AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i RP/RP_profile007_100.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239544 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 RP036 300 CLPB PROTEIN (clpB) #1 RP184 122 DNAJ PROTEIN (dnaJ) #2 RP201 286 unknown #3 RP446 300 GLYCOSYL TRANSFERASE (lgtD) #4 RP629 211 GRPE PROTEIN (grpE) Motif 1 TCCTATGAAAATAAGAATAAATAAAAAAGGTACCACTGTAGACTA 3 138 0 CACAACATACATATTTAGTACGAAAAATAAAATAACGTAGCAAAT 4 90 1 AAACCTAAATAAATATAGAATTCTAAAGTGCAAAATTATTTTCAA 2 188 1 CTTTTAATAGATAATATTAAAGCAAAAATTAAAAAATTATATTTT 3 202 1 TTAAAAAATTATATTTTAAATCTGAAAAATTAGAATTTATAGTAT 3 230 1 AGATCTCAAAAAAATATGAAAGATAAAATTGATAATATTACTTTG 0 125 0 TATTATATCTATATATATCTTAAAAAAGAACACTAATATAAAAAA 4 172 1 ATACATAATCATAGTAAATTTGTCAAAAGTTACAAAGTCCGATT 0 9 0 TCGGTATACGAAAGCAAATTTCAAAAAGAGCAAAATGTTTTATTG 4 43 1 ATAAATAACATATTTTCATTAATAAAGTGCAATATTTTTAACTA 0 266 0 CCACAAGAGTATAATATTGATTTAAAAATATTAGAAAAGCAATAT 2 245 1 ATTTTAATTAAAAATCATTATATGAAAATAGTCTAGTTAAAAATA 0 233 1 ATAACGTAGCAAATTTTTCAAATTAAATGATTATACCGTTGAAAA 4 121 1 AATTGCTAGGAAAAATTGTATTCAAAATGCTTATAAAAAATTAAA 0 77 0 AATGCTTGAAATATTGAAAAATCAAAAAGAGATCTCAAAAAAATA 0 154 0 TATTCAAATAATATTCAGTAACATAAATGATAGATAGTGATGTTA 3 29 1 AATATAATTTGTACTCCTAATAATATTAAAGAATCGGT 4 3 1 ATTGAGATGTAAAACTATAAGTTTTAACAAAACAAGTTCAGAAAT 2 122 0 TCTTATTTTCATAGGAATAAATCTAATATTTAAGACTTTTAATAG 3 167 1 TCAATGAGGAAAAACCTTGTTAATAAAAACCTAAATAAATATAGA 2 162 1 TCCATGCAAGAAAGATATTATTATATACATTAAAAATTTATAAAA 2 17 0 ATAACAAGAGATACATAACTGCATATAGAATATTATAATGCTTGA 0 190 0 *** * * *** * * MAP Score: 28.074 Motif 2 AATATTTTTTATATTAGTGTTCTTTTTTAAGATATATA 4 183 0 CTATATGCAGTTATGTATCTCTTGTTATTTTAATTAAAAA 0 207 1 CAGTGGTACCTTTTTTATTTATTCTTATTTTCATAGGAAT 3 145 1 TGGAATGAGAATATATTTCTGAACTTGTTTTGTTAAAACT 2 108 1 AATATTATCAATTTTATCTTTCATATTTTTTTGAGATCTC 0 131 1 ACTGAATATTATTTGAATATGCATATCTTTTCAAGAAG 3 8 0 TAACTAGACTATTTTCATATAATGATTTTTAATTAAAATA 0 232 0 AATATAATTTGTACTCCTAATAATATTAAAGAATCGGT 4 8 1 GAAATTATGTTATAATAGTTGTTTTATACGACGA 1 98 0 TTTATTTAGGTTTTTATTAACAAGGTTTTTCCTCATTGAG 2 161 0 ATTTTGCACTTTAGAATTCTATATTTATTTAGGTTTTTAT 2 184 0 CCTCATTGAGATGTAAAACTATAAGTTTTAACAAAACAAG 2 131 0 CAAGAGTATAATATTGATTTAAAAATATTAGAAAAGCAAT 2 248 1 TATAAAATCTTTAGTAACATTTAATTTTTTATAAGCATTT 0 58 1 ATTTGAAAAATTTGCTACGTTATTTTATTTTTCGTACTAA 4 104 0 TAAATTTTTAATGTATATAATAATATCTTTCTTGCATGGA 2 22 1 AATTGTATTTTATAAATTTTTAATGTATATAA 2 2 1 ATATTGCACTTTATTAATGAAAATATGTTATTTAT 0 275 1 AAATTAGAATTTATAGTATAAATAGTTTTATTACCATTGA 3 256 1 GTATAAATAGTTATCGTTTATGTAATCTTAAGATTCTGGT 3 74 1 ATATAGAATATTATAATGCTTGAAATATTGAAAAATCAAA 0 173 0 AATTTTTCAGATTTAAAATATAATTTTTTAATTTTTGCTT 3 221 0 AATCTTAAGATTCTGGTTTTGTAGTTAATTGTTTATTTAA 3 97 1 TATTATACTCTTGTGGAAGTTCTAATAATTGAAAATAATT 2 221 0 TAAGATATATATAGATATAATAAATTTTTTTTCAACGGTA 4 154 0 TAAAGATTTTATATGATATACATAATCATAGTAAATTTGT 0 31 0 ** * * * * * *** MAP Score: 26.0824 Motif 3 AATCGGACTTTGTAACTTTTGACAAATTTACTATGATTATGT 0 6 1 TTACTATGATTATGTATATCATATAAAATCTTTAGTAACATTTAAT 0 37 1 TGAATACAATTTTTCCTAGCAATTCATCAAAGTAATATTATCAATT 0 98 1 CTCTTTTTGATTTTTCAATATTTCAAGCATTATAATATTCTATATG 0 168 1 TGTTATTTTAATTAAAAATCATTATATGAAAATAGTCTAGTTAAAA 0 229 1 ATAAATAACATATTTTCATTAATAAAGTGCAATATTTTTAACTAGA 0 264 0 AATTGTATTTTATAAATTTTTAATGTATATAATAATATCTTTC 2 7 1 CTATAAGTTTTAACAAAACAAGTTCAGAAATATATTCTCATTCCAT 2 107 0 GCACTTTAGAATTCTATATTTATTTAGGTTTTTATTAACAAGGTTT 2 173 0 TATTTTCAATTATTAGAACTTCCACAAGAGTATAATATTGATTTAA 2 224 1 ATAATATTGATTTAAAAATATTAGAAAAGCAATATTTTGCC 2 255 1 CTTCTTGAAAAGATATGCATATTCAAATAATATTCAGTAAC 3 5 1 AATCTTAAGATTACATAAACGATAACTATTTATACTAACATCACTA 3 63 0 ATTCTGGTTTTGTAGTTAATTGTTTATTTAAATAGTCTACAGTGGT 3 106 1 TTCATAGGAATAAATCTAATATTTAAGACTTTTAATAGATAATATT 3 174 1 TAGATAATATTAAAGCAAAAATTAAAAAATTATATTTTAAATCTGA 3 209 1 TTTGCTTTCGTATACCGATTCTTTAATATTATTAGGAGTACAAATT 4 15 0 CGAAAGCAAATTTCAAAAAGAGCAAAATGTTTTATTGATCACAACA 4 51 1 ATAATAAATTTTTTTTCAACGGTATAATCATTTAATTTGAAAAATT 4 132 0 ATTAGTGTTCTTTTTTAAGATATATATAGATATAATAAATTTTTTT 4 163 0 * * * * * **** * MAP Score: 21.8213 Motif 4 GTAACTTTTGACAAATTTACTATGATTATGTATATCATATA 0 21 1 TATATACATTAAAAATTTATAAAATACAATT 2 0 0 AAAAACCTAAATAAATATAGAATTCTAAAGTGCAAAATTAT 2 186 1 ATATTAAAGCAAAAATTAAAAAATTATATTTTAAATCTGAA 3 215 1 ACATCGTCGTATAAAACAACTATTATAACATAATTTC 1 95 1 ACAATTAACTACAAAACCAGAATCTTAAGATTACATAAACG 3 88 0 ATTCAGTAACATAAATGATAGATAGTGATGTTAGTATAAAT 3 41 1 TGTATATCATATAAAATCTTTAGTAACATTTAATTTTTTAT 0 49 1 AGAGATCTCAAAAAAATATGAAAGATAAAATTGATAATATT 0 131 0 AGTACGAAAAATAAAATAACGTAGCAAATTTTTCAAATTAA 4 106 1 ATAAGTTTTAACAAAACAAGTTCAGAAATATATTCTCATTC 2 110 0 GAAAATAAGAATAAATAAAAAAGGTACCACTGTAGACTATT 3 136 0 TATTTATACTATAAATTCTAATTTTTCAGATTTAAAATATA 3 239 0 TGATGTTAGTATAAATAGTTATCGTTTATGTAATCTTAAGA 3 66 1 TAGAACTTCCACAAGAGTATAATATTGATTTAAAAATATTA 2 237 1 TTTCATAGGAATAAATCTAATATTTAAGACTTTTAATAGAT 3 173 1 CTTCTTGAAAAGATATGCATATTCAAATAATATTCAGT 3 7 1 AATTTTTCCTAGCAATTCATCAAAGTAATATTATCAATTTT 0 105 1 AATTTATAGTATAAATAGTTTTATTACCATTGACATGTTAG 3 263 1 ATCATTATATGAAAATAGTCTAGTTAAAAATATTGCACTTT 0 246 1 ATACCGTTGAAAAAAAATTTATTATATCTATATATATCTTA 4 153 1 TGATTTTTAATTAAAATAACAAGAGATACATAACTGCATAT 0 209 0 GTATGTTGTGATCAATAAAACATTTTGCTCTTTTTGAAATT 4 59 0 * **** * * * * * MAP Score: 20.0482 Motif 5 AATCGGACTTTGTAACTTTTGACAAATTTACT 0 0 1 TTTTGACAAATTTACTATGATTATGTATATCATATAAAATCT 0 26 1 ATATAAAATCTTTAGTAACATTTAATTTTTTATAAGCATTTT 0 57 1 TAATATTATCAATTTTATCTTTCATATTTTTTTGAGATCTCT 0 130 1 TTGAGATCTCTTTTTGATTTTTCAATATTTCAAGCATTATAA 0 161 1 TATATGCAGTTATGTATCTCTTGTTATTTTAATTAAAAATCA 0 208 1 ACATATTTTCATTAATAAAGTGCAATATTTTTAACTAGACTA 0 261 0 GAAATTATGTTATAATAGTTGTTTTATACGACGATGT 1 95 0 AATTGTATTTTATAAATTTTTAATGTATATAA 2 0 1 TGAGAATATATTTCTGAACTTGTTTTGTTAAAACTTATAGTT 2 113 1 ATAAATATAGAATTCTAAAGTGCAAAATTATTTTCAATTATT 2 196 1 GGCAAAATATTGCTTTTCTAATATTTTTAAATCAATATTA 2 256 0 TCGTTTATGTAATCTTAAGATTCTGGTTTTGTAGTTAATTGT 3 87 1 AGTGGTACCTTTTTTATTTATTCTTATTTTCATAGGAATAAA 3 146 1 CATAGGAATAAATCTAATATTTAAGACTTTTAATAGATAATA 3 176 1 TTTAAAATATAATTTTTTAATTTTTGCTTTAATATTATCTAT 3 208 0 AAAAAATTATATTTTAAATCTGAAAAATTAGAATTTATAGTA 3 232 1 AAAAATTAGAATTTATAGTATAAATAGTTTTATTACCATTGA 3 254 1 ATTTGAAAAATTTGCTACGTTATTTTATTTTTCGTACTAAAT 4 102 0 ACGTAGCAAATTTTTCAAATTAAATGATTATACCGTTGAAAA 4 124 1 AATATTTTTTATATTAGTGTTCTTTTTTAAGATATATAT 4 182 0 *** * * * *** * MAP Score: 19.115 Motif 6 AATATTATCTATTAAAAGTCTTAAATATTAGATTTATTCCTA 3 178 0 AAAAAATTATATTTTAAATCTGAAAAATTAGAATTTATAGTA 3 232 1 ACATAATCATAGTAAATTTGTCAAAAGTTACAAAGTCCGATT 0 10 0 TATGAAAATAAGAATAAATAAAAAAGGTACCACTGTAGACTA 3 138 0 AATTGTATTTTATAAATTTTTAATGTATATAAT 2 1 1 ATCTCTTGTTATTTTAATTAAAAATCATTATATGAAAATAGT 0 223 1 ATATTTCTGAACTTGTTTTGTTAAAACTTATAGTTTTACATC 2 120 1 CACAACATACATATTTAGTACGAAAAATAAAATAACGTAGCA 4 90 1 AAAAATCAAAAAGAGATCTCAAAAAAATATGAAAGATAAAAT 0 141 0 TGCTAGGAAAAATTGTATTCAAAATGCTTATAAAAAATTAAA 0 77 0 TCTAAAGTGCAAAATTATTTTCAATTATTAGAACTTCCACAA 2 209 1 AAAAATTAGAATTTATAGTATAAATAGTTTTATTACCATTGA 3 254 1 ATAACTGCATATAGAATATTATAATGCTTGAAATATTGAAAA 0 179 0 AATATAATTTGTACTCCTAATAATATTAAAGAATCGGT 4 6 1 CAAGAGTATAATATTGATTTAAAAATATTAGAAAAGCAATAT 2 248 1 TCGGTATACGAAAGCAAATTTCAAAAAGAGCAAAATGTTTTA 4 43 1 TAGATATAATAAATTTTTTTTCAACGGTATAATCATTTAATT 4 141 0 AACTACTCAGAATCCATGCAAGAAAGATATTATTATATACAT 2 32 0 TTTAATAGATAATATTAAAGCAAAAATTAAAAAATTATATTT 3 204 1 GAAATTATGTTATAATAGTTGTTTTATACGACG 1 99 0 AATTCATCAAAGTAATATTATCAATTTTATCTTTCATATTTT 0 118 1 CGGTATAATCATTTAATTTGAAAAATTTGCTACGTTATTTTA 4 117 0 * ** * *** ** * MAP Score: 18.8299 Motif 7 AATTGTATTTTATAAATTTTTAATGTATATAATAATATCT 2 5 1 AATATTTTTTATATTAGTGTTCTTTTTTAAGATATAT 4 184 0 TACGTTATTTTATTTTTCGTACTAAATATGTATGTTGTGATCAAT 4 84 0 ATAGTGATGTTAGTATAAATAGTTATCGTTTATGTAATCTTAAGA 3 62 1 TATAATTTTTTAATTTTTGCTTTAATATTATCTATTAAAAGTCTT 3 198 0 TCAAGCATTATAATATTCTATATGCAGTTATGTATCTCTTGTTAT 0 190 1 TTAGAATTTATAGTATAAATAGTTTTATTACCATTGACATGTTAG 3 259 1 GATTCTTTAATATTATTAGGAGTACAAATTATATT 4 0 0 AGATTTTATATGATATACATAATCATAGTAAATTTGTCAAAAGTT 0 23 0 ATGTATCTCTTGTTATTTTAATTAAAAATCATTATATGAAAATAG 0 219 1 TCTACAGTGGTACCTTTTTTATTTATTCTTATTTTCATAGGAATA 3 141 1 CGTTGAAAAAAAATTTATTATATCTATATATATCTTAAAAAAGAA 4 157 1 AATTGAAAATAATTTTGCACTTTAGAATTCTATATTTATTTAGGT 2 190 0 ATCAAAGTAATATTATCAATTTTATCTTTCATATTTTTTTGAGAT 0 123 1 ATAAATAACATATTTTCATTAATAAAGTGCAATATTTTTAACTAG 0 265 0 TATAAATTCTAATTTTTCAGATTTAAAATATAATTTTTTAATTTT 3 226 0 GTATATCATATAAAATCTTTAGTAACATTTAATTTTTTATAAGCA 0 50 1 CTTAAGATTCTGGTTTTGTAGTTAATTGTTTATTTAAATAGTCTA 3 100 1 TATAATCATTTAATTTGAAAAATTTGCTACGTTATTTTATTTTTC 4 111 0 ** *** * * * * * MAP Score: 17.5904 Motif 8 TTTTAATTAAAAATCATTATATGAAAATAGTCTAGT 0 234 1 GAAATTATGTTATAATAGTTGTTTTAT 1 105 0 GAAAAATTAGAATTTATAGTATAAATAGTTTTATTA 3 253 1 TGAAAGATAAAATTGATAATATTACTTTGATGAATT 0 118 0 GTTTTGTTAAAACTTATAGTTTTACATCTCAATGAG 2 134 1 TAAATATTAGATTTATTCCTATGAAAATAAGAATAA 3 163 0 TAAGACTTTTAATAGATAATATTAAAGCAAAAATTA 3 197 1 TTACGTAGCAATCTCATGGAATGAGAATATATTTCT 2 92 1 TAACGTAGCAAATTTTTCAAATTAAATGATTATACC 4 122 1 AATGTTACTAAAGATTTTATATGATATACATAATCA 0 43 0 AAAAATTAAAAAATTATATTTTAAATCTGAAAAATT 3 225 1 GTTGAAAAAAAATTTATTATATCTATATATATCTTA 4 158 1 TTTTGTAGTTAATTGTTTATTTAAATAGTCTACAGT 3 113 1 GCAGTTATGTATCTCTTGTTATTTTAATTAAAAATC 0 213 1 CTTTAGTAACATTTAATTTTTTATAAGCATTTTGAA 0 66 1 TTTTTAATGTATATAATAATATCTTTCTTGCATGGA 2 26 1 TGCTTTTCTAATATTTTTAAATCAATATTATACTCT 2 250 0 TGACGTGGTTAAGCCATGGTATGACATCGTCGTATA 1 72 1 AATATTTTTTATATTAGTGTTCTTTT 4 195 0 ATAAATAACATATTTTCATTAATAAAGTGC 0 280 0 AATTGCTAGGAAAAATTGTATTCAAAATGCTTATAA 0 86 0 AATTGTATTTTATAAATTTTTAATGTATATAA 2 6 1 AAAGTGCAAAATTATTTTCAATTATTAGAACTTCCA 2 212 1 TCGTATACCGATTCTTTAATATTATTAGGAGTACAA 4 18 0 ** * ** *** * * MAP Score: 14.2284 Motif 9 ATATTATTATATACATTAAAAATTTATAAAATACAATT 2 1 0 AATTATATTTTAAATCTGAAAAATTAGAATTTATAGTATAAATAGTT 3 236 1 GGAATAAATCTAATATTTAAGACTTTTAATAGATAATATTAAAGCAA 3 180 1 AATATATTTCTGAACTTGTTTTGTTAAAACTTATAGTTTTACATCTC 2 117 1 GAGATCTCAAAAAAATATGAAAGATAAAATTGATAATATTACTTTGA 0 124 0 CTTCTTGAAAAGATATGCATATTCAAATAATATTCAGTAACATA 3 7 1 TTTATTGATCACAACATACATATTTAGTACGAAAAATAAAATAACGT 4 81 1 GACTATTTAAATAAACAATTAACTACAAAACCAGAATCTTAAGATTA 3 96 0 ATATATCTTAAAAAAGAACACTAATATAAAAAATATT 4 184 1 ATTTTCATTAATAAAGTGCAATATTTTTAACTAGACTATTTTCATAT 0 252 0 AACATAAATGATAGATAGTGATGTTAGTATAAATAGTTATCGTTTAT 3 48 1 ATTGATAATATTACTTTGATGAATTGCTAGGAAAAATTGTATTCAAA 0 96 0 ATAGATAATATTAAAGCAAAAATTAAAAAATTATATTTTAAATCTGA 3 208 1 CTAATAATATTAAAGAATCGGTATACGAAAGCAAATTTCAAAAAGAG 4 26 1 ATGCAGTTATGTATCTCTTGTTATTTTAATTAAAAATCATTATATGA 0 211 1 AAAACCTTGTTAATAAAAACCTAAATAAATATAGAATTCTAAAGTGC 2 172 1 TAGAACTTCCACAAGAGTATAATATTGATTTAAAAATATTAGAAAAG 2 237 1 TAAAGATTTTATATGATATACATAATCATAGTAAATTTGTCAAAAGT 0 24 0 * * * ** ** * * * MAP Score: 13.6406 Motif 10 ATAGTAAATTTGTCAAAAGTTACAAAGTCCGATT 0 9 0 TATGATTATGTATATCATATAAAATCTTTAGTAAC 0 41 1 TCAAAATGCTTATAAAAAATTAAATGTTACTAAAG 0 66 0 ATATGAAAGATAAAATTGATAATATTACTTTGATG 0 122 0 TTTTTCAATATTTCAAGCATTATAATATTCTATAT 0 178 1 TAATGATTTTTAATTAAAATAACAAGAGATACATA 0 218 0 ACATTAAAAATTTATAAAATACAATT 2 1 0 AAAGATATTATTATATACATTAAAAATTTATAAAA 2 17 0 TAATATTGATTTAAAAATATTAGAAAAGCAATATT 2 256 1 AAAGATATGCATATTCAAATAATATTCAGTAACAT 3 18 1 TATTCCTATGAAAATAAGAATAAATAAAAAAGGTA 3 151 0 CTATTAAAAGTCTTAAATATTAGATTTATTCCTAT 3 177 0 ATTTAAGACTTTTAATAGATAATATTAAAGCAAAA 3 194 1 TAAAGCAAAAATTAAAAAATTATATTTTAAATCTG 3 219 1 ATATTTTAAATCTGAAAAATTAGAATTTATAGTAT 3 240 1 ACGTAGCAAATTTTTCAAATTAAATGATTATACCG 4 124 1 TTTAAGATATATATAGATATAATAAATTTTTTTTC 4 161 0 TATCTATATATATCTTAAAAAAGAACACTAATATA 4 177 1 * * * * **** ** MAP Score: 4.17872 Motif 11 GTAACTTTTGACAAATTTACTATGATTATGTATATCATATA 0 21 1 TGTATATCATATAAAATCTTTAGTAACATTTAATTTTTTAT 0 49 1 AGTAACATTTAATTTTTTATAAGCATTTTGAATACAATTTT 0 70 1 TTTTCCTAGCAATTCATCAAAGTAATATTATCAATTTTATC 0 108 1 AATATTATCAATTTTATCTTTCATATTTTTTTGAGATCTCT 0 131 1 TGATTTTTCAATATTTCAAGCATTATAATATTCTATATGCA 0 175 1 TAACTAGACTATTTTCATATAATGATTTTTAATTAAAATAA 0 231 0 ACATATTTTCATTAATAAAGTGCAATATTTTTAACTAGACT 0 262 0 GTCGTATAAAACAACTATTATAACATAATTTC 1 100 1 AATTGTATTTTATAAATTTTTAATGTATATA 2 0 1 TTTTAACAAAACAAGTTCAGAAATATATTCTCATTCCATGA 2 105 0 TTCCTCATTGAGATGTAAAACTATAAGTTTTAACAAAACAA 2 132 0 ATAAATATAGAATTCTAAAGTGCAAAATTATTTTCAATTAT 2 196 1 AATTATTAGAACTTCCACAAGAGTATAATATTGATTTAAAA 2 231 1 TTGATTTAAAAATATTAGAAAAGCAATATTTTGCC 2 261 1 ACTGAATATTATTTGAATATGCATATCTTTTCAAGAAG 3 7 0 TATTCAAATAATATTCAGTAACATAAATGATAGATAGTGAT 3 29 1 AATATTTAAGACTTTTAATAGATAATATTAAAGCAAAAATT 3 191 1 TTCAGATTTAAAATATAATTTTTTAATTTTTGCTTTAATAT 3 215 0 TGGTAATAAAACTATTTATACTATAAATTCTAATTTTTCAG 3 251 0 AATATAATTTGTACTCCTAATAATATTAAAGAATCG 4 5 1 ACGAAAGCAAATTTCAAAAAGAGCAAAATGTTTTATTGATC 4 50 1 AACGTAGCAAATTTTTCAAATTAAATGATTATACCGTTGAA 4 123 1 TTTAAGATATATATAGATATAATAAATTTTTTTTCAACGGT 4 155 0 * ** * * ** ** * MAP Score: 3.54582 Motif 12 AAATCTTTAGTAACATTTAATTTTTTATAAGCATTT 0 62 1 TTATAAGCATTTTGAATACAATTTTTCCTAGCAATT 0 86 1 AAAGTAATATTATCAATTTTATCTTTCATATTTTTT 0 126 1 ATTTCAAGCATTATAATATTCTATATGCAGTTATGT 0 187 1 GTCTAGTTAAAAATATTGCACTTTATTAATGAAAAT 0 263 1 ACTTTATTAATGAAAATATGTTATTTAT 0 282 1 TTTTTAATGTATATAATAATATCTTTCTTGCATGGA 2 26 1 CTGGTTTTGTAGTTAATTGTTTATTTAAATAGTCTA 3 109 1 TAAAAGTCTTAAATATTAGATTTATTCCTATGAAAA 3 172 0 CAGATTTAAAATATAATTTTTTAATTTTTGCTTTAA 3 218 0 TTTAAATCTGAAAAATTAGAATTTATAGTATAAATA 3 244 1 GAATTTATAGTATAAATAGTTTTATTACCATTGACA 3 262 1 GTGATCAATAAAACATTTTGCTCTTTTTGAAATTTG 4 57 0 TACCGTTGAAAAAAAATTTATTATATCTATATATAT 4 154 1 * * **** * *** MAP Score: 2.1717