 3 53 0 TACAGATACTATATAGTATCTGTAATTATTTCCAGTAGA 2 28 0 TTAAATGTTAATATTTAATTGCAAATTATACAAATAATA 2 176 0 GTGTCTATCAATTTTGCATTTTATATCATATATTC 6 190 1 CAATTTAGGTATAATAGTTATTAGATTATCAGCTTTTAA 3 176 0 TTTTATTGAGATTAAAATTGCTGTATTATCGTTTATTAT 1 81 1 GTCTTATTGTATATAAATTATTATTTAATTTAAAAATAA 3 125 0 AAATTAAAAAATAATTGTTGACAGATTAGCCTTTTTCGG 5 255 0 CAATAAAATTATTTTATTTAAAAATTTATTAAGATATGC 1 50 0 ATTAACTAATATTTCGTTTAAATGAGCATATTTCGTAAC 10 121 0 ACCTCACTTAATTTTATTTCCTGCATTAACTAATATTTC 10 145 0 TCGGATTCTTATATACTTTAGAATAACATTAATAATAAA 1 112 0 CAATATAAATATTTATAATTATTCATATTATTTTATTTT 0 53 0 ATTTTTGAATATATTCAATATTCGATCTGTTTAAAGAAT 5 200 0 **** ** ** ** MAP Score: 26.9288 Motif 4 AGAGGTGTTATTTAAAGTTTATCTAAAATTTCATTTTTT 3 22 0 CATTTCATAATTTATATTCTATTAAAGATATCATTCAGT 8 115 0 TTTAAATTAAATAATAATTTATATACAATAAGACTACCA 3 130 1 GTAGCTAAAAATAAAATAATATGAATAATTATAAATATT 0 46 1 AAAGATTTTAATGAAAAAAGATCGATTATATCAGATTAC 4 201 1 GAATATATGATATAAAATGCAAAATTGATAGACAC 6 190 0 AATTACTAAATTCATATTATTTACACTATAATAAAGCAT 1 15 1 ACTGCCTATATTTAAAATTAAAAAATAATTGTTGACAGA 5 269 0 CTTAGCCAATTTTAAAATTAAACGAGTATATCCTTGACT 6 69 0 GAGCAAAAAGTTTATAATGCAAGGAGCATTATTAATGCA 6 135 0 TAACACCTCTTTAAAATACTAAAAAATATATTATTACTT 3 51 1 GGAGTATTTGTTGATACCTAAATTATCATTGAAAAGAAA 9 97 0 CAATTTAGGTATAATAGTTATTAGATTATCAGCTTTTAA 3 176 0 ATTTGATCTCATTATATATATTGCAATATGAGATTAAGT 8 65 1 ATTATATTAGATAATAAAGCAATAAATATGTTTGACTTT 10 244 1 TATTATTTAATTTAAAAATAATGAATTAAATAATATGAA 3 107 0 CTCTATTTCTTTGATAGACAATTCAGTAATCTGATATAA 4 226 0 AATTATTTTATTTAAAAATTTATTAAGATATGCTTTATT 1 44 0 GTAAAGTAATTTTAAATCATATCAAGTTTTTTTATGTTT 4 51 0 TATGTTTTTATTCAAAATGTTTTCATGAACAATCCATCT 4 19 0 ACCACACAGCTTAAAACTTCTTACAATAATGGTC 9 5 0 AATATTAACATTTAAATATATTTAAACAACCTCGT 2 200 1 CTACGTTGTCTTAATAAAGTTTGTAGTTTTTTGTGTTAA 5 159 0 ACTTTCTTACATTAAAATATTTTCATATTATTTAATTCA 3 86 1 AGAATTATATATTAAAGATTTTCTACATTTAAGTCAAGG 6 38 1 TTAATTGCAAATTATACAAATAATATTTTGTTACAAAAT 2 162 0 ** *** ** * ** MAP Score: 26.1221 Motif 5 TGAATTCGGATTCTTATATACTTTAGAATAACATTAATA 1 117 0 AACAAAATATTATTTGTATAATTTGCAATTAAATATTAA 2 169 1 CTGTCAACAATTATTTTTTAATTTTAAATATAGGCAGTT 5 270 1 CCATTTGATCTCATTATATATATTGCAATATGAGATTAA 8 63 1 ATATCTACACTGCTTTTTTAGCTTGTAATCAATACCT 10 8 0 TCATATTATTTAATTCATTATTTTTAAATTAAATAATAA 3 108 1 TCACTCTTGCTTGTAAAGTAATTTTAAATCATATCAAGT 4 63 0 ACGAGGTTGTTTAAATATATTTAAATGTTAATATTT 2 199 0 ATAAAGCATATCTTAATAAATTTTTAAATAAAATAATTT 1 45 1 ATTACGAATCTCTTTATTTAATTTTTAAGATAATAATCT 3 216 1 TGTAAGAAAGTAATAATATATTTTTTAGTATTTTAAAGA 3 58 0 GTCAAGGATATACTCGTTTAATTTTAAAATTGGCTAAGT 6 70 1 TTATCTCATTTCATAATTTATATTCTATTAAAGATATCA 8 121 0 CAAACATATTTATTGCTTTATTATCTAATATAATCGTAA 10 239 0 AAAAATGAAATTTTAGATAAACTTTAAATAACACCTCTT 3 23 1 ACAATGGTGATTATGTAATATTTTGTAACAAAATATTAT 2 143 1 GGCTACGTTGTCTTAATAAAGTTTGTAGTTTTTTGTGTT 5 161 0 ATTTTTAAGATAATAATCTTAATTATAATTATGAGTTAT 3 236 1 * * * ** ** *** MAP Score: 23.8478 Motif 6 TAATTATTCATATTATTTTATTTTTAGCTACCACGTCCACAGT 0 34 0 ATAAAATTATTTTATTTAAAAATTTATTAAGATATGCTTTATT 1 44 0 TTTAAAGAGGTGTTATTTAAAGTTTATCTAAAATTTCATTTTT 3 23 0 TTTCATATTATTTAATTCATTATTTTTAAATTAAATAATAATT 3 106 1 TTCATTAAAATCTTTTTTGCTATTTTTACAACTTTGTGTTCTT 4 173 0 TCATATCAAGTTTTTTTATGTTTTTATTCAAAATGTTTTCATG 4 31 0 TATTATCGTTTATTATTAATGTTATTCTAAAGTATATAAGAAT 1 104 1 ACAATTATTTTTTAATTTTAAATATAGGCAGTTT 5 276 1 GATATACTCGTTTAATTTTAAAATTGGCTAAGTTGTCTTAATA 6 76 1 GACCATTTGATCTCATTATATATATTGCAATATGAGATTAAGT 8 61 1 TTATCTAAAATTTCATTTTTTAATTATGGATAA 3 0 0 AAGCAATAAATATGTTTGACTTTATTTTTAATTGCTGTAAATC 10 260 1 GGATTACGAATCTCTTTATTTAATTTTTAAGATAATAATCTTA 3 214 1 CTCACTTAATTTTATTTCCTGCATTAACTAATATTTCGTTTAA 10 139 0 AAAGTAATAATATATTTTTTAGTATTTTAAAGAGGTGTTATTT 3 48 0 TATCATTACCTGTTTTTCCTTGTATACTGATAAATTAACCTCA 10 178 0 TGTAACAAAATATTATTTGTATAATTTGCAATTAAATATTAAC 2 166 1 TACTGAATGATATCTTTAATAGAATATAAATTATGAAATGAGA 8 114 1 CGTAATTTCTTTTCAATGATAATTTAGGTATCAACAAATACTC 9 92 1 TTGACCGCAGTATCAATATAAATATTTATAATTATTCATATTA 0 62 0 TGGCTAGAATTATATATTAAAGATTTTCTACATTTAAGTCAAG 6 33 1 AAACTGTGTCTATCAATTTTGCATTTTATATCATATATTC 6 185 1 ATCGATTATATCAGATTACTGAATTGTCTATCAAAGAAATAGA 4 221 1 * * *** *** * * MAP Score: 23.1174 Motif 7 AAAGCATATCTTAATAAATTTTTAAATAAAATAATTTTATTG 1 47 1 ATTTTTAAATTAAATAATAATTTATATACAATAAGACTACCA 3 127 1 ACTGTGTCTATCAATTTTGCATTTTATATCATATATTC 6 187 1 TGATGATTACTGAATGATATCTTTAATAGAATATAAATTATG 8 107 1 ATTTAATTTAAAAATAATGAATTAAATAATATGAAAATATTT 3 100 0 CCATAATTAAAAAATGAAATTTTAGATAAACTTTAAATAACA 3 14 1 AATCTTAATTATAATTATGAGTTATATACCATGTACCTATGT 3 250 1 AGTTTAATTACTAAATTCATATTATTTACACTATA 1 3 1 ATTATATTAGATAATAAAGCAATAAATATGTTTGACTTTATT 10 244 1 TATTTAAATGTTAATATTTAATTGCAAATTATACAAATAATA 2 176 0 AATTATACAAATAATATTTTGTTACAAAATATTACATAATCA 2 150 0 TCTACTGGAAATAATTACAGATACTATATAGTATCTGTAATT 2 28 1 GAAAACATTTTGAATAAAAACATAAAAAAACTTGATATGATT 4 34 1 ATTATCTAATATAATCGTAAAATGCAAATGTTCTTCCGTATC 10 217 0 GATCGAATATTGAATATATTCAAAAATATGTTTTACTTTATC 5 212 1 ACACCTCTTTAAAATACTAAAAAATATATTATTACTTTCTTA 3 53 1 CTTAAAATACTGAATTCGGATTCTTATATACTTTAGAATAAC 1 124 0 CATCAAACACTTAATCTCATATTGCAATATATATAATGAGAT 8 70 0 TAAAAGGTTCTTAATTTCTGTTTTTAATCGCTCTATTTCTTT 4 253 0 ATAAATATTTATAATTATTCATATTATTTTATTTTTAGCTAC 0 46 0 TAATCCCAATACAATTCCCATAATTATTAACTCTTACATCTT 10 73 0 TCTATTGGCTAGAATTATATATTAAAGATTTTCTACATTTAA 6 28 1 * *** ** *** * MAP Score: 22.6967 Motif 8 ACGTGGTAGCTAAAAATAAAATAATATGAATAATTATAAATAT 0 41 1 TTAATAAATTTTTAAATAAAATAATTTTATTGAGATTAAAATT 1 57 1 TTATTGAGATTAAAATTGCTGTATTATCGTTTATTATTAATGT 1 83 1 TTTGAGAATCTTAAAATACTGAATTCGGATTCTTATATACTTT 1 132 0 TTATCCATAATTAAAAAATGAAATTTTAGATAAACTTTAAATA 3 10 1 TAACACCTCTTTAAAATACTAAAAAATATATTATTACTTTCTT 3 51 1 CTTTCTTACATTAAAATATTTTCATATTATTTAATTCATTATT 3 87 1 TTCATTATTTTTAAATTAAATAATAATTTATATACAATAAGAC 3 121 1 ATCTTAAAAATTAAATAAAGAGATTCGTAATCCAATTTAGGTA 3 204 0 TGTTATAACAGATGGATTGTTCATGAAAACATTTTG 4 3 1 TAAAGTAATTTTAAATCATATCAAGTTTTTTTATGTTTTTATT 4 46 0 CACAAAGTTGTAAAAATAGCAAAAAAGATTTTAATGAAAAAAG 4 178 1 ATCGATTATATCAGATTACTGAATTGTCTATCAAAGAAATAGA 4 221 1 AGATCAATTTTAAAAAGAGCAAAGAGTTTATCAATTGAGGAAT 5 111 1 GCAGCTTAACACAAAAAACTACAAACTTTATTAAGACAACGTA 5 154 1 TGCCTATATTTAAAATTAAAAAATAATTGTTGACAGATTAGCC 5 263 0 CGTTTAATTTTAAAATTGGCTAAGTTGTCTTAATAAGCTCTGT 6 84 1 TGTGTGGTAATCAAATGAAACCATCATCAATTCCTAAGATTAT 9 36 1 GTGAAATTCTTGAAAAGATGTAAGAGTTAATAATTATGGGAAT 10 59 1 ATGCAGGAAATAAAATTAAGTGAGGTTAATTTATCAGTATACA 10 158 1 * *** * * * ** * MAP Score: 20.5797 Motif 9 TCAATATAAATATTTATAATTATTCATATT 0 63 0 TATCTTAATAAATTTTTAAATAAAATAATT 1 53 1 TTAAATAAAATAATTTTATTGAGATTAAAA 1 68 1 TTTAAATGTTAATATTTAATTGCAAATTAT 2 186 0 CTAAAATTTCATTTTTTAATTATGGATAA 3 9 0 AATTTTAGATAAACTTTAAATAACACCTCT 3 31 1 TAATATGAAAATATTTTAATGTAAGAAAGT 3 86 0 ATATTTTCATATTATTTAATTCATTATTTT 3 102 1 TCATTATTTTTAAATTAAATAATAATTTAT 3 122 1 CTCTTTATTTAATTTTTAAGATAATAATCT 3 225 1 TTAAGATAATAATCTTAATTATAATTATGA 3 240 1 GCTTGTAAAGTAATTTTAAATCATATCAAG 4 64 0 ATAGCAAAAAAGATTTTAATGAAAAAAGAT 4 193 1 CAAAGATAGTTATTTTAAAAGGTTCTTAA 4 281 0 TATGAAGATCAATTTTAAAAAGAGCAAAGA 5 106 1 AAAAAACTACAAACTTTATTAAGACAACGT 5 166 1 CAACGTAGCCATTCTTTAAACAGATCGAAT 5 190 1 GTCAACAATTATTTTTTAATTTTAAATATA 5 272 1 AAACTGCCTATATTTAAAATTAAAAAAT 5 282 0 AAATGTAGAAAATCTTTAATATATAATTCT 6 38 0 ATACTCGTTTAATTTTAAAATTGGCTAAGT 6 79 1 CATATTGCAATATATATAATGAGATCAAAT 8 65 0 TACTGAATGATATCTTTAATAGAATATAAA 8 114 1 ATTTCGTAACAAATTTTAATCCCAATACAA 10 101 0 TAACCTCACTTAATTTTATTTCCTGCATTA 10 156 0 TGTTTGACTTTATTTTTAATTGCTGTAAAT 10 272 1 ********** MAP Score: 3.17466 Motif 10 AATATAAATATTTATAATTATTCATATTATTTTATTTTTAGCTA 0 47 0 TAAGATATGCTTTATTATAGTGTAAATAATATGAATTTAGTAAT 1 16 0 AAAGCATATCTTAATAAATTTTTAAATAAAATAATTTTATTGAG 1 47 1 TAGAATAACATTAATAATAAACGATAATACAGCAATTTTAATCT 1 89 0 AAAATGAGCTTTGAGAATCTTAAAATACTGAATTCGGATTCTTA 1 140 0 CTGGAAATAATTACAGATACTATATAGTATCTGTAATTGGACCT 2 32 1 TAATATTTAATTGCAAATTATACAAATAATATTTTGTTACAAAA 2 163 0 ATTAAATAATATGAAAATATTTTAATGTAAGAAAGTAATAATAT 3 78 0 TATTATTTAATTCATTATTTTTAAATTAAATAATAATTTATATA 3 111 1 TATAATTAAGATTATTATCTTAAAAATTAAATAAAGAGATTCGT 3 219 0 GAATAAAAACATAAAAAAACTTGATATGATTTAAAATTACTTTA 4 45 1 ATAGTTTCTCTTAAGAAGCAGGTAAAGAAGAACACAAAGTTGTA 4 146 1 AAAACAGAAATTAAGAACCTTTTAAAATAACTATCTTTG 4 271 1 TAGCAATATGAAGATCAATTTTAAAAAGAGCAAAGAGTTTATCA 5 100 1 GAATGATATCTTTAATAGAATATAAATTATGAAATGAGATAAAT 8 118 1 TGTTGATACCTAAATTATCATTGAAAAGAAATTACGCACTGAGT 9 84 0 ATATAGTTAATAAACCACGGTGAAAATGAGTAAATTAA 9 156 1 AGGTATTGATTACAAGCTAAAAAAGCAGTGTAGATATAT 10 5 1 GTGAGGTTAATTTATCAGTATACAAGGAAAAACAGGTAATGATA 10 177 1 ** * * * *** * * MAP Score: 3.11054 Motif 11 ACTGTGGACGTGGTAGCTAAAAATAAAATAATATGA 0 34 1 AAAAATAAAATAATATGAATAATTATAAATATTTAT 0 52 1 GTAAATAATATGAATTTAGTAATTAAACT 1 3 0 AATTATTTTATTTAAAAATTTATTAAGATATGCTTT 1 47 0 TGTAATATTTTGTAACAAAATATTATTTGTATAATT 2 156 1 ATATTATTTGTATAATTTGCAATTAAATATTAACAT 2 175 1 TATCTAAAATTTCATTTTTTAATTATGGATAA 3 6 0 CACCTCTTTAAAATACTAAAAAATATATTATTACTT 3 54 1 ATTATTACTTTCTTACATTAAAATATTTTCATATTA 3 80 1 TAATTTAAAAATAATGAATTAAATAATATGAAAATA 3 103 0 TTCATTATTTTTAAATTAAATAATAATTTATATACA 3 121 1 AAAGCTGATAATCTAATAACTATTATACCTAAATTG 3 179 1 GGTATATAACTCATAATTATAATTAAGATTATTATC 3 244 0 ACATTTTGAATAAAAACATAAAAAAACTTGATATGA 4 38 1 CAAAAAAGATTTTAATGAAAAAAGATCGATTATATC 4 197 1 ATAGAGCGATTAAAAACAGAAATTAAGAACCTTTTA 4 259 1 TGCCTATATTTAAAATTAAAAAATAATTGTTGACAG 5 270 0 GTCTATTGGCTAGAATTATATATTAAAGATTTTCTA 6 27 1 CATTTAAAGGAGAAATTATCG 7 3 1 CAACAAATACTCCTAATACTAAATATGTACTAGATA 9 123 1 AAATATGTACTAGATATAGTTAATAAACCACGGTGA 9 143 1 TCTTGAAAAGATGTAAGAGTTAATAATTATGGGAAT 10 66 1 GAAATATTAGTTAATGCAGGAAATAAAATTAAGTGA 10 145 1 ATATTAGATAATAAAGCAATAAATATGTTTGACTTT 10 247 1 * ** * ****** MAP Score: 1.23843