AlignACE 3.0 10/20/99 AlignACE2 -i TP/TP_operons025_300.orf Parameter values: expect = 10 gcback = 0.38 minpass = 200 seed = 944239815 numcols = 10 undersample = 1 oversample = 1 Input sequences: #0 TP0099 194 uridylate kinase (smbA) #1 TP0185 147 signal peptidase I (sip) #2 TP0186 54 oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative #3 TP0187 63 translation elongation factor TU (tuf) #4 TP0188 71 ribosomal protein S10 (rpsJ) #5 TP0189 46 ribosomal protein L3 (rplC) #6 TP0192 55 ribosomal protein L2 (rplB) #7 TP0207 187 ribosomal protein L15 (rplO) #8 TP0214 23 T. pallidum predicted coding region TP0214 #9 TP0215 205 grpE protein (grpE) #10 TP0216 115 heat shock protein 70 (dnaK) #11 TP0843 92 heat shock protein, putative Motif 1 TGTGTAGGCGCCGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCGTGC 2 9 1 GCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 118 1 TAGGATACCCGCCCTGCCTGCAGGGCGCGCAGTATAGCCGTT 10 64 0 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTTATTTTGCA 4 6 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCAGAGCGGT 6 6 1 CAGGCAGGGTATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTC 10 3 1 GTAAATAGGTGTTTTCTTGACCGAGGGCGGCGTCTCTCGTTA 9 125 1 GAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAGCTGTTTCGCACCT 7 131 1 CCATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGGTCGGTGTAGTCAGACG 9 83 1 TGCGAGCTGTTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAGGTT 7 154 1 ATCTGGCATTGCGTCCCAGCGTGCACGGGGCGATGGAGTGTT 0 103 0 TACTTTTACGGCATTACCGCGAGGGTGTTATGGCAAAAAAGG 9 165 1 TGCGTCGGACGGTTCGGTCTTTGGGTTTGAGGAAGTTGCATT 7 70 1 GTGTTTGGAGTTATTTTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTG 4 28 1 CTGTATCTCCGTAGTCTAGTGAGTGTTCTCTGTGC 0 3 0 CGATCTTTTTTCAGATAGCGTTGCGCGGGATGTGTGCTCTTT 11 28 0 AGGTGCCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 33 1 CGGGATGTGTGCTCTTTTTAGAGGAGGTTGGGCAA 11 3 0 GGCGTGTGTGTTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGA 5 6 1 ATGGGTTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGCTACCGGATA 1 49 1 GGGTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 167 1 TGACAAAGAGGGTGCGTATAACGCTGGTGAGGAGTACGATCG 7 13 1 GTGGTCGTGAGAATGGGTACGCCGTGTACTATTT 3 2 1 GCATTCAATGGTGGAGAAAGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGG 7 107 1 GTGATATGAGGTTCCGTCCCAAGGACGTTAGGTGGTTGTCCG 9 22 1 TCGCGCATCCTCGTGATATGAGGTTCCGTCCC 9 0 1 TCAGGATGGAGTTCTGGAGCACCGGTGCTAGGTAACGGCTAT 10 31 1 ** ** * * * ** * MAP Score: 30.8639 Motif 2 CTGGTGAGGAGTACGATCGGTCAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGG 7 36 1 ATTTTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGGGGTT 4 40 1 CGTAAGGTGCCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 29 1 GTTACCATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGGTCGGTGTAGTCAGACG 9 79 1 TTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGAGGTAGGTG 5 20 1 GGGATGGTGCGAGCTGTTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAG 7 147 1 CTGGCATTGCGTCCCAGCGTGCACGGGGCGATGGAGTGTTCTACAC 0 97 0 CGCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 117 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTTATTTTGCA 4 2 1 GGATCCAAAGGGTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 158 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCAGAGCGGT 6 2 1 GAGAAAGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAGCTGTTT 7 120 1 TGTGTAGGCGCCGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCG 2 2 1 CTCTGTATAGGATACCCGCCCTGCCTGCAGGGCGCGCAGTATAGCC 10 67 0 GCATGACAAAGAGGGTGCGTATAACGCTGGTGAGGAGTACGA 7 6 1 ATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTCTGGAGCACCGGTGCTAGGTAA 10 20 1 GCACAGAGAACACTCACTAGACTACGGAGATACAGTTTT 0 3 1 TCTTTGGGTTTGAGGAAGTTGCATTCAATGGTGGAGAAAGACGGGA 7 87 1 TGCGCGGGATGTGTGCTCTTTTTAGAGGAGGTTGGGCAA 11 3 0 CAATGAGATGGGTTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGCTACCGG 1 42 1 GACGGTAAATAGGTGTTTTCTTGACCGAGGGCGGCGTCTCTCGTTA 9 121 1 CTCCTTTTTTGCCATAACACCCTCGCGGTAATGCCGTAAAAGTAAC 9 163 0 * * * * * * * ** * MAP Score: 29.5706 Motif 3 TGCGTAAGGTGCCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 27 1 CAGGCAGGGTATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTCT 10 6 1 CGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCGTGCTGTTCCTTTT 2 21 1 CCATCGCCCCGTGCACGCTGGGACGCAATGCCAGATACAC 0 109 1 GTTTTCTTGACCGAGGGCGGCGTCTCTCGTTACTTTTACG 9 135 1 TTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAGGTTA 7 164 1 TGTGTAGGCGCCGCATTTGTGGTGCGTGCTG 2 1 1 TGTGTGTTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGAGGTAGG 5 14 1 ATTTTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGGGGT 4 40 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTT 4 0 1 TCGTGAGAATGGGTACGCCGTGTACTATTTGAATTCGGGT 3 14 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCC 6 0 1 AACGGCTATACTGCGCGCCCTGCAGGCAGGGCGGGTATCC 10 64 1 GCATGACAAAGAGGGTGCGTATAACGCTGGTGAGGAGTAC 7 10 1 TTCAATGGTGGAGAAAGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGGG 7 110 1 CGCTGGTGAGGAGTACGATCGGTCAGAGGGAGCCGGTGCG 7 34 1 AGATAGCGTTGCGCGGGATGTGTGCTCTTTTTAGAGGAGG 11 18 0 GTCAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGGTTCGGTCTTTGGG 7 55 1 CTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAGCTGTTTCGCACCTGGT 7 136 1 ACAGCAAAGAGGGATTGACGTGCCGATCTTTTTTCAGATA 11 53 0 * * * **** * ** MAP Score: 29.2379 Motif 4 ACAAGAACTAGGAGTCTGTGTCGCCCGTGTAGAACACTCC 0 71 1 GCGTCCCAGCGTGCACGGGGCGATGGAGTGTTCTACACGG 0 95 0 GGATCCAAAGGGTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAG 0 158 1 CAATGAGATGGGTTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGC 1 42 1 CGCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 117 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTTAT 4 2 1 GAGTGTGTTTGGAGTTATTTTGCAAGGTGGGTGCGGTTTT 4 24 1 AGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGGGGTT 4 48 1 GTGCCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 35 1 AAGAGGGTGCGTATAACGCTGGTGAGGAGTACGATCGGTC 7 18 1 TCGGTCAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGGTTCGGTCTTT 7 52 1 GAGAAAGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAG 7 120 1 GAGCTGTTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAGGTTA 7 157 1 ATGAGGTTCCGTCCCAAGGACGTTAGGTGGTTGTCCGTTT 9 27 1 GTTACCATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGGTCGGTGTAGT 9 79 1 ACGGTAAATAGGTGTTTTCTTGACCGAGGGCGGCGTCTCT 9 122 1 AGGTCAGGATGGAGTTCTGGAGCACCGGTGCTAGGTAACG 10 28 1 GCTATACTGCGCGCCCTGCAGGCAGGGCGGGTATCCTATA 10 68 1 GGGAGCCCTACAGCAAAGAGGGATTGACGTG 11 71 0 ** * * * * ** ** MAP Score: 29.1849 Motif 5 CACTCCATCGCCCCGTGCACGCTGGGACGCAATGCCAGA 0 105 1 GGGTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 167 1 AGATGGGTTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGCTACC 1 47 1 GTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 121 1 TAGGCGCCGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCGTGCTG 2 14 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGT 4 0 1 GTTTGGAGTTATTTTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCT 4 30 1 GGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGGGGTT 4 49 1 TTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGAGGTAGGTG 5 20 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCA 6 2 1 GCATGACAAAGAGGGTGCGTATAACGCTG 7 0 1 AGTACGATCGGTCAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGGTT 7 45 1 AAAGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAGCT 7 123 1 ATGGTGCGAGCTGTTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAG 7 150 1 CAGTTGGGCAATGGAGGGGTGGT 8 2 1 GGGACGGAACCTCATATCACGAGGATGCGCGA 9 3 0 CGGTAAATAGGTGTTTTCTTGACCGAGGGCGGCGTCTCT 9 123 1 TACTTTTACGGCATTACCGCGAGGGTGTTATGGCAAAAA 9 165 1 CGCAGTATAGCCGTTACCTAGCACCGGTGCTCCAGAACT 10 40 0 TAGGATACCCGCCCTGCCTGCAGGGCGCGCAGTATAGCC 10 67 0 GGGCGGGTATCCTATACAGAGGAGTTGAGGGTT 10 92 1 TTTTCAGATAGCGTTGCGCGGGATGTGTGCTCTTTTTAG 11 24 0 ** * ** * ** * * MAP Score: 25.4076 Motif 6 GAGAAAGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAGCTGTTTCG 7 120 1 GGATCCAAAGGGTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 158 1 ACGCTGGTGAGGAGTACGATCGGTCAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACG 7 33 1 CGCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 117 1 CAATGAGATGGGTTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGCTACCGGAT 1 42 1 CTGCAGGCAGGGCGGGTATCCTATACAGAGGAGTTGAGGGTT 10 83 1 GTTACCATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGGTCGGTGTAGTCAGACGGT 9 79 1 TGGTGCGAGCTGTTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAGGTTA 7 151 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCAGAGCGGTGACCGA 6 6 1 CAGGCAGGGTATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTCTGGAGCACC 10 6 1 GTAGTCAGACGGTAAATAGGTGTTTTCTTGACCGAGGGCGGCGTCTCT 9 114 1 GAGTGTGTTTGGAGTTATTTTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGAT 4 24 1 AGCGTTGCGCGGGATGTGTGCTCTTTTTAGAGGAGGTTGGGCAA 11 6 0 TATCTGGCATTGCGTCCCAGCGTGCACGGGGCGATGGAGTGTTCTACA 0 98 0 AACGTCCTTGGGACGGAACCTCATATCACGAGGATGCGCGA 9 3 0 TGCAGGGCGCGCAGTATAGCCGTTACCTAGCACCGGTGCTCCAGAACT 10 40 0 GGCGTGTGTGTTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGA 5 0 1 TCCGTCCCAAGGACGTTAGGTGGTTGTCCGTTTCTGTGCTTGGCAGTT 9 34 1 AAAAAAGATCGGCACGTCAATCCCTCTTTGCTGTAGGGCTCCC 11 59 1 TGTGTAGGCGCCGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCG 2 0 1 ** *** ** * * * MAP Score: 23.2863 Motif 7 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCAGAGCG 6 6 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTTATTTTG 4 6 1 TTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAGGTTA 7 163 1 TTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGGGGTT 4 43 1 AGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGGTTCGGTCTTTGGGTTT 7 58 1 AGGTGCCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 33 1 CCGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCGTGCTGTTCCTTT 2 20 1 TGACAAAGAGGGTGCGTATAACGCTGGTGAGGAGTACGAT 7 13 1 GCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 118 1 GGTAGCATCCGGCGCCATGAGGGGCACAGGAACCCATCTC 1 46 0 ATCTGGCATTGCGTCCCAGCGTGCACGGGGCGATGGAGTG 0 105 0 GAGTTCTGGAGCACCGGTGCTAGGTAACGGCTATACTGCG 10 39 1 GGCAGGGTATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTCTGGAGCA 10 12 1 TTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGAGGTAGGTG 5 20 1 TAACGGCTATACTGCGCGCCCTGCAGGCAGGGCGGGTATC 10 63 1 AGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAGCTGTT 7 125 1 TTGACCGAGGGCGGCGTCTCTCGTTACTTTTACGGCATTA 9 141 1 GTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 169 1 ATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGGTCGGTGTAGTCAGACG 9 85 1 ****** ** ** MAP Score: 21.3589 Motif 8 AGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGA 7 125 1 CCCCGTCTCCTTCGGTCACCGCTCTGGCACCT 6 33 0 GTATAGGATACCCGCCCTGCCTGCAGGGCGCGCA 10 75 0 GCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCC 1 118 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCC 6 6 1 GTGAGGAGTACGATCGGTCAGAGGGAGCCGGTGC 7 39 1 GTAGAACACTCCATCGCCCCGTGCACGCTGGGAC 0 99 1 AAACACACTCCGCGCCGCAAACGC 4 0 0 AGTAACGAGAGACGCCGCCCTCGGTCAAGAAAAC 9 135 0 CCGGTAGCATCCGGCGCCATGAGGGGCACAGGAA 1 54 0 TGCGTCGGACGGTTCGGTCTTTGGGTTTGAGGAA 7 70 1 CCTAACTCCTCCACCCGCACCAGGTGCGAAACAG 7 160 0 ATCGGCACGTCAATCCCTCTTTGCTGTAGGGCTC 11 66 1 GAGTTCTGGAGCACCGGTGCTAGGTAACGGCTAT 10 39 1 GTACTCCTCACCAGCGTTATACGCACCCTCTTTG 7 16 0 AGAACTCCATCCTGACCTCTCAGCATACCCTGCC 10 12 0 TTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGG 4 43 1 ACCACCCCTCCATTGCCCAACTG 8 7 0 GTGTATCTGGCATTGCGTCCCAGCGTGCACGGGG 0 115 0 GGAACAGCACGATGCGCAGCACGCACCACAAATG 2 23 0 TGTGTAGGCGCCGCATTTGTGGTGCGTGCT 2 6 1 CCTTTGGATCCAGGCCCTGTGTGTATCTGGCATT 0 135 0 ** ****** ** MAP Score: 20.5589 Motif 9 CGTGCACGGGGCGATGGAGTGTTCTACACGGGCGACACAGAC 0 84 0 ACGCTGGGACGCAATGCCAGATACACACAGGGCCTGGATCCA 0 123 1 GTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 169 1 CCGGTAGCATCCGGCGCCATGAGGGGCACAGGAACCCATCTC 1 46 0 CGCCGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCGTGCTGTTCCTTT 2 18 1 GTGGTCGTGAGAATGGGTACGCCGTGTACTATTTG 3 3 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTTATT 4 1 1 TTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGGGGTT 4 43 1 TTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGAGGTAGGTG 5 20 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCAGAGCGGT 6 6 1 AGGTGCCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 33 1 TGACAAAGAGGGTGCGTATAACGCTGGTGAGGAGTACGATCG 7 13 1 GTGAGGAGTACGATCGGTCAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACG 7 39 1 TGCGTCGGACGGTTCGGTCTTTGGGTTTGAGGAAGTTGCATT 7 70 1 GCATTCAATGGTGGAGAAAGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGG 7 107 1 TTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAGGTTA 7 163 1 GTGATATGAGGTTCCGTCCCAAGGACGTTAGGTGGTTGTCCG 9 22 1 AGTTACCATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGGTCGGTGTAGTC 9 78 1 ATCGTGGTCGGTGTAGTCAGACGGTAAATAGGTGTTTTCTTG 9 102 1 CAGGCAGGGTATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTCTGGA 10 7 1 TCAGGATGGAGTTCTGGAGCACCGGTGCTAGGTAACGGCTAT 10 31 1 CTAGGTAACGGCTATACTGCGCGCCCTGCAGGCAGGGCGGGT 10 58 1 CGGGATGTGTGCTCTTTTTAGAGGAGGTTGGGCAA 11 3 0 *** ** ** *** MAP Score: 16.6197 Motif 10 ACAGAGAACACTCACTAGACTACGGAGATACAGTTTT 0 12 1 CGTCCCAGCGTGCACGGGGCGATGGAGTGTTCTACAC 0 97 0 GGGTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 167 1 GTTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGCTACCGGAT 1 53 1 GATTATCGCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGA 1 111 1 CTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 129 1 GAGTTATTTTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGAT 4 35 1 CTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCAGAGCGGTGACCGA 6 17 1 CCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 38 1 AGTACGATCGGTCAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGG 7 45 1 GAGCCGGTGCGTCGGACGGTTCGGTCTTTGGGTTTGA 7 63 1 GGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAGCTGTTT 7 129 1 CGAGCTGTTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAG 7 156 1 CAGTTGGGCAATGGAGGGGTGGT 8 5 1 CTTGGCAGTTACCATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGG 9 72 1 GTGTTTTCTTGACCGAGGGCGGCGTCTCTCGTTACTT 9 133 1 GGTATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTCTGGAGCACC 10 17 1 TGGAGTTCTGGAGCACCGGTGCTAGGTAACGGCTATA 10 37 1 GCTATACTGCGCGCCCTGCAGGCAGGGCGGGTATCCT 10 68 1 * * ** ***** * MAP Score: 16.596 Motif 11 AACACTCCATCGCCCCGTGCACGCTGGGACGCAATGCC 0 103 1 TGCCCCTCATGGCGCCGGATGCTACCGGATAGGCACTT 1 60 1 GCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTT 1 118 1 CCGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCGTGCTGTTCCT 2 20 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTTATTTTG 4 8 1 TTGCAAGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGGGGTT 4 43 1 TTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGAGGTAGGTG 5 22 1 AGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCAGAGCGGTGACCG 6 15 1 GTGCCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 35 1 GTATAACGCTGGTGAGGAGTACGATCGGTCAGAGGGAG 7 28 1 AGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGGTTCGGTCTTTGGGT 7 58 1 CAGCTCGCACCATCCCCAAGACGGCAGGACTCCCGTCT 7 125 0 ACCCGCACCAGGTGCGAAACAGCTCGCACCATCCCCAA 7 144 0 TTACGGCATTACCGCGAGGGTGTTATGGCAAAAAAGGA 9 170 1 GGCAGGGTATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTCTGGAG 10 12 1 GGCTATACTGCGCGCCCTGCAGGCAGGGCGGGTATCCT 10 67 1 ****** * * ** MAP Score: 10.4174 Motif 12 AGAACTAGGAGTCTGTGTCGCCCGTGTAGAACACTC 0 74 1 GCCCCGTGCACGCTGGGACGCAATGCCAGATACACA 0 114 1 GGTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 168 1 CATCTCATTGCAAAGAACCGCAAGGCTTTTTTCAAT 1 16 0 TTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGCTACCGGAT 1 54 1 TGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 130 1 CGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCGTGCTGTTCC 2 21 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAG 4 2 1 TGTGTTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAGAGGTA 5 16 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGG 6 0 1 TGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCCAGAGCGGTGACCGA 6 18 1 CAAAGAGGGTGCGTATAACGCTGGTGAGGAGTACGA 7 16 1 CTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAGCTGTTTCGCACC 7 136 1 GAGCTGTTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAG 7 157 1 TGGCAGTTACCATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGGT 9 74 1 GCTAGGTAACGGCTATACTGCGCGCCCTGCAGGCAG 10 57 1 CAACTCCTCTGTATAGGATACCCGCCCTGCCTGCAG 10 83 0 TATCCTATACAGAGGAGTTGAGGGTT 10 99 1 TCTTTTTTCAGATAGCGTTGCGCGGGATGTGTGCTC 11 31 0 * * * ****** * MAP Score: 8.75131 Motif 13 CAAGAACTAGGAGTCTGTGTCGCCCGTGTA 0 72 1 TGGATCCAGGCCCTGTGTGTATCTGGCATT 0 135 0 GAAACCCTCTCGCCGGCATCGTAA 0 180 0 GTTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGCT 1 53 1 TCGATTATCGCCGTGTTAGGCTGCCGTGTC 1 109 1 TGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCC 1 122 1 GTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTTAT 4 12 1 GGCGTGTGTGTTTTGTCTGTG 5 1 1 CCCCGTCTCCTTCGGTCACC 6 45 0 GTTATACGCACCCTCTTTGTCATGC 7 5 0 CGCACCGGCTCCCTCTGACCGATCGTACTC 7 44 0 CAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGGTTCGG 7 57 1 TCGGACGGTTCGGTCTTTGGGTTTGAGGAA 7 74 1 GGCAGGACTCCCGTCTTTCTCCACCATTGA 7 111 0 GGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGA 7 129 1 TTGTCCGTTTCTGTGCTTGGCAGTTACCAT 9 57 1 CACCTATTTACCGTCTGACTACACCGACCA 9 106 0 CGAGAGACGCCGCCCTCGGTCAAGAAAACA 9 134 0 ACCGAGGGCGGCGTCTCTCGTTACTTTTAC 9 144 1 TACGGCATTACCGCGAGGGTGTTATGGCAA 9 171 1 CTCCATCCTGACCTCTCAGCATACCCTGCC 10 12 0 TCTGGAGCACCGGTGCTAGGTAACGGCTAT 10 43 1 AGGATACCCGCCCTGCCTGCAGGGCGCGCA 10 75 0 GCACGTCAATCCCTCTTTGCTGTAGGGCTC 11 70 1 ********** MAP Score: 7.44543 Motif 14 CGGAGATACAGTTTTTACGTCGGTTTTTGCACAGAATACA 0 34 1 ACAAGAACTAGGAGTCTGTGTCGCCCGTGTAGAACACTCC 0 71 1 GTCTCTTTGCGTTACGATGCCGGCGAGAGGGTTTC 0 169 1 CAATGAGATGGGTTCCTGTGCCCCTCATGGCGCCGGATGC 1 42 1 CTTGTCAATTCGATTATCGCCGTGTTAGGCTGCCGTGTCT 1 100 1 GTGTTAGGCTGCCGTGTCTGGGAGGGACGCCGTTTT 1 121 1 TGTGTAGGCGCCGCATTTGTGGTGCGTGCTGCGCATCGT 2 9 1 GCGTTTGCGGCGCGGAGTGTGTTTGGAGTT 4 0 1 AGGTGGGTGCGGTTTTAGGCTGATGGAGGGGTT 4 48 1 GGCGTGTGTGTTTTGTCTGTGCGTTGCGATACGGAAG 5 7 1 CGGTAAGCTGCGGTAGCTGCGTAAGGTGCC 6 0 1 TGCGTAAGGTGCCAGAGCGGTGACCGAAGGAGACGGGG 6 27 1 TCGGTCAGAGGGAGCCGGTGCGTCGGACGGTTCGGTCTTT 7 52 1 GAGAAAGACGGGAGTCCTGCCGTCTTGGGGATGGTGCGAG 7 120 1 GAGCTGTTTCGCACCTGGTGCGGGTGGAGGAGTTAGGTTA 7 157 1 ATGAGGTTCCGTCCCAAGGACGTTAGGTGGTTGTCCGTTT 9 27 1 GTTACCATTGGGATGCAGGTCGCATCGTGGTCGGTGTAGT 9 79 1 GTTTTCTTGACCGAGGGCGGCGTCTCTCGTTACTTTTACG 9 135 1 CAGGCAGGGTATGCTGAGAGGTCAGGATGGAGTTCT 10 6 1 GCTAGGTAACGGCTATACTGCGCGCCCTGCAGGCAGGGCG 10 57 1 TCTAAAAAGAGCACACATCCCGCGCAACGCTATCTGAAAA 11 23 1 ** ***** * ** MAP Score: 7.08002 Motif 15 ACAAGAACTAGGAGTCTGTGTCGCCCGTGTAGAACACTCC 0 71 1 ACACTCCATCGCCCCGTGCACGCTGGGACGCAATGCCAGA 0 104 1 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